FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0985, 596 aa
1>>>pF1KE0985 596 - 596 aa - 596 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2568+/-0.00126; mu= -11.0667+/- 0.075
mean_var=480.5264+/-99.790, 0's: 0 Z-trim(114.7): 562 B-trim: 156 in 1/51
Lambda= 0.058508
statistics sampled from 14618 (15224) to 14618 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.468), width: 16
Scan time: 3.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13191.1 MYLK2 gene_id:85366|Hs108|chr20 ( 596) 3981 350.7 3.1e-96
CCDS10723.2 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 ( 819) 1504 141.8 3.3e-33
CCDS76861.1 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 ( 478) 1460 137.8 3e-32
CCDS34330.1 MYLK4 gene_id:340156|Hs108|chr6 ( 388) 1244 119.5 7.9e-27
CCDS43141.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1845) 1049 103.7 2.2e-21
CCDS46896.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1914) 1049 103.7 2.2e-21
CCDS10188.1 DAPK2 gene_id:23604|Hs108|chr15 ( 370) 781 80.4 4.4e-15
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 789 81.6 7.3e-15
CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 ( 454) 756 78.4 2.2e-14
CCDS5470.1 STK17A gene_id:9263|Hs108|chr7 ( 414) 721 75.4 1.6e-13
CCDS2315.1 STK17B gene_id:9262|Hs108|chr2 ( 372) 682 72.1 1.5e-12
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 678 71.7 1.8e-12
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 678 71.7 1.9e-12
CCDS54421.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (26926) 723 77.3 2.9e-12
CCDS54423.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (27051) 723 77.3 2.9e-12
CCDS54422.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (27118) 723 77.3 2.9e-12
CCDS54424.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (33423) 723 77.4 3.3e-12
CCDS74610.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (34350) 723 77.4 3.4e-12
CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (35991) 723 77.4 3.5e-12
CCDS3023.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1863) 686 73.1 3.7e-12
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 623 67.1 5.1e-11
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 620 66.8 5.5e-11
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 615 66.5 8.7e-11
>>CCDS13191.1 MYLK2 gene_id:85366|Hs108|chr20 (596 aa)
initn: 3981 init1: 3981 opt: 3981 Z-score: 1841.3 bits: 350.7 E(32554): 3.1e-96
Smith-Waterman score: 3981; 100.0% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATENGAVELGIQNPSTDKAPKGPTGERPLAAGKDPGPPDPKKAPDPPTLKKDAKAPASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MATENGAVELGIQNPSTDKAPKGPTGERPLAAGKDPGPPDPKKAPDPPTLKKDAKAPASE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KGDGTLAQPSTSSQGPKGEGDRGGGPAEGSAGPPAALPQQTATPETSVKKPKAEQGASGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KGDGTLAQPSTSSQGPKGEGDRGGGPAEGSAGPPAALPQQTATPETSVKKPKAEQGASGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QDPGKPRVGKKAAEGQAAARRGSPAFLHSPSCPAIISSSEKLLAKKPPSEASELTFEGVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QDPGKPRVGKKAAEGQAAARRGSPAFLHSPSCPAIISSSEKLLAKKPPSEASELTFEGVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MTHSPTDPRPAKAEEGKNILAESQKEVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAVPSEKSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MTHSPTDPRPAKAEEGKNILAESQKEVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAVPSEKSEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GQALCLTAREEDCFQILDDCPPPPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGGGKFGAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GQALCLTAREEDCFQILDDCPPPPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGGGKFGAVC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TCMEKATGLKLAAKVIKKQTPKDKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPHEIVLFME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TCMEKATGLKLAAKVIKKQTPKDKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPHEIVLFME
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YIEGGELFERIVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENILCVNTTGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YIEGGELFERIVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENILCVNTTGH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 LVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITYMLLSGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITYMLLSGLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 PFLGDDDTETLNNVLSGNWYFDEETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQCLAHPWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PFLGDDDTETLNNVLSGNWYFDEETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQCLAHPWL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE0 NNLAEKAKRCNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMALGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NNLAEKAKRCNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMALGV
550 560 570 580 590
>>CCDS10723.2 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 (819 aa)
initn: 1534 init1: 1446 opt: 1504 Z-score: 709.6 bits: 141.8 E(32554): 3.3e-33
Smith-Waterman score: 1537; 45.8% identity (66.8% similar) in 596 aa overlap (10-588:271-818)
10 20 30
pF1KE0 MATENGAVELGIQNPSTDKAP---KGPTGERP----LAA
... .:: . :: .: .. :: :
CCDS10 PLPTKVEAKAPETPSENLRTGLELAPAPGRVNVVSPSLEVAPGAGQGASSSRPDPEPLEE
250 260 270 280 290 300
40 50 60 70 80
pF1KE0 GK--DPGPPDPKKAPDPPTLKKDAKAPASEKGDGTLAQPSTSSQGPKGEGDRGGG---PA
: ::: :. : :: : :.: :...: : . : : : : : .
CCDS10 GTRLTPGP-GPQ-CPGPPGLP--AQARATHSGGETPPRISIHIQ----EMDTPGEMLMTG
310 320 330 340 350
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 EGSAGPPAALPQQTATPETSVKKPKAEQGASGS----QDPG-KPRVGKKAAEGQAAARRG
.:: :: : : :. . ..:: :. : :: .: :... :: ::.
CCDS10 RGSLGP-------TLTTEAPAAAQPGKQGPPGTGRCLQAPGTEP--GEQTPEG---AREL
360 370 380 390 400
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 SPAFLHSPSCPAIISSSEKLLAKKPPSEASELTFEGVPMTHSPTDPRPAKAEEGKNILAE
:: :. : :. ... :. : :. : : :..... . ..
CCDS10 SP--LQESSSPGGVKAEEEQRAGAEPG----------------TRPSLARSDDNDHEVGA
410 420 430 440
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SQKEVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAVPSEKSEVGQALCLTAREEDCFQILDDCPP
. : :.:: ::. . . : . .: .. : : .::: :
CCDS10 LGLQQG-KSPG-AGNPEPEQDCAARAPVRAEAVRRMPPGA--------EAGSVVLDDSPA
450 460 470 480 490
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 PPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGGGKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTPK
::::: ::.: .. ..:. . . ..:.::::.:: : : ::.::: ::::.:: .. :
CCDS10 PPAPFEHRVVSVKETSISAGYEVCQHEVLGGGRFGQVHRCTEKSTGLPLAAKIIKVKSAK
500 510 520 530 540 550
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 DKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPHEIVLFMEYIEGGELFERIVDEDYHLTEVD
:.: : ::..::::.: :::::: :.:. : .: :::..:::::.::.:: :::::.:
CCDS10 DREDVKNEINIMNQLSHVNLIQLYDAFESKHSCTLVMEYVDGGELFDRITDEKYHLTELD
560 570 580 590 600 610
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 TMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENILCVNTTGHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVN
...:.::::.:. ..:. .:::::::::::::: ::: .:::::::::::.: ::::::
CCDS10 VVLFTRQICEGVHYLHQHYILHLDLKPENILCVNQTGHQIKIIDFGLARRYKPREKLKVN
620 630 640 650 660 670
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 FGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITYMLLSGLSPFLGDDDTETLNNVLSGNWYFD
:::::::.::::::. .: :::::.::::::::::::::::. :.::.: ... .: ::
CCDS10 FGTPEFLAPEVVNYEFVSFPTDMWSVGVITYMLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDFD
680 690 700 710 720 730
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 EETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQCLAHPWLNNLAEKAKRCNRRLKSQILLKK
.:::..:.::::::: :.::.. ::.:.::: : ::::: ::.: . :::::.::.:
CCDS10 ADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQCLKHEWLNNLPAKASRSKTRLKSQLLLQK
740 750 760 770 780 790
570 580 590
pF1KE0 YLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMALGV
:. .:.:::.: .:.::::..:. .:
CCDS10 YIAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP
800 810
>>CCDS76861.1 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 (478 aa)
initn: 1488 init1: 1446 opt: 1460 Z-score: 692.5 bits: 137.8 E(32554): 3e-32
Smith-Waterman score: 1484; 48.7% identity (70.3% similar) in 505 aa overlap (89-588:13-477)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 SEKGDGTLAQPSTSSQGPKGEGDRGGGPAEGSAGPPAALPQQTATPETSVKKPKAEQGAS
:: :: : : :. . ..::
CCDS76 MDTPGEMLMTGRGSLGP-------TLTTEAPAAAQPGKQGPP
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GS----QDPG-KPRVGKKAAEGQAAARRGSPAFLHSPSCPAIISSSEKLLAKKPPSEASE
:. : :: .: :... :: ::. :: :. : :. ... :. : :.
CCDS76 GTGRCLQAPGTEP--GEQTPEG---ARELSP--LQESSSPGGVKAEEEQRAGAEPG----
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LTFEGVPMTHSPTDPRPAKAEEGKNILAESQKEVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAV
: : :..... . .. . : :.:: ::. . . : . .:
CCDS76 ------------TRPSLARSDDNDHEVGALGLQQG-KSPG-AGNPEPEQDCAARAPVRAE
90 100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PSEKSEVGQALCLTAREEDCFQILDDCPPPPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGG
.. : : .::: : ::::: ::.: .. ..:. . . ..:.:::
CCDS76 AVRRMPPGA--------EAGSVVLDDSPAPPAPFEHRVVSVKETSISAGYEVCQHEVLGG
140 150 160 170 180
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 GKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTPKDKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPH
:.:: : : ::.::: ::::.:: .. ::.: : ::..::::.: :::::: :.:. :
CCDS76 GRFGQVHRCTEKSTGLPLAAKIIKVKSAKDREDVKNEINIMNQLSHVNLIQLYDAFESKH
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 EIVLFMEYIEGGELFERIVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENIL
.: :::..:::::.::.:: :::::.:...:.::::.:. ..:. .:::::::::::
CCDS76 SCTLVMEYVDGGELFDRITDEKYHLTELDVVLFTRQICEGVHYLHQHYILHLDLKPENIL
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 CVNTTGHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITY
::: ::: .:::::::::::.: :::::::::::::.::::::. .: :::::.:::::
CCDS76 CVNQTGHQIKIIDFGLARRYKPREKLKVNFGTPEFLAPEVVNYEFVSFPTDMWSVGVITY
310 320 330 340 350 360
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 MLLSGLSPFLGDDDTETLNNVLSGNWYFDEETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQ
:::::::::::. :.::.: ... .: :: .:::..:.::::::: :.::.. ::.:.:
CCDS76 MLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDFDADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQ
370 380 390 400 410 420
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 CLAHPWLNNLAEKAKRCNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMA
:: : ::::: ::.: . :::::.::.::. .:.:::.: .:.::::..:. .:
CCDS76 CLKHEWLNNLPAKASRSKTRLKSQLLLQKYIAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP
430 440 450 460 470
pF1KE0 LGV
>>CCDS34330.1 MYLK4 gene_id:340156|Hs108|chr6 (388 aa)
initn: 1228 init1: 1228 opt: 1244 Z-score: 595.1 bits: 119.5 E(32554): 7.9e-27
Smith-Waterman score: 1244; 60.5% identity (82.6% similar) in 299 aa overlap (259-557:80-373)
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 EFQAVPSEKSEVGQALCLTAREEDCFQILDDCPPPPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSK
: : ::::: ::.: . : :.: .....
CCDS34 GHNEAKEVWSNADLTERMPVKSKRTSALAVDIPAPPAPFDHRIVTAKQGAVNSFYTVSKT
50 60 70 80 90 100
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 EALGGGKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTPKDKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAA
: ::::.:: : : : :::::::::.:: . :::: : :: :::::.: :::::: :
CCDS34 EILGGGRFGQVHKCEETATGLKLAAKIIKTRGMKDKEEVKNEISVMNQLDHANLIQLYDA
110 120 130 140 150 160
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 IETPHEIVLFMEYIEGGELFERIVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLK
.:. ..::: :::..:::::.::.::.:.:::.::..:..:::.:: ::.: .::::::
CCDS34 FESKNDIVLVMEYVDGGELFDRIIDESYNLTELDTILFMKQICEGIRHMHQMYILHLDLK
170 180 190 200 210 220
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 PENILCVNTTGHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSM
:::::::: .. .:::::::::::.: :::::::::::::.::::::: .: :::::.
CCDS34 PENILCVNRDAKQIKIIDFGLARRYKPREKLKVNFGTPEFLAPEVVNYDFVSFPTDMWSV
230 240 250 260 270 280
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 GVITYMLLSGLSPFLGDDDTETLNNVLSGNWYFDEETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRAR
:::.:::::::::::::.:.:::::.:. : ...: :. .:.:::.:.:.:..:.. :
CCDS34 GVIAYMLLSGLSPFLGDNDAETLNNILACRWDLEDEEFQDISEEAKEFISKLLIKEKSWR
290 300 310 320 330 340
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 MNAAQCLAHPWLNNLAEKAKRCNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSS
..:.. : ::::.. .. . ::..:
CCDS34 ISASEALKHPWLSD-----HKLHSRLNAQKKKNRGSDAQDFVTK
350 360 370 380
>>CCDS43141.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1845 aa)
initn: 992 init1: 952 opt: 1049 Z-score: 497.5 bits: 103.7 E(32554): 2.2e-21
Smith-Waterman score: 1053; 35.4% identity (59.6% similar) in 607 aa overlap (2-586:1123-1693)
10 20 30
pF1KE0 MATENG-AVELGIQNPSTDKAPKGPTGERPL
:.:: : :. . :... : : :
CCDS43 PEDRGLYKCVAKNDAGQAECSCQVTVDDAPASENTKAPEMKSRRPKSSLPPVLGT-ESDA
1100 1110 1120 1130 1140 1150
40 50 60 70
pF1KE0 AAGKDPGPPDPKKAPDPPTL---KKDAKAPASEK----GDGTLAQPSTSS------QGPK
.. : :.: : :: :: . .: :. :.:. : : .:: : . : .
CCDS43 TVKKKPAPKTPPKAAMPPQIIQFPEDQKVRAGESVELFGKVTGTQPITCTWMKFRKQIQE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 GEGDRGGGPAEGSAGPPAALPQQ-----TATPETSVKKPKAEQGASGSQDPGKPRVGKKA
.: . . .:: : :. : :... . .:. . . . : :
CCDS43 SEHMKVENSENGSKLTILAARQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPA-----
1220 1230 1240 1250 1260
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 AEGQAAARRGSPAFLHSPSCPAIISSSEKLLAKKPPSEASELTFEGVPMTHSPTDPRPAK
:.: : . : :: :. : ..: ..: . .
CCDS43 ---------GTP-------CASDIRSSSLTLSWYGSS------YDGGSAVQSYSIEIWDS
1270 1280 1290 1300
200 210 220 230 240
pF1KE0 AEEGKNILAESQK---EVGEKTPGQAGQAKMQGDTSRGIEFQAVPSEKSEVGQALCLTAR
:.. . :: .. .: . : . . .... . : . ::..::. . .
CCDS43 ANKTWKELATCRSTSFNVQDLLPDHEYKFRVRAINVYGT---SEPSQESELTTVGEKPEE
1310 1320 1330 1340 1350 1360
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 EEDCFQILDDCPPPPAPFPHRMVELRTGNVSSEFSMNSKEALGGGKFGAVCTCMEKATGL
.: .. :: : .: : . : . :.: .. .: ::.:::: : .:: :
CCDS43 PKDEVEVSDDDEKEPE-VDYRTVTINTEQKVSDF-YDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTRK
1370 1380 1390 1400 1410
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KLAAKVIKKQTPKDKEMVLLEIEVMNQLNHRNLIQLYAAIETPHEIVLFMEYIEGGELFE
:.: .: . :.:: . :: .:: :.: .:.: :.: .::. .: . ::::::
CCDS43 VWAGKFFKAYSAKEKENIRQEISIMNCLHHPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFE
1420 1430 1440 1450 1460 1470
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 RIVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENILCVNTTGHLVKIIDFGL
::.:::..::: . . ..::: .:. ..::. ..:::::::::.::: :: .:.:::::
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pF1KE0 ARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITYMLLSGLSPFLGDDDTE
::: . .::: ::::::..:::.::. :. :::::.::: :.:.::::::.::.:.:
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:: :: :..: ::.:.:. .::.::::.:::. ::.. :.. .::: :::: . .:
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pF1KE0 CNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMALGV
. . :. .:::. .:.:.:. :: : .:.....
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10 20 30
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.. : :.: : :: :: . .: :. :.:. : : .:: : . : .
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.: . . .:: : :. : :... . .:. . . . : :
CCDS46 SEHMKVENSENGSKLTILAARQEHCGCYTLLVENKLGSRQAQVNLTVVDKPDPPA-----
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:.: : . : :: :. : ..: ..: . .
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:.. . :: .. .: . : . . .... . : . ::..::. . .
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CCDS46 VWAGKFFKAYSAKEKENIRQEISIMNCLHHPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFE
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pF1KE0 RIVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHKMRVLHLDLKPENILCVNTTGHLVKIIDFGL
::.:::..::: . . ..::: .:. ..::. ..:::::::::.::: :: .:.:::::
CCDS46 RIIDEDFELTERECIKYMRQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGTRIKLIDFGL
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pF1KE0 ARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYDQISDKTDMWSMGVITYMLLSGLSPFLGDDDTE
::: . .::: ::::::..:::.::. :. :::::.::: :.:.::::::.::.:.:
CCDS46 ARRLENAGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNE
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pF1KE0 TLNNVLSGNWYFDEETFEAVSDEAKDFVSNLIVKDQRARMNAAQCLAHPWLNNLAEKAKR
:: :: :..: ::.:.:. .::.::::.:::. ::.. :.. .::: :::: . .:
CCDS46 TLANVTSATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLDCTQCLQHPWL---MKDTKN
1670 1680 1690 1700 1710 1720
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pF1KE0 CNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALMALGV
. . :. .:::. .:.:.:. :: : .:.....
CCDS46 MEAKKLSKDRMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEK
1730 1740 1750 1760 1770 1780
CCDS46 LESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSKTIRDLEVVEGSAARFDCKIEGYPDPEVVWFKD
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CCDS10 GSGQFAIVKKCREKSTGLEYAAKFIKKRQSRASRRGVSREEIEREVSILRQVLHHNVITL
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CCDS10 HDVYENRTDVVLILELVSGGELFDFLAQKE-SLSEEEATSFIKQILDGVNYLHTKKIAHF
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CCDS10 DLKPENIMLLDKNIPIPHIKLIDFGLAHEIEDGVEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEA
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::::.:::::.:::: :::::: ::: :. . .. :::: : .:. ::::. .:.::
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. : :.. . : :::.. . .. :. .. ..: ..:::: .: :: :..
CCDS10 ETRKRLTIQEALRHPWITPVDNQQAMVRRESVVNLENFRKQYVRRRWKLSFSIVSLCNHL
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.
CCDS10 TRSLMKKVHLRPDEDLRNCESDTEEDIARRKALHPRRRSSTS
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: ::.:::. ::: :::. :. .: . :. ......: :.: :. . :. .
CCDS43 KCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTD
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..:..: . :::::. ..... ::: .. :..:: .:. ..:.... :.:::::::.
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CCDS43 LDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVIT
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:.:::: :::::: ::: :: . :. :..: : .: ::::. :.::: . ::.
CCDS43 YILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQ
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. : :::.. . . .:. .. . .::. ...::.. .: .:...
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CCDS43 NMSVARSDDTLDEEDSFVMKAIIHAINDDNVPGLQHLLGSLSNYDVNQPNKHGTPPLLIA
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CCDS12 MSTFRQEDVEDHYEMG--EELGSGQFAIVR
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CCDS12 KCRQKGTGKEYAAKFIKKRRLSSSRRGVSREEIEREVNILREIRHPNIITLHDIFENKTD
30 40 50 60 70 80
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CCDS12 VVLILELVSGGELFDFLAEKE-SLTEDEATQFLKQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIML
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. :. . .:.::::.:.. . ....: ::::::..::.:::. .. ..::::.::::
CCDS12 LDKNVPNPRIKLIDFGIAHKIEAGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVIT
150 160 170 180 190 200
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:.:::: :::::. :::.:. . :. :::: : .:. ::::. :.::: . ::. :
CCDS12 YILLSGASPFLGETKQETLTNISAVNYDFDEEYFSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIA
210 220 230 240 250 260
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: : : :.. . .. : . ::::. ::.: .:
CCDS12 QSLEHSWIKAIRRRNVRGEDSGRKPERRRLKTT-RLKEYTIKSHSSLPPNNSYADFERFS
270 280 290 300 310 320
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CCDS12 KVLEEAAAAEEGLRELQRSRRLCHEDVEALAAIYEEKEAWYREESDSLGQDLRRLRQELL
330 340 350 360 370 380
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: ::: : . .. .:: .. .:
CCDS54 MIPLEKPGSGGSSPGATSGSGRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAVVRTEPFQDGYS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 MNSKEALGGGKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTP-KDKEM-VLLEIEVMNQLNHRN-
. . :: :::..: :..: .: ..::: ..:. .: .: .. :: :. .: . :
CCDS54 LCPGRELGRGKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQDCRMEIIHEIAVL-ELAQDNP
70 80 90 100 110
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.:.:. . :: :..: .:: :::.:.. ..:.. . : :.. ..::: .:. :.:
CCDS54 WVINLHEVYETASEMILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHT
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 MRVLHLDLKPENILCVNTT--GHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYD
:.::::::.::: .. . : .::.::::.: . .:.:. .::::...::...::
CCDS54 RDVVHLDLKPQNILLTSESPLGD-IKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYD
180 190 200 210 220 230
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CCDS54 PISMATDMWSIGVLTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFI
240 250 260 270 280 290
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.:.:: . : .: .:: :::: ... : . : .. :. :..
CCDS54 RTLLVKKPEDRATAEECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANALQEGHSVPEINSDTDK
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CCDS54 SETKESIVTEELIVVTSYTLGQCRQSEKEKMEQKAISKRFKFEEPLLQEIPGEFIY
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596 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 04:48:22 2016 done: Sat Nov 5 04:48:23 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]