Result of FASTA (omim) for
pF1KE0750
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0750, 426 aa
1>>>pF1KE0750 426 - 426 aa - 426 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6208+/-0.000863; mu= 18.1999+/- 0.053
mean_var=309.4683+/-59.630, 0's: 0 Z-trim(111.2): 2023 B-trim: 70 in 1/49
Lambda= 0.072906
statistics sampled from 17343 (19681) to 17343 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 8.060
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011511864 (OMIM: 194648,615226) PREDICTED: zinc ( 502) 1094 130.1 1.2e-29
NP_001243209 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 501) 1063 126.9 1.2e-28
NP_001316584 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 455) 1046 125.0 3.9e-28
NP_001316579 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1045 124.9 4.2e-28
NP_001316581 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1045 124.9 4.2e-28
NP_659448 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 is ( 456) 1045 124.9 4.2e-28
NP_001316582 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1045 124.9 4.2e-28
NP_001316583 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1045 124.9 4.2e-28
NP_001316580 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1045 124.9 4.2e-28
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1045 125.2 4.8e-28
XP_011517656 (OMIM: 194528) PREDICTED: zinc finger ( 460) 1029 123.2 1.3e-27
NP_001316578 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1029 123.2 1.3e-27
NP_001316577 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1029 123.2 1.3e-27
NP_001316576 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1029 123.2 1.3e-27
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1030 123.6 1.4e-27
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 1024 122.8 2e-27
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 1024 122.8 2.1e-27
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 1024 122.8 2.1e-27
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1024 122.9 2.2e-27
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1024 123.0 2.2e-27
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 1024 123.0 2.2e-27
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 1020 122.4 2.8e-27
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1020 122.5 2.8e-27
XP_005259773 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881654 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881656 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881645 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881650 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_011525949 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881653 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881649 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881647 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881652 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
NP_006622 (OMIM: 604751) zinc finger protein 266 [ ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_011525950 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881651 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_006722693 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881646 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_011525952 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881648 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_006722690 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
NP_001258243 (OMIM: 604751) zinc finger protein 26 ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_016881655 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1011 121.5 5.4e-27
XP_011525946 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1011 121.6 5.6e-27
XP_006722683 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1011 121.6 5.6e-27
XP_016881643 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1011 121.6 5.6e-27
XP_006722684 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1011 121.6 5.6e-27
XP_006722686 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1011 121.6 5.6e-27
XP_006722685 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1011 121.6 5.6e-27
XP_016881644 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1011 121.6 5.6e-27
>>XP_011511864 (OMIM: 194648,615226) PREDICTED: zinc fin (502 aa)
initn: 1767 init1: 1021 opt: 1094 Z-score: 653.1 bits: 130.1 E(85289): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 1094; 44.2% identity (67.3% similar) in 398 aa overlap (35-426:58-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 DMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDTTQKY
:. . .:: :::.::.:::: :: :.
XP_011 NFCNLIGSAENAMFEDDDWWSWDEKYLCCDNGVGELLTFRDVAIEFSPEEWKCLDPDQQN
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110
pF1KE0 LYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSE-WEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTG---IQMQT--
:::::::::: ::.:. . .:.. : .: ..:... .:. : .:..
XP_011 LYRDVMLENYRNLVSLAMCSHFTQDHWPVQ--GIEDSFHKLILRRYEKCGHDNLQLRKGC
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RSYSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKEASIGQELSKF
.: . :: .. . :.: ::.: ... . .: : : .... : ..:
XP_011 KSLNECKLQKGGYNEFNE--CLST-TQSKILQCKASVKVVSKFSNSNKRKTRHTGE-KHF
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECE
. ::: : :. : : :..:: :.::::.::. ...: :: ::: .::
XP_011 KECGKSFQKFSHLTQHKVIHAGEKPYTCEECGKAFKWSLIFNEHKRIHTGEKPFTCEECG
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFR
.:::::. . .:::.: : ..:::.:. :. :. : . : ::: . :.:: . :
XP_011 SIFTTSSHFAKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRFTTLTKHKRIHAGEKPITCEECRKIFT
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 NSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTG
.::.: : .:::: ::.:: ::::::.::: ::.: : ::: ::: :.:::.:: : .
XP_011 SSSNFAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSTTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFRQSSK
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKH
: : . ::::.::.: ::::::.:: .:..:..::::::::.: ::::.: :. ::.:
XP_011 LNEHKKVHTGERPYKCDECGKAFGRSRVLNEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFRRSTDRSQH
390 400 410 420 430 440
420
pF1KE0 LKTHSGER
: ::...
XP_011 KKIHSADKPYKCKECDKAFKQFSLLSQHKKIHTVDKPYKCKDCDKAFKRFSHLNKHKKIH
450 460 470 480 490 500
>>NP_001243209 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 iso (501 aa)
initn: 872 init1: 872 opt: 1063 Z-score: 635.5 bits: 126.9 E(85289): 1.2e-28
Smith-Waterman score: 1063; 40.5% identity (67.5% similar) in 400 aa overlap (28-426:1-392)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSAFDMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDT
:. . :. : ..: :...::: .:: :::.
NP_001 MATSFRTASCWGLLSFKDISMEFTWDEWQLLDS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQMQTRS
:::::::::.:::: :: ::: . :: . . . :..... . . .:..
NP_001 TQKYLYRDVILENYHNLISVDGW----EEWYQNNQDELESIERSYACSVLGRLNLSKTHD
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KE0 YSGWKLCENCGEVFSEQFC-LKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKEASIGQELSKFN
: .: .. :. .... ....: .. . :.: : . . :..: .. .
NP_001 SSRQRLYNTRGKSLTQNSAPSRSYLR--KNPDKFHG--YEEPYFLKHQRAHSIEKNCVCS
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECER
:::.: : :::.: .:..::.:..: ..:. ..:. :. .: ::: .:::.
NP_001 ECGKAFRCKSQLIVHLRIHTGERPYECSKCERAFSAKSNLNAHQRVHTGEKPYSCSECEK
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRN
... :.: .::: : ..:::... ::: : ..: : : .::.:::..:
NP_001 VFSFRSQLIVHQEIHTGGKPYGCSECGKAYSWKSQLLLHQRSHTGVKPYECSECGKAFSL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGL
.: : :: . :::.:::::.:::::: ...: :.: ::: :::.:..::.::.. : :
NP_001 KSPFVVHQRTHTGVKPHKCSECGKAFRSKSYLLVHIRMHTGEKPYQCSDCGKAFNMKTQL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 AIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHL
.: :::..:::: ::::::.:. :: : : :.::::: : ::::.: ..:. :
NP_001 IVHQGVHTGNNPYQCGECGKAFGRKEQLTAHLRAHAGEKPYGCSECGKAFSSKSYLVIHR
330 340 350 360 370 380
420
pF1KE0 KTHSGER
.::.:::
NP_001 RTHTGERPYECSLCERAFCGKSQLIIHQRTHSTEKPYECNECEKAYPRKASLQIHQKTHS
390 400 410 420 430 440
>--
initn: 431 init1: 431 opt: 431 Z-score: 276.2 bits: 60.4 E(85289): 1.2e-08
Smith-Waterman score: 431; 50.0% identity (79.6% similar) in 108 aa overlap (315-422:393-500)
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 EKSFECKECGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPY
:..:. : .:: ...: : :::. :::
NP_001 EKPYGCSECGKAFSSKSYLVIHRRTHTGERPYECSLCERAFCGKSQLIIHQRTHSTEKPY
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 ECKECGQAFTQYTGLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVE
::.:: .:. . ..: :: ..:.::::..:.::::::...:.:..:.:.::::::..: :
NP_001 ECNECEKAYPRKASLQIHQKTHSGEKPFKCSECGKAFTQKSSLSEHQRVHTGEKPWKCSE
430 440 450 460 470 480
410 420
pF1KE0 CGKTFITSSHRSKHLKTHSGER
:::.: .: : :::
NP_001 CGKSFCWNSGLRIHRKTHK
490 500
>>NP_001316584 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 iso (455 aa)
initn: 5800 init1: 895 opt: 1046 Z-score: 626.1 bits: 125.0 E(85289): 3.9e-28
Smith-Waterman score: 1046; 40.8% identity (65.0% similar) in 397 aa overlap (35-426:2-395)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 DMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDTTQKY
:..: ::. :: :::: ::: :: .:.
NP_001 MNKFQGPVTLKDVIVEFTKEEWKLLTPAQRT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGI----QMQTRS
::.::::::: .:.:: . . . :. . . . .. : . ....:
NP_001 LYKDVMLENYSHLVSVGYHVNKPNAVFKLKQGKEPWILEVEFPHRGFPDLWSIHDLEARY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KE0 YSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCY-GKDSISVHKEASIGQELSKFN
. ::. ..: ::: . :. . :... ::... . .
NP_001 QESQAGNSRNGELTKHQ---KTHTTEKACECKECGKFFCQKSALIVHQHTHSKGKSYDCD
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECER
::: :. . : : .: . . :.:::: : : ...::. :. : ::: : ..::.
NP_001 KCGKSFSKNEDLIRHQKIHTRDKTYECKECKKIFYHLSSLSRHLRTHAGEKPYECNQCEK
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRN
.. . :: . .:::.: . .::: : . : .: ::: ::: .::::::..: .
NP_001 SFYQKPHLTEHQKTHTGEKPFECTECGKFFYVKAYLMVHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQ
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGL
.: ..:: ..::: ::.:: :::: :.:..:: : :.::: :::::::: . : : ..:
NP_001 KSHLTVHQRMHTGEKPYKCKECGKFFSRNSHLKTHQRSHTGEKPYECKECRKCFYQKSAL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 AIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHL
..: :.::::::..:..:::.: .: ::.:.: :::::::::.::::.: ..: :
NP_001 TVHQRTHTGEKPFECNKCGKTFYYKSDLTKHQRKHTGEKPYECTECGKSFAVNSVLRLHQ
330 340 350 360 370 380
420
pF1KE0 KTHSGER
.::.::.
NP_001 RTHTGEKPYACKECGKSFSQKSHFIIHQRKHTGEKPYECQECGETFIQKSQLTAHQKTHT
390 400 410 420 430 440
>>NP_001316579 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 iso (456 aa)
initn: 5800 init1: 895 opt: 1045 Z-score: 625.6 bits: 124.9 E(85289): 4.2e-28
Smith-Waterman score: 1045; 40.9% identity (65.4% similar) in 399 aa overlap (35-426:2-396)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 DMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDTTQKY
:..: ::. :: :::: ::: :: .:.
NP_001 MNKFQGPVTLKDVIVEFTKEEWKLLTPAQRT
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 LYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSL------QQGFLKNQIFTGIQMQT
::.::::::: .:.:: . . . :. . ..:: ..... ....
NP_001 LYKDVMLENYSHLVSVGYHVNKPNAVFKLKQGKEPWILEVEFPHRGF-PEDLWSIHDLEA
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RSYSGWKLCENCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCY-GKDSISVHKEASIGQELSK
: . ::. ..: ::: . :. . :... ::... .
NP_001 RYQESQAGNSRNGELTKHQ---KTHTTEKACECKECGKFFCQKSALIVHQHTHSKGKSYD
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQEC
. ::: :. . : : .: . . :.:::: : : ...::. :. : ::: : ..:
NP_001 CDKCGKSFSKNEDLIRHQKIHTRDKTYECKECKKIFYHLSSLSRHLRTHAGEKPYECNQC
150 160 170 180 190 200
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pF1KE0 ERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSF
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>>NP_001316582 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 iso (456 aa)
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>>NP_001316583 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 iso (456 aa)
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>>NP_001316580 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 iso (456 aa)
initn: 5800 init1: 895 opt: 1045 Z-score: 625.6 bits: 124.9 E(85289): 4.2e-28
Smith-Waterman score: 1045; 40.9% identity (65.4% similar) in 399 aa overlap (35-426:2-396)
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100 110 120 130 140
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pF1KE0 ERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSF
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NP_001 EKSFYQKPHLTEHQKTHTGEKPFECTECGKFFYVKAYLMVHQKTHTGEKPYECKECGKAF
210 220 230 240 250 260
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pF1KE0 RNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYT
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360 370 380 390 400 410
pF1KE0 GLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSK
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NP_001 ALTVHQRTHTGEKPFECNKCGKTFYYKSDLTKHQRKHTGEKPYECTECGKSFAVNSVLRL
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 HLKTHSGER
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>>NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [Homo (642 aa)
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pF1KE0 FFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQMQTRSYSGWK--LCENCGEVFSEQFC
.... . ::..: : :..::..: :
NP_940 SQVPNLDSLKRNTEVKSCECHECGKAFVDHSSLKSHIRSHTGSKPYQCKECGKAFHFLAC
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pF1KE0 LKTHMRAQNGGNTFE-GNCYGKDSIS----VHKEASIGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVH
.: ::.. . . .: .: : : .: . ::. . . ::: :. . .:. :
NP_940 FKKHMKTPTEEKPYECKECTKAFSCSSFFRAHMKIHIGKTNYECKECGKGFSCSSSLTEH
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 LEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECERAITTSSHLKQCVAVH
.: .: .::.::::::.:. .::..: :: :.: : .:: .:...:::: . .:
NP_940 KRIHSGDKPYECKECGKAFSCSSSLSKHKRIHSGDKPYECKECGKAFSSSSHLIIHIRIH
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pF1KE0 TGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIK
::.: . :.:::.:.. :.:..:..:: ::: ..:::::... ::...:.. ::: :
NP_940 TGEKPYECKECGKAFSESSKLTVHGRTHTGEKPYKCKECGKAYNCPSSLSIHMRKHTGEK
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 PHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGLAIHIRNHTGEKPYQC
:..: :::::: : :. ::.... :::::::::.::. ... :.:.:::. :.:
NP_940 PYECLECGKAFYLPTSLNTHVKNQSREKPYECKECGKAFSCPSSFRAHVRDHTGKIQYEC
420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 KECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHLKTHSGER
:::::.:.:::.::.: : :.::::::: ::::.::.::: . :..::.::.
NP_940 KECGKTFSRSSSLTEHLRTHSGEKPYECKECGKAFISSSHLTVHIRTHTGEKPYECKKCG
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NP_940 KAFIYPSALRIHMRTHTGEKPYECKECGKAFRHSSYLTVHARMHTGEKPFECLECGKAFS
540 550 560 570 580 590
>--
initn: 1648 init1: 464 opt: 490 Z-score: 309.0 bits: 66.8 E(85289): 1.8e-10
Smith-Waterman score: 490; 56.8% identity (77.5% similar) in 111 aa overlap (315-425:530-640)
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 EKSFECKECGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPY
:..: .::::: . : :.::::: :::
NP_940 EKPYECKECGKAFISSSHLTVHIRTHTGEKPYECKKCGKAFIYPSALRIHMRTHTGEKPY
500 510 520 530 540 550
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