Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0674
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0674, 396 aa
1>>>pF1KE0674 396 - 396 aa - 396 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4539+/-0.00186; mu= 13.6973+/- 0.112
mean_var=310.7783+/-56.095, 0's: 0 Z-trim(106.7): 921 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.072753
statistics sampled from 8089 (9127) to 8089 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 2.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45982.1 ZNF763 gene_id:284390|Hs108|chr19 ( 397) 2849 313.5 2.2e-85
CCDS42503.1 ZNF440 gene_id:126070|Hs108|chr19 ( 595) 2103 235.5 1e-61
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 2069 232.1 1.3e-60
CCDS12268.1 ZNF439 gene_id:90594|Hs108|chr19 ( 499) 2056 230.4 2.8e-60
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 2047 229.8 6.5e-60
CCDS45985.1 ZNF844 gene_id:284391|Hs108|chr19 ( 666) 1762 199.8 6.2e-51
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 1660 189.1 1e-47
CCDS45986.1 ZNF20 gene_id:7568|Hs108|chr19 ( 532) 1602 182.8 6.4e-46
CCDS42502.1 ZNF627 gene_id:199692|Hs108|chr19 ( 461) 1527 174.8 1.4e-43
CCDS45981.1 ZNF823 gene_id:55552|Hs108|chr19 ( 610) 1504 172.6 8.5e-43
CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 638) 1496 171.8 1.6e-42
CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 ( 553) 1487 170.8 2.8e-42
CCDS12270.1 ZNF563 gene_id:147837|Hs108|chr19 ( 476) 1460 167.8 1.9e-41
CCDS54223.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 663) 1445 166.5 6.5e-41
CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 615) 1438 165.7 1e-40
CCDS45989.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 643) 1412 163.0 7e-40
CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19 ( 671) 1379 159.6 7.9e-39
CCDS12267.1 ZNF491 gene_id:126069|Hs108|chr19 ( 437) 1369 158.2 1.3e-38
CCDS12272.1 ZNF490 gene_id:57474|Hs108|chr19 ( 529) 1363 157.7 2.3e-38
CCDS12269.2 ZNF625 gene_id:90589|Hs108|chr19 ( 372) 1290 149.8 3.9e-36
CCDS31087.1 ZNF670 gene_id:93474|Hs108|chr1 ( 389) 1287 149.5 4.9e-36
CCDS82297.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 611) 1284 149.5 7.6e-36
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1201 140.9 3.3e-33
CCDS12271.1 ZNF442 gene_id:79973|Hs108|chr19 ( 627) 1175 138.1 2.1e-32
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1097 129.9 6.3e-30
CCDS32916.1 ZNF136 gene_id:7695|Hs108|chr19 ( 540) 1087 128.8 1.2e-29
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1081 128.2 1.9e-29
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 1062 126.1 7.4e-29
CCDS12266.2 ZNF441 gene_id:126068|Hs108|chr19 ( 693) 1029 122.9 9.2e-28
CCDS82274.1 ZNF57 gene_id:126295|Hs108|chr19 ( 523) 1016 121.3 2.1e-27
CCDS12098.1 ZNF57 gene_id:126295|Hs108|chr19 ( 555) 1016 121.3 2.1e-27
CCDS59329.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 627) 995 119.2 1e-26
CCDS12096.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 628) 995 119.2 1e-26
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19 ( 545) 980 117.5 2.9e-26
CCDS45945.1 ZNF557 gene_id:79230|Hs108|chr19 ( 423) 975 116.8 3.7e-26
CCDS42485.1 ZNF557 gene_id:79230|Hs108|chr19 ( 430) 975 116.8 3.7e-26
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 976 117.1 3.9e-26
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 976 117.1 3.9e-26
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 976 117.2 4.1e-26
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 976 117.3 4.2e-26
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 976 117.3 4.3e-26
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 976 117.3 4.3e-26
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 971 116.5 5.2e-26
CCDS10901.1 ZNF19 gene_id:7567|Hs108|chr16 ( 458) 969 116.3 6e-26
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 971 116.7 6.1e-26
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 971 116.8 6.1e-26
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 971 116.8 6.3e-26
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 967 116.4 8.4e-26
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 966 116.2 8.7e-26
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 963 115.5 8.8e-26
>>CCDS45982.1 ZNF763 gene_id:284390|Hs108|chr19 (397 aa)
initn: 2849 init1: 2849 opt: 2849 Z-score: 1646.3 bits: 313.5 E(32554): 2.2e-85
Smith-Waterman score: 2849; 100.0% identity (100.0% similar) in 396 aa overlap (1-396:2-397)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFQDPVACEDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKKWKDQNIEYEYQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MMFQDPVACEDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKKWKDQNIEYEYQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NPRRNFRSLIEGNVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKKASPEAKSCDNFVCGEVGIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NPRRNFRSLIEGNVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKKASPEAKSCDNFVCGEVGIG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 NSSFNMNIRGDIGHKAYEYQDYAPKPYKCQQPKKAFRYHPSFRTQERNHTGEKPYACKEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NSSFNMNIRGDIGHKAYEYQDYAPKPYKCQQPKKAFRYHPSFRTQERNHTGEKPYACKEC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GKTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIHERTHTGEKPYECKQCVKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GKTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIHERTHTGEKPYECKQCVKSF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGGKPYECKQCGKSFSWCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGGKPYECKQCGKSFSWCH
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SFQIHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQCKECRKAFTYPSSLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SFQIHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQCKECRKAFTYPSSLRR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KE0 HERTHSAKKPYECKQCGKALSYKFSNTPKNALWRKTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HERTHSAKKPYECKQCGKALSYKFSNTPKNALWRKTL
370 380 390
>>CCDS42503.1 ZNF440 gene_id:126070|Hs108|chr19 (595 aa)
initn: 4557 init1: 2101 opt: 2103 Z-score: 1221.7 bits: 235.5 E(32554): 1e-61
Smith-Waterman score: 2115; 74.3% identity (84.7% similar) in 404 aa overlap (4-379:2-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFQDPVACEDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKKWKDQNIEYEYQN
:::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.::
CCDS42 MDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSLGKRWKDQNIEYEHQN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PRRNFRSLIEGNVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKKASPEAKSCDNFVCGEVGIGN
:::::::::: .:::::.::::::::: ::::::::::::::::.:::..:::::::.::
CCDS42 PRRNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDRLNFQEKKASPEVKSCESFVCGEVGLGN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SSFNMNIRGDIGHKAYEYQDYAPKPYKCQQPKKAFRYHPSFRTQERNHTGEKPYACKECG
:::::::::::::::::::.:.::: :::::::::::.::::::::.:::::: ::: ::
CCDS42 SSFNMNIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYRPSFRTQERDHTGEKPNACKVCG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 KTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIHERTHTGEKPYECKQCVKSFS
:::::::..::.:::::::::::::::::: ::::::::::: :::::: ::::: ::::
CCDS42 KTFISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLRLYLIHERIHTGEKPCECKQCGKSFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE0 YSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGGKPYECKQCGKSFS----
::::::::.:::::::::: :.::::::: :.. :.: : : : :.::.:::.:.
CCDS42 YSATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSYRRHERIHMGEKAYQCKECGKAFTCPRY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE0 --------------WCH----------SFQIHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYLRH
:. ::: : : :.::.: ::. :.: : : :. ::
CCDS42 VRIHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGERPYECKICGKDFCSVNSFQRH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 KRSHTGEKPYQCKECRKAFTYPSSLRRHERTHSAKKPYECKQCGKALSYKFSNTPKNALW
.. :.:::::.::.: ::: . :::: :::::...:::::::::::.
CCDS42 EKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRVHGRTH
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 RKTL
CCDS42 TGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIHSGERRYKCKICGKGFYCPKSFQRHEK
420 430 440 450 460 470
>>CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 (745 aa)
initn: 7443 init1: 1138 opt: 2069 Z-score: 1201.6 bits: 232.1 E(32554): 1.3e-60
Smith-Waterman score: 2089; 72.6% identity (85.6% similar) in 409 aa overlap (1-379:22-430)
10 20 30
pF1KE0 MFQDPVACEDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETF
::::::: ::::::::::::.::::::..:.::::::::
CCDS74 MPCCSHRSCREDPGTSESREMMFQDPVAFEDVAVNFTQEEWTLLDISQKNLFREVMLETF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RNLTSIGKKWKDQNIEYEYQNPRRNFRSLIEGNVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEK
::::::::::.:::::::::::::.:::::: .:::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RNLTSIGKKWSDQNIEYEYQNPRRSFRSLIEEKVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 KASPEAKSCDNFVCGEVGIGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQDYAPKPYKCQQPK--KAFRY
:::::.::::.:::.:::::::::::.:::: ::::::::.:.:::::::::: :::::
CCDS74 KASPEVKSCDSFVCAEVGIGNSSFNMSIRGDTGHKAYEYQEYGPKPYKCQQPKNKKAFRY
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 HPSFRTQERNHTGEKPYACKECGKTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLY
.::.:::::.:::::::::: :::::: ::.:::.:::::::: ::::::::: : . ::
CCDS74 RPSIRTQERDHTGEKPYACKVCGKTFIFHSSIRRHMVMHSGDGTYKCKFCGKAFHSFSLY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LIHERTHTGEKPYECKQCVKSFSYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHK
:::::::::::::::::: :::.:::: .::::::::::::::..: ::::::::.. :.
CCDS74 LIHERTHTGEKPYECKQCGKSFTYSATLQIHERTHTGEKPYECSKCDKAFHSSSSYHRHE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE0 RTHTGGKPYECKQCGKSFSWCHSFQIHERTHTGEKPCECSK-------------------
:.: : :::.::.:::.:.. :.. :::::.:.:: ::..
CCDS74 RSHMGEKPYQCKECGKAFAYTSSLRRHERTHSGKKPYECKQYGEGLSYLISFQTHIRMNS
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360
pF1KE0 ---------CNKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQCKECRKAFTYPSSLRRHERTHSAKKP
:.:.: : .:. :...::::: :.::.: :::. ::.: ::: :...::
CCDS74 GERPYKCKICGKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKRYKCKQCGKAFNLSSSFRYHERIHTGEKP
370 380 390 400 410 420
370 380 390
pF1KE0 YECKQCGKALSYKFSNTPKNALWRKTL
:::::::::.
CCDS74 YECKQCGKAFRSASQLRVHGGTHTGEKPYECKECGKAFRSTSHLRVHGRTHTGEKPYECK
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 2738 init1: 1013 opt: 1020 Z-score: 606.5 bits: 122.0 E(32554): 1.8e-27
Smith-Waterman score: 1020; 50.0% identity (71.2% similar) in 306 aa overlap (78-380:450-745)
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KWKDQNIEYEYQNPRRNFRSLIEGNVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKKASPEAKS
: ..::..: .. ..: . . . :
CCDS74 PYECKQCGKAFRSASQLRVHGGTHTGEKPYECKECGKAFRST--SHLRVHGRTHTGEKP-
420 430 440 450 460 470
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 CDNFVCGEVGIGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQDYAP---KPYKCQQPKKAFRYHPSFRTQ
. : : : ..: . . .: :. : . : .::::. .:.: ::.:.
CCDS74 ---YECKECG---KAFRYVKHLQI-HERTEKHIRMPSGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTH
480 490 500 510 520
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ERNHTGEKPYACKECGKTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIHERTH
:..::::::: :..:::.: ...: . :.:. ::.:: :::: . .:::::
CCDS74 EKTHTGEKPYECNQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRMHERTH
530 540 550 560 570 580
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 TGEKPYECKQCVKSFSYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGGK
::::::::::: :.:: ... : : :::::::::::.::::::.:.:..: :.::::: :
CCDS74 TGEKPYECKQCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRSASNLQMHERTHTGEK
590 600 610 620 630 640
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 PYECKQCGKSFSWCHSFQIHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQC
:::::.: :.: ::::::: : :::: ::..:...: : . : :.: ::: :.:
CCDS74 PYECKECEKAFCKFSSFQIHERKHRGEKPYECKHCGNGFTSAKILQIHARTHIGEKHYEC
650 660 670 680 690 700
350 360 370 380 390
pF1KE0 KECRKAFTYPSSLRRHERTHSAKKPYECKQCGKALSYKFSNTPKNALWRKTL
::: :::.: :::. : ::: ..::::::.::::.:
CCDS74 KECGKAFNYFSSLHIHARTHMGEKPYECKDCGKAFS
710 720 730 740
>>CCDS12268.1 ZNF439 gene_id:90594|Hs108|chr19 (499 aa)
initn: 5552 init1: 1381 opt: 2056 Z-score: 1195.7 bits: 230.4 E(32554): 2.8e-60
Smith-Waterman score: 2071; 71.2% identity (82.7% similar) in 423 aa overlap (1-395:14-431)
10 20 30 40
pF1KE0 MFQDPVACEDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGK
::::::: .::::::::::::::::::..:::::::::: :::::::
CCDS12 MLSLSPILLYTCEMFQDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQKNLYREVMLETFWNLTSIGK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 KWKDQNIEYEYQNPRRNFRSLIEGNVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKKASPEAKS
::::::::::::::::::::. : .::::::::::::::: :::::::::.::::::.::
CCDS12 KWKDQNIEYEYQNPRRNFRSVTEEKVNEIKEDSHCGETFTPVPDDRLNFQKKKASPEVKS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 CDNFVCGEVGIGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQDYAPKPYKCQQPKKAFRYHPSFRTQERN
::.::: :::.:::: ::::::: :::: : :.:.:::.: ::::::::::::.:::::.
CCDS12 CDSFVC-EVGLGNSSSNMNIRGDTGHKACECQEYGPKPWKSQQPKKAFRYHPSLRTQERD
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 HTGEKPYACKECGKTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIHERTHTGE
:::.::::::::::..: ::.:.:.::.::::::::::::::: ::: ::::::::::::
CCDS12 HTGKKPYACKECGKNIIYHSSIQRHMVVHSGDGPYKCKFCGKAFHCLSLYLIHERTHTGE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KPYECKQCVKSFSYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTG-----
:::::::: :::::::::::::::: ::::::::.::::::: : . :.:.: :
CCDS12 KPYECKQCGKSFSYSATHRIHERTHIGEKPYECQECGKAFHSPRSCHRHERSHMGEKAYQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE0 ----GK----P---------------YECKQCGKSFSWCHSFQIHERTHTGEKPCECSKC
:: : ::::::::..: ::: : : :.::.: ::. :
CCDS12 CKECGKAFMCPRYVRRHERTHSRKKLYECKQCGKALSSLTSFQTHIRMHSGERPYECKTC
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 NKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQCKECRKAFTYPSSLRRHERTHSAKKPYECKQCGKAL
.:.: : .:. ::...:.:::::.::.: :::: .:.: :::::...:::::::::::
CCDS12 GKGFYSAKSFQRHEKTHSGEKPYKCKQCGKAFTRSGSFRYHERTHTGEKPYECKQCGKA-
360 370 380 390 400 410
380 390
pF1KE0 SYKFSNTPKNALWRKTL
: ..:. : .:
CCDS12 ---FRSAPNLQLHGRTHTGEKPYQCKECGKAFRSASQLRIHRRIHTGEKPYECKKCGKAF
420 430 440 450 460 470
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10 20 30 40
pF1KE0 MFQDPVACEDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNL
:::: ::::::::::::.::::::..:.:::::::::::
CCDS32 MPCCSHRSCREDPGTSESREMDPVAFEDVAVNFTQEEWTLLDISQKNLFREVMLETFRNL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TSIGKKWKDQNIEYEYQNPRRNFRSLIEGNVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKKAS
:::::::.:::::::::::::.:::::: .::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSIGKKWSDQNIEYEYQNPRRSFRSLIEEKVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKKAS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 PEAKSCDNFVCGEVGIGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQDYAPKPYKCQQPK--KAFRYHPS
::.::::.:::.:::::::::::.:::: ::::::::.:.:::::::::: :::::.::
CCDS32 PEVKSCDSFVCAEVGIGNSSFNMSIRGDTGHKAYEYQEYGPKPYKCQQPKNKKAFRYRPS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 FRTQERNHTGEKPYACKECGKTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIH
.:::::.:::::::::: :::::: ::.:::.:::::::: ::::::::: : . :::::
CCDS32 IRTQERDHTGEKPYACKVCGKTFIFHSSIRRHMVMHSGDGTYKCKFCGKAFHSFSLYLIH
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ERTHTGEKPYECKQCVKSFSYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTH
::::::::::::::: :::.:::: .::::::::::::::..: ::::::::.. :.:.:
CCDS32 ERTHTGEKPYECKQCGKSFTYSATLQIHERTHTGEKPYECSKCDKAFHSSSSYHRHERSH
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE0 TGGKPYECKQCGKSFSWCHSFQIHERTHTGEKPCECSK----------------------
: :::.::.:::.:.. :.. :::::.:.:: ::..
CCDS32 MGEKPYQCKECGKAFAYTSSLRRHERTHSGKKPYECKQYGEGLSYLISFQTHIRMNSGER
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 ------CNKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQCKECRKAFTYPSSLRRHERTHSAKKPYEC
:.:.: : .:. :...::::: :.::.: :::. ::.: ::: :...:::::
CCDS32 PYKCKICGKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKRYKCKQCGKAFNLSSSFRYHERIHTGEKPYEC
370 380 390 400 410 420
380 390
pF1KE0 KQCGKALSYKFSNTPKNALWRKTL
::::::.
CCDS32 KQCGKAFRSASQLRVHGGTHTGEKPYECKECGKAFRSTSHLRVHGRTHTGEKPYECKECG
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>--
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: ..::..: .. ..: . . . :
CCDS32 PYECKQCGKAFRSASQLRVHGGTHTGEKPYECKECGKAFRST--SHLRVHGRTHTGEKP-
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. : : : ..: . . .: :. : . : .::::. .:.: ::.:.
CCDS32 ---YECKECG---KAFRYVKHLQI-HERTEKHIRMPSGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTH
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pF1KE0 ERNHTGEKPYACKECGKTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIHERTH
:..::::::: :..:::.: ...: . :.:. ::.:: :::: . .:::::
CCDS32 EKTHTGEKPYECNQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRMHERTH
530 540 550 560 570 580
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pF1KE0 TGEKPYECKQCVKSFSYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGGK
::::::::::: :.:: ... : : :::::::::::.::::::.:.:..: :.::::: :
CCDS32 TGEKPYECKQCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRSASNLQMHERTHTGEK
590 600 610 620 630 640
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pF1KE0 PYECKQCGKSFSWCHSFQIHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQC
:::::.: :.: ::::::: : :::: ::..:...: : . : :.: ::: :.:
CCDS32 PYECKECEKAFCKFSSFQIHERKHRGEKPYECKHCGNGFTSAKILQIHARTHIGEKHYEC
650 660 670 680 690 700
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::: :::.: :::. : ::: ..::::::.::::.:
CCDS32 KECGKAFNYFSSLHIHARTHMGEKPYECKDCGKAFS
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10 20 30 40 50 60
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:: :.:::. :.: :..::::: .:.::: :: ::.:: .:::.. ::::: .:.
CCDS45 PRNNLRSLLGERVDENTEENHCGETSSQIPDDTLN---KKTSPGVKSCESSVCGEVFVGH
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pF1KE0 SSFNMNIRGDIGHKAYEYQDYAPKPYKCQQPKKAFRYHPSFRTQERNHTGEKPYACKECG
::.: .::.: .:: :::.:. .:::::: ::::: ::::. ::. ::::: : :::::
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 KTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIHERTHTGEKPYECKQCVKSFS
:::::::.:.:.:.::.::: ::::::::: :: .::::::.:::::::.:::: :.::
CCDS45 KTFISHSSIQRHMIMHNGDGTYKCKFCGKACPCLSIYLIHERVHTGEKPYKCKQCGKAFS
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 YSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGGKPYECKQCGKSFSWCHS
::.. .::::::::::::::..::::: : .:. :.::::: ::::::::::.: : ::
CCDS45 YSTSLQIHERTHTGEKPYECKECGKAFGSPNSLYEHRRTHTGEKPYECKQCGKAFRWFHS
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 FQIHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYL-RHKRSHTGEKPYQCKECRKAFTYPSSLRR
::::::::. :: ::.::.:::. ::: ::. .:.:.:: .::.: ::..: ...:
CCDS45 FQIHERTHSEEKAYECTKCGKAFKCP-SYLCRHEVTHSGKKPCECKQCGKALSY-LNFQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KE0 HERTHSAKKPYECKQCGKAL--SYKFSNTPKNALWRKTL
: . :. .::.:: : : .: . . .: :. .
CCDS45 HMKMHTRMRPYKCKTVEKPLILPVRFEDMKELTLERNLMNASTVVKPSIVPVPFTIMKGL
360 370 380 390 400 410
CCDS45 TLERNPMNVSSVVKPSFLPLPFDIMKGLTLERNRMSVSNVGKPSDLPHTFKCMEGLTLKR
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10 20 30 40 50 60
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: :::.: . : . : :: . :: .:::::: : ::.. .:::.. : :::: .
CCDS45 NLRRNLRIVGE-RLFESKEGHQHGEILTQVPDDML----KKTTTGVKSCESSVYGEVGSA
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.::.: .:: : ::::::::.:. :::::. :: : : .:.:: :.:.: :.:.::
CCDS45 HSSLNRHIRDDTGHKAYEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNCLSSVQTHERAHSGRKLYVCEEC
120 130 140 150 160 170
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::::::::...:. .:: :::::::::::::. : :::::.:::::::::.:::: :.:
CCDS45 GKTFISHSNLQRHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLIHKRTHTGEKPYQCKQCGKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 SYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGGKPYECKQCGKSFSWCH
:.:.. :::::::::::::.:..::::::::. ..:::::::: ::::::::::.:: :
CCDS45 SHSSSLRIHERTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSSSH
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 SFQIHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQCKECRKAFTY------
:::::::::::::: ::..:.:::. : ::.:.:. .:::.::.: :...:
CCDS45 SFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRKKPYECKHCGKVLSYLTSFQN
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 ----------------------PSSLRRHERTHSAKKPYECKQCGKALSYKFSNTPKNAL
::::. ::.::...:::.:.:::::..
CCDS45 HLGMHTGEISHKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERT
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 WRKTL
CCDS45 HTGEKPYECKQCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHREE
420 430 440 450 460 470
>--
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pF1KE0 EAKSCDNFVCGEVGIGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQDYAPKPYKCQQPKKAFRYHPSFRT
. .: . :::.:.: :::: ..:
CCDS45 SLQTHEKTHTGEKPYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASLLQT
380 390 400 410 420 430
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pF1KE0 QERNHTGEKPYACKECGKTFISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIHERT
. :.:::::::::::::: : . : .. . :: . ::.:: ::. :. ::::
CCDS45 HGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGYGKTFSLPSLFHRHERT
440 450 460 470 480 490
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pF1KE0 HTGEKPYECKQCVKSFSYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGG
::: : :::::: .::. :.. : : :::::::::::.::::::.:.:..: : :::::
CCDS45 HTGGKTYECKQCGRSFNCSSSFRYHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRSASQLQIHGRTHTGE
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pF1KE0 KPYECKQCGKSFSWCHSFQIHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQ
::::::::::.:. .:.: :::::::: ::..:.:.: : :.:::::::.
CCDS45 KPYECKQCGKAFGSASHLQMHGRTHTGEKPYECKQCGKSFGCASRLQMHGRTHTGEKPYK
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pF1KE0 CKECRKAFTYPSSLRRHERTHSAKKPYECKQCGKALSYKFSNTPKNALWRKTL
::.: ::: ::.:::: :::...:::.:.::::..
CCDS45 CKQCGKAFGCPSNLRRHGRTHTGEKPYKCNQCGKVFRCSSQLQVHGRAHCIDTP
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pF1KE0 MFQDPVACEDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKKWKDQNIEYEYQ
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CCDS45 MMFQDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYK
10 20 30 40 50 60
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:::::. ::.. .. : ::. ::::.:.:. :: :: .:. : :.. :::::: :
CCDS45 NPRRNL-SLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDMLN---RKTLPGITPCESSVCGEVGTG
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.::.: .::.: :::. :::.:. .::. .. :::: : ::..... : :::: :::
CCDS45 HSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFSYLDSFQSHDKACTKEKPYDGKEC
120 130 140 150 160 170
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.:::::: :.:. ::::::::::::::::: . : : ::::: ::: :::.:::: :.:
CCDS45 TETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNLCLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 SYSATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGGKPYECKQCGKSFSWCH
. :.: .::::::: . ::..::.:: : .. :::.::: :::::::::: :
CCDS45 TRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHTGEKPYECKQCGKVFISFS
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 SFQIHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYLRHKRSHTGEKPYQCKECRKAFTYPSSLRR
:.: :. ::::::: ::..:.:::: .: :.:::::::.:..: ::: :.:.:
CCDS45 SIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTHTGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQR
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 HERTHSAKKPYECKQCGKALSYKFSNTPKNALWRKTL
::.::. ::: ::::::..
CCDS45 HEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECKECGKVFKYFSSLRIHERT
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 540 init1: 540 opt: 721 Z-score: 438.2 bits: 90.3 E(32554): 4.4e-18
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FISHSGIRRRMVMHSGDGPYKCKFCGKAVHCLRLYLIHERTHTGEKPYECKQCVKSFSYS
: ::::::.::::.:::.: : :.:
CCDS45 FRCTSDLQRHEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECKECGKVFKYF
350 360 370 380 390 400
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pF1KE0 ATHRIHERTHTGEKPYECQQCGKAFHSSSSFQAHKRTHTGGKPYECKQCGKSFSWCHSFQ
.. ::::::::::::.::.::::::. ::.. :.::::: :::::: :::.:. :..
CCDS45 SSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYECKVCGKAFTCSSSIR
410 420 430 440 450 460
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pF1KE0 IHERTHTGEKPCECSKCNKAFRSYRSYLR-HKRSHTGEKPYQCKECRKAFTYPSSLRRHE
:::::::::: ::..:.::: : .:.: :.:.::::::::::.: ::: :: :.::
CCDS45 YHERTHTGEKPYECKHCGKAFIS--NYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGKAFIRASSCREHE
470 480 490 500 510 520
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pF1KE0 RTHSAKKPYECKQCGKALSYKFSNTPKNALWRKTL
:::. ..
CCDS45 RTHTINR
530
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10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50
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CCDS42 PRRNI-SHIPERLCESKEGGQGEETFSQIPDGILN----KKTPGVKPCESSVCGEVGMGP
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CCDS42 SSLNRHIRDHTGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALSYHRSFPVRERTHPGGKPYDCKECG
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CCDS42 ERTHTGEKPYDCKQCGKAFSCSSSFRKHERIHTGEKPYKCTKCGKAFSRSSYFRIHERTH
360 370 380 390 400 410
>>CCDS45981.1 ZNF823 gene_id:55552|Hs108|chr19 (610 aa)
initn: 2456 init1: 1151 opt: 1504 Z-score: 881.8 bits: 172.6 E(32554): 8.5e-43
Smith-Waterman score: 1504; 56.8% identity (77.5% similar) in 382 aa overlap (4-384:2-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFQDPVACEDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYREVMLETFRNLTSIGKKWKDQNIEYEYQN
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CCDS45 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLGPSQKSLYRNVMQETIRNLDCIEMKWEDQNIGDQCQN
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pF1KE0 PRRNFRSLIEGNVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKKASPEAKSCDNFVCGEVGIGN
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CCDS45 AKRNLRS----HTCEIKDDSQCGETFGQIPDSIVN----KNTPRVNPCDSGECGEVVLGH
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CCDS45 SSLNCNIRVDTGHKSCEHQEYGEKPYTHKQRGKAISHQHSFQTHERPPTGKKPFDCKECA
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CCDS45 KTFSSLGNLRRHMAAHHGDGPYKCKLCGKAFVWPSLFHLHERTHTGEKPYECKQCSKAFP
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. ... ::: ::::: :::.::.::: . :.. :.::::: :::.: ::::.:: :.
CCDS45 FYSSYLRHERIHTGEKAYECKQCSKAFPDYSTYLRHERTHTGEKPYKCTQCGKAFS-CYY
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CCDS45 YTRLHERTHTGEQPYACKQCGKTFYHHTSFRRHMIRHTGDGPHKCKICGKGFDCPSSVRN
290 300 310 320 330 340
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:: ::...::::::::::.::.. :
CCDS45 HETTHTGEKPYECKQCGKVLSHSSSFRSHMITHTGDGPQKCKICGKAFGCPSLFQRHERT
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>--
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396 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]