Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0686
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0686, 400 aa
1>>>pF1KE0686 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2916+/-0.00112; mu= -12.8490+/- 0.067
mean_var=478.3398+/-99.884, 0's: 0 Z-trim(116.5): 491 B-trim: 61 in 1/51
Lambda= 0.058642
statistics sampled from 16861 (17408) to 16861 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.793), E-opt: 0.2 (0.521), width: 16
Scan time: 1.560
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS31001.1 MAPKAPK2 gene_id:9261|Hs109|chr1 ( 400) 2729 244.8 1.1e-64
CCDS1466.1 MAPKAPK2 gene_id:9261|Hs109|chr1 ( 370) 2448 221.0 1.5e-57
CCDS2832.1 MAPKAPK3 gene_id:7867|Hs109|chr3 ( 382) 1762 163.0 4.5e-40
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1 ( 719) 697 73.1 9.4e-13
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1 ( 735) 697 73.1 9.5e-13
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1 ( 744) 697 73.1 9.6e-13
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs109|chr3 ( 370) 652 69.0 8.1e-12
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs109|chr5 ( 473) 642 68.3 1.7e-11
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs109|chr1 ( 476) 637 67.9 2.3e-11
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs109|chrX ( 740) 635 67.9 3.6e-11
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs109|chr10 ( 357) 626 66.8 3.6e-11
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs109|chr10 ( 385) 626 66.9 3.8e-11
CCDS83147.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs109|chr6 ( 644) 619 66.5 8.4e-11
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs109|chrX ( 426) 613 65.8 8.8e-11
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs109|chr6 ( 733) 619 66.5 9.2e-11
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs109|chr6 ( 741) 619 66.5 9.3e-11
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs109|chr6 ( 758) 619 66.5 9.4e-11
>>CCDS31001.1 MAPKAPK2 gene_id:9261|Hs109|chr1 (400 aa)
initn: 2729 init1: 2729 opt: 2729 Z-score: 1275.1 bits: 244.8 E(33420): 1.1e-64
Smith-Waterman score: 2729; 100.0% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE0 ATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
370 380 390 400
>>CCDS1466.1 MAPKAPK2 gene_id:9261|Hs109|chr1 (370 aa)
initn: 2448 init1: 2448 opt: 2448 Z-score: 1147.0 bits: 221.0 E(33420): 1.5e-57
Smith-Waterman score: 2448; 100.0% identity (100.0% similar) in 353 aa overlap (1-353:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKGCLHDKN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE0 ATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
CCDS14 SDQATWLTRL
370
>>CCDS2832.1 MAPKAPK3 gene_id:7867|Hs109|chr3 (382 aa)
initn: 1017 init1: 972 opt: 1762 Z-score: 833.2 bits: 163.0 E(33420): 4.5e-40
Smith-Waterman score: 1768; 70.7% identity (86.2% similar) in 369 aa overlap (21-389:12-368)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLSNSQGQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAII
: :: :. : :. : .. : :: :.
CCDS28 MDGETAEEQGGPVPP-PVAPGGPGLGGAPGGRREP----------KKYAVT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 DDYKVTSQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRASQCPHIVRI
:::....::::::.:::::. :..:: .: :::.: : ::::.::. ::.:: :::: :
CCDS28 DDYQLSKQVLGLGVNGKVLECFHRRTGQKCALKLLYDSPKARQEVDHHWQASGGPHIVCI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VDVYENLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSI
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CCDS28 LDVYENMHHGKRCLLIIMECMEGGELFSRIQERGDQAFTEREAAEIMRDIGTAIQFLHSH
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NIAHRDVKPENLLYTSKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
:::::::::::::::::. .:.::::::::::::: .:.: :::::::::::::::::::
CCDS28 NIAHRDVKPENLLYTSKEKDAVLKLTDFGFAKETT-QNALQTPCYTPYYVAPEVLGPEKY
170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DKSCDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPGMKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKM
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CCDS28 DKSCDMWSLGVIMYILLCGFPPFYSNTGQAISPGMKRRIRLGQYGFPNPEWSEVSEDAKQ
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LIRNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSAL
::: ::::.::.:.:::.::::::: :: ::::::::.:::.:::..:..:::::::::
CCDS28 LIRLLLKTDPTERLTITQFMNHPWINQSMVVPQTPLHTARVLQEDKDHWDEVKEEMTSAL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400
pF1KE0 ATMRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
:::::::.:.::: .. ..: :: :::::
CCDS28 ATMRVDYDQVKIKDLKTSNNRLLNKRRKKQAGSSSASQGCNNQ
340 350 360 370 380
>>CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1 (719 aa)
initn: 623 init1: 206 opt: 697 Z-score: 342.7 bits: 73.1 E(33420): 9.4e-13
Smith-Waterman score: 703; 34.2% identity (66.9% similar) in 366 aa overlap (37-398:377-719)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDDYKVT
: :: : : . :. :: ...: :.
CCDS81 SPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQA-PLHSVVQQLH-GKNLVFSDGYVV
350 360 370 380 390 400
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPK-ARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYE
....:.: .. . .: :. ..:.:... . .:.:. : .: :.:. . :::.
CCDS81 KETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
410 420 430 440 450 460
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHR
. :.. :.. : . ::::...: . . :.::::: ....::....:::: ...::
CCDS81 D---GKHVYLVT-ELMRGGELLDKILRQ--KFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHR
470 480 490 500 510
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DVKPENLLYTSKRPNA-ILKLTDFGFAKETTSHNSLT-TPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKS
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CCDS81 DLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEG
520 530 540 550 560 570
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPG-MKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLI
::.::::...: .: :: :: .: . .: . ::: :.. . . .:. ::: .: :.
CCDS81 CDIWSLGILLYTMLAGYTPF--ANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLV
580 590 600 610 620 630
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALAT
..:...: ::.: . ..:::. :. :.::. : ... . :: :... ..
CCDS81 SKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQL--------SHQDLQLVKGAMAATYSA
640 650 660 670 680
370 380 390 400
pF1KE0 MRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
. . ..: ::.. .: .:: .: : ...:
CCDS81 LNSSKPTPQLKPIESS---ILAQRR--VRKLPSTTL
690 700 710
>>CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1 (735 aa)
initn: 623 init1: 206 opt: 697 Z-score: 342.6 bits: 73.1 E(33420): 9.5e-13
Smith-Waterman score: 703; 34.2% identity (66.9% similar) in 366 aa overlap (37-398:393-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDDYKVT
: :: : : . :. :: ...: :.
CCDS28 SPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQA-PLHSVVQQLH-GKNLVFSDGYVV
370 380 390 400 410 420
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPK-ARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYE
....:.: .. . .: :. ..:.:... . .:.:. : .: :.:. . :::.
CCDS28 KETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
430 440 450 460 470 480
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHR
. :.. :.. : . ::::...: . . :.::::: ....::....:::: ...::
CCDS28 D---GKHVYLVT-ELMRGGELLDKILRQ--KFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHR
490 500 510 520 530
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DVKPENLLYTSKRPNA-ILKLTDFGFAKETTSHNSLT-TPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKS
:.:: :.::... : :.. ::::::. ..:.: ::::: .:::::: . ::..
CCDS28 DLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEG
540 550 560 570 580 590
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPG-MKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLI
::.::::...: .: :: :: .: . .: . ::: :.. . . .:. ::: .: :.
CCDS28 CDIWSLGILLYTMLAGYTPF--ANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLV
600 610 620 630 640 650
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALAT
..:...: ::.: . ..:::. :. :.::. : ... . :: :... ..
CCDS28 SKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQL--------SHQDLQLVKGAMAATYSA
660 670 680 690 700
370 380 390 400
pF1KE0 MRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
. . ..: ::.. .: .:: .: : ...:
CCDS28 LNSSKPTPQLKPIESS---ILAQRR--VRKLPSTTL
710 720 730
>>CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs109|chr1 (744 aa)
initn: 623 init1: 206 opt: 697 Z-score: 342.5 bits: 73.1 E(33420): 9.6e-13
Smith-Waterman score: 703; 34.2% identity (66.9% similar) in 366 aa overlap (37-398:402-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 GQSPPVPFPAPAPPPQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDDYKVT
: :: : : . :. :: ...: :.
CCDS30 SPGIPPSAGAHQLFRGFSFVATGLMEDDGKPRAPQA-PLHSVVQQLH-GKNLVFSDGYVV
380 390 400 410 420
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SQVLGLGINGKVLQIFNKRTQEKFALKMLQDCPK-ARREVELHWRASQCPHIVRIVDVYE
....:.: .. . .: :. ..:.:... . .:.:. : .: :.:. . :::.
CCDS30 KETIGVGSYSECKRCVHKATNMEYAVKVIDKSKRDPSEEIEILLRYGQHPNIITLKDVYD
430 440 450 460 470 480
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NLYAGRKCLLIVMECLDGGELFSRIQDRGDQAFTEREASEIMKSIGEAIQYLHSINIAHR
. :.. :.. : . ::::...: . . :.::::: ....::....:::: ...::
CCDS30 D---GKHVYLVT-ELMRGGELLDKILRQ--KFFSEREASFVLHTIGKTVEYLHSQGVVHR
490 500 510 520 530 540
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DVKPENLLYTSKRPNA-ILKLTDFGFAKETTSHNSLT-TPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKS
:.:: :.::... : :.. ::::::. ..:.: ::::: .:::::: . ::..
CCDS30 DLKPSNILYVDESGNPECLRICDFGFAKQLRAENGLLMTPCYTANFVAPEVLKRQGYDEG
550 560 570 580 590 600
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CDMWSLGVIMYILLCGYPPFYSNHGLAISPG-MKTRIRMGQYEFPNPEWSEVSEEVKMLI
::.::::...: .: :: :: .: . .: . ::: :.. . . .:. ::: .: :.
CCDS30 CDIWSLGILLYTMLAGYTPF--ANGPSDTPEEILTRIGSGKFTLSGGNWNTVSETAKDLV
610 620 630 640 650 660
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RNLLKTEPTQRMTITEFMNHPWIMQSTKVPQTPLHTSRVLKEDKERWEDVKEEMTSALAT
..:...: ::.: . ..:::. :. :.::. : ... . :: :... ..
CCDS30 SKMLHVDPHQRLTAKQVLQHPWVTQKDKLPQSQL--------SHQDLQLVKGAMAATYSA
670 680 690 700 710
370 380 390 400
pF1KE0 MRVDYEQIKIKKIEDASNPLLLKRRKKARALEAAALAH
. . ..: ::.. .: .:: .: : ...:
CCDS30 LNSSKPTPQLKPIESS---ILAQRR--VRKLPSTTL
720 730 740
>>CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs109|chr3 (370 aa)
initn: 623 init1: 399 opt: 652 Z-score: 325.8 bits: 69.0 E(33420): 8.1e-12
Smith-Waterman score: 652; 35.9% identity (67.2% similar) in 323 aa overlap (51-364:7-317)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 PQPPTPALPHPPAQPPPPPPQQFPQFHVKSGLQIKKNAIIDDYKVTSQVLGLGINGKVLQ
: . :. : : .::: : ..:.
CCDS25 MLGAVEGPRWKQAEDIRDIYDFRDVLGTGAFSEVIL
10 20 30
90 100 110 120 130
pF1KE0 IFNKRTQEKFALKMLQDCPKARREVELHWRAS-----QCPHIVRIVDVYENLYAGRKCLL
.::::. :.: . .: .. . . . :.:: . :.::. .:. :
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..:. ..:::::.:: ..: .:::.::... .. .:..:::...:.:::.:::::::
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pF1KE0 SKRPNAILKLTDFGFAKETTSHNSLTTPCYTPYYVAPEVLGPEKYDKSCDMWSLGVIMYI
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CCDS25 CEQALQHPWIAGDTALDKN-IHQSVSEQIKKNFAKSKWKQA-FNATAVVRHMRKLQLGTS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]