Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0813
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0813, 254 aa
1>>>pF1KE0813 254 - 254 aa - 254 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6095+/-0.00112; mu= 12.5194+/- 0.067
mean_var=76.0297+/-18.305, 0's: 0 Z-trim(102.9): 351 B-trim: 815 in 2/46
Lambda= 0.147090
statistics sampled from 6777 (7152) to 6777 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1010 224.1 8.8e-59
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 926 206.3 2.1e-53
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 924 205.9 2.8e-53
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 917 204.4 7.6e-53
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 917 204.4 7.7e-53
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 916 204.2 8.8e-53
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 914 203.8 1.2e-52
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 899 200.6 1.2e-51
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 892 199.1 3.1e-51
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 892 199.1 3.1e-51
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 876 195.7 3.2e-50
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 874 195.3 4.3e-50
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 872 194.8 5.8e-50
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 863 192.9 2.2e-49
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 862 192.8 2.8e-49
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 861 192.5 2.9e-49
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 860 192.3 3.8e-49
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 852 190.6 1.1e-48
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 849 190.0 1.7e-48
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 846 189.3 2.6e-48
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 843 188.7 4e-48
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 841 188.3 6e-48
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 836 187.2 1.1e-47
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 836 187.2 1.2e-47
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 835 187.0 1.3e-47
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 832 186.4 2.1e-47
CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 ( 322) 831 186.2 2.4e-47
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 826 185.1 5e-47
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 826 185.1 5e-47
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 823 184.5 8.2e-47
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 822 184.2 8.9e-47
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 821 184.0 1e-46
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 821 184.0 1e-46
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 819 183.6 1.4e-46
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 817 183.2 1.9e-46
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 816 183.0 2.2e-46
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 814 182.5 3e-46
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 813 182.3 3.5e-46
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 812 182.1 3.9e-46
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 811 181.9 4.5e-46
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 811 181.9 4.5e-46
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 809 181.5 6.1e-46
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 809 181.5 6.2e-46
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 802 180.0 1.7e-45
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 801 179.8 2e-45
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 800 179.6 2.3e-45
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 798 179.1 3e-45
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 796 178.7 4.1e-45
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 796 178.7 4.2e-45
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 795 178.5 4.7e-45
>>CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1030 init1: 1010 opt: 1010 Z-score: 1168.8 bits: 224.1 E(32554): 8.8e-59
Smith-Waterman score: 1010; 59.9% identity (86.6% similar) in 247 aa overlap (1-247:59-305)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLGNLSFCDICYSTVFAPKMLVNFLSK
:::.:. ::: : :::...:::::::.:
CCDS31 VVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTPMYFLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVV
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 HKSSTFSGCVLQSFPFAVYVTTKDILLSMMAYDHYVAIANPLLYTVIMAQKVCIQMVLAS
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CCDS31 KATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVMAYDRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGS
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGLINSLTHTIGLLKLDFCGPNIVNHYFCDVPPLLRLSCSDAHINEMLPLVFSGLIAM
..::..:.: :::.: .:.:: : :.:.:::.: ::.:::::. .::.: :.:::.:::
CCDS31 WIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSHFFCDIPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAM
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 FTFIVIMVSYICIIIAIQRIHAAEGRYKAFSTCVSHLTTVTLFYGSVSFSYIQPSSQYSL
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CCDS31 ATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGRQQAFSTCASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFV
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 EQEKVLAVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKDAAKRLIWWGKNPT
:::::...:::: ::::: ::.::::::::.:.:: :
CCDS31 EQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRNKDVKEAVKRAIEMKHFLC
270 280 290 300 310
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 958 init1: 926 opt: 926 Z-score: 1072.4 bits: 206.3 E(32554): 2.1e-53
Smith-Waterman score: 926; 49.6% identity (83.9% similar) in 248 aa overlap (1-248:65-312)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLGNLSFCDICYSTVFAPKMLVNFLSK
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CCDS31 ALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLCLHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAE
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 HKSSTFSGCVLQSFPFAVYVTTKDILLSMMAYDHYVAIANPLLYTVIMAQKVCIQMVLAS
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CCDS31 NKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFLLAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGLINSLTHTIGLLKLDFCGPNIVNHYFCDVPPLLRLSCSDAHINEMLPLVFSGLIAM
.:.: :. :: ..:.::: : .::..::.::::.:::::.:.: .. ..::..:..
CCDS31 FLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRINHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVI
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 FTFIVIMVSYICIIIAIQRIHAAEGRYKAFSTCVSHLTTVTLFYGSVSFSYIQPSSQYSL
.....::.::.::. .. . :::.::::::.:.: .::.:.:.. : :..:.:.::.
CCDS31 SCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGRHKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSM
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250
pF1KE0 EQEKVLAVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKDAAKRLIWWGKNPT
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CCDS31 EQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKNKDVKKALKKILWKHIL
280 290 300 310
>>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 957 init1: 924 opt: 924 Z-score: 1070.0 bits: 205.9 E(32554): 2.8e-53
Smith-Waterman score: 924; 53.0% identity (85.4% similar) in 247 aa overlap (1-247:59-305)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLGNLSFCDICYSTVFAPKMLVNFLSK
::.::.:::: :: ::...::::.:::..
CCDS31 LVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMYYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLAS
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 HKSSTFSGCVLQSFPFAVYVTTKDILLSMMAYDHYVAIANPLLYTVIMAQKVCIQMVLAS
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CCDS31 RKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAYDRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLA
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100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGLINSLTHTIGLLKLDFCGPNIVNHYFCDVPPLLRLSCSDAHINEMLPLVFSGLIAM
:..: .::.:. ..:.::: :::::.:::.:::: :::.:..::..: ... ..:
CCDS31 YFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCDIPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQT
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 FTFIVIMVSYICIIIAIQRIHAAEGRYKAFSTCVSHLTTVTLFYGSVSFSYIQPSSQYSL
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CCDS31 STFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFSTCASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 EQEKVLAVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKDAAKRLIWWGKNPT
. .::.:::::.:.::.::.:::.::::::.: :.:.
CCDS31 DTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
270 280 290 300 310 320
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 957 init1: 917 opt: 917 Z-score: 1062.3 bits: 204.4 E(32554): 7.6e-53
Smith-Waterman score: 917; 53.4% identity (84.2% similar) in 247 aa overlap (1-247:59-305)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLGNLSFCDICYSTVFAPKMLVNFLSK
::.::..::: :.:::.:..::::::::.:
CCDS31 LLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMYYFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGK
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 HKSSTFSGCVLQSFPFAVYVTTKDILLSMMAYDHYVAIANPLLYTVIMAQKVCIQMVLAS
... .: :..: : :.:.:... ::. ::::.:::: .::::..::.. :: .:::.
CCDS31 KNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAA
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGLINSLTHTIGLLKLDFCGPNIVNHYFCDVPPLLRLSCSDAHINEMLPLVFSGLIAM
.. :....:::: ...::.:: .:.::::::: ::: ::::..:.::.: ....:. ..
CCDS31 FFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 FTFIVIMVSYICIIIAIQRIHAAEGRYKAFSTCVSHLTTVTLFYGSVSFSYIQPSSQYSL
... ::: :. .: .:...::: :::.:: ::: .:..:.::..: :..: :. ::
CCDS31 VPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 EQEKVLAVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKDAAKRLIWWGKNPT
.:::: .:::: :::::::::::::::::: : ....
CCDS31 DQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKALRKVLVGK
270 280 290 300
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 938 init1: 917 opt: 917 Z-score: 1062.1 bits: 204.4 E(32554): 7.7e-53
Smith-Waterman score: 917; 51.4% identity (83.0% similar) in 247 aa overlap (1-247:61-307)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLGNLSFCDICYSTVFAPKMLVNFLSK
:::::.:::: :.:: . ..:::::::::.
CCDS79 LMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSE
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 HKSSTFSGCVLQSFPFAVYVTTKDILLSMMAYDHYVAIANPLLYTVIMAQKVCIQMVLAS
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CCDS79 NKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGLINSLTHTIGLLKLDFCGPNIVNHYFCDVPPLLRLSCSDAHINEMLPLVFSGLIAM
:::: ..::.:: . : .: :..::.:::.::::.:::.:. ::: : .... . .
CCDS79 YLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEI
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 FTFIVIMVSYICIIIAIQRIHAAEGRYKAFSTCVSHLTTVTLFYGSVSFSYIQPSSQYSL
. ::.:..::. :.... .:.. :: :.::::.::::.::.. :.. : : .:: ::
CCDS79 ICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSP
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250
pF1KE0 EQEKVLAVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKDAAKRLIWWGKNPT
. .:...::::. ::.:::::::::::::::::....
CCDS79 NTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
280 290 300 310
>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 936 init1: 916 opt: 916 Z-score: 1061.1 bits: 204.2 E(32554): 8.8e-53
Smith-Waterman score: 916; 53.3% identity (82.5% similar) in 246 aa overlap (1-246:59-304)
10 20 30
pF1KE0 MYFFLGNLSFCDICYSTVFAPKMLVNFLSK
:::::..:::::.::::. .:::::..:.:
CCDS31 AVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAK
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 HKSSTFSGCVLQSFPFAVYVTTKDILLSMMAYDHYVAIANPLLYTVIMAQKVCIQMVLAS
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CCDS31 NKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGV
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 YLGGLINSLTHTIGLLKLDFCGPNIVNHYFCDVPPLLRLSCSDAHINEMLPLVFSGLIAM
:: :. ..: : ..: ::: : .::.:::.:::: :: ::...::.. .. :.: .
CCDS31 YLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCDIPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIEL
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 FTFIVIMVSYICIIIAIQRIHAAEGRYKAFSTCVSHLTTVTLFYGSVSFSYIQPSSQYSL
:. ...:: ::... .::.::::.::.:::.:::..:..: :.. : :..:::.:::
CCDS31 STISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250
pF1KE0 EQEKVLAVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKDAAKRLIWWGKNPT
.:.:. ..:::::.::::::::::::::::.: :.:
CCDS31 DQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEALKKLKNKILF
270 280 290 300 310
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10 20 30
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220 230 240 250
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CCDS31 DNDMIVSIFYTIVIPMLNPIIYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
290 300 310 320
>>CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 (340 aa)
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10 20 30
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CCDS31 NKSISFIGCATQMLLFVTFGTTECFLLAAMAYDHYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITAS
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CCDS31 YVAGILHATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEI
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CCDS31 VTILIVLISCDFILLSILKMHSAKGRQKAFSTCGSHLTGVTIYHGTILVSYMRPSSSYAS
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CCDS31 DHDIIVSIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
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10 20 30
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CCDS46 TIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSK
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40 50 60 70 80 90
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CCDS46 KKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASC
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CCDS46 WAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNE-LALLSTGVFIG
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160 170 180 190 200
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CCDS46 WTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYS
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CCDS46 LKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKEAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
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CCDS31 MLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPMYFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITE
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CCDS31 QKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAMAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGA
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CCDS31 YVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFFCDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGI
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CCDS31 NRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKNAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]