Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0926
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0926, 359 aa
1>>>pF1KE0926 359 - 359 aa - 359 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4794+/-0.00111; mu= -7.1449+/- 0.065
mean_var=341.4471+/-78.721, 0's: 0 Z-trim(112.5): 696 B-trim: 548 in 1/52
Lambda= 0.069408
statistics sampled from 12409 (13262) to 12409 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.756), E-opt: 0.2 (0.407), width: 16
Scan time: 3.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14373.1 KLF8 gene_id:11279|Hs108|chrX ( 359) 2397 253.7 1.8e-67
CCDS55428.1 KLF8 gene_id:11279|Hs108|chrX ( 257) 1631 176.8 1.8e-44
CCDS3444.1 KLF3 gene_id:51274|Hs108|chr4 ( 345) 665 80.2 2.9e-15
CCDS9449.1 KLF12 gene_id:11278|Hs108|chr13 ( 402) 605 74.3 2.1e-13
CCDS66562.1 KLF5 gene_id:688|Hs108|chr13 ( 366) 591 72.8 5.1e-13
CCDS9448.1 KLF5 gene_id:688|Hs108|chr13 ( 457) 591 72.9 6e-13
CCDS6770.2 KLF4 gene_id:9314|Hs108|chr9 ( 479) 564 70.2 4e-12
CCDS7060.1 KLF6 gene_id:1316|Hs108|chr10 ( 283) 546 68.2 9.6e-12
CCDS12343.1 KLF2 gene_id:10365|Hs108|chr19 ( 355) 547 68.4 1.1e-11
CCDS59440.1 KLF7 gene_id:8609|Hs108|chr2 ( 269) 537 67.3 1.7e-11
CCDS59438.1 KLF7 gene_id:8609|Hs108|chr2 ( 274) 537 67.3 1.7e-11
CCDS2373.1 KLF7 gene_id:8609|Hs108|chr2 ( 302) 537 67.4 1.9e-11
CCDS12285.1 KLF1 gene_id:10661|Hs108|chr19 ( 362) 516 65.3 9.2e-11
>>CCDS14373.1 KLF8 gene_id:11279|Hs108|chrX (359 aa)
initn: 2397 init1: 2397 opt: 2397 Z-score: 1324.7 bits: 253.7 E(32554): 1.8e-67
Smith-Waterman score: 2397; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVDMDKLINNLEVQLNSEGGSMQVFKQVTASVRNRDPPEIEYRSNMTSPTLLDANPMENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVDMDKLINNLEVQLNSEGGSMQVFKQVTASVRNRDPPEIEYRSNMTSPTLLDANPMENP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ALFNDIKIEPPEELLASDFSLPQVEPVDLSFHKPKAPLQPASMLQAPIRPPKPQSSPQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALFNDIKIEPPEELLASDFSLPQVEPVDLSFHKPKAPLQPASMLQAPIRPPKPQSSPQTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VVSTSTSDMSTSANIPTVLTPGSVLTSSQSTGSQQILHVIHTIPSVSLPNKMGGLKTIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VVSTSTSDMSTSANIPTVLTPGSVLTSSQSTGSQQILHVIHTIPSVSLPNKMGGLKTIPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VVQSLPMVYTTLPADGGPAAITVPLIGGDGKNAGSVKVDPTSMSPLEIPSDSEESTIESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VVQSLPMVYTTLPADGGPAAITVPLIGGDGKNAGSVKVDPTSMSPLEIPSDSEESTIESG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SSALQSLQGLQQEPAAMAQMQGEESLDLKRRRIHQCDFAGCSKVYTKSSHLKAHRRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSALQSLQGLQQEPAAMAQMQGEESLDLKRRRIHQCDFAGCSKVYTKSSHLKAHRRIHTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE0 EKPYKCTWDGCSWKFARSDELTRHFRKHTGIKPFRCTDCNRSFSRSDHLSLHRRRHDTM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EKPYKCTWDGCSWKFARSDELTRHFRKHTGIKPFRCTDCNRSFSRSDHLSLHRRRHDTM
310 320 330 340 350
>>CCDS55428.1 KLF8 gene_id:11279|Hs108|chrX (257 aa)
initn: 1631 init1: 1631 opt: 1631 Z-score: 912.1 bits: 176.8 E(32554): 1.8e-44
Smith-Waterman score: 1631; 98.8% identity (99.2% similar) in 257 aa overlap (1-257:1-257)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVDMDKLINNLEVQLNSEGGSMQVFKQVTASVRNRDPPEIEYRSNMTSPTLLDANPMENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MVDMDKLINNLEVQLNSEGGSMQVFKQVTASVRNRDPPEIEYRSNMTSPTLLDANPMENP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ALFNDIKIEPPEELLASDFSLPQVEPVDLSFHKPKAPLQPASMLQAPIRPPKPQSSPQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALFNDIKIEPPEELLASDFSLPQVEPVDLSFHKPKAPLQPASMLQAPIRPPKPQSSPQTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VVSTSTSDMSTSANIPTVLTPGSVLTSSQSTGSQQILHVIHTIPSVSLPNKMGGLKTIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVSTSTSDMSTSANIPTVLTPGSVLTSSQSTGSQQILHVIHTIPSVSLPNKMGGLKTIPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VVQSLPMVYTTLPADGGPAAITVPLIGGDGKNAGSVKVDPTSMSPLEIPSDSEESTIESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVQSLPMVYTTLPADGGPAAITVPLIGGDGKNAGSVKVDPTSMSPLEIPSDSEESTIESG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SSALQSLQGLQQEPAAMAQMQGEESLDLKRRRIHQCDFAGCSKVYTKSSHLKAHRRIHTG
::::::::::::: :.
CCDS55 SSALQSLQGLQQEREAL
250
>>CCDS3444.1 KLF3 gene_id:51274|Hs108|chr4 (345 aa)
initn: 692 init1: 586 opt: 665 Z-score: 387.6 bits: 80.2 E(32554): 2.9e-15
Smith-Waterman score: 696; 38.3% identity (59.5% similar) in 368 aa overlap (22-356:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVDMDKLINNLEVQLNSEGGSMQVFKQVTASVRNRDPPEIEYRSNMTSPTLLDANPMENP
: .: : .. . :: . : ::. .:
CCDS34 MLMFDPVPVKQEAMDPVSVSYPSNYMESM--------KP
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 ALFNDIKIEP-PEELLASDFSLP---QVEPVDLSFHKPKAPLQPASMLQAPIRPPKPQSS
.. : : ::... . .: :.:::::. .: ..: :. .:
CCDS34 NKYGVIYSTPLPEKFFQTPEGLSHGIQMEPVDLTVNKRSSP-------------PSAGNS
40 50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PQTLVVSTSTSDMSTSANIPTVLTPGSVLTSSQSTGSQQILHVIHTIPSVSLP--NKMG-
:..: .: : . ..:. : . : . . : . : ..: : .. :
CCDS34 PSSLKFPSSHRRASPGLSMPSSSPP--IKKYSPPSPGVQPFGVPLSMPPVMAAALSRHGI
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210
pF1KE0 ---GLKTI--PVVVQSLPMVYTT---LP--------ADGGPAAITVPLIGGDGK--NAGS
:. . ::::: .:..::. : ... ... ::.: . : . .
CCDS34 RSPGILPVIQPVVVQPVPFMYTSHLQQPLMVSLSEEMENSSSSMQVPVIESYEKPISQKK
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260
pF1KE0 VKVDPTSMSPLEIPSDSEESTIESGSSALQSLQGLQQE--PAAMAQMQGE-----ESLDL
.:..: .. : . :: . .: .. :.: :: :....: :. :: :
CCDS34 IKIEP-GIEPQRTDYYPEEMSPPLMNS-VSPPQALLQENHPSVIVQ-PGKRPLPVESPDT
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 KR-RRIHQCDFAGCSKVYTKSSHLKAHRRIHTGEKPYKCTWDGCSWKFARSDELTRHFRK
.: ::::.::. ::.:::::::::::::: :::::::::::.::.:::::::::::::::
CCDS34 QRKRRIHRCDYDGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGEKPYKCTWEGCTWKFARSDELTRHFRK
260 270 280 290 300 310
330 340 350
pF1KE0 HTGIKPFRCTDCNRSFSRSDHLSLHRRRHDTM
:::::::.: ::.:::::::::.:::.::
CCDS34 HTGIKPFQCPDCDRSFSRSDHLALHRKRHMLV
320 330 340
>>CCDS9449.1 KLF12 gene_id:11278|Hs108|chr13 (402 aa)
initn: 989 init1: 605 opt: 605 Z-score: 354.3 bits: 74.3 E(32554): 2.1e-13
Smith-Waterman score: 981; 44.4% identity (70.7% similar) in 365 aa overlap (44-356:38-399)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 QLNSEGGSMQVFKQVTASVRNRDPPEIEYRSNMTSPTLLDANPMEN-PALFNDIKIEPPE
:.. ::.. . :: : :.:..: ::::
CCDS94 KTIKNINTFENRMLMLDGMPAVRVKTELLESEQGSPNVHNYPDMEAVPLLLNNVKGEPPE
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120
pF1KE0 ELLASDFSLPQVEPVDLSFHKPKAPLQPASMLQAPIRPPKPQSSPQTLVVSTSTSD----
. :. : :.::::::..: .. .:... ..:. :::.. .:.:.:.
CCDS94 DSLSVDHFQTQTEPVDLSINKART--SPTAVSSSPVSMTASASSPSSTSTSSSSSSRLAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 -------MSTSANIPTVLTPGSVLTSSQSTGSQQILHVIHTIPSVS----LPNKMGGLKT
.:.... :::::: ...:....:.::.::.:: .: : ::.. ..
CCDS94 SPTVITSVSSASSSSTVLTPGPLVASASGVGGQQFLHIIHPVPPSSPMNLQSNKLSHVHR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IPVVVQSLPMVYTTLPADGG-PAAITVPLIGGDGKNAGSVKVDPTSMSPLEIPSDSEE--
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CCDS94 IPVVVQSVPVVYTAVRSPGNVNNTIVVPLLE-DGRGHGKAQMDPRGLSPRQSKSDSDDDD
190 200 210 220 230 240
240 250 260
pF1KE0 -------STIESGSSALQSLQGLQQ-EPAAMAQMQGE-----------------------
:. :.::.::. ...:. .:. .....:.
CCDS94 LPNVTLDSVNETGSTALSIARAVQEVHPSPVSRVRGNRMNNQKFPCSISPFSIESTRRQR
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 --ESLDLKRRRIHQCDFAGCSKVYTKSSHLKAHRRIHTGEKPYKCTWDGCSWKFARSDEL
:: : ..::::.::: ::.:::::::::::::: :::::::::::.::.:::::::::
CCDS94 RSESPDSRKRRIHRCDFEGCNKVYTKSSHLKAHRRTHTGEKPYKCTWEGCTWKFARSDEL
310 320 330 340 350 360
330 340 350
pF1KE0 TRHFRKHTGIKPFRCTDCNRSFSRSDHLSLHRRRHDTM
:::.:::::.:::.:.::.:::::::::.::::::
CCDS94 TRHYRKHTGVKPFKCADCDRSFSRSDHLALHRRRHMLV
370 380 390 400
>>CCDS66562.1 KLF5 gene_id:688|Hs108|chr13 (366 aa)
initn: 591 init1: 555 opt: 591 Z-score: 347.2 bits: 72.8 E(32554): 5.1e-13
Smith-Waterman score: 600; 35.3% identity (59.1% similar) in 320 aa overlap (42-356:60-364)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 EVQLNSEGGSMQVFKQVTASVRNRDPPEIEYRSNMTSPTLLDANPMENPALFNDIKIEPP
:.:. : . ..:. . .. ::
CCDS66 DQFFTDTEGLPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQRPCVTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPP
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 EELLASDFSLPQVEPVDLSFHKPKAPLQPASMLQAPIRPPKPQSSPQTLVVSTSTSDMST
: .::. . .: :. :: ... . : :. : : :. . .
CCDS66 ----APTQALPEFTSI-FSSHQTAAPEVNNIFIKQEL--PTPDLH---LSVPTQQGHLYQ
90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 SANIPTVLTPGSVLTSSQSTGSQQILHVIHTIPSVSLPNKMGGLKTIPVV-VQSLPMVYT
: : . : .:...:.... :.: . ..: .. ... : :..:
CCDS66 LLNTPDLDMP----SSTNQTAAMDTLNVSMSAAMAGLNTHTSAVPQTAVKQFQGMPPCTY
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240
pF1KE0 TLPADGGPAAITVPLIGGDGKNAGSVKVDPTSMSPLEIPSDSEESTIESG----SSALQS
:.:.. : : . ... :: . .. : : : .:: : . : .
CCDS66 TMPSQFLPQQATYFPPSPPSSEPGSPDRQAEMLQNLT-PPPSYAATIASKLAIHNPNLPT
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LQGLQQEPAAMAQMQGEESLDLKRRRIHQCDFAGCSKVYTKSSHLKAHRRIHTGEKPYKC
.... .... . . ::..:::: ::. ::.:::::::::::: : :::::::::
CCDS66 TLPVNSQNIQPVRYNRRSNPDLEKRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYKC
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350
pF1KE0 TWDGCSWKFARSDELTRHFRKHTGIKPFRCTDCNRSFSRSDHLSLHRRRHDTM
::.::.:.::::::::::.::::: :::.: :::::::::::.:: .::
CCDS66 TWEGCDWRFARSDELTRHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN
320 330 340 350 360
>>CCDS9448.1 KLF5 gene_id:688|Hs108|chr13 (457 aa)
initn: 591 init1: 555 opt: 591 Z-score: 346.0 bits: 72.9 E(32554): 6e-13
Smith-Waterman score: 600; 35.3% identity (59.1% similar) in 320 aa overlap (42-356:151-455)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 EVQLNSEGGSMQVFKQVTASVRNRDPPEIEYRSNMTSPTLLDANPMENPALFNDIKIEPP
:.:. : . ..:. . .. ::
CCDS94 DQFFTDTEGLPYSINMNVFLPDITHLRTGLYKSQRPCVTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPP
130 140 150 160 170 180
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 EELLASDFSLPQVEPVDLSFHKPKAPLQPASMLQAPIRPPKPQSSPQTLVVSTSTSDMST
: .::. . .: :. :: ... . : :. : : :. . .
CCDS94 ----APTQALPEFTSI-FSSHQTAAPEVNNIFIKQEL--PTPDLH---LSVPTQQGHLYQ
190 200 210 220 230
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 SANIPTVLTPGSVLTSSQSTGSQQILHVIHTIPSVSLPNKMGGLKTIPVV-VQSLPMVYT
: : . : .:...:.... :.: . ..: .. ... : :..:
CCDS94 LLNTPDLDMP----SSTNQTAAMDTLNVSMSAAMAGLNTHTSAVPQTAVKQFQGMPPCTY
240 250 260 270 280
200 210 220 230 240
pF1KE0 TLPADGGPAAITVPLIGGDGKNAGSVKVDPTSMSPLEIPSDSEESTIESG----SSALQS
:.:.. : : . ... :: . .. : : : .:: : . : .
CCDS94 TMPSQFLPQQATYFPPSPPSSEPGSPDRQAEMLQNLT-PPPSYAATIASKLAIHNPNLPT
290 300 310 320 330 340
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LQGLQQEPAAMAQMQGEESLDLKRRRIHQCDFAGCSKVYTKSSHLKAHRRIHTGEKPYKC
.... .... . . ::..:::: ::. ::.:::::::::::: : :::::::::
CCDS94 TLPVNSQNIQPVRYNRRSNPDLEKRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYKC
350 360 370 380 390 400
310 320 330 340 350
pF1KE0 TWDGCSWKFARSDELTRHFRKHTGIKPFRCTDCNRSFSRSDHLSLHRRRHDTM
::.::.:.::::::::::.::::: :::.: :::::::::::.:: .::
CCDS94 TWEGCDWRFARSDELTRHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLALHMKRHQN
410 420 430 440 450
>>CCDS6770.2 KLF4 gene_id:9314|Hs108|chr9 (479 aa)
initn: 535 init1: 513 opt: 564 Z-score: 331.1 bits: 70.2 E(32554): 4e-12
Smith-Waterman score: 590; 36.1% identity (57.0% similar) in 321 aa overlap (54-356:178-478)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 VFKQVTASVRNRDPPEIEYRSNMTSPTLLDANPMENPALFNDIKIEPPEELLASDFSLPQ
: : : . ::. : ..... :.
CCDS67 CSFTYPIRAGNDPGVAPGGTGGGLLYGRESAPPPTAPFNLADINDVSPSGGFVAELLRPE
150 160 170 180 190 200
90 100 110 120 130
pF1KE0 VEPVDLSFHKPKAP---LQPASMLQAPIRPPKPQ-SSPQTLVVSTSTSDMSTSANI----
..:: . ..:. : :. .:.: . : . .::... :: .. : : . .
CCDS67 LDPVYIPPQQPQPPGGGLMGKFVLKASLSAPGSEYGSPSVISVSKGSPDGSHPVVVAPYN
210 220 230 240 250 260
140 150 160 170 180
pF1KE0 --PTVLTPG---SVLTSSQSTGSQQILHVIHTIPSVSLP-NKMGGLKTIPVVVQSLPMVY
: : ...: :. : : . ..: ... .: :.. .: :
CCDS67 GGPPRTCPKIKQEAVSSCTHLGAGPPLSNGHRPAAHDFPLGRQLPSRTTPTL--GLEEVL
270 280 290 300 310 320
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TTLPADGGPAAITVPLIGG----DGKNAGSVKVDPTSMSPLEIPSDSEESTIESGSSALQ
.. : :: .:: : : : : : .:.: ..: . . ::
CCDS67 SS--RDCHPA---LPLPPGFHPHPGPNYPSFL--PDQMQP-QVPPLHYQELMPPGSC---
330 340 350 360 370
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SLQGLQQEPAAMAQMQGEESLDLKRRRIHQCDFAGCSKVYTKSSHLKAHRRIHTGEKPYK
. .:: .:..: :: : ::.:::.:.:::::::::: : :::::::.
CCDS67 ----MPEEPKPK---RGRRSWPRKRTATHTCDYAGCGKTYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYH
380 390 400 410 420
310 320 330 340 350
pF1KE0 CTWDGCSWKFARSDELTRHFRKHTGIKPFRCTDCNRSFSRSDHLSLHRRRHDTM
: ::::.::::::::::::.::::: .::.: :.:.:::::::.:: .::
CCDS67 CDWDGCGWKFARSDELTRHYRKHTGHRPFQCQKCDRAFSRSDHLALHMKRHF
430 440 450 460 470
>>CCDS7060.1 KLF6 gene_id:1316|Hs108|chr10 (283 aa)
initn: 559 init1: 537 opt: 546 Z-score: 324.3 bits: 68.2 E(32554): 9.6e-12
Smith-Waterman score: 548; 58.3% identity (75.8% similar) in 132 aa overlap (225-356:166-282)
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 DGGPAAITVPLIGGDGKNAGSVKVDPTSMSPLEIPSDSEESTIESGSSALQSLQGLQQEP
: :.:: .. ..::.:. . .:
CCDS70 SSGKLSSSVTSTPPSSPELSREPSQLWGCVPGELPSPGK---VRSGTSGKPGDKG-----
140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 AAMAQMQGEESLDLKRRRIHQCDFAGCSKVYTKSSHLKAHRRIHTGEKPYKCTWDGCSWK
.:. : : :::.:.: : :: ::::::::::::.: :::::::.:.:.:: :.
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:::::::::::::::: :::.:. :.: :::::::.:: .::
CCDS70 FARSDELTRHFRKHTGAKPFKCSHCDRCFSRSDHLALHMKRHL
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: : :: . : :: : :.: .::
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. :.. :.: . :.... . : . . .
CCDS12 ELLRPELDAPLGPALHGRFLLAPPGRLVKAEPPEADGGGGYGCAPGLTRGPRGLKREGAP
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:..: :: : . : : . ::: : : : : .:: : .: . ..
CCDS12 GPAASCMRGPGGRPPPPPDTPPLSPDGPARLPAPG-PRASFPPPFGGPGFGAPGPGLHYA
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: . . . .:. .. : : . .:: ::. .. .:..: ::
CCDS12 PPAPPAFGLFDDAAAAAAALGL-APPAARGLLTPPASPLELLEAKPKRGRRSWPRKRTAT
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: :..:::.:.:::::::::: : :::::::.:.::::.::::::::::::.::::: .:
CCDS12 HTCSYAGCGKTYTKSSHLKAHLRTHTGEKPYHCNWDGCGWKFARSDELTRHYRKHTGHRP
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:.: :.:.:::::::.:: .::
CCDS12 FQCHLCDRAFSRSDHLALHMKRHM
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>>CCDS59440.1 KLF7 gene_id:8609|Hs108|chr2 (269 aa)
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: :.: .: .. .: :. .. :..
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:.. : . . : . :: : : ..:. :.. : : .:::: .. .
CCDS59 PSS-------PELSRHLVKTSQTLSAVDG--TVTLKLVAK--KAALSSVKVGGVATAAAA
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:::::::.: :::::::::.:.:: :.::::::::::.::::: :::.:. :.: :::::
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CCDS59 HLALHMKRHI
260
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]