Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0687
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0687, 428 aa
1>>>pF1KE0687 428 - 428 aa - 428 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2630+/-0.000813; mu= 18.2751+/- 0.049
mean_var=115.3989+/-32.682, 0's: 0 Z-trim(109.2): 403 B-trim: 1160 in 2/46
Lambda= 0.119391
statistics sampled from 10047 (10696) to 10047 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.329), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 ( 428) 2841 500.6 1.2e-141
CCDS7761.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 ( 447) 1243 225.4 8.7e-59
CCDS81550.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 ( 363) 784 146.2 4.8e-35
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 445 87.9 2e-17
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 445 87.9 2e-17
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 445 88.0 2.3e-17
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 419 83.5 4.5e-16
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 399 80.0 4.9e-15
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 389 78.2 1.4e-14
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 388 78.2 2e-14
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 386 77.8 2.3e-14
CCDS14656.1 BRS3 gene_id:680|Hs108|chrX ( 399) 379 76.5 5.1e-14
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 377 76.2 6.9e-14
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 374 75.6 8.8e-14
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 372 75.3 1.2e-13
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 370 75.0 1.5e-13
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 369 74.9 1.9e-13
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 368 74.7 2e-13
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 365 74.1 2.8e-13
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 365 74.2 3e-13
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 360 73.2 4.8e-13
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 347 71.0 2.3e-12
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 346 70.8 2.6e-12
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 345 70.7 2.9e-12
CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2 ( 426) 341 70.0 5e-12
CCDS5744.1 GPR22 gene_id:2845|Hs108|chr7 ( 433) 339 69.7 6.4e-12
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 338 69.4 6.5e-12
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 336 69.0 7.4e-12
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 336 69.1 8.8e-12
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 331 68.2 1.5e-11
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 331 68.3 1.6e-11
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 330 68.0 1.7e-11
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 330 68.0 1.7e-11
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 328 67.7 2.2e-11
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 328 67.8 2.3e-11
CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8 ( 398) 326 67.4 2.9e-11
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 325 67.2 3.2e-11
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 323 66.9 4e-11
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 323 66.9 4.1e-11
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 323 66.9 4.1e-11
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 323 66.9 4.1e-11
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 323 66.9 4.1e-11
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 323 66.9 4.1e-11
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 323 66.9 4.2e-11
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 323 66.9 4.2e-11
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 323 66.9 4.4e-11
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 323 67.0 4.7e-11
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 320 66.4 5.8e-11
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 319 66.2 6.4e-11
CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 ( 348) 317 65.8 7.7e-11
>>CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 (428 aa)
initn: 2841 init1: 2841 opt: 2841 Z-score: 2656.6 bits: 500.6 E(32554): 1.2e-141
Smith-Waterman score: 2841; 100.0% identity (100.0% similar) in 428 aa overlap (1-428:1-428)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDVVDSLLVNGSNITPPCELGLENETLFCLDQPRPSKEWQPAVQILLYSLIFLLSVLGNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MDVVDSLLVNGSNITPPCELGLENETLFCLDQPRPSKEWQPAVQILLYSLIFLLSVLGNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LVITVLIRNKRMRTVTNIFLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLIPNLLKDFIFGSAVCKTTTYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVITVLIRNKRMRTVTNIFLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLIPNLLKDFIFGSAVCKTTTYF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 MGTSVSVSTFNLVAISLERYGAICKPLQSRVWQTKSHALKVIAATWCLSFTIMTPYPIYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGTSVSVSTFNLVAISLERYGAICKPLQSRVWQTKSHALKVIAATWCLSFTIMTPYPIYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NLVPFTKNNNQTANMCRFLLPNDVMQQSWHTFLLLILFLIPGIVMMVAYGLISLELYQGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NLVPFTKNNNQTANMCRFLLPNDVMQQSWHTFLLLILFLIPGIVMMVAYGLISLELYQGI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KFEASQKKSAKERKPSTTSSGKYEDSDGCYLQKTRPPRKLELRQLSTGSSSRANRIRSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KFEASQKKSAKERKPSTTSSGKYEDSDGCYLQKTRPPRKLELRQLSTGSSSRANRIRSNS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SAANLMAKKRVIRMLIVIVVLFFLCWMPIFSANAWRAYDTASAERRLSGTPISFILLLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SAANLMAKKRVIRMLIVIVVLFFLCWMPIFSANAWRAYDTASAERRLSGTPISFILLLSY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 TSSCVNPIIYCFMNKRFRLGFMATFPCCPNPGPPGARGEVGEEEEGGTTGASLSRFSYSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSSCVNPIIYCFMNKRFRLGFMATFPCCPNPGPPGARGEVGEEEEGGTTGASLSRFSYSH
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MSASVPPQ
::::::::
CCDS34 MSASVPPQ
>>CCDS7761.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 (447 aa)
initn: 1294 init1: 603 opt: 1243 Z-score: 1168.9 bits: 225.4 E(32554): 8.7e-59
Smith-Waterman score: 1313; 50.4% identity (73.8% similar) in 423 aa overlap (27-426:37-446)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDVVDSLLVNGSNITPPCELGLENETLFCLDQPR----PSKEWQPAVQILLYSLIF
: : . :: ..: . :..: ::..::
CCDS77 NRSVQGTGPGPGASLCRPGAPLLNSSSVGNLSC-EPPRIRGAGTRELELAIRITLYAVIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LLSVLGNTLVITVLIRNKRMRTVTNIFLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLIPNLLKDFIFGSA
:.:: :: :.:.:: ..:.::::: ::::::::::.: . ::::.:.:::. ::::..
CCDS77 LMSVGGNMLIIVVLGLSRRLRTVTNAFLLSLAVSDLLLAVACMPFTLLPNLMGTFIFGTV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VCKTTTYFMGTSVSVSTFNLVAISLERYGAICKPLQSRVWQTKSHALKVIAATWCLSFTI
.::...:.::.::::::..::::.::::.:::.:::.:::::.::: .::.::: :: .
CCDS77 ICKAVSYLMGVSVSVSTLSLVAIALERYSAICRPLQARVWQTRSHAARVIVATWLLSGLL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 MTPYPIYSNLVPFTKNNNQTANMCRFLLPNDVMQQSWHTFLLLILFLIPGIVMMVAYGLI
:.:::.:. . : : : :. ..:.: ..:::.::.:::.:: ::::::
CCDS77 MVPYPVYTVVQPVGPRVLQ----CVHRWPSARVRQTWSVLLLLLLFFIPGVVMAVAYGLI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KE0 SLELYQGIKFEASQKKSAKER-----------------KPSTTSSGKYEDSDGCYLQKTR
: ::: :..:.... .... : .: : . : :::::::.: :
CCDS77 SRELYLGLRFDGDSDSDSQSRVRNQGGLPGAVHQNGRCRPETGAVG--EDSDGCYVQLPR
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 PPRKLELRQLSTGSSSRANRIRSNSSAANLMAKKRVIRMLIVIVVLFFLCWMPIFSANAW
::: :.. . . ..: . :.:.:::::.:::.::::::::::.:..:::.:
CCDS77 SRPALELTALTAPGPGSGSR----PTQAKLLAKKRVVRMLLVIVVLFFLCWLPVYSANTW
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RAYDTASAERRLSGTPISFILLLSYTSSCVNPIIYCFMNKRFRLGFMATFP-CCPNPGPP
::.: .:.: :::.::::: ::::.:.::::..::::..::: . . : ::: : :
CCDS77 RAFDGPGAHRALSGAPISFIHLLSYASACVNPLVYCFMHRRFRQACLETCARCCPRP--P
360 370 380 390 400 410
400 410 420
pF1KE0 GARGEVGEEEEGGTTG-ASLSRFSYSHMSASVPPQ
:: .. .:. : . :::::.::. .:. :
CCDS77 RARPRALPDEDPPTPSIASLSRLSYTTISTLGPG
420 430 440
>>CCDS81550.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 (363 aa)
initn: 971 init1: 437 opt: 784 Z-score: 742.6 bits: 146.2 E(32554): 4.8e-35
Smith-Waterman score: 976; 49.4% identity (71.9% similar) in 324 aa overlap (122-426:51-362)
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LFCMPFNLIPNLLKDFIFGSAVCKTTTYFMGTSVSVSTFNLVAISLERYGAICKPLQSRV
:.::::::..::::.::::.:::.:::.::
CCDS81 LCRPGAPLLNSSSVGNLSCEPPRIRGAGTRGVSVSVSTLSLVAIALERYSAICRPLQARV
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 WQTKSHALKVIAATWCLSFTIMTPYPIYSNLVPFTKNNNQTANMCRFLLPNDVMQQSWHT
:::.::: .::.::: :: .:.:::.:. . : : : :. ..:.: .
CCDS81 WQTRSHAARVIVATWLLSGLLMVPYPVYTVVQPVGPRVLQ----CVHRWPSARVRQTWSV
90 100 110 120 130
220 230 240 250
pF1KE0 FLLLILFLIPGIVMMVAYGLISLELYQGIKFEASQKKSAKER-----------------K
.:::.::.:::.:: ::::::: ::: :..:.... .... : .
CCDS81 LLLLLLFFIPGVVMAVAYGLISRELYLGLRFDGDSDSDSQSRVRNQGGLPGAVHQNGRCR
140 150 160 170 180 190
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 PSTTSSGKYEDSDGCYLQKTRPPRKLELRQLSTGSSSRANRIRSNSSAANLMAKKRVIRM
: : . : :::::::.: : ::: :.. . . ..: . :.:.:::::.::
CCDS81 PETGAVG--EDSDGCYVQLPRSRPALELTALTAPGPGSGSR----PTQAKLLAKKRVVRM
200 210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 LIVIVVLFFLCWMPIFSANAWRAYDTASAERRLSGTPISFILLLSYTSSCVNPIIYCFMN
:.::::::::::.:..:::.:::.: .:.: :::.::::: ::::.:.::::..::::.
CCDS81 LLVIVVLFFLCWLPVYSANTWRAFDGPGAHRALSGAPISFIHLLSYASACVNPLVYCFMH
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410 420
pF1KE0 KRFRLGFMATFP-CCPNPGPPGARGEVGEEEEGGTTG-ASLSRFSYSHMSASVPPQ
.::: . . : ::: : : :: .. .:. : . :::::.::. .:. :
CCDS81 RRFRQACLETCARCCPRP--PRARPRALPDEDPPTPSIASLSRLSYTTISTLGPG
320 330 340 350 360
>>CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (420 aa)
initn: 482 init1: 337 opt: 445 Z-score: 426.3 bits: 87.9 E(32554): 2e-17
Smith-Waterman score: 518; 28.9% identity (57.8% similar) in 370 aa overlap (40-394:41-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 NGSNITPPCELGLENETLFCLDQPRPSKEWQP---AVQILLYSLIFLLSVLGNTLVITVL
:: :. :. : :::.: ..:::.: ..
CCDS35 ENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQPQVAAIFIISYFLIFFLCMMGNTVVCFIV
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IRNKRMRTVTNIFLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLIPNLLKDFIFGSAVCKTTTYFMGTSVS
.:::.:.::::.:.:.::.:::.. .::::..:. :.. . ::...:: . .: ::.
CCDS35 MRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTMCKISGLVQGISVA
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE0 VSTFNLVAISLERYGAICKPLQSRVWQTKSHALKVIAATWCLSFTIMTPYPI--------
.:.:.::::...:. . :.. .. : . :. .: : :..:::.: .
CCDS35 ASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKL--TIKTAFVIIMIIWVLAITIMSPSAVMLHVQEEK
140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YSNLVPFTKNNNQTANMCRFLLPNDVMQQSWHTFLLLILFLIPGIVMMVAYGLISLELYQ
: . ..:... . :: ::. :.. . : :. ..: : .... :: :.. :.
CCDS35 YYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSLIVIMYGRIGISLF-
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GIKFEASQKKSAKERKPSTTSSGKYEDSDGCYLQKTRPPRKLELRQLSTGSSSRANRIRS
. .. .:. :.. .. :.
CCDS35 ---------------RAAVPHTGR----------KNQEQWHVVSRK--------------
250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 NSSAANLMAKKRVIRMLIVIVVLFFLCWMPIFSANAWRAY-DTASAERRLSGTPI-SFIL
:...:.::.....::.: :.:... : : . : .. . : :
CCDS35 ---------KQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSDYADLSPNELQIINIYIYPFAH
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LLSYTSSCVNPIIYCFMNKRFRLGFMATFPC--CPNPGPPGARGEVGEEEEGGTTGASLS
:.. .: :::::: :.:. :: ::. .: : . . :
CCDS35 WLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQL
320 330 340 350 360 370
420
pF1KE0 RFSYSHMSASVPPQ
CCDS35 VQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNSSEI
380 390 400 410 420
>>CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (423 aa)
initn: 482 init1: 337 opt: 445 Z-score: 426.3 bits: 87.9 E(32554): 2e-17
Smith-Waterman score: 518; 28.9% identity (57.8% similar) in 370 aa overlap (40-394:44-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 NGSNITPPCELGLENETLFCLDQPRPSKEWQP---AVQILLYSLIFLLSVLGNTLVITVL
:: :. :. : :::.: ..:::.: ..
CCDS47 ENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQPQVAAIFIISYFLIFFLCMMGNTVVCFIV
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IRNKRMRTVTNIFLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLIPNLLKDFIFGSAVCKTTTYFMGTSVS
.:::.:.::::.:.:.::.:::.. .::::..:. :.. . ::...:: . .: ::.
CCDS47 MRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTMCKISGLVQGISVA
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE0 VSTFNLVAISLERYGAICKPLQSRVWQTKSHALKVIAATWCLSFTIMTPYPI--------
.:.:.::::...:. . :.. .. : . :. .: : :..:::.: .
CCDS47 ASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKL--TIKTAFVIIMIIWVLAITIMSPSAVMLHVQEEK
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YSNLVPFTKNNNQTANMCRFLLPNDVMQQSWHTFLLLILFLIPGIVMMVAYGLISLELYQ
: . ..:... . :: ::. :.. . : :. ..: : .... :: :.. :.
CCDS47 YYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSLIVIMYGRIGISLF-
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GIKFEASQKKSAKERKPSTTSSGKYEDSDGCYLQKTRPPRKLELRQLSTGSSSRANRIRS
. .. .:. :.. .. :.
CCDS47 ---------------RAAVPHTGR----------KNQEQWHVVSRK--------------
260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 NSSAANLMAKKRVIRMLIVIVVLFFLCWMPIFSANAWRAY-DTASAERRLSGTPI-SFIL
:...:.::.....::.: :.:... : : . : .. . : :
CCDS47 ---------KQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSDYADLSPNELQIINIYIYPFAH
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LLSYTSSCVNPIIYCFMNKRFRLGFMATFPC--CPNPGPPGARGEVGEEEEGGTTGASLS
:.. .: :::::: :.:. :: ::. .: : . . :
CCDS47 WLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQL
330 340 350 360 370 380
420
pF1KE0 RFSYSHMSASVPPQ
CCDS47 VQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNSSEI
390 400 410 420
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10 20 30 40 50 60
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:: :. :. : :::.: ..:::.: ..
CCDS35 ENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQPQVAAIFIISYFLIFFLCMMGNTVVCFIV
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70 80 90 100 110 120
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.:::.:.::::.:.:.::.:::.. .::::..:. :.. . ::...:: . .: ::.
CCDS35 MRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTMCKISGLVQGISVA
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.:.:.::::...:. . :.. .. : . :. .: : :..:::.: .
CCDS35 ASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKL--TIKTAFVIIMIIWVLAITIMSPSAVMLHVQEEK
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pF1KE0 YSNLVPFTKNNNQTANMCRFLLPNDVMQQSWHTFLLLILFLIPGIVMMVAYGLISLELYQ
: . ..:... . :: ::. :.. . : :. ..: : .... :: :.. :.
CCDS35 YYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSLIVIMYGRIGISLF-
300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GIKFEASQKKSAKERKPSTTSSGKYEDSDGCYLQKTRPPRKLELRQLSTGSSSRANRIRS
. .. .:. :.. .. :.
CCDS35 ---------------RAAVPHTGR----------KNQEQWHVVSRK--------------
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300 310 320 330 340 350
pF1KE0 NSSAANLMAKKRVIRMLIVIVVLFFLCWMPIFSANAWRAY-DTASAERRLSGTPI-SFIL
:...:.::.....::.: :.:... : : . : .. . : :
CCDS35 ---------KQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSDYADLSPNELQIINIYIYPFAH
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360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LLSYTSSCVNPIIYCFMNKRFRLGFMATFPC--CPNPGPPGARGEVGEEEEGGTTGASLS
:.. .: :::::: :.:. :: ::. .: : . . :
CCDS35 WLAFGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQL
430 440 450 460 470 480
420
pF1KE0 RFSYSHMSASVPPQ
CCDS35 VQESTFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNSSEI
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>>CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 (430 aa)
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:. :. :.::::: ..::::: ....:..
CCDS53 PLSQNGTNTEATPATNLTFSSYYQHTSPVAAMFIVAYALIFLLCMVGNTLVCFIVLKNRH
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pF1KE0 MRTVTNIFLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLIPNLLKDFIFGSAVCKTTTYFMGTSVSVSTFN
:.::::.:.:.::::::.. .:::: .:. ::. . : .:.:: . .: :::.:.:.
CCDS53 MHTVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNATCKMSGLVQGMSVSASVFT
80 90 100 110 120 130
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pF1KE0 LVAISLERYGAICKPLQSRVWQTKSHALKVIAATWCLSFTIMTPYPIYSNLV----PF--
::::..::. : .:.. .. : .:: .::. : :.. :: : . ... :
CCDS53 LVAIAVERFRCIVHPFREKL--TLRKALVTIAVIWALALLIMCPSAVTLTVTREEHHFMV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 -TKNNNQTANMCRFLLPNDVMQQSWHTFLLLILFLIPGIVMMVAYGLISLELYQGIKFEA
..: . : :. :.. . : :. ..: : ...: :. :. .: :.
CCDS53 DARNRSYPLYSCWEAWPEKGMRRVYTTVLFSHIYLAPLALIVVMYARIARKLCQA-----
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SQKKSAKERKPSTTSSGKYEDSDGCYLQKTRPPRKLELRQLSTGSSSRANRIRSNSSAAN
:. . .:. : .: :: :.: :.
CCDS53 ----------PGPAPGGE-EAAD---------PR--------------ASRRRA------
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310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LMAKKRVIRMLIVIVVLFFLCWMPIFSANAWRAYDTASAERR--LSGTPISFILLLSYTS
::..::......: : :.:... : :: . .. . : :.. .
CCDS53 -----RVVHMLVMVALFFTLSWLPLWALLLLIDYGQLSAPQLHLVTVYAFPFAHWLAFFN
270 280 290 300 310 320
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pF1KE0 SCVNPIIYCFMNKRFRLGFMATFPCCPNPGPPGARGEVGEEEEGGTTGASLSRFSYSHMS
: .::::: ..:. :: ::.:.: : : :.. :. :. ::
CCDS53 SSANPIIYGYFNENFRRGFQAAFRARLCPRPSGSHKEAYSERPGGLLHRRVFVVVRPSDS
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 ASVPPQ
CCDS53 GLPSESGPSSGAPRPGRLPLRNGRVAHHGLPREGPGCSHLPLTIPAWDI
390 400 410 420 430
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:: : :.: : : : :.. :: : : : .:
CCDS34 MEPSATPGAQMGVPPGSREPSPVPPDYEDEFLRYLWRDYLYPKQYEW---VLIAAYVAVF
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pF1KE0 LLSVLGNTLVITVLIRNKRMRTVTNIFLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLIPNLLKDFIFGSA
.....::::: .. ::..:::::: :...:...:... .:.: .:. .. ....:: :
CCDS34 VVALVGNTLVCLAVWRNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTAICLPASLLVDITESWLFGHA
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pF1KE0 VCKTTTYFMGTSVSVSTFNLVAISLERYGAICKPLQSRVWQTKSHALKVIAATWCLSFTI
.::. :....::::....: :.:.:. :::.:: . .: .: : . : .:..:
CCDS34 LCKVIPYLQAVSVSVAVLTLSFIALDRWYAICHPLLFK--STARRARGSILGIWAVSLAI
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:.: :...: : .. ..: .:.. . .:. .... .: :
CCDS34 MVPQAAVMECSSVLPELANRTRLFSVCDERWADDLYPKIYHSCFFIVTYLAP-------L
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::... .: .. : .. :.:::. . :: .: .:.: .:
CCDS34 GLMAMAYFQIFR------KLWGRQIPGTTSA--------LVRNWKRPSDQLGDLEQGLSG
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. : :. . .. : :.... .::.:....: ::..:: :. :.. ...
CCDS34 EPQ--PRARAFLAEVKQMRARRKTAKMLMVVLLVFALCYLPISVLNVLKRVFGMFRQASD
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pF1KE0 RRLSGTPISFILLLSYTSSCVNPIIYCFMNKRFRLGFMATFPCC-PNPGPPGARGEVGEE
:. . ..: : :..: .::::: :.. .:: : :.: :: :. :: :. . .
CCDS34 REAVYACFTFSHWLVYANSAANPIIYNFLSGKFREQFKAAFSCCLPGLGPCGSLKAPSPR
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410 420
pF1KE0 EEGGTTGASL-SRFSYSHMSASVPPQ
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CCDS34 SSASHKSLSLQSRCSISKISEHVVLTSVTTVLP
400 410 420
>>CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 (349 aa)
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pF1KE0 NITPPCELGLENETLFCLDQPRPSKEWQPAVQILLYSLIFLLSVLGNTLVITVLIRNK--
: .....::: :.::::.:::::: :.:
CCDS12 VGNLSEGNASWPEPPAPEPGPLFGIGVENFVTLVVFGLIFALGVLGNSLVITVLARSKPG
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. :..::.:.:.:...:: :::.::. : ...:. .:: ::. .:. :: :
CCDS12 KPRSTTNLFILNLSIADLAYLLFCIPFQATVYALPTWVLGAFICKFIHYFFTVSMLVSIF
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.:.:.:..:: :: . .: ... .:: .. : ::... .: ...: . .:
CCDS12 TLAAMSVDRYVAIVHSRRSSSLRVSRNALLGVGCIWALSIAMASPVAYHQGLF-HPRASN
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200 210 220 230 240 250
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:: .: :. .... . ... .:.: ... :. . .:.. .: . :.:. :
CCDS12 QT--FCWEQWPDPRHKKAYVVCTFVFGYLLPLLLICFCYAKVLNHLHKKLK-NMSKKSEA
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pF1KE0 KERKPSTTSSGKYEDSDGCYLQKTRPPRKLELRQLSTGSSSRANRIRSNSSAANLMAKKR
.::.
CCDS12 --------------------------------------------------------SKKK
320 330 340 350 360
pF1KE0 VIRMLIVIVVLFFLCWMPIFSANAWRAYDTASAERRLSGTPISFIL-----LLSYTSSCV
. . ..:.::.: . :.: . : . . . :: ::.. :.:..: :
CCDS12 TAQTVLVVVVVFGISWLPHHIIHLWAEFGV------FPLTPASFLFRITAHCLAYSNSSV
250 260 270 280 290
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pF1KE0 NPIIYCFMNKRFRLGFMATFPCCPNPGPPGARGEVGEEEEGGTTGASLSRFSYSHMSASV
::::: :... :: .. .: :
CCDS12 NPIIYAFLSENFRKAYKQVFKCHIRKDSHLSDTKESKSRIDTPPSTNCTHV
300 310 320 330 340
>>CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 (481 aa)
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pF1KE0 PPCELGLENETLFCLDQPRPSKEWQPAVQILLYSLIFLLSVLGNTLVITVLIRNKRMRTV
:: .... .. :::::: .. .:... .
CCDS24 SNWSGLQTESIPEEMKQIVEEQGNKLHWAALLILMVIIPTIGGNTLVILAVSLEKKLQYA
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pF1KE0 TNIFLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLIPNLLKD-FIFGSAVCKTTTYFMGTSVSVSTFNLVA
:: ::.::::.::.. :: ::. :. ... . . ..: . .. ..: ..: :
CCDS24 TNYFLMSLAVADLLVGLFVMPIALLTIMFEAMWPLPLVLCPAWLFLDVLFSTASIMHLCA
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pF1KE0 ISLERYGAICKPLQSRVWQTKSHALKVIAATWCLSFTIMTPYPIYSNLVPFTKNNNQTAN
::..:: :: ::.:. ..... :. :...: .:. : : :: . . . :: :
CCDS24 ISVDRYIAIKKPIQANQYNSRATAFIKITVVWLISIGIAIPVPIKGIETDVDNPNNITCV
150 160 170 180 190 200
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. . . .: : : : :. : .:.:.: ..... : : ..: ..
CCDS24 LTKERF-GDFM-----LFGSLAAFFTPLAIMIVTY-FLTIHALQK-KAYLVKNKPPQRLT
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300
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:.:. .: : .:. .: . : ..:. . : . ..:. ..
CCDS24 WLTVSTVFQRDETPCSSPEKVAMLDGSRKDKALP----NSGDETLMRRTSTIGKKSVQTI
270 280 290 300 310
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CCDS24 SNEQRASKVLGIVFFLFLLMWCPFFITNITLVLCDSCNQTTLQML-LEIFVWIGYVSSGV
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pF1KE0 NPIIYCFMNKRFRLGFMATFPCCPNPGPPGARGEVGEEEEGGTTGASLSRFSYSHMSASV
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CCDS24 NPLVYTLFNKTFRDAFGRYITCNYRATKSVKTLRKRSSKIYFRNPMAENSKFFKKHGIRN
380 390 400 410 420 430
428 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]