FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1589, 1052 aa
1>>>pF1KE1589 1052 - 1052 aa - 1052 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3393+/-0.00113; mu= 5.4964+/- 0.068
mean_var=319.0662+/-68.599, 0's: 0 Z-trim(111.7): 649 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.071802
statistics sampled from 12045 (12791) to 12045 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.383), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs109|chr8 (1052) 7054 745.7 1.2e-214
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs109|chr8 (1065) 5901 626.3 1.1e-178
CCDS87628.1 PTK2 gene_id:5747|Hs109|chr8 ( 362) 2436 266.8 6e-71
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs109|chr8 (1009) 2333 256.6 2e-67
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs109|chr8 ( 967) 2266 249.7 2.3e-65
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 ( 453) 797 97.2 9e-20
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 ( 822) 797 97.4 1.3e-19
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs109|chr7 ( 976) 793 97.1 2e-19
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs109|chr7 ( 987) 766 94.3 1.4e-18
CCDS86924.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2 ( 949) 761 93.8 2e-18
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs109|chr2 ( 986) 761 93.8 2e-18
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs109|chr3 ( 984) 760 93.7 2.2e-18
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1004) 758 93.5 2.5e-18
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1037) 758 93.5 2.6e-18
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1038) 758 93.5 2.6e-18
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1015) 755 93.2 3.2e-18
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1016) 755 93.2 3.2e-18
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1308) 756 93.4 3.5e-18
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs109|chr1 ( 986) 750 92.7 4.4e-18
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs109|chr1 ( 987) 750 92.7 4.4e-18
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs109|chr1 (1055) 750 92.7 4.7e-18
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs109|chr3 ( 983) 748 92.4 5.1e-18
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs109|chr6 ( 998) 748 92.5 5.2e-18
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1292) 749 92.7 5.7e-18
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9 (1130) 746 92.3 6.5e-18
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9 (1149) 746 92.3 6.6e-18
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs109|chr2 ( 312) 733 90.3 7e-18
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs109|chr1 (1005) 739 91.5 9.9e-18
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1043) 738 91.4 1.1e-17
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs109|chr2 ( 619) 733 90.7 1.1e-17
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1058) 738 91.4 1.1e-17
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1064) 738 91.4 1.1e-17
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1079) 738 91.5 1.1e-17
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1161) 738 91.5 1.2e-17
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1167) 738 91.5 1.2e-17
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1182) 738 91.5 1.2e-17
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs109|chr3 ( 998) 734 91.0 1.4e-17
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 694) 730 90.4 1.5e-17
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 752) 730 90.5 1.6e-17
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 764) 730 90.5 1.6e-17
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 822) 730 90.5 1.7e-17
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 ( 542) 726 89.9 1.7e-17
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs109|chr1 ( 976) 730 90.6 1.9e-17
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs109|chr9 ( 612) 724 89.7 2.1e-17
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs109|chr9 ( 635) 724 89.8 2.1e-17
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1225) 724 90.1 3.3e-17
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1240) 724 90.1 3.4e-17
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1255) 724 90.1 3.4e-17
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 504) 702 87.4 8.9e-17
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 505) 702 87.4 8.9e-17
>>CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs109|chr8 (1052 aa)
initn: 7054 init1: 7054 opt: 7054 Z-score: 3967.1 bits: 745.7 E(33420): 1.2e-214
Smith-Waterman score: 7054; 100.0% identity (100.0% similar) in 1052 aa overlap (1-1052:1-1052)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAAYLDPNLNHTPNSSTKTHLGTGMERSPGAMERVLKVFHYFESNSEPTTWASIIRHGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MAAAYLDPNLNHTPNSSTKTHLGTGMERSPGAMERVLKVFHYFESNSEPTTWASIIRHGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ATDVRGIIQKIVDSHKVKHVACYGFRLSHLRSEEVHWLHVDMGVSSVREKYELAHPPEEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ATDVRGIIQKIVDSHKVKHVACYGFRLSHLRSEEVHWLHVDMGVSSVREKYELAHPPEEW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KYELRIRYLPKGFLNQFTEDKPTLNFFYQQVKSDYMLEIADQVDQEIALKLGCLEIRRSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KYELRIRYLPKGFLNQFTEDKPTLNFFYQQVKSDYMLEIADQVDQEIALKLGCLEIRRSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 WEMRGNALEKKSNYEVLEKDVGLKRFFPKSLLDSVKAKTLRKLIQQTFRQFANLNREESI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 WEMRGNALEKKSNYEVLEKDVGLKRFFPKSLLDSVKAKTLRKLIQQTFRQFANLNREESI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LKFFEILSPVYRFDKECFKCALGSSWIISVELAIGPEEGISYLTDKGCNPTHLADFTQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LKFFEILSPVYRFDKECFKCALGSSWIISVELAIGPEEGISYLTDKGCNPTHLADFTQVQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TIQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGTSQSFII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TIQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGTSQSFII
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RPQKEGERALPSIPKLANSEKQGMRTHAVSVSETDDYAEIIDEEDTYTMPSTRDYEIQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RPQKEGERALPSIPKLANSEKQGMRTHAVSVSETDDYAEIIDEEDTYTMPSTRDYEIQRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 RIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKYSLDLASLILYAYQLSTALAYLESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKYSLDLASLILYAYQLSTALAYLESK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 RFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYMEDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINFRRFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYMEDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINFRRFT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 SASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 YDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 YDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 PSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRPQE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 IAMWQPNVEDSTVLDLRGIGQVLPTHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 IAMWQPNVEDSTVLDLRGIGQVLPTHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 RGSIDREDGSLQGPIGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKPPRPGAPGHLGSLASLSSPADSYNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RGSIDREDGSLQGPIGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKPPRPGAPGHLGSLASLSSPADSYNE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 GVKLQPQEISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GVKLQPQEISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLA
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 LRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KE1 LTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQTRPH
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQTRPH
1030 1040 1050
>>CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs109|chr8 (1065 aa)
initn: 5869 init1: 5869 opt: 5901 Z-score: 3321.5 bits: 626.3 E(33420): 1.1e-178
Smith-Waterman score: 7002; 98.7% identity (98.8% similar) in 1065 aa overlap (1-1052:1-1065)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAAYLDPNLNHTPNSSTKTHLGTGMERSPGAMERVLKVFHYFESNSEPTTWASIIRHGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MAAAYLDPNLNHTPNSSTKTHLGTGMERSPGAMERVLKVFHYFESNSEPTTWASIIRHGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ATDVRGIIQKIVDSHKVKHVACYGFRLSHLRSEEVHWLHVDMGVSSVREKYELAHPPEEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ATDVRGIIQKIVDSHKVKHVACYGFRLSHLRSEEVHWLHVDMGVSSVREKYELAHPPEEW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KYELRIRYLPKGFLNQFTEDKPTLNFFYQQVKSDYMLEIADQVDQEIALKLGCLEIRRSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KYELRIRYLPKGFLNQFTEDKPTLNFFYQQVKSDYMLEIADQVDQEIALKLGCLEIRRSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 WEMRGNALEKKSNYEVLEKDVGLKRFFPKSLLDSVKAKTLRKLIQQTFRQFANLNREESI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 WEMRGNALEKKSNYEVLEKDVGLKRFFPKSLLDSVKAKTLRKLIQQTFRQFANLNREESI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LKFFEILSPVYRFDKECFKCALGSSWIISVELAIGPEEGISYLTDKGCNPTHLADFTQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LKFFEILSPVYRFDKECFKCALGSSWIISVELAIGPEEGISYLTDKGCNPTHLADFTQVQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TIQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGTSQSFII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TIQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGTSQSFII
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RPQKEGERALPSIPKLANSEKQGMRTHAVSVSETDDYAEIIDEEDTYTMPSTRDYEIQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RPQKEGERALPSIPKLANSEKQGMRTHAVSVSETDDYAEIIDEEDTYTMPSTRDYEIQRE
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430 440 450 460 470 480
pF1KE1 RIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDH
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490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKYSLDLASLILYAYQLSTALAYLESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKYSLDLASLILYAYQLSTALAYLESK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 RFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYMEDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINFRRFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYMEDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINFRRFT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 SASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWA
610 620 630 640 650 660
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pF1KE1 YDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 PSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRPQE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 IAMWQPNVEDSTVLDLRGIGQVLPTHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IAMWQPNVEDSTVLDLRGIGQVLPTHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KE1 RGSIDREDGSLQGPIGNQHIYQPVGKP----------DPAAPPKKPPRPGAPGHLGSLAS
::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::
CCDS56 RGSIDREDGSLQGPIGNQHIYQPVGKPGKEEKNWAERNPAAPPKKPPRPGAPGHLGSLAS
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940
pF1KE1 LSSPADSYNEGVK---LQPQEISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPP
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LSSPADSYNEGVKPWRLQPQEISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPP
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 EEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQY
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE1 VMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQTRPH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQTRPH
1030 1040 1050 1060
>>CCDS87628.1 PTK2 gene_id:5747|Hs109|chr8 (362 aa)
initn: 2436 init1: 2436 opt: 2436 Z-score: 1387.4 bits: 266.8 E(33420): 6e-71
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670 680 690 700 710 720
pF1KE1 YDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGY
10 20 30
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 PSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 PSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNHRPQE
40 50 60 70 80 90
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 IAMWQPNVEDSTVLDLRGIGQVLPTHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 IAMWQPNVEDSTVLDLRGIGQVLPTHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPDVRLS
100 110 120 130 140 150
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 RGSIDREDGSLQGPIGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKPPRPGAPGHLGSLASLSSPADSYNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 RGSIDREDGSLQGPIGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKPPRPGAPGHLGSLASLSSPADSYNE
160 170 180 190 200 210
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 GVKLQPQEISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GVKLQPQEISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLA
220 230 240 250 260 270
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 LRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQYVMTSLQQEYKKQM
280 290 300 310 320 330
1030 1040 1050
pF1KE1 LTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQTRPH
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQTRPH
340 350 360
>>CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs109|chr8 (1009 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 YLDPNLNHTPNSSTKTHLGTGMERSPGAMERVLKVFHYFESNS-EPTTWASIIRHGDATD
:.::: : ::: .: .... :.
CCDS60 SRVKLGTLRRPEGPAEPMVVVPVDVEKEDVRILKVCFY--SNSFNPGKNFKLVKCTVQTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE1 VRGIIQKIVDSHKV----KHVACYGFRLSHLRSEEVHWLHVDMGVSSVREKYELAHPPEE
.: :: .:. : .. . . :::.::.:..:.:.:::: .: :. :..::: : :
CCDS60 IREIITSILLSGRIGPNIRLAECYGLRLKHMKSDEIHWLHPQMTVGEVQDKYECLHVEAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 WKYELRIRYLPKGFLNQFTEDKPTLNFFYQQVKSDYMLEIADQVDQEIALKLGCLEIRRS
:.:.:.:::::. :.... ::. :: .::::...::: . :..:.. .::.:::::.::
CCDS60 WRYDLQIRYLPEDFMESLKEDRTTLLYFYQQLRNDYMQRYASKVSEGMALQLGCLELRRF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 YWEMRGNALEKKSNYEVLEKDVGLKRFFPKSLLDSVKAKTLRKLIQQTFRQFANLNREES
. .: :::.::::.:.:::.::: ::::.. ...: : .::.:::::.:.:.: .::
CCDS60 FKDMPHNALDKKSNFELLEKEVGLDLFFPKQMQENLKPKQFRKMIQQTFQQYASLREEEC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 ILKFFEILSPVYRFDKECFKCALGSSWIISVELAIGPEEGISYLTDKGCNPTHLADFTQV
..:::. :. .:.: ..: : ..: :.:.:.:::. :: ::.. .:: ::.: :.
CCDS60 VMKFFNTLAGFANIDQETYRCELIQGWNITVDLVIGPK-GIRQLTSQDAKPTCLAEFKQI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 QTIQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGTSQSFI
..:. :. ...::: : :::. :.. . ::. :::::::::::::: . . :.:
CCDS60 RSIRCLPLEEG--QAVLQLGIEGAPQALSIKTSSLAEAENMADLIDGYCRLQGEHQGSLI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 IRPQKEGER--ALPSIPKLANSEKQGMRTHAVSVSETDDYAEIIDEEDTYTMPSTRDYEI
:.:.:.::. .::.:: : ... ... :. :.: :::: :: : :. .: :
CCDS60 IHPRKDGEKRNSLPQIPMLNLEARRSHLSESCSI-ESDIYAEIPDE--TLRRPGGPQYGI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 QRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKTCK-NCTSDSVREKFLQEALTMR
:: . :.: .::: ::.:..:.: . .. . ::.:::: .:: :. .:::..::. :.
CCDS60 AREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDN-KEKFMSEAVIMK
430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 QFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKYSLDLASLILYAYQLSTALAY
..::::::::::.: :.:.:::::: ::: .:. : :: . .:.::. :. :.::
CCDS60 NLDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAY
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 LESKRFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYMEDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINF
::: ::::::.::.::.: .::::::::::::.:: ::::: .::::::.::::::
CCDS60 LESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRYIEDEDYYKASVTRLPIKWMSPESINF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 RRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMT
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CCDS60 RRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMT
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 KCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPS
.:: :::: ::::::: .:: . . :: :. : : . . . .: :::::
CCDS60 RCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIAMEQERNARYRTPKI-LEPTAFQEPPPKPS
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 RPGYPSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNH
:: : : ... . :. : .:: . . : . ::. .. : :
CCDS60 RPKYRPPPQTNLLAPKLQ-------FQVPEGLCASSPTLTSPMEYPSPVNSLHTPPLHRH
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 RP-QEIAMWQPN-VEDSTVLDLRGIGQVLPTHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLK
.. .: . . .. :. . . . .. .. :.. : .::..: :: .::..::. :
CCDS60 NVFKRHSMREEDFIQPSSREEAQQLWEAEKVK-MRQILDKQQKQMVEDYQWLRQEEKSLD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 PDVRLSRGSIDREDGSLQGPIGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKPPRPGAPGHLGSLASLSSP
: : .. :. .:. . . :: . ..::.:::: ::
CCDS60 PMVYMN----DK------SPLTPE---KEVGYLEFTGPPQKPPRLGA-------------
840 850 860
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 ADSYNEGVKLQPQEISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMV
: :. :::::::..: :: :: ::.::.:..... ::: :: .:
CCDS60 ------------QSIQ--PTANLDRTDDLVYLNVMELVRAVLELKNELCQLPPEGYVVVV
870 880 890 900 910
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 KEVGLALRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQYVMTSLQQ
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CCDS60 KNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRTEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSE
920 930 940 950 960 970
1020 1030 1040 1050
pF1KE1 EYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQTRPH
: :.:::::.:.::::::::::..:::..
CCDS60 ECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPAE
980 990 1000
>>CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs109|chr8 (967 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 YLDPNLNHTPNSSTKTHLGTGMERSPGAMERVLKVFHYFESNS-EPTTWASIIRHGDATD
:.::: : ::: .: .... :.
CCDS60 SRVKLGTLRRPEGPAEPMVVVPVDVEKEDVRILKVCFY--SNSFNPGKNFKLVKCTVQTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE1 VRGIIQKIVDSHKV----KHVACYGFRLSHLRSEEVHWLHVDMGVSSVREKYELAHPPEE
.: :: .:. : .. . . :::.::.:..:.:.:::: .: :. :..::: : :
CCDS60 IREIITSILLSGRIGPNIRLAECYGLRLKHMKSDEIHWLHPQMTVGEVQDKYECLHVEAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 WKYELRIRYLPKGFLNQFTEDKPTLNFFYQQVKSDYMLEIADQVDQEIALKLGCLEIRRS
:.:.:.:::::. :.... ::. :: .::::...::: . :..:.. .::.:::::.::
CCDS60 WRYDLQIRYLPEDFMESLKEDRTTLLYFYQQLRNDYMQRYASKVSEGMALQLGCLELRRF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 YWEMRGNALEKKSNYEVLEKDVGLKRFFPKSLLDSVKAKTLRKLIQQTFRQFANLNREES
. .: :::.::::.:.:::.::: ::::.. ...: : .::.:::::.:.:.: .::
CCDS60 FKDMPHNALDKKSNFELLEKEVGLDLFFPKQMQENLKPKQFRKMIQQTFQQYASLREEEC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 ILKFFEILSPVYRFDKECFKCALGSSWIISVELAIGPEEGISYLTDKGCNPTHLADFTQV
..:::. :. .:.: ..: : ..: :.:.:.:::. :: ::.. .:: ::.: :.
CCDS60 VMKFFNTLAGFANIDQETYRCELIQGWNITVDLVIGPK-GIRQLTSQDAKPTCLAEFKQI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 QTIQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGTSQSFI
..:. :. ...::: : :::. :.. . ::. :::::::::::::: . . :.:
CCDS60 RSIRCLPLEEG--QAVLQLGIEGAPQALSIKTSSLAEAENMADLIDGYCRLQGEHQGSLI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 IRPQKEGER--ALPSIPKLANSEKQGMRTHAVSVSETDDYAEIIDEEDTYTMPSTRDYEI
:.:.:.::. .::.:: : ... ... :. :.: :::: :: : :. .: :
CCDS60 IHPRKDGEKRNSLPQIPMLNLEARRSHLSESCSI-ESDIYAEIPDE--TLRRPGGPQYGI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 QRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKTCK-NCTSDSVREKFLQEALTMR
:: . :.: .::: ::.:..:.: . .. . ::.:::: .:: :. .:::..::. :.
CCDS60 AREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDN-KEKFMSEAVIMK
430 440 450 460 470
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pF1KE1 QFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKYSLDLASLILYAYQLSTALAY
..::::::::::.: :.:.:::::: ::: .:. : :: . .:.::. :. :.::
CCDS60 NLDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAY
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 LESKRFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYMEDSTYYKASKGKLPIKWMAPESINF
::: ::::::.::.::.: .::::::::::::.:: ::::: .::::::.::::::
CCDS60 LESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRYIEDEDYYKASVTRLPIKWMSPESINF
540 550 560 570 580 590
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pF1KE1 RRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMT
::::.:::::::.::::::: : .:: ..:.:::: .:.:.::: : :::.::.:::
CCDS60 RRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMT
600 610 620 630 640 650
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pF1KE1 KCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPS
.:: :::: ::::::: .:: . . :: :. : : . . . .: :::::
CCDS60 RCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIAMEQERNARYRTPKI-LEPTAFQEPPPKPS
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 RPGYPSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSHGITAMAGSIYPGQASLLDQTDSWNH
:: : : ... . :. : .: . : :.. .: :.
CCDS60 RPKYRPPPQTNLLAPKLQ-------FQEEDF------------IQPSSREEAQQL--WE-
720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 RPQEIAMWQPNVEDSTVLDLRGIGQVLPTHLMEERLIRQQQEMEEDQRWLEKEERFLKPD
... : : .:: .::..: :: .::..::. : :
CCDS60 -AEKVKMRQ-------ILD------------------KQQKQMVEDYQWLRQEEKSLDPM
760 770 780 790
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 VRLSRGSIDREDGSLQGPIGNQHIYQPVGKPDPAAPPKKPPRPGAPGHLGSLASLSSPAD
: .. : : : . :: . ..::.:::: ::
CCDS60 VYMN-------DKSPLTP------EKEVGYLEFTGPPQKPPRLGA---------------
800 810 820
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 SYNEGVKLQPQEISPPPTANLDRSNDKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKE
: :.: ::::::..: :: :: ::.::.:..... ::: :: .::.
CCDS60 ----------QSIQP--TANLDRTDDLVYLNVMELVRAVLELKNELCQLPPEGYVVVVKN
830 840 850 860 870
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 VGLALRTLLATVDETIPLLPASTHREIEMAQKLLNSDLGELINKMKLAQQYVMTSLQQEY
:::.:: :...::. .: ::.:.. ::: .:::::.::.::::::.:::: ..:::..:
CCDS60 VGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRTEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSEEC
880 890 900 910 920 930
1020 1030 1040 1050
pF1KE1 KKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKMLGQTRPH
:.:::::.:.::::::::::..:::..
CCDS60 KRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPAE
940 950 960
>>CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 (453 aa)
initn: 734 init1: 584 opt: 797 Z-score: 468.6 bits: 97.2 E(33420): 9e-20
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310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGTSQSFIIR
: . : . : : .: ...
CCDS78 KSALGSSALSDMISISEKPLAEQDWYHGAIPRIEAQELLKKQGDFLVRESHGKPGEYVLS
70 80 90 100 110 120
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pF1KE1 PQKEGER---ALPSIPKLANSEKQGMRTHAVSVSETDDYAEIIDEEDTYTM----PSTRD
..:.: . . .. : :. . ... ..: ... .. :. .
CCDS78 VYSDGQRRHFIIQYVDNMYRFEGTGFSNIPQLIDHHYTTKQVITKKSGVVLLNPIPKDKK
130 140 150 160 170 180
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALT
. ...: . ::. .:.:.::.:..: . .::.::::. . .. ::::::
CCDS78 WILSHEDVILGELLGKGNFGEVYKGTL----KDKTSVAVKTCKEDLPQELKIKFLQEAKI
190 200 210 220 230 240
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 MRQFDHPHIVKLIGVITE-NPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKYSLDLASLILYAYQLSTA
..:.:::.::::::: :. .::.::::: . :.. .::. .: : : .:. .. . ...
CCDS78 LKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYIIMELVSGGDFLTFLRRKKDELKLKQLVKFSLDAAAG
250 260 270 280 290 300
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 LAYLESKRFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYMEDSTYYKASKGKLPIKWMAPES
. ::::: .:::.:::: ::. :. .:..:::.:: . ..: ... ..:::: :::.
CCDS78 MLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNVLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEA
310 320 330 340 350 360
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 INFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYS
.:. :..: :::: ::. .:: . :: :. :. :... ..: : :. : .:: . .
CCDS78 LNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMSAPQHCPEDISK
370 380 390 400 410 420
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 LMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERMRMESRRQATVSWDSGGSDEAPP
.: ::: : : ::.:.::. .:. :
CCDS78 IMMKCWDYKPENRPKFSELQKELTIIKRKLT
430 440 450
>>CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 (822 aa)
initn: 734 init1: 584 opt: 797 Z-score: 465.5 bits: 97.4 E(33420): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 797; 34.3% identity (64.9% similar) in 356 aa overlap (332-679:466-817)
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IQYSNSEDKDRKGMLQLKIAGAPEPLTVTAPSLTIAENMADLIDGYCRLVNGTSQSFIIR
: . : . : : .: ...
CCDS40 KSALGSSALSDMISISEKPLAEQDWYHGAIPRIEAQELLKKQGDFLVRESHGKPGEYVLS
440 450 460 470 480 490
370 380 390 400 410
pF1KE1 PQKEGER---ALPSIPKLANSEKQGMRTHAVSVSETDDYAEIIDEEDTYTM----PSTRD
..:.: . . .. : :. . ... ..: ... .. :. .
CCDS40 VYSDGQRRHFIIQYVDNMYRFEGTGFSNIPQLIDHHYTTKQVITKKSGVVLLNPIPKDKK
500 510 520 530 540 550
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALT
. ...: . ::. .:.:.::.:..: . .::.::::. . .. ::::::
CCDS40 WILSHEDVILGELLGKGNFGEVYKGTL----KDKTSVAVKTCKEDLPQELKIKFLQEAKI
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