Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2129
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2129, 931 aa
1>>>pF1KE2129 931 - 931 aa - 931 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0197+/-0.00113; mu= 18.2083+/- 0.068
mean_var=92.2525+/-18.695, 0's: 0 Z-trim(104.1): 59 B-trim: 210 in 1/50
Lambda= 0.133532
statistics sampled from 7676 (7729) to 7676 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 ( 931) 6153 1196.5 0
CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 862) 3907 763.8 0
CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 921) 3835 750.0 4.7e-216
CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 848) 3832 749.4 6.6e-216
CCDS54906.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 801) 2203 435.6 1.9e-121
CCDS54905.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 746) 1875 372.3 1.9e-102
CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 828) 778 161.0 8.3e-39
CCDS45039.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 836) 778 161.0 8.4e-39
CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 893) 778 161.1 8.9e-39
CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 977) 778 161.1 9.5e-39
CCDS45037.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 982) 778 161.1 9.6e-39
CCDS3126.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 759) 737 153.1 1.9e-36
CCDS58856.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 793) 737 153.1 1.9e-36
CCDS45035.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 804) 498 107.1 1.4e-22
CCDS14561.1 TRPC5 gene_id:7224|Hs108|chrX ( 973) 475 102.7 3.5e-21
>>CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 (931 aa)
initn: 6153 init1: 6153 opt: 6153 Z-score: 6405.6 bits: 1196.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6153; 100.0% identity (100.0% similar) in 931 aa overlap (1-931:1-931)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSQSPAFGPRRGSSPRGAAGAAARRNESQDYLLMDSELGEDGCPQAPLPCYGYYPCFRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MSQSPAFGPRRGSSPRGAAGAAARRNESQDYLLMDSELGEDGCPQAPLPCYGYYPCFRGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DNRLAHRRQTVLREKGRRLANRGPAYMFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DNRLAHRRQTVLREKGRRLANRGPAYMFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 CHSLNVNCVDYMGQNALQLAVANEHLEITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 CHSLNVNCVDYMGQNALQLAVANEHLEITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LSHPAFAEGKRLATSPSQSELQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LSHPAFAEGKRLATSPSQSELQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SNELAVLANIEKEFKNDYKKLSMQCKDFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVETLQSGDHGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SNELAVLANIEKEFKNDYKKLSMQCKDFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVETLQSGDHGR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLSIWYENLSGLRQQTMAVKFLVVLAVAIGLPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLSIWYENLSGLRQQTMAVKFLVVLAVAIGLPFL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ALIYWFAPCSKMGKIMRGPFMKFVAHAASFTIFLGLLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ALIYWFAPCSKMGKIMRGPFMKFVAHAASFTIFLGLLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KQLFRMKTSCFSWMEMLIISWVIGMIWAECKEIWTQGPKEYLFELWNMLDFGMLAIFAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KQLFRMKTSCFSWMEMLIISWVIGMIWAECKEIWTQGPKEYLFELWNMLDFGMLAIFAAS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FIARFMAFWHASKAQSIIDANDTLKDLTKVTLGDNVKYYNLARIKWDPSDPQIISEGLYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FIARFMAFWHASKAQSIIDANDTLKDLTKVTLGDNVKYYNLARIKWDPSDPQIISEGLYA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 IAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLSEVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLSEVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 KKWISELFQGHKKGFQEDAEMNKINEEKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KKWISELFQGHKKGFQEDAEMNKINEEKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 EDFHLNSFNNPPRQYQKIMKRLIKRYVLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EDFHLNSFNNPPRQYQKIMKRLIKRYVLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLE
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KE2 EKSQNTEDLAELIRELGEKLSMEPNQEETNR
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EKSQNTEDLAELIRELGEKLSMEPNQEETNR
910 920 930
>>CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 (862 aa)
initn: 4266 init1: 3900 opt: 3907 Z-score: 4067.6 bits: 763.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4245; 73.9% identity (89.4% similar) in 871 aa overlap (57-927:2-852)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 ESQDYLLMDSELGEDGCPQAPLPCYGYYPCFRGSDNRLAHRRQTVLREKGRRLANRGPAY
.:.: . .::.:.::::::: : :::::
CCDS47 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRGPAY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 MFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEECHSLNVNCVDYMGQNALQLAVANEHL
::....:::. :::::::.::::::::::::::: ..:: :::::::::::::::.::::
CCDS47 MFNEKGTSLTPEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 EITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILSHPAFAEGKRLATSPSQSELQQDDF
:.::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::.:.::. :: ..::..:::
CCDS47 EVTELLLKKENLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDF
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 YAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLRKGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDS
:::::::::::::.:::::::::::::::: :: ::::::::::::::::.:..::..::
CCDS47 YAYDEDGTRFSHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDS
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 FSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALELSNELAVLANIEKEFKNDYKKLSMQCK
:::::::.:::::::: :::::::::::.:::::::::: ::::: ::::::.:::::::
CCDS47 FSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFKNDYRKLSMQCK
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 DFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVETLQSGDHGRPNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQ
:::::.:::::.::::::::::::. .:: ::.:::.::::::::::::::::::::
CCDS47 DFVVGVLDLCRDTEEVEAILNGDVNFQVWSDHHRPSLSRIKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQ
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 LLSIWYENLSGLRQQTMAVKFLVVLAVAIGLPFLALIYWFAPCSKMGKIMRGPFMKFVAH
::..:::::::::::..:::::.:..:.:::::::. ::.:::::.:. .:.::::::::
CCDS47 LLTMWYENLSGLRQQSIAVKFLAVFGVSIGLPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVAH
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 AASFTIFLGLLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNAKQLFRMKTSCFSWMEMLIISWVIGMI
:.::::::::::.::.:::::.: ::::: :: ::.::.::. ::: ::::..::.:::
CCDS47 AVSFTIFLGLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMI
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 WAECKEIWTQGPKEYLFELWNMLDFGMLAIFAASFIARFMAFWHASKAQSIIDANDTLKD
:.:::::: .::.::...:::.::::::.::.::: :::::: .:..:: .: .
CCDS47 WSECKEIWEEGPREYVLHLWNLLDFGMLSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDT
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 LTKVTLGDNVKYYNLARIKWDPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQIS
: .:.: .: :.. :: :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LHNVSLPPEVAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQIS
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 LGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYIGAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: : ::::::::::::::.:::::
CCDS47 LGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLS
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 EVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFAR
:: :::..:.::::::::::::::::::::.:::::::::::.:.::::.::::::::::
CCDS47 EVISVVLKYDHKFIENIGYVLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFAR
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 AKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKLKKWISELFQGHKKGFQEDAEMNKINE
::::.:::.::::::.::::::::::..::....: . .: ... :. ..: ::. .:
CCDS47 AKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSPKSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLN-
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 EKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSSEDFHLNSFNNPPRQYQKIMKRLIKRY
::.. . :.: .:.::.. :. . : .::::::::::::
CCDS47 -------------SKFKKTRYQAG------MRNSENLTANNTLSKPTRYQKIMKRLIKRY
760 770 780 790
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 VLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQNTEDLAELIRELGEKLSMEPNQ
::.::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::: : .::.::..:.::.. . :.
CCDS47 VLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQATGELADLIQQLSEKFGKNLNK
800 810 820 830 840 850
930
pF1KE2 EETNR
.
CCDS47 DHLRVNKGKDI
860
>>CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 (921 aa)
initn: 4189 init1: 2192 opt: 3835 Z-score: 3992.3 bits: 750.0 E(32554): 4.7e-216
Smith-Waterman score: 4161; 71.8% identity (87.4% similar) in 884 aa overlap (43-921:62-914)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 SSPRGAAGAAARRNESQDYLLMDSELGEDGCPQAPLPCYGYYP--CFRGSDNRLAHRRQT
:: : ... : ..:: . ::.:
CCDS47 EPQRRRRGWRGVNGGLEPRSAPSQREPHGYCP----PPFSHGPDLSMEGSPS---LRRMT
40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 VLREKGRRLANRGPAYMFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEECHSLNVNCVD
:.:::::: : ::::.::.::.:::. ::::::::::::::::::::::: ..:::::::
CCDS47 VMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVD
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 YMGQNALQLAVANEHLEITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILSHPAFAEGK
:::::::::::.:::::.::::::::::.:.::::::::::::::::::::.::.:: .:
CCDS47 YMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASK
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 RLATSPSQSELQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLRKGARIERPHD
::. :: ..:::.:::::::::::::: :.::::::::::.::.:: :: ::::::::::
CCDS47 RLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHD
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 YFCKCNDCNQKQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALELSNELAVLANI
:::::.:: .::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: ::::
CCDS47 YFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANI
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360
pF1KE2 EKEFKNDYKKLSMQCKDFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVET---LQSGDHGRPNLSRLK
::::::::.::::::::::::.:::::..::::::::::.:. :. : . .:::.:
CCDS47 EKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRH-KASLSRVK
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLSIWYENLSGLRQQTMAVKFLVVLAVAIGLPFLALIYWFA
:::::::::::::::::::::.::::::::::.::.:.: ::::.::.::::::. ::.:
CCDS47 LAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIA
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PCSKMGKIMRGPFMKFVAHAASFTIFLGLLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNAKQLFRMK
:::..:::.:.:::::::::::: :::::::.::.::::: ::: : :: ::.::.:
CCDS47 PCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVK
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TSCFSWMEMLIISWVIGMIWAECKEIWTQGPKEYLFELWNMLDFGMLAIFAASFIARFMA
:. :.: ::::. ::.::.:.::::.: .::.::...:::.::::::.:: :.: :::.:
CCDS47 TTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLA
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FWHASKAQSIIDANDTLKDLTKVTLGDNVKYYNLARIKWDPSDPQIISEGLYAIAVVLSF
: .:.:::. .:. .::..::: ...:.. :: :: ::::::::::::::::::::
CCDS47 FLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSF
570 580 590 600 610 620
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 SRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYIGAKQNEA
::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::::: :::::.::: : :
CCDS47 SRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAA
630 640 650 660 670 680
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 FTTVEESFKTLFWAIFGLSEVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLLNMLIAMI
:::::::::::::.::::::: :::..:.:::::::::::::.::::::.::::::::::
CCDS47 FTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMI
690 700 710 720 730 740
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 NSSFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKLKKWISEL
:::.::::::.::::::::.:::.:::..:.::: ::.:::::::. :.... : ..
CCDS47 NSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMR----IVNF
750 760 770 780 790
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 FQGHKKGFQEDAEMNKINEEKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSSEDFHLNS
. ... .:.: ::. : ...:... : . : :. .::
CCDS47 PKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLF-------------------TQSNSRVFESHSFNS
800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 FNNPPRQYQKIMKRLIKRYVLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQNTE
. : : .::.:::::::::::.::.:::.::::::::::::::::::::::::.::: ::
CCDS47 ILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATE
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KE2 DLAELIRELGEKLSMEPNQEETNR
.:: ::..:.:::.
CCDS47 ELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
910 920
>>CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 (848 aa)
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CCDS37 AEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
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::.:.::::::::::::::::::::.::.:: .:::. :: ..:::.:::::::::::::
CCDS37 NLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRF
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: :.::::::::::.::.:: :: :::::::::::::::.:: .::.:::::::::::::
CCDS37 SPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINA
160 170 180 190 200 210
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::::::::::::::::::.:::::::::: ::::::::::::.::::::::::::.::::
CCDS37 YKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
220 230 240 250 260 270
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:..::::::::::.:. :. : . .:::.::::::::::::::::::::::.::::
CCDS37 RDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRH-KASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYE
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::::::.::.:.: ::::.::.::::::. ::.::::..:::.:.:::::::::::: ::
CCDS37 NLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIF
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:::::.::.::::: ::: : :: ::.::.::. :.: ::::. ::.::.:.::::.
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: .::.::...:::.::::::.:: :.: :::.:: .:.:::. .:. .::..:::
CCDS37 WLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLP
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...:.. :: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKD
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pF1KE2 IFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYIGAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLSEVKSVVI
::::::.::::: ::::::: :::::.::: : ::::::::::::::.::::::: :::.
CCDS37 IFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVL
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pF1KE2 NYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSY
.:.:::::::::::::.::::::.:::::::::::::.::::::.::::::::.:::.::
CCDS37 KYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSY
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pF1KE2 FEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKLKKWISELFQGHKKGFQEDAEMNKINEEKKLGIL
:..:.::: ::.:::::::. :.... : .. . ... .:.: ::. : ...:...
CCDS37 FDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMR----IVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLF
700 710 720 730 740 750
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pF1KE2 GSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSSEDFHLNSFNNPPRQYQKIMKRLIKRYVLQAQID
: . : :. .::. : : .::.:::::::::::.::.:
CCDS37 -------------------TQSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVD
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pF1KE2 KESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQNTEDLAELIRELGEKLSMEPNQEETNR
::.::::::::::::::::::::::::.::: ::.:: ::..:.:::.
CCDS37 KENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
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>>CCDS54906.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 (801 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KE2 ESQDYLLMDSELGEDGCPQAPLPCYGYYPCFRGSDNRLAHRRQTVLREKGRRLANRGPAY
.:.: . .::.:.::::::: : :::::
CCDS54 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRGPAY
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90 100 110 120 130 140
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CCDS54 MFNEKGTSLTPEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHL
40 50 60 70 80 90
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pF1KE2 EITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILSHPAFAEGKRLATSPSQSELQQDDF
:.::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::.:.::. :: ..::..:::
CCDS54 EVTELLLKKENLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDF
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210 220 230 240 250 260
pF1KE2 YAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLRKGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDS
:::::::::::::.:::::::::::::::: :: ::::::::::::::::.:..::..::
CCDS54 YAYDEDGTRFSHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDS
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270 280 290 300 310 320
pF1KE2 FSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALELSNELAVLANIEKEFKNDYKKLSMQCK
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CCDS54 FSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFK-----------
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 DFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVETLQSGDHGRPNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQ
::::::::::
CCDS54 --------------------------------------------------FVAHPNCQQQ
270
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::..:::::::::::..:::::.:..:.:::::::. ::.:::::.:. .:.::::::::
CCDS54 LLTMWYENLSGLRQQSIAVKFLAVFGVSIGLPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVAH
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CCDS54 AVSFTIFLGLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMI
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pF1KE2 WAECKEIWTQGPKEYLFELWNMLDFGMLAIFAASFIARFMAFWHASKAQSIIDANDTLKD
:.:::::: .::.::...:::.::::::.::.::: :::::: .:..:: .: .
CCDS54 WSECKEIWEEGPREYVLHLWNLLDFGMLSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDT
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: .:.: .: :.. :: :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LHNVSLPPEVAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQIS
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pF1KE2 LGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYIGAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: : ::::::::::::::.:::::
CCDS54 LGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLS
520 530 540 550 560 570
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pF1KE2 EVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFAR
:: :::..:.::::::::::::::::::::.:::::::::::.:.::::.::::::::::
CCDS54 EVISVVLKYDHKFIENIGYVLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFAR
580 590 600 610 620 630
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 AKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKLKKWISELFQGHKKGFQEDAEMNKINE
::::.:::.::::::.::::::::::..::....: . .: ... :. ..: ::. .:
CCDS54 AKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSPKSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLN-
640 650 660 670 680
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pF1KE2 EKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSSEDFHLNSFNNPPRQYQKIMKRLIKRY
::.. . :.: .:.::.. :. . : .::::::::::::
CCDS54 -------------SKFKKTRYQAG------MRNSENLTANNTLSKPTRYQKIMKRLIKRY
690 700 710 720 730
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pF1KE2 VLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQNTEDLAELIRELGEKLSMEPNQ
::.::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::: : .::.::..:.::.. . :.
CCDS54 VLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQATGELADLIQQLSEKFGKNLNK
740 750 760 770 780 790
930
pF1KE2 EETNR
.
CCDS54 DHLRVNKGKDI
800
>>CCDS54905.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 (746 aa)
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pF1KE2 ESQDYLLMDSELGEDGCPQAPLPCYGYYPCFRGSDNRLAHRRQTVLREKGRRLANRGPAY
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CCDS54 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRGPAY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 MFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEECHSLNVNCVDYMGQNALQLAVANEHL
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CCDS54 MFNEKGTSLTPEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHL
40 50 60 70 80 90
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pF1KE2 EITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILSHPAFAEGKRLATSPSQSELQQDDF
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CCDS54 EVTELLLKKENLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDF
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CCDS54 YAYDEDGTRFSHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDS
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pF1KE2 FSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALELSNELAVLANIEKEFKNDYKKLSMQCK
:::::::.:::::::: :::::::::::.:::::::::: ::::: :::
CCDS54 FSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFK-----------
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pF1KE2 DFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVETLQSGDHGRPNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQ
CCDS54 ------------------------------------------------------------
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CCDS54 ---------------------------------------------LGRTLRSPFMKFVAH
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CCDS54 WSECKEIWEEGPREYVLHLWNLLDFGMLSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDT
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pF1KE2 LTKVTLGDNVKYYNLARIKWDPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQIS
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CCDS54 LHNVSLPPEVAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQIS
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::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: : ::::::::::::::.:::::
CCDS54 LGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLS
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pF1KE2 EVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFAR
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CCDS54 EVISVVLKYDHKFIENIGYVLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFAR
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pF1KE2 AKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKLKKWISELFQGHKKGFQEDAEMNKINE
::::.:::.::::::.::::::::::..::....: . .: ... :. ..: ::. .:
CCDS54 AKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSPKSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLN-
580 590 600 610 620 630
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pF1KE2 EKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSSEDFHLNSFNNPPRQYQKIMKRLIKRY
::.. . :.: .:.::.. :. . : .::::::::::::
CCDS54 -------------SKFKKTRYQAG------MRNSENLTANNTLSKPTRYQKIMKRLIKRY
640 650 660 670
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pF1KE2 VLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQNTEDLAELIRELGEKLSMEPNQ
::.::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::: : .::.::..:.::.. . :.
CCDS54 VLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQATGELADLIQQLSEKFGKNLNK
680 690 700 710 720 730
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pF1KE2 EETNR
.
CCDS54 DHLRVNKGKDI
740
>>CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (828 aa)
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pF1KE2 YGYYPCFRGSDNRLAHRRQTVLREKGRRLANRGPAYMFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGN
.: : . .: :: :. .:.:.: :.
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESE-LSPSEKAYLNAVEKGD
10 20 30 40
120 130 140 150 160
pF1KE2 IPVVRKMLEECH---SLNVNCVDYMGQNALQLAVANEHLEITELLLKKENLSRVGDALLL
:.: ::: . ..:.::.: .:..:: .:. ::.::. ::::. :. ::::::
CCDS45 YASVKKSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLS-FNV-YVGDALLH
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 AISKGYVRIVEAILSHPAFAEGKRLATSPSQSELQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAA
:: : : :: .:.: :. :: .: :.. ..:. :.:::::::
CCDS45 AIRKEVVGAVELLLNH------KK----PSGE--KQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAA
110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 HCQEYEIVHTLLRKGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLS
: ..:::.. :..::. . :::. :.: .: ... ::. :::::.: ::.::::. ..
CCDS45 HTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIA
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 LSSEDPVMTALELSNELAVLANIEKEFKNDYKKLSMQCKDFVVGLLDLCRNTEEVEAILN
:::::: .::..:: :: :...:.:::..:..:: :::.:. ::: :...:.: :::
CCDS45 LSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILN
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 G-DVETL---QSGDHGRPNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLSIWYENLSGLRQQTM
: ..: :::. .:.::::::::. :.:::.::::: : : ::... : :..
CCDS45 YRDDNSLIEEQSGN----DLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHW
280 290 300 310 320
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pF1KE2 AVKFLVVLAVAIGLPFLALIYWFAPCSKMGKIMRGPFMKFVAHAASFTIFLGLLVMNAA-
:::... . ... .: ... : .:: : .: ..: ::.::. :.::. :: ::.. .
CCDS45 AVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQH
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 -DRFEGTKLLPNETSTDNAKQLFRMKTSCFSWMEMLIISWVIGMIWAECKEIWTQGPKEY
:: . .. : : .. :: :. ::.:.::.: :..: : ..:
CCDS45 IDRSDLNRQGPPPTIVE--------------WM---ILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDY
390 400 410 420
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 LFELWNMLDFGMLAIFAASFIARFMAFWHASKAQSIIDANDTLKDLTKVTLGDNVKYYNL
. . ::..:: : ... :.. ...:: ::: :
CCDS45 IHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAF---------------------------VKYSAL
430 440 450 460
590 600 610 620 630 640
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]