Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2133
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2133, 993 aa
1>>>pF1KE2133 993 - 993 aa - 993 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4407+/-0.0017; mu= 1.1470+/- 0.095
mean_var=544.9754+/-134.043, 0's: 0 Z-trim(103.9): 339 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.054940
statistics sampled from 7361 (7648) to 7361 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 4.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13 ( 993) 6715 549.8 9.9e-156
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 972) 1512 137.4 1.4e-31
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 976) 1504 136.8 2.1e-31
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 ( 972) 1465 133.7 1.8e-30
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338) 1166 110.2 2.9e-23
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356) 1137 107.9 1.4e-22
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4 (1089) 765 78.3 9.6e-14
CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5 (1106) 735 75.9 5e-13
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298) 729 75.5 7.6e-13
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363) 729 75.6 7.8e-13
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 653 69.0 3.3e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 653 69.1 3.6e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 653 69.1 3.6e-11
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 653 69.1 3.6e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 653 69.1 3.7e-11
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 653 69.2 3.9e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 653 69.2 3.9e-11
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 653 69.2 3.9e-11
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 644 68.4 5.9e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 644 68.4 5.9e-11
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 644 68.5 6.3e-11
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 644 68.5 6.3e-11
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 637 67.8 8.5e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 637 67.9 9.1e-11
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 636 67.8 9.3e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 636 67.8 9.4e-11
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 636 67.8 9.9e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 636 67.9 9.9e-11
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 636 67.9 9.9e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 636 67.9 9.9e-11
>>CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13 (993 aa)
initn: 6715 init1: 6715 opt: 6715 Z-score: 2909.4 bits: 549.8 E(32554): 9.9e-156
Smith-Waterman score: 6715; 99.8% identity (99.8% similar) in 993 aa overlap (1-993:1-993)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MPALARGGGQLPLLVVFSAMIFGTITNQDLPVIKCVLINHKNNDSSVGKSSSYPMVSESP
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPALARDGGQLPLLVVFSAMIFGTITNQDLPVIKCVLINHKNNDSSVGKSSSYPMVSESP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EDLGCALRPQSSGTVYEAAAVEVDVSASITLQVLVDAPGNISCLWVFKHSSLNCQPHFDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EDLGCALRPQSSGTVYEAAAVEVDVSASITLQVLVDAPGNISCLWVFKHSSLNCQPHFDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QNRGVVSMVILKMTETQAGEYLLFIQSEATNYTILFTVSIRNTLLYTLRRPYFRKMENQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QNRGVVSMVILKMTETQAGEYLLFIQSEATNYTILFTVSIRNTLLYTLRRPYFRKMENQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ALVCISESVPEPIVEWVLCDSQGESCKEESPAVVKKEEKVLHELFGMDIRCCARNELGRE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS31 ALVCISESVPEPIVEWVLCDSQGESCKEESPAVVKKEEKVLHELFGTDIRCCARNELGRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 CTRLFTIDLNQTPQTTLPQLFLKVGEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELENKALEEGNYFEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CTRLFTIDLNQTPQTTLPQLFLKVGEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELENKALEEGNYFEM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 STYSTNRTMIRILFAFVSSVARNDTGYYTCSSSKHPSQSALVTIVEKGFINATNSSEDYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STYSTNRTMIRILFAFVSSVARNDTGYYTCSSSKHPSQSALVTIVEKGFINATNSSEDYE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IDQYEEFCFSVRFKAYPQIRCTWTFSRKSFPCEQKGLDNGYSISKFCNHKHQPGEYIFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IDQYEEFCFSVRFKAYPQIRCTWTFSRKSFPCEQKGLDNGYSISKFCNHKHQPGEYIFHA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASASQASCFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASASQASCFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEITE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ELKMMTQLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ELKMMTQLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 HNFSFYPTFQSHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEIEYENQKRLEEEEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HNFSFYPTFQSHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEIEYENQKRLEEEEDL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 NVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 NYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 LIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDG
910 920 930 940 950 960
970 980 990
pF1KE2 RVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
970 980 990
>>CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (972 aa)
initn: 1394 init1: 781 opt: 1512 Z-score: 680.7 bits: 137.4 E(32554): 1.4e-31
Smith-Waterman score: 1639; 33.8% identity (61.6% similar) in 956 aa overlap (47-958:20-935)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 FSAMIFGTITNQDLPVIKCVLINHKNNDSSVGKSSSYPMVSESPEDLGCALRPQSSGTVY
: .:: : :: . : ...: .: .
CCDS47 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPG-EPSPPSIHPGKSDLI-
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 EAAAVEVDVSASITLQVLVDAPGNISCLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTET
: :. : : : :: .. :.:. . . . . ::. .. : :
CCDS47 ------VRVGDEIRL--LCTDPGFVK--WTFE---ILDETNENKQNEWITE----KAEAT
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 QAGEYLLFIQSEATNYTILFTVSIRNTL-LYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVE
..:.: . .: .: .:. :. . : . : :..:.:: . :: ...
CCDS47 NTGKYTCTNKHGLSNSIYVF---VRDPAKLFLVDRSLYGK-EDNDTLVRCPLTDPE-VTN
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240
pF1KE2 WVLCDSQGESCKEE-----SPA---VVKKEEKVLHELFGMDIRCCARNELGRECTRLFTI
. : ::. .. .: ..:. ... :.: ..: . .: .. : .
CCDS47 YSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLC---LHCSVDQEGKSVLSEKFIL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KE2 DL----NQTPQTTLPQ--LFLKVGEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELEN---KALEEGNYF
. . .: ... . .:. :: . . : :. . ::. :: : :. : .
CCDS47 KVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWKRENSQTKLQEKYNSW
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EMSTYSTNRTMIRILFAFVSSVARNDTGYYTCSSSKHPSQSALVT---IVEKGFINATNS
. . .. .: .::. ::.: . : ... ... ..: .:.:::::
CCDS47 HHGDFNYERQATLT----ISSARVNDSGVFMCYANNTFGSANVTTTLEVVDKGFINIFPM
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 -SEDYEIDQYEEFCFSVRFKAYPQIRCT-WTFSRKSFPCEQKGLDNGYSIS--KFCNHKH
. ... :. . :...:.:. . : . ..: . . .. . : .. .. :
CCDS47 INTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKSENESNIRYVSELH
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460
pF1KE2 -------QPGEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLA--EASASQASCFSDGYPLPSW
. : : : . :.:.. . :.. . ::..:. . .. .: . :.: :.
CCDS47 LTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDRLVNGMLQCVAAGFPEPTI
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 TWKKCSDKSPNCTEEITE-GVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLG
: : :. . : . ... ::. : .:... : .. :.: :::..:
CCDS47 DWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVG
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KE2 -TSCETILLNSPGPFP---FIQDNISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQ
:: . . : : :.: . :. .....:: .:: .. :: : .
CCDS47 KTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILT----YKYLQKPMYEVQWK
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 MVQ-VTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTG
.:. ..: :.: :.: . :: ::::::. : :::.::.::::::..:::::. :.
CCDS47 VVEEING---NNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSD
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 VSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCY
... ::::::: .: .::::::::::... ::.: ::::::::::..:: .: :::::
CCDS47 AAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCY
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 GDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSFYPTFQSHPNSSMPGSRE-VQIHPDSDQISGL
:::::.:: ::..: . : : . . ..:. .: .. : ....: . .
CCDS47 GDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAAL-YKNLLHSKESSCSDSTNEYMDMKPGVSYVVPT
680 690 700 710 720 730
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 HGNSFHSE---DEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDL
.... .: . :: . . :...: .: .:::: :.::::::: :: :.:.::::
CCDS47 KADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDEL-ALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDL
740 750 760 770 780
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 AARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVW
::::.:.:::...::::::::::: .::::::.::::::::::::::.:. .::..::::
CCDS47 AARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVW
790 800 810 820 830 840
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 SYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRK
::::.:::.:::: .::::.:::..:::.:..::.: .: .: :.: ::..:: : :
CCDS47 SYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLK
850 860 870 880 890 900
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 RPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVED
::.: ...... :.... . .:.:.
CCDS47 RPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVH
910 920 930 940 950 960
>>CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (976 aa)
initn: 1394 init1: 781 opt: 1504 Z-score: 677.2 bits: 136.8 E(32554): 2.1e-31
Smith-Waterman score: 1636; 33.5% identity (61.4% similar) in 960 aa overlap (47-958:20-939)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 FSAMIFGTITNQDLPVIKCVLINHKNNDSSVGKSSSYPMVSESPEDLGCALRPQSSGTVY
: .:: : :: . : ...: .: .
CCDS34 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPG-EPSPPSIHPGKSDLI-
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 EAAAVEVDVSASITLQVLVDAPGNISCLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTET
: :. : : : :: .. :.:. . . . . ::. .. : :
CCDS34 ------VRVGDEIRL--LCTDPGFVK--WTFE---ILDETNENKQNEWITE----KAEAT
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 QAGEYLLFIQSEATNYTILFTVSIRNTL-LYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVE
..:.: . .: .: .:. :. . : . : :..:.:: . :: ...
CCDS34 NTGKYTCTNKHGLSNSIYVF---VRDPAKLFLVDRSLYGK-EDNDTLVRCPLTDPE-VTN
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240
pF1KE2 WVLCDSQGESCKEE-----SPA---VVKKEEKVLHELFGMDIRCCARNELGRECTRLFTI
. : ::. .. .: ..:. ... :.: ..: . .: .. : .
CCDS34 YSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLC---LHCSVDQEGKSVLSEKFIL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KE2 DL----NQTPQTTLPQ--LFLKVGEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELEN---KALEEGNYF
. . .: ... . .:. :: . . : :. . ::. :: : :. : .
CCDS34 KVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWKRENSQTKLQEKYNSW
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EMSTYSTNRTMIRILFAFVSSVARNDTGYYTCSSSKHPSQSALVT---IVEKGFINATNS
. . .. .: .::. ::.: . : ... ... ..: .:.:::::
CCDS34 HHGDFNYERQATLT----ISSARVNDSGVFMCYANNTFGSANVTTTLEVVDKGFINIFPM
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 -SEDYEIDQYEEFCFSVRFKAYPQIRCT-WTFSRKSFPCEQKGLDNGYSIS--KFCNHKH
. ... :. . :...:.:. . : . ..: . . .. . : .. .. :
CCDS34 INTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKSENESNIRYVSELH
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460
pF1KE2 -------QPGEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLA--EASASQASCFSDGYPLPSW
. : : : . :.:.. . :.. . ::..:. . .. .: . :.: :.
CCDS34 LTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDRLVNGMLQCVAAGFPEPTI
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 TWKKCSDKSPNCTEEITE-GVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLG
: : :. . : . ... ::. : .:... : .. :.: :::..:
CCDS34 DWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVG
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KE2 TSCETILLNSPG-------PFP-FIQDNISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYE
. . . : : : :.: . :. .....:: .:: .. ::
CCDS34 KTSAYFNFAFKGNNKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILT----YKYLQKPMYE
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 SQLQMVQ-VTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGI
: ..:. ..: :.: :.: . :: ::::::. : :::.::.::::::..:::::.
CCDS34 VQWKVVEEING---NNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGL
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 SKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFE
:. ... ::::::: .: .::::::::::... ::.: ::::::::::..:: .: :
CCDS34 IKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITE
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 YCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSFYPTFQSHPNSSMPGSRE-VQIHPDSDQ
:::::::::.:: ::..: . : : . . ..:. .: .. : ....: .
CCDS34 YCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAAL-YKNLLHSKESSCSDSTNEYMDMKPGVSY
680 690 700 710 720 730
760 770 780 790 800
pF1KE2 ISGLHGNSFHSE---DEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCV
. .... .: . :: . . :...: .: .:::: :.::::::: :: :.:.
CCDS34 VVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDEL-ALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCI
740 750 760 770 780
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 HRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIK
::::::::.:.:::...::::::::::: .::::::.::::::::::::::.:. .::..
CCDS34 HRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFE
790 800 810 820 830 840
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 SDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAF
::::::::.:::.:::: .::::.:::..:::.:..::.: .: .: :.: ::..::
CCDS34 SDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDA
850 860 870 880 890 900
930 940 950 960 970 980
pF1KE2 DSRKRPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQA
: :::.: ...... :.... . .:.:.
CCDS34 DPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQP
910 920 930 940 950 960
>>CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 (972 aa)
initn: 1426 init1: 785 opt: 1465 Z-score: 660.5 bits: 133.7 E(32554): 1.8e-30
Smith-Waterman score: 1562; 38.1% identity (65.7% similar) in 741 aa overlap (253-958:203-926)
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 ELFGMDIRCCARNELGRECTRLFTIDLNQTPQTTL-PQLFLKV-GEPLWIRCKAVHVNHG
: :: : .... :: : :.: :. .
CCDS43 QDYQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVN
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330
pF1KE2 FGLTWELENKALEEGNYFEMSTYSTNRTMIRILFAFVSSVARNDTGYYTCSSS----KHP
: . . .: : ..: . .:: . ..: ...: . .: :.: .: ::
CCDS43 FDVFLQHNNTKLA---IPQQSDFHNNRYQ-KVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKH-
240 250 260 270 280
340 350 360 370 380
pF1KE2 SQSALVTIVEKGFIN-ATNSSEDYEIDQYEEFCFSVRFKAYPQIR-CTWTF-----SRKS
: : . .::....: ..... :. : . ..: .::: .. .::. ...
CCDS43 STSMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQP
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 FP-----CEQKGLDNGYSISKFCNHKHQPGEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAE
: . . ...: . . :.: : :.: . . : :..: :.: .
CCDS43 EPKLANATTKDTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEVSVI
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490
pF1KE2 ASASQAS----CFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEITEGVWNRKA----NRKVFGQWV
. ..: : ..::: :. :: .:: .. : : . ::. ... : . .
CCDS43 WTFINGSGTLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVT
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 SSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQDNISFYATIGVCL---L
.: :.. .. .: :.::.:.. ... : : :.. : .. .:.
CCDS43 VQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMA
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 FIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLEFG
....: ::. .:::.. .:. . .... . : : ..: . :. ::::::.::.::
CCDS43 LLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIE--SYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFG
530 540 550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 KVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSHEN
:.::.::::::..:::.:..: . ..::::::: : ..:.::::::::.:..::.:::
CCDS43 KTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHEN
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 IVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSF-YPTFQSH
::::::::: .::. .: ::::::::::.:: : : . .. . . : ... .
CCDS43 IVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLE
650 660 670 680 690 700
740 750 760 770 780
pF1KE2 PN----SSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDL
. .: .:. :. . . .: ..:: ::.... :. . :: ..::
CCDS43 KKYVRRDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSNDSF-SEQDLDKEDGRPLE---------LRDL
710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 LCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNA
: :. :::.:: :: :.:.:::.::::::.:.:.:.:: :::::::::.::::.:.:::
CCDS43 LHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNA
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 RLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKM
:::::::::::.:. .::..:::::::::::::::::.:::::: :...::::...:..:
CCDS43 RLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQM
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 DQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLA-DAEEAMYQNVDGRVSECPH
:: .: ..:: :::.:::.. .::.: .. ::: : : .: : :.
CCDS43 AQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGS
880 890 900 910 920 930
970 980 990
pF1KE2 TYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
CCDS43 GSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
940 950 960 970
>>CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338 aa)
initn: 1063 init1: 695 opt: 1166 Z-score: 531.2 bits: 110.2 E(32554): 2.9e-23
Smith-Waterman score: 1208; 31.7% identity (58.4% similar) in 875 aa overlap (123-961:386-1167)
100 110 120 130 140
pF1KE2 VLVDAPGNISCLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTETQAGEYLLFI---QSEA
:: :..: .:: .::.: ... ::..
CCDS93 SMKVKAFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGY-SLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNV
360 370 380 390 400 410
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 -TNYTILFTVSIRNTL----LYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVEWVLCDSQGE
: : . :... . . .. : . . ... :.: . ..:.: ..: . .
CCDS93 FKNLTATLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHN
420 430 440 450 460 470
210 220 230 240 250
pF1KE2 SCKEESPAVVKKEEKVLHELFGMDIRCCARNELGRECTRLFTIDLNQTPQTTL-------
. . ..::. : .: :.. :. :. .. .::
CCDS93 HSEARCDFCSNNEES-----FILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRI
480 490 500 510 520
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 PQLFL-----KVGE-PLWIRCKAVHVNHGFGLTWELENKALEEGNYFEMSTYSTNRTMIR
... ::: : . : .:: .. : : ::. ...: ..:. . :
CCDS93 SGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLE---KMPTEGEDLKLSC-TVNKFLYR
530 540 550 560 570 580
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 ILFAFVSSVARNDTGYYTCSSSKHPSQSALVTIVEKGFINATNSSEDYEIDQYEEFCFSV
. .. .. : : .:. :..: . .. ..:. : .:
CCDS93 DVTWILLRTVNNRTMHYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNV--SLQD-------------
590 600 610 620 630
380 390 400 410 420
pF1KE2 RFKAYPQIRCTWTFSRKSFPCEQKGLDNGYSI--SKFCNHKHQPGEYIFHAENDDAQFTK
.. :. ... .: : .: . . : . :... .:
CCDS93 ---------------SGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSD------
640 650 660
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 MFTLNIRRKPQVLAEASASQASCFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEITEGVWNRKANR
...: .:.. .: ..: : :. :: : . : .: :.
CCDS93 ----------HTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHK---IQQE--PGI-------
670 680 690 700
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KVFGQWVSSSTL---NMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQDNISFYA
..: .:::: ..: .: . .: : :. :. . :. : ..:. . .
CCDS93 -ILGP--GSSTLFIERVTEEDEG-VYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSD--KSNLELIT
710 720 730 740 750 760
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 TIGVCL---LFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYDL-K
.:. :: ..:::.: .:.:.. : . ..... . :. . . .. :: :
CCDS93 LTCTCVAATLFWLLLTLFI-RKMKRS-SSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASK
770 780 790 800 810
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 WEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSEL
::: :: :..:: :: ::::::..:.:.::.:. . :::::::: : .:: .:::.::
CCDS93 WEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTEL
820 830 840 850 860 870
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KMMTQLGSHENIVNLLGACT-LSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEH
:..:..: : :.:::::::: .::...: ::: ::.: :::.:::. : . :.
CCDS93 KILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFF-----LNKDA
880 890 900 910 920 930
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NFSFYPTFQSHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEIEYENQKRLEEEEDLN
. . : .. :: .. . .: :.... ..:: : : .. . .::::: .
CCDS93 ALHMEPKKEKME----PGLEQGK-KPRLDSVTS--SESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSD
940 950 960 970 980
790 800 810 820 830
pF1KE2 -----VLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDI
.:.:::. ...:::.::::: ..:.::::::::.:.....:::::::::::::
CCDS93 GFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDI
990 1000 1010 1020 1030 1040
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 MSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDA
... .:: .:..:::.:::::::.:. ::. ::::::::.::::::::: .::::. .:
CCDS93 YKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 NFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQ
.: . ...:..: : :.: ::: :: .:: : ..:: : .:. :: : .: :
CCDS93 DFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLG----DLLQANVQ
1110 1120 1130 1140 1150 1160
960 970 980 990
pF1KE2 NVDGRVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
. ::.
CCDS93 Q-DGKDYIPINAILTGNSGFTYSTPAFSEDFFKESISAPKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
>>CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356 aa)
initn: 1128 init1: 704 opt: 1137 Z-score: 518.7 bits: 107.9 E(32554): 1.4e-22
Smith-Waterman score: 1156; 38.9% identity (64.5% similar) in 552 aa overlap (449-990:685-1199)
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 HAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASASQASCFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEI
..:: ..: : :. : : : :
CCDS34 VVRQLTVLERVAPTITGNLENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWFK-----DNETLVE
660 670 680 690 700
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 TEGVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFI
:. . .::.. . : . .: : : : . :: . .. :
CCDS34 DSGIVLKDGNRNLTIRRVRKED-------EG-LYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQE--
710 720 730 740 750
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 QDNISFYATIG--VCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFRE
. :. . .: : .:. .: ..: . :. : . ..... . :. . ..
CCDS34 KTNLEIIILVGTAVIAMFFWLLLVIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCER
760 770 780 790 800 810
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 YEYDL-KWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSER
:: ::::::. :..:: :: ::::.:..: :.::.::.. :::::::: : ::.
CCDS34 LPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEH
820 830 840 850 860 870
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 EALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTL-SGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTW
.:::::::.. ..: : :.:::::::: .::...: :.: .:.: .::::::..:
CCDS34 RALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEF----
880 890 900 910 920 930
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 TEIFKEHNFSFYPTFQSHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEIEYENQKRL
.: .. : . .... :. :... :.:.. ..: : .: .. . .
CCDS34 -VPYKTKGARF------RQGKDYVGAIPVDLKRRLDSITS--SQSSASSGFVEEKSLSDV
940 950 960 970 980
780 790 800 810 820
pF1KE2 EEEE---DL--NVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICD
:::: :: . ::.: :.:...::::::::: ..:.::::::::.:... .::::::
CCDS34 EEEEAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICD
990 1000 1010 1020 1030 1040
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 FGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPY
:::::::..: .:: .:.::::.::::::..:. .:::.:::::.:.:::::::::..::
CCDS34 FGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPY
1050 1060 1070 1080 1090 1100
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 PGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQL-A
::. .: .: . ...: .: : :.: :.: : .:: . .::.: .:. :: : :
CCDS34 PGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQA
1110 1120 1130 1140 1150 1160
950 960 970 980 990
pF1KE2 DAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
.:.. . . .:: .: : : :: : . :
CCDS34 NAQQDGKDYIVLPISE---------TLSMEEDSGLSLPTSPVSCMEEEEVCDPKFHYDNT
1170 1180 1190 1200 1210
CCDS34 AGISQYLQNSKRKSRPVSVKTFEDIPLEEPEVKVIPDDNQTDSGMVLASEELKTLEDRTK
1220 1230 1240 1250 1260 1270
>>CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4 (1089 aa)
initn: 1327 init1: 740 opt: 765 Z-score: 360.2 bits: 78.3 E(32554): 9.6e-14
Smith-Waterman score: 1466; 33.6% identity (60.5% similar) in 917 aa overlap (133-958:61-965)
110 120 130 140 150
pF1KE2 CLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTETQAGEYLLFIQSEATNYTILFTV----
:.: .... . :..: .: .. ::
CCDS34 LPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEVSWQYPMSEEESSD--VEIRNEENNSGLFVTVLEVS
40 50 60 70 80
160 170 180 190 200
pF1KE2 --SIRNTLLYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVEWVLC------------DSQGE
: .: ::: . . ::. : ::.: : .: ::
CCDS34 SASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGRHIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAII
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240
pF1KE2 SCKE---ESPAVVKKEEKVL----------HELFGMDIRCCARNELGRECTRL-FTI-DL
:. :.:..... : :. . : . : . :.. . :.. :
CCDS34 PCRTTDPETPVTLHNSEGVVPASYDSRQGFNGTFTVGPYICEATVKGKKFQTIPFNVYAL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NQTPQTTLPQLFLKV----GEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELENKALEEGNYFEMSTYST
. : . : . ::. :: . . : :: :. : : ... .:. . :
CCDS34 KATSELDLEMEALKTVYKSGETIVVTC-AVFNNEVVDLQWTYPGEV--KGKGITM-LEEI
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE2 NRTMIRILFAF-VSSVARNDTGYYTCSSSK-----HPSQSALVTIVEKGFINATNSSEDY
. :...... : .. .:.: : :.. . . ... ... :::::. . .
CCDS34 KVPSIKLVYTLTVPEATVKDSGDYECAARQATREVKEMKKVTISVHEKGFIEIKPTFSQL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE2 E-IDQYEEFCFSVRFKAYPQIRCTW---------TFSRKSFPCEQKGLDNGYSISKFCNH
: .. .: : :. .::: : .: .... . :. : :.
CCDS34 EAVNLHEVKHFVVEVRAYPPPRISWLKNNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRA
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 KHQP-GEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASASQAS-------CFSDGYPLPS
:.. :.: . :.:.:: . : : . ..: .. ..: : ..: :::.
CCDS34 KEEDSGHYTIVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPD
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KE2 WTWKKCSDKSPNCTEEITEGVW-NRKAN--RKVFGQWVSS--STLNMSEAIKGFLVKCCA
: :.: . .:..: . . : .: .. .. :. . ...... . . :.: :
CCDS34 IEWMICKDIK-KCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLA
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 YNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQDNISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQL
: ::. . . : .: ...... :.. : :..... ... .:.. ::: .
CCDS34 KNLLGAENRELKLVAPT----LRSELTVAAAVLVLLVIVIISLIVLVVIWKQKPRYEIRW
510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 QMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTG
.... . . .::.::: . :: .:::::..: .:.::::::::::...::::.:..
CCDS34 RVIESISPDGHEYIYVDPMQLPYDSRWEFPRDGLVLGRVLGSGAFGKVVEGTAYGLSRSQ
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 VSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCY
..::::::: : :::..:::::::.::.:: : :::::::::: :::::.: ::: :
CCDS34 PVMKVAVKMLKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFY
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730
pF1KE2 GDLLNYLRSKREKF--H---------------------RTWTEIFKEHNFSFYPTFQSHP
:::.:::...:..: : :... . :.: ... :.
CCDS34 GDLVNYLHKNRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADT
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 NSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGN--SFHSEDEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDLLCF
.. .: .. .. :: .:. :..... .. : : : ... . ::. ::: :
CCDS34 TQYVPMLERKEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEV-KNLLSDDNSEGLTLLDLLSF
740 750 760 770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 AYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLP
.::::.::::: :.::::::::::::...::.::::::::::::: ::::: .:.. ::
CCDS34 TYQVARGMEFLASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLP
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890 900 910
pF1KE2 VKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQP
::::::::.:...:: ::::::::::::::::: .::::. ::..::. :..:..: .:
CCDS34 VKWMAPESIFDNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKP
860 870 880 890 900 910
920 930 940 950 960 970
pF1KE2 FYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQN
.:: :.: :: .:: . .::::: .:. .. : . :...
CCDS34 DHATSEVYEIMVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVA
920 930 940 950 960 970
980 990
pF1KE2 RRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
CCDS34 RMRVDSDNAYIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRN
980 990 1000 1010 1020 1030
>>CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5 (1106 aa)
initn: 1285 init1: 735 opt: 735 Z-score: 347.3 bits: 75.9 E(32554): 5e-13
Smith-Waterman score: 1396; 34.8% identity (61.3% similar) in 790 aa overlap (259-986:222-1001)
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 IRCCARNELGRECTRLFTIDLNQTPQTTLPQLFLKVGEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELE
: .. :: . . : .. :. .. :
CCDS43 TTIGDREVDSDAYYVYRLQVSSINVSVNAVQTVVRQGENITLMCIVIG-NEVVNFEWTYP
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 NKALEEGNYFE-MSTYSTNRTM-IRILFAFVSSVARNDTGYYTC----SSSKHPSQSAL-
: : : : .. . . . :: .. . :. .:.: ::: : . : ...:.
CCDS43 RK--ESGRLVEPVTDFLLDMPYHIRSIL-HIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAIN
260 270 280 290 300
350 360 370 380 390
pF1KE2 VTIVEKGFINATNSSEDYEIDQ-YEEFCFSVRFKAYPQIRCTWTFSRKSFPCEQKG---L
.:.::.:.. . .. . .. ..: :.::: : . ... . : :
CCDS43 ITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYPPPTVLWFKDNRTLGDSSAGEIAL
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440
pF1KE2 DN-GYSISKFCNHKH-------QPGEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASASQ
.. . : ... .. . :.: ..: ..::. : :.: .:: : : :.
CCDS43 STRNVSETRYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQINVPVRVL-ELSESH
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490
pF1KE2 AS-------CFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEITEGVWNRKANRKV-----FGQWVS
. : . :.: :. :. : : . : .:. . . ..... :
CCDS43 PDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSACRDLK-RCPRELPPTLLGNSSEEESQLETNVTYWEE
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 S------STLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQDNISFYATIGVC
::: .... . . :.: :..: . . ... : .:: :: : ...
CCDS43 EQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIV-VPHSLPFKVVVIS--AILALV
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 LLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLE
.: :. : .:: ..:. ::: . .... ..:. .::.::: . :: ::.::..:
CCDS43 VLTIISLIILI-MLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQLV
550 560 570 580 590 600
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 FGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSH
.:..:::::::.:..:::.:.:.. ....::::::: : :::..:::::::.:..:: :
CCDS43 LGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGPH
610 620 630 640 650 660
680 690 700 710 720
pF1KE2 ENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSFY-----
:.:::::::: .::::.: ::: ::::..::. ... : . .. . . .:
CCDS43 LNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRPPSAELYSNALP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE2 -----PTFQSHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGL--HGNSFHSEDE-----IEYENQ---
:. : . : : ... . : . : .:. ... : :.:
CCDS43 VGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVPS
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820
pF1KE2 --KRLEEEEDLN---VLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVK
.: . .: ::.. ::. :.::::.::::: :.::::::::::::. .::.::
CCDS43 APERTCRATLINESPVLSYMDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLVK
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 ICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGV
::::::::::: ::::. .:.. ::.:::::::.:...:: :::::.::::::::.::
CCDS43 ICDFGLARDIMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLGG
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 NPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQ
.::: .:.. .::. :. :..: :: .:..::: :::.:: . :: : .:. .:
CCDS43 TPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLERL
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990
pF1KE2 LADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
:... . ::.:: . . : : :: ::
CCDS43 LGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDNDY
970 980 990 1000 1010 1020
CCDS43 IIPLPDPKPEVADEGPLEGSPSLASSTLNEVNTSSTISCDSPLEPQDEPEPEPQLELQVE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
>>CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298 aa)
initn: 1155 init1: 703 opt: 729 Z-score: 344.1 bits: 75.5 E(32554): 7.6e-13
Smith-Waterman score: 1153; 38.7% identity (63.1% similar) in 561 aa overlap (441-993:687-1217)
420 430 440 450 460
pF1KE2 HQPGEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASAS-QASCFSDGYPLPSWTWKKCSD
.:...: : . .:. : :: .:
CCDS43 DRRSHDKHCHKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY----
660 670 680 690 700 710
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 KSPNCTEEITEGVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILL
:. :: . :: .:.:. : : : .: . : :. : . .
CCDS43 KDERLLEEKS-GVDLADSNQKLSIQRVRE------EDAGRYLCSVC--NAKGCVNSSASV
720 730 740 750 760
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 NSPGPFPFIQDNISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEY
: . .: . . :: .:. :: ::: .... . . . .... . .
CCDS43 AVEGSEDKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIMDPGEVP
770 780 790 800 810 820
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 FYVDFREYEYDL-KWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKE
. . . :: .:::::: :..:.::: ::::::..:.:.:: : . ::::::::
CCDS43 LEEQCEYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKE
830 840 850 860 870 880
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 KADSSEREALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTL-SGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKR
: .::..:::::::.. ..:.: :.:::::::: .::...: :.: ::.: :.::.::
CCDS43 GATASEHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKR
890 900 910 920 930 940
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 EKFHRTWTEIFKEHNFSFYPTFQ-SHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEI
. : .: :. : . .. . ::: . . .. : : : :.
CCDS43 DAFSPC-AEKSPEQRGRFRAMVELARLDRRRPGSSDRVLFARFSKTEG--GARRASPDQ-
950 960 970 980 990
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 EYENQKRLEEEEDL--NVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKV
: ::: . ::.:::.:...:::.::::: ..:.::::::::.:.... :
CCDS43 ---------EAEDLWLSPLTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 VKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSL
::::::::::::..: .:: .:.::::.:::::::.:. .:: .:::::.:.::::::::
CCDS43 VKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 GVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLG
:..::::. .. .: . ...: .: : :: : :: .::. : . ::.: .:. .::
CCDS43 GASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
950 960 970 980 990
pF1KE2 CQLADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRP--FSREMDLGLLSPQAQVEDS
: .. . . .: :.. :. . ::. ..: ::..:::
CCDS43 ----DLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSL
1180 1190 1200 1210 1220
CCDS43 AARYYNWVSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMTPTTYKGSVDNQTDSGMVLASEEFEQ
1230 1240 1250 1260 1270 1280
>>CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363 aa)
initn: 1155 init1: 703 opt: 729 Z-score: 343.9 bits: 75.6 E(32554): 7.8e-13
Smith-Waterman score: 1153; 38.7% identity (63.1% similar) in 561 aa overlap (441-993:687-1217)
420 430 440 450 460
pF1KE2 HQPGEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLAEASAS-QASCFSDGYPLPSWTWKKCSD
.:...: : . .:. : :: .:
CCDS44 DRRSHDKHCHKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY----
660 670 680 690 700 710
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 KSPNCTEEITEGVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILL
:. :: . :: .:.:. : : : .: . : :. : . .
CCDS44 KDERLLEEKS-GVDLADSNQKLSIQRVRE------EDAGRYLCSVC--NAKGCVNSSASV
720 730 740 750 760
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 NSPGPFPFIQDNISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEY
: . .: . . :: .:. :: ::: .... . . . .... . .
CCDS44 AVEGSEDKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIMDPGEVP
770 780 790 800 810 820
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 FYVDFREYEYDL-KWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKE
. . . :: .:::::: :..:.::: ::::::..:.:.:: : . ::::::::
CCDS44 LEEQCEYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKE
830 840 850 860 870 880
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 KADSSEREALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTL-SGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKR
: .::..:::::::.. ..:.: :.:::::::: .::...: :.: ::.: :.::.::
CCDS44 GATASEHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKR
890 900 910 920 930 940
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 EKFHRTWTEIFKEHNFSFYPTFQ-SHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEI
. : .: :. : . .. . ::: . . .. : : : :.
CCDS44 DAFSPC-AEKSPEQRGRFRAMVELARLDRRRPGSSDRVLFARFSKTEG--GARRASPDQ-
950 960 970 980 990
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 EYENQKRLEEEEDL--NVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKV
: ::: . ::.:::.:...:::.::::: ..:.::::::::.:.... :
CCDS44 ---------EAEDLWLSPLTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 VKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSL
::::::::::::..: .:: .:.::::.:::::::.:. .:: .:::::.:.::::::::
CCDS44 VKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
890 900 910 920 930 940
pF1KE2 GVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLG
:..::::. .. .: . ...: .: : :: : :: .::. : . ::.: .:. .::
CCDS44 GASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
950 960 970 980 990
pF1KE2 CQLADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRP--FSREMDLGLLSPQAQVEDS
: .. . . .: :.. :. . ::. ..: ::..:::
CCDS44 ----DLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSL
1180 1190 1200 1210 1220
CCDS44 AARYYNWVSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMTPTTYKGSVDNQTDSGMVLASEEFEQ
1230 1240 1250 1260 1270 1280
993 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 09:16:57 2016 done: Sun Nov 6 09:16:57 2016
Total Scan time: 4.420 Total Display time: 0.380
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]