Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0394
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0394, 1120 aa
1>>>pF1KE0394 1120 - 1120 aa - 1120 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1841+/-0.00106; mu= 18.4808+/- 0.063
mean_var=86.1665+/-17.197, 0's: 0 Z-trim(105.2): 31 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.138167
statistics sampled from 8267 (8293) to 8267 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 4.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42071.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15 (1120) 7430 1491.8 0
CCDS42070.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15 (1069) 6930 1392.1 0
CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19 ( 858) 440 98.4 7.6e-20
CCDS45707.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 ( 937) 432 96.8 2.5e-19
CCDS11489.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 ( 972) 432 96.8 2.6e-19
CCDS3468.1 GUF1 gene_id:60558|Hs108|chr4 ( 669) 381 86.6 2.1e-16
CCDS59295.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 ( 962) 383 87.0 2.2e-16
CCDS47232.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5 ( 513) 328 75.9 2.6e-13
CCDS4024.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5 ( 732) 328 76.0 3.5e-13
CCDS4023.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5 ( 779) 328 76.0 3.7e-13
CCDS82867.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3 ( 591) 304 71.2 8e-12
CCDS33885.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3 ( 751) 304 71.2 9.8e-12
CCDS77851.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3 ( 770) 304 71.2 1e-11
>>CCDS42071.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15 (1120 aa)
initn: 7430 init1: 7430 opt: 7430 Z-score: 7998.2 bits: 1491.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7430; 100.0% identity (100.0% similar) in 1120 aa overlap (1-1120:1-1120)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 WGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILEN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 IWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 QKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 DAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 RGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 GFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 LPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 TAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 MKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 SSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 EDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 KFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 LIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 MFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120
pF1KE0 ADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHAEKQRTLSKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHAEKQRTLSKNK
1090 1100 1110 1120
>>CCDS42070.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15 (1069 aa)
initn: 6920 init1: 6920 opt: 6930 Z-score: 7459.9 bits: 1392.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7002; 95.4% identity (95.4% similar) in 1120 aa overlap (1-1120:1-1069)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSR
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHG-----------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ----------------------NEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCIIVVDAV
40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINALTGTL
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFTSAIDG
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 WGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WGFGIEHFARIYSQKIGIKKEVLMKTLWGDYYINMKAKKIMKGDQAKGKKPLFVQLILEN
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 IWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVC
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 QKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAV
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 DAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEP
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pF1KE0 RGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPL
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pF1KE0 GFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCS
490 500 510 520 530 540
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pF1KE0 LPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLV
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pF1KE0 TAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQ
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pF1KE0 MKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLPEEVTQILEENSDLIRSMEQLT
670 680 690 700 710 720
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 SSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNIVDQIWSFGPRKCGPNILVNKS
730 740 750 760 770 780
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 EDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLSGPMCEEPLMGVCFVLEKWDLS
790 800 810 820 830 840
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 KFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQ
850 860 870 880 890 900
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 LIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LIATMKEACRYALQVKPQRLMAAMYTCDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTD
910 920 930 940 950 960
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 MFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSGLASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEK
970 980 990 1000 1010 1020
1090 1100 1110 1120
pF1KE0 ADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHAEKQRTLSKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKIVEHAEKQRTLSKNK
1030 1040 1050 1060
>>CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19 (858 aa)
initn: 1670 init1: 432 opt: 440 Z-score: 469.8 bits: 98.4 E(32554): 7.6e-20
Smith-Waterman score: 1465; 30.5% identity (53.2% similar) in 1130 aa overlap (1-1100:1-844)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVLNSLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGKTTLADCLISSNGIISSRLAGKLRYMDSR
:: ..:.. .. . :::::. :.:::::::.::.: :. . :::.: ::. :. :.:
CCDS12 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE0 EDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEE------------YLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVR
.::: : ::.::.:::: : .... .:::::::::::::::::..:.:
CCDS12 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ICDGCIIVVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKN
. :: ..::: : ::: ::..::::: : :.:::..::.:: ..::.. :.: :. ..
CCDS12 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPE
:.:..:.. .: :.. .: .:. . : :
CCDS12 IVENVNVIISTY-------------GEGESGP---MGNIMID----------------PV
190 200
230 240 250 260 270
pF1KE0 QGNVVFTSAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIK-----------KEV--LMKTLWGDYYINM
:.: : :.. ::.: ...::..: :.. : :.: .:: :::: :..
CCDS12 LGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDP
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 KAKKIMKGDQA-KGKK-P-LFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREA
:. :. . .::: : : ::::. :....::... :.. :.. .: .:. . :
CCDS12 ANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDS-ED
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RHSDPKVQINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPET
. .. : ..:. .::: . :.: :. .::::. : : :. : ::.
CCDS12 KDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCE-LLYEG-------PPDD
330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 QALKAAFMKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEK
.: .. .: . .:.....:::
CCDS12 EA-AMGIKSC--DPKGPLMMYISKMV----------------------------------
380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 LAAAQGQAPLEPTQDGSAIETCPKGEEPRGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVF
::.: ::. : ::.:::
CCDS12 -----------PTSD--------KGR--------------------------FYAFGRVF
410
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SGVARRGKKIFVLGPKYSPLEFLRRVPLGFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELE
::.. : :. ..::.:.: . . : : .. :.::: .:
CCDS12 SGLVSTGLKVRIMGPNYTP------------GKKEDLYLKP------IQRTILMMGRYVE
420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 YLEEVPPGNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQ
.:.:: ::..:. :...:..:..:. .. . ..: ..:.:::::: :.:...:.
CCDS12 PIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPK
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 LVKGMKLLNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPF
::.:.: : ..:: :: .:.:.:::... :::.::. :: ::.: : : :. :.:.. .
CCDS12 LVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSY
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KE0 RETITKPPKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQMKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLS
:::... .:. : .::: :
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..: :.:. :. ....:: . .:. ... . : : ..
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: .:: ::: :::::.. .. : .. .:.:.:
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:: :: : .::: . :: : .. : .: ..:
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.::.: : .. : :: : ..: ::: .: .:.
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.:.: .:.::....:.:..: . :: ::..:: ::: :::::. ..:. :.: : :
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: ::.::.:.:.::: :. .. . . .::::::
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1120
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CCDS12 LDKL
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. . . . .:.... . . : :..::: . ..:. . : ::
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.. : ::... .. : .:..:...: . : .:. :
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. .::.:: . . : :: :. : .
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:: ::.:.:.::. . .. : . . ::..: .:.::::
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CCDS45 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
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340 350 360 370 380 390
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. . . . .:.... . . : :..::: . ..:. . : ::
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400 410 420 430 440 450
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CCDS11 IVQGFQWGTREGPLCDELIRNV----------KFKILDAV-VAQEPLHR-----GG----
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CCDS11 ------------------------------GQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVE
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CCDS11 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
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CCDS59 LKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLI-SMYST-------------------------------
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CCDS59 -----DENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYF
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CCDS59 NPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHL-TKEEL
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...:: :: . : :... ..:.::. . : : ::.:..: ....:::: .:::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]