Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0963
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0963, 489 aa
1>>>pF1KE0963 489 - 489 aa - 489 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6918+/-0.00125; mu= 6.9303+/- 0.073
mean_var=227.1095+/-50.527, 0's: 0 Z-trim(108.1): 732 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.085105
statistics sampled from 9167 (9993) to 9167 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73576.1 NEK3 gene_id:4752|Hs108|chr13 ( 506) 2005 259.9 4.7e-69
CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189) 1094 148.5 3.8e-35
CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214) 1094 148.5 3.9e-35
CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1242) 1094 148.5 3.9e-35
CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1258) 1094 148.5 4e-35
CCDS56351.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1286) 1094 148.5 4e-35
CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13 ( 708) 1049 142.7 1.3e-33
CCDS2863.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 ( 841) 848 118.1 3.8e-26
CCDS54639.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 599) 750 105.9 1.3e-22
CCDS3069.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 645) 750 105.9 1.3e-22
CCDS46915.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 470) 742 104.8 2.1e-22
CCDS82836.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 482) 742 104.8 2.2e-22
CCDS9839.1 NEK9 gene_id:91754|Hs108|chr14 ( 979) 668 96.1 1.9e-19
CCDS32597.1 NEK8 gene_id:284086|Hs108|chr17 ( 692) 631 91.4 3.5e-18
CCDS6854.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 313) 609 88.3 1.3e-17
CCDS55338.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 331) 609 88.3 1.4e-17
CCDS55339.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 338) 609 88.3 1.4e-17
CCDS48015.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 347) 609 88.3 1.4e-17
CCDS1394.1 NEK7 gene_id:140609|Hs108|chr1 ( 302) 592 86.2 5.6e-17
CCDS1500.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 445) 568 83.4 5.6e-16
CCDS55682.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 384) 560 82.3 1e-15
CCDS73024.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 388) 560 82.3 1e-15
CCDS58750.1 STK36 gene_id:27148|Hs108|chr2 (1294) 561 83.1 2e-15
CCDS2421.1 STK36 gene_id:27148|Hs108|chr2 (1315) 561 83.1 2.1e-15
CCDS82837.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 540) 520 77.6 3.8e-14
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 503 75.8 2.3e-13
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 494 74.4 3.2e-13
CCDS54593.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 ( 752) 497 74.9 3.3e-13
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 494 74.4 3.3e-13
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 480 72.6 1e-12
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 483 73.2 1.1e-12
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 483 73.2 1.1e-12
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 483 73.2 1.1e-12
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 970) 481 73.1 1.5e-12
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 478 72.6 1.7e-12
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 478 72.6 1.7e-12
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 472 71.6 2e-12
CCDS10616.1 PLK1 gene_id:5347|Hs108|chr16 ( 603) 474 72.0 2e-12
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 472 71.6 2e-12
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 475 72.2 2.1e-12
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 472 71.7 2.2e-12
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 472 71.9 2.7e-12
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 472 71.9 2.7e-12
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 472 71.9 2.8e-12
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 463 70.6 4.5e-12
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 466 71.2 5.1e-12
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 466 71.2 5.2e-12
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 459 70.0 5.8e-12
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 459 70.0 5.9e-12
CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 464 71.1 6.8e-12
>>CCDS73576.1 NEK3 gene_id:4752|Hs108|chr13 (506 aa)
initn: 3277 init1: 1994 opt: 2005 Z-score: 1353.3 bits: 259.9 E(32554): 4.7e-69
Smith-Waterman score: 3247; 96.6% identity (96.6% similar) in 506 aa overlap (1-489:1-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDDYMVLRMIGEGSFGRALLVQHESSNQMFAMKEIRLPKSFSNTQNSRKEAVLLAKMKHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDDYMVLRMIGEGSFGRALLVQHESSNQMFAMKEIRLPKSFSNTQNSRKEAVLLAKMKHP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NIVAFKESFEAEGHLYIVMEYCDGGDLMQKIKQQKGKLFPEDMILNWFTQMCLGVNHIHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NIVAFKESFEAEGHLYIVMEYCDGGDLMQKIKQQKGKLFPEDMILNWFTQMCLGVNHIHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KRVLHRDIKSKNIFLTQNGKVKLGDFGSARLLSNPMAFACTYVGTPYYVPPEIWENLPYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KRVLHRDIKSKNIFLTQNGKVKLGDFGSARLLSNPMAFACTYVGTPYYVPPEIWENLPYN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NKSDIWSLGCILYELCTLKHPFQANSWKNLILKVCQGCISPLPSHYSYELQFLVKQMFKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NKSDIWSLGCILYELCTLKHPFQANSWKNLILKVCQGCISPLPSHYSYELQFLVKQMFKR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 NPSHRPSATTLLSRGIVARLVQKCLPPEIIMEYGEEVLEEIKNSKHNTPRKK--------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NPSHRPSATTLLSRGIVARLVQKCLPPEIIMEYGEEVLEEIKNSKHNTPRKKTNPSRIRI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE0 ---------QEEEQDRKGSHTDLESINENLVESALRRVNREEKGNKSVHLRKASSPNLHR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ALGNEASTVQEEEQDRKGSHTDLESINENLVESALRRVNREEKGNKSVHLRKASSPNLHR
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 RQWEKNVPNTALTALENASILTSSLTAEDDRGGSVIKYSKNTTRKQWLKETPDTLLNILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RQWEKNVPNTALTALENASILTSSLTAEDDRGGSVIKYSKNTTRKQWLKETPDTLLNILK
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 NADLSLAFQTYTIYRPGSEGFLKGPLSEETEASDSVDGGHDSVILDPERLEPGLDEEDTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NADLSLAFQTYTIYRPGSEGFLKGPLSEETEASDSVDGGHDSVILDPERLEPGLDEEDTD
430 440 450 460 470 480
470 480
pF1KE0 FEEEDDNPDWVSELKKRAGWQGLCDR
::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FEEEDDNPDWVSELKKRAGWQGLCDR
490 500
>>CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189 aa)
initn: 1106 init1: 988 opt: 1094 Z-score: 744.4 bits: 148.5 E(32554): 3.8e-35
Smith-Waterman score: 1094; 46.8% identity (77.5% similar) in 355 aa overlap (1-353:1-351)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDDYMVLRMIGEGSFGRALLVQHESSNQMFAMKEIRLPK-SFSNTQNSRKEAVLLAKMKH
:. :. :. :::::::.:.::. .......::: . . : .. ..::.:...::.:::
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 PNIVAFKESFEAEGHLYIVMEYCDGGDLMQKIKQQKGKLFPEDMILNWFTQMCLGVNHIH
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CCDS56 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KKRVLHRDIKSKNIFLTQNGKVKLGDFGSARLLSNPMAFACTYVGTPYYVPPEIWENLPY
...:::::::.:::::..: :.::::: ::.:.. . .: : .:::::. ::: :: ::
CCDS56 DRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPY
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NNKSDIWSLGCILYELCTLKHPFQANSWKNLILKVCQGCISPLPSHYSYELQFLVKQMFK
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CCDS56 NNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RNPSHRPSATTLLSRGIVARLVQKCLPPEIIMEYGEEVLEEI-KNSKHNTPRKKQEEEQD
::: :::....: .:..:. ..: : :..: : : :. . : ... : :. :.
CCDS56 RNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAE--EFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQN
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RKGSHTDLESINENLVESALRRVNREEKGNKSVHLRKASSPNLHRRQWEKNVPNTALTAL
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CCDS56 -SISVMPAQKITKPAAKYGIP-LAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ENASILTSSLTAEDDRGGSVIKYSKNTTRKQWLKETPDTLLNILKNADLSLAFQTYTIYR
CCDS56 KISEEAARKRRLEFIEKEKKQKDQIISLMKAEQMKRQEKERAPFLGSGGTIAPSSFSSRG
360 370 380 390 400 410
>>CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214 aa)
initn: 1106 init1: 988 opt: 1094 Z-score: 744.3 bits: 148.5 E(32554): 3.9e-35
Smith-Waterman score: 1094; 46.8% identity (77.5% similar) in 355 aa overlap (1-353:1-351)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDDYMVLRMIGEGSFGRALLVQHESSNQMFAMKEIRLPK-SFSNTQNSRKEAVLLAKMKH
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CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH
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pF1KE0 PNIVAFKESFEAEGHLYIVMEYCDGGDLMQKIKQQKGKLFPEDMILNWFTQMCLGVNHIH
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CCDS56 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
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pF1KE0 KKRVLHRDIKSKNIFLTQNGKVKLGDFGSARLLSNPMAFACTYVGTPYYVPPEIWENLPY
...:::::::.:::::..: :.::::: ::.:.. . .: : .:::::. ::: :: ::
CCDS56 DRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NNKSDIWSLGCILYELCTLKHPFQANSWKNLILKVCQGCISPLPSHYSYELQFLVKQMFK
:::::::.:::.::::::::: :.:.: :::.::. .: . :. ::::.:. ::.:.::
CCDS56 NNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RNPSHRPSATTLLSRGIVARLVQKCLPPEIIMEYGEEVLEEI-KNSKHNTPRKKQEEEQD
::: :::....: .:..:. ..: : :..: : : :. . : ... : :. :.
CCDS56 RNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAE--EFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQN
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RKGSHTDLESINENLVESALRRVNREEKGNKSVHLRKASSPNLHRRQWEKNVPNTALTAL
. : ..:.. .. .. . .. :.:..: .: . . . .: .. ::
CCDS56 -SISVMPAQKITKPAAKYGIP-LAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ENASILTSSLTAEDDRGGSVIKYSKNTTRKQWLKETPDTLLNILKNADLSLAFQTYTIYR
CCDS56 KISEEAARKRRLEFIEKEKKQKDQIISLMKAEQMKRQEKERLERINRAREQGWRNVLSAG
360 370 380 390 400 410
>>CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1242 aa)
initn: 1142 init1: 988 opt: 1094 Z-score: 744.2 bits: 148.5 E(32554): 3.9e-35
Smith-Waterman score: 1094; 46.8% identity (77.5% similar) in 355 aa overlap (1-353:1-351)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDDYMVLRMIGEGSFGRALLVQHESSNQMFAMKEIRLPK-SFSNTQNSRKEAVLLAKMKH
:. :. :. :::::::.:.::. .......::: . . : .. ..::.:...::.:::
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 PNIVAFKESFEAEGHLYIVMEYCDGGDLMQKIKQQKGKLFPEDMILNWFTQMCLGVNHIH
:::: ..:::: .: :::::.::.::::...:. ::: :: ::.::.::.:.::...:.:
CCDS56 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KKRVLHRDIKSKNIFLTQNGKVKLGDFGSARLLSNPMAFACTYVGTPYYVPPEIWENLPY
...:::::::.:::::..: :.::::: ::.:.. . .: : .:::::. ::: :: ::
CCDS56 DRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NNKSDIWSLGCILYELCTLKHPFQANSWKNLILKVCQGCISPLPSHYSYELQFLVKQMFK
:::::::.:::.::::::::: :.:.: :::.::. .: . :. ::::.:. ::.:.::
CCDS56 NNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RNPSHRPSATTLLSRGIVARLVQKCLPPEIIMEYGEEVLEEI-KNSKHNTPRKKQEEEQD
::: :::....: .:..:. ..: : :..: : : :. . : ... : :. :.
CCDS56 RNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAE--EFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQN
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RKGSHTDLESINENLVESALRRVNREEKGNKSVHLRKASSPNLHRRQWEKNVPNTALTAL
. : ..:.. .. .. . .. :.:..: .: . . . .: .. ::
CCDS56 -SISVMPAQKITKPAAKYGIP-LAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ENASILTSSLTAEDDRGGSVIKYSKNTTRKQWLKETPDTLLNILKNADLSLAFQTYTIYR
CCDS56 KISEEAARKRRLEFIEKEKKQKDQIISLMKAEQMKRQEKERLERINRAREQGWRNVLSAG
360 370 380 390 400 410
>>CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1258 aa)
initn: 1106 init1: 988 opt: 1094 Z-score: 744.1 bits: 148.5 E(32554): 4e-35
Smith-Waterman score: 1094; 46.8% identity (77.5% similar) in 355 aa overlap (1-353:1-351)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDDYMVLRMIGEGSFGRALLVQHESSNQMFAMKEIRLPK-SFSNTQNSRKEAVLLAKMKH
:. :. :. :::::::.:.::. .......::: . . : .. ..::.:...::.:::
CCDS47 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 PNIVAFKESFEAEGHLYIVMEYCDGGDLMQKIKQQKGKLFPEDMILNWFTQMCLGVNHIH
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CCDS47 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
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120 130 140 150 160 170
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180 190 200 210 220 230
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240 250 260 270 280 290
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CCDS47 -SISVMPAQKITKPAAKYGIP-LAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ENASILTSSLTAEDDRGGSVIKYSKNTTRKQWLKETPDTLLNILKNADLSLAFQTYTIYR
CCDS47 KISEEAARKRRLEFIEKEKKQKDQIISLMKAEQMKRQEKERLERINRAREQGWRNVLSAG
360 370 380 390 400 410
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CCDS56 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
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CCDS56 NNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFK
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CCDS56 RNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAE--EFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQN
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pF1KE0 RKGSHTDLESINENLVESALRRVNREEKGNKSVHLRKASSPNLHRRQWEKNVPNTALTAL
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CCDS56 -SISVMPAQKITKPAAKYGIP-LAYKKYGDKKLHEKKPLQKHKQAHQTPEKRVNTGEERR
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pF1KE0 ENASILTSSLTAEDDRGGSVIKYSKNTTRKQWLKETPDTLLNILKNADLSLAFQTYTIYR
CCDS56 KISEEAARKRRLEFIEKEKKQKDQIISLMKAEQMKRQEKERLERINRAREQGWRNVLSAG
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CCDS31 MDKYDVIKAIGQGAFGKAYLAKGKSDSKHCVIKEINFEKMPIQEKEASKKEVILLEKMKH
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CCDS31 PNIVAFFNSFQENGRLFIVMEYCDGGDLMKRINRQRGVLFSEDQILGWFVQISLGLKHIH
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CCDS31 DRKILHRDIKAQNIFLSKNGMVAKLGDFGIARVLNNSMELARTCIGTPYYLSPEICQNKP
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pF1KE0 YNNKSDIWSLGCILYELCTLKHPFQANSWKNLILKVCQGCISPLPSHYSYELQFLVKQMF
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CCDS31 YNNKTDIWSLGCVLYELCTLKHPFEGNNLQQLVLKICQAHFAPISPGFSRELHSLISQLF
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pF1KE0 KRNPSHRPSATTLLSRGIVARLVQKCLPPEIIMEYGEEVLEEIKNSKHNTPRKKQEEEQD
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CCDS31 QVSPRDRPSINSILKRPFLENLIPKYLTPEVIQEEFSHMLICRAGAPASRHAGKVVQKCK
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CCDS31 IQKVRFQGKCPPRSRISVPIKRNAILHRNEWRPPAGAQKARSIKMIERPKIAAVCGHYDY
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CCDS28 MPLAAYCYLRVVGKGSYGEVTLVKHRRDGKQYVIKKLNLRNASSRERRAAEQEAQLLSQL
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CCDS28 KHPNIVTYKESWEGGDGLLYIVMGFCEGGDLYRKLKEQKGQLLPENQVVEWFVQIAMALQ
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pF1KE0 HIHKKRVLHRDIKSKNIFLTQNGKVKLGDFGSARLLSNPMAFACTYVGTPYYVPPEIWEN
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CCDS28 YLHEKHILHRDLKTQNVFLTRTNIIKVGDLGIARVLENHCDMASTLIGTPYYMSPELFSN
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CCDS28 KPYNYKSDVWALGCCVYEMATLKHAFNAKDMNSLVYRIIEGKLPPMPRDYSPELAELIRT
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CCDS28 MLSKRPEERPSVRSILRQPYIKRQISFFLEATKIKTSKNNIKNGDSQSKPFATVVSGEAE
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pF1KE0 QDRKGSHTD-LESINENLVESALRRVNREEKGNKSVHLRKASSPNLHR-RQWEKNVPNTA
.... : . : : . . . . .:: : :.. .: . : .: .:. . :
CCDS28 SNHEVIHPQPLSSEGSQTYIMGEGKCLSQEKPRASGLLKSPASLKAHTCKQDLSNTTELA
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pF1KE0 LTALENASILTSSLTAEDDRGGSVIKYSKNTTRKQWLKETPDTLLNILKNADLSLAFQTY
. : .::
CCDS28 TISSVNIDILPAKGRDSVSDGFVQENQPRYLDASNELGGICSISQVEEEMLQDNTKSSAQ
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CCDS54 QEYKQAGKIFPENQIIEWFIQLLLGVDYMHERRILHRDLKSKNVFL-KNNLLKIGDFGVS
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. ...: . .. :.: : . .. ... .. :. . :: :
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440 450 460 470 480
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.:. :. . : :. : .:.. . ....: ..:
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CCDS30 MLKFQEAAKCVSGSTAISTYPKTLIARRYVLQQKLGSGSFGTVYLVSDKKAKRGEELKVL
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CCDS30 KEISVGELNPNETVQANLEAQLLSKLDHPAIVKFHASFVEQDNFCIITEYCEGRDLDDKI
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CCDS30 IVLKIVEGDTPSLPERYPKELNAIMESMLNKNPSLRPSAIEILKIPYLDEQLQNLMCRYS
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. ...: . .. :.: : . .. ... .. :. . :: :
CCDS30 DEDEERWQGREEESDEPTLENLPESQPIPSMDLHELESIVEDATSDLGYHEIPEDPLVAE
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440 450 460 470 480
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.:. :. . : :. : .:.. . ....: ..:
CCDS30 EYYADAFDSYCEES--DEEEEEIALERPEKEIRNEGSQPAYRTNQQDSDIEALARCLENV
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489 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]