Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0614, 364 aa
1>>>pF1KE0614 364 - 364 aa - 364 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5709+/-0.00118; mu= 15.3546+/- 0.069
mean_var=190.7390+/-75.175, 0's: 0 Z-trim(103.6): 202 B-trim: 988 in 2/44
Lambda= 0.092866
statistics sampled from 7141 (7480) to 7141 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 2415 337.1 1.5e-92
CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 1242 179.9 2.9e-45
CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 1225 177.6 1.4e-44
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 828 124.5 1.5e-28
CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 762 115.6 7e-26
CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 668 103.1 4.4e-22
CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 ( 384) 566 89.4 5.7e-18
CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 ( 353) 546 86.6 3.5e-17
CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 442 72.7 5.2e-13
CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 ( 334) 431 71.2 1.5e-12
>>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 2415 init1: 2415 opt: 2415 Z-score: 1775.2 bits: 337.1 E(32554): 1.5e-92
Smith-Waterman score: 2415; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVC
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CCDS67 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVST
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CCDS67 IFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGA
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CCDS67 WLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCDVLAYEKFFLLLA
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CCDS67 RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCDVLAYEKFFLLLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSND
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CCDS67 EFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSND
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 HSVV
::::
CCDS67 HSVV
>>CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 (353 aa)
initn: 984 init1: 984 opt: 1242 Z-score: 926.0 bits: 179.9 E(32554): 2.9e-45
Smith-Waterman score: 1242; 51.9% identity (80.8% similar) in 339 aa overlap (19-354:1-329)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGL--GIT
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CCDS70 MNE--CHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDW-TGTKLVIVLCVGTF
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
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CCDS70 FCLFIFFSNSLVIAAVIKNRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTV
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
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CCDS70 NRWFLRQGLLDSSLTASLTNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFM
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMR
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CCDS70 GAVPTLGWNCLCNISACSSLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFL
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CCDS70 LSPHTSGSISRRRTPMKLMKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVH
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CCDS70 LLALLNSVVNPIIYSYKDEDMYGTMKKMICCFSQENP-------ERRPSRIPSTVLSRSD
280 290 300 310 320 330
360
pF1KE0 SNDHSVV
CCDS70 TGSQYIEDSISQGAVCNKSTS
340 350
>>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 1043 init1: 1043 opt: 1225 Z-score: 913.7 bits: 177.6 E(32554): 1.4e-44
Smith-Waterman score: 1225; 57.3% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (23-328:6-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVC
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CCDS12 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 IFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVST
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CCDS12 VLVLLTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGA
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CCDS12 WFLRQGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMS
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CCDS12 LPAHSWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE0 RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFLLL
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CCDS12 EHVSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 AEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSN
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CCDS12 AEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENG
290 300 310 320 330 340
>>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 (382 aa)
initn: 790 init1: 538 opt: 828 Z-score: 625.9 bits: 124.5 E(32554): 1.5e-28
Smith-Waterman score: 828; 38.2% identity (72.6% similar) in 343 aa overlap (6-340:4-338)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAF-FYNRSGK-HLATEWNTVSKLVMGLGIT
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CCDS77 MGPTSVPLVKAHRSSVSD----YVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFIL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
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CCDS77 ICCFIILENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
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CCDS77 AQWFLREGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLIL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVF-WAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTM
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CCDS77 GGLPIMGWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLL-LLSIVILYCRIYSLVRTRSR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RMS--RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCP--QCDVLAYE
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CCDS77 RLTFRKNISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLDVGCKVKTCDILFRA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KFFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQIL-CCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTI
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CCDS77 EYFLVLAVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCK---CPSGDSAGKFKRPIIAGMEF
300 310 320 330 340 350
360
pF1KE0 LAGVHSNDHSVV
CCDS77 SRSKSDNSSHPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS
360 370 380
>>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 (378 aa)
initn: 706 init1: 501 opt: 762 Z-score: 578.2 bits: 115.6 E(32554): 7e-26
Smith-Waterman score: 762; 38.4% identity (70.9% similar) in 333 aa overlap (27-347:15-340)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLA---TEWNTVSKLVMGLGI
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CCDS66 MATALPPRLQPVRGNETLREHYQYVGK-LAGRLKEASEGSTLTTVLFL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TVCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLT
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CCDS66 VICSFIVLENLMVLIAIWKNNKFHNRMYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VSTWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIV
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CCDS66 PTVWFLREGSMFVALGASTCSLLAIAIERHLTMIKMRPYDANKRHRVFLLIGMCWLIAFT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 MGAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVF-WAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRT
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CCDS66 LGALPILGWNCLHNLPDCSTILPLYSKKYIAFCISIFTAI-LVTIVILYARIYFLVKSSS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MRMSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCC--PQCDVLAYEK
... :... : :.::.:::::...:: ::.: ..:.:.:: : : .: .
CCDS66 RKVANHNNSERS-----MALLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLIDVACRVQACPILFKAQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE0 FFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILC-CQ-RSE----NPTGPTEGSDRSASSL
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CCDS66 WFIVLAVLNSAMNPVIYTLASKEMRRAFFRLVCNCLVRGRGARASPIQPALDPSRSKSSS
290 300 310 320 330 340
350 360
pF1KE0 NHTILAGVHSNDHSVV
CCDS66 SNNSSHSPKVKEDLPHTAPSSCIMDKNAALQNGIFCN
350 360 370
>>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 (398 aa)
initn: 670 init1: 415 opt: 668 Z-score: 509.9 bits: 103.1 E(32554): 4.4e-22
Smith-Waterman score: 668; 34.1% identity (66.2% similar) in 331 aa overlap (27-347:12-341)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMG--LGIT
.: :.. :: .:: ..... . : . ..
CCDS12 MESGLLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVCLA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTV
:: ::.: :: :.... . ::: :.. :...:. .:..:: :: .. .:: : .:.
CCDS12 VCAFIVLENLAVLLVLGRHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 STWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVM
. :. :.: . ..::::: .:::::.:: .:. : : :.... .. : .....
CCDS12 ALWFAREGGVFVALTASVLSLLAIALERSLTMARRGPAPVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 GAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMR
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CCDS12 GLLPALGWNCLGRLDACSTVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 M-----SRHSSGPR-RNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQ--CDVL
. . ... : : . ..::.:. .:: ::. :: : ..:::::: :: : ::
CCDS12 LPARPGTAGTTSTRARRKPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLDVACPARTCPVL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 AYEKFFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNH
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CCDS12 LQADPFLGLAMANSLLNPIIYTLTNRDLRHALLRLVCCGRHSCGRDPS-GSQQSASAAEA
290 300 310 320 330 340
360
pF1KE0 TILAGVHSNDHSVV
CCDS12 SGGLRRCLPPGLDGSFSGSERSSPQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD
350 360 370 380 390
>>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 (384 aa)
initn: 578 init1: 210 opt: 566 Z-score: 436.2 bits: 89.4 E(32554): 5.7e-18
Smith-Waterman score: 566; 35.0% identity (63.5% similar) in 337 aa overlap (1-328:1-324)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLA----TEWNTVSKLVMGLG
: : .: . : :..: . ... :.. ::.::. :: : . .. : ::.
CCDS12 MNATGTPVAPESCQQLAAGG-----HSRLIVLHYNHSGR-LAGRGGPEDGGLGAL-RGLS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ITVCIFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRL
... ...: ::::..:: . : . .:: ..:.. .:...: ::. .. .: : ::
CCDS12 VAASCLVVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 TVSTWLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNR-RVVVVIVVIWTMA
. . :.::.::. :.:.::. .:: : :: :. : .. .. :: : . : .:
CCDS12 APAQWFLREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 IVMGAIPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVF-WAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQ
..: .: .::::.: .. ::.. :::: :..: .:: : ..: ::. :: :.
CCDS12 ALLGMLPLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYILFCLVIFAGVLATIMG-LYGAIFRLVQA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RTMRMSRHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLDVCCPQCDVLAYEK
.. : .. :. : :::::...: ::..:: : . ::: :: . . : .
CCDS12 SGQKAPR-PAARRKAR----RLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLR
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ---FFLLLAEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHT
..: :: .:::.::::::.:..:. . ..:::
CCDS12 GMDWILALAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSG
290 300 310 320 330 340
360
pF1KE0 ILAGVHSNDHSVV
CCDS12 ASTTDSSLRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI
350 360 370 380
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:: . . : :. .: ... .. . .: :
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:.: .:.::: .:::::::::... ...:. .. :....: . : ...:.:..:
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.:: .::.::..:.... . : : : : ..: :... .: .
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CCDS12 ERGMHMPTSPTFLEGNTVV
340 350
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...:: .. : ::.. : . :. :
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:: : ..:: :: ...: .:. :::.: : . . . ..:: : . . . .
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CCDS30 ATLAVVLGAFAACWLPFTVYCLLGDAHSPPL----YTYLTLLPATYNSMINPIIYAFRNQ
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CCDS30 DVQKVLWAVCCCCSSSKIPFRSRSPSDV
310 320 330
>>CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 (334 aa)
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CCDS93 AAAAENISAAVSSRVPAVEPEPELVVNPWDIVLCTSGTLISCENAIVVLIIFHNPSLRAP
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.. :...:: ::..::.. :. : . .: :. ::: .:..::: .::::.
CCDS93 MFLLIGSLALADLLAGIG---LITNFVFAYLLQSEATKLVTIGLIVASFSASVCSLLAIT
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CCDS93 VDRYLSLYYALTYHSERTVTFTYVMLVMLWGTSICLGLLPVMGWNCLRDESTCSVVRPLT
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CCDS93 AL-CLICCGCIPSSLAQRARSPSDV
320 330
364 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]