Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0585
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0585, 302 aa
1>>>pF1KE0585 302 - 302 aa - 302 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1071+/-0.0011; mu= 6.2378+/- 0.063
mean_var=203.4742+/-49.032, 0's: 0 Z-trim(109.0): 742 B-trim: 227 in 1/50
Lambda= 0.089912
statistics sampled from 9737 (10604) to 9737 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 2.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1394.1 NEK7 gene_id:140609|Hs108|chr1 ( 302) 2059 279.9 1.6e-75
CCDS6854.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 313) 1624 223.5 1.6e-58
CCDS55338.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 331) 1624 223.6 1.6e-58
CCDS55339.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 338) 1624 223.6 1.7e-58
CCDS48015.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 347) 1624 223.6 1.7e-58
CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189) 638 96.3 1.2e-19
CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214) 638 96.3 1.2e-19
CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1242) 638 96.3 1.2e-19
CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1258) 638 96.4 1.2e-19
CCDS56351.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1286) 638 96.4 1.2e-19
CCDS2863.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 ( 841) 633 95.5 1.5e-19
CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13 ( 708) 618 93.5 5.1e-19
CCDS32597.1 NEK8 gene_id:284086|Hs108|chr17 ( 692) 597 90.7 3.3e-18
CCDS73576.1 NEK3 gene_id:4752|Hs108|chr13 ( 506) 592 89.9 4.3e-18
CCDS46915.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 470) 580 88.3 1.2e-17
CCDS82836.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 482) 580 88.3 1.2e-17
CCDS54639.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 599) 580 88.4 1.4e-17
CCDS3069.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 645) 580 88.5 1.5e-17
CCDS9839.1 NEK9 gene_id:91754|Hs108|chr14 ( 979) 578 88.4 2.3e-17
CCDS55682.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 384) 566 86.4 3.7e-17
CCDS73024.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 388) 566 86.4 3.7e-17
CCDS1500.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 445) 566 86.5 4.1e-17
CCDS33293.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 510) 493 77.1 3.1e-14
CCDS63020.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 (1215) 493 77.5 5.5e-14
CCDS58750.1 STK36 gene_id:27148|Hs108|chr2 (1294) 493 77.6 5.7e-14
CCDS2421.1 STK36 gene_id:27148|Hs108|chr2 (1315) 493 77.6 5.8e-14
CCDS2176.2 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 (1328) 493 77.6 5.8e-14
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 481 75.5 9e-14
CCDS63021.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 460) 474 74.6 1.6e-13
CCDS63022.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 462) 466 73.5 3.3e-13
CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 465 73.8 6.2e-13
CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122) 465 73.9 6.5e-13
CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235) 465 73.9 6.9e-13
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 458 72.5 7.1e-13
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 457 72.4 8.1e-13
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 450 71.4 1.3e-12
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 450 71.4 1.4e-12
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 455 72.4 1.4e-12
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 448 71.1 1.6e-12
CCDS82837.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 540) 444 70.8 2.7e-12
CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 278) 438 69.6 3e-12
CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 334) 438 69.7 3.4e-12
CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 ( 853) 443 70.9 3.9e-12
CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001) 443 70.9 4.3e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 440 70.5 5.6e-12
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 442 71.0 5.6e-12
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 442 71.0 5.7e-12
CCDS34566.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1558) 441 70.9 6.9e-12
CCDS75544.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1604) 441 70.9 7e-12
CCDS34565.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1608) 441 70.9 7e-12
>>CCDS1394.1 NEK7 gene_id:140609|Hs108|chr1 (302 aa)
initn: 2059 init1: 2059 opt: 2059 Z-score: 1469.4 bits: 279.9 E(32554): 1.6e-75
Smith-Waterman score: 2059; 100.0% identity (100.0% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDEQSQGMQGPPVPQFQPQKALRPDMGYNTLANFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDEQSQGMQGPPVPQFQPQKALRPDMGYNTLANFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHPNVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHPNVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVNMCINPDPEKRPDVTYVYDVAKRMHACTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVNMCINPDPEKRPDVTYVYDVAKRMHACTA
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SS
::
CCDS13 SS
>>CCDS6854.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1614 init1: 1614 opt: 1624 Z-score: 1164.2 bits: 223.5 E(32554): 1.6e-58
Smith-Waterman score: 1624; 80.0% identity (91.3% similar) in 300 aa overlap (4-302:19-313)
10 20 30 40
pF1KE0 MDEQSQGMQGPPVPQFQPQK-ALRPDMGYNTLANFRIEKKIGRGQ
.. : :: :: .:. ..: .::.:.:::::::::
CCDS68 MAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHPPDPQRHPNTLSFR-----CSLADFQIEKKIGRGQ
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 FSEVYRAACLLDGVPVALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHPNVIKYYASFIED
:::::.:.:::: :::::::::..:::::: ::.::: :::::::::.::: :::::
CCDS68 FSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIED
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 NELNIVLELADAGDLSRMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHMHSRRVMHRDIKP
::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS68 NELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGC
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LLYEMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVNMCINPDPEKRPD
:::::::::::::::::::.:::.:::::::::::..::::.::.::.::: :::..:::
CCDS68 LLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPD
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE0 VTYVYDVAKRMHACTASS
. ::..:::.:: .:.
CCDS68 IGYVHQVAKQMHIWMSST
300 310
>>CCDS55338.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 (331 aa)
initn: 1614 init1: 1614 opt: 1624 Z-score: 1164.0 bits: 223.6 E(32554): 1.6e-58
Smith-Waterman score: 1624; 80.0% identity (91.3% similar) in 300 aa overlap (4-302:37-331)
10 20 30
pF1KE0 MDEQSQGMQGPPVPQFQPQK-ALRPDMGYNTLA
.. : :: :: .:. ..: .::
CCDS55 APFRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHPPDPQRHPNTLSFR-----CSLA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 NFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPVALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHP
.:.::::::::::::::.:.:::: :::::::::..:::::: ::.::: ::::::::
CCDS55 DFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHP
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 NVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLSRMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHM
:.::: :::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::.:::
CCDS55 NIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSAVEHM
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 HSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 YNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVN
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::..::::.::.::.
CCDS55 YNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVS
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE0 MCINPDPEKRPDVTYVYDVAKRMHACTASS
::: :::..:::. ::..:::.:: .:.
CCDS55 MCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
310 320 330
>>CCDS55339.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 (338 aa)
initn: 1614 init1: 1614 opt: 1624 Z-score: 1163.9 bits: 223.6 E(32554): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 1624; 80.0% identity (91.3% similar) in 300 aa overlap (4-302:44-338)
10 20 30
pF1KE0 MDEQSQGMQGPPVPQFQPQK-ALRPDMGYNTLA
.. : :: :: .:. ..: .::
CCDS55 TQVRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHPPDPQRHPNTLSFR-----CSLA
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 NFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPVALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHP
.:.::::::::::::::.:.:::: :::::::::..:::::: ::.::: ::::::::
CCDS55 DFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHP
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 NVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLSRMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHM
:.::: :::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::.:::
CCDS55 NIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSAVEHM
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 HSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 YNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVN
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::..::::.::.::.
CCDS55 YNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVS
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE0 MCINPDPEKRPDVTYVYDVAKRMHACTASS
::: :::..:::. ::..:::.:: .:.
CCDS55 MCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
310 320 330
>>CCDS48015.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 (347 aa)
initn: 1614 init1: 1614 opt: 1624 Z-score: 1163.7 bits: 223.6 E(32554): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 1624; 80.0% identity (91.3% similar) in 300 aa overlap (4-302:53-347)
10 20 30
pF1KE0 MDEQSQGMQGPPVPQFQPQK-ALRPDMGYNTLA
.. : :: :: .:. ..: .::
CCDS48 PRVRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHPPDPQRHPNTLSFR-----CSLA
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 NFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPVALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHP
.:.::::::::::::::.:.:::: :::::::::..:::::: ::.::: ::::::::
CCDS48 DFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHP
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 NVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLSRMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHM
:.::: :::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::.:::
CCDS48 NIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSAVEHM
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 HSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS48 HSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENG
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 YNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVN
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::..::::.::.::.
CCDS48 YNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVS
260 270 280 290 300 310
280 290 300
pF1KE0 MCINPDPEKRPDVTYVYDVAKRMHACTASS
::: :::..:::. ::..:::.:: .:.
CCDS48 MCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
320 330 340
>>CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189 aa)
initn: 535 init1: 385 opt: 638 Z-score: 466.4 bits: 96.3 E(32554): 1.2e-19
Smith-Waterman score: 638; 38.9% identity (72.9% similar) in 262 aa overlap (38-295:8-262)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MQGPPVPQFQPQKALRPDMGYNTLANFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPVALKKVQI
.:::.:.:... . :: ..:...:
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHPNVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLSRMIKHFK
. :..: : . .:. .: ...:::...: :: :.. : ::.. ..::: .:...
CCDS56 -SRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDL---FKRIN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KQKR-LIPERTVWKYFVQLCSALEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFF
:: :. : . .:::.: ::.:.:.:...::::: :.:.: :.:.:::.:..: .
CCDS56 AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLYSL
.: . :.. .:::::.::: ... :: :::::.:::.:::. .:. : . .:. .:
CCDS56 NSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMK--NL
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