Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0582
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0582, 306 aa
1>>>pF1KE0582 306 - 306 aa - 306 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5260+/-0.00119; mu= 14.3760+/- 0.070
mean_var=123.8857+/-35.441, 0's: 0 Z-trim(102.4): 364 B-trim: 372 in 1/48
Lambda= 0.115229
statistics sampled from 6515 (6940) to 6515 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 1.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1264 222.1 4.4e-58
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1263 221.9 4.9e-58
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1221 215.0 7e-56
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1205 212.3 3.9e-55
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1195 210.6 1.3e-54
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1194 210.4 1.4e-54
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1194 210.4 1.4e-54
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1164 205.5 4.6e-53
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1159 204.6 8e-53
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1131 200.0 2e-51
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1118 197.8 8.9e-51
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1093 193.6 1.6e-49
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1084 192.2 4.6e-49
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1067 189.3 3.1e-48
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1035 184.0 1.3e-46
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1025 182.3 4e-46
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1015 180.7 1.3e-45
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 991 176.7 2e-44
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 985 175.7 4e-44
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 979 174.7 8.1e-44
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 976 174.2 1.1e-43
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 965 172.4 4e-43
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 960 171.5 7.2e-43
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 955 170.7 1.3e-42
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 946 169.3 3.8e-42
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 944 168.9 4.5e-42
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 942 168.5 5.7e-42
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 937 167.7 1e-41
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 936 167.5 1.2e-41
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 927 166.0 3.2e-41
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 926 165.9 3.6e-41
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 917 164.4 1.1e-40
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 908 162.9 2.9e-40
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 907 162.7 3.2e-40
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 907 162.7 3.3e-40
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 906 162.6 3.6e-40
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 905 162.4 4e-40
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 900 161.6 7.2e-40
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 898 161.2 9e-40
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 891 160.1 2e-39
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 890 159.9 2.3e-39
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 890 159.9 2.3e-39
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 890 159.9 2.3e-39
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 888 159.5 2.8e-39
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 887 159.4 3.2e-39
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 881 158.4 6.3e-39
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 877 157.7 1e-38
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 869 156.4 2.6e-38
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 853 153.7 1.6e-37
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 839 151.4 8.2e-37
>>CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1288 init1: 1264 opt: 1264 Z-score: 1156.3 bits: 222.1 E(32554): 4.4e-58
Smith-Waterman score: 1264; 61.1% identity (85.1% similar) in 303 aa overlap (3-305:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNNVTEFILLGLTHNPELQKFLFVMFLITYLITLAGNLLISVIIFISPALGSPMYLF
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CCDS31 MEKKKNVTEFILIGLTQNPIMEKVTFVVFLVLYMITLSGNLLIVVTITTSQALSSPMYFF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LSYLSIIDIFYSSSIAPKMIFDLISENNTISFNGCMTQLFTEHFFAAAETILLSVMAYDC
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CCDS31 LTHLSLIDTVYSSSSAPKLIVDSFQEKKIISFNGCMAQAYAEHIFGATEIILLTVMACDC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YVAICKPLHYATIMTQSMCGFLMVVAGILGFVHGGIQTLFIAQLPFCGPNVIDHFMCDLV
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CCDS31 YVAICKPLNYTTIMSHSLCILLVAVAWVGGFLHATIQILFTVWLPFCGPNVIGHFMCDLY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PLLELACTDTHTLGPLIAANSGSLCFLIFSILDASYVIILCSLRSHSSEGHLKALSSCAS
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CCDS31 PLLKLVCIDTHTLGLFVAVNSGFICLLNFLILVVSYVIILRSLKNNSLEGRCKALSTCIS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HIFTVILFFVPCSYLYLRPLTSFPTDKAVTVFCTLFTPMLNPLIYTVKNKAVKNVIKKLW
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CCDS31 HIIVVVLFFVPCIFVYLRSVTTLPIDKAVAVFYTMVVPMLNPVVYTLRNAEVKSAIRKLW
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 KQIMTTDDK
.. .:.:.
CCDS31 RKKVTSDND
>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1263 init1: 1263 opt: 1263 Z-score: 1155.4 bits: 221.9 E(32554): 4.9e-58
Smith-Waterman score: 1263; 62.0% identity (83.9% similar) in 305 aa overlap (2-306:5-309)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNNVTEFILLGLTHNPELQKFLFVMFLITYLITLAGNLLISVIIFISPALGSPMYLF
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CCDS73 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LSYLSIIDIFYSSSIAPKMIFDLISENNTISFNGCMTQLFTEHFFAAAETILLSVMAYDC
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CCDS73 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YVAICKPLHYATIMTQSMCGFLMVVAGILGFVHGGIQTLFIAQLPFCGPNVIDHFMCDLV
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CCDS73 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PLLELACTDTHTLGPLIAANSGSLCFLIFSILDASYVIILCSLRSHSSEGHLKALSSCAS
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CCDS73 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HIFTVILFFVPCSYLYLRPLTSFPTDKAVTVFCTLFTPMLNPLIYTVKNKAVKNVIKKLW
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CCDS73 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 KQIMTTDDK
.. . ::
CCDS73 SRKDISGDK
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
initn: 1223 init1: 1056 opt: 1221 Z-score: 1116.8 bits: 215.0 E(32554): 7e-56
Smith-Waterman score: 1221; 57.6% identity (85.5% similar) in 304 aa overlap (4-306:61-364)
10 20 30
pF1KE0 MNNVTEFILLGLTHNPELQKFLFVMFLITYLIT
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CCDS31 QIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFLFVYIAT
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 LAGNLLISVIIFISPALG-SPMYLFLSYLSIIDIFYSSSIAPKMIFDLISENNTISFNGC
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CCDS31 VGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKTISFEGC
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 MTQLFTEHFFAAAETILLSVMAYDCYVAICKPLHYATIMTQSMCGFLMVVAGILGFVHGG
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CCDS31 MMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTGGLLHSM
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 IQTLFIAQLPFCGPNVIDHFMCDLVPLLELACTDTHTLGPLIAANSGSLCFLIFSILDAS
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CCDS31 IQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINFSLLLVS
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 YVIILCSLRSHSSEGHLKALSSCASHIFTVILFFVPCSYLYLRPLTSFPTDKAVTVFCTL
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CCDS31 YAVILLSLRTHSSEGRWKALSTCGSHIAVVILFFVPCIFVYTRPPSAFSLDKMAAIFYII
280 290 300 310 320 330
280 290 300
pF1KE0 FTPMLNPLIYTVKNKAVKNVIKKLWKQIMTTDDK
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CCDS31 LNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL
340 350 360 370
>>CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1205 init1: 1205 opt: 1205 Z-score: 1103.3 bits: 212.3 E(32554): 3.9e-55
Smith-Waterman score: 1205; 61.0% identity (83.4% similar) in 295 aa overlap (2-296:5-299)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNNVTEFILLGLTHNPELQKFLFVMFLITYLITLAGNLLISVIIFISPALGSPMYLF
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CCDS31 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LSYLSIIDIFYSSSIAPKMIFDLISENNTISFNGCMTQLFTEHFFAAAETILLSVMAYDC
:.:::.:: ::: .::.: : . ::.:: :::::::.: :::: ..:.:::.:::::
CCDS31 LAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YVAICKPLHYATIMTQSMCGFLMVVAGILGFVHGGIQTLFIAQLPFCGPNVIDHFMCDLV
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CCDS31 YVAICKPLHYTTVMKQHVCSLLVGVSWVGGFLHATIQILFICQLPFCGPNVIDHFMCDLY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PLLELACTDTHTLGPLIAANSGSLCFLIFSILDASYVIILCSLRSHSSEGHLKALSSCAS
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CCDS31 TLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALSTCVS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HIFTVILFFVPCSYLYLRPLTSFPTDKAVTVFCTLFTPMLNPLIYTVKNKAVKNVIKKLW
:: .::: :.:: ..:.:: ...: ::::.:: :..: ::::::::..: .::.:.::
CCDS31 HITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 KQIMTTDDK
CCDS31 SRKAISSVK
>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 1220 init1: 1195 opt: 1195 Z-score: 1093.8 bits: 210.6 E(32554): 1.3e-54
Smith-Waterman score: 1195; 58.0% identity (81.6% similar) in 305 aa overlap (2-306:35-339)
10 20 30
pF1KE0 MNNVTEFILLGLTHNPELQKFLFVMFLITYL
::::::::::::.::: :: ::: ::. :.
CCDS31 TNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFLLIYM
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 ITLAGNLLISVIIFISPALGSPMYLFLSYLSIIDIFYSSSIAPKMIFDLISENNTISFNG
.:. ::::: : :. : .::::::.::. ::.:: ::...::::: ::.::..::::.:
CCDS31 VTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTISFQG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 CMTQLFTEHFFAAAETILLSVMAYDCYVAICKPLHYATIMTQSMCGFLMVVAGILGFVHG
::.::: .:.::.::.::: ::::: :.::::::: :.. .: .....: : ::.:.
CCDS31 CMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGGFLHS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 GIQTLFIAQLPFCGPNVIDHFMCDLVPLLELACTDTHTLGPLIAANSGSLCFLIFSILDA
.: ::: :::::::::::.:.::: :::.::::.:.. : . ::.:..: . : .
CCDS31 LVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFFTILL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 SYVIILCSLRSHSSEGHLKALSSCASHIFTVILFFVPCSYLYLRPLTSFPTDKAVTVFCT
:: .:: ::...: ::. ::. .::::. .:::::::: .:: :: ..:: ::..:: :
CCDS31 SYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMTVVLT
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE0 LFTPMLNPLIYTVKNKAVKNVIKKLWKQIMTTDDK
..::::::::::.:: .:....:::.. .. :
CCDS31 FITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
310 320 330 340
>>CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1194 init1: 1194 opt: 1194 Z-score: 1093.4 bits: 210.4 E(32554): 1.4e-54
Smith-Waterman score: 1194; 58.4% identity (83.4% similar) in 296 aa overlap (2-297:5-300)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNNVTEFILLGLTHNPELQKFLFVMFLITYLITLAGNLLISVIIFISPALGSPMYLF
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300
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CCDS31 RRDLISSST
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CCDS31 YIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKNMALFYGI
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CCDS31 LTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
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CCDS73 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
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. .:
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