Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0919
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0919, 305 aa
1>>>pF1KE0919 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2888+/-0.000874; mu= 5.3848+/- 0.053
mean_var=201.6619+/-41.622, 0's: 0 Z-trim(114.8): 10 B-trim: 385 in 1/52
Lambda= 0.090316
statistics sampled from 15333 (15342) to 15333 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.78), E-opt: 0.2 (0.471), width: 16
Scan time: 2.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41737.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 ( 305) 2078 282.3 3.2e-76
CCDS31729.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 ( 434) 2078 282.4 4.1e-76
CCDS31730.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 ( 391) 1881 256.7 2e-68
CCDS7810.2 TEAD1 gene_id:7003|Hs108|chr11 ( 426) 1529 210.9 1.4e-54
CCDS47414.1 TEAD3 gene_id:7005|Hs108|chr6 ( 435) 1396 193.6 2.3e-49
CCDS58670.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 319) 687 101.1 1.2e-21
CCDS58671.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 450) 687 101.2 1.5e-21
CCDS12761.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 447) 675 99.6 4.5e-21
CCDS59406.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 451) 675 99.6 4.5e-21
>>CCDS41737.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 (305 aa)
initn: 2078 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 1482.0 bits: 282.3 E(32554): 3.2e-76
Smith-Waterman score: 2078; 100.0% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAVSGFWQGALPGQAGTSHDVKPFSQQTYAVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAVSGFWQGALPGQAGTSHDVKPFSQQTYAVQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PLPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPPWQGRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PLPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPPWQGRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 IGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLNTNIEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLNTNIEDE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GSSFYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSSFYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIY
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RLVKE
:::::
CCDS41 RLVKE
>>CCDS31729.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 (434 aa)
initn: 2078 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 1479.9 bits: 282.4 E(32554): 4.1e-76
Smith-Waterman score: 2078; 100.0% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:130-434)
10 20 30
pF1KE0 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHIQVLARRKAREIQAKLKDQAAKDKALQSMAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAV
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 SGFWQGALPGQAGTSHDVKPFSQQTYAVQPPLPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPPWQGRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SGFWQGALPGQAGTSHDVKPFSQQTYAVQPPLPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPPWQGRSV
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 ASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKG
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGK
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 QVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVV
340 350 360 370 380 390
280 290 300
pF1KE0 TNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
400 410 420 430
>>CCDS31730.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 (391 aa)
initn: 1879 init1: 1879 opt: 1881 Z-score: 1341.8 bits: 256.7 E(32554): 2e-68
Smith-Waterman score: 1881; 96.9% identity (97.2% similar) in 287 aa overlap (21-305:105-391)
10 20 30 40
pF1KE0 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRP--AVSGFWQGALPGQAGTSHDV
::: .: : ::::::::::::::::
CCDS31 YGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKAREIQAKLKFWQGALPGQAGTSHDV
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KPFSQQTYAVQPPLPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPPWQGRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KPFSQQTYAVQPPLPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPPWQGRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQ
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 DPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVK
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 FWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHY
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 SYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEV
320 330 340 350 360 370
290 300
pF1KE0 SASEHGAQHHIYRLVKE
:::::::::::::::::
CCDS31 SASEHGAQHHIYRLVKE
380 390
>>CCDS7810.2 TEAD1 gene_id:7003|Hs108|chr11 (426 aa)
initn: 1498 init1: 1349 opt: 1529 Z-score: 1093.4 bits: 210.9 E(32554): 1.4e-54
Smith-Waterman score: 1529; 73.0% identity (88.1% similar) in 311 aa overlap (1-305:122-426)
10 20
pF1KE0 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARG---PGR
:::::::::.::::.:....: : :
CCDS78 SHIQVLARRKSRDFHSKLKDQTAKDKALQHMAAMSSAQIVSATAIHNKLGLP-GIPRPTF
100 110 120 130 140 150
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 PAVSGFWQGALP-GQAGTSHDVKPFSQQTYAVQPPL--PLPGFESPAGPAPSPSAPPAPP
:.. ::: : . :: :.:.::::: ::.: .:: . :.:::: ..:::: .:
CCDS78 PGAPGFWPGMIQTGQPGSSQDVKPFVQQAYPIQPAVTAPIPGFEPASAPAPS-----VPA
160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 WQGRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDK
:::::....:: ..:::::::::.:::.::::::::::... ::::: ::.:::::::::
CCDS78 WQGRSIGTTKLRLVEFSAFLEQQRDPDSYNKHLFVHIGHANHSYSDPLLESVDIRQIYDK
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 FPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCSTK
:::::::::.:: .::.::::::::::::: ::.:....::::.::::: ::: .:::::
CCDS78 FPEKKGGLKELFGKGPQNAFFLVKFWADLNCNIQDDAGAFYGVTSQYESSENMTVTCSTK
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 VCSFGKQVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENF
::::::::::::::::::.:::.. :::.:::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VCSFGKQVVEKVETEYARFENGRFVYRINRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENF
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300
pF1KE0 TILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
::: :::::::::::::.: ::::: ::::::::::::::.
CCDS78 TILLVVTNRDTQETLLCMACVFEVSNSEHGAQHHIYRLVKD
390 400 410 420
>>CCDS47414.1 TEAD3 gene_id:7005|Hs108|chr6 (435 aa)
initn: 1384 init1: 1273 opt: 1396 Z-score: 999.7 bits: 193.6 E(32554): 2.3e-49
Smith-Waterman score: 1396; 67.4% identity (85.9% similar) in 313 aa overlap (1-305:126-435)
10 20 30
pF1KE0 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAV
::.::::::.::........ .: ::
CCDS47 VLARKKVREYQVGIKAMNLDQVSKDKALQSMASMSSAQIVSASVLQNKFS-PPSPLPQAV
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80
pF1KE0 ----SGFWQGA--LPGQAGTSHDVKPFSQQTYAVQPPLP--LPGFESPAGPAPSPSAPPA
: ::.. : : : :.:.:::.: .: .::::: : ..: : .: :: .: .
CCDS47 FSTSSRFWSSPPLLGQQPGPSQDIKPFAQPAYPIQPPLPPTLSSYE-PLAPLPSAAAS-V
160 170 180 190 200 210
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 PPWQGRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIY
: :: :..:::.: .::.:::.: :.:::::.:::::::::..:..::: :::::.::::
CCDS47 PVWQDRTIASSRLRLLEYSAFMEVQRDPDTYSKHLFVHIGQTNPAFSDPPLEAVDVRQIY
220 230 240 250 260 270
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 DKFPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCS
:::::::::::.:.:.:: :::::::::::::..:.. ..:::::::: : ..: :. :
CCDS47 DKFPEKKGGLKELYEKGPPNAFFLVKFWADLNSTIQEGPGAFYGVSSQYSSADSMTISVS
280 290 300 310 320 330
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 TKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLE
:::::::::::::::::::: :::.. :::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TKVCSFGKQVVEKVETEYARLENGRFVYRIHRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLE
340 350 360 370 380 390
270 280 290 300
pF1KE0 NFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
:::::::::.::.::::: ::.:::::.::::::::.:.:::.
CCDS47 NFTILQVVTSRDSQETLLVIAFVFEVSTSEHGAQHHVYKLVKD
400 410 420 430
>>CCDS58670.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 1132 init1: 655 opt: 687 Z-score: 502.2 bits: 101.1 E(32554): 1.2e-21
Smith-Waterman score: 1224; 59.0% identity (78.4% similar) in 324 aa overlap (1-305:1-319)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAVSG------FWQGALPGQAGTSHDVKPFSQQ
::.:::::.::: ...... :: : : ::.:. : . :::::::
CCDS58 MATMSSAQLISAPSLQAKL----GPTGPQVVQASELFQFWSGG-SGPPWNVPDVKPFSQT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 --TYAVQPP-LPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPP-WQGRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDP
: .. :: :::.: : . .: : :.:: ::.:......: ..:::::.: .
CCDS58 PFTLSLTPPSTDLPGYEPPQALSPLPPPTPSPPAWQARGLGTARLQLVEFSAFVEPPDAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 DTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFW
:.:..::::::.: :: . : ::.::.::::::::::::::..:..::: .::::::::
CCDS58 DSYQRHLFVHISQHCPSPGAPPLESVDVRQIYDKFPEKKGGLRELYDRGPPHAFFLVKFW
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE0 ADLN--TNIEDEGSS-------FYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEKVETEYA
:::: . :. :.. :::::::::: :.: .:::.:::::::::::::::: :
CCDS58 ADLNWGPSGEEAGAGGSISSGGFYGVSSQYESLEHMTLTCSSKVCSFGKQVVEKVETERA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 RYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQETLLC
. :.:.. ::. :::.:::..::.:::..:::.::::::::::::::::::::::: :::
CCDS58 QLEDGRFVYRLLRSPMCEYLVNFLHKLRQLPERYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQELLLC
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE0 IAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
:::::::.::.::::::::::..
CCDS58 TAYVFEVSTSERGAQHHIYRLVRD
300 310
>>CCDS58671.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 (450 aa)
initn: 1132 init1: 655 opt: 687 Z-score: 500.2 bits: 101.2 E(32554): 1.5e-21
Smith-Waterman score: 1224; 59.0% identity (78.4% similar) in 324 aa overlap (1-305:132-450)
10 20 30
pF1KE0 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAV
::.:::::.::: ...... :: : :
CCDS58 SHIQVLARRKSREIQSKLKDQVSKDKAFQTMATMSSAQLISAPSLQAKL----GPTGPQV
110 120 130 140 150
40 50 60 70 80
pF1KE0 SG------FWQGALPGQAGTSHDVKPFSQQ--TYAVQPP-LPLPGFESPAGPAPSPSAPP
::.:. : . ::::::: : .. :: :::.: : . .: : :
CCDS58 VQASELFQFWSGG-SGPPWNVPDVKPFSQTPFTLSLTPPSTDLPGYEPPQALSPLPPPTP
160 170 180 190 200 210
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 APP-WQGRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQ
.:: ::.:......: ..:::::.: . :.:..::::::.: :: . : ::.::.::
CCDS58 SPPAWQARGLGTARLQLVEFSAFVEPPDAVDSYQRHLFVHISQHCPSPGAPPLESVDVRQ
220 230 240 250 260 270
150 160 170 180 190
pF1KE0 IYDKFPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLN--TNIEDEGSS-------FYGVSSQY
::::::::::::..:..::: .:::::::::::: . :. :.. ::::::::
CCDS58 IYDKFPEKKGGLRELYDRGPPHAFFLVKFWADLNWGPSGEEAGAGGSISSGGFYGVSSQY
280 290 300 310 320 330
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 ESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHL
:: :.: .:::.:::::::::::::::: :. :.:.. ::. :::.:::..::.:::..:
CCDS58 ESLEHMTLTCSSKVCSFGKQVVEKVETERAQLEDGRFVYRLLRSPMCEYLVNFLHKLRQL
340 350 360 370 380 390
260 270 280 290 300
pF1KE0 PEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
::.::::::::::::::::::::::: ::: :::::::.::.::::::::::..
CCDS58 PERYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQELLLCTAYVFEVSTSERGAQHHIYRLVRD
400 410 420 430 440 450
>>CCDS12761.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 (447 aa)
initn: 1132 init1: 655 opt: 675 Z-score: 491.8 bits: 99.6 E(32554): 4.5e-21
Smith-Waterman score: 1235; 59.4% identity (79.9% similar) in 318 aa overlap (1-305:132-447)
10 20 30
pF1KE0 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAV
::.:::::.::: ....... :: .
CCDS12 SHIQVLARRKSREIQSKLKDQVSKDKAFQTMATMSSAQLISAPSLQAKLG-PTGPQASEL
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80
pF1KE0 SGFWQGALPGQAGTSHDVKPFSQQ--TYAVQPP-LPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPP-WQ
::.:. : . ::::::: : .. :: :::.: : . .: : :.:: ::
CCDS12 FQFWSGG-SGPPWNVPDVKPFSQTPFTLSLTPPSTDLPGYEPPQALSPLPPPTPSPPAWQ
170 180 190 200 210
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 GRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFP
.:......: ..:::::.: . :.:..::::::.: :: . : ::.::.::::::::
CCDS12 ARGLGTARLQLVEFSAFVEPPDAVDSYQRHLFVHISQHCPSPGAPPLESVDVRQIYDKFP
220 230 240 250 260 270
150 160 170 180 190
pF1KE0 EKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLN--TNIEDEGSS-------FYGVSSQYESPENM
::::::..:..::: .:::::::::::: . :. :.. :::::::::: :.:
CCDS12 EKKGGLRELYDRGPPHAFFLVKFWADLNWGPSGEEAGAGGSISSGGFYGVSSQYESLEHM
280 290 300 310 320 330
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 IITCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMM
.:::.:::::::::::::::: :. :.:.. ::. :::.:::..::.:::..:::.:::
CCDS12 TLTCSSKVCSFGKQVVEKVETERAQLEDGRFVYRLLRSPMCEYLVNFLHKLRQLPERYMM
340 350 360 370 380 390
260 270 280 290 300
pF1KE0 NSVLENFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE
:::::::::::::::::::: ::: :::::::.::.::::::::::..
CCDS12 NSVLENFTILQVVTNRDTQELLLCTAYVFEVSTSERGAQHHIYRLVRD
400 410 420 430 440
>>CCDS59406.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 (451 aa)
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