Result of FASTA (omim) for
pF1KE0758
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0758, 432 aa
1>>>pF1KE0758 432 - 432 aa - 432 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3722+/-0.000734; mu= 14.1225+/- 0.045
mean_var=275.5480+/-54.013, 0's: 0 Z-trim(113.5): 2080 B-trim: 87 in 1/53
Lambda= 0.077264
statistics sampled from 20493 (22806) to 20493 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 8.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1230 151.7 4.7e-36
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1205 148.9 3.3e-35
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1205 148.9 3.3e-35
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1205 149.0 3.3e-35
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1205 149.0 3.4e-35
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1205 149.0 3.4e-35
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1205 149.0 3.5e-35
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1205 149.0 3.5e-35
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1205 149.0 3.5e-35
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1205 149.0 3.5e-35
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1205 149.0 3.5e-35
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 1187 146.9 1.3e-34
XP_016869365 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1171 145.0 4.1e-34
XP_011515622 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1171 145.0 4.1e-34
NP_001273699 (OMIM: 194526) zinc finger protein 34 ( 520) 1171 145.0 4.2e-34
NP_998763 (OMIM: 616847) zinc finger protein 543 [ ( 600) 1166 144.6 6.7e-34
XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 1165 144.4 6.9e-34
XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 1165 144.4 6.9e-34
XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 1165 144.4 6.9e-34
NP_003399 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ho ( 630) 1161 144.1 1e-33
NP_001269447 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 631) 1161 144.1 1e-33
NP_001269444 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 645) 1161 144.1 1e-33
NP_001243454 (OMIM: 194548) zinc finger protein 74 ( 573) 1157 143.5 1.3e-33
NP_003417 (OMIM: 194548) zinc finger protein 74 is ( 644) 1157 143.6 1.4e-33
NP_001243453 (OMIM: 194548) zinc finger protein 74 ( 644) 1157 143.6 1.4e-33
XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1154 143.1 1.5e-33
NP_001309189 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1154 143.1 1.5e-33
NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1154 143.1 1.5e-33
NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1154 143.1 1.5e-33
NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 is ( 498) 1154 143.1 1.5e-33
NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 364) 1152 142.6 1.5e-33
NP_001284554 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 458) 1152 142.8 1.7e-33
NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 492) 1152 142.9 1.8e-33
NP_653285 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 i ( 535) 1152 142.9 1.9e-33
XP_011524767 (OMIM: 613910) PREDICTED: zinc finger ( 535) 1152 142.9 1.9e-33
XP_011524764 (OMIM: 616798) PREDICTED: zinc finger ( 771) 1151 143.1 2.4e-33
XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 489) 1148 142.4 2.4e-33
NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger p ( 489) 1148 142.4 2.4e-33
XP_011524765 (OMIM: 616798) PREDICTED: zinc finger ( 859) 1151 143.2 2.5e-33
NP_065879 (OMIM: 616798) zinc finger protein 28 ho ( 868) 1151 143.2 2.5e-33
XP_011515620 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1147 142.4 2.7e-33
NP_001273698 (OMIM: 194526) zinc finger protein 34 ( 539) 1147 142.4 2.7e-33
XP_011515618 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1147 142.4 2.7e-33
XP_011515617 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1147 142.4 2.7e-33
XP_016869364 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1147 142.4 2.7e-33
XP_011515616 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1147 142.4 2.8e-33
NP_085057 (OMIM: 194526) zinc finger protein 34 is ( 560) 1147 142.4 2.8e-33
XP_016869362 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1147 142.4 2.8e-33
XP_016869363 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1147 142.4 2.8e-33
XP_016869361 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1147 142.4 2.8e-33
>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa)
initn: 7733 init1: 1118 opt: 1230 Z-score: 768.2 bits: 151.7 E(85289): 4.7e-36
Smith-Waterman score: 1230; 45.7% identity (66.8% similar) in 431 aa overlap (1-423:33-448)
10 20 30
pF1KE0 MLENYGNLVSVGCQLSKPGVISQLEKGEEP
::::: ::: .: .::: .:. ::.:.:
NP_003 PLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 WLMERDISGVPSSDLKSKTKTKESALQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKC
: :.: : .: . : . .:. : : . : : . :: : .::
NP_003 WSMKRHEIMV------AKPTVMCSHFAQDL-WPEQN--------IKDSFQKVTLKRYGKC
70 80 90 100
100 110 120 130 140
pF1KE0 NK--------LESQQENQRMGKGQIPLMCKKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIG
. ::..: . : : : :: . . ... : . :. :
NP_003 RHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIR
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 LPRKRDRKYDTPGKRSRYNIDLVNHSRSYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGE
.:. : :: . :..::: .:... ..:. : : :. ::.: ::::::
NP_003 HTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGE
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 KPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYE
::..:.::::::.:::.:: :..::::::::.:.:::::: . :.:: : ::::::::.
NP_003 KPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYK
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 CRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFTCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVC
:. : :::..: : : . :. :::. :..::::: : .: :.::::: ::: :. :
NP_003 CKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKC
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 SKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECGKAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAF
.:.:..:..:: :. ::::.::::..:::::.. ::. :. .::: :::.:..:::::
NP_003 GKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAF
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KE0 RHDSSFAKHQRIHTGEKPYDCNECGKAFSCSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
.:.:...::. :::::::: :.:: :::. ::.: .: : :
NP_003 KHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSS
410 420 430 440 450 460
NP_003 NLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTK
470 480 490 500 510 520
>--
initn: 614 init1: 614 opt: 614 Z-score: 397.1 bits: 83.0 E(85289): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 614; 57.6% identity (79.9% similar) in 144 aa overlap (200-343:449-592)
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTG
:::::..:..:::::.:::.: :.. ::
NP_003 IHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTE
420 430 440 450 460 470
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 EKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPF
::::.:.:::: :. ::.:: : ::::::::.:. : :::.:: : .: . :. :::.
NP_003 EKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPY
480 490 500 510 520 530
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKE
::..::::: : .: .:. :::: ::: :. :.:.:. :. ::.:. ::::.
NP_003 TCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
540 550 560 570 580 590
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 CGKAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHDSSFAKHQRIHTGEKPYDCNECGKA
>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
initn: 5695 init1: 1205 opt: 1205 Z-score: 753.0 bits: 148.9 E(85289): 3.3e-35
Smith-Waterman score: 1228; 51.5% identity (70.8% similar) in 342 aa overlap (86-423:173-502)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKCNKLESQQ----ENQRMGKGQIPLMC
. ..:.: :.. :..: :. : :
NP_001 QSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYEC
150 160 170 180 190 200
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pF1KE0 KKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIGLPRKRDRKYDTPGKRSRYNIDLVNHSRSY
.. . :.. . ..::.. .. : :. :..:.:..
NP_001 HECLKGFRNSSALTKHQRIHTG------------EKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
210 220 230 240 250
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 TKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEK
: : .::. : : :. ...: : ::::::..:.:::::: :: : : :::::::
NP_001 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFTC
::.: ::::.: : ::::.: :::::::::::. : :::.: :::: :::. :::. :
NP_001 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECG
.::::: : : .:. :::: ::: :: :.::::::. :.::.::::::.::.:..::
NP_001 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHDSSFAKHQRIHTGEKPYDCNECGKAFS
::: : ::. :::.::: :::::. ::::: :.::..::::::::::::.::.::.:::
NP_001 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
440 450 460 470 480 490
420 430
pF1KE0 CSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
. ::.: . :
NP_001 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
500 510 520 530 540 550
>--
initn: 541 init1: 541 opt: 541 Z-score: 353.0 bits: 74.9 E(85289): 6.3e-13
Smith-Waterman score: 541; 64.0% identity (78.9% similar) in 114 aa overlap (200-313:503-616)
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTG
:::::..:..::.:::::: :: ::::::
NP_001 IHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTK
480 490 500 510 520 530
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 EKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPF
:::: :.::::.: : :::.:: : :::::::::. : :.: :: : :: : :. :::.
NP_001 EKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPY
540 550 560 570 580 590
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKE
.:.:::::: . : .:. :::
NP_001 ACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
600 610
>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (621 aa)
initn: 5695 init1: 1205 opt: 1205 Z-score: 753.0 bits: 148.9 E(85289): 3.3e-35
Smith-Waterman score: 1228; 51.5% identity (70.8% similar) in 342 aa overlap (86-423:178-507)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKCNKLESQQ----ENQRMGKGQIPLMC
. ..:.: :.. :..: :. : :
XP_016 QSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYEC
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIGLPRKRDRKYDTPGKRSRYNIDLVNHSRSY
.. . :.. . ..::.. .. : :. :..:.:..
XP_016 HECLKGFRNSSALTKHQRIHTG------------EKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
210 220 230 240 250
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 TKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEK
: : .::. : : :. ...: : ::::::..:.:::::: :: : : :::::::
XP_016 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFTC
::.: ::::.: : ::::.: :::::::::::. : :::.: :::: :::. :::. :
XP_016 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECG
.::::: : : .:. :::: ::: :: :.::::::. :.::.::::::.::.:..::
XP_016 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHDSSFAKHQRIHTGEKPYDCNECGKAFS
::: : ::. :::.::: :::::. ::::: :.::..::::::::::::.::.::.:::
XP_016 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
440 450 460 470 480 490
420 430
pF1KE0 CSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
. ::.: . :
XP_016 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
500 510 520 530 540 550
>--
initn: 541 init1: 541 opt: 541 Z-score: 353.0 bits: 74.9 E(85289): 6.4e-13
Smith-Waterman score: 541; 64.0% identity (78.9% similar) in 114 aa overlap (200-313:508-621)
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTG
:::::..:..::.:::::: :: ::::::
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. ..:.: :.. :..: :. : :
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: : .::. : : :. ...: : ::::::..:.:::::: :: : : :::::::
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. ..:.: :.. :..: :. : :
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XP_016 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
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pF1KE0 CSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
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pF1KE0 SYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTG
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XP_016 IHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTK
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pF1KE0 EKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPF
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XP_016 EKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPY
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pF1KE0 TCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKE
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XP_016 ACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650
>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (658 aa)
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pF1KE0 LQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKCNKLESQQ----ENQRMGKGQIPLMC
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NP_001 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
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420 430
pF1KE0 CSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
. ::.: . :
NP_001 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
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pF1KE0 SYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTG
:::::..:..::.:::::: :: ::::::
NP_001 IHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTK
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pF1KE0 EKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPF
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NP_001 EKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPY
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pF1KE0 TCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKE
.:.:::::: . : .:. :::
NP_001 ACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650
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pF1KE0 LQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKCNKLESQQ----ENQRMGKGQIPLMC
. ..:.: :.. :..: :. : :
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.. . :.. . ..::.. .. : :. :..:.:..
NP_003 HECLKGFRNSSALTKHQRIHTG------------EKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
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pF1KE0 TKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEK
: : .::. : : :. ...: : ::::::..:.:::::: :: : : :::::::
NP_003 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFTC
::.: ::::.: : ::::.: :::::::::::. : :::.: :::: :::. :::. :
NP_003 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
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300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECG
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NP_003 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
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NP_003 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
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pF1KE0 CSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
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NP_003 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
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pF1KE0 SYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTG
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NP_003 IHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTK
530 540 550 560 570 580
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 EKPYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPF
:::: :.::::.: : :::.:: : :::::::::. : :.: :: : :: : :. :::.
NP_003 EKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPY
590 600 610 620 630 640
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TCKDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKE
.:.:::::: . : .:. :::
NP_003 ACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
650 660 670
>>XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (670 aa)
initn: 5695 init1: 1205 opt: 1205 Z-score: 752.7 bits: 149.0 E(85289): 3.5e-35
Smith-Waterman score: 1228; 51.5% identity (70.8% similar) in 342 aa overlap (86-423:227-556)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LQNDISWEELHCGLMMERFTKGSSMYSTLGRISKCNKLESQQ----ENQRMGKGQIPLMC
. ..:.: :.. :..: :. : :
XP_006 QSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYEC
200 210 220 230 240 250
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KKTFTQERGQESNRFEKRINVKSEVMPGPIGLPRKRDRKYDTPGKRSRYNIDLVNHSRSY
.. . :.. . ..::.. .. : :. :..:.:..
XP_006 HECLKGFRNSSALTKHQRIHTG------------EKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
260 270 280 290 300
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pF1KE0 TKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTGEK
: : .::. : : :. ...: : ::::::..:.:::::: :: : : :::::::
XP_006 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PYECKECGKTFRHPSSLTQHVRIHTGEKPYECRVCEKAFSQSIGLIQHLRTHVREKPFTC
::.: ::::.: : ::::.: :::::::::::. : :::.: :::: :::. :::. :
XP_006 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KDCGKAFFQIRHLRQHEIIHTGVKPYICNVCSKTFSHSTYLTQHQRTHTGERPYKCKECG
.::::: : : .:. :::: ::: :: :.::::::. :.::.::::::.::.:..::
XP_006 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
430 440 450 460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KAFSQRIHLSIHQRVHTGVKPYECSHCGKAFRHDSSFAKHQRIHTGEKPYDCNECGKAFS
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XP_006 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
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pF1KE0 CSSSLIRHCKTHLRNTFSNVV
. ::.: . :
XP_006 QLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSS
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>--
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:::::..:..::.:::::: :: ::::::
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:::: :.::::.: : :::.:: : :::::::::. : :.: :: : :: : :. :::.
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.:.:::::: . : .:. :::
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. ..:.: :.. :..: :. : :
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. ::.: . :
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pF1KE0 SYTKMKTFECNICEKIFKQLIHLTEHMRIHTGEKPFRCKECGKAFSQSSSLIPHQRIHTG
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XP_005 ACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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XP_006 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
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XP_006 EKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPY
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XP_006 ACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
650 660 670
432 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]