Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1328
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1328, 364 aa
1>>>pF1KE1328 364 - 364 aa - 364 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4577+/-0.000709; mu= 16.0005+/- 0.043
mean_var=66.0154+/-12.972, 0's: 0 Z-trim(109.3): 19 B-trim: 4 in 1/50
Lambda= 0.157853
statistics sampled from 10934 (10945) to 10934 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16
Scan time: 1.280
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS44980.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 ( 364) 2507 579.4 1.7e-165
CCDS31905.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 ( 414) 2388 552.3 2.7e-157
CCDS81742.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 ( 360) 2386 551.9 3.3e-157
CCDS41838.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 ( 400) 2381 550.7 7.9e-157
CCDS31906.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 ( 719) 1259 295.3 1.1e-79
CCDS41839.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 ( 687) 1258 295.1 1.2e-79
CCDS44981.1 OAS3 gene_id:4940|Hs109|chr12 (1087) 977 231.2 3.3e-60
CCDS9211.1 OASL gene_id:8638|Hs109|chr12 ( 514) 834 198.5 1.1e-50
CCDS9212.1 OASL gene_id:8638|Hs109|chr12 ( 255) 464 114.1 1.4e-25
CCDS73536.1 OASL gene_id:8638|Hs109|chr12 ( 384) 459 113.0 4.4e-25
CCDS44982.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 ( 172) 253 66.0 2.9e-11
>>CCDS44980.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 (364 aa)
initn: 2507 init1: 2507 opt: 2507 Z-score: 3084.9 bits: 579.4 E(33420): 1.7e-165
Smith-Waterman score: 2507; 99.7% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGSYKPNPQIYVKLIEECTDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS44 VQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGGYKPNPQIYVKLIEECTDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPPQYALELLTVYAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPPQYALELLTVYAW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASSLPFIPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASSLPFIPAP
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LHEA
::::
CCDS44 LHEA
>>CCDS31905.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 (414 aa)
initn: 2385 init1: 2385 opt: 2388 Z-score: 2937.6 bits: 552.3 E(33420): 2.7e-157
Smith-Waterman score: 2388; 97.8% identity (98.9% similar) in 356 aa overlap (1-355:1-356)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGSYKPNPQIYVKLIEECTDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS31 VQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGGYKPNPQIYVKLIEECTDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPPQYALELLTVYAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPPQYALELLTVYAW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE1 PADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVR-PPASSLPFIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. :.: :
CCDS31 PADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLTQHTPGSIHPTGRR
310 320 330 340 350 360
360
pF1KE1 PLHEA
CCDS31 GLDLHHPLNASASWGKGLQCYLDQFLHFQVGLLIQRGQSSSVSWCIIQDRTQVS
370 380 390 400 410
>>CCDS81742.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 (360 aa)
initn: 2386 init1: 2386 opt: 2386 Z-score: 2936.1 bits: 551.9 E(33420): 3.3e-157
Smith-Waterman score: 2386; 99.7% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGSYKPNPQIYVKLIEECTDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS81 VQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGGYKPNPQIYVKLIEECTDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPPQYALELLTVYAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPPQYALELLTVYAW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASSLPFIPAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVNLTLVGRRNYTNN
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LHEA
>>CCDS41838.1 OAS1 gene_id:4938|Hs109|chr12 (400 aa)
initn: 2381 init1: 2381 opt: 2381 Z-score: 2929.2 bits: 550.7 E(33420): 7.9e-157
Smith-Waterman score: 2381; 99.7% identity (100.0% similar) in 346 aa overlap (1-346:1-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGSYKPNPQIYVKLIEECTDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS41 VQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGGYKPNPQIYVKLIEECTDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPPQYALELLTVYAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPPQYALELLTVYAW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASSLPFIPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLAESNSADDETDDPR
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LHEA
CCDS41 RYQKYGYIGTHEYPHFSHRPSTLQAASTPQAEEDWTCTIL
370 380 390 400
>>CCDS31906.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 (719 aa)
initn: 1308 init1: 525 opt: 1259 Z-score: 1544.4 bits: 295.3 E(33420): 1.1e-79
Smith-Waterman score: 1259; 52.7% identity (77.5% similar) in 355 aa overlap (4-352:340-690)
10 20 30
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHA
: .::.. :::::...: :. :: ::. :
CCDS31 WLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNKCFLEQIDSA
310 320 330 340 350 360
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 IDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVKGGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLN
..:: :::: ::: :. . ..:.:::..:::.:. :::::::: . : .. .: :
CCDS31 VNIIRTFLKENCFRQSTAKI---QIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKSYTSQKN
370 380 390 400 410 420
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 RRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFEVQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAF
.: ....::..::.: ::. .. . :.: ::.::: :.: :.:.: :::::::
CCDS31 ERHKIVKEIHEQLKAFWREKEEELEVSFEPPKWKAPRVLSFSLKSKVLNESVSFDVLPAF
430 440 450 460 470 480
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 DALGQLTGSYKPNPQIYVKLIE--ECTDLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRL
.:::::... :.:..:. ::. . .:: :::::::: :::.:...::::::.::::
CCDS31 NALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPG-GEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLKDLIRL
490 500 510 520 530 540
220 230 240 250 260
pF1KE1 VKHWYQNCKKKL---GKLPPQYALELLTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQL
:::::..:..:: :.:::.:::::::.::::.:: :.::.::::::::: .::::
CCDS31 VKHWYKECERKLKPKGSLPPKYALELLTIYAWEQGSGVPDFDTAEGFRTVLELVTQYQQL
550 560 570 580 590 600
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 CIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLN
::.: :.:.. ..:.: :: : ::::::::.:::..:::: :. ::.::. ::.
CCDS31 CIFWKVNYNFEDETVRKFLLSQLQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAKEAKEWLS
610 620 630 640 650 660
330 340 350 360
pF1KE1 YPCFKNWDGSPVSSW-ILLVRPPASSLPFIPAPLHEA
::::. :.:. : . .. :.:
CCDS31 SPCFKDGTGNPIPPWKVPTMQTPGSCGARIHPIVNEMFSSRSHRILNNNSKRNF
670 680 690 700 710
>--
initn: 828 init1: 312 opt: 818 Z-score: 1001.6 bits: 194.9 E(33420): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 818; 40.7% identity (66.2% similar) in 349 aa overlap (4-349:8-339)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVS
: ..::..: ::..:: : . :.. .. :: :.: ..:. :.
CCDS31 MGNGESQLSSVPAQKLGWFIQEYLKPYEECQTLIDEMVNTICDVLQE----PEQFPL-VQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KVVKGGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFS
:. ::: :. :.::: ::. ::.:.: : :::: . ..... .:. : . ..
CCDS31 GVAIGGSYGRKTVLRGNSDGTLVLFFSDLKQFQDQKRSQRDILDKTGDKLKFCLFTKWLK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 VKFEVQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGSYKPNPQIYVKLIEE
.::.: : :... . .. . :.:: ::.:: . . .:.: :: .: .
CCDS31 NNFEIQKSLDG------FTIQVFTKNQRISFEVLAAFNAL---SLNDNPSPWIYRELKRS
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 CTDLQ-KEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPP--QYALE
. . :::..::::::. :. .:: :::.:: :.:::.:.:.::. :: ::::
CCDS31 LDKTNASPGEFAVCFTELQQKFFDNRPGKLKDLILLIKHWHQQCQKKIKDLPSLSPYALE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LLTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTK
::::::::.: : .:. :.: ::::::. ..::::: :.:.. :.. : .:: .
CCDS31 LLTVYAWEQGCRKDNFDIAEGVRTVLELIKCQEKLCIYWMVNYNFEDETIRNILLHQLQS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 PRPVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASS
:::::::.:::.:..: : :. : .::..::. : . : :. :: .: :
CCDS31 ARPVILDPVDPTNNVSG-DKICWQWLKKEAQTWLTSPNLDNE--LPAPSWNVLPAPLFTT
290 300 310 320 330 340
360
pF1KE1 LPFIPAPLHEA
CCDS31 PGHLLDKFIKEFLQPNKCFLEQIDSAVNIIRTFLKENCFRQSTAKIQIVRGGSTAKGTAL
350 360 370 380 390 400
>>CCDS41839.1 OAS2 gene_id:4939|Hs109|chr12 (687 aa)
initn: 1308 init1: 525 opt: 1258 Z-score: 1543.4 bits: 295.1 E(33420): 1.2e-79
Smith-Waterman score: 1258; 53.1% identity (77.7% similar) in 350 aa overlap (4-348:340-685)
10 20 30
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHA
: .::.. :::::...: :. :: ::. :
CCDS41 WLKKEAQTWLTSPNLDNELPAPSWNVLPAPLFTTPGHLLDKFIKEFLQPNKCFLEQIDSA
310 320 330 340 350 360
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 IDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVKGGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLN
..:: :::: ::: :. . ..:.:::..:::.:. :::::::: . : .. .: :
CCDS41 VNIIRTFLKENCFRQSTAKI---QIVRGGSTAKGTALKTGSDADLVVFHNSLKSYTSQKN
370 380 390 400 410 420
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 RRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKFEVQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAF
.: ....::..::.: ::. .. . :.: ::.::: :.: :.:.: :::::::
CCDS41 ERHKIVKEIHEQLKAFWREKEEELEVSFEPPKWKAPRVLSFSLKSKVLNESVSFDVLPAF
430 440 450 460 470 480
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 DALGQLTGSYKPNPQIYVKLIE--ECTDLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRL
.:::::... :.:..:. ::. . .:: :::::::: :::.:...::::::.::::
CCDS41 NALGQLSSGSTPSPEVYAGLIDLYKSSDLPG-GEFSTCFTVLQRNFIRSRPTKLKDLIRL
490 500 510 520 530 540
220 230 240 250 260
pF1KE1 VKHWYQNCKKKL---GKLPPQYALELLTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQL
:::::..:..:: :.:::.:::::::.::::.:: :.::.::::::::: .::::
CCDS41 VKHWYKECERKLKPKGSLPPKYALELLTIYAWEQGSGVPDFDTAEGFRTVLELVTQYQQL
550 560 570 580 590 600
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 CIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLN
::.: :.:.. ..:.: :: : ::::::::.:::..:::: :. ::.::. ::.
CCDS41 CIFWKVNYNFEDETVRKFLLSQLQKTRPVILDPAEPTGDVGGGDRWCWHLLAKEAKEWLS
610 620 630 640 650 660
330 340 350 360
pF1KE1 YPCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASSLPFIPAPLHEA
::::. :.:. : . :.
CCDS41 SPCFKDGTGNPIPPWKVPVKVI
670 680
>--
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10 20 30 40 50
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVS
: ..::..: ::..:: : . :.. .. :: :.: ..:. :.
CCDS41 MGNGESQLSSVPAQKLGWFIQEYLKPYEECQTLIDEMVNTICDVLQE----PEQFPL-VQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KVVKGGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFS
:. ::: :. :.::: ::. ::.:.: : :::: . ..... .:. : . ..
CCDS41 GVAIGGSYGRKTVLRGNSDGTLVLFFSDLKQFQDQKRSQRDILDKTGDKLKFCLFTKWLK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 VKFEVQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGSYKPNPQIYVKLIEE
.::.: : :... . .. . :.:: ::.:: . . .:.: :: .: .
CCDS41 NNFEIQKSLDG------FTIQVFTKNQRISFEVLAAFNAL---SLNDNPSPWIYRELKRS
120 130 140 150 160
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pF1KE1 CTDLQ-KEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPP--QYALE
. . :::..::::::. :. .:: :::.:: :.:::.:.:.::. :: ::::
CCDS41 LDKTNASPGEFAVCFTELQQKFFDNRPGKLKDLILLIKHWHQQCQKKIKDLPSLSPYALE
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pF1KE1 LLTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTK
::::::::.: : .:. :.: ::::::. ..::::: :.:.. :.. : .:: .
CCDS41 LLTVYAWEQGCRKDNFDIAEGVRTVLELIKCQEKLCIYWMVNYNFEDETIRNILLHQLQS
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 PRPVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASS
:::::::.:::.:..: : :. : .::..::. : . : :. :: .: :
CCDS41 ARPVILDPVDPTNNVSG-DKICWQWLKKEAQTWLTSPNLDNE--LPAPSWNVLPAPLFTT
290 300 310 320 330 340
360
pF1KE1 LPFIPAPLHEA
CCDS41 PGHLLDKFIKEFLQPNKCFLEQIDSAVNIIRTFLKENCFRQSTAKIQIVRGGSTAKGTAL
350 360 370 380 390 400
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10 20 30
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHA
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CCDS44 AQEAAALGMQACFLSRDGTSVQPWDVMPALLYQTPAGDLDKFISEFLQPNRQFLAQVNKA
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.: ::.:::: :::.: :. : ::::::::.:::.:::::::::::::: .. : .: :
CCDS44 VDTICSFLKENCFRNS--PIKVIKVVKGGSSAKGTALRGRSDADLVVFLSCFSQFTEQGN
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.:.:.:.::: ::::::.:: : :::::. .: :::.::: :.: .: ..:.::::::
CCDS44 KRAEIISEIRAQLEACQQERQFEVKFEVS--KWENPRVLSFSLTSQTMLDQSVDFDVLPA
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pF1KE1 FDALGQLTGSYKPNPQIYVKLIEECTDLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLV
:::::::... .:. :.:: ::. .. ::.:::::::::::. .::::::::::::
CCDS44 FDALGQLVSGSRPSSQVYVDLIHSYSN---AGEYSTCFTELQRDFIISRPTKLKSLIRLV
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pF1KE1 KHWYQNC---KKKLGKLPPQYALELLTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLC
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CCDS44 KHWYQQCTKISKGRGSLPPQHGLELLTVYAWEQGGKDSQFNMAEGFRTVLELVTQYRQLC
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pF1KE1 IYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPRPVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNY
:::: :. :. . .:..:: ::::.:::::::::::: . : ::.:: : .
CCDS44 IYWTINYNAKDKTVGDFLKQQLQKPRPIILDPADPTGNLGHN--ARWDLLAKEAAACTSA
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pF1KE1 PCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASSLPFIPAPLHEA
: . .: :.. :
CCDS44 LCCMGRNGIPIQPWPVKAAV
1070 1080
>--
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10 20 30
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQIN
.:: . :.: ::.::.:.: :. :. :..
CCDS44 YPRAGSKPPSCPAPGPTGAASIVPSVPGMALDLSQIPTKELDRFIQDHLKPSPQFQEQVK
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pF1KE1 HAIDIICGFLKERCFRGSSYPVCVSKVVKGGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQ
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CCDS44 KAIDIILRCLHENCVHKAS------RVSKGGSFGRGTDLRDGCDVELIIFLNCFTDYKDQ
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CCDS44 GPRRAEILDEMRAQLESWWQDQVPSLS--LQFPEQNVPEALQFQLVSTALKSWTDVSLLP
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pF1KE1 AFDALGQLTGSYKPNPQIYVKLIEECTDLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRL
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CCDS44 AFDAVGQLSSGTKPNPQVYSRLL---TSGCQEGEHKACFAELRRNFMNIRPVKLKNLILL
550 560 570 580 590 600
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pF1KE1 VKHWY-QNCKKKLGK------LPPQYALELLTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVIN
::::: : .. :: ::: :::::::..:::.: . :: :::::::: :: .
CCDS44 VKHWYRQVAAQNKGKGPAPASLPPAYALELLTIFAWEQGCRQDCFNMAQGFRTVLGLVQQ
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CCDS44 HQQLCVYWTVNYSTEDPAMRMHLLGQLRKPRPLVLDPADPTWNVGHGS---WELLAQEAA
670 680 690 700 710 720
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pF1KE1 AWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASSLPFIPAPLHEA
: :: . ::. :. :
CCDS44 ALGMQACFLSRDGTSVQPWDVMPALLYQTPAGDLDKFISEFLQPNRQFLAQVNKAVDTIC
730 740 750 760 770 780
>--
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10 20 30 40 50
pF1KE1 MMDLRNTPAKSLDKFIEDYLLPDTCFRMQINHAIDIICGFLKERCFR-GSSYPVCVSKVV
::: .::: .::.:. : : : . .:. . . :.:: : :.. : : :.:
CCDS44 MDLYSTPAAALDRFVARRLQPRKEFVEKARRALGALAAALRERGGRLGAAAPR-VLKTV
10 20 30 40 50
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pF1KE1 KGGSSGKGTTLRGRSDADLVVFLSPLTTFQDQLNRRGEFIQEIRRQLEACQRERAFSVKF
::::::.::.:.: :..::.::. . .. :: ::.:...:.: .::. .. . ....
CCDS44 KGGSSGRGTALKGGCDSELVIFLDCFKSYVDQRARRAEILSEMRASLESWWQNPVPGLRL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE1 EVQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGSYKPNPQIYVKLIEE-CT
:. . : ::.: :.:..: . .. ...:::..::: .. ::.::.: :.. :
CCDS44 TF--PEQSVPGALQFRLTSVDLEDWMDVSLVPAFNVLGQAGSGVKPKPQVYSTLLNSGC-
120 130 140 150 160 170
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pF1KE1 DLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWY-QNCKKKLGK--LPPQYALELL
. :: ..:::::.:.:.. ::.:::.:: :::::: : : . : : ::: ::::::
CCDS44 ---QGGEHAACFTELRRNFVNIRPAKLKNLILLVKHWYHQVCLQGLWKETLPPVYALELL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE1 TVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKPR
:..:::.: : :. :.:.:::: :. ..:.::..:: : :..: . ..:.::: .::
CCDS44 TIFAWEQGCKKDAFSLAEGLRTVLGLIQQHQHLCVFWTVNYGFEDPAVGQFLQRQLKRPR
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 PVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVRPPASSLP
:::::::::: .::.: : ::::: . ..::: :.::.::
CCDS44 PVILDPADPTWDLGNGAAWHWDLLAQEAASCYDHPCFLRGMGDPVQSWKGPGLPRAGCSG
300 310 320 330 340 350
360
pF1KE1 FIPAPLHEA
CCDS44 LGHPIQLDPNQKTPENSKSLNAVYPRAGSKPPSCPAPGPTGAASIVPSVPGMALDLSQIP
360 370 380 390 400 410
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10 20 30 40 50
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CCDS92 LDLGLEDLRMEQRVPDALVFTIQTRGTAEPITVTIVPAYRALGPSLPNSQPPPEVYVSLI
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pF1KE1 EECTDLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQN---CKKKLGKLPPQYA
. : :.: :.::::.:.:.::::::::.::::::::. .. ..::: ::
CCDS92 KACGG---PGNFCPSFSELQRNFVKHRPTKLKSLLRLVKHWYQQYVKARSPRANLPPLYA
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pF1KE1 LELLTVYAWERGSMKT-HFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQ
:::::.:::: :. . .: .:: ::..:...:. .:::::::: ..: ::: .:.:
CCDS92 LELLTIYAWEMGTEEDENFMLDEGFTTVMDLLLEYEVICIYWTKYYTLHNAIIEDCVRKQ
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pF1KE1 LTKPRPVILDPADPTGNLGGGDPKGWRQLAQEAEAWLNYPCFKNWDGSPVSSWILLVRPP
: : ::.:::::::: :.. : : .::.: :. : . .:.:::
CCDS92 LKKERPIILDPADPTLNVAEG--YRWDIVAQRASQCLKQDCCYDNRENPISSWNVKRARD
300 310 320 330 340 350
360
pF1KE1 ASSLPFIPAPLHEA
CCDS92 IHLTVEQRGYPDFNLIVNPYEPIRKVKEKIRRTRGYSGLQRLSFQVPGSERQLLSSRCSL
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... .: . : :: :.... .: . ..::. ::: . .: :..::.::
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. : :.: :.::::.:.:.::::::::.::::::::. .. :. ::
CCDS92 KACGG---PGNFCPSFSELQRNFVKHRPTKLKSLLRLVKHWYQQAHHPGSGRPHPQRGRR
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CCDS92 VQMGHRCSEGLPVPETGLLL
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CCDS73 VLKVVKVGSFGNGTVLRSTREVELVAFLSCFHSFQEAAKHHKDVLRLIWKTMW--QSQDL
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pF1KE1 FSVKFEVQAPRWGNPRALSFVLSSLQLGEGVEFDVLPAFDALGQLTGSYKPNPQIYVKLI
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CCDS73 LDLGLEDLRMEQRVPDALVFTIQTRGTAEPITVTIVPAYRALGPSLPNSQPPPEVYVSLI
120 130 140 150 160 170
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pF1KE1 EECTDLQKEGEFSTCFTELQRDFLKQRPTKLKSLIRLVKHWYQNCKKKLGKLPPQYALEL
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CCDS73 KACGG---PGNFCPSFSELQRNFVKHRPTKLKSLLRLVKHWYQQRARDIHLTVEQRGYPD
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pF1KE1 LTVYAWERGSMKTHFNTAQGFRTVLELVINYQQLCIYWTKYYDFKNPIIEKYLRRQLTKP
CCDS73 FNLIVNPYEPIRKVKEKIRRTRGYSGLQRLSFQVPGSERQLLSSRCSLAKYGIFSHTHIY
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364 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]