Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2112
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2112, 921 aa
1>>>pF1KE2112 921 - 921 aa - 921 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4253+/-0.00105; mu= 16.9468+/- 0.063
mean_var=107.3599+/-20.748, 0's: 0 Z-trim(107.0): 48 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.123781
statistics sampled from 9244 (9289) to 9244 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 3.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 921) 6091 1099.2 0
CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 848) 5556 1003.6 0
CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 862) 4519 818.5 0
CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 ( 931) 3835 696.3 6.8e-200
CCDS54906.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 801) 2767 505.6 1.6e-142
CCDS54905.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 746) 2447 448.4 2.3e-125
CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 828) 803 154.8 6.1e-37
CCDS45039.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 836) 803 154.8 6.1e-37
CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 893) 803 154.9 6.4e-37
CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 977) 803 154.9 6.9e-37
CCDS45037.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 982) 803 154.9 6.9e-37
CCDS14561.1 TRPC5 gene_id:7224|Hs108|chrX ( 973) 786 151.9 5.6e-36
CCDS3126.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 759) 747 144.8 5.8e-34
CCDS58856.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 793) 747 144.8 6e-34
CCDS45035.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 804) 483 97.7 9.4e-20
>>CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 (921 aa)
initn: 6091 init1: 6091 opt: 6091 Z-score: 5879.6 bits: 1099.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6091; 100.0% identity (100.0% similar) in 921 aa overlap (1-921:1-921)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSTKVRKCKEQARVTFPAPEEEEDEGEDEGAEPQRRRRGWRGVNGGLEPRSAPSQREPHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSTKVRKCKEQARVTFPAPEEEEDEGEDEGAEPQRRRRGWRGVNGGLEPRSAPSQREPHG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YCPPPFSHGPDLSMEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YCPPPFSHGPDLSMEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAIL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 IKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 FFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 YVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SLVPSPKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLVPSPKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 ILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATE
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KE2 ELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
:::::::::::::::::::::
CCDS47 ELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
910 920
>>CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 (848 aa)
initn: 5556 init1: 5556 opt: 5556 Z-score: 5363.8 bits: 1003.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5556; 100.0% identity (100.0% similar) in 848 aa overlap (74-921:1-848)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 NGGLEPRSAPSQREPHGYCPPPFSHGPDLSMEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFN
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 DRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVT
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 ELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAY
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 DEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSH
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 SRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFV
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 VGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 LTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHA
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMW
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 SECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDL
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 SEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISL
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 GRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSE
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 VTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARS
640 650 660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 KLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLN
700 710 720 730 740 750
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 LFTQSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LFTQSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQD
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920
pF1KE2 ISSLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ISSLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
820 830 840
>>CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 (862 aa)
initn: 2788 init1: 2426 opt: 4519 Z-score: 4362.9 bits: 818.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4519; 81.1% identity (92.5% similar) in 841 aa overlap (81-917:12-849)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 SAPSQREPHGYCPPPFSHGPDLSMEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLT
:: :..::::::::.::::.:::..:::::
CCDS47 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRGPAYMFNEKGTSLT
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 AEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
:::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRF
::::.:::::::::::::::::::::::.:: ..:::::: ::::.::::::::::::::
CCDS47 NLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRF
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINA
: ::::::::::::.::.::.::.:::::::::::::::..: ::::.:::::::::.::
CCDS47 SHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNA
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
:::::: ::::::::::::::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 RDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYEN
::.::::::::::.. . .:. ::::.:::::::::::::::::::::::.::::
CCDS47 RDTEEVEAILNGDVNFQ--VWSDHHRPSLSRIKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTMWYEN
290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFL
:::::.:.::.: :.:. :..:::::::.:::::::.::. ::::::::::::.:: :::
CCDS47 LSGLRQQSIAVKFLAVFGVSIGLPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVAHAVSFTIFL
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 GLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELW
:::: ::::::::. :::: : :::::::::::::::.::::::: :::::.::::::.:
CCDS47 GLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIW
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPP
::::::.:.:::.:::::::::.:.:::::.:::.::.:: :::..::.. : .:.:::
CCDS47 EEGPREYVLHLWNLLDFGMLSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDTLHNVSLPP
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 EIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
:. ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EVAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 FKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLK
:::::.::::: ::::::: ::::: ::: : :::::::::::::::::::::: :::::
CCDS47 FKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLK
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 YDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYF
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::.:.::::::::.:::::::
CCDS47 YDHKFIENIGYVLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYF
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820
pF1KE2 DDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRI----VNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFT
:.:.::: ::.:::::::: :.:::: ... : . . ..:.:::: ::: . . .
CCDS47 DEGRTLPAPFNLVPSPKSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRY-
700 710 720 730 740 750
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 QSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISS
:.. : :. . :. :..:::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS47 QAGMRNSENLTANNTLSKPTRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISS
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920
pF1KE2 LRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
:::::::.::::: ::: ::..::::.. ..
CCDS47 LRYELLEEKSQATGELADLIQQLSEKFGKNLNKDHLRVNKGKDI
820 830 840 850 860
>>CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 (931 aa)
initn: 4189 init1: 2192 opt: 3835 Z-score: 3702.2 bits: 696.3 E(32554): 6.8e-200
Smith-Waterman score: 4161; 72.0% identity (87.4% similar) in 882 aa overlap (62-914:43-921)
40 50 60 70 80
pF1KE2 EPQRRRRGWRGVNGGLEPRSAPSQREPHGYCP--PPFSHGPDLSMEGSPSL---RRMTVM
:: : .: ..:: . ::.::.
CCDS83 SSPRGAAGAAARRNESQDYLLMDSELGEDGCPQAPLPCYGYYPCFRGSDNRLAHRRQTVL
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 REKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYM
:::::: : ::::.::.::.:::. ::::::::::::::::::::::: ..:::::::::
CCDS83 REKGRRLANRGPAYMFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEECHSLNVNCVDYM
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 GQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRL
:::::::::.:::::.::::::::::.:.::::::::::::::::::::.::.:: .:::
CCDS83 GQNALQLAVANEHLEITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILSHPAFAEGKRL
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 TLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYF
. :: ..:::.:::::::::::::: :.::::::::::.::.:: :: ::::::::::::
CCDS83 ATSPSQSELQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLRKGARIERPHDYF
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 CKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEK
:::.:: .::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: ::::::
CCDS83 CKCNDCNQKQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALELSNELAVLANIEK
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 EFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRH-KASLSRVKLA
::::::.::::::::::::.:::::..::::::::::.:. :. : . .:::.:::
CCDS83 EFKNDYKKLSMQCKDFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVET---LQSGDHGRPNLSRLKLA
320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 IKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPC
:::::::::::::::::::.::::::::::.::.:.: ::::.::.::::::. ::.:::
CCDS83 IKYEVKKFVAHPNCQQQLLSIWYENLSGLRQQTMAVKFLVVLAVAIGLPFLALIYWFAPC
370 380 390 400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 SRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTT
:..:::.:.:::::::::::: :::::::.::.::::: ::: : :: ::.::.::.
CCDS83 SKMGKIMRGPFMKFVAHAASFTIFLGLLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNAKQLFRMKTS
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 QFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFL
:.: ::::. ::.::.:.::::.: .::.::...:::.::::::.:: :.: :::.::
CCDS83 CFSWMEMLIISWVIGMIWAECKEIWTQGPKEYLFELWNMLDFGMLAIFAASFIARFMAFW
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 QATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSR
.:.:::. .:. .::..::: ...:.. :: :: ::::::::::::::::::::::
CCDS83 HASKAQSIIDANDTLKDLTKVTLGDNVKYYNLARIKWDPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSR
550 560 570 580 590 600
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 IAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFT
::::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::::: :::::.::: : :::
CCDS83 IAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYIGAKQNEAFT
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 TVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINS
:::::::::::.::::::: :::..:.:::::::::::::.::::::.::::::::::::
CCDS83 TVEESFKTLFWAIFGLSEVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLLNMLIAMINS
670 680 690 700 710 720
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 SYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMR----IVNFPK
:.::::::.::::::::.:::.:::..:.::: ::.:::::::. :.... : .. .
CCDS83 SFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKLKKWISELFQ
730 740 750 760 770 780
810 820 830 840
pF1KE2 CRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLF-------------------TQSNSRVFESHSFNSIL
... .:.: ::. : ...:... : . : :. .::.
CCDS83 GHKKGFQEDAEMNKINEEKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSSEDFHLNSFN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 NQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEEL
: : .::.:::::::::::.::.:::.::::::::::::::::::::::::.::: ::.:
CCDS83 NPPRQYQKIMKRLIKRYVLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQNTEDL
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KE2 AILIHKLSEKLNPSMLRCE
: ::..:.:::.
CCDS83 AELIRELGEKLSMEPNQEETNR
910 920 930
>>CCDS54906.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 (801 aa)
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60 70 80 90 100 110
pF1KE2 SAPSQREPHGYCPPPFSHGPDLSMEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLT
:: :..::::::::.::::.:::..:::::
CCDS54 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRGPAYMFNEKGTSLT
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 AEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
:::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRF
::::.:::::::::::::::::::::::.:: ..:::::: ::::.::::::::::::::
CCDS54 NLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRF
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINA
: ::::::::::::.::.::.::.:::::::::::::::..: ::::.:::::::::.::
CCDS54 SHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNA
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
:::::: ::::::::::::::::::::::.::::: :::
CCDS54 YKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFK---------------------
230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 RDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYEN
:::::::::::::.::::
CCDS54 ------------------------------------------FVAHPNCQQQLLTMWYEN
270
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFL
:::::.:.::.: :.:. :..:::::::.:::::::.::. ::::::::::::.:: :::
CCDS54 LSGLRQQSIAVKFLAVFGVSIGLPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVAHAVSFTIFL
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 GLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELW
:::: ::::::::. :::: : :::::::::::::::.::::::: :::::.::::::.:
CCDS54 GLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIW
340 350 360 370 380 390
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPP
::::::.:.:::.:::::::::.:.:::::.:::.::.:: :::..::.. : .:.:::
CCDS54 EEGPREYVLHLWNLLDFGMLSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDTLHNVSLPP
400 410 420 430 440 450
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 EIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
:. ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
460 470 480 490 500 510
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 FKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLK
:::::.::::: ::::::: ::::: ::: : :::::::::::::::::::::: :::::
CCDS54 FKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLK
520 530 540 550 560 570
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 YDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYF
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::.:.::::::::.:::::::
CCDS54 YDHKFIENIGYVLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYF
580 590 600 610 620 630
780 790 800 810 820
pF1KE2 DDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRI----VNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFT
:.:.::: ::.:::::::: :.:::: ... : . . ..:.:::: ::: . . .
CCDS54 DEGRTLPAPFNLVPSPKSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRY-
640 650 660 670 680 690
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 QSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISS
:.. : :. . :. :..:::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 QAGMRNSENLTANNTLSKPTRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISS
700 710 720 730 740 750
890 900 910 920
pF1KE2 LRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
:::::::.::::: ::: ::..::::.. ..
CCDS54 LRYELLEEKSQATGELADLIQQLSEKFGKNLNKDHLRVNKGKDI
760 770 780 790 800
>>CCDS54905.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 (746 aa)
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pF1KE2 SAPSQREPHGYCPPPFSHGPDLSMEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLT
:: :..::::::::.::::.:::..:::::
CCDS54 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRGPAYMFNEKGTSLT
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 AEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
:::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRF
::::.:::::::::::::::::::::::.:: ..:::::: ::::.::::::::::::::
CCDS54 NLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRF
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 SPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINA
: ::::::::::::.::.::.::.:::::::::::::::..: ::::.:::::::::.::
CCDS54 SHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNA
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
:::::: ::::::::::::::::::::::.::::: :::
CCDS54 YKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFK---------------------
230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 RDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYEN
CCDS54 ------------------------------------------------------------
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFL
::. ::::::::::::.:: :::
CCDS54 -------------------------------------LGRTLRSPFMKFVAHAVSFTIFL
270 280
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 GLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELW
:::: ::::::::. :::: : :::::::::::::::.::::::: :::::.::::::.:
CCDS54 GLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIW
290 300 310 320 330 340
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPP
::::::.:.:::.:::::::::.:.:::::.:::.::.:: :::..::.. : .:.:::
CCDS54 EEGPREYVLHLWNLLDFGMLSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDTLHNVSLPP
350 360 370 380 390 400
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 EIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
:. ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDI
410 420 430 440 450 460
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 FKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLK
:::::.::::: ::::::: ::::: ::: : :::::::::::::::::::::: :::::
CCDS54 FKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLK
470 480 490 500 510 520
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 YDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYF
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::.:.::::::::.:::::::
CCDS54 YDHKFIENIGYVLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYF
530 540 550 560 570 580
780 790 800 810 820
pF1KE2 DDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRI----VNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFT
:.:.::: ::.:::::::: :.:::: ... : . . ..:.:::: ::: . . .
CCDS54 DEGRTLPAPFNLVPSPKSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRY-
590 600 610 620 630 640
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 QSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISS
:.. : :. . :. :..:::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 QAGMRNSENLTANNTLSKPTRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISS
650 660 670 680 690 700
890 900 910 920
pF1KE2 LRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
:::::::.::::: ::: ::..::::.. ..
CCDS54 LRYELLEEKSQATGELADLIQQLSEKFGKNLNKDHLRVNKGKDI
710 720 730 740
>>CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (828 aa)
initn: 1630 init1: 500 opt: 803 Z-score: 776.7 bits: 154.8 E(32554): 6.1e-37
Smith-Waterman score: 1490; 39.8% identity (67.6% similar) in 658 aa overlap (107-750:27-627)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 SPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESK
. :. :. .:.:.: :. :.: :::..
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAE
10 20 30 40 50
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 T---LNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEA
.:.::.: .:..:: .:. ::.::. ::::. . . .::::: :: : : ::
CCDS45 IYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFN--VYVGDALLHAIRKEVVGAVEL
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 ILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLL
.::: .. :.. : : : .: ..:.::::::::::: ..::....:.
CCDS45 LLNHKKPSGEKQVP--PI---LLDKQF-------SEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLV
120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 MKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALE
.::. . :::. :.: .:. .. ::. :::::.: ::.::::. ..:::::: :::..
CCDS45 QKGVSVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQ
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 LSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVH
:: :: .:...:.:::..:..:: :::.:. .:: :.:.:.: ::: .. . : .
CCDS45 LSWELQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILN--YRDDNSLIEE
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 RHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGL
. .:.:.::::::. :.:::.::::: : . ::... : :.. :.: .. ....: .
CCDS45 QSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLF
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 PFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVT
: ... : ::: : :: ..:.::.::. :.::.. :: ::.. .. .: .
CCDS45 PVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQ----------HIDRS
350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 DYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIF
: .: : .: .:. ::::..:.: :..: : ..:: . ::..:: : :..
CCDS45 DLNRQ-----GPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLY
400 410 420 430 440
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 IAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEG
.:... ...::.. . .: : :..: : ...:.
CCDS45 LATISLKIVAFVKYS------------------ALNP--------RESWDMWHPTLVAEA
450 460 470
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 LYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYS
:.::: ..: :. .. :: .::::::::: . ::.::. .. .:..:: :. ::
CCDS45 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
480 490 500 510 520 530
680 690 700 710 720
pF1KE2 YYLGAK-----------VNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYV
:: .: : ::.:. :....:::::::: .. . .: .:.: : .: .
CCDS45 YYEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGAT
540 550 560 570 580 590
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSL
..: ::: .::::::::::.:.::: :
CCDS45 MFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIARRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]