Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0577
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0577, 309 aa
1>>>pF1KE0577 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2801+/-0.00133; mu= 15.4066+/- 0.079
mean_var=153.8791+/-52.764, 0's: 0 Z-trim(101.1): 371 B-trim: 757 in 2/46
Lambda= 0.103391
statistics sampled from 5901 (6374) to 5901 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 1.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 2019 314.1 8.9e-86
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1325 210.6 1.3e-54
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 1270 202.4 3.8e-52
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 1253 199.8 2.3e-51
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 1235 197.1 1.4e-50
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 1229 196.2 2.6e-50
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1134 182.1 4.8e-46
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 1106 177.9 9e-45
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1091 175.7 4.2e-44
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 1082 174.3 1.1e-43
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1040 168.0 8.1e-42
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1032 166.9 1.9e-41
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1022 165.4 5.2e-41
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1017 164.7 9.2e-41
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1013 164.0 1.3e-40
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1012 163.9 1.6e-40
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 998 161.8 6.2e-40
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 998 161.8 6.2e-40
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 996 161.5 7.6e-40
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 994 161.3 1e-39
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 986 160.0 2.2e-39
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 983 159.6 3e-39
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 978 158.8 4.9e-39
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 970 157.6 1.1e-38
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 968 157.3 1.4e-38
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 966 157.0 1.7e-38
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 964 156.7 2.1e-38
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 964 156.7 2.1e-38
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 960 156.1 3.2e-38
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 959 156.0 3.5e-38
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 932 152.0 5.9e-37
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 929 151.5 7.8e-37
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 929 151.5 7.8e-37
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 928 151.3 8.6e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 926 151.1 1.1e-36
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 923 150.6 1.4e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 923 150.6 1.5e-36
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 921 150.3 1.8e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 918 149.9 2.6e-36
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 917 149.7 2.7e-36
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 915 149.4 3.3e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 911 148.8 5e-36
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 911 148.8 5e-36
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 911 148.8 5.1e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 910 148.7 5.6e-36
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 905 147.9 9.4e-36
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 905 147.9 9.4e-36
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 905 148.0 9.9e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 904 147.8 1.1e-35
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 902 147.5 1.3e-35
>>CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 (309 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2019 Z-score: 1653.5 bits: 314.1 E(32554): 8.9e-86
Smith-Waterman score: 2019; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 HALRRVIRK
:::::::::
CCDS33 HALRRVIRK
>>CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 (314 aa)
initn: 1356 init1: 1309 opt: 1325 Z-score: 1094.0 bits: 210.6 E(32554): 1.3e-54
Smith-Waterman score: 1325; 64.0% identity (85.7% similar) in 308 aa overlap (2-309:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHL
:. . : ::.::::::::: .: .. .:.::::.::::.: :::::.::::::.:
CCDS33 MSNEDMEQDNTTLLTEFVLTGLTYQPEWKMPLFLVFLVIYLITIVWNLGLIALIWNDPQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 HMPMYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLL
:.:::.:::.::: :: :...::.:::::: :. ::::.::. ::. :: ..:::::::
CCDS33 HIPMYFFLGSLAFVDAWISSTVTPKMLVNFLAKNRMISLSECMIQFFSFAFGGTTECFLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VMMAYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIH
. ::::::::::.::::::.:.:.: .::..:.. :::: :.: :..::::: ::::
CCDS33 ATMAYDRYVAICKPLLYPVIMNNSLCIRLLAFSFLGGFLHALIHEVLIFRLTFCNSNIIH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YFYCEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRS
.:::.:. :: :::. :::: ::.::... ::. :..:.. ::: .:: :::::: .:
CCDS33 HFYCDIIPLFMISCTDPSINFLMVFILSGSIQVFTIVTVLNSYTFALFTILKKKSVRGVR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KAFSTCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNK
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CCDS33 KAFSTCGAHLLSVSLYYGPLIFMYLRPASPQADDQDMIDSVFYTIIIPLLNPIIYSLRNK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 KVMHALRRVIRK
.:. .. .....
CCDS33 QVIDSFTKMVKRNV
310
>>CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 1249 init1: 1249 opt: 1270 Z-score: 1049.6 bits: 202.4 E(32554): 3.8e-52
Smith-Waterman score: 1270; 61.9% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (3-309:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
. : : ::.:::::::. .: .. .:..:::.::::..::::::..::.:::::.:
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
:::.::.::: :: :...::.:: ::: :. ::::.:: ::. :: :.:::::::. :
CCDS33 MYLLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSFAISVTTECFLLATM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
:::::::::.:::::..:.: : .:: .::: :.:: :.: ..:.::::: ::.:..:
CCDS33 AYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
:. . : ::::. ::: ::.:::.. ::. ...::..::: ::: ::::::.:: :::
CCDS33 CDTIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFAILKKKSDKGVRKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
:::::::.::::::: :.:.:: ::: :.::: : ::::.:::::::.:::::::.:
CCDS33 STCGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVT
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HALRRVIRK
.. ....:
CCDS33 VSFTKMLKKHVKVSY
300 310
>>CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 (325 aa)
initn: 1294 init1: 1241 opt: 1253 Z-score: 1035.8 bits: 199.8 E(32554): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 1253; 60.3% identity (84.0% similar) in 307 aa overlap (2-308:16-322)
10 20 30 40
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLG
.. : : ::.:::::::. .: .. .:..:::.::::..::::
CCDS33 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 LIVLIWNDPHLHMPMYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFF
::::::.:::::.:::::::.::: :: :...::.::.::: :. ::::.::..::. .
CCDS33 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDASLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ASSATTECFLLVMMAYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLL
....:::::::. ::::::::::. :::::.:.:.: ::: .:.. :.:: :.: .. .
CCDS33 VTTVTTECFLLATMAYDRYVAICKALLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 RLTFCRFNIIHYFYCEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFD
::::: :::..:::.:. :.::::. ::: ::.:::.. .:. :. ::.:::: .::
CCDS33 RLTFCNSNIIQHFYCDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ILKKKSEKGRSKAFSTCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPL
::.::: :: :: ::::::::::::::: : : :. :: :.::: . :::::.:.::
CCDS33 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLTFKYLGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPL
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE0 LNPFIYSLRNKKVMHALRRVIRK
:::.:::::::.:. .. ....
CCDS33 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
310 320
>>CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 (310 aa)
initn: 1252 init1: 1225 opt: 1235 Z-score: 1021.5 bits: 197.1 E(32554): 1.4e-50
Smith-Waterman score: 1235; 60.9% identity (83.1% similar) in 307 aa overlap (3-309:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
. : : ::.:::::::. .: .. .:..:::.::::..::::::..::.:::::.:
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
:::.::.::: :: :.:.: .::.::: :. ::::.:: :.. :: :.:::::::. :
CCDS33 MYLLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
:::::::::.:::::..:.: : .:: .::: :.:: :.: ..:.::::: :::..::
CCDS33 AYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
:.:. :.::: . ::: ::.:::.. ::. :. :..::: ::. :::::: :: :::
CCDS33 CDIIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
::::::::::::::: : :::. :: :.::: . :::::.:.:::::.:::::::.:.
CCDS33 STCGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVI
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HALRRVIRK
.. .....
CCDS33 ASFTKMFKRNDV
300 310
>>CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 1213 init1: 1213 opt: 1229 Z-score: 1016.6 bits: 196.2 E(32554): 2.6e-50
Smith-Waterman score: 1229; 59.3% identity (83.4% similar) in 307 aa overlap (3-309:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
. : : ::.:::::::. .: .. .:..:::.::::..::::::..::.:::::.:
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
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