Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1056
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1056, 1270 aa
1>>>pF1KE1056 1270 - 1270 aa - 1270 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3521+/-0.00126; mu= 14.9950+/- 0.076
mean_var=203.7637+/-40.874, 0's: 0 Z-trim(108.2): 109 B-trim: 29 in 1/51
Lambda= 0.089848
statistics sampled from 9986 (10088) to 9986 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 5.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 8558 1123.7 0
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 1542 214.1 1.4e-54
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 1072 153.2 3.1e-36
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 892 130.1 4.1e-29
CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 772 114.5 1.9e-24
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 732 109.2 6.4e-23
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 732 109.3 7.1e-23
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 629 95.9 6.5e-19
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 568 88.0 1.6e-16
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 534 83.3 2.3e-15
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 534 83.3 2.4e-15
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 530 83.1 4.9e-15
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220) 530 83.1 5e-15
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 519 81.4 9.3e-15
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 520 81.7 1.1e-14
CCDS9987.2 TDRD9 gene_id:122402|Hs108|chr14 (1382) 471 75.5 1.1e-12
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 430 69.9 3e-11
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 428 69.6 3.3e-11
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 428 69.6 3.5e-11
>>CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270 aa)
initn: 8558 init1: 8558 opt: 8558 Z-score: 6007.1 bits: 1123.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8558; 100.0% identity (100.0% similar) in 1270 aa overlap (1-1270:1-1270)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGDVKNFLYAWCGKRKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVQVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSN
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CCDS41 MGDVKNFLYAWCGKRKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVQVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AARDFVNYLVRINEIKSEEVPAFGVASPPPLTDTPDTTANAEGDLPTTMGGPLPPHLALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AARDFVNYLVRINEIKSEEVPAFGVASPPPLTDTPDTTANAEGDLPTTMGGPLPPHLALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AENNSEVGASGYGVPGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEVQATLESEEVDLNAGLHGNWTLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AENNSEVGASGYGVPGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEVQATLESEEVDLNAGLHGNWTLEN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNLSQDLEHQLQNIIQELNLEILPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNLSQDLEHQLQNIIQELNLEILPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFESILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFESILP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 GEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 NLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 TINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 RFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 ALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGKRL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 GYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 KEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 LIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 IVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 PSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 GSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGY
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KE1 FGQGRGGGGY
::::::::::
CCDS41 FGQGRGGGGY
1270
>>CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (994 aa)
initn: 1348 init1: 673 opt: 1542 Z-score: 1093.3 bits: 214.1 E(32554): 1.4e-54
Smith-Waterman score: 1648; 37.2% identity (67.1% similar) in 817 aa overlap (345-1125:161-957)
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 LAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQ
: ::. . .. . : ..:. .:..
CCDS54 KNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQK
140 150 160 170 180 190
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 D-HDLQAI-LQE-RELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQ
.::. : .:. :: :: ...:... :....:..: : ::::::::: :::::..:.
CCDS54 KKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIE
200 210 220 230 240 250
440 450 460 470 480
pF1KE1 NDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEE--PGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFC
... : :: ::::::::.::::::: ::.: :.: ::..:..: ::: ..::..:
CCDS54 RGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYC
260 270 280 290 300 310
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATID
:.:..:. :.. . ..::...::::::....: :..:..:... .....:::::..
CCDS54 TTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLN
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590
pF1KE1 TSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDK--------DDD
. : ::: :::.:.. : :.:: ::.::: :. ..:: :..... : . .
CCDS54 AEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQ
380 390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 GGEDDDANCNLICGD-------EYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGA
:. .: . : .:. : . .... .. ..:: ::..:: . ::
CCDS54 EKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGA
440 450 460 470 480 490
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 VLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILS
.:::::::. : :.. : . : : .: .:: .: :: :....
CCDS54 ILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKS--------------VNQTQVFKRTPPGVRKIVIA
500 510 520 530
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 TNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGF
::::::::::.:::::::. : : : ..::...... :.::.: .:::::::::.::
CCDS54 TNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGH
540 550 560 570 580 590
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 CFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEA
:.:: . : :. .. ::..::::.:. :.::.::::::. ::.. ..:: .::. .
CCDS54 CYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLS
600 610 620 630 640 650
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 EHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEP
. : ::.::: ..:::::: ::.::.::..:::...: .: : . ::::. : .:
CCDS54 IRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP
660 670 680 690 700 710
900 910 920 930 940
pF1KE1 FINE-GK-RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMAT
:. :: ... .:. .: . :::......:..:..:: : . : .: . :. :
CCDS54 FVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNT
720 730 740 750 760 770
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 LRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHK--
:.: . : :. : :...:: . . .: . ::. .. ... :.::.: .
CCDS54 LQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNE-KIIKAVICAGLYPKVAKIRLN
780 790 800 810 820 830
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 --EKRKILT----TEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTL
.:::.. :.: : .: .::: . :..: .... :.:: .: :
CCDS54 LGKKRKMVKVYTKTDGLVA-VHPKSVNVE--QTDFHYN--WLIYHLKMRTSSIYLYDCTE
840 850 860 870 880 890
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 VTPLQLLLFASK-KVQSDG--QIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQP
:.: ::.:.. ..:.:. . . ::.:: .: . : . :: .. :. : ..:
CCDS54 VSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESP
900 910 920 930 940 950
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE1 AIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGS
.. :
CCDS54 HPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
960 970 980 990
>>CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008 aa)
initn: 1409 init1: 837 opt: 1072 Z-score: 764.0 bits: 153.2 E(32554): 3.1e-36
Smith-Waterman score: 1736; 37.9% identity (68.3% similar) in 817 aa overlap (345-1125:161-971)
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 LAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQ
: ::. . .. . : ..:. .:..
CCDS31 KNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQK
140 150 160 170 180 190
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 D-HDLQAI-LQE-RELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQ
.::. : .:. :: :: ...:... :....:..: : ::::::::: :::::..:.
CCDS31 KKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIE
200 210 220 230 240 250
440 450 460 470 480
pF1KE1 NDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEE--PGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFC
... : :: ::::::::.::::::: ::.: :.: ::..:..: ::: ..::..:
CCDS31 RGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYC
260 270 280 290 300 310
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATID
:.:..:. :.. . ..::...::::::....: :..:..:... .....:::::..
CCDS31 TTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLN
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590
pF1KE1 TSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDK--------DDD
. : ::: :::.:.. : :.:: ::.::: :. ..:: :..... : . .
CCDS31 AEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQ
380 390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 GGEDDDANCNLICGD-------EYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGA
:. .: . : .:. : . .... .. ..:: ::..:: . ::
CCDS31 EKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGA
440 450 460 470 480 490
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 VLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILS
.:::::::. : :.. : . : : .. :.:::: .: .: .:: .: :: :....
CCDS31 ILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIA
500 510 520 530 540 550
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 TNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGF
::::::::::.:::::::. : : : ..::...... :.::.: .:::::::::.::
CCDS31 TNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGH
560 570 580 590 600 610
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 CFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEA
:.:: . : :. .. ::..::::.:. :.::.::::::. ::.. ..:: .::. .
CCDS31 CYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLS
620 630 640 650 660 670
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 EHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEP
. : ::.::: ..:::::: ::.::.::..:::...: .: : . ::::. : .:
CCDS31 IRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP
680 690 700 710 720 730
900 910 920 930 940
pF1KE1 FINE-GK-RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMAT
:. :: ... .:. .: . :::......:..:..:: : . : .: . :. :
CCDS31 FVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNT
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pF1KE1 LRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHK--
:.: . : :. : :...:: . . .: . ::. .. ... :.::.: .
CCDS31 LQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNE-KIIKAVICAGLYPKVAKIRLN
800 810 820 830 840
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 --EKRKILT----TEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTL
.:::.. :.: : .: .::: . :..: .... :.:: .: :
CCDS31 LGKKRKMVKVYTKTDGLVA-VHPKSVNVE--QTDFHYN--WLIYHLKMRTSSIYLYDCTE
850 860 870 880 890 900
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pF1KE1 VTPLQLLLFASK-KVQSDG--QIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQP
:.: ::.:.. ..:.:. . . ::.:: .: . : . :: .. :. : ..:
CCDS31 VSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESP
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.. :
CCDS31 HPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
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CCDS41 SGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIR
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.:: . :.. . ::: ::::: : :: . ..::::::.:::: .::::. :::..
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:.:: .:: .
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:.: . :.
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: : .... ..:: :: : ::::.::::.. :
CCDS41 VQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIV
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.. .. .. . :. .::::.. :::.. .:.::. :.:: :.::::::::::::
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.::::.:::: : : : : : : .: :: ::.. :::::::: :::.::.: :: :
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:. . .:::..: ::.:. : ::: . :..:: :: :::: : .: . :. .
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::.:. ..:: :: :: ::.::..:::.. . .. : : ::: . . .::.
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:: ... :. :... ::::.::: .::::. :: : : :::.. :..::...
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CCDS41 VTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFT
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CCDS41 LEPEAASLLLQLRQKWHSLFLRRMRAPSKPWSQVDEATIRAIIAVLSTEEQSA-GLQQPS
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: :. ::: . . .:..: ..: :
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CCDS34 DSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSL
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.:::::::.:::....::::..:....: .....:::::.:. : :: .:::...
CCDS34 VSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRIS
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::.:::. . ::: :. : :: ::.. .: . :. : . : .:: :
CCDS34 GRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLE-KDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPV
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.:. .. .: .. ..:: :: :.. :. ::::.::
CCDS34 QTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFL
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:: : . : . .: :.::... ::: . ..: .: : :: :..:.:::::
CCDS34 PGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAE
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:.::: :::.:::. . : . . ..:.. . ...::.. ::.::::::: ::::..
CCDS34 TGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMY
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CCDS34 TRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLR
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.. : . :. .:::::. :: ::.. ..:::.:.: :: : . :.::. :: .
CCDS34 KIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTP
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:.. . . .. . :::... ... .: ::. :: ..:: .:... :: ..:
CCDS34 IGRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTL
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..: .: ... .:: . :. : . .. .. .. ..:. :.: :: :
CCDS34 EDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYT
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pF1KE1 K-----EKRK--ILTTEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGM
: :: . :..:. : .: :::: .:.. .... :::: . .
CCDS34 KSVDVTEKLACIVETAQGK-AQVHPSSVN-----RDLQ-THGWLLYQEKIRYARVYLRET
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CCDS34 TLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENP
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pF1KE1 AIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGS
. . : . . . ..:.
CCDS34 KMSLENDKILQIITELIKTENN
1350 1360
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CCDS27 ITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLELWRRRGPVWQEAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVVVIS
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pF1KE1 GATGCGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCG
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CCDS27 GDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNVG
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pF1KE1 YSVRFESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLR
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CCDS27 FQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLK
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. . : .:.:::::: :. : .:: .::.:.: : :::.:..::: .
CCDS27 GLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKL------
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590 600 610 620 630 640
pF1KE1 KDKKKKDKDDDGGEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLN
:.. . :..: .: : ..:. :. .:.. .
CCDS27 -GKHQYLHRHRHHESED-ECAL----------------------DLDLVTDLVLHIDARG
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pF1KE1 VPGAVLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTK
::..: :::::. : .:..:. . .: :::.::.:: .:. .:. :::: :
CCDS27 EPGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQEALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRK
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..:.::::::::::::.:.:.:: .: . . ..... :::.:..:. ::.:::::
CCDS27 IVLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRC
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. :: .:: :.:.:.. ..::..::::....:. :. . .::.::.. : .
CCDS27 QSGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVPEILRTPLENLVLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPNIK
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CCDS27 AVDEAVILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPL--LVVVS
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pF1KE1 CFP-EPF---INEGKRLGYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDA-RMGGEEAEIRFCEH
:. .:: ... .. .. .. . :::.:.. . .:... : . .. . :.
CCDS27 CLTRDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEE
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pF1KE1 KRLNMATLRMTWEAKVQLKEILINS---GFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGV
. : .::. :..: . .. : : :: :... : ... ..: ..: :.
CCDS27 NLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEE-ELVKGVLMAGL
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1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE1 YPNVCYHKEKRKILTTEGR-------------NALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFG
:::. .. . .: .:. : :.:::..: . . : ....
CCDS27 YPNLIQVRQGK--VTRQGKFKPNSVTYRTKSGNILLHKSTIN----REATRLRSRWLTYF
1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE1 EKIRTR-AISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQ--SDGQ---IVLVD-DWIKLQISHEAAAC
... .. .. . : :: .::... :. .::. : : : : ..:. . ...
CCDS27 MAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRL
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 ITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGP
. :: :. .:
CCDS27 LKELRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQEEHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD
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CCDS18 SKDHKYPYQAPLVAFYSTNENLPL-ACRLHISEFLYDKALTFA----------ETSEPVV
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340 350 360 370
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: . . :. :.:: . .. ..::... ...
CCDS18 QIPEVEKASESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQFR
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..: ....:.:::::. ::. . . ::. . ...::.: : ::::::::.::::::: .
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.. ::. ::::::::.::::::: ::.:. : . ::..:.::. . :. ...:
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:.:::::.::. ...:.::.::::.::: ..::::.::.:.:. : ....:::::..
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. .: .:: .::.: . :::.::...:::: : .:..: : :.: :
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.. . :. .: .: :. . :. .: .:: .. .
CCDS18 RNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFE
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.. .:::::::..: . :::.:::::: : . ..:. : :. :.: :
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::::.. :::. :: :.::::.:.:::::::::::.:::::::: :.: : . : ..
CCDS18 PLHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKG
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: . ...:..: ::::::::: : :::: . ... .: .. ::. :.::... :
CCDS18 MESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCL
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pF1KE1 SIKLLRL---GGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPI
::.:.. .. . ... :::: :.. .. ::.: :: ...::::: ::.::.
CCDS18 RIKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPV
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. :.::.:..: :: : ::::. : ::. .. .. . . .:: ::..:
CCDS18 DVRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFAN-SDYLA
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::.....:. . : .: .:... :. .:. : :. :.: . :: .. : ..
CCDS18 LLQAYKGWQLSTKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGLRAR
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KE1 -----------VFTNTGPDNNLD-----VVISLLAFGVYPNVC--------YHKEKRKIL
:. :: . : . .. ..: ..:::: ..: . .
CCDS18 EIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTSTGAV
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. ..: :: :::: : .. ::.... :::.: . . ..
CCDS18 RMQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVN----YQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIRDCSM
1250 1260 1270 1280 1290
1070 1080 1090 1100 1110
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:. :.::.. .:. . : .: .:: ::.. ::..: . :: .. :. .
CCDS18 VSVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKI
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pF1KE1 KQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRR
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CCDS18 KNPSIDLCTCPRGSRIISTIVKLVTTQ
1360 1370 1380
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CCDS12 RT--YDPRYRINL----------SVLGPATRGS--QG-LGRHLPAERVAEFRRALLHYLD
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CCDS12 FGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLA-
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CCDS12 FLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSAT
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:. :.: :: : :...: :: .:. . : . : . ..: :
CCDS12 INISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVY-----QPQEAEPTTSKSEKLDPR--------
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: :. . ....: : : : .:::: : : .
CCDS12 ------------PFLRV-LESIDHKYPPEER--------------GDLLVFLSGMAEISA
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. :: ..:: :. .::::: . .: :::: .: :: : ::::::::::.::.
CCDS12 V---LEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTID
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. . .::. :. : ..:..: . .: : ::::: .. : ::. :::
CCDS12 AFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTF--PFIEPPPPASLETAILYLRDQGALD
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pF1KE1 ANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGK---RL
... :::.: .::.::.. .:::.:.: .: . . . ::::: :: .. .
CCDS12 SSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPEC
570 580 590 600 610 620
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pF1KE1 GYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQL
. .: . ... .: .:..::.:: ... . ..:... .. : . . :.
CCDS12 AAARRPLESDQ-GDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQF
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pF1KE1 KEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNA
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CCDS12 KELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDG
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CCDS10 AQHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKK
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..::..:. ::. ..:.: : .::.::. : :: :::::. :.. .: .
CCDS10 ---KSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGM
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CCDS10 IGC----TQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRFEDCTSE-NTLIKYMTDGILL
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CCDS10 RESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAA
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CCDS10 FFGNVPIFHIPGRTFPV------DIL----FSKTPQE-----------------------
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CCDS10 DYVEAAVKQSLQ------------------VHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEH
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:: . . .::..::.: . : :.:. .: :: : :..:::::::.:.. ...::
CCDS10 LEELEN--APALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVI
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CCDS10 DSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTT
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.::. :: : ...: .: : . . :: . ..::: : .... . : : ::: . :
CCDS10 TVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQF--HFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGL
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CCDS10 TSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIRE
940 950 960 970 980 990
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pF1KE1 NFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQLKEILI
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CCDS10 KFAVPE-SDHLTYLNVYLQWKNNNY----STI-WCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMV
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pF1KE1 NSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNALIHKS
CCDS10 QQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYT
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pF1KE1 VVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIV-VTQPRRISAVSVAERVAFERGEE
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CCDS54 VVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAV
40 50 60 70 80 90
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pF1KE1 PGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDF
:. :: .::.. . . : : : :.:.:.. . . : ...:: ::: . ::.
CCDS54 LGHEVGYCIRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDI
100 110 120 130 140 150
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pF1KE1 LLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFN-----------CPIIEVYGRTYPVQ
. .:. . . ..:... :::.:.. : . ::: : :. : :::.::.
CCDS54 AIGLLKKIQKKRGDLRLIVASATLDADKFRD-FFNQNETSDPARDTCVILTVEGRTFPVD
160 170 180 190 200 210
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pF1KE1 EYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDGGEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKE
..:.. . .. . : .. .: : :. .. :.: : :
CCDS54 IFYLQSPVP--DYIKSTVETVVKIHQTEG--DGDV-LAFLTGQE-------------EVE
220 230 240 250
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pF1KE1 TPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIP
: .. :.. ..: : :..:: ..::... .:
CCDS54 T---VVSMLIEQARALARTG--------------MKRHL-----------RVLPMYAGLP
260 270 280
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