Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2142
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2142, 962 aa
1>>>pF1KE2142 962 - 962 aa - 962 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5444+/-0.000997; mu= 8.1852+/- 0.060
mean_var=223.0407+/-45.438, 0's: 0 Z-trim(112.5): 47 B-trim: 134 in 1/48
Lambda= 0.085878
statistics sampled from 13232 (13273) to 13232 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.408), width: 16
Scan time: 5.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13771.1 ARVCF gene_id:421|Hs108|chr22 ( 962) 6462 814.3 0
CCDS73290.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 939) 2049 267.5 8.7e-71
CCDS44604.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 968) 2049 267.5 8.9e-71
CCDS53632.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 838) 1879 246.4 1.7e-64
CCDS44608.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 867) 1879 246.4 1.8e-64
CCDS55764.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 885) 1879 246.4 1.8e-64
CCDS55763.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 914) 1879 246.4 1.9e-64
CCDS44606.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 933) 1452 193.5 1.6e-48
CCDS44607.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 941) 1452 193.5 1.6e-48
CCDS44605.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 962) 1452 193.6 1.6e-48
CCDS33306.1 PKP4 gene_id:8502|Hs108|chr2 (1149) 1393 186.3 2.9e-46
CCDS33305.1 PKP4 gene_id:8502|Hs108|chr2 (1192) 1393 186.3 3e-46
CCDS44609.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 832) 1282 172.4 3.2e-42
CCDS53634.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 840) 1282 172.4 3.2e-42
CCDS53633.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 861) 1282 172.5 3.3e-42
CCDS55766.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 879) 1282 172.5 3.3e-42
CCDS55767.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 887) 1282 172.5 3.4e-42
CCDS55765.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 908) 1282 172.5 3.4e-42
CCDS75227.1 CTNND2 gene_id:1501|Hs108|chr5 ( 888) 1090 148.7 4.9e-35
CCDS75228.1 CTNND2 gene_id:1501|Hs108|chr5 (1134) 1090 148.8 5.8e-35
CCDS3881.1 CTNND2 gene_id:1501|Hs108|chr5 (1225) 1090 148.8 6.2e-35
CCDS30966.1 PKP1 gene_id:5317|Hs108|chr1 ( 747) 662 95.6 3.9e-19
CCDS31771.1 PKP2 gene_id:5318|Hs108|chr12 ( 837) 643 93.3 2.2e-18
CCDS7695.1 PKP3 gene_id:11187|Hs108|chr11 ( 797) 558 82.7 3.1e-15
CCDS30967.1 PKP1 gene_id:5317|Hs108|chr1 ( 726) 553 82.1 4.5e-15
CCDS8731.1 PKP2 gene_id:5318|Hs108|chr12 ( 881) 445 68.8 5.5e-11
>>CCDS13771.1 ARVCF gene_id:421|Hs108|chr22 (962 aa)
initn: 6462 init1: 6462 opt: 6462 Z-score: 4339.1 bits: 814.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6462; 100.0% identity (100.0% similar) in 962 aa overlap (1-962:1-962)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEDCNVHSAASILASVKEQEARFERLTRALEQERRHVALQLERAQQPGMVSGGMGSGQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEDCNVHSAASILASVKEQEARFERLTRALEQERRHVALQLERAQQPGMVSGGMGSGQPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PMAWQQLVLQEQSPGSQASLATMPEAPDVLEETVTVEEDPGTPTSHVSIVTSEDGTTRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PMAWQQLVLQEQSPGSQASLATMPEAPDVLEETVTVEEDPGTPTSHVSIVTSEDGTTRRT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ETKVTKTVKTVTTRTVRQVPVGPDGLPLLDGGPPLGPFADGALDRHFLLRGGGPVATLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ETKVTKTVKTVTTRTVRQVPVGPDGLPLLDGGPPLGPFADGALDRHFLLRGGGPVATLSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AYLSSGGGFPEGPEPRDSPSYGSLSRGLGMRPPRAGPLGPGPGDGCFTLPGHREAFPVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AYLSSGGGFPEGPEPRDSPSYGSLSRGLGMRPPRAGPLGPGPGDGCFTLPGHREAFPVGP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 EPGPPGGRSLPERFQAEPYGLEDDTRSLAADDEGGPELEPDYGTATRRRPECGRGLHTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EPGPPGGRSLPERFQAEPYGLEDDTRSLAADDEGGPELEPDYGTATRRRPECGRGLHTRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YEDTADDGGELADERPAFPMVTAPLAQPERGSMGSLDRLVRRSPSVDSARKEPRWRDPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YEDTADDGGELADERPAFPMVTAPLAQPERGSMGSLDRLVRRSPSVDSARKEPRWRDPEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PEVLAMLRHPVDPVKANAAAYLQHLCFENEGVKRRVRQLRGLPLLVALLDHPRAEVRRRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PEVLAMLRHPVDPVKANAAAYLQHLCFENEGVKRRVRQLRGLPLLVALLDHPRAEVRRRA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CGALRNLSYGRDTDNKAAIRDCGGVPALVRLLRAARDNEVRELVTGTLWNLSSYEPLKMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CGALRNLSYGRDTDNKAAIRDCGGVPALVRLLRAARDNEVRELVTGTLWNLSSYEPLKMV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IIDHGLQTLTHEVIVPHSGWEREPNEDSKPRDAEWTTVFKNTSGCLRNVSSDGAEARRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IIDHGLQTLTHEVIVPHSGWEREPNEDSKPRDAEWTTVFKNTSGCLRNVSSDGAEARRRL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RECEGLVDALLHALQSAVGRKDTDNKSVENCVCIMRNLSYHVHKEVPGADRYQEAEPGPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RECEGLVDALLHALQSAVGRKDTDNKSVENCVCIMRNLSYHVHKEVPGADRYQEAEPGPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 GSAVGSQRRRRDDASCFGGKKAKEEWFHQGKKDGEMDRNFDTLDLPKRTEAAKGFELLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSAVGSQRRRRDDASCFGGKKAKEEWFHQGKKDGEMDRNFDTLDLPKRTEAAKGFELLYQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 PEVVRLYLSLLTESRNFNTLEAAAGALQNLSAGNWMWATYIRATVRKERGLPVLVELLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PEVVRLYLSLLTESRNFNTLEAAAGALQNLSAGNWMWATYIRATVRKERGLPVLVELLQS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 ETDKVVRAVAIALRNLSLDRRNKDLIGSYAMAELVRNVRNAQAPPRPGACLEEDTVVAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ETDKVVRAVAIALRNLSLDRRNKDLIGSYAMAELVRNVRNAQAPPRPGACLEEDTVVAVL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 NTIHEIVSDSLDNARSLLQARGVPALVALVASSQSVREAKAASHVLQTVWSYKELRGTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NTIHEIVSDSLDNARSLLQARGVPALVALVASSQSVREAKAASHVLQTVWSYKELRGTLQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 KDGWTKARFQSAAATAKGPKGALSPGGFDDSTLPLVDKSLEGEKTGSRDVIPMDALGPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KDGWTKARFQSAAATAKGPKGALSPGGFDDSTLPLVDKSLEGEKTGSRDVIPMDALGPDG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 YSTVDRRERRPRGASSAGEASEKEPLKLDPSRKAPPPGPSRPAVRLVDAVGDAKPQPVDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YSTVDRRERRPRGASSAGEASEKEPLKLDPSRKAPPPGPSRPAVRLVDAVGDAKPQPVDS
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 WV
::
CCDS13 WV
>>CCDS73290.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (939 aa)
initn: 2312 init1: 1178 opt: 2049 Z-score: 1384.3 bits: 267.5 E(32554): 8.7e-71
Smith-Waterman score: 2660; 47.8% identity (71.8% similar) in 967 aa overlap (1-927:1-930)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEDCNVHSAASILASVKEQEARFERLTRALEQERRHVALQLERAQ------QPGMVSGGM
:.: .:.:.::::::::::::.::.::::::.:::::. ::::.. .: :..: .
CCDS73 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 G----SGQPL---PMAWQQLV-LQEQSPGSQASL--ATMP--EAPDVLEETVTVEEDPGT
.:. . . :.. :. ..: ... : .:.: . : . :: : ::::
CCDS73 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYT-EEDPEG
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 PTSHVSIVTSEDGTTRRTETKVTKTVKTVTTRTVRQVPVGPDGLPLLDGGPPLGPFADGA
: ::. ::.::::::::: : :.:::::::::. : .::::::. :.. . . . .
CCDS73 AMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPV-DASSVSNNYIQ-T
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE2 LDRHFLLRG-GGP--------VATLSRAYLSSGGGFPEGPE---PRDSPSYGSLSRGLGM
: : : : ::: .::: : . :. . : : : .:::::: .
CCDS73 LGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE2 RPPRAGPLGPGPGDGCFTLPGHREAFPVGPEPGPP-GGRSLP-ERFQAEPYGLEDDTRSL
. : : : . :...... ::.: :: :. .::. :::::::: ::.
CCDS73 EE-RYRPSMEG-----YRAPSRQDVY--GPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSM
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 AADD-EGGPELEPDYGTATRRRPECGRGLHTRAYEDTADDGGELADERPAFPMVTAPLAQ
. :: . : . ::::: : . :.::: ...: :. . :::::
CCDS73 GYDDLDYG--MMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDM------IGEEVPSDQYYWAPLAQ
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330 340 350 360 370 380
pF1KE2 PERGSMGSLDRLVRRSPSVDSARKEPRWRDPELPEVLAMLRHPVDPVKANAAAYLQHLCF
::::..::: : . .: : ::.::::::.::: .: ::.::::::::::.
CCDS73 HERGSLASLDSLRKGGPP------PPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCY
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pF1KE2 ENEGVKRRVRQLRGLPLLVALLDHPRAEVRRRACGALRNLSYGRDTDNKAAIRDCGGVPA
.:. :: ::.:.:.:.::.:::::. ::. :::::.:.:.::: ::: ::..: ::::
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450 460 470 480 490 500
pF1KE2 LVRLLRAARDNEVRELVTGTLWNLSSYEPLKMVIIDHGLQTLTHEVIVPHSGWEREPNED
:::::: ::: .. :..:::::::::.. .:: :.::.:..:: :::.::::::::::::
CCDS73 LVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNED
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 SKPRDAEWTTVFKNTSGCLRNVSSDGAEARRRLRECEGLVDALLHALQSAVGRKDTDNKS
::: :: .:. ::.::::::::. .::::.::::.::::::. .:. .:.::.:.:
CCDS73 CKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKL
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570 580 590 600 610 620
pF1KE2 VENCVCIMRNLSYHVHKEVPGADRYQEAEPGPLGSAVGSQRRRRDDASCFGGKKAKEEWF
::::::..:::::.::.:.: :.::::: :. ... .: . :::::.::.:.:::
CCDS73 VENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPN-VANNTGPHA-----ASCFGAKKGKDEWF
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pF1KE2 HQGKKDGEMDRNFDTLDLPKRTEAAKGFELLYQPEVVRLYLSLLTESRNFNTLEAAAGAL
.::: : : ::.:.:::: :.:.:::.::::::.:.::: ::.. :::.:::.
CCDS73 SRGKKPIE-DPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAI
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pF1KE2 QNLSAGNWMWATYIRATVRKERGLPVLVELLQSETDKVVRAVAIALRNLSLDRRNKDLIG
::: :: : .. :::...:.:..: ....:: .: ..::.:.. :::::..: :::.:::
CCDS73 QNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIG
690 700 710 720 730 740
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pF1KE2 SYAMAELVRNVRNAQAPPRPGACLEEDTVVAVLNTIHEIVSDSLDNARSLLQARGVPALV
..:. .::.:. ..: . . ::::...::::.:.....:. :..: ...:. ::
CCDS73 KHAIPNLVKNLPGGQQ--NSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLV
750 760 770 780 790 800
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 ALVAS-SQSVREAKAASHVLQTVWSYKELRGTLQKDGWTKARFQSAAATAKGPKGALSPG
. : ..: .:..::. ::::.:.::::: :.:.:: :. :: .:. ... :
CCDS73 LINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS--
810 820 830 840 850 860
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 GFDDSTLPLVDKSLEGEKTGSRDVIPMDALGPD------GYSTVDRRERRPRGASSAGEA
.:::::::.:.. ...: .:. : :. .: . .::: ..: . : . .:.
CCDS73 -YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDL
870 880 890 900 910 920
930 940 950 960
pF1KE2 SEKEPLKLDPSRKAPPPGPSRPAVRLVDAVGDAKPQPVDSWV
.. ::::
CCDS73 GDMEPLKGTTPLMQKI
930
>>CCDS44604.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (968 aa)
initn: 2312 init1: 1178 opt: 2049 Z-score: 1384.2 bits: 267.5 E(32554): 8.9e-71
Smith-Waterman score: 2660; 47.8% identity (71.8% similar) in 967 aa overlap (1-927:1-930)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEDCNVHSAASILASVKEQEARFERLTRALEQERRHVALQLERAQ------QPGMVSGGM
:.: .:.:.::::::::::::.::.::::::.:::::. ::::.. .: :..: .
CCDS44 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 G----SGQPL---PMAWQQLV-LQEQSPGSQASL--ATMP--EAPDVLEETVTVEEDPGT
.:. . . :.. :. ..: ... : .:.: . : . :: : ::::
CCDS44 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYT-EEDPEG
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 PTSHVSIVTSEDGTTRRTETKVTKTVKTVTTRTVRQVPVGPDGLPLLDGGPPLGPFADGA
: ::. ::.::::::::: : :.:::::::::. : .::::::. :.. . . . .
CCDS44 AMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPV-DASSVSNNYIQ-T
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE2 LDRHFLLRG-GGP--------VATLSRAYLSSGGGFPEGPE---PRDSPSYGSLSRGLGM
: : : : ::: .::: : . :. . : : : .:::::: .
CCDS44 LGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE2 RPPRAGPLGPGPGDGCFTLPGHREAFPVGPEPGPP-GGRSLP-ERFQAEPYGLEDDTRSL
. : : : . :...... ::.: :: :. .::. :::::::: ::.
CCDS44 EE-RYRPSMEG-----YRAPSRQDVY--GPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSM
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 AADD-EGGPELEPDYGTATRRRPECGRGLHTRAYEDTADDGGELADERPAFPMVTAPLAQ
. :: . : . ::::: : . :.::: ...: :. . :::::
CCDS44 GYDDLDYG--MMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDM------IGEEVPSDQYYWAPLAQ
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 PERGSMGSLDRLVRRSPSVDSARKEPRWRDPELPEVLAMLRHPVDPVKANAAAYLQHLCF
::::..::: : . .: : ::.::::::.::: .: ::.::::::::::.
CCDS44 HERGSLASLDSLRKGGPP------PPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCY
350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 ENEGVKRRVRQLRGLPLLVALLDHPRAEVRRRACGALRNLSYGRDTDNKAAIRDCGGVPA
.:. :: ::.:.:.:.::.:::::. ::. :::::.:.:.::: ::: ::..: ::::
CCDS44 RNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPA
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 LVRLLRAARDNEVRELVTGTLWNLSSYEPLKMVIIDHGLQTLTHEVIVPHSGWEREPNED
:::::: ::: .. :..:::::::::.. .:: :.::.:..:: :::.::::::::::::
CCDS44 LVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNED
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 SKPRDAEWTTVFKNTSGCLRNVSSDGAEARRRLRECEGLVDALLHALQSAVGRKDTDNKS
::: :: .:. ::.::::::::. .::::.::::.::::::. .:. .:.::.:.:
CCDS44 CKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKL
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::::::..:::::.::.:.: :.::::: :. ... .: . :::::.::.:.:::
CCDS44 VENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPN-VANNTGPHA-----ASCFGAKKGKDEWF
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.::: : : ::.:.:::: :.:.:::.::::::.:.::: ::.. :::.:::.
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::: :: : .. :::...:.:..: ....:: .: ..::.:.. :::::..: :::.:::
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..:. .::.:. ..: . . ::::...::::.:.....:. :..: ...:. ::
CCDS44 KHAIPNLVKNLPGGQQ--NSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLV
750 760 770 780 790 800
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. : ..: .:..::. ::::.:.::::: :.:.:: :. :: .:. ... :
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.:::::::.:.. ...: .:. : :. .: . .::: ..: . : . .:.
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.. ::::
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..: . . ::::...::::.:.....:. :..: ...:. :: . : ..: .:
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. :..:::::::::.. .:: :.::.:..:: :::.:::::::::::: ::: :: .:.
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CCDS44 TNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLS
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pF1KE2 NAQAPPRPGACLEEDTVVAVLNTIHEIVSDSLDNARSLLQARGVPALVALVAS-SQSVRE
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CCDS44 GGQ--QNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKE
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CCDS44 VRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS---YDDSTLPLIDR
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pF1KE2 SLEGEKTGSRDVIPMDALGPD------GYSTVDRRERRPRGASSAGEASEKEPLKLDPSR
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CCDS44 NQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPL
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pF1KE2 KAPPPGPSRPAVRLVDAVGDAKPQPVDSWV
CCDS44 MQDEGQESLEEELDVLVLDDEGGQVSYPSMQKI
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CCDS55 AYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAI
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:::::::: ::: :: .:. ::.::::::::. .::::.::::.::::::. .:. .:
CCDS55 WEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIG
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CCDS55 QKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPN-VANNTGPHA-----ASCFGA
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CCDS55 KKGKDEWFSRGKKPIE-DPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAI
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pF1KE2 LEAAAGALQNLSAGNWMWATYIRATVRKERGLPVLVELLQSETDKVVRAVAIALRNLSLD
:::.:::.::: :: : .. :::...:.:..: ....:: .: ..::.:.. :::::..:
CCDS55 LEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVD
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pF1KE2 RRNKDLIGSYAMAELVRNVRNAQAPPRPGACLEEDTVVAVLNTIHEIVSDSLDNARSLLQ
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CCDS55 ARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQ--NSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRE
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CCDS55 TQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASR
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... : .:::::::.:.. ...: .:. : :. .: . .::: ..: . :
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920 930 940 950 960
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. .:. .. ::::
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.::.:.: ::::::..:::::.::.:.: :.::::: :. ... .: . :::::.
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::.:.::: .::: : : ::.:.:::: :.:.:::.::::::.:.::: ::..
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CCDS55 ARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQ--NSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRE
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CCDS55 SQSSHS---YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNR
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CCDS55 TLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQDEGQESLEEELDVLVLDDEGGQVSYPSMQKI
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CCDS44 -YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDL
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CCDS44 GDMEPLKGTTPLMQKI
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CCDS44 AMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPV-DASSVSNNYIQ-T
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pF1KE2 LDRHFLLRG-GGP--------VATLSRAYLSSGGGFPEGPE---PRDSPSYGSLSRGLGM
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CCDS44 LGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRI
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CCDS44 EE-RYRPSMEG-----YRAPSRQDVY--GPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSM
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CCDS44 GYDDLDYG--MMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDM------IGEEVPSDQYYWAPLAQ
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CCDS44 HERGSLASLDSLRKGGPP------PPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCY
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CCDS44 LVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNED
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CCDS44 VENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPN-VANNTGPHA-----ASCFGAKKGK----
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CCDS44 --GKKPIE-DPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAI
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CCDS44 QNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIG
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CCDS44 KHAIPNLVKNLPGGQQ--NSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLV
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CCDS44 LINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS--
810 820 830 840 850
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pF1KE2 GFDDSTLPLVDKSLEGEKTGSRDVIPMDALGPDGYSTVDRRERRPRGASSAGEASEKEPL
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CCDS44 -YDDSTLPLIDRNQKSD---------------NNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPL
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:
CCDS44 KGTTPLMQDEGQESLEEELDVLVLDDEGGQVSYPSMQKI
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MEDCNVHSAASILASVKEQEARFERLTRALEQERRHVALQLERAQ------QPGMVSGGM
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CCDS44 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
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