Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0763
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0763, 337 aa
1>>>pF1KE0763 337 - 337 aa - 337 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9390+/-0.00166; mu= -13.4728+/- 0.092
mean_var=425.4160+/-97.609, 0's: 0 Z-trim(104.6): 248 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.062182
statistics sampled from 7807 (8007) to 7807 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 2.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13 ( 337) 2250 217.0 1.8e-56
CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 337) 2084 202.1 5.4e-52
CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 325) 2037 197.9 9.7e-51
CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22 ( 416) 1519 151.5 1.1e-36
CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 ( 409) 1517 151.3 1.3e-36
CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 ( 415) 1517 151.3 1.3e-36
CCDS47304.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 ( 365) 1169 120.1 2.9e-27
CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 424) 1095 113.5 3.2e-25
CCDS4135.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 447) 1085 112.6 6.2e-25
CCDS43355.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 455) 1085 112.6 6.3e-25
CCDS34218.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 423) 1084 112.5 6.3e-25
CCDS10192.2 CSNK1G1 gene_id:53944|Hs108|chr15 ( 422) 1069 111.2 1.6e-24
CCDS12077.1 CSNK1G2 gene_id:1455|Hs108|chr19 ( 415) 1058 110.2 3.1e-24
CCDS59492.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 348) 967 101.9 8e-22
CCDS59493.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 ( 311) 897 95.6 5.8e-20
>>CCDS9363.1 CSNK1A1L gene_id:122011|Hs108|chr13 (337 aa)
initn: 2250 init1: 2250 opt: 2250 Z-score: 1127.5 bits: 217.0 E(32554): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 2250; 99.4% identity (100.0% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEEVAVKLESQKVKHPQLLYE
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CCDS93 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEDVAVKLESQKVKHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLKAMTKKQKYEKISEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS93 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLRAMTKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE0 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
310 320 330
>>CCDS47303.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (337 aa)
initn: 2139 init1: 2075 opt: 2084 Z-score: 1047.0 bits: 202.1 E(32554): 5.4e-52
Smith-Waterman score: 2084; 91.6% identity (97.9% similar) in 335 aa overlap (1-335:1-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEEVAVKLESQKVKHPQLLYE
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CCDS47 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
:::: ::::::::::..::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
::::::::::::.:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS47 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLKAMTKKQKYEKISEKK
: ::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS47 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE0 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
::::::::::::::::::::: :::::.:.:.:.:
CCDS47 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKSNMKGF
310 320 330
>>CCDS64291.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (325 aa)
initn: 2037 init1: 2037 opt: 2037 Z-score: 1024.4 bits: 197.9 E(32554): 9.7e-51
Smith-Waterman score: 2037; 92.6% identity (97.8% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEEVAVKLESQKVKHPQLLYE
:...::::::..::::::::::::::::::.::.:. ::::::::::::::..:::::::
CCDS64 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
:::: ::::::::::..::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
::::::::::::.:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS64 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLKAMTKKQKYEKISEKK
: ::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS64 LTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLMYFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE0 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
::::::::::::::::::::: ::
CCDS64 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGF
310 320
>>CCDS13970.1 CSNK1E gene_id:1454|Hs108|chr22 (416 aa)
initn: 1519 init1: 1519 opt: 1519 Z-score: 771.9 bits: 151.5 E(32554): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 1519; 72.5% identity (89.6% similar) in 298 aa overlap (10-307:2-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEEVAVKLESQKVKHPQLLYE
:: ::.::.: ::::::::::.::: . ..:::::.::: :.::::: :
CCDS13 MELRVGNKYRLGRKIGSGSFGDIYLGANIASGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::.: ..::::::: ..: : : : ::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS13 SKFYKMMQGGVGIPSIKWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
::::::.:.:::.:::.:::::::: :.. : ...::::::::::: ::.:::::::.:.
CCDS13 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLKAMTKKQKYEKISEKK
: ::.::::::.:::::::::::.::::::.:::: ::::::::: ::.::::.:::::
CCDS13 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::.::::::.:.::. :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS13 MSTPIEVLCKGYPSEFSTYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE0 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
:: ::.
CCDS13 LKFGAARNPEDVDRERREHEREERMGQLRGSATRALPPGPPTGATANRLRSAAEPVASTP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS11806.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 (409 aa)
initn: 1512 init1: 1512 opt: 1517 Z-score: 771.1 bits: 151.3 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 1517; 72.0% identity (88.7% similar) in 300 aa overlap (10-309:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEEVAVKLESQKVKHPQLLYE
:: ::..:.: ::::::::::.::: . :::::.::: :.::::: :
CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::.: ..::::::: ..: : : : ::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS11 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
::::::.:.:::.:::.:::::::: :.. : ...::::::::::: ::.:::::::.:.
CCDS11 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLKAMTKKQKYEKISEKK
: ::.::::::.:::::::::::.::::::.:::: ::::::::: ::.::::.:::::
CCDS11 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS11 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE0 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
:: :.. :
CCDS11 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
300 310 320 330 340 350
>>CCDS11805.1 CSNK1D gene_id:1453|Hs108|chr17 (415 aa)
initn: 1512 init1: 1512 opt: 1517 Z-score: 771.0 bits: 151.3 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 1517; 72.0% identity (88.7% similar) in 300 aa overlap (10-309:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEEVAVKLESQKVKHPQLLYE
:: ::..:.: ::::::::::.::: . :::::.::: :.::::: :
CCDS11 MELRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
::.: ..::::::: ..: : : : ::.::.:::::::::::::::.:..::::.:::::
CCDS11 SKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNKLFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKH
::::::.:.:::.:::.:::::::: :.. : ...::::::::::: ::.:::::::.:.
CCDS11 ISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFMYFNRTSLPWQGLKAMTKKQKYEKISEKK
: ::.::::::.:::::::::::.::::::.:::: ::::::::: ::.::::.:::::
CCDS11 LTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVPDYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTM
::::.::::::.:.::: :::.::.:::.. ::: ::::::: ::. . .:::.:::.:
CCDS11 MSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNM
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE0 LKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKNNVKDN
:: :.. :
CCDS11 LKFGASRAADDAERERRDREERLRHSRNPATRGLPSTASGRLRGTQEVAPPTPLTPTSHT
300 310 320 330 340 350
>>CCDS47304.1 CSNK1A1 gene_id:1452|Hs108|chr5 (365 aa)
initn: 2139 init1: 1160 opt: 1169 Z-score: 602.9 bits: 120.1 E(32554): 2.9e-27
Smith-Waterman score: 2018; 84.6% identity (90.4% similar) in 363 aa overlap (1-335:1-363)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLGITTTNGEEVAVKLESQKVKHPQLLYE
:...::::::..::::::::::::::::::.::.:. ::::::::::::::..:::::::
CCDS47 MASSSGSKAEFIVGGKYKLVRKIGSGSFGDIYLAINITNGEEVAVKLESQKARHPQLLYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SKLYTILQGGVGIPHMHWYGQEKDNNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
:::: ::::::::::..::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKLYKILQGGVGIPHIRWYGQEKDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRRFTMKTVLMLADQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150
pF1KE0 ISRIEYVHTKNFLHRDIKPDNFLMGTGRHCNK----------------------------
::::::::::::.:::::::::::: ::::::
CCDS47 ISRIEYVHTKNFIHRDIKPDNFLMGIGRHCNKCLESPVGKRKRSMTVSTSQDPSFSGLNQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKHLIGTVRYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVFM
:::::::::::::::::::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::.:
CCDS47 LFLIDFGLAKKYRDNRTRQHIPYREDKNLTGTARYASINAHLGIEQSRRDDMESLGYVLM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 YFNRTSLPWQGLKAMTKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEVP
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS47 YFNRTSLPWQGLKAATKKQKYEKISEKKMSTPVEVLCKGFPAEFAMYLNYCRGLRFEEAP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 DYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTQTGKQTEKNKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:.:.
CCDS47 DYMYLRQLFRILFRTLNHQYDYTFDWTMLKQKAAQQAASSSGQGQQAQTPTGKQTDKTKS
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 NVKDN
:.:
CCDS47 NMKGF
>>CCDS59491.1 CSNK1G3 gene_id:1456|Hs108|chr5 (424 aa)
initn: 1101 init1: 612 opt: 1095 Z-score: 566.3 bits: 113.5 E(32554): 3.2e-25
Smith-Waterman score: 1095; 51.2% identity (75.3% similar) in 336 aa overlap (5-331:31-363)
10 20 30
pF1KE0 MTNNSGSKAELVVGGKYKLVRKIGSGSFGDVYLG
:.:.. :.:: .... .::: :.::.. ::
CCDS59 MENKKKDKDKSDDRMARPSGRSGHNTRGTGSSSSGVLMVGPNFRVGKKIGCGNFGELRLG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]