Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0762
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0762, 436 aa
1>>>pF1KE0762 436 - 436 aa - 436 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6895+/-0.00126; mu= 10.9730+/- 0.073
mean_var=251.6850+/-57.185, 0's: 0 Z-trim(106.8): 691 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.080844
statistics sampled from 8392 (9188) to 8392 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 2886 350.8 1.6e-96
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 895 119.1 1.9e-26
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 875 117.0 1.2e-25
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 866 115.6 1.8e-25
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 866 115.6 1.8e-25
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 863 115.2 2.3e-25
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 863 115.2 2.3e-25
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 863 115.2 2.3e-25
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 862 115.0 2.4e-25
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 862 115.0 2.4e-25
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 862 115.0 2.4e-25
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 862 115.1 2.4e-25
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 862 115.1 2.5e-25
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 855 114.2 4.2e-25
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 855 114.2 4.3e-25
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 855 114.3 4.3e-25
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 853 114.0 4.8e-25
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 853 114.0 5.1e-25
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 852 113.9 5.3e-25
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 834 112.1 3.1e-24
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 747 101.7 2.7e-21
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 714 97.6 3.3e-20
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 708 96.9 5.3e-20
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 681 93.8 4.9e-19
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 681 93.9 5.1e-19
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 682 94.1 5.2e-19
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 676 93.3 7.8e-19
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 676 93.3 7.8e-19
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 676 93.4 8.2e-19
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 649 90.2 6.9e-18
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 643 89.4 1.1e-17
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 639 89.1 1.7e-17
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 601 84.6 3.6e-16
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 593 83.7 6.6e-16
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 567 80.3 4.1e-15
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 569 80.8 4.3e-15
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 561 79.5 6.1e-15
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 554 79.0 1.4e-14
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 552 78.6 1.5e-14
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 549 78.1 1.6e-14
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 548 78.0 1.8e-14
CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 ( 358) 535 76.4 5e-14
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 532 76.2 6.9e-14
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 533 76.6 8e-14
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 520 74.7 1.7e-13
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 520 74.7 1.7e-13
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 513 73.8 2.9e-13
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 513 73.9 2.9e-13
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 510 73.3 3.2e-13
CCDS75250.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 ( 671) 516 74.6 3.2e-13
>>CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 (436 aa)
initn: 2886 init1: 2886 opt: 2886 Z-score: 1846.5 bits: 350.8 E(32554): 1.6e-96
Smith-Waterman score: 2886; 100.0% identity (100.0% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTAVYMNGGGLVNPHYARWDRRDSVESGCQTESSKEGEEGQPRQLTPFEKLTQDMSQDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MTAVYMNGGGLVNPHYARWDRRDSVESGCQTESSKEGEEGQPRQLTPFEKLTQDMSQDEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VVREITLGKRIGFYRIRGEIGSGNFSQVKLGIHSLTKEKVAIKILDKTKLDQKTQRLLSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VVREITLGKRIGFYRIRGEIGSGNFSQVKLGIHSLTKEKVAIKILDKTKLDQKTQRLLSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EISSMEKLHHPNIIRLYEVVETLSKLHLVMEYAGGGELFGKISTEGKLSEPESKLIFSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 EISSMEKLHHPNIIRLYEVVETLSKLHLVMEYAGGGELFGKISTEGKLSEPESKLIFSQI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VSAVKHMHENQIIHRDLKAENVFYTSNTCVKVGDFGFSTVSKKGEMLNTFCGSPPYAAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VSAVKHMHENQIIHRDLKAENVFYTSNTCVKVGDFGFSTVSKKGEMLNTFCGSPPYAAPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LFRDEHYIGIYVDIWALGVLLYFMVTGTMPFRAETVAKLKKSILEGTYSVPPHVSEPCHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LFRDEHYIGIYVDIWALGVLLYFMVTGTMPFRAETVAKLKKSILEGTYSVPPHVSEPCHR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LIRGVLQQIPTERYGIDCIMNDEWMQGVPYPTPLEPFQLDPKHLSETSTLKEEENEVKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LIRGVLQQIPTERYGIDCIMNDEWMQGVPYPTPLEPFQLDPKHLSETSTLKEEENEVKST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LEHLGITEEHIRNNQGRDARSSITGVYRIILHRVQRKKALESVPVMMLPDPKERDLKKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LEHLGITEEHIRNNQGRDARSSITGVYRIILHRVQRKKALESVPVMMLPDPKERDLKKGS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE0 RVYRGIRHTSKFCSIL
::::::::::::::::
CCDS39 RVYRGIRHTSKFCSIL
430
>>CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 (926 aa)
initn: 837 init1: 837 opt: 895 Z-score: 588.3 bits: 119.1 E(32554): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 895; 40.5% identity (71.1% similar) in 346 aa overlap (70-414:16-355)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GQPRQLTPFEKLTQDMSQDEKVVREITLGKRIGFYRIRGEIGSGNFSQVKLGIHSLTKEK
:.::: :.: .:.:::. :::: : .:: .
CCDS83 MVMADGPRHLQRGPVRVGFYDIEGTLGKGNFAVVKLGRHRITKTE
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 VAIKILDKTKLDQKTQRLLSREISSMEKLHHPNIIRLYEVVETLSKLHLVMEYAGGGELF
:::::.::..:: . . . ::.. :. : ::.::.::.:.:: : :.:: ::: .::.:
CCDS83 VAIKIIDKSQLDAVNLEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYLVTEYAKNGEIF
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GKISTEGKLSEPESKLIFSQIVSAVKHMHENQIIHRDLKAENVFYTSNTCVKVGDFGFST
....:.:.: :.. : ::.::: . : .:.::::::::.. .: .:..::::..
CCDS83 DYLANHGRLNESEARRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNMNIKIADFGFGN
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 VSKKGEMLNTFCGSPPYAAPELFRDEHYIGIYVDIWALGVLLYFMVTGTMPFRAETVAKL
:.::.: :.::::::::::.:. ..: : .:::..::.:: .: :..:: . :. :
CCDS83 FFKSGELLATWCGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGALPFDGPTLPIL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 KKSILEGTYSVPPHVSEPCHRLIRGVLQQIPTERYGIDCIMNDEWMQ-GVPYPTPLEPFQ
.. .::: . .: .:: :..::: .: :..: : : . .:: :: :.
CCDS83 RQRVLEGRFRIPYFMSEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPV----
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 LDPKHLSETSTLKEEENEVKSTLEHLGITEEHIRNNQGRDARSSITGVYRIILHRVQRKK
: :.. . .. : ...: .. ::: ... .. . . ....: ....:.. ..
CCDS83 LYPQEQENEPSIGEFNEQVLRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYFLLVERLKSHR
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430
pF1KE0 ALESVPVMMLPDPKERDLKKGSRVYRGIRHTSKFCSIL
. : :: . : ..:
CCDS83 S--SFPVEQRLDGRQRRPSTIAEQTVAKAQTVGLPVTMHSPNMRLLRSALLPQASNVEAF
350 360 370 380 390
>>CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321 aa)
initn: 871 init1: 871 opt: 875 Z-score: 574.2 bits: 117.0 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 875; 40.6% identity (72.1% similar) in 340 aa overlap (70-406:62-400)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GQPRQLTPFEKLTQDMSQDEKVVREITLGKRIGFYRIRGEIGSGNFSQVKLGIHSLTKEK
:::.:.: ::.:::. :: . : .:: :
CCDS83 PGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARIGYYEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAK
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 VAIKILDKTKLDQKTQRLLSREISSMEKLHHPNIIRLYEVVETLSKLHLVMEYAGGGELF
:::::.:::.::... . . ::.. :. : ::.:::::.:.:: ..:: :::.:::.:
CCDS83 VAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIF
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GKISTEGKLSEPESKLIFSQIVSAVKHMHENQIIHRDLKAENVFYTSNTCVKVGDFGFST
.. ..:...: :.. :.:::.:: : .:.::::::::.. .: .:..:::::.
CCDS83 DHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSN
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 VSKKGEMLNTFCGSPPYAAPELFRDEHYIGIYVDIWALGVLLYFMVTGTMPFRAETVAKL
. :..:.:.::::::::::::. ..: : ::::.:::.:: .: :..:: . :. .:
CCDS83 LFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNL
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 KKSILEGTYSVPPHVSEPCHRLIRGVLQQIPTERYGIDCIMNDEWMQ-GVPYPTPLEPFQ
. .: : . .: .: :..::: .: :..: ... : . .::. : :. .. .
CCDS83 RARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPN-FDRLI
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 LDPKHLSETSTLKEEENEVKSTLEHLGITEEHIRNNQGRDARSSITGVYRIILHRVQRKK
. ..:.: . ...: ..: .:. .:. .. :: . ...: .. : .:.:
CCDS83 AECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHK
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430
pF1KE0 ALE--SVPVMMLPDPKERDLKKGSRVYRGIRHTSKFCSIL
.:. ..: :
CCDS83 TLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDE
400 410 420 430 440 450
>>CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 (783 aa)
initn: 809 init1: 809 opt: 866 Z-score: 570.7 bits: 115.6 E(32554): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 866; 39.6% identity (72.6% similar) in 351 aa overlap (70-416:23-369)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GQPRQLTPFEKLTQDMSQDEKVVREITLGKRIGFYRIRGEIGSGNFSQVKLGIHSLTKEK
:.::: :. .:.:::. :::. : .:: .
CCDS33 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAVVKLARHRVTKTQ
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 VAIKILDKTKLDQKTQRLLSREISSMEKLHHPNIIRLYEVVETLSKLHLVMEYAGGGELF
:::::.:::.::... . . ::.. :. :.::.::.::.:.:: . :..: :.: .::.:
CCDS33 VAIKIIDKTRLDSSNLEKIYREVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKDMLYIVTEFAKNGEMF
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GKISTEGKLSEPESKLIFSQIVSAVKHMHENQIIHRDLKAENVFYTSNTCVKVGDFGFST
....:.::: :.. : ::.:::.. :...:.:::::.::.. .: .:..::::..
CCDS33 DYLTSNGHLSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLLDGNMDIKLADFGFGN
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 VSKKGEMLNTFCGSPPYAAPELFRDEHYIGIYVDIWALGVLLYFMVTGTMPFRAETVAKL
:.:: :.:.::::::::::.:. ..: : .:::.:::.:: .: :..:: . .. :
CCDS33 FYKSGEPLSTWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCGSLPFDGPNLPTL
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 KKSILEGTYSVPPHVSEPCHRLIRGVLQQIPTERYGIDCIMNDEWMQGVP-YPTPLEP-F
.. .::: . .: .:. :. ::: .: :..: : : . .::.. : : : : :
CCDS33 RQRVLEGRFRIPFFMSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMRAEPCLPGPACPAF
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 QLDPKHLSETSTLKEEENEVKSTLEHLGITEEHIRNNQGRDARSSITGVYRIILHRVQR-
. : : ::.: . .... . .. ::. ... .. .. . ....: ..:.:...
CCDS33 S---AH-SYTSNLGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFAAIYYLLLERLKEY
300 310 320 330 340
400 410 420 430
pF1KE0 KKALESVP-VMMLPDPKERDLKKGSRVYRGIRHTSKFCSIL
..: . : : :. ::
CCDS33 RNAQCARPGPARQPRPRSSDLSGLEVPQEGLSTDPFRPALLCPQPQTLVQSVLQAEMDCE
350 360 370 380 390 400
>>CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|chr21 (783 aa)
initn: 809 init1: 809 opt: 866 Z-score: 570.7 bits: 115.6 E(32554): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 866; 39.6% identity (72.6% similar) in 351 aa overlap (70-416:23-369)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 GQPRQLTPFEKLTQDMSQDEKVVREITLGKRIGFYRIRGEIGSGNFSQVKLGIHSLTKEK
:.::: :. .:.:::. :::. : .:: .
CCDS82 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAVVKLARHRVTKTQ
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 VAIKILDKTKLDQKTQRLLSREISSMEKLHHPNIIRLYEVVETLSKLHLVMEYAGGGELF
:::::.:::.::... . . ::.. :. :.::.::.::.:.:: . :..: :.: .::.:
CCDS82 VAIKIIDKTRLDSSNLEKIYREVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKDMLYIVTEFAKNGEMF
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GKISTEGKLSEPESKLIFSQIVSAVKHMHENQIIHRDLKAENVFYTSNTCVKVGDFGFST
....:.::: :.. : ::.:::.. :...:.:::::.::.. .: .:..::::..
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436 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]