Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1497
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1497, 951 aa
1>>>pF1KE1497 951 - 951 aa - 951 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4903+/-0.00116; mu= 16.4318+/- 0.070
mean_var=102.6726+/-21.125, 0's: 0 Z-trim(104.1): 34 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.126575
statistics sampled from 7729 (7755) to 7729 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 3.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32621.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 ( 951) 6193 1142.5 0
CCDS13855.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 ( 949) 5190 959.3 0
CCDS32622.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 ( 937) 4310 798.6 0
CCDS13856.2 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 ( 939) 3880 720.1 5e-207
CCDS54515.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 ( 919) 3877 719.5 7.2e-207
CCDS865.1 AP4B1 gene_id:10717|Hs108|chr1 ( 739) 1031 199.8 1.7e-50
CCDS61736.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1050) 633 127.2 1.7e-28
CCDS76192.1 AP4B1 gene_id:10717|Hs108|chr1 ( 571) 622 125.0 4.1e-28
CCDS45331.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1082) 551 112.2 5.6e-24
CCDS61737.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1101) 551 112.2 5.7e-24
CCDS64186.1 AP3B1 gene_id:8546|Hs108|chr5 (1045) 526 107.6 1.3e-22
CCDS4041.1 AP3B1 gene_id:8546|Hs108|chr5 (1094) 526 107.6 1.3e-22
>>CCDS32621.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 (951 aa)
initn: 6193 init1: 6193 opt: 6193 Z-score: 6112.9 bits: 1142.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6193; 100.0% identity (100.0% similar) in 951 aa overlap (1-951:1-951)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 DSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 YVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 STPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 VEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KE1 LYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
910 920 930 940 950
>>CCDS13855.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 (949 aa)
initn: 4968 init1: 3615 opt: 5190 Z-score: 5123.1 bits: 959.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5190; 83.2% identity (94.3% similar) in 957 aa overlap (1-951:1-949)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
:::::::::.:::::::::::::..::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS13 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.::::::::::
CCDS13 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
:::::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::
CCDS13 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
::::::::::::::::::::::::::.:.: :: :::. ::::::::::::::.:::.::
CCDS13 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS13 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
:::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS13 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
CCDS13 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE1 DAGDSP-VGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQV--SSMQMGAVDLLG
....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
CCDS13 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 GGLDSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMA
::::::.: : ::::. .:. . :.. .:. : ..:::.:::.:..:.:
CCDS13 GGLDSLMG-DEPEGIGGT-----NFV--APPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTL
670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 PGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFG
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CCDS13 SGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFG
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 VIPSTPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLN
. :..:: .:.:: :::....::::.:.: :::::::::::::::::::::::: : ::.
CCDS13 LAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLH
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 VLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEG
.::::::::.::.::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.:::::::
CCDS13 ILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEG
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 QDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYT---LSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
:::::::::::::::.:::::::::::. : ::::::::::::..::.:..::::
CCDS13 QDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTDLELSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
900 910 920 930 940
>>CCDS32622.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 (937 aa)
initn: 4289 init1: 4289 opt: 4310 Z-score: 4254.7 bits: 798.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6059; 98.5% identity (98.5% similar) in 951 aa overlap (1-951:1-937)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 DSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGG
::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSL--------------VGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGG
670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 YVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIP
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 STPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLF
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 VEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDM
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950
pF1KE1 LYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
890 900 910 920 930
>>CCDS13856.2 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 (939 aa)
initn: 5196 init1: 3615 opt: 3880 Z-score: 3830.3 bits: 720.1 E(32554): 5e-207
Smith-Waterman score: 5177; 83.0% identity (94.0% similar) in 954 aa overlap (1-951:1-939)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
:::::::::.:::::::::::::..::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS13 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.::::::::::
CCDS13 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
:::::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::
CCDS13 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
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pF1KE1 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
::::::::::::::::::::::::::.:.: :: :::. ::::::::::::::.:::.::
CCDS13 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS13 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
:::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
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pF1KE1 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS13 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
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pF1KE1 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
CCDS13 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
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610 620 630 640 650
pF1KE1 DAGDSP-VGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQV--SSMQMGAVDLLG
....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
CCDS13 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
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660 670 680 690 700 710
pF1KE1 GGLDSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMA
::::::.: : .:. . :.. .:. : ..:::.:::.:..:.:
CCDS13 GGLDSLIG-------------GTNFV--APPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTL
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pF1KE1 PGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFG
:.:::::::::::.::::::::::::.. : : :....:::::: :::::::::.::::
CCDS13 SGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFG
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780 790 800 810 820 830
pF1KE1 VIPSTPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLN
. :..:: .:.:: :::....::::.:.: :::::::::::::::::::::::: : ::.
CCDS13 LAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLH
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840 850 860 870 880 890
pF1KE1 VLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEG
.::::::::.::.::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.:::::::
CCDS13 ILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEG
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pF1KE1 QDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
:::::::::::::::.:::::::::::. :::::::::::::..::.:..::::
CCDS13 QDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
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>>CCDS54515.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 (919 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
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CCDS54 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
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pF1KE1 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
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pF1KE1 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.::::::::::
CCDS54 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
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:::::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::
CCDS54 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
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pF1KE1 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
::::::::::::::::::::::::::.:.: :: :::. ::::::::::::::.:::.::
CCDS54 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
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pF1KE1 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
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pF1KE1 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS54 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
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pF1KE1 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
:::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
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pF1KE1 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS54 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
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pF1KE1 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
CCDS54 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
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pF1KE1 DAGDSP-VGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQV--SSMQMGAVDLLG
....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
CCDS54 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
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pF1KE1 GGLDSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMA
::::::.: : .:. . :.. .:. : ..:::.:::.:..:.:
CCDS54 GGLDSLIG-------------GTNFV--APPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTL
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pF1KE1 PGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFG
:.::::::: : : :....:::::: :::::::::.::::
CCDS54 SGSYVAPKAV--------------------GSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFG
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pF1KE1 VIPSTPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLN
. :..:: .:.:: :::....::::.:.: :::::::::::::::::::::::: : ::.
CCDS54 LAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLH
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pF1KE1 VLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEG
.::::::::.::.::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.:::::::
CCDS54 ILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEG
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pF1KE1 QDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
:::::::::::::::.:::::::::::. :::::::::::::..::.:..::::
CCDS54 QDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
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pF1KE1 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEK----KEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVN
::: : : . . . ......:: :: : :.:..: ..:.
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pF1KE1 CMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVD
: .. :::::::. .:: .::.:..:.:.. ::: ::::..:.::.:.: .:.
CCDS86 ASATVDIVQKKLVYLYMCTYAPLKPDLALLAINTLCKDCSDPNPMVRGLALRSMCSLRMP
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pF1KE1 KITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMV
. ::. .:. . :.:. :::..:.. ::.:..... : .... : .:. :..:.:
CCDS86 GVQEYIQQPILNGLRDKASYVRRVAVLGCAKMHNLHGDSEVDGALVNELYSLLRDQDPIV
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pF1KE1 VANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDRE
:.: . .: :: ... . . .: ..::. ... .::: .:. : :.:....:
CCDS86 VVNCLRSLEEILKQEGG---VVINKPIAHHLLNRMSKLDQWGQAEVLNFLLRYQPRSEEE
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pF1KE1 AQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPK-DSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGE
.: . . :. .. .::..:.:... . ...:. ..: .: .. ::.. :.:
CCDS86 LFDILNLLDSFLKSSSPGVVMGATKLFLILAKMFPHVQTD----VLVRVKGPLLAACSSE
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pF1KE1 P-EVQYVALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQV
:. .::: .. :... : .... : :: .:..: :.::.:.... .:... :. ::
CCDS86 SRELCFVALCHVRQILHSLPGHFSSHYKKFFCSYSEPHYIKLQKVEVLCELVNDENVQQV
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pF1KE1 LAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVI
: ::. : :.:..::.. :. ::: : . ...::. : .:. . .... .. ..
CCDS86 LEELRGYCTDVSADFAQAAIFAIGGIA---RTYTDQCVQILTELLGLRQEHITTVVVQTF
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pF1KE1 RDIFRKYPNKYESIIATL--CENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEG
::. :. :.. .: :: ..... ... :.::..: ..::: :: .::.:.:.
CCDS86 RDLVWLCPQCTEAVCQALPGCE--ENIQDSEGKQALIWLLGVHGERIPNAPYVLEDFVEN
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pF1KE1 FHDES-TQVQLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLS
..:. :.. ::::...:::..:.: :... ..: .. . .:::: .:.:::
CCDS86 VKSETFPAVKMELLTALLRLFLSRPAECQDMLGRLLYYCIEEEKDMAVRDRGLFYYRLLL
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pF1KE1 TDPVTAKEVVLSEK--PLISEETDLIE-PTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGI
. .:... : : : .. : : : .. ...:. :: : : . .:
CCDS86 VGIDEVKRILCSPKSDPTLGLLEDPAERP--VNSWASDFNTLVPVYGKAHWATISKCQGA
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pF1KE1 HRKHLPIHHGSTDAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSM
.: . . :. :...:. : :. : .:..: :.
CCDS86 ERCDPELPKTSSFAASGPL--IPEENKERVQELPDSGALMLVPNRQLTADYFEKTWLSLK
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pF1KE1 QMGAVDLLGGGLDSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLF
CCDS86 VAHQQVLPWRGEFHPDTLQMALQVVNIQTIAMSRAGSRPWKAYLSAQDDTGCLFLTELLL
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>>CCDS61736.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1050 aa)
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10 20 30 40
pF1KE1 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKD
.:: :...: . ::.:...: .. ::.
CCDS61 KGGSAGPGEPEYGHDPASGGIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKLEAMKRIVAMIARGKN
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 VSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALA
.:.::: ::. : :. :::: :::: :
CCDS61 ASDLFPAVVK--------------------------------NVACKNIEDPNQLIRASA
80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 VRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLR
.:... ::: :. . ... .: .:::::::: . ::....... .:: ... ..
CCDS61 LRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSLDSDQ-KDQ-LIEVIE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 DLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCL
:.::.. .:....: :. :. :. .:: .: :: . : . ::::. :.. :
CCDS61 KLLADKTTLVAGSVVMAFEEVC---PER--IDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWGQVVIISML
160 170 180 190 200 210
230 240 250
pF1KE1 SNY------NP-----------------KDDREAQSICERVT---------PRLSHANSA
. : .: ... ::.. . : : . .
CCDS61 TRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKPYVMDPDHR
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300
pF1KE1 VVLSAVKVLMKFLE---LLPKDSDYYNMLLKK----LAPPLVTLLSGEPEVQYVALRNIN
..: .: :.. .. . :... : .: :: :: .. :::::.:.:.
CCDS61 LLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQYVVLQNVA
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDV
. :: ... .: :... .:: .:. ::... ::...:: :: :.. : .:
CCDS61 TMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQTYIRSMDK
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 DFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRKYPNKYES
::: ...:::::: .. . . :.. :..:.... . :: :..:::. ... : ..
CCDS61 DFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGE
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 IIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDN-ADELLESFLEGFHDESTQVQLTLLT
:: : . :... : :::...:..::: :.. : ..:... ..: : :.: ...
CCDS61 IIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEEDIVKLQVIN
460 470 480 490 500 510
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pF1KE1 AIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVT------AKEV
.::.: . ..:. :.: ::::: :. : :.:::. . .:. . ::..
CCDS61 LAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQ-NYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGALSRHAKKL
520 530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
:. :: . ..: .. :. ..:::. . . ... :
CCDS61 FLAPKP-----APVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRNVE
580 590 600 610 620
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pF1KE1 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
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.:. . : .:. . . ... .:::
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230 240 250 260 270
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.:. : :.:....: .: . . :. .. .::..:.:... . ...:. ..:
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.... .:... :. ::: ::. : :.:..::.. :. ::: : . ...::. : .:
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. . .... .. ..::. :. :.. .: :: ..... ... :.::..: ..
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::: :: .::.:.:. ..:. :.. ::::...:::..:.: :... ..: ..
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. .:::: .:.::: . .:... : : : .. : : . . ...:. :
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: : : . .: .: . . :. :...:. : :. : .:..: :.
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170 180 190 200 210 220
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230 240 250
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260 270 280 290 300
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..: .: :.. .. . :... : .: :: :: .. :::::.:.:.
CCDS45 LLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQYVVLQNVA
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310 320 330 340 350 360
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. :: ... .: :... .:: .:. ::... ::...:: :: :.. : .:
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370 380 390 400 410 420
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:: : . :... : :::...:..::: :.. : ..:... ..: : :.: ...
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550 560 570 580 590 600
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50 60 70 80 90 100
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CCDS61 LRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSLDSDQ-KDQ-LIEVIE
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170 180 190 200 210 220
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CCDS61 KLLADKTTLVAGSVVMAFEEVC---PER--IDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWGQVVIISML
190 200 210 220 230 240
230 240 250
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CCDS61 TRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKPYVMDPDHR
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260 270 280 290 300
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CCDS61 TMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQTYIRSMDK
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370 380 390 400 410 420
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610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
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951 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 00:00:24 2016 done: Sun Nov 6 00:00:25 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]