Result of FASTA (omim) for
pF1KE0799
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0799, 501 aa
1>>>pF1KE0799 501 - 501 aa - 501 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0393+/-0.00037; mu= 19.8976+/- 0.023
mean_var=67.7663+/-13.775, 0's: 0 Z-trim(112.4): 72 B-trim: 1077 in 1/54
Lambda= 0.155800
statistics sampled from 21171 (21246) to 21171 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 9.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [ ( 501) 3357 763.8 0
NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 518) 2528 577.5 3.2e-164
NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase ( 497) 2489 568.7 1.3e-161
NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydroge ( 512) 2438 557.3 3.9e-158
NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydroge ( 517) 2352 537.9 2.6e-152
XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde de ( 517) 2245 513.9 4.5e-145
NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, ( 517) 2245 513.9 4.5e-145
NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 422) 2216 507.3 3.5e-143
NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydr ( 470) 1911 438.8 1.6e-122
XP_016874378 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1555 358.9 3e-98
XP_011536288 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 777) 1555 358.9 3e-98
NP_001257294 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 801) 1555 358.9 3.1e-98
XP_011510657 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1555 359.0 3.4e-98
NP_036322 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltetrah ( 902) 1555 359.0 3.4e-98
XP_006713544 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 902) 1555 359.0 3.4e-98
NP_001257293 (OMIM: 600249) cytosolic 10-formyltet ( 912) 1555 359.0 3.4e-98
NP_001029345 (OMIM: 613584) mitochondrial 10-formy ( 923) 1555 359.0 3.4e-98
NP_001280744 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydr ( 405) 1455 336.2 1e-91
NP_733797 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 i ( 480) 1294 300.1 9.4e-81
NP_000687 (OMIM: 602733) 4-trimethylaminobutyralde ( 518) 1181 274.7 4.4e-73
XP_016861103 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 828) 1183 275.3 4.7e-73
XP_016861102 (OMIM: 600249) PREDICTED: cytosolic 1 ( 838) 1183 275.3 4.7e-73
NP_072090 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase fa ( 487) 1150 267.7 5.3e-71
XP_011507596 (OMIM: 602733) PREDICTED: 4-trimethyl ( 424) 1126 262.3 2e-69
NP_001071 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 535) 928 217.9 5.9e-56
NP_005580 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate-sem ( 535) 775 183.5 1.3e-45
NP_001180409 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase ( 437) 766 181.4 4.6e-45
NP_001188306 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadip ( 511) 719 170.9 7.9e-42
NP_001173 (OMIM: 107323,266100) alpha-aminoadipic ( 539) 719 170.9 8.3e-42
NP_001265522 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 522) 666 159.0 3.1e-38
NP_001265523 (OMIM: 603178,614105) methylmalonate- ( 381) 648 154.8 4e-37
XP_016876820 (OMIM: 603178,614105) PREDICTED: meth ( 381) 648 154.8 4e-37
NP_733936 (OMIM: 271980,610045) succinate-semialde ( 548) 622 149.1 3.1e-35
NP_739577 (OMIM: 606467) aldehyde dehydrogenase fa ( 433) 613 147.0 1e-34
XP_011541719 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404) 604 145.0 4e-34
XP_016864982 (OMIM: 107323,266100) PREDICTED: alph ( 404) 604 145.0 4e-34
NP_001128640 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 453) 573 138.0 5.5e-32
NP_000682 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase, d ( 453) 573 138.0 5.5e-32
NP_001128639 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 453) 573 138.0 5.5e-32
XP_011536290 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondri ( 622) 560 135.2 5.3e-31
NP_001317079 (OMIM: 100660) aldehyde dehydrogenase ( 380) 526 127.4 7.2e-29
XP_011522033 (OMIM: 100660) PREDICTED: aldehyde de ( 380) 526 127.4 7.2e-29
XP_016879845 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 485) 521 126.4 1.9e-28
XP_016879846 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 485) 521 126.4 1.9e-28
NP_000373 (OMIM: 270200,609523) fatty aldehyde deh ( 485) 521 126.4 1.9e-28
XP_011522034 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 508) 521 126.4 2e-28
NP_001026976 (OMIM: 270200,609523) fatty aldehyde ( 508) 521 126.4 2e-28
XP_011522035 (OMIM: 270200,609523) PREDICTED: fatt ( 508) 521 126.4 2e-28
XP_011524743 (OMIM: 613358) PREDICTED: aldehyde de ( 773) 503 122.5 4.5e-27
XP_011524744 (OMIM: 613358) PREDICTED: aldehyde de ( 773) 503 122.5 4.5e-27
>>NP_000680 (OMIM: 100640) retinal dehydrogenase 1 [Homo (501 aa)
initn: 3357 init1: 3357 opt: 3357 Z-score: 4076.6 bits: 763.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3357; 100.0% identity (100.0% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPATEEELCQVEEGDKEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPATEEELCQVEEGDKEDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLATMESMNGGKLYSNAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLATMESMNGGKLYSNAYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCGQIIPWNFPLVMLIWKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCGQIIPWNFPLVMLIWKI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTAGAAISSHMDID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTAGAAISSHMDID
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADLDNAVEFAHHGVFYHQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADLDNAVEFAHHGVFYHQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGPQIDKEQYDKILDLIES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGPQIDKEQYDKILDLIES
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 GKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIMKFKSLDDVIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIMKFKSLDDVIKR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQCPFGGFKMSGNGRELGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQCPFGGFKMSGNGRELGE
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE0 YGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
:::::::::::::::::::::
NP_000 YGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
490 500
>>NP_003879 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo (518 aa)
initn: 2528 init1: 2528 opt: 2528 Z-score: 3069.3 bits: 577.5 E(85289): 3.2e-164
Smith-Waterman score: 2528; 73.2% identity (91.5% similar) in 493 aa overlap (9-501:26-518)
10 20 30 40
pF1KE0 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNP
:: .:.:.::::::::::..: ::. :::.::
NP_003 MTSSKIEMPGEVKADPAALMASLHLLPSPTPNLEIKYTKIFINNEWQNSESGRVFPVYNP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ATEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLL
:: :..:.:.:.:: :.::::.::: ::..:: :: :::::::::: :::::.:::: .:
NP_003 ATGEQVCEVQEADKADIDKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ATMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVC
:::::.:::: . .:. :: : :::.:: :::::::.: :::.::..::.:::::::::
NP_003 ATMESLNGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 GQIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVP
::::::::::.:. :::.::: ::::::.::::::::.::....:::::::::::.::.:
NP_003 GQIIPWNFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 GYGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADAD
::::::::::.::. :::.::::::::::::.::::.::::::::::::::: :..::::
NP_003 GYGPTAGAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADAD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LDNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQG
:: ::: ::.:::..::::: :.::::::::::.:::::::::::. ..:.:. : . ::
NP_003 LDYAVEQAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQG
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 PQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFG
:::::.::.:::.::.:: ::::::::: : ::.:..:::::::::.::::::::::
NP_003 PQIDKKQYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFG
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 PVQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQ
:::.:..::..:.::.::::. .:: :.:::.::.::.:.:::.::::::.:::....::
NP_003 PVQEILRFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQ
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500
pF1KE0 CPFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
:::::::::::::.::.:..::.::::::::: ::::
NP_003 SPFGGFKMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
490 500 510
>>NP_001193826 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 is (497 aa)
initn: 2487 init1: 2487 opt: 2489 Z-score: 3022.2 bits: 568.7 E(85289): 1.3e-161
Smith-Waterman score: 2489; 73.3% identity (91.5% similar) in 484 aa overlap (18-501:14-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPATEEELCQVEEGDKEDV
:. :::::::..: ::. :::.:::: :..:.:.:.:: :.
NP_001 MKNQCETVWLKSPIKLKLIFINNEWQNSESGRVFPVYNPATGEQVCEVQEADKADI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLATMESMNGGKLYSNAYL
::::.::: ::..:: :: :::::::::: :::::.:::: .::::::.:::: . .:.
NP_001 DKAVQAARLAFSLGSVWRRMDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESLNGGKPFLQAFY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCGQIIPWNFPLVMLIWKI
:: : :::.:: :::::::.: :::.::..::.:::::::::::::::::::.:. :::
NP_001 VDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPWNFPLLMFAWKI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTAGAAISSHMDID
.::: ::::::.::::::::.::....:::::::::::.::.:::::::::::.::. ::
NP_001 APALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTAGAAIASHIGID
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADLDNAVEFAHHGVFYHQG
:.::::::::::::.::::.::::::::::::::: :..:::::: ::: ::.:::..::
NP_001 KIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVEQAHQGVFFNQG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGPQIDKEQYDKILDLIES
::: :.::::::::::.:::::::::::. ..:.:. : . :::::::.::.:::.::.:
NP_001 QCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKKQYNKILELIQS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 GKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIMKFKSLDDVIKR
: ::::::::: : ::.:..:::::::::.:::::::::::::.:..::..:.::.:
NP_001 GVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEILRFKTMDEVIER
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQCPFGGFKMSGNGRELGE
:::. .:: :.:::.::.::.:.:::.::::::.:::....:: :::::::::::::.::
NP_001 ANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGFKMSGNGREMGE
420 430 440 450 460 470
490 500
pF1KE0 YGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
.:..::.::::::::: ::::
NP_001 FGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
480 490
>>NP_000684 (OMIM: 600463,615113) aldehyde dehydrogenase (512 aa)
initn: 2438 init1: 2438 opt: 2438 Z-score: 2960.1 bits: 557.3 E(85289): 3.9e-158
Smith-Waterman score: 2438; 70.9% identity (89.7% similar) in 494 aa overlap (7-500:18-511)
10 20 30 40
pF1KE0 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPATEEEL
: :: . .:....::::::::::.: ::::: . ::.:.:..
NP_000 MATANGAVENGQPDRKPPALPRPIRNLEVKFTKIFINNEWHESKSGKKFATCNPSTREQI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 CQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLATMESM
:.:::::: ::::::.::. ::: ::::: .:: :::::..::::.:::: ::..:.:
NP_000 CEVEEGDKPDVDKAVEAAQVAFQRGSPWRRLDALSRGRLLHQLADLVERDRATLAALETM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 NGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCGQIIPW
. :: . .:.. :: :::.:::: :::::::::.::: : : .:::::::::: : ::
NP_000 DTGKPFLHAFFIDLEGCIRTLRYFAGWADKIQGKTIPTDDNVVCFTRHEPIGVCGAITPW
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 NFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTA
::::.::.::..::: ::::.:.:::::::::::...::::::::::::::::::.:::.
NP_000 NFPLLMLVWKLAPALCCGNTMVLKPAEQTPLTALYLGSLIKEAGFPPGVVNIVPGFGPTV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 GAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADLDNAVE
::::::: .:.:.:::::::::::.::::..:::::::::::::.:::: :::::: :::
NP_000 GAAISSHPQINKIAFTGSTEVGKLVKEAASRSNLKRVTLELGGKNPCIVCADADLDLAVE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 FAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGPQIDKE
::.:::..::::: ::::.::::..:.:::::::: ::: .:.:. . ::::::..
NP_000 CAHQGVFFNQGQCCTAASRVFVEEQVYSEFVRRSVEYAKKRPVGDPFDVKTEQGPQIDQK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 QYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIM
:.::::.::::::::::::::::. .:: :..:::::.:::.::::::::::::: :.
NP_000 QFDKILELIESGKKEGAKLECGGSAMEDKGLFIKPTVFSEVTDNMRIAKEEIFGPVQPIL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 KFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQCPFGGF
::::...::::::.: :::.:.::::..:::. ..:::..::::.:::... :: :::::
NP_000 KFKSIEEVIKRANSTDYGLTAAVFTKNLDKALKLASALESGTVWINCYNALYAQAPFGGF
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500
pF1KE0 KMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
::::::::::::.. :::::::::.:...::
NP_000 KMSGNGRELGEYALAEYTEVKTVTIKLGDKNP
490 500 510
>>NP_000681 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogenase (517 aa)
initn: 2344 init1: 2344 opt: 2352 Z-score: 2855.6 bits: 537.9 E(85289): 2.6e-152
Smith-Waterman score: 2352; 68.1% identity (86.8% similar) in 501 aa overlap (1-501:17-517)
10 20 30 40
pF1KE0 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPA
.:...: .:. . .. ..:::::::::.:: : ::. ::.
NP_000 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLA
: : .::: ::::::::::::::: :::.::::: ::::.::::: .::::::::: ::
NP_000 TGEVICQVAEGDKEDVDKAVKAARAAFQLGSPWRRMDASHRGRLLNRLADLIERDRTYLA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 TMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCG
..:....:: : .:: :: .: ::: :::::: .:.::::::.::.::::::.::::
NP_000 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 QIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPG
:::::::::.: ::.::::. ::.::.: :::::::::.::.:::::::::::::::::
NP_000 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 YGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADL
.::::::::.:: :.::::::::::.:..:. :::.::::::::::::::: :...:::.
NP_000 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 DNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGP
: ::: :: ..:..::::: :.:: ::.:.::::::.::: :::. ..:::. . :::
NP_000 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 QIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGP
:.:. :. ::: :..::.::::: :::: ...:::.:::::..: : : :::::::::
NP_000 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 VQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQC
:.::.:::....:. ::::. :::.:.:::::.::: .:.:::::::::::: : .::
NP_000 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500
pF1KE0 PFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
::::.::::.::::::::.. ::::::::::. ::::
NP_000 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
490 500 510
>>XP_011516104 (OMIM: 100670) PREDICTED: aldehyde dehydr (517 aa)
initn: 2242 init1: 2242 opt: 2245 Z-score: 2725.6 bits: 513.9 E(85289): 4.5e-145
Smith-Waterman score: 2245; 64.8% identity (87.4% similar) in 500 aa overlap (2-501:21-517)
10 20 30 40
pF1KE0 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVF
:... :. :.: : : :...::::::.:.:: : ::.
XP_011 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPS-PILNPD--IPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 NPATEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRL
::.: : . .: :::. :::.::::::.::..::::: :::::::::: .::::.::::.
XP_011 NPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVERDRV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LLATMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIG
::..:....:: ....: :: ::. :: :::::: .:.:::.::. : .:::::.:
XP_011 YLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 VCGQIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNI
:::::::::::::: ::..:::. :::::.: ::::::.::..::::::::::::::::
XP_011 VCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VPGYGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLAD
. ::::::::::..:.:.::::::::::::.::..::: ::::::::::::::: :::::
XP_011 ITGYGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLAD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 ADLDNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVT
::...::: :...:...:::: :.:: :::::::.::..:.::.::. .:::. .
XP_011 ADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 QGPQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEI
::::.::::....: :. :.:::::: ::: .:..:.:..::::..: :.::::::::
XP_011 QGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 FGPVQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVS
::::: ..:::....:..::::: :::.:.:::.:.:::. ...:::::::::: :..:.
XP_011 FGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500
pF1KE0 AQCPFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
. :::::: ::::::::: :.. ::::::::.:. ::::
XP_011 CHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
480 490 500 510
>>NP_000683 (OMIM: 100670) aldehyde dehydrogenase X, mit (517 aa)
initn: 2242 init1: 2242 opt: 2245 Z-score: 2725.6 bits: 513.9 E(85289): 4.5e-145
Smith-Waterman score: 2245; 64.8% identity (87.4% similar) in 500 aa overlap (2-501:21-517)
10 20 30 40
pF1KE0 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVF
:... :. :.: : : :...::::::.:.:: : ::.
NP_000 MLRFLAPRLLSLQGRTARYSSAAALPS-PILNPD--IPYNQLFINNEWQDAVSKKTFPTV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 NPATEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRL
::.: : . .: :::. :::.::::::.::..::::: :::::::::: .::::.::::.
NP_000 NPTTGEVIGHVAEGDRADVDRAVKAAREAFRLGSPWRRMDASERGRLLNRLADLVERDRV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LLATMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIG
::..:....:: ....: :: ::. :: :::::: .:.:::.::. : .:::::.:
NP_000 YLASLETLDNGKPFQESYALDLDEVIKVYRYFAGWADKWHGKTIPMDGQHFCFTRHEPVG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 VCGQIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNI
:::::::::::::: ::..:::. :::::.: ::::::.::..::::::::::::::::
NP_000 VCGQIIPWNFPLVMQGWKLAPALATGNTVVMKVAEQTPLSALYLASLIKEAGFPPGVVNI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VPGYGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLAD
. ::::::::::..:.:.::::::::::::.::..::: ::::::::::::::: :::::
NP_000 ITGYGPTAGAAIAQHVDVDKVAFTGSTEVGHLIQKAAGDSNLKRVTLELGGKSPSIVLAD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 ADLDNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVT
::...::: :...:...:::: :.:: :::::::.::..:.::.::. .:::. .
NP_000 ADMEHAVEQCHEALFFNMGQCCCAGSRTFVEESIYNEFLERTVEKAKQRKVGNPFELDTQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 QGPQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEI
::::.::::....: :. :.:::::: ::: .:..:.:..::::..: :.::::::::
NP_000 QGPQVDKEQFERVLGYIQLGQKEGAKLLCGGERFGERGFFIKPTVFGGVQDDMRIAKEEI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 FGPVQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVS
::::: ..:::....:..::::: :::.:.:::.:.:::. ...:::::::::: :..:.
NP_000 FGPVQPLFKFKKIEEVVERANNTRYGLAAAVFTRDLDKAMYFTQALQAGTVWVNTYNIVT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500
pF1KE0 AQCPFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
. :::::: ::::::::: :.. ::::::::.:. ::::
NP_000 CHTPFGGFKESGNGRELGEDGLKAYTEVKTVTIKVPQKNS
480 490 500 510
>>NP_733798 (OMIM: 603687) retinal dehydrogenase 2 isofo (422 aa)
initn: 2216 init1: 2216 opt: 2216 Z-score: 2691.6 bits: 507.3 E(85289): 3.5e-143
Smith-Waterman score: 2216; 75.1% identity (92.7% similar) in 422 aa overlap (80-501:1-422)
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 CQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLATMESM
:::::::::: :::::.:::: .::::::.
NP_733 MDASERGRLLDKLADLVERDRAVLATMESL
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 NGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCGQIIPW
:::: . .:. :: : :::.:: :::::::.: :::.::..::.:::::::::::::::
NP_733 NGGKPFLQAFYVDLQGVIKTFRYYAGWADKIHGMTIPVDGDYFTFTRHEPIGVCGQIIPW
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 NFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTA
::::.:. :::.::: ::::::.::::::::.::....:::::::::::.::.:::::::
NP_733 NFPLLMFAWKIAPALCCGNTVVIKPAEQTPLSALYMGALIKEAGFPPGVINILPGYGPTA
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 GAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADLDNAVE
::::.::. :::.::::::::::::.::::.::::::::::::::: :..:::::: :::
NP_733 GAAIASHIGIDKIAFTGSTEVGKLIQEAAGRSNLKRVTLELGGKSPNIIFADADLDYAVE
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 FAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGPQIDKE
::.:::..::::: :.::::::::::.:::::::::::. ..:.:. : . :::::::.
NP_733 QAHQGVFFNQGQCCTAGSRIFVEESIYEEFVRRSVERAKRRVVGSPFDPTTEQGPQIDKK
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 QYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGPVQQIM
::.:::.::.:: ::::::::: : ::.:..:::::::::.:::::::::::::.:.
NP_733 QYNKILELIQSGVAEGAKLECGGKGLGRKGFFIEPTVFSNVTDDMRIAKEEIFGPVQEIL
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 KFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQCPFGGF
.::..:.::.::::. .:: :.:::.::.::.:.:::.::::::.:::....:: :::::
NP_733 RFKTMDEVIERANNSDFGLVAAVFTNDINKALTVSSAMQAGTVWINCYNALNAQSPFGGF
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500
pF1KE0 KMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
::::::::.::.:..::.::::::::: ::::
NP_733 KMSGNGREMGEFGLREYSEVKTVTVKIPQKNS
400 410 420
>>NP_001191818 (OMIM: 100650,610251) aldehyde dehydrogen (470 aa)
initn: 2077 init1: 1911 opt: 1911 Z-score: 2320.4 bits: 438.8 E(85289): 1.6e-122
Smith-Waterman score: 1995; 60.3% identity (78.4% similar) in 501 aa overlap (1-501:17-470)
10 20 30 40
pF1KE0 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPA
.:...: .:. . .. ..:::::::::.:: : ::. ::.
NP_001 MLRAAARFGPRLGRRLLSAAATQAVPAPNQQPEVFCNQIFINNEWHDAVSRKTFPTVNPS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLA
: : .::: ::::
NP_001 TGEVICQVAEGDK-----------------------------------------------
70
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 TMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCG
..:....:: : .:: :: .: ::: :::::: .:.::::::.::.::::::.::::
NP_001 ALETLDNGKPYVISYLVDLDMVLKCLRYYAGWADKYHGKTIPIDGDFFSYTRHEPVGVCG
80 90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 QIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPG
:::::::::.: ::.::::. ::.::.: :::::::::.::.:::::::::::::::::
NP_001 QIIPWNFPLLMQAWKLGPALATGNVVVMKVAEQTPLTALYVANLIKEAGFPPGVVNIVPG
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 YGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADL
.::::::::.:: :.::::::::::.:..:. :::.::::::::::::::: :...:::.
NP_001 FGPTAGAAIASHEDVDKVAFTGSTEIGRVIQVAAGSSNLKRVTLELGGKSPNIIMSDADM
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 DNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGP
: ::: :: ..:..::::: :.:: ::.:.::::::.::: :::. ..:::. . :::
NP_001 DWAVEQAHFALFFNQGQCCCAGSRTFVQEDIYDEFVERSVARAKSRVVGNPFDSKTEQGP
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 QIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEEIFGP
:.:. :. ::: :..::.::::: :::: ...:::.:::::..: : : :::::::::
NP_001 QVDETQFKKILGYINTGKQEGAKLLCGGGIAADRGYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGP
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 VQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQC
:.::.:::....:. ::::. :::.:.:::::.::: .:.:::::::::::: : .::
NP_001 VMQILKFKTIEEVVGRANNSTYGLAAAVFTKDLDKANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQS
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500
pF1KE0 PFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKNS
::::.::::.::::::::.. ::::::::::. ::::
NP_001 PFGGYKMSGSGRELGEYGLQAYTEVKTVTVKVPQKNS
440 450 460 470
>>XP_016874378 (OMIM: 613584) PREDICTED: mitochondrial 1 (777 aa)
initn: 1545 init1: 930 opt: 1555 Z-score: 1884.9 bits: 358.9 E(85289): 3e-98
Smith-Waterman score: 1555; 49.4% identity (76.3% similar) in 486 aa overlap (16-495:293-776)
10 20 30 40
pF1KE0 MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPAT
.:. : . :::... :. .:: . ..::.
XP_016 IQKVVRKLRGEDQEVELVVDYISKEVNEIMVKMPY-QCFINGQFTDADDGKTYDTINPTD
270 280 290 300 310 320
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 EEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDRLLLAT
.:.: .. :::::: ::..::. : : :.: :::::.:.::::.:... :::
XP_016 GSTICKVSYASLADVDKAVAAAKDAFENGE-WGRMNARERGRLMYRLADLLEENQEELAT
330 340 350 360 370 380
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 MESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPID----GNFFTYTRHEPIG
.:....: .:. : . .. ..:.:: ::: ::::: ::::. . .:.:..::.:
XP_016 IEALDSGAVYTLALKTHIGMSVQTFRYFAGWCDKIQGSTIPINQARPNRNLTFTKKEPLG
390 400 410 420 430 440
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 VCGQIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIKEAGFPPGVVNI
::. :::::.::.:: :: . :. :::.:.:::. ::::::. : : .:::: ::.::
XP_016 VCAIIIPWNYPLMMLAWKSAACLAAGNTLVLKPAQVTPLTALKFAELSVKAGFPKGVINI
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