Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0786
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0786, 457 aa
1>>>pF1KE0786 457 - 457 aa - 457 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5657+/-0.000975; mu= -10.0196+/- 0.059
mean_var=318.8447+/-65.068, 0's: 0 Z-trim(116.0): 121 B-trim: 6 in 1/50
Lambda= 0.071826
statistics sampled from 16456 (16577) to 16456 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.8), E-opt: 0.2 (0.509), width: 16
Scan time: 3.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4422.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 ( 457) 3252 350.2 2.7e-96
CCDS4423.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 ( 423) 2366 258.3 1.1e-68
CCDS4424.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 ( 222) 1305 148.2 7.9e-36
CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 727) 1030 120.0 8e-27
CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 617) 1028 119.8 8.1e-27
CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 732) 1028 119.8 9.3e-27
CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 271) 889 105.2 8.8e-23
CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 487) 889 105.3 1.4e-22
CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 596) 889 105.4 1.7e-22
CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 625) 889 105.4 1.8e-22
CCDS58917.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 483) 861 102.4 1.1e-21
CCDS47104.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 214) 580 73.1 3.2e-13
CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 444) 574 72.6 8.9e-13
CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 461) 574 72.7 9.2e-13
>>CCDS4422.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 (457 aa)
initn: 3252 init1: 3252 opt: 3252 Z-score: 1842.4 bits: 350.2 E(32554): 2.7e-96
Smith-Waterman score: 3252; 100.0% identity (100.0% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-457)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 YHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 HVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE0 WHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
430 440 450
>>CCDS4423.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 (423 aa)
initn: 2348 init1: 2348 opt: 2366 Z-score: 1346.7 bits: 258.3 E(32554): 1.1e-68
Smith-Waterman score: 2905; 91.5% identity (92.3% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
:::::::::::::::::::::::::::::::::...:
CCDS44 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKVQTP-----------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -----------DKQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 YHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTW
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 HVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFS
330 340 350 360 370 380
430 440 450
pF1KE0 WHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
390 400 410 420
>>CCDS4424.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 (222 aa)
initn: 1301 init1: 1301 opt: 1305 Z-score: 756.7 bits: 148.2 E(32554): 7.9e-36
Smith-Waterman score: 1305; 95.5% identity (96.5% similar) in 201 aa overlap (1-201:1-201)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARPFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 APPPADSAPQQNGQPLRPLVPDASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
:::::::::: . : .:
CCDS44 DPDEEHLKKSREKYVLELQSPRYTRLRDWHHQRSAHVLNVQS
190 200 210 220
>>CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 (727 aa)
initn: 1662 init1: 882 opt: 1030 Z-score: 595.0 bits: 120.0 E(32554): 8e-27
Smith-Waterman score: 1067; 39.3% identity (64.8% similar) in 412 aa overlap (86-455:318-724)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ENAGSLTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQPVQSKPQKASAP-AADPPRYTFAPSVSLNK
:....: :..: ::.:: : : ... .
CCDS73 QDPDEEALRRSSTPIEHAPVCTSQATTPLLPASAQPPAAASPSAASPPLATAAAHTAIAS
290 300 310 320 330 340
120 130 140 150 160
pF1KE0 TARPFGAPPPADSAPQQNGQPLRPLVP----DASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFR--
.. : :::: :. ... : : :.. :. :.: . . :.:
CCDS73 ASTTAPASSPADS-PRPQASSYSPAVAASSAPATHTSYSEGPAAPAPKPRVVTTASIRPS
350 360 370 380 390 400
170 180 190 200 210
pF1KE0 ILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASS-------TPQE-----PWPGPT--
. . .. . .: .. : .: : .:::: . ::. : :.:.
CCDS73 VYQPVPASTYSPSPGANY----SPTPYTPSPAPAYTPSPAPAYTPSPVPTYTPSPAPAYT
410 420 430 440 450 460
220 230 240 250
pF1KE0 ---------APS---------PTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTSTVLTRHSQP-ATPTPL
::: :.:::::..: .:....:: :..: ..... : . :.
CCDS73 PSPAPNYNPAPSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQKFAPGKSTTSISKQTLPRGGPAYT
470 480 490 500 510 520
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 QSRTSIVQAAAGGVPGGGS--NNGKTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGK
. .. : : : . ...::.: .:..:::: .:::.:...:::::.:. :
CCDS73 PAGPQVPPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKT
530 540 550 560 570 580
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 VLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIMHALKMTWHVHCFTCAACKTP
: . : ::.. ..: ::. .:: ::::. :: ::.::::..:::. ::.::::: :
CCDS73 SLADVCFVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVMHALRQTWHTTCFVCAACKKP
590 600 610 620 630 640
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 IRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFSWHDTCFVCAICQI
. : :.::.: ::::.:: ..:.:::::::: ..:::.:.:::: .::::::.::.:..
CCDS73 FGNSLFHMEDGEPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKFIEALGHTWHDTCFICAVCHV
650 660 670 680 690 700
440 450
pF1KE0 NLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
::::. :::::::::::.:: .
CCDS73 NLEGQPFYSKKDRPLCKKHAHTINL
710 720
>>CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 (617 aa)
initn: 1792 init1: 882 opt: 1028 Z-score: 595.0 bits: 119.8 E(32554): 8.1e-27
Smith-Waterman score: 1040; 38.2% identity (64.6% similar) in 432 aa overlap (51-455:190-614)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 GKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGSLTHIEAQNKIRACGERLSLG
:..:. . . :..::: . ... .
CCDS41 MYSQDAIMDAIAGQAQAQGSDFSGSLPIKDLAVDSASPVYQAVIKSQNKPEDEADEWA--
160 170 180 190 200 210
90 100 110 120 130
pF1KE0 LSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARP----FGAPPPADSAPQ-QNGQP
:.. .::. . : . .. :. . .:: .. :.::: ...
CCDS41 -RRSSNLQSRSFRILAQMTGT-EFMQDPDEEALRRSRPQASSYSPAVAASSAPATHTSYS
220 230 240 250 260 270
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 LRPLVPDASKQRLMENTEDWRP---RPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKS--
: .: : : :.. .: . :: .: ... : :. . : . .: . .
CCDS41 EGPAAP-APKPRVV-TTASIRPSVYQPVPASTYSPSPGANYSPTPYTPSPAPAYTPSPAP
280 290 300 310 320 330
200 210 220 230
pF1KE0 ----SQVPR-TEAPAPASSTPQEPWPGPTAPS---------PTSRPPWAVDPAFAERYAP
: :: : .:::: . : .: ::: :.:::::..: .:....::
CCDS41 AYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNP-APSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQKFAP
340 350 360 370 380 390
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DKTSTVLTRHSQP-ATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGS--NNGKTPVCHQCHKVIRGRY
:..: ..... : . :. . .. : : : . ...::.: .:..:::: .
CCDS41 GKSTTSISKQTLPRGGPAYTPAGPQVPPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPF
400 410 420 430 440 450
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIM
:::.:...:::::.:. : : . : ::.. ..: ::. .:: ::::. :: ::.:
CCDS41 LVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVM
460 470 480 490 500 510
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 HALKMTWHVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRF
:::..:::. ::.::::: :. : :.::.: ::::.:: ..:.:::::::: ..:::.:
CCDS41 HALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLFHMEDGEPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKF
520 530 540 550 560 570
420 430 440 450
pF1KE0 LEALGFSWHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
.:::: .::::::.::.:..::::. :::::::::::.:: .
CCDS41 IEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKKDRPLCKKHAHTINL
580 590 600 610
>>CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 (732 aa)
initn: 1764 init1: 882 opt: 1028 Z-score: 593.9 bits: 119.8 E(32554): 9.3e-27
Smith-Waterman score: 1040; 38.2% identity (64.6% similar) in 432 aa overlap (51-455:305-729)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 GKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGSLTHIEAQNKIRACGERLSLG
:..:. . . :..::: . ... .
CCDS53 MYSQDAIMDAIAGQAQAQGSDFSGSLPIKDLAVDSASPVYQAVIKSQNKPEDEADEWA--
280 290 300 310 320 330
90 100 110 120 130
pF1KE0 LSRAQPVQSKPQKASAPAADPPRYTFAPSVSLNKTARP----FGAPPPADSAPQ-QNGQP
:.. .::. . : . .. :. . .:: .. :.::: ...
CCDS53 -RRSSNLQSRSFRILAQMTGT-EFMQDPDEEALRRSRPQASSYSPAVAASSAPATHTSYS
340 350 360 370 380 390
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 LRPLVPDASKQRLMENTEDWRP---RPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKS--
: .: : : :.. .: . :: .: ... : :. . : . .: . .
CCDS53 EGPAAP-APKPRVV-TTASIRPSVYQPVPASTYSPSPGANYSPTPYTPSPAPAYTPSPAP
400 410 420 430 440
200 210 220 230
pF1KE0 ----SQVPR-TEAPAPASSTPQEPWPGPTAPS---------PTSRPPWAVDPAFAERYAP
: :: : .:::: . : .: ::: :.:::::..: .:....::
CCDS53 AYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNP-APSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQKFAP
450 460 470 480 490 500
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DKTSTVLTRHSQP-ATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGS--NNGKTPVCHQCHKVIRGRY
:..: ..... : . :. . .. : : : . ...::.: .:..:::: .
CCDS53 GKSTTSISKQTLPRGGPAYTPAGPQVPPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPF
510 520 530 540 550 560
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKKITGEIM
:::.:...:::::.:. : : . : ::.. ..: ::. .:: ::::. :: ::.:
CCDS53 LVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVM
570 580 590 600 610 620
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 HALKMTWHVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRF
:::..:::. ::.::::: :. : :.::.: ::::.:: ..:.:::::::: ..:::.:
CCDS53 HALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLFHMEDGEPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKF
630 640 650 660 670 680
420 430 440 450
pF1KE0 LEALGFSWHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
.:::: .::::::.::.:..::::. :::::::::::.:: .
CCDS53 IEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKKDRPLCKKHAHTINL
690 700 710 720 730
>>CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 (271 aa)
initn: 1129 init1: 871 opt: 889 Z-score: 522.5 bits: 105.2 E(32554): 8.8e-23
Smith-Waterman score: 889; 46.5% identity (73.3% similar) in 258 aa overlap (199-455:26-268)
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ILAHLTGTEFMQDPDEEHLKKSSQVPRTEAPAPASSTPQEP-WPGPTAPSPTSRPPWAVD
:. .... . : : :. :.. . .
CCDS75 MPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPST-GRISNS
10 20 30 40 50
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 PAFAERYAPDKTSTVLTRHSQPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNGKTPVCHQCHK
... :: ... ..::. .. ..:: : .:.: .::.: .:..
CCDS75 ATYSGSVAPANSAL---GQTQPS------DQDTLVQRAEH-IPAGK----RTPMCAHCNQ
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290 300 310 320 330 340
pF1KE0 VIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYAPSCAKCKKK
:::: .:::::...::::: :..: ... :: :::::..: ::. .:: :..:..:
CCDS75 VIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRK
110 120 130 140 150 160
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 ITGEIMHALKMTWHVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKI
: ::.. :::.:::: ::.:.:: :::: .:..:.: :::: :: .::: ::::.: :
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.::: ::::::..::::::::..: .:::.::.::::.::::.:: :
CCDS75 EAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
230 240 250 260 270
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:....: : ::::::::::::::::.::.:: : :::::::.: .:: :::::: :: .
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.::.::::::..: :.. :.:: .. :. .:. . : : . : . .. :.
CCDS47 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRA---SAAPKPEPVPV-QKPTVTSVCSETSQELAEGQR
70 80 90 100 110
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.:: :::: : . .: : ::::.::.:.::::::: :: ::::::
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. . : . : .. :. : .: .: .: : . .:.: ..: :
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.::.: .:..:::: .:::::...::::: :..: ... :: ::
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:::..: ::. .:: :..:..:: ::.. :::.:::: ::.:.:: :::: .:..:.
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pF1KE0 GVPYCERDYEKMFGTKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFSWHDTCFVCAICQINLEGKTFYSK
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CCDS47 GEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSK
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450
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CCDS47 KDKPLCKKHAHSVNF
480
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10 20 30
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.... .. . . :.: : .:. . :: : . : : .: .:. .
CCDS36 TTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLHANANLSADQSPSALSAGKT-AVNVPRQPTVTSVCS
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. . . . . .. ..:: . . . : ::::.::.:.:::::::
CCDS36 ETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPR
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:: :::::::::..:::: ... . .. ::. :: : . . ..:: . : .
CCDS36 TGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMP---ESLD
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:::: : ... . : . : .. :. : .: .: .: : . .:.: ..:
CCDS36 SPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANS
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: .::.: .:..:::: .:::::...::::: :..: .
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.. :: :::::..: ::. .:: :..:..:: ::.. :::.:::: ::.:.:: :
CCDS36 TMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKP
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::: .:..:.: :::: :: .::: ::::.: :.::: ::::::..::::::::..:
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pF1KE0 NLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
.:::.::.::::.::::.:: :
CCDS36 SLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
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. :::: : ... . : . : .. :. : .: .: .: : . .:.:
CCDS58 SLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAP
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..: : .::.: .:..:::: .:::::...::::: :..
CCDS58 ANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAH
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CCDS58 GKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSV
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CCDS58 CCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
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CCDS58 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
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CCDS58 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRAS---AAPKPEPVPV-QKPTVTSVCSETSQELAEGQR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]