Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0935
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0935, 418 aa
1>>>pF1KE0935 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0157+/-0.00196; mu= 10.3342+/- 0.116
mean_var=274.1960+/-53.684, 0's: 0 Z-trim(104.2): 992 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.077454
statistics sampled from 6714 (7794) to 6714 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 2974 346.7 2.4e-95
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 2962 345.4 6e-95
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 314) 2269 267.8 1.1e-71
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1853 221.6 1.3e-57
CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19 ( 517) 1791 214.7 1.7e-55
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 1634 197.2 3.2e-50
CCDS12496.1 ZNF790 gene_id:388536|Hs108|chr19 ( 636) 1612 194.8 1.9e-49
CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 ( 532) 1608 194.3 2.4e-49
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1527 185.3 1.4e-46
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 1520 184.7 2.8e-46
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1515 184.0 3.6e-46
CCDS59381.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 665) 1376 168.5 1.7e-41
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1348 165.4 1.5e-40
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1321 162.2 1.1e-39
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1316 161.8 1.8e-39
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 1308 160.6 2.7e-39
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 1303 160.2 4.6e-39
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 1278 157.2 2.6e-38
CCDS46042.1 ZNF302 gene_id:55900|Hs108|chr19 ( 399) 1277 157.1 2.8e-38
CCDS74330.1 ZNF302 gene_id:55900|Hs108|chr19 ( 443) 1276 157.0 3.2e-38
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1268 156.2 6.3e-38
CCDS33931.1 ZNF141 gene_id:7700|Hs108|chr4 ( 474) 1267 156.1 6.7e-38
CCDS74332.1 ZNF302 gene_id:55900|Hs108|chr19 ( 400) 1265 155.7 7.1e-38
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 1265 155.9 8.2e-38
CCDS77434.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 438) 1263 155.6 8.7e-38
CCDS42531.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 444) 1263 155.6 8.8e-38
CCDS42712.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 425) 1260 155.2 1.1e-37
CCDS55114.1 ZNF736 gene_id:728927|Hs108|chr7 ( 427) 1260 155.2 1.1e-37
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 1250 154.3 2.8e-37
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1243 153.5 4.6e-37
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1221 151.0 2.5e-36
CCDS78236.1 ZNF735 gene_id:730291|Hs108|chr7 ( 412) 1219 150.6 2.5e-36
CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 432) 1216 150.3 3.3e-36
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 1217 150.6 3.4e-36
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 1217 150.6 3.5e-36
CCDS59380.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 513) 1216 150.4 3.6e-36
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 1208 149.5 6.4e-36
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 1203 148.9 9.5e-36
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1201 149.3 1.8e-35
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1186 147.6 5.5e-35
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1186 147.6 5.6e-35
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1180 146.4 5.8e-35
CCDS12316.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19 ( 665) 1172 145.7 1.3e-34
CCDS33089.1 ZNF613 gene_id:79898|Hs108|chr19 ( 617) 1171 145.5 1.3e-34
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1171 145.6 1.4e-34
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1168 145.1 1.5e-34
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1166 145.0 1.9e-34
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1166 145.0 1.9e-34
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 1162 144.5 2.5e-34
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 1157 143.8 3.3e-34
>>CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 (418 aa)
initn: 2974 init1: 2974 opt: 2974 Z-score: 1825.4 bits: 346.7 E(32554): 2.4e-95
Smith-Waterman score: 2974; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSMGHSISKPNVISYLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSMGHSISKPNVISYLEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GKEPWLADRELTRGQWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQCSSFRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKEPWLADRELTRGQWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQCSSFRD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DWECNRQFKKELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DWECNRQFKKELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 HQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQRI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE0 HTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
370 380 390 400 410
>>CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 (419 aa)
initn: 2672 init1: 2672 opt: 2962 Z-score: 1818.1 bits: 345.4 E(32554): 6e-95
Smith-Waterman score: 2962; 99.8% identity (99.8% similar) in 419 aa overlap (1-418:1-419)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSM-GHSISKPNVISYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS46 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSMAGHSISKPNVISYLE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 QGKEPWLADRELTRGQWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQCSSFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QGKEPWLADRELTRGQWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQCSSFR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DDWECNRQFKKELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DDWECNRQFKKELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FRHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FRHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SDLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SDLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 QHQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QHQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 IHTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IHTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
370 380 390 400 410
>>CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 (314 aa)
initn: 2269 init1: 2269 opt: 2269 Z-score: 1400.8 bits: 267.8 E(32554): 1.1e-71
Smith-Waterman score: 2269; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (105-418:1-314)
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 QWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQCSSFRDDWECNRQFKKELGS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MEKLTRRDFQCSSFRDDWECNRQFKKELGS
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 QGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKTFRHGSQFATHEIIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKTFRHGSQFATHEIIHT
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 IEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICGSDLTRHHRIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICGSDLTRHHRIHTGEKP
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 YECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTQHQRIHTGEKPYECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTQHQRIHTGEKPYECK
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 ECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQRIHTGEKPYECKICGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQRIHTGEKPYECKICGK
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410
pF1KE0 AYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
280 290 300 310
>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 (475 aa)
initn: 3717 init1: 1380 opt: 1853 Z-score: 1147.8 bits: 221.6 E(32554): 1.3e-57
Smith-Waterman score: 1853; 65.2% identity (81.3% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-416)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSMGHSISKPNVISYLEQ
::. ::::::::.:::::::.::. :::::::::::::.:::::: ::.::: :::
CCDS12 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLYRDVMLENYGNLVSMGLYTPKPQVISLLEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GKEPWLADRELTRGQWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQCSSFRD
:::::.. :::::: ::: :::: : ::::.:::: : ::: ::.. .. ::: :
CCDS12 GKEPWMVGRELTRGLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEIELCQREIM-GLTKHGLEYSSFGD
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DWECNRQFKKELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKTF
: .. :.:: .:::.: .:: : .::. .. .::.::::.. . :. :.:
CCDS12 VLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEYMPTFIQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKAF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICGS
..::: :. :: :: :::::::: : :..:.: :::::.::::::::::.: :.:
CCDS12 SQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTQ
:..:.:::::.::::::::::::: ::. :::::::::::::: :::::...:.. :
CCDS12 YLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 HQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQRI
: :::::::::::::::.::.:::.:..:::::::::::::::: ::: ::: :: ::::
CCDS12 HARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE0 HTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
:::::::.:: ::::..::::: .:.:::..:::.: :::: :. . ::.::: ..
CCDS12 HTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHAGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDE
360 370 380 390 400 410
CCDS12 KPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK
420 430 440 450 460 470
>>CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19 (517 aa)
initn: 5571 init1: 1768 opt: 1791 Z-score: 1110.0 bits: 214.7 E(32554): 1.7e-55
Smith-Waterman score: 1791; 58.5% identity (81.3% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSMGHSISKPNVISYLEQ
:. : .: ::.. ::::::. : :::::::::::.::::::.: ..:::.:::.:::
CCDS33 MSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDLYRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GKEPWLADRELTRGQWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWEIMEKLTRRDFQCSSFRD
:::::...: .. : :::::: .::.:: :...::.:: ::::::.:: ..::::.:
CCDS33 GKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFPKQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DWECNRQFKKELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKTF
:::: :: .. :. ::.:... ::..::...: :.:. : :....: . .. :: :
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CCDS12 ISGSDHTQHQLIHTSEKFCGDKECGNTFLPDSEVIQYQTVHTVKKTYECKECGKSFSLRS
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CCDS33 EKEPWMVVRKETSRRYPDLELKYGPEKVSPENDTSEVNLPKQVIKQISTTLGIEAFYFRN
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CCDS33 DSE-YRQFEGLQGYQEGNINQKMISYEKLPTHTPHASL----ICNTHKPYEC--KECGKY
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CCDS33 FSRSANLIQHQSIHTGEKPFECKECGKAFRLHIQFTRHQKFHTGEKPFECNECGKAFSLL
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CCDS33 TLLNRHKNIHTGEKLFECKECGKSFNRSSNLVQHQSIHSGVKPYECKECGKGFNRGAHLI
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CCDS33 QHQKIHSNEKPFVCKECGMAFRYHYQLIEHCQIHTGEKPFECKECGKAFTLLTKLVRHQK
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CCDS33 IHTGEKPFECRECGKAFSLLNQLNRHKNIHTGEKPFECKECGKSFNRSSNLVQHQSIHAG
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