FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0740, 424 aa
1>>>pF1KE0740 424 - 424 aa - 424 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4830+/-0.00133; mu= 13.1609+/- 0.079
mean_var=220.7162+/-42.829, 0's: 0 Z-trim(109.5): 910 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.086329
statistics sampled from 9909 (10905) to 9909 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 3.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10505.1 ZNF597 gene_id:146434|Hs108|chr16 ( 424) 2953 381.1 1.1e-105
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CCDS42112.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 ( 394) 625 91.1 2e-18
CCDS10497.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 ( 395) 625 91.1 2e-18
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CCDS12974.1 ZNF8 gene_id:7554|Hs108|chr19 ( 575) 583 86.1 9.3e-17
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CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 350) 555 82.3 7.9e-16
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CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 555 82.6 1e-15
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 563) 555 82.6 1e-15
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 551 82.1 1.4e-15
CCDS59371.1 ZNF730 gene_id:100129543|Hs108|chr19 ( 503) 550 82.0 1.5e-15
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19 ( 584) 549 81.9 1.8e-15
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CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 546 81.5 2.2e-15
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 546 81.6 2.3e-15
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 546 81.6 2.4e-15
CCDS73057.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 351) 540 80.5 2.9e-15
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 546 81.9 3e-15
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 539 80.6 4e-15
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CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 539 80.9 5.2e-15
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CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 533 80.1 8.5e-15
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CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 528 79.2 9.9e-15
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 528 79.4 1.1e-14
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 529 79.6 1.2e-14
CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 ( 683) 528 79.4 1.2e-14
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 527 79.2 1.2e-14
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 527 79.2 1.2e-14
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 527 79.2 1.2e-14
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 529 79.7 1.3e-14
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 529 79.7 1.3e-14
CCDS10686.1 ZNF689 gene_id:115509|Hs108|chr16 ( 500) 525 78.8 1.3e-14
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 525 78.9 1.3e-14
CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 527 79.3 1.3e-14
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 525 78.9 1.4e-14
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 525 79.0 1.4e-14
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 528 79.7 1.5e-14
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 524 78.8 1.5e-14
>>CCDS10505.1 ZNF597 gene_id:146434|Hs108|chr16 (424 aa)
initn: 2953 init1: 2953 opt: 2953 Z-score: 2010.9 bits: 381.1 E(32554): 1.1e-105
Smith-Waterman score: 2953; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MASMPPTPEAQGPILFEDLAVYFSQEECVTLHPAQRSLSKDGTKESLEDAALMGEEGKPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MASMPPTPEAQGPILFEDLAVYFSQEECVTLHPAQRSLSKDGTKESLEDAALMGEEGKPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 INQQLSLESMELDELALEKYPIAAPLVPYPEKSSEDGVGNPEAKILSGTPTYKRRVISLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 INQQLSLESMELDELALEKYPIAAPLVPYPEKSSEDGVGNPEAKILSGTPTYKRRVISLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VTIENHTPLVELSEYLGTNTLSEILDSPWEGAKNVYKCPECDQNFSDHSYLVLHQKIHSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VTIENHTPLVELSEYLGTNTLSEILDSPWEGAKNVYKCPECDQNFSDHSYLVLHQKIHSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 EKKHKCGDCGKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPYKCAKCSASFRQHSHLSRHMNSHVKEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EKKHKCGDCGKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPYKCAKCSASFRQHSHLSRHMNSHVKEKPY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCSICGRGFMWLPGLAQHQKSHSAENTYESTNCDKHFNEKPNLALPEETFVSGPQYQHTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TCSICGRGFMWLPGLAQHQKSHSAENTYESTNCDKHFNEKPNLALPEETFVSGPQYQHTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 CMKSFRQSLYPALSEKSHDEDSERCSDDGDNFFSFSKFKPLQCPDCDMTFPCFSELISHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CMKSFRQSLYPALSEKSHDEDSERCSDDGDNFFSFSKFKPLQCPDCDMTFPCFSELISHQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 NIHTEERPHKCKTCEESFALDSELACHQKSHMLAEPFKCTVCGKTFKSNLHLITHKRTHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NIHTEERPHKCKTCEESFALDSELACHQKSHMLAEPFKCTVCGKTFKSNLHLITHKRTHI
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KNTT
::::
CCDS10 KNTT
>>CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17 (807 aa)
initn: 452 init1: 452 opt: 668 Z-score: 470.1 bits: 96.9 E(32554): 7.3e-20
Smith-Waterman score: 688; 36.0% identity (61.5% similar) in 275 aa overlap (156-419:239-510)
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HTPLVELSEYLGTNTLSEILDSPWEGAKNVYKCPECDQNFSDHSYLVLHQKIHSGEKKHK
: : .: . ::. . :..:..::.::: ..
CCDS42 NPYECKECGKAFKGSSNLVLHQRIHSRGKPYLCNKCGKAFSQSTDLIIHHRIHTGEKPYE
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CGDCGKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPYKCAKCSASFRQHSHLSRHMNSHVKEKPYTCSIC
: :::..:.. ..: :.:::::::: :: .: .:::::::..:. : :::: : :
CCDS42 CYDCGQMFSQSSHLVPHQRIHTGEKPLKCNECEKAFRQHSHLTEHQRLHSGEKPYECHRC
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GRGFMWLPGLAQHQKSHSAENTYESTNCDKHFNEKPNLALPEETFVSGPQYQHTKCMKSF
:. : .. .::. :..:. : :.: :.. .: .. : ..: ..:
CCDS42 GKTFSGRTAFLKHQRLHAGEKIEE---CEKTFSKDEELREEQRIHQEEKAYWCNQCGRNF
330 340 350 360 370 380
310 320 330 340 350
pF1KE0 RQSLYPALSEKSHD-EDSERCSDDGDNFFSFSKF----------KPLQCPDCDMTFPCFS
. . . .: : .:.. : .: . : . :: : : .: :
CCDS42 QGTSDLIRHQVTHTGEKPYECKECGKTFNQSSDLLRHHRIHSGEKPCVCSKCGKSFRGSS
390 400 410 420 430 440
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ELISHQNIHTEERPHKCKTCEESFALDSELACHQKSHMLAEPFKCTVCGKTFKSNLHLIT
.:: :. .:: :.:..:. : ..:. :.:. ::: : .:..:: :::.:. ::
CCDS42 DLIRHHRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSHLVTHQKIHTGEKPYQCTECGKAFRRRSLLIQ
450 460 470 480 490 500
420
pF1KE0 HKRTHIKNTT
:.: :
CCDS42 HRRIHSGEKPYECKECGKLFIWRTAFLKHQSLHTGEKLECEKTFSQDEELRGEQKIHQEA
510 520 530 540 550 560
>--
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Smith-Waterman score: 551; 33.5% identity (60.6% similar) in 254 aa overlap (160-405:544-797)
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VELSEYLGTNTLSEILDSPWEGAKNVYKCPECDQNFSDHSYLVLHQKIHSGEKKHKCGDC
::...::. : .::::. : . :..:
CCDS42 KPYECKECGKLFIWRTAFLKHQSLHTGEKLECEKTFSQDEELRGEQKIHQEAKAYWCNQC
520 530 540 550 560 570
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPYKCAKCSASFRQHSHLSRHMNSHVKEKPYTCSICGRGF
:. :. ..: :. :: ::::.: .:. .: : : : :: : ::::.:. ::..:
CCDS42 GRAFQGSSDLIRHQVTHTREKPYECKECGKTFNQSSDLLRHHRIHSGEKPYVCNKCGKSF
580 590 600 610 620 630
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MWLPGLAQHQKSHSAENTYESTNCDKHFNEKPNLALPEETFVSGPQYQHTKCMKSFRQSL
: .:.. :..:. :: ..: : :... .:: .. .. :: ..: ..::.
CCDS42 RGSSDLIKHHRIHTGEKPYECSECGKAFSQRSHLATHQKIHTGEKPYQCSECGNAFRRRS
640 650 660 670 680 690
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pF1KE0 YPALSEKSHD-EDSERCSDDGDNFF---SFSKFKPLQC----PDCDMTFPCFSELISHQN
.. :. : .:.. : :. .: : . :. .:. :: :: ..:
CCDS42 LLIQHRRLHSGEKPYECKECGKLFMWHTAFLKHQRLHAGEKLEECEKTFSKDEELRKEQR
700 710 720 730 740 750
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 IHTEERPHKCKTCEESFALDSELACHQKSHMLAEPFKCTVCGKTFKSNLHLITHKRTHIK
: :.. . :. : ..: .:.: :: .: .:..: ::::
CCDS42 THQEKKVYWCNQCSRTFQGSSDLIRHQVTHTREKPYECKECGKTQSELRPSETS
760 770 780 790 800
pF1KE0 NTT
>>CCDS45395.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 (394 aa)
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Smith-Waterman score: 637; 36.8% identity (61.8% similar) in 296 aa overlap (14-307:116-393)
10 20 30 40
pF1KE0 MASMPPTPEAQGPILFEDLAVYFSQEECVTLHPAQRSLSKDGT
..:::: :. :::::.: :.:. :.
CCDS45 PRPLVKLLPKGVQKEQETVSLYLKANPEELVVFEDLNVFHCQEECVSLDPTQQLTSEKED
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50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KESLEDAALMGEEGKPEIN--QQLSLESMELDELALEKYPIAAPLVPYPEKSSEDGVGNP
:. . :. . ..:: . .. .:. . : . . . . :: :.. :
CCDS45 DSSVGEMMLLVNGSNPEGEDPEREPVENEDYREKSSDDDEMDSSLV------SQQPPDNQ
150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 EAKILSGTPTYKRRVISLLVTIENHTPLVELSEYLGTNTLSEILDSPWEGAKNVYKCPEC
: . :. . ::.. .::::::: ::: :::.:. .: : . . .. : :: :
CCDS45 EKERLNTSIPQKRKMRNLLVTIENDTPLEELSKYVD---ISIIALTRNRRTRRWYTCPLC
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 DQNFSDHSYLVLHQKIHSGEKKHKCGDCGKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPYKCAKCSASF
..:.. :::. ::. :.::: . :. ::: :::..:: :.:::::::::.:..:. .:
CCDS45 GKQFNESSYLISHQRTHTGEKPYDCNHCGKSFNHKTNLNKHERIHTGEKPYSCSQCGKNF
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 RQHSHLSRHMNSHVKEKPYTCSICGRGFMWLPGLAQHQKSHSAENTYESTNCDKHFNEKP
::.:: ::: . :..:: . : ::. : .. : .:: :: : .: ..:..
CCDS45 RQNSHRSRHEGIHIREKIFKCPECGKTFPKNEEFVLHLQSHEAERPYGCKKCGRRFGRLS
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 NLALPEETFVSGPQYQHTKCMKSFRQSLYPALSEKSHDEDSERCSDDGDNFFSFSKFKPL
: . :.: :. : :. .:
CCDS45 NCTRHEKT--------HSAC-KTRKQK
380 390
>>CCDS42112.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 (394 aa)
initn: 781 init1: 437 opt: 625 Z-score: 444.3 bits: 91.1 E(32554): 2e-18
Smith-Waterman score: 637; 37.0% identity (62.0% similar) in 297 aa overlap (14-307:115-393)
10 20 30 40
pF1KE0 MASMPPTPEAQGPILFEDLAVYFSQEECVTLHPAQRSLSKDGT
..:::: :. :::::.: :.:. :.
CCDS42 HPRPLVKLLPKGVQKEQETVSLYLKANPELVVFEDLNVFHCQEECVSLDPTQQLTSEKED
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KESLEDAALMGEEGK-PEIN--QQLSLESMELDELALEKYPIAAPLVPYPEKSSEDGVGN
:. . :.. .:. :: . .. .:. . : . . . . :: :.. :
CCDS42 DSSVGEMMLLAVNGSNPEGEDPEREPVENEDYREKSSDDDEMDSSLV------SQQPPDN
150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 PEAKILSGTPTYKRRVISLLVTIENHTPLVELSEYLGTNTLSEILDSPWEGAKNVYKCPE
: . :. . ::.. .::::::: ::: :::.:. .: : . . .. : ::
CCDS42 QEKERLNTSIPQKRKMRNLLVTIENDTPLEELSKYVD---ISIIALTRNRRTRRWYTCPL
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 CDQNFSDHSYLVLHQKIHSGEKKHKCGDCGKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPYKCAKCSAS
: ..:.. :::. ::. :.::: . :. ::: :::..:: :.:::::::::.:..:. .
CCDS42 CGKQFNESSYLISHQRTHTGEKPYDCNHCGKSFNHKTNLNKHERIHTGEKPYSCSQCGKN
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FRQHSHLSRHMNSHVKEKPYTCSICGRGFMWLPGLAQHQKSHSAENTYESTNCDKHFNEK
:::.:: ::: . :..:: . : ::. : .. : .:: :: : .: ..:..
CCDS42 FRQNSHRSRHEGIHIREKIFKCPECGKTFPKNEEFVLHLQSHEAERPYGCKKCGRRFGRL
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 PNLALPEETFVSGPQYQHTKCMKSFRQSLYPALSEKSHDEDSERCSDDGDNFFSFSKFKP
: . :.: :. : :. .:
CCDS42 SNCTRHEKT--------HSAC-KTRKQK
380 390
>>CCDS10497.1 ZNF200 gene_id:7752|Hs108|chr16 (395 aa)
initn: 781 init1: 437 opt: 625 Z-score: 444.3 bits: 91.1 E(32554): 2e-18
Smith-Waterman score: 637; 37.0% identity (62.0% similar) in 297 aa overlap (14-307:116-394)
10 20 30 40
pF1KE0 MASMPPTPEAQGPILFEDLAVYFSQEECVTLHPAQRSLSKDGT
..:::: :. :::::.: :.:. :.
CCDS10 PRPLVKLLPKGVQKEQETVSLYLKANPEELVVFEDLNVFHCQEECVSLDPTQQLTSEKED
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KESLEDAALMGEEGK-PEIN--QQLSLESMELDELALEKYPIAAPLVPYPEKSSEDGVGN
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CCDS10 DSSVGEMMLLAVNGSNPEGEDPEREPVENEDYREKSSDDDEMDSSLV------SQQPPDN
150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 PEAKILSGTPTYKRRVISLLVTIENHTPLVELSEYLGTNTLSEILDSPWEGAKNVYKCPE
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CCDS10 QEKERLNTSIPQKRKMRNLLVTIENDTPLEELSKYVD---ISIIALTRNRRTRRWYTCPL
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 CDQNFSDHSYLVLHQKIHSGEKKHKCGDCGKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPYKCAKCSAS
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CCDS10 CGKQFNESSYLISHQRTHTGEKPYDCNHCGKSFNHKTNLNKHERIHTGEKPYSCSQCGKN
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230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FRQHSHLSRHMNSHVKEKPYTCSICGRGFMWLPGLAQHQKSHSAENTYESTNCDKHFNEK
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CCDS10 FRQNSHRSRHEGIHIREKIFKCPECGKTFPKNEEFVLHLQSHEAERPYGCKKCGRRFGRL
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290 300 310 320 330 340
pF1KE0 PNLALPEETFVSGPQYQHTKCMKSFRQSLYPALSEKSHDEDSERCSDDGDNFFSFSKFKP
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CCDS10 SNCTRHEKT--------HSAC-KTRKQK
380 390
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: .::: : ..: :.:::::::::.: .:. .: : : : .:. :. :.:: : :
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:..: :..::..:..: : .: : :... .:: .. . .: . : : :
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420
pF1KE0 ITHKRTHIKNTT
: :.: :
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CCDS64 QKISRCQECQKKLSDCLQGKHTNNCHGEKPYECAECGKVFRLCSQLNQHQRIHTGEKPFK
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420
pF1KE0 ITHKRTHIKNTT
: :.: :
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pF1KE0 FSELISHQNIHTEERPHKCKTCEESFALDSELACHQKSHMLAEPFKCTVCGKTFKSNLHL
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CCDS64 SSRLIRHQRTHTGEKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTGEKPYVCNDCGKAFSQSSSL
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pF1KE0 ITHKRTHIKNTT
: :.: :
CCDS64 IYHQRIHKGEKPYECLQCGKAFSMSTQLTIHQRVHTGERPYKCNECGKAFSQNSTLFQHQ
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CCDS12 CAECGKSFCHSTHLTVHRRIHTGEKPYECQDCGRAFNQNSSLGRHKRTHTGEKPYTCSVC
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:..: : : ..:. : :: ..: : : .. .:: .. .. .. : .
CCDS12 GKSFSRTTCLFLHLRTHTEERPYECNHCGKGFRHSSSLAQHQRKHAGEKPFE---CRQRL
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pF1KE0 -FRQSLYPALSEKSHDEDSERCSDD-GDNFFSFSKFKPLQCPDCDMTFPCFSELISHQNI
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CCDS12 IFEQT--PALTKHEWTE-ALGCDPPLSQDERTHRSDRPFKCNQCGKCFIQSSHLIRHQIT
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:: ::.:: . . :.: . .:.:. ::
CCDS12 HTREEQPHGRSRRREQSSSRNSHLVQHQHPNSRKSSAGGAKAGQPESRALALFDIQKIMQ
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CCDS33 CNECGKAFSVYSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNEC
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CCDS33 GKVFRHNSYLSRHQRIHTGEKPYKYNEYGKAFSEHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVF
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pF1KE0 RQSLYPALSEKSHDEDSE-RCSDDGDNFFSFSKF----------KPLQCPDCDMTFPCFS
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CCDS33 TQNSHLARHRRVHTGGKPYQCNECGKAFSQTSKLARHQRVHTGEKPYECNQCGKAFSVRS
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: .:: ::: ..:.::. : . :. .:.:: :. : .:.::. :::.:... .:
CCDS33 SLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKAFSQTSKLAR
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420
pF1KE0 HKRTHIKNTT
:.: :
CCDS33 HQRIHTGEKPYECGKPFSICSSLTTHQTIHTGGKPYKCNVWKVLKSEFKPCKPSQNS
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>--
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...: :...... :.. . :.
CCDS33 YEGKIYECNQVEKSFNNNSSVSPPQQMPYNVKTHISKKYLKDFISSLLLTQGQKANNWGS
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pF1KE0 KNVYKCPECDQNFSDHSYLVLHQKIHSGEKKHKCGDCGKIFNHRANLRTHRRIHTGEKPY
:: : . : ..:.:. ::. :. :: .:: .::: : :.:: ::. :::::: :
CCDS33 P--YKSNGCGMVFPQNSHLASHQRSHTKEKPYKCYECGKAFRTRSNLTTHQVIHTGEKRY
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KCAKCSASFRQHSHLSRHMNSHVKEKPYTCSICGRGFMWLPGLAQHQKSHSAENTYESTN
:: .:. : ..:.::.:.. :. :::: :. ::. : :..:. :..:. :. ..
CCDS33 KCNECGKVFSRNSQLSQHQKIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLVRHRGIHTGEKPYKCNE
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pF1KE0 CDKHFNEKPNLALPEETFVSGPQYQHTKCMKSFRQSLYPALSEKSHDEDSERCSDDGDNF
: : : . .::. . : . :. ..: : : :. :: . : :.
CCDS33 CGKAFRARSSLAIHQATHSGEKPYKCNECGKVFTQN--------SHLTNHWRIHT-GE--
380 390 400 410 420
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pF1KE0 FSFSKFKPLQCPDCDMTFPCFSELISHQNIHTEERPHKCKTCEESFALDSELACHQKSHM
:: .: .: .: : : : ::: :.:.::. : . : .:.:: :: :
CCDS33 ------KPYKCNECGKAFGVRSSLAIHLVIHTGEKPYKCHECGKVFRRNSHLARHQLIHT
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.:.::. :::.:... .: ::. :
CCDS33 GEKPYKCNECGKAFRAHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLANHQRIHTGVKP
490 500 510 520 530 540
424 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 03:02:30 2016 done: Sat Nov 5 03:02:31 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]