FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1056, 1270 aa
1>>>pF1KE1056 1270 - 1270 aa - 1270 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1019+/-0.000477; mu= 16.0299+/- 0.030
mean_var=192.0101+/-39.275, 0's: 0 Z-trim(115.6): 266 B-trim: 661 in 1/53
Lambda= 0.092558
statistics sampled from 25846 (26141) to 25846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 13.460
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001348 (OMIM: 603115) ATP-dependent RNA helicas (1270) 8558 1157.0 0
NP_001107869 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA heli ( 994) 1542 220.0 6.3e-56
NP_065916 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA helicas (1008) 1072 157.3 4.9e-37
XP_016865224 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT ( 971) 892 133.2 8.3e-30
NP_001332905 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent (1130) 892 133.3 9.2e-30
XP_016865222 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1139) 892 133.3 9.2e-30
XP_011541888 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1162) 892 133.3 9.3e-30
NP_001332904 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent (1268) 892 133.4 9.9e-30
XP_016865220 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1277) 892 133.4 9.9e-30
XP_011541884 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1406) 892 133.4 1.1e-29
NP_073739 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent RN (1430) 892 133.4 1.1e-29
XP_016865219 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1430) 892 133.4 1.1e-29
XP_011541883 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1439) 892 133.4 1.1e-29
NP_001332894 (OMIM: 612720) ATP-dependent RNA heli ( 733) 772 117.1 4.6e-25
NP_001332893 (OMIM: 612720) ATP-dependent RNA heli (1318) 772 117.3 6.8e-25
NP_061903 (OMIM: 612720) ATP-dependent RNA helicas (1369) 772 117.4 6.9e-25
XP_016861406 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1155) 732 111.9 2.5e-23
NP_055781 (OMIM: 616423) putative ATP-dependent RN (1155) 732 111.9 2.5e-23
XP_016861405 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1157) 732 111.9 2.5e-23
XP_006713096 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1162) 732 111.9 2.5e-23
XP_016861404 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1162) 732 111.9 2.5e-23
XP_011531800 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1166) 732 111.9 2.5e-23
XP_011531799 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1166) 732 111.9 2.5e-23
XP_011531798 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1166) 732 111.9 2.5e-23
NP_001317919 (OMIM: 616423) putative ATP-dependent (1166) 732 111.9 2.5e-23
XP_011531796 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1194) 732 112.0 2.6e-23
XP_011531797 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1194) 732 112.0 2.6e-23
NP_619520 (OMIM: 616423) putative ATP-dependent RN (1194) 732 112.0 2.6e-23
XP_011531795 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1228) 732 112.0 2.6e-23
XP_016861403 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1238) 732 112.0 2.6e-23
XP_011531793 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1265) 732 112.0 2.7e-23
XP_011531792 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1265) 732 112.0 2.7e-23
XP_011531794 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1265) 732 112.0 2.7e-23
XP_005259500 (OMIM: 615475) PREDICTED: probable AT (1143) 629 98.2 3.4e-19
NP_055496 (OMIM: 615475) probable ATP-dependent RN (1143) 629 98.2 3.4e-19
XP_011525852 (OMIM: 615475) PREDICTED: probable AT (1143) 629 98.2 3.4e-19
XP_011525853 (OMIM: 615475) PREDICTED: probable AT (1143) 629 98.2 3.4e-19
XP_016879402 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1192) 568 90.1 1e-16
XP_005256326 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1192) 568 90.1 1e-16
XP_011521786 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1227) 568 90.1 1e-16
XP_011521787 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1227) 568 90.1 1e-16
NP_054722 (OMIM: 605584) pre-mRNA-splicing factor (1227) 568 90.1 1e-16
NP_001309145 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli ( 945) 530 84.9 2.9e-15
NP_001309146 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1129) 530 85.0 3.3e-15
NP_001309149 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1152) 530 85.0 3.3e-15
NP_001309148 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1169) 530 85.0 3.3e-15
NP_001309147 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1179) 530 85.0 3.4e-15
NP_001289552 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1181) 530 85.0 3.4e-15
NP_001309150 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1218) 530 85.0 3.4e-15
NP_004932 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA helicas (1220) 530 85.0 3.4e-15
>>NP_001348 (OMIM: 603115) ATP-dependent RNA helicase A (1270 aa)
initn: 8558 init1: 8558 opt: 8558 Z-score: 6187.1 bits: 1157.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8558; 100.0% identity (100.0% similar) in 1270 aa overlap (1-1270:1-1270)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGDVKNFLYAWCGKRKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVQVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGDVKNFLYAWCGKRKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVQVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AARDFVNYLVRINEIKSEEVPAFGVASPPPLTDTPDTTANAEGDLPTTMGGPLPPHLALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARDFVNYLVRINEIKSEEVPAFGVASPPPLTDTPDTTANAEGDLPTTMGGPLPPHLALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AENNSEVGASGYGVPGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEVQATLESEEVDLNAGLHGNWTLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AENNSEVGASGYGVPGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEVQATLESEEVDLNAGLHGNWTLEN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNLSQDLEHQLQNIIQELNLEILPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNLSQDLEHQLQNIIQELNLEILPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFESILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFESILP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 GEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 NLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 TINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 RFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 ALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGKRL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 GYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 KEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 LIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 IVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 PSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 GSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGY
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KE1 FGQGRGGGGY
::::::::::
NP_001 FGQGRGGGGY
1270
>>NP_001107869 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA helicase (994 aa)
initn: 1348 init1: 673 opt: 1542 Z-score: 1125.1 bits: 220.0 E(85289): 6.3e-56
Smith-Waterman score: 1648; 37.2% identity (67.1% similar) in 817 aa overlap (345-1125:161-957)
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 LAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQ
: ::. . .. . : ..:. .:..
NP_001 KNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQK
140 150 160 170 180 190
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 D-HDLQAI-LQE-RELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQ
.::. : .:. :: :: ...:... :....:..: : ::::::::: :::::..:.
NP_001 KKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIE
200 210 220 230 240 250
440 450 460 470 480
pF1KE1 NDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEE--PGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFC
... : :: ::::::::.::::::: ::.: :.: ::..:..: ::: ..::..:
NP_001 RGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYC
260 270 280 290 300 310
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATID
:.:..:. :.. . ..::...::::::....: :..:..:... .....:::::..
NP_001 TTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLN
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590
pF1KE1 TSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDK--------DDD
. : ::: :::.:.. : :.:: ::.::: :. ..:: :..... : . .
NP_001 AEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQ
380 390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 GGEDDDANCNLICGD-------EYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGA
:. .: . : .:. : . .... .. ..:: ::..:: . ::
NP_001 EKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGA
440 450 460 470 480 490
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 VLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILS
.:::::::. : :.. : . : : .: .:: .: :: :....
NP_001 ILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKS--------------VNQTQVFKRTPPGVRKIVIA
500 510 520 530
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 TNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGF
::::::::::.:::::::. : : : ..::...... :.::.: .:::::::::.::
NP_001 TNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGH
540 550 560 570 580 590
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 CFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEA
:.:: . : :. .. ::..::::.:. :.::.::::::. ::.. ..:: .::. .
NP_001 CYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLS
600 610 620 630 640 650
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 EHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEP
. : ::.::: ..:::::: ::.::.::..:::...: .: : . ::::. : .:
NP_001 IRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP
660 670 680 690 700 710
900 910 920 930 940
pF1KE1 FINE-GK-RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMAT
:. :: ... .:. .: . :::......:..:..:: : . : .: . :. :
NP_001 FVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNT
720 730 740 750 760 770
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 LRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHK--
:.: . : :. : :...:: . . .: . ::. .. ... :.::.: .
NP_001 LQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNE-KIIKAVICAGLYPKVAKIRLN
780 790 800 810 820 830
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 --EKRKILT----TEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTL
.:::.. :.: : .: .::: . :..: .... :.:: .: :
NP_001 LGKKRKMVKVYTKTDGLVA-VHPKSVNVE--QTDFHYN--WLIYHLKMRTSSIYLYDCTE
840 850 860 870 880 890
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 VTPLQLLLFASK-KVQSDG--QIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQP
:.: ::.:.. ..:.:. . . ::.:: .: . : . :: .. :. : ..:
NP_001 VSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESP
900 910 920 930 940 950
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE1 AIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGS
.. :
NP_001 HPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
960 970 980 990
>>NP_065916 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA helicase DH (1008 aa)
initn: 1409 init1: 837 opt: 1072 Z-score: 785.8 bits: 157.3 E(85289): 4.9e-37
Smith-Waterman score: 1736; 37.9% identity (68.3% similar) in 817 aa overlap (345-1125:161-971)
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 LAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQ
: ::. . .. . : ..:. .:..
NP_065 KNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQK
140 150 160 170 180 190
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 D-HDLQAI-LQE-RELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQ
.::. : .:. :: :: ...:... :....:..: : ::::::::: :::::..:.
NP_065 KKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIE
200 210 220 230 240 250
440 450 460 470 480
pF1KE1 NDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEE--PGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFC
... : :: ::::::::.::::::: ::.: :.: ::..:..: ::: ..::..:
NP_065 RGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYC
260 270 280 290 300 310
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATID
:.:..:. :.. . ..::...::::::....: :..:..:... .....:::::..
NP_065 TTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLN
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590
pF1KE1 TSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDK--------DDD
. : ::: :::.:.. : :.:: ::.::: :. ..:: :..... : . .
NP_065 AEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQ
380 390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 GGEDDDANCNLICGD-------EYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGA
:. .: . : .:. : . .... .. ..:: ::..:: . ::
NP_065 EKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGA
440 450 460 470 480 490
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 VLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILS
.:::::::. : :.. : . : : .. :.:::: .: .: .:: .: :: :....
NP_065 ILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIA
500 510 520 530 540 550
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 TNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGF
::::::::::.:::::::. : : : ..::...... :.::.: .:::::::::.::
NP_065 TNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGH
560 570 580 590 600 610
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 CFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEA
:.:: . : :. .. ::..::::.:. :.::.::::::. ::.. ..:: .::. .
NP_065 CYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLS
620 630 640 650 660 670
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 EHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEP
. : ::.::: ..:::::: ::.::.::..:::...: .: : . ::::. : .:
NP_065 IRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP
680 690 700 710 720 730
900 910 920 930 940
pF1KE1 FINE-GK-RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMAT
:. :: ... .:. .: . :::......:..:..:: : . : .: . :. :
NP_065 FVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNT
740 750 760 770 780 790
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 LRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHK--
:.: . : :. : :...:: . . .: . ::. .. ... :.::.: .
NP_065 LQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNE-KIIKAVICAGLYPKVAKIRLN
800 810 820 830 840
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 --EKRKILT----TEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTL
.:::.. :.: : .: .::: . :..: .... :.:: .: :
NP_065 LGKKRKMVKVYTKTDGLVA-VHPKSVNVE--QTDFHYN--WLIYHLKMRTSSIYLYDCTE
850 860 870 880 890 900
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 VTPLQLLLFASK-KVQSDG--QIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQP
:.: ::.:.. ..:.:. . . ::.:: .: . : . :: .. :. : ..:
NP_065 VSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESP
910 920 930 940 950 960
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE1 AIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGS
.. :
NP_065 HPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
970 980 990 1000
>>XP_016865224 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de (971 aa)
initn: 889 init1: 468 opt: 892 Z-score: 656.1 bits: 133.2 E(85289): 8.3e-30
Smith-Waterman score: 950; 33.3% identity (59.8% similar) in 639 aa overlap (601-1181:101-733)
580 590 600 610 620
pF1KE1 QEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDGGEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMS----Q
:. :... :.. . : : .. .
XP_016 NGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSLVQTNGSDLSAEDRELLKAYHHS
80 90 100 110 120 130
630 640 650 660 670 680
pF1KE1 LNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPH-FG--SHRYQI
...... ..:: :: : ::::.::::.. : .. .. .. . :. .::::.
XP_016 FDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIVGLRDRILFDDKRFADSTHRYQV
140 150 160 170 180 190
690 700 710 720 730 740
pF1KE1 LPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHN
. :::.. .:.::. :.:: :.::::::::::::.::::.:::: : : : : : :
XP_016 FMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSITVNDVVFVIDSGKVKEKSFDALN
200 210 220 230 240 250
750 760 770 780 790 800
pF1KE1 NMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIAL
.: :: ::.. :::::::: :::.::.: :: ::. . .:::..: ::.:. :
XP_016 FVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLRFQNMLEFQTPELLRMPLQELCL
260 270 280 290 300 310
810 820 830 840 850 860
pF1KE1 SIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIE
::: . :..:: :: :::: : .: . :. .::.:. ..:: :: :: ::.:
XP_016 HTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTIDAMDTWEDLTELGYHLADLPVE
320 330 340 350 360 370
870 880 890 900 910
pF1KE1 PRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----NEGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHV
:..:::.. . .. : : ::: . . .::. :: ... :. :... ::::.
XP_016 PHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQASQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHM
380 390 400 410 420 430
920 930 940 950 960 970
pF1KE1 ALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLT
::: .::::. :: : : :::.. :..::... ..:: : ::: .
XP_016 ALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVRARGGG
440 450 460 470 480
980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 QVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT-TEGRNALIHKSSVNC------
.. . ..: :: . :. :.:::. . .. .:: . ... .: .::
XP_016 DIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLTGPKEKKVRFHPASVLSQPQYKK
490 500 510 520 530 540
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 --PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTLVTPLQLLLF------ASKKVQ-
: ..: :. .... : :. : . . . :::. .:.: ::. .:
XP_016 IPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTPVTILVFCGPARLASNALQE
550 560 570 580 590 600
1080 1090 1100 1110
pF1KE1 -------------SDGQI----------VLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVE
::... . .:.:... . :::. . :: ..: ..
XP_016 PSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFTLEPEAASLLLQLRQKWHSLFLR
610 620 630 640 650 660
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE1 VTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSG
. :. ::.: .. : . . . .. ..::.. : :. ::: . . .:.
XP_016 RMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLS-TEEQSAGLQQPSG---IGQRPRPMSSEELPLASS
670 680 690 700 710 720
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE1 YRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGG
.: ..: :
XP_016 WRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQKYKDRGILHPKRGTEDRSDQSS
730 740 750 760 770 780
>>NP_001332905 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent RNA (1130 aa)
initn: 1180 init1: 468 opt: 892 Z-score: 655.4 bits: 133.3 E(85289): 9.2e-30
Smith-Waterman score: 961; 29.4% identity (51.1% similar) in 898 aa overlap (505-1181:10-901)
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAY
..::::::.:::: .::::. :::..: .
NP_001 MAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLLQKH
10 20 30
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 PEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKK
: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : .. : ::
NP_001 PTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLKYKK
40 50 60 70 80 90
600
pF1KE1 DKD----------------------------------------DDGGE-------DDDAN
.:. ::::. . :.:
NP_001 EKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEKDVN
100 110 120 130 140 150
610
pF1KE1 C-----------------------------NLICGD------------------------
: .:: .
NP_001 CLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAGRGF
160 170 180 190 200 210
620
pF1KE1 -----------------------------------------------EYGPETRLSMSQL
:.: . :. :
NP_001 ASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSLVQT
220 230 240 250 260 270
630 640 650 660
pF1KE1 N--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQ
: .... ..:: :: : ::::.::::.. : ..
NP_001 NGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIVGLR
280 290 300 310 320 330
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 KHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSITIND
.. .. . :. .::::.. :::.. .:.::. :.:: :.::::::::::::.::
NP_001 DRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSITVND
340 350 360 370 380 390
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 VVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRARFER
::.:::: : : : : : : .: :: ::.. :::::::: :::.::.: :: ::.
NP_001 VVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLRFQN
400 410 420 430 440 450
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 LETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELDAL
. .:::..: ::.:. : ::: . :..:: :: :::: : .: . :. .::.
NP_001 MLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTIDAM
460 470 480 490 500 510
850 860 870 880 890
pF1KE1 DANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----NEGK
:. ..:: :: :: ::.::..:::.. . .. : : ::: . . .::. :
NP_001 DTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQASQK
520 530 540 550 560 570
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAK
: ... :. :... ::::.::: .::::. :: : : :::.. :..::... .
NP_001 RAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIIIGMR
580 590 600 610 620 630
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 VQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT-TE
.:: : ::: . .. . ..: :: . :. :.:::. . .. .:: .
NP_001 TQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLTGPK
640 650 660 670 680 690
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 GRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTLVTP
... .: .:: : ..: :. .... : :. : . . . :::
NP_001 EKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTP
700 710 720 730 740 750
1070 1080 1090
pF1KE1 LQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQISH
. .:.: ::. .: ::... . .:.:... .
NP_001 VTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFTLEP
760 770 780 790 800 810
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 EAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGST
:::. . :: ..: .. . :. ::.: .. : . . . .. ..::.. :
NP_001 EAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLS-TEEQSAGLQQPSG--
820 830 840 850 860 870
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE1 RYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGYGAG
:. ::: . . .:..: ..: :
NP_001 -IGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQKYK
880 890 900 910 920 930
>>XP_016865222 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de (1139 aa)
initn: 1180 init1: 468 opt: 892 Z-score: 655.3 bits: 133.3 E(85289): 9.2e-30
Smith-Waterman score: 961; 29.4% identity (51.1% similar) in 898 aa overlap (505-1181:10-901)
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAY
..::::::.:::: .::::. :::..: .
XP_016 MAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLLQKH
10 20 30
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 PEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKK
: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : .. : ::
XP_016 PTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLKYKK
40 50 60 70 80 90
600
pF1KE1 DKD----------------------------------------DDGGE-------DDDAN
.:. ::::. . :.:
XP_016 EKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEKDVN
100 110 120 130 140 150
610
pF1KE1 C-----------------------------NLICGD------------------------
: .:: .
XP_016 CLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAGRGF
160 170 180 190 200 210
620
pF1KE1 -----------------------------------------------EYGPETRLSMSQL
:.: . :. :
XP_016 ASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSLVQT
220 230 240 250 260 270
630 640 650 660
pF1KE1 N--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQ
: .... ..:: :: : ::::.::::.. : ..
XP_016 NGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIVGLR
280 290 300 310 320 330
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 KHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSITIND
.. .. . :. .::::.. :::.. .:.::. :.:: :.::::::::::::.::
XP_016 DRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSITVND
340 350 360 370 380 390
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 VVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRARFER
::.:::: : : : : : : .: :: ::.. :::::::: :::.::.: :: ::.
XP_016 VVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLRFQN
400 410 420 430 440 450
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 LETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELDAL
. .:::..: ::.:. : ::: . :..:: :: :::: : .: . :. .::.
XP_016 MLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTIDAM
460 470 480 490 500 510
850 860 870 880 890
pF1KE1 DANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----NEGK
:. ..:: :: :: ::.::..:::.. . .. : : ::: . . .::. :
XP_016 DTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQASQK
520 530 540 550 560 570
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAK
: ... :. :... ::::.::: .::::. :: : : :::.. :..::... .
XP_016 RAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIIIGMR
580 590 600 610 620 630
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 VQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT-TE
.:: : ::: . .. . ..: :: . :. :.:::. . .. .:: .
XP_016 TQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLTGPK
640 650 660 670 680 690
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 GRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTLVTP
... .: .:: : ..: :. .... : :. : . . . :::
XP_016 EKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTP
700 710 720 730 740 750
1070 1080 1090
pF1KE1 LQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQISH
. .:.: ::. .: ::... . .:.:... .
XP_016 VTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFTLEP
760 770 780 790 800 810
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 EAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGST
:::. . :: ..: .. . :. ::.: .. : . . . .. ..::.. :
XP_016 EAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLS-TEEQSAGLQQPSG--
820 830 840 850 860 870
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE1 RYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGYGAG
:. ::: . . .:..: ..: :
XP_016 -IGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQKYK
880 890 900 910 920 930
>>XP_011541888 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de (1162 aa)
initn: 1251 init1: 468 opt: 892 Z-score: 655.2 bits: 133.3 E(85289): 9.3e-30
Smith-Waterman score: 1275; 33.7% identity (54.6% similar) in 879 aa overlap (385-1070:190-1063)
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATG
:. ::: . . ::.. :..:.::.: : ::
XP_011 NREMSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 CGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVR
:::::.:::.::: ..: . : : :::::..:..:::::: :: :. :.. ::..:
XP_011 SGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIR
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG---IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVV
.:: . :.. . ::: ::::: : :: . ..::::::.:::: .::::. :::..
XP_011 LESRVS-PKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLL
280 290 300 310 320 330
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 QAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDK
: .: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : .. :
XP_011 QKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLK
340 350 360 370 380 390
600
pF1KE1 KKKDKD----------------------------------------DDGGE-------DD
::.:. ::::. .
XP_011 YKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEK
400 410 420 430 440 450
610
pF1KE1 DANC-----------------------------NLICGD---------------------
:.:: .:: .
XP_011 DVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAG
460 470 480 490 500 510
620
pF1KE1 --------------------------------------------------EYGPETRLSM
:.: . :.
XP_011 RGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSL
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660
pF1KE1 SQLN--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIY
: : .... ..:: :: : ::::.::::.. :
XP_011 VQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIV
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 TMQKHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSIT
.. .. .. . :. .::::.. :::.. .:.::. :.:: :.::::::::::::
XP_011 GLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSIT
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 INDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRAR
.::::.:::: : : : : : : .: :: ::.. :::::::: :::.::.: :: :
XP_011 VNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLR
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830
pF1KE1 FERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL
:. . .:::..: ::.:. : ::: . :..:: :: :::: : .: . :. .
XP_011 FQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTI
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 DALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----N
::.:. ..:: :: :: ::.::..:::.. . .. : : ::: . . .::.
XP_011 DAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQA
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 EGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTW
:: ... :. :... ::::.::: .::::. :: : : :::.. :..::...
XP_011 SQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIII
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 EAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT
..:: : ::: . .. . ..: :: . :. :.:::. . .. .::
XP_011 GMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLT
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 -TEGRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTL
. ... .: .:: : ..: :. .... : :. : . . .
XP_011 GPKEKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE1 VTPLQLLLFASKKVQSDGQIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII
:::. .:.:
XP_011 VTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFT
1060 1070 1080 1090 1100 1110
>>NP_001332904 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent RNA (1268 aa)
initn: 1251 init1: 468 opt: 892 Z-score: 654.8 bits: 133.4 E(85289): 9.9e-30
Smith-Waterman score: 1313; 31.9% identity (53.6% similar) in 1021 aa overlap (385-1181:28-1039)
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATG
:. ::: . . ::.. :..:.::.: : ::
NP_001 MSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG
10 20 30 40 50
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 CGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVR
:::::.:::.::: ..: . : : :::::..:..:::::: :: :. :.. ::..:
NP_001 SGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIR
60 70 80 90 100 110
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG---IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVV
.:: . :.. . ::: ::::: : :: . ..::::::.:::: .::::. :::..
NP_001 LESRVS-PKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLL
120 130 140 150 160 170
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 QAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDK
: .: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : .. :
NP_001 QKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLK
180 190 200 210 220 230
600
pF1KE1 KKKDKD----------------------------------------DDGGE-------DD
::.:. ::::. .
NP_001 YKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEK
240 250 260 270 280 290
610
pF1KE1 DANC-----------------------------NLICGD---------------------
:.:: .:: .
NP_001 DVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAG
300 310 320 330 340 350
620
pF1KE1 --------------------------------------------------EYGPETRLSM
:.: . :.
NP_001 RGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSL
360 370 380 390 400 410
630 640 650 660
pF1KE1 SQLN--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIY
: : .... ..:: :: : ::::.::::.. :
NP_001 VQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIV
420 430 440 450 460 470
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 TMQKHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSIT
.. .. .. . :. .::::.. :::.. .:.::. :.:: :.::::::::::::
NP_001 GLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSIT
480 490 500 510 520 530
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 INDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRAR
.::::.:::: : : : : : : .: :: ::.. :::::::: :::.::.: :: :
NP_001 VNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLR
540 550 560 570 580 590
790 800 810 820 830
pF1KE1 FERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL
:. . .:::..: ::.:. : ::: . :..:: :: :::: : .: . :. .
NP_001 FQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTI
600 610 620 630 640 650
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 DALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----N
::.:. ..:: :: :: ::.::..:::.. . .. : : ::: . . .::.
NP_001 DAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQA
660 670 680 690 700 710
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 EGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTW
:: ... :. :... ::::.::: .::::. :: : : :::.. :..::...
NP_001 SQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIII
720 730 740 750 760 770
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 EAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT
..:: : ::: . .. . ..: :: . :. :.:::. . .. .::
NP_001 GMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLT
780 790 800 810 820 830
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 -TEGRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTL
. ... .: .:: : ..: :. .... : :. : . . .
NP_001 GPKEKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSA
840 850 860 870 880 890
1070 1080 1090
pF1KE1 VTPLQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQ
:::. .:.: ::. .: ::... . .:.:...
NP_001 VTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFT
900 910 920 930 940 950
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 ISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMI
. :::. . :: ..: .. . :. ::.: .. : . . . . :: :..
NP_001 LEPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLSTEEQSA-GLQQPS
960 970 980 990 1000 1010
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE1 GSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGY
: :. ::: . . .:..: ..: :
NP_001 G---IGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQ
1020 1030 1040 1050 1060
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE1 GAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGYFGQGRGGGGY
NP_001 KYKDRGILHPKRGTEDRSDQSSLKSTDSSSYPSPCASPSPPSSGKGSKSPSPRPNMPVRY
1070 1080 1090 1100 1110 1120
>>XP_016865220 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de (1277 aa)
initn: 1251 init1: 468 opt: 892 Z-score: 654.7 bits: 133.4 E(85289): 9.9e-30
Smith-Waterman score: 1313; 31.9% identity (53.6% similar) in 1021 aa overlap (385-1181:28-1039)
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATG
:. ::: . . ::.. :..:.::.: : ::
XP_016 MSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG
10 20 30 40 50
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 CGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVR
:::::.:::.::: ..: . : : :::::..:..:::::: :: :. :.. ::..:
XP_016 SGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIR
60 70 80 90 100 110
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG---IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVV
.:: . :.. . ::: ::::: : :: . ..::::::.:::: .::::. :::..
XP_016 LESRVS-PKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLL
120 130 140 150 160 170
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 QAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDK
: .: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : .. :
XP_016 QKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLK
180 190 200 210 220 230
600
pF1KE1 KKKDKD----------------------------------------DDGGE-------DD
::.:. ::::. .
XP_016 YKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEK
240 250 260 270 280 290
610
pF1KE1 DANC-----------------------------NLICGD---------------------
:.:: .:: .
XP_016 DVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAG
300 310 320 330 340 350
620
pF1KE1 --------------------------------------------------EYGPETRLSM
:.: . :.
XP_016 RGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSL
360 370 380 390 400 410
630 640 650 660
pF1KE1 SQLN--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIY
: : .... ..:: :: : ::::.::::.. :
XP_016 VQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIV
420 430 440 450 460 470
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 TMQKHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSIT
.. .. .. . :. .::::.. :::.. .:.::. :.:: :.::::::::::::
XP_016 GLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSIT
480 490 500 510 520 530
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 INDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRAR
.::::.:::: : : : : : : .: :: ::.. :::::::: :::.::.: :: :
XP_016 VNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLR
540 550 560 570 580 590
790 800 810 820 830
pF1KE1 FERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL
:. . .:::..: ::.:. : ::: . :..:: :: :::: : .: . :. .
XP_016 FQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTI
600 610 620 630 640 650
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 DALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----N
::.:. ..:: :: :: ::.::..:::.. . .. : : ::: . . .::.
XP_016 DAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQA
660 670 680 690 700 710
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 EGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTW
:: ... :. :... ::::.::: .::::. :: : : :::.. :..::...
XP_016 SQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIII
720 730 740 750 760 770
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 EAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT
..:: : ::: . .. . ..: :: . :. :.:::. . .. .::
XP_016 GMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLT
780 790 800 810 820 830
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 -TEGRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTL
. ... .: .:: : ..: :. .... : :. : . . .
XP_016 GPKEKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSA
840 850 860 870 880 890
1070 1080 1090
pF1KE1 VTPLQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQ
:::. .:.: ::. .: ::... . .:.:...
XP_016 VTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFT
900 910 920 930 940 950
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 ISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMI
. :::. . :: ..: .. . :. ::.: .. : . . . . :: :..
XP_016 LEPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLSTEEQSA-GLQQPS
960 970 980 990 1000 1010
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE1 GSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGY
: :. ::: . . .:..: ..: :
XP_016 G---IGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQ
1020 1030 1040 1050 1060
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE1 GAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGYFGQGRGGGGY
XP_016 KYKDRGILHPKRGTEDRSDQSSLKSTDSSSYPSPCASPSPPSSGKGSKSPSPRPNMPVRY
1070 1080 1090 1100 1110 1120
>>XP_011541884 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable ATP-de (1406 aa)
initn: 1251 init1: 468 opt: 892 Z-score: 654.2 bits: 133.4 E(85289): 1.1e-29
Smith-Waterman score: 1313; 31.9% identity (53.6% similar) in 1021 aa overlap (385-1181:190-1201)
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATG
:. ::: . . ::.. :..:.::.: : ::
XP_011 NREMSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 CGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVR
:::::.:::.::: ..: . : : :::::..:..:::::: :: :. :.. ::..:
XP_011 SGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIR
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 FESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG---IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVV
.:: . :.. . ::: ::::: : :: . ..::::::.:::: .::::. :::..
XP_011 LESRVS-PKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLL
280 290 300 310 320 330
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 QAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDK
: .: ....: ::..:...: .:: .::.: . :: . :.:.:::: .. : .. :
XP_011 QKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLK
340 350 360 370 380 390
600
pF1KE1 KKKDKD----------------------------------------DDGGE-------DD
::.:. ::::. .
XP_011 YKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQLTEK
400 410 420 430 440 450
610
pF1KE1 DANC-----------------------------NLICGD---------------------
:.:: .:: .
XP_011 DVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATALMVAAG
460 470 480 490 500 510
620
pF1KE1 --------------------------------------------------EYGPETRLSM
:.: . :.
XP_011 RGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNLDESSL
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660
pF1KE1 SQLN--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIY
: : .... ..:: :: : ::::.::::.. :
XP_011 VQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIV
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 TMQKHLEMNPH-FG--SHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSIT
.. .. .. . :. .::::.. :::.. .:.::. :.:: :.::::::::::::
XP_011 GLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSIT
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 INDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRAR
.::::.:::: : : : : : : .: :: ::.. :::::::: :::.::.: :: :
XP_011 VNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLR
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830
pF1KE1 FERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGG--IGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL
:. . .:::..: ::.:. : ::: . :..:: :: :::: : .: . :. .
XP_011 FQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTI
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 DALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----N
::.:. ..:: :: :: ::.::..:::.. . .. : : ::: . . .::.
XP_011 DAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQA
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 EGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTW
:: ... :. :... ::::.::: .::::. :: : : :::.. :..::...
XP_011 SQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIII
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 EAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT
..:: : ::: . .. . ..: :: . :. :.:::. . .. .::
XP_011 GMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLT
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 -TEGRNALIHKSSVNC--------PFSSQDMKY---PSPFFVFGEKIRT-RAISAKGMTL
. ... .: .:: : ..: :. .... : :. : . . .
XP_011 GPKEKKVRFHPASVLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1070 1080 1090
pF1KE1 VTPLQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQ
:::. .:.: ::. .: ::... . .:.:...
XP_011 VTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFT
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 ISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAII-SQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMI
. :::. . :: ..: .. . :. ::.: .. : . . . . :: :..
XP_011 LEPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLSTEEQSA-GLQQPS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE1 GSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGY
: :. ::: . . .:..: ..: :
XP_011 G---IGQRPRPMSSEELPLASSWRSNNSRKSSADTEFSDECTTAERVLMKSPSPALHPPQ
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE1 GAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGYFGQGRGGGGY
XP_011 KYKDRGILHPKRGTEDRSDQSSLKSTDSSSYPSPCASPSPPSSGKGSKSPSPRPNMPVRY
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1270 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 09:11:17 2016 done: Sat Nov 5 09:11:19 2016
Total Scan time: 13.460 Total Display time: 0.480
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]