Result of FASTA (ccds) for
pF1KE1054
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1054, 537 aa
1>>>pF1KE1054 537 - 537 aa - 537 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6855+/-0.00114; mu= 12.0606+/- 0.067
mean_var=126.5231+/-26.228, 0's: 0 Z-trim(105.7): 130 B-trim: 8 in 3/50
Lambda= 0.114022
statistics sampled from 8444 (8583) to 8444 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 537) 3691 619.2 3.9e-177
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 3621 607.8 1.6e-173
CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 477) 3209 539.8 2.6e-153
CCDS35051.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 553) 3204 539.1 5.1e-153
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 3204 539.2 7.1e-153
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 834 149.3 1.6e-35
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 817 146.5 1.1e-34
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 754 136.1 1.4e-31
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 446 85.5 2.6e-16
CCDS32323.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 612) 429 82.6 1.4e-15
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 416 80.6 8e-15
CCDS32322.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 839) 416 80.6 8.1e-15
CCDS81916.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 617) 372 73.2 9.7e-13
>>CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (537 aa)
initn: 3691 init1: 3691 opt: 3691 Z-score: 3293.7 bits: 619.2 E(32554): 3.9e-177
Smith-Waterman score: 3691; 100.0% identity (100.0% similar) in 537 aa overlap (1-537:1-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
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CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE1 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTWPRGSPKTA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTWPRGSPKTA
490 500 510 520 530
>>CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (822 aa)
initn: 3649 init1: 3621 opt: 3621 Z-score: 3228.9 bits: 607.8 E(32554): 1.6e-173
Smith-Waterman score: 3621; 99.8% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE1 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTWPRGSPKTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS35 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVL
490 500 510 520 530 540
CCDS35 KRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHI
550 560 570 580 590 600
>>CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (477 aa)
initn: 3209 init1: 3209 opt: 3209 Z-score: 2865.9 bits: 539.8 E(32554): 2.6e-153
Smith-Waterman score: 3209; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGFVLFHKIPLDG
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KE1 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTWPRGSPKTA
>>CCDS35051.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (553 aa)
initn: 3677 init1: 3201 opt: 3204 Z-score: 2860.6 bits: 539.1 E(32554): 5.1e-153
Smith-Waterman score: 3649; 97.1% identity (97.1% similar) in 553 aa overlap (1-537:1-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE1 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMK---------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKDFSWFGFGKVKSRQG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 -GPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQL
490 500 510 520 530 540
530
pF1KE1 KPDTWPRGSPKTA
:::::::::::::
CCDS35 KPDTWPRGSPKTA
550
>>CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (838 aa)
initn: 3607 init1: 3201 opt: 3204 Z-score: 2858.1 bits: 539.2 E(32554): 7.1e-153
Smith-Waterman score: 3579; 96.9% identity (97.1% similar) in 545 aa overlap (1-529:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE1 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMK---------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKDFSWFGFGKVKSRQG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 -GPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQL
490 500 510 520 530 540
530
pF1KE1 KPDTWPRGSPKTA
::::.
CCDS66 KPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKD
550 560 570 580 590 600
>>CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 (796 aa)
initn: 740 init1: 274 opt: 834 Z-score: 751.4 bits: 149.3 E(32554): 1.6e-35
Smith-Waterman score: 936; 35.2% identity (63.5% similar) in 520 aa overlap (7-517:12-497)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV
::. : . . ::... :: :: .: : ..: . :. : .
CCDS11 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK
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CCDS11 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAK--SSPDT
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CCDS11 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE-
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD
: : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . :
CCDS11 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE1 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI
. .: .. : :: .: :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : :.
CCDS11 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSF-PAS
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ
. :.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::.
CCDS11 VQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLR
290 300 310 320 330 340
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pF1KE1 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYP-DVIYEDYGTAAND
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CCDS11 LNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPF---EFNPEDPIPVSFSPVDTNSTS
350 360 370 380 390 400
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pF1KE1 IGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKG
:: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::..
CCDS11 -GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINR
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CCDS11 PA-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHIIENPQYFSDACVHHIK
460 470 480 490 500
530
pF1KE1 DTWPRGSPKTA
CCDS11 RRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTM
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10 20 30 40 50
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::. : . . ::... :: :: .: : ..: . :. : .
CCDS30 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL
10 20 30 40 50
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pF1KE1 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK
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CCDS30 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF
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pF1KE1 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAK--SSPDT
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CCDS30 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE-
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pF1KE1 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD
: : : ... :::.. .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: : . . :
CCDS30 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI
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pF1KE1 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI
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CCDS30 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSF-PAS
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pF1KE1 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ
. :.. . :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :.. ..:.: ::::.
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pF1KE1 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDI
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:: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : : .:..:::.. :
CCDS30 GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINRP
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pF1KE1 ASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPD
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CCDS30 A-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGL-----QGHIIENPQYFSDACVHHIKR
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530
pF1KE1 TWPRGSPKTA
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CCDS30 AANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDP-IPDT
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. :: .....: : :. .: :.:.: . .... .: : :
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pF1KE1 YFGITNSQLKPDTWPRGSPKTA
::
CCDS30 YFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQ
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pF1KE1 GLKFVAHKAFLKNSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKT
::. . .:: :: .:..::.. :.::.:: . :. :.: :: : : :.::::: :..
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:: .... ..:.:::.: .....:: ..: .: :: ... ::::.:: . ...:.
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pF1KE1 AGDPVPNMYWDVGNL--VSKH---MNETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGED
.:.:.:.. : : .: .. : .: :. .: ..:..:.:.: ..:.:::.:: .
CCDS58 SGSPLPDVDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMS
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280 290 300 310 320 330
pF1KE1 QDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIH
. :: :::.. : .. :: : . :: :.:.::: :.:.:..:: : ::: ::
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: . : .::: ...:::.:::.::::::: : .. :..::. : .
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pF1KE1 PDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFC-LLVML
: ..... : : :: : .. ..: .: .:. . : :::.:
CCDS58 P----------VDEVSPT-------PPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFA--CVLLVVL
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pF1KE1 FLL--KLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIP
:.. : .:.::::::::..:::...:::::::::..: .:::: ..:::.:.::::.::
CCDS58 FVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIP
450 460 470 480 490 500
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pF1KE1 VIENPQYFGITNSQLKPDTWPRGSPKTA
:::::::: .. ::::.
CCDS58 VIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLV
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pF1KE1 MSSWIRWHGPAMARLW-----GFCWL-VVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVA
:: .: : :: :: ...:::..: :: ..: : :. : .
CCDS32 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVG---SVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNL-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE1 FPRLEP------------NSVD-PENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDS
:: :: : .: .::: : : : . :. .: :.: :.::..::: .:
CCDS32 FPLLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNS
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pF1KE1 GLKFVAHKAFLKNSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKT
::. . .:: :: .:..::.. :.::.:: . :. :.: :: : : :.::::: :..
CCDS32 GLRSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQL
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pF1KE1 LQE-AKSSPDTQDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSV
:: .... ..:.:::.: .....:: ..: .: :: ... ::::.:: . ...:.
CCDS32 WQEQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNG
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.:.:.:.. : : .: .. : .: :. .: ..:..:.:.: ..:.:::.:: .
CCDS32 SGSPLPDVDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMS
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 QDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIH
. :: :::.. : .. :: : . :: :.:.::: :.:.:..:: : ::: : :
CCDS32 NASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKII----H
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pF1KE1 VTNHTE---YHGCLQLDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNY
: . : .::: ...:::.:::.::::::: : .. :..::. : .
CCDS32 VEYYQEGEISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEP---------F
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pF1KE1 PDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFC-LLVML
:. : .... : : :: : .. ..: .: .:. . : :::.:
CCDS32 PES--TDNFILFDEVSPT-------PPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFA--CVLLVVL
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pF1KE1 FLL--KLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIP
:.. : .:.::::::::..:::...:::::::::..: .:::: ..:::.:.::::.::
CCDS32 FVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIP
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:::::::: .. :::::
CCDS32 VIENPQYFRQGHNCHKPDTWVFSNIDNHGILNLKDNRDHLVPSTHYIYEEPEVQSGEVSY
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537 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:53:56 2016 done: Sat Nov 5 01:53:57 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]