Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1861
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1861, 380 aa
1>>>pF1KE1861 380 - 380 aa - 380 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4233+/-0.000908; mu= 16.6356+/- 0.055
mean_var=81.1144+/-15.934, 0's: 0 Z-trim(106.9): 28 B-trim: 42 in 1/49
Lambda= 0.142405
statistics sampled from 9358 (9383) to 9358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 1.330
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs109|chr3 ( 380) 2662 556.7 1.3e-158
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs109|chr3 ( 365) 2569 537.5 7e-153
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs109|chr12 ( 359) 2125 446.3 2e-125
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs109|chr1 ( 391) 1236 263.7 2e-70
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs109|chr1 ( 372) 1234 263.3 2.6e-70
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs109|chr1 ( 351) 1215 259.4 3.7e-69
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs109|chr7 ( 360) 1214 259.2 4.4e-69
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs109|chr22 ( 349) 1183 252.8 3.6e-67
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs109|chr1 ( 299) 1158 247.6 1.1e-65
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs109|chr3 ( 349) 1140 244.0 1.6e-64
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs109|chr17 ( 355) 1130 241.9 6.8e-64
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs109|chr1 ( 352) 1128 241.5 9e-64
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs109|chr7 ( 355) 993 213.8 2e-55
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs109|chr7 ( 365) 990 213.1 3.2e-55
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs109|chr11 ( 354) 950 204.9 9.2e-53
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs109|chr10 ( 351) 861 186.6 2.9e-47
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs109|chr5 ( 351) 854 185.2 7.9e-47
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs109|chr5 ( 369) 854 185.2 8.3e-47
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs109|chr12 ( 370) 743 162.4 6.1e-40
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs109|chr2 ( 365) 670 147.4 2e-35
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs109|chr12 ( 389) 669 147.2 2.4e-35
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs109|chr17 ( 357) 480 108.4 1.1e-23
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs109|chr2 ( 417) 471 106.6 4.4e-23
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs109|chr1 ( 365) 403 92.6 6.4e-19
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs109|chr17 ( 329) 288 68.9 7.6e-12
>>CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs109|chr3 (380 aa)
initn: 2662 init1: 2662 opt: 2662 Z-score: 2961.4 bits: 556.7 E(33420): 1.3e-158
Smith-Waterman score: 2662; 100.0% identity (100.0% similar) in 380 aa overlap (1-380:1-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKKSIGILSPGVALGMAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEV
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CCDS46 MKKSIGILSPGVALGMAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFH
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE1 WCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
::::::::::::::::::::
CCDS46 WCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
370 380
>>CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs109|chr3 (365 aa)
initn: 2569 init1: 2569 opt: 2569 Z-score: 2858.3 bits: 537.5 E(33420): 7e-153
Smith-Waterman score: 2569; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (16-380:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKKSIGILSPGVALGMAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDN
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKC
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFH
290 300 310 320 330 340
370 380
pF1KE1 WCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
::::::::::::::::::::
CCDS58 WCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
350 360
>>CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs109|chr12 (359 aa)
initn: 2039 init1: 2039 opt: 2125 Z-score: 2365.5 bits: 446.3 E(33420): 2e-125
Smith-Waterman score: 2125; 80.3% identity (94.4% similar) in 360 aa overlap (21-380:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKKSIGILSPGVALGMAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEV
: : ..: . :.. :.::.. .:::::::..: ::: :.
CCDS85 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALN-PVQRPEM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDN
.::::::.:::: ::: ::.:::.:::.:: ::::::::::::::.:::.:::::::.::
CCDS85 FIIGAQPVCSQLPGLSPGQRKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWG
.:::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS85 ASVFGRVMQIGSRETAFTHAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLPRDWLWG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKC
:::::..::::::::::::::::. :::: :..:.::::.:::::::.::..:::::::
CCDS85 GCGDNVEYGYRFAKEFVDAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKC
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLV
:::::::::::::::::.:::::: ::::::::::::.. .:.: :::::..:: .:::
CCDS85 HGVSGSCSLKTCWLQLAEFRKVGDRLKEKYDSAAAMRVTRKGRLELVNSRFTQPTPEDLV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFH
:.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::.::::::::
CCDS85 YVDPSPDYCLRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFH
280 290 300 310 320 330
370 380
pF1KE1 WCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
:::.:.::::::::::..::
CCDS85 WCCFVRCKKCTEIVDQYICK
340 350
>>CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs109|chr1 (391 aa)
initn: 1276 init1: 436 opt: 1236 Z-score: 1377.9 bits: 263.7 E(33420): 2e-70
Smith-Waterman score: 1255; 48.2% identity (74.4% similar) in 367 aa overlap (18-380:32-380)
10 20 30 40
pF1KE1 MKKSIGILSPGVALGMAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWW
:: :... :. : ... .. . .:::
CCDS84 LRPGGAEEAAQLPLRRASAPVPVPSPAAPDGSRASARLGLACLLLLLLLTLPARVDTSWW
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 SLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQ
.: .::. .:... :: . :..::. : : :. .::::. :.:::.:
CCDS84 YIGA-----------LGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMRSVGEGAREWIRECQHQ
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 FRHRRWNCSTVD-NTSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSR
:::.::::.:.: . .:::::: .:::.::.::.:.::::.:..::: .::::.:.:.
CCDS84 FRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAITRACSQGELSVCSCDP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 AARPK--DLPRDWLWGGCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNE
.: . : :. ::::.::: :: :::: ::::.:. :. ..:: :::::::.
CCDS84 YTRGRHHDQRGDFDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEK-RL------KDARALMNLHNNR
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 AGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSRG-K
:: .: . . ::::::::::.:.::: :.:::..:: :...::.:. . .. : .
CCDS84 CGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQVMATQDGAN
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 LVQVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRG
.. . . . : ::::.: :::::: ....::::: ::.:.:::.: ::::.::::::
CCDS84 FTAARQGYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTSKGTDGCEIMCCGRG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380
pF1KE1 YDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
:: ..... .:.::::::: :.::.: . :: .::
CCDS84 YDTTRVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWLDQT
350 360 370 380 390
>>CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs109|chr1 (372 aa)
initn: 1236 init1: 436 opt: 1234 Z-score: 1375.9 bits: 263.3 E(33420): 2.6e-70
Smith-Waterman score: 1234; 52.2% identity (78.3% similar) in 322 aa overlap (63-380:47-361)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 FFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQY
.::. .:... :: . :..::. : : :.
CCDS84 LKTEGSLRTAVPGIPTQSAFNKCLQRYIGALGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMRS
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 IGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVD-NTSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMS
.::::. :.:::.::::.::::.:.: . .:::::: .:::.::.::.:.::::.:..
CCDS84 VGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAIT
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200
pF1KE1 RACREGELSTCGCSRAARPK--DLPRDWLWGGCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKG
::: .::::.:.:. .: . : :. ::::.::: :: :::: ::::.:. :.
CCDS84 RACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGDFDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEK-RL----
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 SYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEK
..:: :::::::. :: .: . . ::::::::::.:.::: :.:::..:: :...
CCDS84 --KDARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRR
200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 YDSAAAMRLNSRG-KLVQVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKT
::.:. . .. : ... . . . : ::::.: :::::: ....::::: ::.:.::
CCDS84 YDGAVQVMATQDGANFTAARQGYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKT
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
:.: ::::.:::::::: ..... .:.::::::: :.::.: . :: .::
CCDS84 SKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWL
310 320 330 340 350 360
CCDS84 DQT
370
>>CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs109|chr1 (351 aa)
initn: 1153 init1: 441 opt: 1215 Z-score: 1355.2 bits: 259.4 E(33420): 3.7e-69
Smith-Waterman score: 1220; 47.9% identity (72.7% similar) in 363 aa overlap (21-380:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKKSIGILSPGVALGMAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEV
:: . : .: .. :: :..: :. ..: :
CCDS22 MSPRSCLRSLRLLV-FAVFSAAASNWLYLA-----KLSSV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDN
:. . : .: :: : : ..:. . :. . .::. .:.:::::::.:::::::.:.
CCDS22 GSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRNLEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWG
:::.:. :.::.::.::.:.:::. :..::: ::: :::.:... . :. . :.
CCDS22 LPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGVAFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVS-PQGFQWS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKC
::.::: :: :.. :::.::: .::. :.: :::::::::::... . : :::
CCDS22 GCSDNIAYGVAFSQSFVDVRER----SKGA-SSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKC
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290
pF1KE1 HGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAM---RLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQ
::::::: .:::: . ::.:: :::::.:.:. . :..: :: :..:. : .
CCDS22 HGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDE
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 DLVYIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHC
::::..::::.: .. .: :::.:: :::::...:::::.:::::. .. .::: :
CCDS22 DLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSC
270 280 290 300 310 320
360 370 380
pF1KE1 KFHWCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
::::::.:::..: ..:. .:.
CCDS22 KFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
330 340 350
>>CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs109|chr7 (360 aa)
initn: 1064 init1: 453 opt: 1214 Z-score: 1353.9 bits: 259.2 E(33420): 4.4e-69
Smith-Waterman score: 1215; 49.6% identity (74.8% similar) in 341 aa overlap (44-380:25-349)
20 30 40 50 60 70
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:: ..:..::: . : :. :..:. :::.:::..::::.:.: . :.::::. .:
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::.::.::.:.:::: :..::: .::...:.:. . . :: . ::::.::::::
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200 210 220 230 240 250
pF1KE1 RFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLK
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:::: .:::::.:: : .::..: . .:. : : : ::..:: .::::.. :::::
CCDS57 TCWLAMADFRKTGDYLWRKYNGAIQVVMNQDGTGFTVANERFKKPTKNDLVYFENSPDYC
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: : .: .::
CCDS57 CLEALDVHTCKAPKNADWTTAT
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30 40 50 60 70 80
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380
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::
CCDS33 CK
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CCDS76 RTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTSKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQC
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CCDS76 ECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWLDQT
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CCDS26 MNRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]