Result of FASTA (omim) for
pF1KE0383
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0383, 1048 aa
1>>>pF1KE0383 1048 - 1048 aa - 1048 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5484+/-0.000392; mu= 20.8963+/- 0.024
mean_var=87.9536+/-18.228, 0's: 0 Z-trim(113.2): 189 B-trim: 1169 in 1/56
Lambda= 0.136756
statistics sampled from 22154 (22369) to 22154 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 11.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_789781 (OMIM: 609659) NACHT, LRR and PYD domain (1048) 7165 1424.7 0
NP_001303929 (OMIM: 609659) NACHT, LRR and PYD dom (1029) 5794 1154.2 0
NP_789792 (OMIM: 609665) NACHT, LRR and PYD domain (1093) 2168 438.9 7.6e-122
XP_011518346 (OMIM: 609665) PREDICTED: NACHT, LRR (1052) 2148 434.9 1.1e-120
NP_789780 (OMIM: 609660) NACHT, LRR and PYD domain (1043) 1571 321.0 2.1e-86
NP_001307986 (OMIM: 609660) NACHT, LRR and PYD dom (1036) 1561 319.1 8.2e-86
NP_001167553 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD dom (1040) 1543 315.5 9.7e-85
NP_001167554 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD dom (1039) 1539 314.7 1.7e-84
NP_001167552 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD dom (1062) 1534 313.8 3.4e-84
NP_060322 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD domain (1062) 1534 313.8 3.4e-84
NP_703148 (OMIM: 609658) NACHT, LRR and PYD domain (1200) 1496 306.3 6.7e-82
NP_604393 (OMIM: 609645) NACHT, LRR and PYD domain ( 994) 1346 276.6 4.7e-73
NP_996611 (OMIM: 231090,609661) NACHT, LRR and PYD ( 980) 1280 263.6 3.9e-69
XP_011524903 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1008) 1280 263.6 3.9e-69
NP_001120727 (OMIM: 231090,609661) NACHT, LRR and (1037) 1280 263.6 4e-69
XP_011524901 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1037) 1280 263.6 4e-69
XP_006723139 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1037) 1280 263.6 4e-69
XP_006723138 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1037) 1280 263.6 4e-69
XP_011524898 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1065) 1280 263.6 4.1e-69
XP_016881834 (OMIM: 609645) PREDICTED: NACHT, LRR ( 937) 1271 261.8 1.3e-68
XP_016881833 (OMIM: 609645) PREDICTED: NACHT, LRR ( 938) 1270 261.6 1.5e-68
XP_011525781 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH (1005) 1263 260.3 4e-68
NP_001264058 (OMIM: 609648,611762) NACHT, LRR and (1004) 1262 260.1 4.6e-68
NP_653288 (OMIM: 609648,611762) NACHT, LRR and PYD (1061) 1260 259.7 6.3e-68
XP_011525782 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH (1005) 1257 259.1 9.2e-68
XP_016882956 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 1255 258.7 1.1e-67
XP_016882955 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 1255 258.7 1.1e-67
XP_016882953 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 1255 258.7 1.1e-67
XP_016882954 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 1255 258.7 1.1e-67
XP_016882952 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 1255 258.7 1.1e-67
XP_016882950 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH (1005) 1255 258.7 1.2e-67
XP_016882949 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH (1061) 1255 258.7 1.3e-67
NP_001264055 (OMIM: 609648,611762) NACHT, LRR and (1062) 1255 258.7 1.3e-67
XP_016882951 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH (1004) 1250 257.7 2.4e-67
XP_011525784 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 948) 1247 257.1 3.4e-67
XP_011542357 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P ( 865) 1051 218.4 1.4e-55
XP_011542355 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P ( 922) 1045 217.2 3.3e-55
NP_631915 (OMIM: 231090,609661) NACHT, LRR and PYD (1009) 1045 217.3 3.6e-55
NP_001120933 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) N ( 979) 1042 216.7 5.3e-55
NP_001230062 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) N (1034) 1042 216.7 5.5e-55
XP_016855671 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P (1036) 1042 216.7 5.5e-55
XP_016855670 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P (1036) 1042 216.7 5.5e-55
XP_011542350 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P (1036) 1042 216.7 5.5e-55
NP_004886 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) NACH (1036) 1042 216.7 5.5e-55
NP_001073289 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) N (1036) 1042 216.7 5.5e-55
XP_016855673 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P ( 922) 1037 215.6 1e-54
NP_899632 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) NACH ( 922) 1037 215.6 1e-54
NP_001120934 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) N ( 979) 1037 215.7 1e-54
XP_016855672 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P ( 979) 1037 215.7 1e-54
NP_789790 (OMIM: 609663) NACHT, LRR and PYD domain ( 991) 1016 211.5 1.9e-53
>>NP_789781 (OMIM: 609659) NACHT, LRR and PYD domains-co (1048 aa)
initn: 7165 init1: 7165 opt: 7165 Z-score: 7636.9 bits: 1424.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7165; 100.0% identity (100.0% similar) in 1048 aa overlap (1-1048:1-1048)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LTELSTGTMPITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 LTELSTGTMPITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 INAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 INAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 GVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 FYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 DLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNTM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 EKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 PNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 QTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LIASPRGSKSYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 LIASPRGSKSYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SPGSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRCQYLHEVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 SPGSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRCQYLHEVEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 TVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 TVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 KALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 KALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 RVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 RVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVAQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 LERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 LERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 LVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCTLQILEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 LVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCTLQILEL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 ENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVIFCIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 ENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVIFCIPA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KE0 WTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
::::::::::::::::::::::::::::
NP_789 WTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
1030 1040
>>NP_001303929 (OMIM: 609659) NACHT, LRR and PYD domains (1029 aa)
initn: 6115 init1: 5768 opt: 5794 Z-score: 6175.2 bits: 1154.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6988; 98.2% identity (98.2% similar) in 1048 aa overlap (1-1048:1-1029)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFKQLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LTELSTGTMPITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTELSTGTMPITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDKMCVVVRRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 INAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INAILPTLEPEDLNVGETQVNLEEGESGKIRRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVHRHEEYLPCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLIDRLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSEDWRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSWQTCKPLLKCPSLVTLPGFNTM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNATSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QTGVTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LIASPRGSKSYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIASPRGSKSYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SPGSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRCQYLHEVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPGSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRCQYLHEVEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 TVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVTLNFMNVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 KALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 RVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVAQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 LERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQR
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LERLS-------------------QSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHLRCPLQR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCTLQILEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVIFCIPA
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::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
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:.: ..:::: . .:. : .:.. . ::: :: . :. .:: . ... ..
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: :. : ::. :..::: :.::: :..:.:..::....: .. .::.. .:.
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:: ..::..:: . ::... . .:: .:..::...:.:.::. .. . : ::: :
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.: . . .:.: : .:::::.::.::: .:. ::::::.:...: .: ..:..:.
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:::::: : ... : .. .::::. ::..:: ..: .:. .:.:.. : :. :..:
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. .:... : :. :::: . ::::::.::.: . : ... :. :
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. .:..: ::::.::: .. .:..:.::.:. : :::. . .: . : :
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.::.::.: ...::.:::. . ::.. : .. .. ::.::::.:. :. ..:.::. :
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. :. ..: : ... ... . . :::::::. ::..:. : . .: : .. : :
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:.:: ::::.: : ...: : . : : : :.: . :. : : :
NP_789 CKLQTLRLESCNLTVFCCLNISNALIRSQSLIFLNLSTNNLLDDGVQLLCEALRHPKCYL
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::::.:.:.::. :: :. : ..: :::: ::.:.: : :.: . .:: : .: :. :
NP_789 ERLSLESCGLTEAGCEYLSLALISNKRLTHLCLADNVLGDGGVKLMSDALQHAQCTLKSL
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:::.: .: . . ..: .::.: :::. : :.:.:: :::.....:.:.:: :::
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pF1KE0 NCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEVIFCIPAW
.:..:. :: .::.. .: .:: :::..: . :. ::.:.
NP_789 GCVLTNACCLDLASVILNNPNLRSLDLGNNDLQDDGVKILCDALRYPNCNIQRLGLEYCG
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NP_789 LTSLCCQDLSSALICNKRLIKMNLTQNTLGYEGIVKLYKVLKSPKCKLQVLGLCKEAFDE
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>--
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NP_789 KPDCNYHNEEDVSWWWCF
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XP_011 LEHLFDVDVKTGAQPQIVVLQGAAGVGKTTLVRKAMLDWAEGSLYQQRFKYVFYLNGREI
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XP_011 EHPVSFLMSSLLRKVMLPEASLLVTTRLTTSKRLKQLLKNHHYVELLGMSEDAREEYIYQ
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:::::: : ... : .. .::::. ::..:: ..: .:. .:.:.. : :. :..:
XP_011 CYISSLF-TPVDGGSPSLPNQAQLRRLCQVAAKGIWTMTYVFYRENLRRLGLTQSDVSSF
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pF1KE0 LGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQRLIASPRG
. .:... : :. :::: . ::::::.::.: . : ... :. :
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.::.::.: ...::.:::. . ::.. : .. .. ::.::::.:. :. ..:.::. :
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. :. ..: : ... ... . . :::::::. ::..:. : . .: : .. : :
XP_011 K--KILKTSLP-TNTWDGDRITHCWQDLCSVLHTNEHLRELDLYHSNLDKSAMNILHHEL
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pF1KE0 TRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
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>>NP_789780 (OMIM: 609660) NACHT, LRR and PYD domains-co (1043 aa)
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NP_789 MNFSVITC-PNGGTNQGLLPYLMALDQYQLEEFKLCL
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pF1KE0 --QLLLTELST--GTMP-ITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDK
: :. :. : .: : : ....:. .. :: :.:: .:: :. .:: :: .
NP_789 EPQQLMDFWSAPQGHFPRIPWANLRAADPLNLSFLLDEHFPKGQAWKVVLGIFQTMNLTS
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.: :: :.. . : : : :::.. :. :. : :: :.:..
NP_789 LCEKVRAEMKENVQTQELQDPTQEDLEMLEAAAGNMQTQGCQDPNQEELDELEEETGNVQ
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pF1KE0 ---------------------RRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQGVHRHEEYL
:.:. :. ... :: .:: .. . . .::: :
NP_789 AQGCQDPNQEEPEMLEEADHRRKYRENMKAELLETWDNISWPKDHVYIRNTSKDEHEE-L
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:: :.: .. : .:... : :.::: :: ..:..:: . .. .. .::. :...
NP_789 QRLLDPNRTRA-QAQTIVLVGRAGVGKTTLAMQAMLHWANGVLFQQRFSYVFYLSCHKIR
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. .:.::: :: . . ..::.:..::...:::::. . . . :.: : :
NP_789 YMKETTFAELISLDWPDFDAPIEEFMSQPEKLLFIIDGFEEIIISESRSESLDDGSPCTD
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NP_789 WYQELPVTKILHSLLKKELVPLATLLITIK--TWFVRDLKASLVNPCFVQITGFTGDDLR
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pF1KE0 KYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSCPNA
::. .: . : ...:. .: :: : .:.::: ::: ::: : .: . ..
NP_789 VYFMRHFDDSSEVEKILQQLRKNETLFHSCSAPMVCWTVCSCLKQPKVRYYDLQSITQTT
400 410 420 430 440 450
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::... ..:.:: : ... .: ..:: :: ...: .....::: : :.
NP_789 TSLYAYFFSNLFSTAEVDLADDSWPGQWRALCSLAIEGLWSMNFTFNKEDTEIEGLEVPF
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. .. ..::..: .:: ..:::::::. .:: :... : . ... :.
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.: .: . . ::.::.::. : .:....::.: ..::: : : . :
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. .... .. .:. :. .: : ...::...::..:. : ..:: : .:
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:::: . :.:. .:. :.. : :.. ::::.:..:.:.:::.: . .:: .
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:: : : :..: . : .. .:: .:...: :::. :.:.:::: ::::::: : .:
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. : : .: .:. ::: . :.: ... : .:.: : . . :. ::.:.... :
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NP_789 G
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::... ..:.:: : ... .: ..:: :: ...: .....::: : :.
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.. :: .:: ... ... . :. ::.. .:.:::.::. :: :::.:.. . .
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: : . . .:. ::.: .:: .:.... ..... :.. : .: :.::.:.:
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. :... : : . :. . ..:. .:. .: . : .: ::::.:..: : :.
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...: :. ... : . :.::..... .. . ...: .: :.. . :: .:
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NP_001 VKFLCEGLRYPECKLQTLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKF
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NP_001 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPH
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pF1KE0 DQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWD-VTSNIFAIMNCDKMCV--VVRRE-----INAIL
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NP_001 KEMASLQVFEKMHRMDL---SERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDVDEML
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pF1KE0 PTLEPEDLNVGETQVNL----EEGESGKI----RRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDF
.. : ::. :. .: .:: : . . :: .: .:::....
NP_001 ERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMW--KSWPGDSKEV
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.. .:.. .: . :. : ::.. : :.::: ::.:.:..::.... ::
NP_001 QVMA-ERYKMLIP-FSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLI-HKF
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pF1KE0 WCAFYFHCQEVNQTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEELTSTLID
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NP_001 KYAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGA
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NP_001 LIEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGF
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pF1KE0 NTMEKIKYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLT
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NP_001 LEEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPV
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NP_001 PTCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQ------LRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERL
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.... . :: .:::. . : : ..::.:..::::.: .. .. :. .
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pF1KE0 IQRLIAS-PRGSKSYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHK
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NP_060 AINDSFLSASLVRILCEQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQG
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pF1KE0 VEVESKAVKLLCRVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSL
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NP_060 ND-QDDMFPALCEVLRHPECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNEL
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pF1KE0 ENCGAYYLSVAQ------LERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDE
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pF1KE0 EAFSSQKKREEVIFCIPAWTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
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NP_060 ETLTCSSGTLRTLRLKIDDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
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1048 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]