Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2259
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2259, 502 aa
1>>>pF1KE2259 502 - 502 aa - 502 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2828+/-0.00077; mu= 18.1131+/- 0.046
mean_var=67.3920+/-13.085, 0's: 0 Z-trim(108.3): 76 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.156232
statistics sampled from 10178 (10254) to 10178 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 1.520
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS10027.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs109|chr15 ( 502) 3488 795.2 0
CCDS53924.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs109|chr15 ( 531) 3360 766.3 0
CCDS32184.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs109|chr15 ( 412) 2685 614.1 9.3e-176
CCDS42008.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs109|chr15 ( 321) 2206 506.1 2.4e-143
CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs109|chr8 ( 529) 1232 286.7 4.4e-77
CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs109|chr15 ( 505) 1220 284.0 2.8e-76
CCDS64856.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs109|chr8 ( 514) 1132 264.1 2.6e-70
CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs109|chr15 ( 489) 1131 263.9 2.9e-70
CCDS13517.1 CHRNA4 gene_id:1137|Hs109|chr20 ( 627) 1118 261.0 2.8e-69
CCDS7745.1 CHRNA10 gene_id:57053|Hs109|chr11 ( 450) 1074 251.0 2e-66
CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs109|chr4 ( 479) 1070 250.2 4e-66
CCDS10306.1 CHRNB4 gene_id:1143|Hs109|chr15 ( 498) 1052 246.1 6.9e-65
CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs109|chr8 ( 494) 1049 245.4 1.1e-64
CCDS1070.1 CHRNB2 gene_id:1141|Hs109|chr1 ( 502) 1019 238.7 1.2e-62
CCDS2261.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs109|chr2 ( 457) 991 232.3 8.8e-61
CCDS6134.1 CHRNB3 gene_id:1142|Hs109|chr8 ( 458) 949 222.9 6.2e-58
CCDS10304.1 CHRNA5 gene_id:1138|Hs109|chr15 ( 468) 946 222.2 1e-57
CCDS56536.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs109|chr8 ( 479) 870 205.1 1.5e-52
CCDS33331.1 CHRNA1 gene_id:1134|Hs109|chr2 ( 482) 845 199.4 7.4e-51
CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs109|chr11 ( 463) 714 169.9 5.5e-42
CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs109|chr11 ( 484) 714 169.9 5.8e-42
CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs109|chr11 ( 516) 607 145.8 1.1e-34
CCDS8364.1 HTR3B gene_id:9177|Hs109|chr11 ( 441) 584 140.6 3.5e-33
CCDS86249.1 HTR3B gene_id:9177|Hs109|chr11 ( 430) 581 139.9 5.5e-33
CCDS58868.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 456) 565 136.3 7e-32
CCDS3251.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 471) 565 136.3 7.2e-32
CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs109|chr3 ( 447) 533 129.1 1e-29
CCDS33400.1 CHRNG gene_id:1146|Hs109|chr2 ( 517) 497 121.0 3.2e-27
CCDS11106.1 CHRNB1 gene_id:1140|Hs109|chr17 ( 501) 469 114.7 2.5e-25
CCDS58754.1 CHRND gene_id:1144|Hs109|chr2 ( 502) 467 114.3 3.4e-25
CCDS2494.1 CHRND gene_id:1144|Hs109|chr2 ( 517) 459 112.5 1.2e-24
CCDS58869.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 441) 440 108.1 2.1e-23
CCDS58870.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 456) 440 108.1 2.1e-23
CCDS11058.1 CHRNE gene_id:1145|Hs109|chr17 ( 493) 428 105.5 1.5e-22
CCDS58871.1 HTR3E gene_id:285242|Hs109|chr3 ( 482) 369 92.2 1.5e-18
CCDS76786.1 CHRNA5 gene_id:1138|Hs109|chr15 ( 160) 340 85.3 5.5e-17
CCDS58392.1 CHRNB4 gene_id:1143|Hs109|chr15 ( 231) 303 77.1 2.4e-14
CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs109|chr5 ( 467) 286 73.4 6.1e-13
CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs109|chr5 ( 475) 286 73.4 6.2e-13
CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs109|chr4 ( 465) 283 72.8 9.8e-13
CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs109|chr5 ( 440) 274 70.7 3.8e-12
CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs109|chr4 ( 497) 271 70.1 6.7e-12
CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs109|chr1 ( 452) 261 67.8 3e-11
CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs109|chrX ( 417) 259 67.3 3.8e-11
CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs109|chr5 ( 449) 258 67.1 4.7e-11
CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs109|chrX ( 452) 258 67.1 4.7e-11
CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs109|chr5 ( 457) 258 67.1 4.8e-11
CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs109|chrX ( 452) 256 66.7 6.5e-11
>>CCDS10027.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs109|chr15 (502 aa)
initn: 3488 init1: 3488 opt: 3488 Z-score: 4246.0 bits: 795.2 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 3488; 100.0% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRCSPGGVWLALAASLLHVSLQGEFQRKLYKELVKNYNPLERPVANDSQPLTVYFSLSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MRCSPGGVWLALAASLLHVSLQGEFQRKLYKELVKNYNPLERPVANDSQPLTVYFSLSLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 QIMDVDEKNQVLTTNIWLQMSWTDHYLQWNVSEYPGVKTVRFPDGQIWKPDILLYNSADE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QIMDVDEKNQVLTTNIWLQMSWTDHYLQWNVSEYPGVKTVRFPDGQIWKPDILLYNSADE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFKSSCYIDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFKSSCYIDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYECCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYECCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 CVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFAST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 MIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRGLDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRGLDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQDESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQDESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTI
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE2 ICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
::::::::::::::::::::::
CCDS10 ICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
490 500
>>CCDS53924.1 CHRNA7 gene_id:1139|Hs109|chr15 (531 aa)
initn: 3474 init1: 3360 opt: 3360 Z-score: 4089.7 bits: 766.3 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 3420; 94.5% identity (94.5% similar) in 531 aa overlap (1-502:1-531)
10 20 30
pF1KE2 MRCSPGGVWLALAASLLH-----------------------------VSLQGEFQRKLYK
:::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS53 MRCSPGGVWLALAASLLHGKATASPPSTPPWDPGHIPGASVRPAPGPVSLQGEFQRKLYK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 ELVKNYNPLERPVANDSQPLTVYFSLSLLQIMDVDEKNQVLTTNIWLQMSWTDHYLQWNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ELVKNYNPLERPVANDSQPLTVYFSLSLLQIMDVDEKNQVLTTNIWLQMSWTDHYLQWNV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 SEYPGVKTVRFPDGQIWKPDILLYNSADERFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFKSSCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SEYPGVKTVRFPDGQIWKPDILLYNSADERFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFKSSCY
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 IDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDLQMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDLQMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500
pF1KE2 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
490 500 510 520 530
>>CCDS32184.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs109|chr15 (412 aa)
initn: 2685 init1: 2685 opt: 2685 Z-score: 3269.1 bits: 614.1 E(33420): 9.3e-176
Smith-Waterman score: 2685; 100.0% identity (100.0% similar) in 385 aa overlap (118-502:28-412)
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 QWNVSEYPGVKTVRFPDGQIWKPDILLYNSADERFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MQKYCIYQHFQFQLLIQHLWIAANCDIADERFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFK
10 20 30 40 50
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 SSCYIDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDLQMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSCYIDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDLQMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSE
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 RFYECCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RFYECCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGIT
120 130 140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 VLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKM
180 190 200 210 220 230
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 PKWTRVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PKWTRVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYI
240 250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 GFRGLDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GFRGLDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRF
300 310 320 330 340 350
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 RCQDESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RCQDESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
360 370 380 390 400 410
>>CCDS42008.1 CHRFAM7A gene_id:89832|Hs109|chr15 (321 aa)
initn: 2206 init1: 2206 opt: 2206 Z-score: 2687.2 bits: 506.1 E(33420): 2.4e-143
Smith-Waterman score: 2206; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (182-502:1-321)
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 IDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGWSLDLQMQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MQEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYE
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CCKEPYPDVTFTVTMRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLS
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWT
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRG
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQD
220 230 240 250 260 270
460 470 480 490 500
pF1KE2 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
280 290 300 310 320
>>CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs109|chr8 (529 aa)
initn: 571 init1: 571 opt: 1232 Z-score: 1497.5 bits: 286.7 E(33420): 4.4e-77
Smith-Waterman score: 1233; 42.2% identity (69.8% similar) in 483 aa overlap (24-494:57-525)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MRCSPGGVWLALAASLLHVSLQGEFQRKLYKELVKNYNPLERPVANDSQPLTV
: . .:.:.: ..:: ::: : :. . :
CCDS60 EEAKRPPPRAPGDPLSSPSPTALPQGGSHTETEDRLFKHLFRGYNRWARPVPNTSDVVIV
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 YFSLSLLQIMDVDEKNQVLTTNIWLQMSWTDHYLQWNVSEYPGVKTVRFPDGQIWKPDIL
:.::. :..:::::::..:::.::.. :.:. :.:: ... .. ..: :. .:: :::.
CCDS60 RFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLRVPSEMIWIPDIV
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LYNSADERFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFKSSCYIDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSY
:::.:: .: .: :.. . :.: ...::.:.:::: ::: .:::: :.::.:::::.:
CCDS60 LYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCKMKFGSWTY
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GGWSLDL-QM-QEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYECCKEPYPDVTFTVTMRRRTL
..:: :: : .:.. : .::: .:. : . . :.:: : :::::.. ..:: :
CCDS60 DKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPDVTYAFVIRRLPL
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 YYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVP
.: .::.:::.::: :..::: ::.: ::::.: :.::::::::.::..::.:.:: .:
CCDS60 FYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEIIPSTSLVIP
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340
pF1KE2 LIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVILLNWCA--WFLRMKRPG
::..:. :::.: ::.:.::.::. ::..:. ::.:.: ::. :. :.: :.::
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350 360 370 380 390 400
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: . : ...: :: .. . . : :. .:. :.
CCDS60 -----PPVEL----CHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSVGT
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.: :.. . : . : ::. :. .: . : :: :.:::...: .: . .: .::
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..: :.::. : : . .. :::... : :.
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10 20 30 40 50
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:: . : : ::: :. .: ...:...: ..:: . ::::: :.:.
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..: .:. :.. ::: ::.. ::.::.. :.:. :.:: :.: :.. .: : .:::::
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:: ..:: . . ... : .::: .. :: . . :.::.: :::.:... .::
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230 240 250 260 270 280
pF1KE2 TLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDS
:.: .::.:::.::: :..::: ::.: :::..: :.::::::::.:...: .:.::
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350 360 370 380 390 400
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.. . :. : ..:.: . .... :. ::. .: . .
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.. : . : . : : .. :: . . .. :.:::. .. :.:.. . ..::..
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: :.::. : .:.. :. : :...
CCDS10 AMVIDRIFLWVFTLVCILGTAGLFLQPLMAREDA
480 490 500
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10 20 30 40 50
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60 70 80 90 100 110
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..:: :: : .:.. : .::: .:. : . . :.:: : :::::.. ..:: :
CCDS64 DKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPDVTYAFVIRRLPL
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 YYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVP
.: .::.:::.::: :..::: ::.: ::::.: :.::::::::.::..::.:.:: .:
CCDS64 FYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEIIPSTSLVIP
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pF1KE2 LIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVILLNWCA--WFLRMKRPG
::..:. :::.: ::.:.::.::. ::..:. ::.:.: ::. :. :.: :.::
CCDS64 LIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPSTHTMPHWVRGALLG-CVPRWLL-MNRPP
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pF1KE2 EDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASN--GNLLYIGFRGLDGVHCVP--TPDSGV
: . : ...: :: .. . . : :. .:. :.
CCDS64 -----PPVEL----CHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSVGT
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pF1KE2 VC--GRM--ACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQDESEAVCSEWK
.: :.. . : . : ::. :. .: . : :: :.:::...: .: . .: .::
CCDS64 LCSHGHLHSGASGPKAEALLQEGEL-LLSPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKEDWK
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pF1KE2 FAACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
..: :.::. : : . .. :::... : :.
CCDS64 YVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFL--PPFLAGMI
480 490 500 510
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10 20 30 40 50
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:: . : : ::: :. .: ...:...: ..:: . ::::: :.:.
CCDS53 MGSGPLSLPLALSPPRLLLLLLLSLLPVARASEAEHRLFERLFEDYNEIIRPVANVSDPV
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pF1KE2 TVYFSLSLLQIMDVDEKNQVLTTNIWLQMSWTDHYLQWNVSEYPGVKTVRFPDGQIWKPD
..: .:. :.. ::: ::.. ::.::.. :.:. :.:: :.: :.. .: : .:::::
CCDS53 IIHFEVSMSQLVKVDEVNQIMETNLWLKQIWNDYKLKWNPSDYGGAEFMRVPAQKIWKPD
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pF1KE2 ILLYNSADERFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFKSSCYIDVRWFPFDVQHCKLKFGSW
:.:::.: :.. .:..:.. .:. ..::.:::::: ::: .:::: :.: .:::::
CCDS53 IVLYNNAVGDFQVDDKTKALLKYTGEVTWIPPAIFKSSCKIDVTYFPFDYQNCTMKFGSW
130 140 150 160 170 180
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pF1KE2 SYGGWSLDLQM--QEADISGYIPNGEWDLVGIPGKRSERFYECCKEPYPDVTFTVTMRRR
:: ..:: . . ... : .::: .. :: . . :.::.: :::.:... .::
CCDS53 SYDKAKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEEIYPDITYSLYIRRL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 TLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDS
:.: .::.:::.::: :..::: ::.: :::..: :.::::::::.:...: .:.::
CCDS53 PLFYTINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 VPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVILLNWCAWFLRMKRPG
.:::..:. :::.: ::.:.::.::. :.. : ::.:.....:: . : ::
CCDS53 IPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTTHTMPSWVKTVFLNLLPRVMFMTRPT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 EDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRGLDGV--HC----VPTPDS
.. . :. : ..:.: . .... :. ::. .: . .
CCDS53 SNE-----GNAQKPRPLYGAELSNLNCFSRAESKGCKEGYPCQDGMCGYCHHRRIKISNF
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.. : . : . : : .. :: . . .. :.:::. .. :.:..
CCDS53 SANLTRSSSSESVDAVLSLSALSPE----IKEAIQSVKYIAENMKAQNEAKEEQKAQEIQ
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500
pF1KE2 ACVVDRLCLMAFSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
CCDS53 QLKRKEKSTETSDQEPGL
480
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10 20 30 40
pF1KE2 MRCSPGGVWLALAASLLHVSLQGEFQRKLYKELVKNYNPLERPVAND
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CCDS13 MELGGPGAPRLLPPLLLLLGTGLLRASS--HVETRAHAEERLLKKLFSGYNKWSRPVANI
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CCDS13 SDVVLVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWVKQEWHDYKLRWDPADYENVTSIRIPSELI
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CCDS13 WRPDIVLYNNADGDFAVTHLTKAHLFHDGRVQWTPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCTMK
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::::.: ..:: . ...: . .::: .: : . : :::: : :::.:.. .
CCDS13 FGSWTYDKAKIDLVNMHSRVDQLDFWESGEWVIVDAVGTYNTRKYECCAEIYPDITYAFV
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pF1KE2 MRRRTLYYGLNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPA
.:: :.: .::.:::.::: :..::: ::.. ::::.: :.::::::::.::..::.:.
CCDS13 IRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSECGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEIIPS
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pF1KE2 TSDSVPLIAQYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVILLNWCAWFLRM
:: .:::..:. :::.: ::.:.::.::. ::..: :: :.: ..:. .: :
CCDS13 TSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRTHTMPTWVRRVFLDIVPRLLLM
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pF1KE2 KRPG--EDKVRPACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRGLDGVHCVPTPDS
:::. .:. : . .. : . :::..:. ... . ::: :
CCDS13 KRPSVVKDNCRRLIESMHKMASAPRFWPEPEGEPPATSGTQ---SLHPPSPSFCVPL-DV
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pF1KE2 GVVCGRMACSPTHDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQDESEAVCSEWKFA
. : .:. :. : :: :..
CCDS13 PAEPGP-SCKSPSDQ--LPPQQPLEAEKASPHPSPGPCRPPHGTQAPGLAKARSLSVQHM
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MRCSPGGVWLALAASLLHVSLQGEFQRKLYKELVKNYNPLERPVANDSQPLTVYFS
.:.. ::...: ::. ::::. .: :.: .
CCDS77 MGLRSHHLSLGLLLLFLLPAECLGAEGRLALKLFRDLFANYTSALRPVADTDQTLNVTLE
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CCDS77 VTLSQIIDMDERNQVLTLYLWIRQEWTDAYLRWDPNAYGGLDAIRIPSSLVWRPDIVLYN
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pF1KE2 SADERFDATFHTNVLVNSSGHCQYLPPGIFKSSCYIDVRWFPFDVQHCKLKFGSWSYGGW
.:: . .. :::.. .: .. :.: .::: .:: ::::.::: : ::::..::
CCDS77 KADAQPPGSASTNVVLRHDGAVRWDAPAITRSSCRVDVAAFPFDAQHCGLTFGSWTHGGH
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.::.. . :... .. : :: ..:.:..: : ::.:::::::::. .:::. :
CCDS77 QLDVRPRGAAASLADFVENVEWRVLGMPARRRVLTYGCCSEPYPDVTFTLLLRRRAAAYV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LNLLIPCVLISALALLVFLLPADSGEKISLGITVLLSLTVFMLLVAEIMPATSDSVPLIA
:::.:::::: :: :.: ::::::::.:::.::::.::::.::.:: :: ..:::::.
CCDS77 CNLLLPCVLISLLAPLAFHLPADSGEKVSLGVTVLLALTVFQLLLAESMPP-AESVPLIG
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pF1KE2 QYFASTMIIVGLSVVVTVIVLQYHHHDPDGGKMPKWTRVILLNWCAWFLRMKRPGEDKVR
.:. .:: .: .:...:..... :. :. .: :.:..::. : : ... ::
CCDS77 KYYMATMTMVTFSTALTILIMNLHYCGPSVRPVPAWARALLLGHLARGLCVRERGE----
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pF1KE2 PACQHKQRRCSLASVEMSAVAPPPASNGNLLYIGFRGLDGVHCVPTPDSGVVCGRMACSP
: : . :.: : : : .: : : .: : . :
CCDS77 PCGQSRPP-------ELS---PSPQSP--------EGGAG------PPAGP-CHEPRCL-
360 370 380
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pF1KE2 THDEHLLHGGQPPEGDPDLAKILEEVRYIANRFRCQDESEAVCSEWKFAACVVDRLCLMA
..: ::: .: ::: :: . .. .:: : :.::. :
CCDS77 CRQEALLH----------------HVATIANTFRSHRAAQRCHEDWKRLARVMDRFFLAI
390 400 410 420 430
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pF1KE2 FSVFTIICTIGILMSAPNFVEAVSKDFA
: .... .. .:..:
CCDS77 FFSMALVMSLLVLVQAL
440 450
502 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Oct 2 18:31:42 2018 done: Tue Oct 2 18:31:43 2018
Total Scan time: 1.520 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]