Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0993
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0993, 645 aa
1>>>pF1KE0993 645 - 645 aa - 645 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4959+/-0.00138; mu= -5.0122+/- 0.080
mean_var=333.9582+/-70.520, 0's: 0 Z-trim(108.7): 680 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.070182
statistics sampled from 9633 (10380) to 9633 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.319), width: 16
Scan time: 2.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3069.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 645) 4242 444.3 2.4e-124
CCDS54639.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 599) 3566 375.8 9.3e-104
CCDS46915.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 470) 3067 325.2 1.3e-88
CCDS82836.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 482) 3067 325.2 1.3e-88
CCDS82837.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 540) 2125 229.9 7.2e-60
CCDS2863.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 ( 841) 788 94.7 5.6e-19
CCDS73576.1 NEK3 gene_id:4752|Hs108|chr13 ( 506) 750 90.6 5.6e-18
CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214) 757 91.7 6.5e-18
CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1242) 741 90.1 2e-17
CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1258) 741 90.1 2e-17
CCDS56351.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1286) 741 90.1 2.1e-17
CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189) 740 89.9 2.1e-17
CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13 ( 708) 727 88.4 3.6e-17
CCDS1500.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 445) 624 77.8 3.5e-14
CCDS55682.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 384) 601 75.4 1.6e-13
CCDS73024.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 388) 601 75.4 1.6e-13
CCDS1394.1 NEK7 gene_id:140609|Hs108|chr1 ( 302) 580 73.2 5.8e-13
CCDS6854.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 313) 575 72.7 8.4e-13
CCDS55338.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 331) 575 72.7 8.8e-13
CCDS55339.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 338) 575 72.8 8.9e-13
CCDS48015.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 347) 575 72.8 9.1e-13
CCDS32597.1 NEK8 gene_id:284086|Hs108|chr17 ( 692) 579 73.4 1.1e-12
CCDS9839.1 NEK9 gene_id:91754|Hs108|chr14 ( 979) 543 69.9 1.8e-11
CCDS54593.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 ( 752) 531 68.6 3.5e-11
>>CCDS3069.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 (645 aa)
initn: 4242 init1: 4242 opt: 4242 Z-score: 2345.8 bits: 444.3 E(32554): 2.4e-124
Smith-Waterman score: 4242; 100.0% identity (100.0% similar) in 645 aa overlap (1-645:1-645)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 MTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAEEYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAEEYYA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 DAFDSYCEESDEEEEEIALERPEKEIRNEGSQPAYRTNQQDSDIEALARCLENVLGCTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DAFDSYCEESDEEEEEIALERPEKEIRNEGSQPAYRTNQQDSDIEALARCLENVLGCTSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 DTKTITTMAEDMSPGPPIFNSVMARTKMKRMRESAMQKLGTEVFEEVYNYLKRARHQNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DTKTITTMAEDMSPGPPIFNSVMARTKMKRMRESAMQKLGTEVFEEVYNYLKRARHQNAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE0 EAEIRECLEKVVPQASDCFEVDQLLYFEEQLLITMGKEPTLQNHL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EAEIRECLEKVVPQASDCFEVDQLLYFEEQLLITMGKEPTLQNHL
610 620 630 640
>>CCDS54639.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 (599 aa)
initn: 3566 init1: 3566 opt: 3566 Z-score: 1976.3 bits: 375.8 E(32554): 9.3e-104
Smith-Waterman score: 3566; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 MTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAEEYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAEEYYA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 DAFDSYCEESDEEEEEIALERPEKEIRNEGSQPAYRTNQQDSDIEALARCLENVLGCTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DAFDSYCEESDEEEEEIALERPEKEIRNEGSQPAYRTNQQDSDIEALARCLENVLGCTSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 DTKTITTMAEDMSPGPPIFNSVMARTKMKRMRESAMQKLGTEVFEEVYNYLKRARHQNAS
:
CCDS54 DQPCRSWGQKYLKRSIITSREQGIRMLAKQRSASVWKKWCLKPATVLKWTSSCTLKSSC
550 560 570 580 590
>>CCDS46915.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 (470 aa)
initn: 3067 init1: 3067 opt: 3067 Z-score: 1704.6 bits: 325.2 E(32554): 1.3e-88
Smith-Waterman score: 3067; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 MTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAEEYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHATHS
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 DAFDSYCEESDEEEEEIALERPEKEIRNEGSQPAYRTNQQDSDIEALARCLENVLGCTSL
>>CCDS82836.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 (482 aa)
initn: 3067 init1: 3067 opt: 3067 Z-score: 1704.5 bits: 325.2 E(32554): 1.3e-88
Smith-Waterman score: 3067; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 MTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAEEYYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHGDCNLISLDEYWKN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 DAFDSYCEESDEEEEEIALERPEKEIRNEGSQPAYRTNQQDSDIEALARCLENVLGCTSL
CCDS82 EK
>>CCDS82837.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 (540 aa)
initn: 3529 init1: 2125 opt: 2125 Z-score: 1188.3 bits: 229.9 E(32554): 7.2e-60
Smith-Waterman score: 3323; 83.7% identity (83.7% similar) in 645 aa overlap (1-645:1-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFLKNNLLKIGDFGVSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIW------------------------
190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYSE
CCDS82 ------------------------------------------------------------
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 MTLEDKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ---------------------QKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKARKL
220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQDEDE
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430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAEEYYA
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CCDS82 ERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAEEYYA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DAFDSYCEESDEEEEEIALERPEKEIRNEGSQPAYRTNQQDSDIEALARCLENVLGCTSL
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CCDS82 DTKTITTMAEDMSPGPPIFNSVMARTKMKRMRESAMQKLGTEVFEEVYNYLKRARHQNAS
440 450 460 470 480 490
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CCDS82 EAEIRECLEKVVPQASDCFEVDQLLYFEEQLLITMGKEPTLQNHL
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: . .:.::.: : :: : .: . :.
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:.... . . : :. ::::::.: :: :: .. :. :.. :. .::: :: :
CCDS28 KKLNLRNASSRERRAAEQEAQLLSQLKHPNIVTYKESWEGGDGLLYIVMGFCEGGDLYRK
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..: : :...::::..:::.:. ....:.::..:::::::..:::: ..:..:.::.:.
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.:.: . ::.:.:: :::.::::: .... :. :::.:.:.: .::: ..::: ....
CCDS28 ARVLENHCDMASTLIGTPYYMSPELFSNKPYNYKSDVWALGCCVYEMATLKHAFNAKDMN
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pF1KE0 SIVLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRY
:.: .:.:: : .:. : :: ....::.: : :::. ::. ::. .:.. ..
CCDS28 SLVYRIIEGKLPPMPRDYSPELAELIRTMLSKRPEERPSVRSILRQPYIKRQISFFLEAT
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pF1KE0 SEMTLED--KNLDCQ-KEAAHIIN----AMQKRIHLQTLRAL-SEVQKMTPRERMRLRKL
. : .. :: : : : : ... . .. :: : : . :.. : . . .:
CCDS28 KIKTSKNNIKNGDSQSKPFATVVSGEAESNHEVIHPQPLSSEGSQTYIMGEGKCLSQEKP
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.:. .. .:: . .. :. .. . : : .:.: : . .. .:.:
CCDS28 RASGLLKSPASLKAHTCKQDLSNTTELATISSVN-----IDILPAKGRDSVSDGFVQENQ
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pF1KE0 PE-----GRLS--CSPQDEDEERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDA
:. ..:. :: .. .:: : . : .: ::: :. : :. .
CCDS28 PRYLDASNELGGICSISQVEEEMLQDNTKSSAQP--ENLI---PMWSSDI---------V
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:.. . : .::. :. :
CCDS28 TGEKNEPVKPLQPLIKEQKPKDQSLALSPKLECSGTILAHSNLRLLGSSDSPASASRVAG
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CCDS73 KEIRLPKSFSN-TQNSRKEAVLLAKMKHPNIVAFKESFEAEGHLYIVMEYCDGGDLMQKI
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.. : ::.:::..:..:: :. :::...:..:.::::.::::.:: .:. .:.:::: .
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::: . .: : .:::.:. :: .. :..:::::::.:::::.: ..: : .... .
CCDS73 RLLSNPMAFACTYVGTPYYVPPEIWENLPYNNKSDIWSLGCILYELCTLKHPFQANSWKN
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pF1KE0 IVLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYS
..::. .: :: .: ::. ....:...::: :::: .:. . . .:. :
CCDS73 LILKVCQGCISPLPSHYSYELQFLVKQMFKRNPSHRPSATTLLSRGIVARLVQK--CLPP
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pF1KE0 EMTLE--DKNLDCQKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMTPRERMRLRKLQAADEKA
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CCDS73 EIIMEYGEEVLEEIKNSKH--NTPRKKTNPSRIRIALGNEASTVQEEEQDRKGSHTDLES
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pF1KE0 RKLKKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSPQD
. ...:: .. ... . .: .... : ::..
CCDS73 IN-ENLVESALRRVNREEKGNKSVHLRKASSPNLHRRQWEKNVPNTALTALENASILTSS
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 EDEERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAEE
CCDS73 LTAEDDRGGSVIKYSKNTTRKQWLKETPDTLLNILKNADLSLAFQTYTIYRPGSEGFLKG
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.:: ::.: :::: . :: :... :.. :.
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
:::...... .: .. :. .:... :: ::... :: :. .. :. .:::: :: .:
CCDS56 KEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRI
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pF1KE0 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFL-KNNLLKIGDFGVS
. : : .: :.::..::.:. :.. ..:.:.:::::.::.:.:: :.. ...::::..
CCDS56 N--AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIA
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pF1KE0 RLLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLS
:.: .. .:: : :::.:.::: ... :..:::::.:.:.:::.: ..::: .... .
CCDS56 RVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKN
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.::::. :. : . .: .: ... .....:: :::. ::. .. .......
CCDS56 LVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLS--P
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pF1KE0 EMTLEDKNLDC-QKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMT-PRER--MRLRKLQAADE
.. :. : .: ... : : .. :. .. .::.: : . . : . .:.
CCDS56 QLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPA-KRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDK
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pF1KE0 KARKLKKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSP
: .. : . ..: ... . . ... ...: .. . : .:. .:....: . .:
CCDS56 KLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERRKISEEAAR-KRRLEFIEKEKKQKDQIISLMK
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 QDE----DEERWQ--GREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIP
.. ..:: . .: .:. .. . : . . : .:. .. :. : .:
CCDS56 AEQMKRQEKERLERINRAREQGWRNVLSAGGSGEVKAPFLGSGGTIAPSSFSSRGQYE--
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pF1KE0 EDPLVAEEYYADAFDSYCEESDEEEEEIALERPEKEIRNEG---SQPAYRTNQQDSDIEA
.: ::.. .. :..: . ..:: ..: : . . .. ...:
CCDS56 --------HYHAIFDQMQQQRAEDNE----AKWKREIYGRGLPERQKGQLAVERAKQVEE
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pF1KE0 LARCLENVLGCTSLDTKTITTMAEDMSPGPPIFNSVMA-RTKMKRMRESAMQKLGTEVFE
. . .... . .. .:. . :: . ..:.. .. : .. : : :
CCDS56 FLQRKREAMQNKARAEGHMVYLARLRQIRLQNFNERQQIKAKLRGEKKEANHSEGQEGSE
500 510 520 530 540 550
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pF1KE0 EVYNYLKRAR----HQNASEAEIRECLEKVVPQASDCFEVDQLLYFEEQLLITMGKEPTL
:. :. . : :: : ..: ::. . .. .: .. .. ::.:.
CCDS56 EADMRRKKIESLKAHANARAAVLKEQLER---KRKEAYEREKKVW-EEHLVAKGVKSSDV
560 570 580 590 600
pF1KE0 QNHL
CCDS56 SPPLGQHETGGSPSKQQMRSVISVTSALKEVGVDSSLTDTRETSEEMQKTNNAISSKREI
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pF1KE0 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
.:: ::.: :::: . :: :... :.. :.
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILV--KSTEDGRQY-VI
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CCDS56 KEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRI
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. : : .: :.::..::.:. :.. ..:.:.:::::.::.:.:: :.. ...::::..
CCDS56 N--AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIA
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:.: .. .:: : :::.:.::: ... :..:::::.:.:.:::.: ..::: .... .
CCDS56 RVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKN
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.::::. :. : . .: .: ... .....:: :::. ::. .. .......
CCDS56 LVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLS--P
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.. :. : .: ... : : .. :. .. .::.: : . . : . .:.
CCDS56 QLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPA-KRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDK
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pF1KE0 KARKLKKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSP
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CCDS56 KLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERRKISEEAAR-KRRLEFIEKEKKQKDQIISLMK
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.. ... . : :
CCDS56 AEQMKRQEKERLERINRAREQGWRNVLSAGGSGEVKAPFLGSGGTIAPSSFSSRGQYEHY
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pF1KE0 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
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CCDS47 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILV--KSTEDGRQY-VI
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:::...... .: .. :. .:... :: ::... :: :. .. :. .:::: :: .:
CCDS47 KEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRI
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pF1KE0 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFL-KNNLLKIGDFGVS
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CCDS47 N--AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIA
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pF1KE0 RLLMGSCDLATTLTGTPHYMSPEALKHQGYDTKSDIWSLACILYEMCCMNHAFAGSNFLS
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CCDS47 RVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKN
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pF1KE0 IVLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYS
.::::. :. : . .: .: ... .....:: :::. ::. .. .......
CCDS47 LVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLS--P
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pF1KE0 EMTLEDKNLDC-QKEAAHIINAMQKRIHLQTLRALSEVQKMT-PRER--MRLRKLQAADE
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CCDS47 QLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPA-KRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDK
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pF1KE0 KARKLKKIVEEKYEENSKRMQELRSRNFQQLSVDVLHEKTHLKGMEEKEEQPEGRLSCSP
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CCDS47 KLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERRKISEEAAR-KRRLEFIEKEKKQKDQIISLMK
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 QDEDEERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVA
.. ... . : :
CCDS47 AEQMKRQEKERLERINRAREQGWRNVLSAGGSGEVKAPFLGSGGTIAPSSFSSRGQYEHY
390 400 410 420 430 440
645 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 18:05:17 2016 done: Sat Nov 5 18:05:18 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]