Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0804
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0804, 289 aa
1>>>pF1KE0804 289 - 289 aa - 289 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5422+/-0.000737; mu= 20.6500+/- 0.044
mean_var=84.9342+/-18.918, 0's: 0 Z-trim(110.3): 78 B-trim: 663 in 1/51
Lambda= 0.139166
statistics sampled from 11400 (11484) to 11400 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 2.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 ( 289) 1995 409.9 1.1e-114
CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 ( 312) 595 128.9 4.7e-30
CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 ( 322) 546 119.1 4.4e-27
CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 ( 322) 505 110.8 1.3e-24
CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 ( 322) 500 109.8 2.7e-24
CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 ( 330) 483 106.4 2.9e-23
CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 ( 321) 459 101.6 8e-22
CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 ( 325) 369 83.5 2.2e-16
CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 ( 378) 367 83.2 3.2e-16
CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 ( 343) 361 81.9 6.9e-16
>>CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 (289 aa)
initn: 1995 init1: 1995 opt: 1995 Z-score: 2172.5 bits: 409.9 E(32554): 1.1e-114
Smith-Waterman score: 1995; 100.0% identity (100.0% similar) in 289 aa overlap (1-289:1-289)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFGLFGLWRTFDSVVFYLTLIVGLGGPVGNGLVLWNLGFRIKKGPFSIYLLHLAAADFLF
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CCDS44 MFGLFGLWRTFDSVVFYLTLIVGLGGPVGNGLVLWNLGFRIKKGPFSIYLLHLAAADFLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LSCRVGFSVAQAALGAQDTLYFVLTFLWFAVGLWLLAAFSVERCLSDLFPACYQGCRPRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSCRVGFSVAQAALGAQDTLYFVLTFLWFAVGLWLLAAFSVERCLSDLFPACYQGCRPRH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ASAVLCALVWTPTLPAVPLPANACGLLRNSACPLVCPRYHVASVTWFLVLARVAWTAGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ASAVLCALVWTPTLPAVPLPANACGLLRNSACPLVCPRYHVASVTWFLVLARVAWTAGVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LFVWVTCCSTRPRPRLYGIVLGALLLLFFCGLPSVFYWSLQPLLNFLLPVFSPLATLLAC
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CCDS44 LFVWVTCCSTRPRPRLYGIVLGALLLLFFCGLPSVFYWSLQPLLNFLLPVFSPLATLLAC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KE0 VNSSSKPLIYSGLGRQPGKREPLRSVLRRALGEGAELGARGQSLPMGLL
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CCDS44 VNSSSKPLIYSGLGRQPGKREPLRSVLRRALGEGAELGARGQSLPMGLL
250 260 270 280
>>CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 597 init1: 228 opt: 595 Z-score: 653.0 bits: 128.9 E(32554): 4.7e-30
Smith-Waterman score: 595; 38.8% identity (63.6% similar) in 286 aa overlap (11-289:23-308)
10 20 30 40
pF1KE0 MFGLFGLWRTFDSVVFYLTLIVGLGGPVGNGLVLWNLGFRIKKGPFSI
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CCDS41 MMEPREAGQHVGAANGAQEDVAFNLIILSLTEGLGLGGLLGNGAVLWLLSSNVYRNPFAI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 YLLHLAAADFLFLSCRVGFSVAQAALGAQDTLYFV------LTFLWFAVGLWLLAAFSVE
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CCDS41 YLLDVACADLIFLGCHMVAIVPDLLQGRLDFPGFVQTSLATLRFFCYIVGLSLLAAVSVE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 RCLSDLFPACYQGCRPRHASAVLCALVWTPTLPAVPLPANACGLLRNSACPLVCPRYHVA
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CCDS41 QCLAALFPAWYSCRRPRHLTTCVCALTWALCLLLHLLLSGACTQFFGEPSRHLCRTLWLV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SVTWFLVLARVAWTAGVVLFVWVTCCSTRPRPRLY-GIVLGALLLLFFCGLPSVFYWSLQ
... . .: . :...:.. : :: :: . :..: ..::..::::: .:: .
CCDS41 AAVLLALLCCTMCGASLMLLLRVERGPQRPPPRGFPGLILLTVLLFLFCGLPFGIYWLSR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 PLLNFLLPVFSPLATLLACVNSSSKPLIYSGLGRQPGKREPLRSVLRRALGEGAELGARG
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CCDS41 NLLWYIPHYFYHFSFLMAAVHCAAKPVVYFCLGSAQGRRLPLRLVLQRALGDEAELGAVR
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QSLPMGLL
.. ::.
CCDS41 ETSRRGLVDIAA
310
>>CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 543 init1: 214 opt: 546 Z-score: 599.7 bits: 119.1 E(32554): 4.4e-27
Smith-Waterman score: 546; 38.5% identity (64.0% similar) in 283 aa overlap (18-289:33-313)
10 20 30 40
pF1KE0 MFGLFGLWRTFDSVVFYLTLIVGLGGPVGNGLVLWNLGFRIKKGPFS
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CCDS78 PTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNAFS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 IYLLHLAAADFLFLSCRVGFSV---AQAALGAQDTLYFVLTFLWFAVGLWLLAAFSVERC
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CCDS78 IYILNLAAADFLFLSGRLIYSLLSFISIPHTISKILYPVMMFSYFA-GLSFLSAVSTERC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LSDLFPACYQGCRPRHASAVLCALVWTPTLPAVPLPANACGLLRNSACPLVCPRYHVASV
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CCDS78 LSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWCQTSDFITV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE0 TWFLVLARVAWTAGVVLFVWVTCCSTR-PRPRLYGIVLGALLLLFFCGLPS-----VFYW
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CCDS78 AWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQFFLFLW
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 SLQPLLNFLLPVFSPLATLLACVNSSSKPLIYSGLG--RQPGKREPLRSVLRRALGEGAE
.. . :. .. .:. .:::..:.:: .: :: .:. :. ::.::: ...:
CCDS78 -IHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDASE
250 260 270 280 290 300
280
pF1KE0 LGARGQSLPMGLL
. : .:: .:
CCDS78 VDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
310 320
>>CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 498 init1: 208 opt: 505 Z-score: 555.2 bits: 110.8 E(32554): 1.3e-24
Smith-Waterman score: 505; 36.2% identity (63.5% similar) in 282 aa overlap (18-289:33-313)
10 20 30 40
pF1KE0 MFGLFGLWRTFDSVVFYLTLIVGLGGPVGNGLVLWNLGFRIKKGPFS
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CCDS78 STIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNAVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 IYLLHLAAADFLFLSCRVGFS---VAQAALGAQDTLYFVLTFLWFAVGLWLLAAFSVERC
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CCDS78 IYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIRHPISKILSPVMTFPYF-IGLSMLSAISTERC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LSDLFPACYQGCRPRHASAVLCALVWTPTLPAVPLPANACGLLRNSACPLVCPRYHVASV
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CCDS78 LSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGANSVWCETSDFITI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 TWFLVLARVAWTAGVVLFVWVTCCSTR-PRPRLYGIVLGALLLLFFCGLPSVFYWSLQPL
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CCDS78 AWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWALFSR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KE0 LNFLLPVF----SPLATLLACVNSSSKPLIYSGLG--RQPGKREPLRSVLRRALGEGAEL
... :. .. .:. .:::..:.:: .: :: .:. :. ::.::: . :.
CCDS78 IHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDTPEV
250 260 270 280 290 300
280
pF1KE0 GARGQSLPMGLL
: ::. :
CCDS78 DEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
310 320
>>CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 504 init1: 204 opt: 500 Z-score: 549.8 bits: 109.8 E(32554): 2.7e-24
Smith-Waterman score: 500; 37.4% identity (62.9% similar) in 278 aa overlap (18-285:33-309)
10 20 30 40
pF1KE0 MFGLFGLWRTFDSVVFYLTLIVGLGGPVGNGLVLWNLGFRIKKGPFS
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CCDS78 PTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNAVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 IYLLHLAAADFLFLSC---RVGFSVAQAALGAQDTLYFVLTFLWFAVGLWLLAAFSVERC
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CCDS78 IYILNLAAADFLFLSFQIIRLPLRLINISHLIRKILVSVMTFPYFT-GLSMLSAISTERC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LSDLFPACYQGCRPRHASAVLCALVWTPTLPAVPLPANACGLLRNSACPLVCPRYHVASV
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CCDS78 LSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWCETSDFIPV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 TWFLVLARVAWTAGVVLFVWVTCCSTR-PRPRLYGIVLGALLLLFFCGLPSVFYWSLQPL
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CCDS78 AWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGILGALIYR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KE0 LNFLLPVFSPLATL----LACVNSSSKPLIYSGLG--RQPGKREPLRSVLRRALGEGAEL
... : :. . : :. .:::..:.:: .: :: .:. :. ::.::: . :.
CCDS78 MHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDKPEV
250 260 270 280 290 300
280
pF1KE0 GARGQSLPMGLL
.::
CCDS78 DKGEGQLPEESLELSGSRLGP
310 320
>>CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 504 init1: 211 opt: 483 Z-score: 531.2 bits: 106.4 E(32554): 2.9e-23
Smith-Waterman score: 502; 36.1% identity (65.3% similar) in 277 aa overlap (17-277:35-310)
10 20 30 40
pF1KE0 MFGLFGLWRTFDSVVFYLTLIVGLGGPVGNGLVLWNLGFRIKKGPF
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CCDS78 TPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMRRNAF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE0 SIYLLHLAAADFLFL-----SCRVGFSVAQAALGAQDTLYF--VLTFLWFAVGLWLLAAF
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CCDS78 SVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLA-GLSMLSTV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 SVERCLSDLFPACYQGCRPRHASAVLCALVWTPTLPAVPLPANACGLLRNSACPLVCPRY
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CCDS78 STERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWCQTF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 HVASVTWFLVLARVAWTAGVVLFVWVTCCSTR-PRPRLYGIVLGALLLLFFCGLPSVFYW
...:.. : : ....:.: . : : : ::: .: ..:....:::: . :
CCDS78 DFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFGIQW
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 SLQPLL----NFLLPVFSPLATLLACVNSSSKPLIYSGLG---RQPGKREP-LRSVLRRA
: . . :. . :....:. .:::..:.:: .: .: ..: :. .:.::
CCDS78 FLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLALQRA
250 260 270 280 290 300
280
pF1KE0 LGEGAELGARGQSLPMGLL
: . ::.
CCDS78 LQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
310 320 330
>>CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 411 init1: 191 opt: 459 Z-score: 505.3 bits: 101.6 E(32554): 8e-22
Smith-Waterman score: 486; 37.5% identity (66.9% similar) in 293 aa overlap (14-287:29-315)
10 20 30 40
pF1KE0 MFGLFGLWRTFDSVVFYLTLIVGLGGPVGNGLVLWNLGFRIKKGP
:. :.... : : .::..:.: ::::....:
CCDS31 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 FSIYLLHLAAADFLFL-SCRVGFSV-AQAALGAQDTLYFVLT-FLWFA--VGLWLLAAFS
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CCDS31 FCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTAIS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE0 VERCLSDLFPACYQGCRPRHASAVLCALVWTPTLPAVPLPANACG-LLRNSACPLVCPRY
..:::: ::: .. :::: :: .:.:.:: : : .. :. .:. . : :
CCDS31 TQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNED--RCFRV
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 HVASVTWFL-VLARVAWTAGVVLFVWVTCCST--RPRP-RLYGIVLGALLLLFFCGLPSV
..... .. ::. : ....::::: : : .: ::. .::...:....:.::
CCDS31 DMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQPTRLFVVVLASVLVFLICSLPLS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE0 FYW------SLQPLLNFLLPVFSPLATLLACVNSSSKPLIYSGLGRQPGKREPLRS---V
.:: :: : .. : :: :. : . :.::..:.:: .: . ..: : :: :
CCDS31 IYWFVLYWLSLPPEMQVL--CFS-LSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTRSLGTV
240 250 260 270 280 290
270 280
pF1KE0 LRRALGEGAELGARGQSLPMGLL
:..:: : :: . :.. .:
CCDS31 LQQALREEPELEG-GETPTVGTNEMGA
300 310 320
>>CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 (325 aa)
initn: 330 init1: 160 opt: 369 Z-score: 407.6 bits: 83.5 E(32554): 2.2e-16
Smith-Waterman score: 369; 29.1% identity (59.6% similar) in 285 aa overlap (14-282:34-312)
10 20 30 40
pF1KE0 MFGLFGLWRTFDSVVFYLTLIVGLGGPVGNGLVLWNLGFRIKK
.: .. . .. : : ::..:: : ::...
CCDS52 SNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRMRR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE0 GPFSIYLLHLAAADFLFLSCRVGFSVAQA-----ALGAQDTLYFV-LTFLW-FAVGLWLL
.::..:. ::. ::. .: : .:. : . : :. . .:::. . .::.::
CCDS52 NPFTVYITHLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGLYLL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 AAFSVERCLSDLFPACYQGCRPRHASAVLCALVWTPTLPAVPLPANAC------GLLRNS
.:.::::::: :.: :. ::.. ::..:::.:. . .. . : . ::.
CCDS52 TAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHSRND
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KE0 ACPLVCPRYHVASVTWFLVLARVAWTAGVVLFVWVTCCS-TRPRPRLYGIVLGALLLLFF
: : . : :::.. . .....: : . . . .:: ... .......
CCDS52 -CRAVIIFIAILS---FLVFTPLMLVSSTILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLI
190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 CGLPSVFYWSLQPLLNFLLPVFSPLATLLACVNSSSKPLIYSGLGRQPGKR--EPLRSVL
..: . . : . . .. :.. .:::..:.:: .: . :: : :. ::
CCDS52 FAMPMRLLYLLYYEYWSTFGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVL
240 250 260 270 280 290
270 280
pF1KE0 RRALGEGAELGARGQSLPMGLL
::. . :. : :
CCDS52 TRAFKD--EMQPRRQKDNCNTVTVETVV
300 310 320
>>CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 (378 aa)
initn: 284 init1: 131 opt: 367 Z-score: 404.7 bits: 83.2 E(32554): 3.2e-16
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10 20 30 40
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..:.: : . :: :.: : . :. .:
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.:::.::: ..: : ::: . . : . ...:. :: : : : ::.:.:.:
CCDS46 ILHLVAADVIYLCCSAVGF-LQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFSFEVCLCLLVAISTE
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110 120 130 140 150 160
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::. ::: :. ::...: :.:.:.: ..:. : : . : : .
CCDS46 RCVCVLFPIWYRCHRPKYTSNVVCTLIW-----GLPFCINIVKSLFLTYWKHVKACVIFL
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170 180 190 200 210
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: . .:. : .....:.. ::: . . :.:..: . .... .:: :
CCDS46 KLSGLFHAILSLVMCVSSLTLLIRFLCCSQQQKATRVYAVVQISAPMFLLWALP----LS
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. ::. .: . : : : .:. .:::..:.:: .: :: : :: .:.:::..
CCDS46 VAPLITDFKMFVTTSYLISLFLIINSSANPIIYFFVGSLRKKRLKESLRVILQRALADKP
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280
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:.:
CCDS46 EVGRNKKAAGIDPMEQPHSTQHVENLLPREHRVDVET
350 360 370
>>CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 (343 aa)
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Smith-Waterman score: 508; 37.0% identity (62.3% similar) in 289 aa overlap (13-285:45-328)
10 20 30 40
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.:. :. :.. : : :::::::: .:: ::
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50 60 70 80 90
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..:::::.::::.:: .: .. ::. ... ::. : .. :: . : .:. ::
CCDS81 RNPFSIYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCMFLTGVSLL
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: :.::: : .::: : ::.. :::.:::.:. .: .. : : .: .: .:
CCDS81 PAVSAERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAAC
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160 170 180 190 200
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.. . .. ::. . ..:.. : : . : . .: ..: :.. .:
CCDS81 RHMDIFLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVIL-AMVSVFLVSSI
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. :. ..: .: : : . .. : :.:::.::..: ::. ..: :::: :
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270 280
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..::: .::::: : : :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]