Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0907
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0907, 217 aa
1>>>pF1KE0907 217 - 217 aa - 217 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3719+/-0.000649; mu= 13.2916+/- 0.040
mean_var=60.4442+/-11.924, 0's: 0 Z-trim(109.9): 18 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.164967
statistics sampled from 11210 (11225) to 11210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16
Scan time: 2.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34031.1 EIF4E gene_id:1977|Hs108|chr4 ( 217) 1498 364.4 3.2e-101
CCDS47109.1 EIF4E gene_id:1977|Hs108|chr4 ( 237) 1460 355.3 1.8e-98
CCDS82940.1 EIF4E gene_id:1977|Hs108|chr4 ( 245) 1460 355.3 1.9e-98
CCDS47345.1 EIF4E1B gene_id:253314|Hs108|chr5 ( 242) 1003 246.6 1e-65
CCDS54779.1 EIF4E gene_id:1977|Hs108|chr4 ( 248) 941 231.8 2.9e-61
CCDS63159.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 ( 234) 440 112.6 2.1e-25
CCDS2496.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 ( 245) 439 112.4 2.6e-25
CCDS63158.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 ( 236) 432 110.7 8e-25
CCDS74671.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 ( 189) 370 95.9 1.8e-20
CCDS82579.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 ( 200) 369 95.7 2.3e-20
CCDS46867.1 EIF4E3 gene_id:317649|Hs108|chr3 ( 224) 280 74.5 5.9e-14
>>CCDS34031.1 EIF4E gene_id:1977|Hs108|chr4 (217 aa)
initn: 1498 init1: 1498 opt: 1498 Z-score: 1930.8 bits: 364.4 E(32554): 3.2e-101
Smith-Waterman score: 1498; 100.0% identity (100.0% similar) in 217 aa overlap (1-217:1-217)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANL
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CCDS34 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIG
130 140 150 160 170 180
190 200 210
pF1KE0 RVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV
190 200 210
>>CCDS47109.1 EIF4E gene_id:1977|Hs108|chr4 (237 aa)
initn: 1460 init1: 1460 opt: 1460 Z-score: 1881.3 bits: 355.3 E(32554): 1.8e-98
Smith-Waterman score: 1460; 100.0% identity (100.0% similar) in 211 aa overlap (7-217:27-237)
10 20 30 40
pF1KE0 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLDLTSRGQVGTSRRMAEAACSAHFLETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQ
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 NRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 MWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE0 DKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV
190 200 210 220 230
>>CCDS82940.1 EIF4E gene_id:1977|Hs108|chr4 (245 aa)
initn: 1460 init1: 1460 opt: 1460 Z-score: 1881.1 bits: 355.3 E(32554): 1.9e-98
Smith-Waterman score: 1460; 100.0% identity (100.0% similar) in 211 aa overlap (7-217:35-245)
10 20 30
pF1KE0 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QNKKERKKMRAEDGENDAIKKQAESLRESQETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 HPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 GIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 RAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFV
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 V
:
CCDS82 V
>>CCDS47345.1 EIF4E1B gene_id:253314|Hs108|chr5 (242 aa)
initn: 1014 init1: 996 opt: 1003 Z-score: 1293.4 bits: 246.6 E(32554): 1e-65
Smith-Waterman score: 1003; 65.6% identity (85.6% similar) in 215 aa overlap (6-217:30-242)
10 20 30
pF1KE0 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIK
: .:: : : . ... ....: . .:
CCDS47 MLAVEVSEAEGGIREWEEEEKEEEAAERTPTGEKSPNSPRTLL-SLRGKARTGGPME-VK
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 ---HPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSL
:::::::::::::::.:..:: ::.:..: ::::::::::.::::.:.: ::::.:
CCDS47 LELHPLQNRWALWFFKNDRSRAWQDNLHLVTKVDTVEDFWALYSHIQLASKLSSGCDYAL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 FKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAV
:::::.::::: .::::::::..: ::::. .:::.:::::::::::::...: .:::::
CCDS47 FKDGIQPMWEDSRNKRGGRWLVSLAKQQRHIELDRLWLETLLCLIGESFEEHSREVCGAV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKN
::.:.::::::.:: : ::. .: :.:::::::::: :: .::::.::::::::.: .::
CCDS47 VNIRTKGDKIAVWTREAENQAGVLHVGRVYKERLGLSPKTIIGYQAHADTATKSNSLAKN
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RFVV
.:::
CCDS47 KFVV
240
>>CCDS54779.1 EIF4E gene_id:1977|Hs108|chr4 (248 aa)
initn: 1484 init1: 941 opt: 941 Z-score: 1213.5 bits: 231.8 E(32554): 2.9e-61
Smith-Waterman score: 1426; 87.5% identity (87.5% similar) in 248 aa overlap (1-217:1-248)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQ
70 80 90 100 110 120
130 140
pF1KE0 QRRSDLDRFWLET-------------------------------LLCLIGESFDDYSDDV
::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS54 QRRSDLDRFWLETRWDLAMLPRLVSNFWPQVILPLQPPKVLELQLLCLIGESFDDYSDDV
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 CGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGS
190 200 210 220 230 240
210
pF1KE0 TTKNRFVV
::::::::
CCDS54 TTKNRFVV
>>CCDS63159.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 (234 aa)
initn: 368 init1: 203 opt: 440 Z-score: 569.5 bits: 112.6 E(32554): 2.1e-25
Smith-Waterman score: 442; 33.8% identity (67.6% similar) in 207 aa overlap (18-213:29-229)
10 20 30 40
pF1KE0 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTE--SNQEVANPEHYI----KHPLQNRW
:.:::: .:: .. . . .:::: .
CCDS63 MNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKNQSSSKRKAVVPGPAEHPLQYNY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE0 ALWFFKND-----KSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGI
..:. . .:.... :.. :. : .::.:: .:.:. ..: :. :::.::
CCDS63 TFWYSRRTPGRPTSSQSYEQNIKQIGTFASVEQFWRFYSHMVRPGDLTGHSDFHLFKEGI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 EPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRA
.:::::. :: ::.:.: : :.. .: : . .: ..::.: ....:::::.::
CCDS63 KPMWEDDANKNGGKWIIRL----RKGLASRCWENLILAMLGEQFM-VGEEICGAVVSVRF
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 KGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV
. : :.::. .. ....: . .. :.:::. .. :..:.:. :..:. .:
CCDS63 QEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTHTDSI-KDNSSFRNTKITL
180 190 200 210 220 230
>>CCDS2496.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 (245 aa)
initn: 364 init1: 203 opt: 439 Z-score: 567.9 bits: 112.4 E(32554): 2.6e-25
Smith-Waterman score: 441; 32.9% identity (65.7% similar) in 210 aa overlap (18-216:29-233)
10 20 30 40
pF1KE0 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTE--SNQEVANPEHYI----KHPLQNRW
:.:::: .:: .. . . .:::: .
CCDS24 MNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKNQSSSKRKAVVPGPAEHPLQYNY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE0 ALWFFKND-----KSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGI
..:. . .:.... :.. :. : .::.:: .:.:. ..: :. :::.::
CCDS24 TFWYSRRTPGRPTSSQSYEQNIKQIGTFASVEQFWRFYSHMVRPGDLTGHSDFHLFKEGI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 EPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRA
.:::::. :: ::.:.: : :.. .: : . .: ..::.: ....:::::.::
CCDS24 KPMWEDDANKNGGKWIIRL----RKGLASRCWENLILAMLGEQFM-VGEEICGAVVSVRF
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 KGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV
. : :.::. .. ....: . .. :.:::. .. :..:.:. : .:..
CCDS24 QEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTHTDSIKMPGRLGPQRLLFQ
180 190 200 210 220 230
CCDS24 NLWKPRLNVP
240
>>CCDS63158.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 (236 aa)
initn: 364 init1: 203 opt: 432 Z-score: 559.1 bits: 110.7 E(32554): 8e-25
Smith-Waterman score: 434; 34.0% identity (67.5% similar) in 197 aa overlap (18-203:29-220)
10 20 30 40
pF1KE0 MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTE--SNQEVANPEHYI----KHPLQNRW
:.:::: .:: .. . . .:::: .
CCDS63 MNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKNQSSSKRKAVVPGPAEHPLQYNY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE0 ALWFFKND-----KSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGI
..:. . .:.... :.. :. : .::.:: .:.:. ..: :. :::.::
CCDS63 TFWYSRRTPGRPTSSQSYEQNIKQIGTFASVEQFWRFYSHMVRPGDLTGHSDFHLFKEGI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 EPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRA
.:::::. :: ::.:.: : :.. .: : . .: ..::.: ....:::::.::
CCDS63 KPMWEDDANKNGGKWIIRL----RKGLASRCWENLILAMLGEQFM-VGEEICGAVVSVRF
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 KGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV
. : :.::. .. ....: . .. :.:::. .. :..:.:.
CCDS63 QEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTHTDSIKAWEEFHGLVNSSG
180 190 200 210 220 230
CCDS63 R
>>CCDS74671.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 (189 aa)
initn: 370 init1: 203 opt: 370 Z-score: 480.9 bits: 95.9 E(32554): 1.8e-20
Smith-Waterman score: 370; 36.2% identity (68.7% similar) in 163 aa overlap (51-213:29-184)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 KTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQ
.: :: . . . :: ::.:: .:.:.
CCDS74 MNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKNQSSSK-RKVEQFWRFYSHMV
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 LSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGE
..: :. :::.::.:::::. :: ::.:.: : :.. .: : . .: ..::
CCDS74 RPGDLTGHSDFHLFKEGIKPMWEDDANKNGGKWIIRL----RKGLASRCWENLILAMLGE
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 SFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSH
.: ....:::::.:: . : :.::. .. ....: . .. :.:::. .. :..:
CCDS74 QFM-VGEEICGAVVSVRFQEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTH
120 130 140 150 160 170
210
pF1KE0 ADTATKSGSTTKNRFVV
.:. :..:. .:
CCDS74 TDSI-KDNSSFRNTKITL
180
>>CCDS82579.1 EIF4E2 gene_id:9470|Hs108|chr2 (200 aa)
initn: 348 init1: 203 opt: 369 Z-score: 479.2 bits: 95.7 E(32554): 2.3e-20
Smith-Waterman score: 369; 34.9% identity (66.3% similar) in 166 aa overlap (51-216:29-188)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 KTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQ
.: :: . . . :: ::.:: .:.:.
CCDS82 MNNKFDALKDDDSGDHDQNEENSTQKDGEKEKTERDKNQSSSK-RKVEQFWRFYSHMV
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 LSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGE
..: :. :::.::.:::::. :: ::.:.: : :.. .: : . .: ..::
CCDS82 RPGDLTGHSDFHLFKEGIKPMWEDDANKNGGKWIIRL----RKGLASRCWENLILAMLGE
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 SFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSH
.: ....:::::.:: . : :.::. .. ....: . .. :.:::. .. :..:
CCDS82 QFM-VGEEICGAVVSVRFQEDIISIWNKTASDQATTARIRDTLRRVLNLPPNTIMEYKTH
120 130 140 150 160 170
210
pF1KE0 ADTATKSGSTTKNRFVV
.:. : .:..
CCDS82 TDSIKMPGRLGPQRLLFQNLWKPRLNVP
180 190 200
217 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 04:26:18 2016 done: Sat Nov 5 04:26:18 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]