FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1018, 639 aa
1>>>pF1KE1018 639 - 639 aa - 639 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4534+/-0.00218; mu= 9.7371+/- 0.128
mean_var=271.8798+/-51.192, 0's: 0 Z-trim(102.9): 995 B-trim: 14 in 1/49
Lambda= 0.077783
statistics sampled from 6075 (7154) to 6075 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 2.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 4494 519.5 5.6e-147
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 4341 502.3 8.1e-142
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 2243 266.9 6.2e-71
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 2152 256.6 6.9e-68
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2106 251.6 2.8e-66
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 2062 246.6 8.7e-65
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2010 241.0 5.7e-63
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CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1980 237.4 5e-62
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1977 236.9 5.3e-62
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1980 237.5 5.4e-62
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1980 237.5 5.4e-62
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1980 237.5 5.4e-62
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1980 237.5 5.5e-62
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1977 237.1 6.2e-62
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1949 233.9 5.1e-61
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1949 233.9 5.3e-61
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1949 233.9 5.4e-61
CCDS33480.1 ZNF334 gene_id:55713|Hs108|chr20 ( 680) 1949 233.9 5.4e-61
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1949 233.9 5.5e-61
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1945 233.4 7.2e-61
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1945 233.5 7.4e-61
CCDS74736.1 ZNF334 gene_id:55713|Hs108|chr20 ( 679) 1939 232.8 1.2e-60
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1934 232.3 1.9e-60
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1934 232.4 2e-60
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1934 232.4 2e-60
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1923 231.1 4.5e-60
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1923 231.1 4.6e-60
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1915 230.1 7.9e-60
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1915 230.2 8.2e-60
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1912 229.8 1e-59
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1900 228.4 2.5e-59
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1895 227.9 3.9e-59
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1895 228.0 4.2e-59
CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 1885 226.7 7.7e-59
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1883 226.5 9.3e-59
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1881 226.2 9.7e-59
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1881 226.2 1e-58
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1881 226.2 1e-58
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1880 226.4 1.5e-58
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1877 225.9 1.5e-58
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1877 225.9 1.5e-58
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1867 224.7 3.2e-58
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 1867 224.9 3.7e-58
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1863 224.2 4.1e-58
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1863 224.2 4.3e-58
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1856 223.6 8.5e-58
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1856 223.6 8.5e-58
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1845 222.2 1.7e-57
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 1845 222.3 1.8e-57
>>CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX (639 aa)
initn: 4494 init1: 4494 opt: 4494 Z-score: 2752.2 bits: 519.5 E(32554): 5.6e-147
Smith-Waterman score: 4494; 100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (1-639:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTPASASGEDSGSFYSWQKAKREQGLVTFEDVAVDFTQEEWQYLNPPQRTLYRDVMLETY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MTPASASGEDSGSFYSWQKAKREQGLVTFEDVAVDFTQEEWQYLNPPQRTLYRDVMLETY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SNLVFVGQQVTKPNLILKLEVEECPAEGKIPFWNFPEVCQVDEQIERQHQDDQDKCLLMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SNLVFVGQQVTKPNLILKLEVEECPAEGKIPFWNFPEVCQVDEQIERQHQDDQDKCLLMQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VGFSDKKTIITKSARDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDLFSRSSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VGFSDKKTIITKSARDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDLFSRSSAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NKYDNGCAKLFFHTEYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFECTACR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NKYDNGCAKLFFHTEYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFECTACR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFNEKSTLIVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFNEKSTLIVH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 QRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQKSYLMLHQRGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQKSYLMLHQRGH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIHQRIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIHQRIHTGEK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 PYECPVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTHTGEKPYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PYECPVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTHTGEKPYKC
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE1 TECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
610 620 630
>>CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX (620 aa)
initn: 4341 init1: 4341 opt: 4341 Z-score: 2659.5 bits: 502.3 E(32554): 8.1e-142
Smith-Waterman score: 4341; 99.7% identity (99.8% similar) in 618 aa overlap (22-639:3-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTPASASGEDSGSFYSWQKAKREQGLVTFEDVAVDFTQEEWQYLNPPQRTLYRDVMLETY
. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MAKPQGLVTFEDVAVDFTQEEWQYLNPPQRTLYRDVMLETY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SNLVFVGQQVTKPNLILKLEVEECPAEGKIPFWNFPEVCQVDEQIERQHQDDQDKCLLMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SNLVFVGQQVTKPNLILKLEVEECPAEGKIPFWNFPEVCQVDEQIERQHQDDQDKCLLMQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VGFSDKKTIITKSARDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDLFSRSSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VGFSDKKTIITKSARDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDLFSRSSAE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NKYDNGCAKLFFHTEYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFECTACR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NKYDNGCAKLFFHTEYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFECTACR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFR
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLD
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFNEKSTLIVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFNEKSTLIVH
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 QRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQKSYLMLHQRGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQKSYLMLHQRGH
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIHQRIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIHQRIHTGEK
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 PYECPVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTHTGEKPYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PYECPVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTHTGEKPYKC
530 540 550 560 570 580
610 620 630
pF1KE1 TECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
590 600 610 620
>>CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (644 aa)
initn: 9528 init1: 1849 opt: 2243 Z-score: 1387.0 bits: 266.9 E(32554): 6.2e-71
Smith-Waterman score: 2243; 52.5% identity (78.2% similar) in 602 aa overlap (27-624:48-640)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MTPASASGEDSGSFYSWQKAKREQGLVTFEDVAVDFTQEEWQYLNPPQRTLYRDVM
:::.:::::.:::::. ..: ::.::::::
CCDS42 LSHMMERKAWCSQESALSEEEEDTTRPLETVTFKDVAVDLTQEEWEQMKPAQRNLYRDVM
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LETYSNLVFVGQQVTKPNLILKLEVEECP--AEGKIPFWNFPEVCQVDEQIERQHQDDQD
::.::::: :: :::::..:.::: :: : : .. . ::: .:::::..:..
CCDS42 LENYSNLVTVGCQVTKPDVIFKLEQEEEPWVMEEEMFGRHCPEVWEVDEQIKKQQET---
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KCLLMQVGFSDKKTIITKSARDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDL-
:. .: .:: .: ... .:.. ..:. ::...:.: : .:. ... ::::
CCDS42 --LVRKVTSISKKILIKEKVIECKKVAKIFPLSSDIVTSRQSFYDCDSLDKGLEHNLDLL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 -FSRSSAENKYDNGCAKLFFHTEYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEK
. .. ...: .: .: :.: .. . :. ..::. . .: : :.::. :::
CCDS42 RYEKGCVREKQSNEFGKPFYHC----ASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEK
200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PFECTACRKTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFEC
:.:: : :.::.: .::.: . ::::::. :.:::::: : :.:: : : ::::.:. :
CCDS42 PYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYAC
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 PECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCG
.: ::: .::..: : : :::::::::.::::.:.::.::: :.: ::::: : :..::
CCDS42 KDCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFN
..: . .. .: .:::.::..::.: :.::. :..:::.:.::::::. :.::::.:.
CCDS42 RAFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 EKSTLIVHQRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQKSY
..:.: ::.:.::.:::::: :::.:..: :: .::. :.::::.::.:: ::: : :
CCDS42 QSSSLTVHMRNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSN
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 LMLHQRGHTGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIH
:. ::: ::::::: :. : ::::::: : :.. :: ::::.::.::::: ....:. :
CCDS42 LIRHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEH
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 QRIHTGEKPYECPVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTH
..:::::::..: : ::::. :.: .: :.::::::: :..::::: . : . .:.:.:
CCDS42 EKIHTGEKPFKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRSH
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KE1 TGEKPYKCTECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
:::::..:.::::::.:...: .:.: :.:..
CCDS42 TGEKPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
610 620 630 640
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..: ::.::::::::.::::: :: :::::
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80 90 100 110 120 130
pF1KE1 NLILKLEVEECP--AEGKIPFWNFPEVCQVDEQIERQHQDDQDKCLLMQVGFSDKKTIIT
..:.::: :: : : .. . ::: .:::::..:.. :. .: .:: .:
CCDS56 DVIFKLEQEEEPWVMEEEMFGRHCPEVWEVDEQIKKQQE-----TLVRKVTSISKKILIK
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180
pF1KE1 KSARDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDL--FSRSSAENKYDNGCAK
... .:.. ..:. ::...:.: : .:. ... :::: . .. ...: .: .:
CCDS56 EKVIECKKVAKIFPLSSDIVTSRQSFYDCDSLDKGLEHNLDLLRYEKGCVREKQSNEFGK
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190 200 210 220 230 240
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:.: .. . :. ..::. . .: : :.::. ::::.:: : :.::.: .:
CCDS56 PFYHC----ASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEKPYECKECGKAFSRKENL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 IVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFREKSTVIIHY
:.: . ::::::. :.:::::: : :.:: : : ::::.:. : .: ::: .::..: :
CCDS56 ITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKDCWKAFSQKSNLIEHE
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLDLIIHHSTHT
: :::::::::.::::.:.::.::: :.: ::::: : :..::..: . .. .: .::
CCDS56 RIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSVTLHMRSHT
270 280 290 300 310 320
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pF1KE1 GKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFNEKSTLIVHQRTHTGEKP
:.::..::.: :.::. :..:::.:.::::::. :.::::.:...:.: ::.:.::.:::
CCDS56 GEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQSSSLTVHMRNHTAEKP
330 340 350 360 370 380
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pF1KE1 YECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQKSYLMLHQRGHTGEKPYECN
::: :::.:..: :: .::. :.::::.::.:: ::: : : :. ::: ::::::: :.
CCDS56 YECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACT
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 ECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIHQRIHTGEKPYECPVCWK
: ::::::: : :.. :: ::::.::.::::: ....:. :..:::::::..: : :
CCDS56 VCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKPFKCNECGK
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
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:::. :.: .: :.::::::: :..::::: . : . .:.:.::::::..:.::::::.:
CCDS56 AFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHTGEKPFECNECGKAFSQ
510 520 530 540 550 560
610 620 630
pF1KE1 KSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
...: .:.: :.:..
CCDS56 RASLSIHKRGHTGERHQVY
570 580
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CCDS31 KYYDCDKYKESYKKSQIIIYHRNRLGEKLYECSECRKRFSKKPSLIKHQSRHIRDIAFGC
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140 150 160 170 180
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. :. . ...... . ..: . . :. . .. .: :.. ..:. :. : :.
CCDS31 GNCGKTFPQKSQFITHHRTHTGEKPYNCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHTGEKPYECGECG
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190 200 210 220 230 240
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: : . . .:. : :::: .:::... .:..: ::::..::::::: : :.::
CCDS31 KAFSRKSHLISHWRTHTGEKPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFS
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250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFREKST
.::.:..: ::::: :::::..: ::: .::.:: : ::::.:.:: :: :::::.:.
CCDS31 RKSQLVTHHRTHTGTKPFGCSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSS
360 370 380 390 400 410
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLDLIIH
.: : ::::::::. : .:::::.:::.:: :: :::::: . :.:::..: .: .:. :
CCDS31 LINHQRTHTGEKPHGCIQCGKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRH
420 430 440 450 460 470
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 HSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFNEKSTLIVHQRTH
. ::::.::.::.:: :.::.: .: ::: ::::::. :.::::.: .:: :: :::::
CCDS31 QRTHTGEKPYECSECGKAFSEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTH
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430 440 450 460 470 480
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CCDS31 TGEKPYECSECGKAFGEKSSLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAFSQKSQLNTHQRIHTGEK
540 550 560 570 580 590
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIHQRIHTGEKPYEC
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CCDS31 PYECSLCRKAFFEKSELIRHLRTHTGEKPYECNECRKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFEC
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550 560 570 580 590 600
pF1KE1 PVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTHTGEKPYKCTECG
: ::::.::.:: :::::::::::.:.:: ::: .:: .. ::: :::::::.: :::
CCDS31 SECGKAFSRKSHLIPHQRTHTGEKPYGCSECRKAFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYRCIECG
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610 620 630
pF1KE1 KAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
:::.:::.:: :::::. ::.
CCDS31 KAFSQKSQLINHQRTHTVKKS
720 730
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTPASASGEDSGSFYSWQKAKREQGLVTFEDVAVDFTQEEWQYLNPPQRTLYRDVMLETY
: .:.:::::::: ::::.:.: :. ::::::::.:
CCDS59 MMQAQESLTLEDVAVDFTWEEWQFLSPAQKDLYRDVMLENY
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE1 SNLVFVGQQVTKPNLILKLEV--EECPAEGKIPFWNFPEVCQVD------EQIERQHQDD
:::: :: :..::. . ::: : : .: .: . ..:. . : .. ::
CCDS59 SNLVAVGYQASKPDALSKLERGEETCTTEDEI----YSRICSDSGGASGGAYAEIRKIDD
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KE1 QDKCLLMQVGFSDKKTIITKSARDCHE---FGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVD
.: ..... : ::...::: ::::.. . . : : . . . .
CCDS59 P-----LQHHLQNQS--IQKSVKQCHEQNMFGNIVNQNKGHFLLKQDCDTFDLHEKPLKS
100 110 120 130 140 150
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pF1KE1 NLDLFS--RSSA-ENKYD-NGCAKLFFHTEYEKTNPGMK-PYGYK---------------
::.. . :::. .:. . : .: .::..... :: : :
CCDS59 NLSFENQKRSSGLKNSAEFNRDGKSLFHANHKQFYTEMKFPAIAKPINKSQFIKQQRTHN
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 --------ECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFECTACRKTFSKKSHLIVHWRTHTGEKP
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CCDS59 IENAHVCSECGKAFLKLSQFIDHQRVHTGEKPHVCSMCGKAFSRKSRLMDHQRTHTELKH
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 FGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECN
. :::: :.: .:::: :: .:: : .:. : .::::: .: .: : ::::::::. :.
CCDS59 YECTECDKTFLKKSQLNIHQKTHMGGKPYTCSQCGKAFIKKCRLIYHQRTHTGEKPHGCS
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pF1KE1 ECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHECNECKK
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CCDS59 VCGKAFSTKFSLTTHQKTHTGEKPYICSECGKGFIEKRRLTAHHRTHTGEKPFICNKCGK
340 350 360 370 380 390
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pF1KE1 TFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFNEKSTLIVHQRTHTGEKPYECDVCGKTFTQ
:. :..:: ::.:::::: . :.::::.:. : :.::::::::::::.:. ::: :.
CCDS59 GFTLKNSLITHQQTHTGEKLYTCSECGKGFSMKHCLMVHQRTHTGEKPYKCNECGKGFAL
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pF1KE1 KSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQKSYLMLHQRGHTGEKPYECNECEKAFSQKSYL
:: : :::::.::::. :.::.:.:..:: :..::: ::.:::: ::.: :.:. :: :
CCDS59 KSPLIRHQRTHTGEKPYVCTECRKGFTMKSDLIVHQRTHTAEKPYICNDCGKGFTVKSRL
460 470 480 490 500 510
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pF1KE1 IIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIHQRIHTGEKPYECPVCWKAFSQKSQLIIHQ
:.:::::: :::: :.::::.: : .:. ::: ::::::: : : :.:..::.: .:.
CCDS59 IVHQRTHTGEKPYVCGECGKGFPAKIRLMGHQRTHTGEKPYICNECGKGFTEKSHLNVHR
520 530 540 550 560 570
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pF1KE1 RTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTHTGEKPYKCTECGKAFTQKSNLIVHQRTHA
:::::::::.:.::::.. :: . .::::::::::: :.::::.::.::.: .::.::.
CCDS59 RTHTGEKPYVCSECGKGLTGKSMLIAHQRTHTGEKPYICNECGKGFTMKSTLSIHQQTHT
580 590 600 610 620 630
630
pF1KE1 GKKAHGRGHTRKSKFMAH
:.: .
CCDS59 GEKPYKCNECDKTFRKKTCLIQHQRFHTGKTSFACTECGKFSLRKNDLITHQRIHTGEKP
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CCDS45 MCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQTHAEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQR
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:. .: :: :: ...: . . ..:: :. :.:.: . . ..::
CCDS45 IHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIH---TGENPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKT
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CCDS45 HSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYECNECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGE
390 400 410 420 430 440
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::. :..:::::. :::::.: ::: .:. : .:::.: :: .:.: :.::: :::
CCDS45 KPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTGVKPYGCIQCGKGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYV
450 460 470 480 490 500
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:::::::: .:: ::.: .:::::: .::..::..: : .::::. :::..:.::.::
CCDS45 CNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAFSFKSQLIIHQRIHTGENPYECHEC
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CCDS45 GKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTDCGKAFGLKSQLIIHQRTHTGEKPFECSECQKAF
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CCDS45 NTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKS
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::.:::.:: ::: :.::::::: :: ::::.: ::::::.:: : :.:: .::::.
CCDS45 QLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTHTGEKPHECRECGKSFSFNSQLIV
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::: ::::.:: :.:::::: .:. . :::::.::::: :.::::::..:: ::.:.::
CCDS45 HQRIHTGENPYECSECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYGCSECGKAFSSKSYLIIHMRT
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:.:.: . :.. :: ...:
CCDS45 HSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQCEKSFSGKLRLLVHQRMHTRE
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CCDS45 IHMRTHSGEKPYECNECGKAFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQCEKSFSGKLRLLVHQR
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CCDS45 MHTREKPYECSECGKAFIRNSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTFSQKSILSAHQRTHTG
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CCDS45 EKPCKCTECGKAFCWKSQLIMHQRTHVDDKH
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pF1KE1 LKLEVEECPAEGKIPFWNFPEVCQVDEQIERQHQDDQDKCLLMQVG--FSDKKTIITKS-
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CCDS71 QHEKIQTLDHNFEYSICQETLLEKAVFNTRKRENAEENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQI
210 220 230 240 250 260
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pF1KE1 --ARDCH-EFGN---ILHLSTNLVASIQRPDKH----ESFGNNMVDNL---DLFSRSSAE
..: : ::.. .: ....: : :: :: :::. .: .: . ...:
CCDS71 PPSKDSHYEFSDCEKFLCVKSTLSKHDGVPVKHYDCGES-GNNFRRKLCLSQLQKGDKGE
270 280 290 300 310 320
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pF1KE1 NKYD-NGCAKLFFH----TEYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFE
.... : :.: :.. :...... : : . ..::: . .:..:. ::: ..::::::
CCDS71 KHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGEKHFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKPFE
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pF1KE1 CTACRKTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKAFSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPEC
:. : :.::.:: : .: ::::::::. :. :::.: :::.: : :::::..:.:: ::
CCDS71 CNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFYQKSDLTKHQRTHTGQKPYECYEC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]