Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0726
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0726, 417 aa
1>>>pF1KE0726 417 - 417 aa - 417 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9883+/-0.00157; mu= 10.7091+/- 0.094
mean_var=307.9505+/-60.005, 0's: 0 Z-trim(109.0): 856 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.073086
statistics sampled from 9578 (10617) to 9578 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12713.1 ZNF114 gene_id:163071|Hs108|chr19 ( 417) 2944 324.7 1e-88
CCDS74412.1 ZNF114 gene_id:163071|Hs108|chr19 ( 383) 2721 301.1 1.2e-81
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 749 93.5 5.8e-19
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 709 89.1 9.4e-18
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 679 86.2 9.8e-17
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 677 85.9 1.1e-16
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 674 85.6 1.4e-16
CCDS12216.2 ZNF561 gene_id:93134|Hs108|chr19 ( 486) 672 85.2 1.4e-16
CCDS46171.1 ZNF765 gene_id:91661|Hs108|chr19 ( 523) 666 84.7 2.3e-16
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 666 84.9 2.6e-16
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 665 84.7 2.8e-16
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 651 83.1 7.1e-16
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 648 82.7 8e-16
CCDS33092.1 ZNF701 gene_id:55762|Hs108|chr19 ( 465) 644 82.3 1.1e-15
CCDS54311.1 ZNF701 gene_id:55762|Hs108|chr19 ( 531) 644 82.4 1.2e-15
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 607 78.4 1.6e-14
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 607 78.4 1.7e-14
CCDS54223.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 663) 593 77.1 5.4e-14
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 591 76.9 6.4e-14
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 588 76.3 6.5e-14
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 588 76.4 6.7e-14
CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12 ( 457) 587 76.2 6.9e-14
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 588 76.5 7e-14
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 584 75.8 7.7e-14
CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 615) 586 76.3 8.7e-14
CCDS59238.1 ZNF891 gene_id:101060200|Hs108|chr12 ( 544) 585 76.2 8.8e-14
CCDS12211.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19 ( 538) 581 75.7 1.2e-13
CCDS62531.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19 ( 602) 581 75.8 1.2e-13
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 577 75.4 1.7e-13
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 577 75.4 1.7e-13
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19 ( 463) 573 74.8 1.9e-13
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 575 75.2 2e-13
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 575 75.2 2e-13
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 575 75.2 2e-13
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 571 74.7 2.5e-13
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 568 74.3 2.9e-13
CCDS45981.1 ZNF823 gene_id:55552|Hs108|chr19 ( 610) 568 74.4 3.2e-13
CCDS46807.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs108|chr3 ( 452) 564 73.8 3.7e-13
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 566 74.2 3.7e-13
CCDS54213.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 ( 563) 564 74.0 4.2e-13
CCDS12210.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 ( 595) 564 74.0 4.3e-13
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 563 73.8 4.4e-13
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 561 73.5 4.6e-13
CCDS82407.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 474) 558 73.2 5.9e-13
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 559 73.6 6.6e-13
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 558 73.4 6.8e-13
CCDS33135.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 487) 556 73.0 6.9e-13
CCDS42496.1 ZNF846 gene_id:162993|Hs108|chr19 ( 533) 556 73.1 7.2e-13
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 557 73.3 7.5e-13
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 557 73.3 7.6e-13
>>CCDS12713.1 ZNF114 gene_id:163071|Hs108|chr19 (417 aa)
initn: 2944 init1: 2944 opt: 2944 Z-score: 1706.2 bits: 324.7 E(32554): 1e-88
Smith-Waterman score: 2944; 100.0% identity (100.0% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSQDSVTFADVAVNFTKEEWTLLDPAQRNLYRDVMLENSRNLAFIDWATPCKTKDATPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSQDSVTFADVAVNFTKEEWTLLDPAQRNLYRDVMLENSRNLAFIDWATPCKTKDATPQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DILPKRTFPEANRVCLTSISSQHSTLREDWRCPKTEEPHRQGVNNVKPPAVAPEKDESPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DILPKRTFPEANRVCLTSISSQHSTLREDWRCPKTEEPHRQGVNNVKPPAVAPEKDESPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SICEDHEMRNHSKPTCRLVPSQGDSIRQCILTRDSSIFKYNPVLNDSQKTHENNEDDGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SICEDHEMRNHSKPTCRLVPSQGDSIRQCILTRDSSIFKYNPVLNDSQKTHENNEDDGVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GWNIQWVPCGRKTELKSSTWTGSQNTVHHIRDEIDTGANRHQRNPFGKAFREDGSLRAHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GWNIQWVPCGRKTELKSSTWTGSQNTVHHIRDEIDTGANRHQRNPFGKAFREDGSLRAHN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 THGREKMYDFTQCENTSRNNSIHAMQMQLYTAETNKKDCQTGATSANAPNSGSHKSHCTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 THGREKMYDFTQCENTSRNNSIHAMQMQLYTAETNKKDCQTGATSANAPNSGSHKSHCTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EKTHKCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHTGEKPYECGKCGKAFRYSLHLNKHLRKHVVQKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKTHKCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHTGEKPYECGKCGKAFRYSLHLNKHLRKHVVQKKP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE0 YECEECGKVIRESSKYTHIRSHTGEKPYKCKTCGKDFAKSSGLKKHLKTHKDEKPCE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YECEECGKVIRESSKYTHIRSHTGEKPYKCKTCGKDFAKSSGLKKHLKTHKDEKPCE
370 380 390 400 410
>>CCDS74412.1 ZNF114 gene_id:163071|Hs108|chr19 (383 aa)
initn: 2721 init1: 2721 opt: 2721 Z-score: 1579.5 bits: 301.1 E(32554): 1.2e-81
Smith-Waterman score: 2721; 100.0% identity (100.0% similar) in 383 aa overlap (35-417:1-383)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 SVTFADVAVNFTKEEWTLLDPAQRNLYRDVMLENSRNLAFIDWATPCKTKDATPQPDILP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MLENSRNLAFIDWATPCKTKDATPQPDILP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KRTFPEANRVCLTSISSQHSTLREDWRCPKTEEPHRQGVNNVKPPAVAPEKDESPVSICE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KRTFPEANRVCLTSISSQHSTLREDWRCPKTEEPHRQGVNNVKPPAVAPEKDESPVSICE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DHEMRNHSKPTCRLVPSQGDSIRQCILTRDSSIFKYNPVLNDSQKTHENNEDDGVLGWNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DHEMRNHSKPTCRLVPSQGDSIRQCILTRDSSIFKYNPVLNDSQKTHENNEDDGVLGWNI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 QWVPCGRKTELKSSTWTGSQNTVHHIRDEIDTGANRHQRNPFGKAFREDGSLRAHNTHGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QWVPCGRKTELKSSTWTGSQNTVHHIRDEIDTGANRHQRNPFGKAFREDGSLRAHNTHGR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 EKMYDFTQCENTSRNNSIHAMQMQLYTAETNKKDCQTGATSANAPNSGSHKSHCTGEKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EKMYDFTQCENTSRNNSIHAMQMQLYTAETNKKDCQTGATSANAPNSGSHKSHCTGEKTH
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHTGEKPYECGKCGKAFRYSLHLNKHLRKHVVQKKPYECE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHTGEKPYECGKCGKAFRYSLHLNKHLRKHVVQKKPYECE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KE0 ECGKVIRESSKYTHIRSHTGEKPYKCKTCGKDFAKSSGLKKHLKTHKDEKPCE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ECGKVIRESSKYTHIRSHTGEKPYKCKTCGKDFAKSSGLKKHLKTHKDEKPCE
340 350 360 370 380
>>CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 (609 aa)
initn: 1072 init1: 389 opt: 749 Z-score: 453.9 bits: 93.5 E(32554): 5.8e-19
Smith-Waterman score: 756; 33.6% identity (60.6% similar) in 429 aa overlap (6-415:6-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSQDSVTFADVAVNFTKEEWTLLDPAQRNLYRDVMLENSRNLAFIDWATPCKTKDATPQP
::: :::..:..::: ::::::.::::::::: :: .: . : :: .:.
CCDS12 MPHLLVTFRDVAIDFSQEEWECLDPAQRDLYRDVMLENYSNLISLDLESSCVTKKLSPEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DILPKRTFPEANRVCLTSISSQHSTLREDWRCPKTEEPHRQGVNNVKPPAVAPEKDESPV
.: ... : . :.. : .. .: .: :.. .. : :
CCDS12 EIYEMESLQWENMGKRINHHLQYNGLGDNMEC--------KG--NLEGQEASQEGLYMCV
70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE0 SI-CEDHEMRNHSKPTC--RLVPSQGDSIRQCILTRD-----SSIFKYNPVLNDSQ----
.: ::.. ..:: . :..:.. ... .: :. : ..... : .
CCDS12 KITCEEKATESHSTSSTFHRIIPTK-EKLYKCKECRQGFSYLSCLIQHEENHNIEKCSEV
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 KTHENNEDDGVLGWNIQWVPCGRKTE--LKSSTWTG-SQNTVHHIRDEIDTGANRHQRNP
: :.:. . . : . :.: .. . : ... ..: ..: :. . .: :
CCDS12 KKHRNTFSKKPSYIQHQRIQTGEKPYECMECGKAFGRTSDLIQH--QKIHTNEKPYQCNA
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 FGKAFREDGSLRAHN-THGREKMYDFTQCENTSRNNSIHAMQMQLYTAET--NKKDCQTG
:::: . ..: :. .: :: :. .: .. : ..........: . ::: :
CCDS12 CGKAFIRGSQLTEHQRVHTGEKPYECKKCGKAFSYCSQYTLHQRIHSGEKPYECKDC--G
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 ATSANAPNSGSHKSHCTGEKTHKCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHTGEKPYECGKCGKAFR
. . . :. .::: ..: :::.::. : : :...::::::: : .:::::
CCDS12 KAFILGSQLTYHQRIHSGEKPYECKECGKAFILGSHLTYHQRVHTGEKPYICKECGKAFL
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 YSLHLNKHLRKHVVQKKPYECEECGKVIRESSKYT-HIRSHTGEKPYKCKTCGKDFAKSS
. .::.: : :. .:::::.::::.. ..:. : :.: :.::.::::: ::: : ..:
CCDS12 CASQLNEHQRIHT-GEKPYECKECGKTFFRGSQLTYHLRVHSGERPYKCKECGKAFISNS
350 360 370 380 390 400
410
pF1KE0 GLKKHLKTHKDEKPCE
.: .: . : :::
CCDS12 NLIQHQRIHTGEKPYKCKECGKAFICGKQLSEHQRIHTGEKPFECKECGKAFIRVAYLTQ
410 420 430 440 450 460
>>CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 (463 aa)
initn: 1907 init1: 378 opt: 709 Z-score: 432.2 bits: 89.1 E(32554): 9.4e-18
Smith-Waterman score: 713; 35.2% identity (58.6% similar) in 440 aa overlap (1-415:1-410)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSQDSVTFADVAVNFTKEEWTLLDPAQRNLYRDVMLENSRNLAFIDWATPCKTKDATPQP
:.: :::::::..:..:::. :. :::.:: :::::: ::. .: . ..:.
CCDS33 MAQGLVTFADVAIDFSQEEWACLNSAQRDLYWDVMLENYSNLVSLDLESAYENKS-----
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 DILPKRTFPEANRVCLTSISSQHSTLREDWRCPKT-EEPHR-QG-------VNNVKPPAV
:: . . :. . . . ..: ..: : : :.:.: .: .: :: ::.
CCDS33 --LPTEKNIHEIRASKRNSDRRSKSLGRNWICEGTLERPQRSRGRYVNQMIINYVKRPAT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE0 APEKDESPVSICEDHEMRNHSK-PTCRLVPSQGDSI--RQCILTRDS--------SIFKY
.. .: . :. .: . : . :.: .. .: : : .. . :..
CCDS33 ---REGTPPRTHQRHHKENSFECKDCGKAFSRGYQLSQHQKIHTGEKPYECKECKKAFRW
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 NPVLNDSQKTHENNEDDGVLGWNIQWVPCGRKTELKSSTWTGSQNTVHHIRDEIDTGANR
. :.. :: : ... . :: :. : ::. ..:. .: :: .
CCDS33 GNQLTQHQKIHTGEKP-------YECKDCG-----KAFRW-GSSLVIHK---RIHTGEKP
180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KE0 HQRNPFGKAFREDGSLRAHNT-HGREKMYDFTQCENT-SRNNSIHAMQMQLYTAET--NK
.. . :::::. : :. : :: :. .: .: :: .. .. .....: .
CCDS33 YECKDCGKAFRRGDELTQHQRFHTGEKDYECKDCGKTFSRVYKL-IQHKRIHSGEKPYEC
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 KDCQTGATSANAPNSGSHKSHCTGEKTHKCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHTGEKPYECGK
::: : . . . .:: :::: ..: :::.:: ..: .:.::::::::.:: .
CCDS33 KDC--GKAFICGSSLIQHKRIHTGEKPYECQECGKAFTRVNYLTQHQKIHTGEKPHECKE
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 CGKAFRYSLHLNKHLRKHVVQKKPYECEECGKVIRESSKYT-HIRSHTGEKPYKCKTCGK
::::::.. : :: : :. .:::.: ::::.. . . : : : :::: ::::: :::
CCDS33 CGKAFRWGSSLVKHERIHT-GEKPYKCTECGKAFNCGYHLTQHERIHTGETPYKCKECGK
340 350 360 370 380 390
400 410
pF1KE0 DFAKSSGLKKHLKTHKDEKPCE
: .:.: :: . : ::
CCDS33 AFIYGSSLVKHERIHTGVKPYGCTECGKSFSHGHQLTQHQKTHSGAKSYECKECGKACNH
400 410 420 430 440 450
>>CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 (624 aa)
initn: 2453 init1: 420 opt: 679 Z-score: 413.9 bits: 86.2 E(32554): 9.8e-17
Smith-Waterman score: 679; 33.7% identity (58.5% similar) in 439 aa overlap (5-417:13-430)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSQDSVTFADVAVNFTKEEWTLLDPAQRNLYRDVMLENSRNLAFIDWATPCK
:::: :::. :...:: :: .::.::::::::: ::: .. : .
CCDS46 MAHKYVGLQYHGSVTFEDVAIAFSQQEWESLDSSQRGLYRDVMLENYRNL--VSMAGHSR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE0 TK-------DATPQPDILPKRTFPEANRVCLTSISSQHSTL--RE---DWRCPKTEEPHR
.: . .:.. .. .. : : :... . .:. .: . :: . :
CCDS46 SKPHVIALLEQWKEPEVTVRK---DGRRWC-TDLQLEDDTIGCKEMPTSENCP-SFALH-
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE0 QGVNNVKPPAVAPEKDESPVSICEDHEMRNHSKPTCRLVPSQGDSIRQCILT-RDSSIFK
: .. :: : .: ..:.: . .: . :.. ..: . .. .
CCDS46 QKISRQKP----RECQEYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNR---CKECGKNFSNGHQLT
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 YNPVLNDSQKTHENNEDDGVLGWNIQWVPCGR--------KTELKSSTWTGS-QNTVHHI
. :. ..: .. .. .. . .: :: : . ..: .:: : :::.
CCDS46 IHQRLHVGEKPYKYEKCGKAFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHK-
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260
pF1KE0 RDEIDTGANRHQRNPFGKAFREDGSLRAH-NTHGREKMYDFTQCENTSRNNSIHAMQMQL
: :: . .. . :::: :.: : .:: :: . .: .. . : ......
CCDS46 --SIHTGKKPYECGECGKAFLVYGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRI
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 YTAET--NKKDCQTGATSANAPNSGSHKSHCTGEKTHKCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHT
.:.: . :.: : :...: . .. : :::: ..: :::..: . : ::..:::
CCDS46 HTSEKPYECKECGK-AFSTSSPLAKHQRIH-TGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHT
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 GEKPYECGKCGKAFRYSLHLNKHLRKHVVQKKPYECEECGKVI-RESSKYTHIRSHTGEK
::::.:: .:::::: : :. : : :. . ::: :.:::... : : : : :::::
CCDS46 GEKPFECKECGKAFRLSSFLHAHQRIHA-EIKPYGCKECGRTFSRASYLVQHGRLHTGEK
350 360 370 380 390
390 400 410
pF1KE0 PYKCKTCGKDFAKSSGLKKHLKTHKDEKPCE
::.:: ::: :. .: : .: . : ::: :
CCDS46 PYECKECGKAFSTGSYLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYEC
400 410 420 430 440 450
CCDS46 KECGKAFRVHVHLTQHRKIHTDVKPYECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECG
460 470 480 490 500 510
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. : .:: :::..:..::: ::::::.::::::::: :::. .: .. : :. .
CCDS46 MALPQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLDISSKCMMKEFS-
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. ..:: : :. ..: . . :.: . .. : : .. . :
CCDS46 --------STAQGNREVIHTGTLQRHESHHTGDFRFQEIDKDIHNLEFQWQEDERNSHEA
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pF1KE0 PEKDESPVSICEDHEMRNHS--KPTCRLVPSQ-GDSIRQCILTRDSSIFKYNPVLNDSQK
: . . .. :. . :. :: . .: :.:... . . .:. . ... .
CCDS46 PMTEIKKLTGSADRYDQRHAGNKP----IKDQLGSSFHSHL--PELHMFQTQGKIGN--Q
120 130 140 150 160
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.... .: . .. . : . : ::..... .. .:. . ..:. . : : ::
CCDS46 VEKSINDASSISTS-QRISCRPKTHISNNYGNNFRNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGK
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pF1KE0 AFREDGSLRAHNT-HGREKMYDFTQCE---NTSRNNSIHAMQMQLYTAETNKKDCQTGAT
:: .. :: :. : ::.: : : .:: : . .:.: . . : :
CCDS46 AFNYSSLLRKHQIIHLGEKQYKCDVCGKVFNRKRNLVCHR---RCHTGEKPYRCNECGKT
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pF1KE0 SANAPNSGSHKSHCTGEKTHKCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHTGEKPYECGKCGKAFRYS
... . :. :::: .:: :: .:: ..: : :: .::.:::::.:..:::.: .
CCDS46 FSQTYSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFSFKSNLKRHRRIHAGEKPYKCNECGKTFSQT
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pF1KE0 LHLNKHLRKHVVQKKPYECEECGKVI-RESSKYTHIRSHTGEKPYKCKTCGKDFAKSSGL
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CCDS46 SSLTCHRRLHT-GEKPFKCNECGKTFSRKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSQELTL
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410
pF1KE0 KKHLKTHKDEKPCE
: : . : :::
CCDS46 KCHRRLHTGEKPYKCNECGKVFNKKANLARHHRLHSGEKPYKCTECVKTFSRNSALVIHK
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CCDS46 MAHKYVGLQYHGSVTFEDVAIAFSQQEWESLDSSQRGLYRDVMLENYRNLVSMGHSRSKP
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. .:.. .. .. : : :... . .:. .: . :: . : : .
CCDS46 HVIALLEQWKEPEVTVRK---DGRRWC-TDLQLEDDTIGCKEMPTSENCP-SFALH-QKI
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. :: : .: ..:.: . .: . :.. ..: . .. . .
CCDS46 SRQKP----RECQEYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNR---CKECGKNFSNGHQLTIHQ
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:. ..: .. .. .. . .: :: : . ..: .:: : :::.
CCDS46 RLHVGEKPYKYEKCGKAFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHK---S
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: :: . .. . :::: :.: : .:: :: . .: .. . : .......:.
CCDS46 IHTGKKPYECGECGKAFLVYGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTS
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: . :.: : :...: . .. : :::: ..: :::..: . : ::..::::::
CCDS46 EKPYECKECGK-AFSTSSPLAKHQRIH-TGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEK
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pF1KE0 PYECGKCGKAFRYSLHLNKHLRKHVVQKKPYECEECGKVI-RESSKYTHIRSHTGEKPYK
:.:: .:::::: : :. : : :. . ::: :.:::... : : : : :::::::.
CCDS46 PFECKECGKAFRLSSFLHAHQRIHA-EIKPYGCKECGRTFSRASYLVQHGRLHTGEKPYE
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pF1KE0 CKTCGKDFAKSSGLKKHLKTHKDEKPCE
:: ::: :. .: : .: . : ::: :
CCDS46 CKECGKAFSTGSYLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKEC
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CCDS12 RGFFSREPICPFEEKTKVERMVEDYLASGYQDSVTFDDVAVDFTPEEWALLDTTEKYLYR
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40 50 60 70 80
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:::::: ::: ..: .:: .. : .: .. : . .: : . .. ..
CCDS12 DVMLENYMNLASVEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQMTRGYSGWKLCDCKNCGEVF
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::.. : ::. ..: :. . . :: : :. . .. .. : :
CCDS12 REQF-CLKTHMRVQNGGNTSEGNCYG--KDTLSV-----HKEASTGQELSKFNPC-GK--
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..: .. . ::: : . .. : . : .:. : . :
CCDS12 ---VFTLTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYGRA
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210 220 230 240 250 260
pF1KE0 NTVH-HIRD--EIDTGANRHQRNPFGKAFREDGSLRAH-NTHGREKMYDFTQCENTSRNN
:. :... . :: . .. . ::.: . ..: : .:: :: .. .: . ::.
CCDS12 VTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFRNS
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270 280 290 300 310 320
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: ..:..:. .: : . . . . : :: : ..: :::.:: : :
CCDS12 SCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSGLS
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pF1KE0 RHMKIHTGEKPYECGKCGKAFRYSLHLNKHLRKHVVQKKPYECEECGKVIRESSKYT-HI
:.. :.:.:::.: .::::: : : .: : :. .::::: ::::.. ::. . :.
CCDS12 IHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHT-GEKPYECVECGKTFITSSRRSKHL
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380 390 400 410
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..:.::::. :: ::: : :: :. ::.:: :::
CCDS12 KTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIHT
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CCDS12 GEKPYECKDMSVTI
480
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. : .:: :::..:..::: ::::::.::::::::: :::. .: .. : :. .
CCDS46 MALPQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLDISSKCMMKEFSS
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: : . .: . : :. .:... .. .:. .. :. ....:
CCDS46 TAQGNREVFHAGTSQRHESHHNGDFCFQDIDKDIHDIEFQWQ-EDERNGHEALMTKIKKL
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. . :. :.. ::. ...: : .. .. : . . .:.:. .
CCDS46 TGSTERYDQNYAGNKPVKYQLGFSFHSHL-PELHIFHTEEKIDNQVVKSIHDASLVSTAQ
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pF1KE0 VLNDSQKTHENNEDDGVLGWNIQWVPCGRKTELKSSTWTGSQNTVHHIRDEIDTGANRHQ
.. .:: .:. : :. :.:: .: .:.. :.:.. :
CCDS46 RISCRPETHISND----YGNNF----------LNSSLFTQKQEV--HMREK------SFQ
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pF1KE0 RNPFGKAFREDGSLRAHNT-HGREKMYDFTQCENTSRNNSIHAMQMQLYTAETNKKDCQT
: :::. .. :: :. : ::.: : .. .. : . . .:.: : .
CCDS46 CNDSGKAYNCSSLLRKHQLIHLGEKQYKCDICGKVFNSKRYVARHRRCHTGEKPYKCNEC
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 GATSANAPNSGSHKSHCTGEKTHKCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHTGEKPYECGKCGKAF
: : ... :. :::: .:: :: .:: ..: :. : .::::::::.:..:::.:
CCDS46 GKTFSQTYYLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFHFKSKLQIHRRIHTGEKPYKCNECGKTF
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pF1KE0 RYSLHLNKHLRKHVVQKKPYECEECGKVIRESSKYT-HIRSHTGEKPYKCKTCGKDFAKS
. .:. : : :. .:::.:.::::.. ..:..: : : :::::::::. :.: :...
CCDS46 SQKSYLTCHRRLHT-GEKPYKCNECGKTFSRKSHFTCHHRVHTGEKPYKCNECSKTFSHK
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pF1KE0 SGLKKHLKTHKDEKPCE
:.: : . : .:::
CCDS46 SSLTYHRRLHTEEKPYKCNECGKTFNQQLTLNICRLHSGEKPYKCEECDKAYSFKSNLEI
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CCDS54 MELGSRRRSVGCRCRGLCLAVRREQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFR
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:. . : : . . .. ::. ..:: . : : .
CCDS54 LLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPEIKG------HFQFLLLSDLETR
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::.. .::... .. .. :. . . :. .. ..: . .: .:...
CCDS54 PKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSC-------ESLESL
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pF1KE0 ILTRDSSIFKYNPVLNDSQKTHENNEDDGVLGWNIQW---VPCGRKTELKSS--TWTGSQ
. . : .:::.. :. .: .: ::. .: : ..: :: :..
CCDS54 AVPVAFTPVK-TPVLEQWQR-------NG-FGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-GTR
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pF1KE0 NTVHHIRDEIDTGANRH---QRNPF-----GKAFREDGSL-RAHNTHGREKMYDFTQCEN
. :.. : .. .. ...:. :::: ....: . : :: :. :. .: .
CCDS54 GK----REKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLK
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 TSRNNSIHAMQMQLYTAETNKKDCQTGAT-SANAPNSGSHKSHCTGEKTHKCPECGRAFF
::.: . .....:.: : : : : . :: ...: :::: ..: :::..:
CCDS54 GFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH-TGEKPYECSECGKSFS
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pF1KE0 YQSFLMRHMKIHTGEKPYECGKCGKAFRYSLHLNKHLRKHVVQKKPYECEECGKVIRESS
..: . .: . :::::::::..:::::: :.::..::: :. .:::.: ::::.. .::
CCDS54 FRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT-GEKPYQCGECGKAFSHSS
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pF1KE0 KYT-HIRSHTGEKPYKCKTCGKDFAKSSGLKKHLKTHKDEKPCE
. : : : :::::::.:. ::: :.. . : .: .:: ::: :
CCDS54 SLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTE
400 410 420 430 440 450
CCDS54 HRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRI
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>--
initn: 445 init1: 445 opt: 559 Z-score: 345.2 bits: 73.6 E(32554): 6.6e-13
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pF1KE0 NNEDDGVLGWNIQWVPCGRKTELKSSTWTGSQNTVHHIRDEIDTGANRHQRNPFGKAFRE
::.:. . .: :: . . : ::.: .
CCDS54 AFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSH
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pF1KE0 DGSLRAHN-THGREKMYDFTQCENTSRNNSIHAMQMQ-LYTAETNKK--DCQTGATSANA
..:: :. :: :: :. .:: .. :. : : : : ..:.: . :: : . ...
CCDS54 SSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQ-STHLTQHQRIHTGEKPYECNDC--GKAFSHS
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pF1KE0 PNSGSHKSHCTGEKTHKCPECGRAFFYQSFLMRHMKIHTGEKPYECGKCGKAFRYSLHLN
. .:. :::: ..: .::::: . :..:..::::::::::..::.:: : :
CCDS54 SSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLI
540 550 560 570 580 590
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pF1KE0 KHLRKHVVQKKPYECEECGKVIRESSKYT-HIRSHTGEKPYKCKTCGKDFAKSSGLKKHL
.: : :. ..::: :.:::: . .::. . : :.:::::::.:. :::.: .:. : .:
CCDS54 EHQRIHT-KEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHR
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pF1KE0 KTHKDEKPCE
. : :::
CCDS54 RIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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