Result of FASTA (omim) for
pF1KE0660
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0660, 389 aa
1>>>pF1KE0660 389 - 389 aa - 389 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2954+/-0.0008; mu= 14.4367+/- 0.050
mean_var=293.9013+/-55.737, 0's: 0 Z-trim(112.5): 2082 B-trim: 205 in 2/47
Lambda= 0.074812
statistics sampled from 19151 (21512) to 19151 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 7.040
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 ( 529) 1412 167.1 9.1e-41
NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 is ( 532) 1405 166.3 1.5e-40
NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [ ( 671) 1327 158.1 5.9e-38
NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 is ( 615) 1324 157.7 7e-38
XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 673) 1323 157.6 7.9e-38
XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 685) 1322 157.5 8.6e-38
XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 718) 1322 157.6 8.8e-38
XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1317 156.9 1.2e-37
XP_011526364 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1317 157.0 1.2e-37
NP_001157748 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 ( 663) 1317 157.0 1.2e-37
XP_006711876 (OMIM: 194631) PREDICTED: zinc finger ( 310) 1170 140.5 5.1e-33
XP_011542574 (OMIM: 194631) PREDICTED: zinc finger ( 343) 1170 140.6 5.4e-33
NP_001284497 (OMIM: 194631) zinc finger protein 12 ( 351) 1170 140.6 5.4e-33
XP_011525924 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 639) 1169 141.0 7.8e-33
XP_011526082 (OMIM: 612248) PREDICTED: zinc finger ( 429) 1147 138.3 3.3e-32
NP_001277012 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 429) 1147 138.3 3.3e-32
NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 i ( 461) 1147 138.3 3.5e-32
NP_001277014 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1137 137.1 6.4e-32
NP_001277013 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1137 137.1 6.4e-32
XP_016882359 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 583) 1139 137.7 7e-32
NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1123 136.0 2.4e-31
XP_016882732 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1118 135.2 3.1e-31
XP_011526571 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 508) 1118 135.3 3.2e-31
NP_003428 (OMIM: 604078) zinc finger protein 136 [ ( 540) 1118 135.3 3.3e-31
XP_011526368 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 571) 1099 133.3 1.4e-30
XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger ( 569) 1089 132.2 2.9e-30
NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 554) 1075 130.7 8.2e-30
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1054 128.5 4.2e-29
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1054 128.5 4.2e-29
NP_001316584 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 455) 1052 128.1 4.2e-29
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1054 128.5 4.2e-29
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1054 128.6 4.3e-29
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1054 128.6 4.3e-29
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1054 128.6 4.3e-29
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1054 128.6 4.3e-29
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1054 128.6 4.3e-29
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1054 128.6 4.3e-29
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1054 128.6 4.4e-29
XP_016878354 (OMIM: 604752) PREDICTED: zinc finger ( 711) 1052 128.4 5.2e-29
XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1044 127.0 6.9e-29
XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1044 127.0 6.9e-29
NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [H ( 545) 1044 127.4 8.3e-29
NP_001252517 (OMIM: 604752) zinc finger protein 26 ( 711) 1036 126.7 1.7e-28
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1030 126.0 2.6e-28
XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669) 1021 125.0 5.1e-28
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1020 124.8 5.2e-28
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1020 124.8 5.2e-28
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1020 124.9 5.4e-28
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1020 124.9 5.4e-28
NP_001316589 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 420) 1017 124.2 5.5e-28
>>NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 iso (529 aa)
initn: 4119 init1: 1081 opt: 1412 Z-score: 852.9 bits: 167.1 E(85289): 9.1e-41
Smith-Waterman score: 1477; 53.5% identity (72.5% similar) in 415 aa overlap (1-387:1-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
::::.::::::.::::::::::::::::::::::: :.::.:::. . :::.:..:::
NP_001 MDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYKNPR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
:::: . :.: : ::. . ::.:.: .. ::.:. :. ::: ::::.: ::.:.
NP_001 RNLSL-MREKLCESKESHHCGESFNQIADDMLNRKTLPGITPCESSVCGEVGTGHSSLNT
70 80 90 100 110
130 140 150
pF1KE0 HILSHIGNKL----------FECEECP------------------EKLYHCKQCGKAFIS
:: . :.: .. .:: :: : :.: ..:::
NP_001 HIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFSYLDSFQSHDKACTKEKPYDGKECTETFIS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYL
. ..:: : :...:::: : : : .. . . .:: : ::::.: :::. :. :
NP_001 HSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNLCLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAFTRSTTL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 REHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHE
::::::: . ::.::..:.: : .:.:.::::::::::::.:::.: . . :.
NP_001 PVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHTGEKPYECKQCGKVFISFSSIQYHK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 RTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHT
:::::::::: .:::::::. :. : :::.:::::::.::::::. .:.: .::.:::
NP_001 MTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTHTGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQRHEKTHT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE0 GVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
::::::.:::.: .: :. :::::.::::.:::.:::.:. :::: :::..
NP_001 EDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKP
360 370 380 390 400 410
NP_001 HECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYECKVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECK
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 572 init1: 406 opt: 428 Z-score: 278.9 bits: 60.8 E(85289): 8.5e-09
Smith-Waterman score: 569; 69.0% identity (80.5% similar) in 113 aa overlap (248-360:415-526)
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 THTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTG
:::::.:::.::::: . : ::::::::
NP_001 THSGEKPHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTG
390 400 410 420 430 440
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 EKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPY
.::::: ::::: :: .: :::::.::::::::.::::: :. . ::::::: :::
NP_001 DKPYECKVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAF-ISNYIRYHERTHTGEKPY
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370 380
pF1KE0 GCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
::.:::.: .:. : ::::::
NP_001 QCKQCGKAFIRASSCREHERTHTINR
510 520
>>NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 isofor (532 aa)
initn: 4119 init1: 1081 opt: 1405 Z-score: 848.8 bits: 166.3 E(85289): 1.5e-40
Smith-Waterman score: 1470; 53.4% identity (72.5% similar) in 414 aa overlap (2-387:5-417)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFK
:::.::::::.::::::::::::::::::::::: :.::.:::. . :::.:..:
NP_066 MMFQDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 NPGRNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSA
:: :::: . :.: : ::. . ::.:.: .. ::.:. :. ::: ::::.: ::.
NP_066 NPRRNLSL-MREKLCESKESHHCGESFNQIADDMLNRKTLPGITPCESSVCGEVGTGHSS
70 80 90 100 110
120 130 140
pF1KE0 LHRHILSHIGNKL----------FECEECP------------------EKLYHCKQCGKA
:. :: . :.: .. .:: :: : :.: ..
NP_066 LNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFSYLDSFQSHDKACTKEKPYDGKECTET
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 FISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYS
::: . ..:: : :...:::: : : : .. . . .:: : ::::.: :::. :
NP_066 FISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNLCLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAFTRS
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 SYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLG
. : ::::::: . ::.::..:.: : .:.:.::::::::::::.:::.: . .
NP_066 TTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHTGEKPYECKQCGKVFISFSSIQ
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 IHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHER
:. :::::::::: .:::::::. :. : :::.:::::::.::::::. .:.: .::.
NP_066 YHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTHTGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQRHEK
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 THTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
::: ::::::.:::.: .: :. :::::.::::.:::.:::.:. :::: :::..
NP_066 THTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTG
360 370 380 390 400 410
NP_066 EKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYECKVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPY
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 572 init1: 406 opt: 428 Z-score: 278.9 bits: 60.9 E(85289): 8.5e-09
Smith-Waterman score: 569; 69.0% identity (80.5% similar) in 113 aa overlap (248-360:418-529)
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 THTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTG
:::::.:::.::::: . : ::::::::
NP_066 THSGEKPHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTG
390 400 410 420 430 440
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 EKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPY
.::::: ::::: :: .: :::::.::::::::.::::: :. . ::::::: :::
NP_066 DKPYECKVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAF-ISNYIRYHERTHTGEKPY
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370 380
pF1KE0 GCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
::.:::.: .:. : ::::::
NP_066 QCKQCGKAFIRASSCREHERTHTINR
510 520 530
>>NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [Homo (671 aa)
initn: 4657 init1: 1316 opt: 1327 Z-score: 802.5 bits: 158.1 E(85289): 5.9e-38
Smith-Waterman score: 1412; 53.2% identity (72.3% similar) in 412 aa overlap (1-383:1-411)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPG
: ::..::::: ::.:::::: : :::::.::::: .::: : : .::::.:... :
NP_005 MASVALEDVAVNFTREEWALLGPCQKNLYKDVMQETIRNLDCVVMKWKDQNIEDQYRYPR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHR
.:: ...::. : :.:.: ::: :: .. ..:.. :: ::: :. :. . ::.:.
NP_005 KNLRCRMLERFVESKDGTQCGETSSQIQDSIVTKNTLPGVGPCESSMRGEKVMGHSSLNC
70 80 90 100 110 120
130 140 150
pF1KE0 HILSHIGNKLFECEECPEK-----------LYH-----------------CKQCGKAFIS
.: :.: : .:: :: :: ::.:::.: :
NP_005 YIRVGAGHKPHEYHECGEKPDTHKQRGKAFSYHNSFQTHERLHTGKKPYDCKECGKSFSS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 LTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFN-YSSY
: ...:::... ..:::: . : : .::...: . :.:::: :.::.:.:::. ::::
NP_005 LGNLQRHMAVQRGDGPYKCKLCGKAFFWPSLLHMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAFSRSTYLGIH
:: ::::::::::: ::.:.:.: : :: .:::.:::::::.::.:.::: :. ::
NP_005 LR-HERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLRHERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIH
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 ERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTH
:::::::::: : .::::: : :. :: :::.:::: :.::::::.. ... .: :
NP_005 ERTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTHSAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE0 TGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
:: :. :: :::.: :.:.:::::::::::::::.::::.: ::.:.:
NP_005 TGNGPHKCKICGKGFDCPSSLQSHERTHTGEKPYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDG
360 370 380 390 400 410
NP_005 PHKCKVCGKAFVYPSVFQRHERTHTAEKPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKC
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 1900 init1: 697 opt: 972 Z-score: 595.4 bits: 119.7 E(85289): 2e-26
Smith-Waterman score: 972; 60.0% identity (77.4% similar) in 230 aa overlap (160-389:412-639)
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQS
:. ::..::.: : : : .::::: .
NP_005 SHERTHTGEKPYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHKCKVCGKAFVYPSVFQRHER
390 400 410 420 430 440
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pF1KE0 TYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTG
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:::.:::::.. . . .::: : : : : .:::.:: : :..::.:::::.:::::.
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:::::. :::..:.... :
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XP_011 THTAEKPYKCKQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCK-LGKACIDFCSFQNHKTTHTG
490 500 510 520 530 540
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 EKPYECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPY
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XP_011 EKPYECKECGKAFSRFRYLSRHKRTHTGEKPYECKTCRKAFGHYDNLKVHERIHSGEKPY
550 560 570 580 590 600
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKK
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XP_011 ECKECGKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFTHSRFLQGHEKTHTGENPYECKE
610 620 630 640 650 660
370 380
pF1KE0 CGKAFSCSSSLRKHERAYMW
:::::. :::..:.... :
XP_011 CGKAFASLSSLHRHKKTH-WKKTHTGENPYECKECGKAFASLSSLHRHKKTH
670 680 690 700 710
>>XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro (616 aa)
initn: 4625 init1: 1311 opt: 1317 Z-score: 797.0 bits: 156.9 E(85289): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 1317; 53.5% identity (70.5% similar) in 387 aa overlap (2-387:3-388)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRDVMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNP
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XP_011 MKDSVAFEDVAVNFTHEEWALLGPSQKNLYRDVMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GRNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLNLNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALH
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XP_011 RRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSIVNKNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RHILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFD
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XP_011 CYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLSYRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSS
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XP_011 SPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSLLRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LRQHERSHTGEKPYECKECGKAF-SRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRV
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XP_011 YLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLR-HERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRV
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 HERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERT
::: :.::::: :::::::: . ... .: :.: :. :: :::.: .. : :: :
XP_011 HERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMHSGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGT
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE0 HTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
:: :::::::.::: .: ::.:.: :.
XP_011 HTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGE
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 1945 init1: 717 opt: 976 Z-score: 598.0 bits: 120.1 E(85289): 1.4e-26
Smith-Waterman score: 976; 61.9% identity (77.4% similar) in 226 aa overlap (164-389:389-612)
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 EECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTG
:..::.: : : :: ::::: . :.::
XP_011 THTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTG
360 370 380 390 400 410
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 EKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPY
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XP_011 EKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKCK-CGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPY
420 430 440 450 460 470
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 ECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQ
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XP_011 ECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQ
480 490 500 510 520 530
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 CGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKA
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XP_011 CRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKA
540 550 560 570 580 590
380
pF1KE0 FSCSSSLRKHERAYMW
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XP_011 FSSLSSFNRHKRTH-WKDIL
600 610
>>XP_011526364 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro (653 aa)
initn: 4625 init1: 1311 opt: 1317 Z-score: 796.7 bits: 157.0 E(85289): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 1317; 53.5% identity (70.5% similar) in 387 aa overlap (2-387:40-425)
10 20 30
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRD
:::.:::::: ::.:::::: :::::::::
XP_011 GYPKMLEAANLMEGLVDIGPWVTLPRGQPEDSVAFEDVAVNFTHEEWALLGPSQKNLYRD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPGRNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLN
::.: .::: .: : :.:::.:. .: :: ::::. . :.::: :::.:: :
XP_011 VMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHRHILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFI
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XP_011 VNKNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 SLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSY
: . ::.. :: : :. :. .. . . :. :::. : ::: . :
XP_011 YRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAF-SRSTYLGI
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XP_011 LRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLR-
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 HERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERT
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XP_011 HERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIM
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KE0 HTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
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XP_011 HSGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGD
370 380 390 400 410 420
XP_011 GPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYK
430 440 450 460 470 480
>--
initn: 1945 init1: 717 opt: 976 Z-score: 597.8 bits: 120.2 E(85289): 1.5e-26
Smith-Waterman score: 976; 61.9% identity (77.4% similar) in 226 aa overlap (164-389:426-649)
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 EECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTG
:..::.: : : :: ::::: . :.::
XP_011 THTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTG
400 410 420 430 440 450
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 EKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPY
:: :.::.: ::: :: ::.:: :::::.:: :: :::.:. :...:: .:. :.::
XP_011 EKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKCK-CGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPY
460 470 480 490 500 510
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 ECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQ
:::::::::: :. :::::. :: ::: ::::: :..:::::..::::::::
XP_011 ECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQ
520 530 540 550 560 570
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 CGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKA
: ::: . : : .::::::: .:: ::.:::.:. :: : ::::::::::::::.::::
XP_011 CRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKA
580 590 600 610 620 630
380
pF1KE0 FSCSSSLRKHERAYMW
:: ::. .:.:.. :
XP_011 FSSLSSFNRHKRTH-WKDIL
640 650
>>NP_001157748 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 iso (663 aa)
initn: 4625 init1: 1311 opt: 1317 Z-score: 796.7 bits: 157.0 E(85289): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 1317; 53.5% identity (70.5% similar) in 387 aa overlap (2-387:50-435)
10 20 30
pF1KE0 MDSVSFEDVAVAFTQEEWALLDPSQKNLYRD
:::.:::::: ::.:::::: :::::::::
NP_001 LMEGLVDIGPWVTLPRGQPEVLEWGLPKDQDSVAFEDVAVNFTHEEWALLGPSQKNLYRD
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 VMQEIFRNLASVGNKSEDQNIQDDFKNPGRNLSSHVVERLFEIKEGSQYGETFSQDSNLN
::.: .::: .: : :.:::.:. .: :: ::::. . :.::: :::.:: :
NP_001 VMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSI
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LNKKVSTGVKPCECSVCGKVFICHSALHRHILSHIGNKLFECEECPEKLYHCKQCGKAFI
.::.. . : : :: :.:.. ::.:. .: :.: ::.: :: : :::::..
NP_001 VNKNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 SLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTGEKTYKCKHCDKAFNYSSY
: . ::.. :: : :. :. .. . . :. :::. : ::: . :
NP_001 YRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSSPGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPYECKECGKAF-SRSTYLGI
:: ::::::::::: ::.:.:.: :: .::. ::::::::::.:.::: . :.::
NP_001 LRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLR-
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 HERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQCGKAFKYSSNLCEHERT
:::::::::::.: .::::: : :::::: :.::::: :::::::: . ... .:
NP_001 HERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIM
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380
pF1KE0 HTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKAFSCSSSLRKHERAYMW
:.: :. :: :::.: .. : :: ::: :::::::.::: .: ::.:.: :.
NP_001 HSGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGD
380 390 400 410 420 430
NP_001 GPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYK
440 450 460 470 480 490
>--
initn: 1945 init1: 717 opt: 976 Z-score: 597.8 bits: 120.2 E(85289): 1.5e-26
Smith-Waterman score: 976; 61.9% identity (77.4% similar) in 226 aa overlap (164-389:436-659)
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 EECPEKLYHCKQCGKAFISLTSVDRHMVTHTSNGPYKGPVYEKPFDFPSVFQMPQSTYTG
:..::.: : : :: ::::: . :.::
NP_001 THTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTG
410 420 430 440 450 460
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 EKTYKCKHCDKAFNYSSYLREHERTHTGEKPYACKKCGKSFTFSSSLRQHERSHTGEKPY
:: :.::.: ::: :: ::.:: :::::.:: :: :::.:. :...:: .:. :.::
NP_001 EKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKCK-CGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPY
470 480 490 500 510 520
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 ECKECGKAFSRSTYLGIHERTHTGEKPYECIKCGKAFRCSRVLRVHERTHSGEKPYECKQ
:::::::::: :. :::::. :: ::: ::::: :..:::::..::::::::
NP_001 ECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQ
530 540 550 560 570 580
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 CGKAFKYSSNLCEHERTHTGVKPYGCKECGKSFTSSSALRSHERTHTGEKPYECKKCGKA
: ::: . : : .::::::: .:: ::.:::.:. :: : ::::::::::::::.::::
NP_001 CRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKA
590 600 610 620 630 640
380
pF1KE0 FSCSSSLRKHERAYMW
:: ::. .:.:.. :
NP_001 FSSLSSFNRHKRTH-WKDIL
650 660
389 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:19:22 2016 done: Sat Nov 5 20:19:23 2016
Total Scan time: 7.040 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]