Result of FASTA (omim) for
pF1KE0382
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0382, 710 aa
1>>>pF1KE0382 710 - 710 aa - 710 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3543+/-0.000462; mu= 19.8253+/- 0.029
mean_var=75.3200+/-15.588, 0's: 0 Z-trim(110.8): 29 B-trim: 203 in 1/47
Lambda= 0.147781
statistics sampled from 19199 (19227) to 19199 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 11.270
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_443187 (OMIM: 606776) protein-glutamine gamma-g ( 710) 4816 1037.0 0
XP_016877392 (OMIM: 606776) PREDICTED: protein-glu ( 711) 4790 1031.4 0
NP_945345 (OMIM: 613900,613908) protein-glutamine ( 706) 1975 431.3 6.4e-120
NP_963925 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 720) 1895 414.2 8.8e-115
NP_003236 (OMIM: 600238) protein-glutamine gamma-g ( 693) 1820 398.2 5.6e-110
NP_001241663 (OMIM: 613900,613908) protein-glutami ( 625) 1760 385.4 3.6e-106
NP_945189 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 548) 1589 348.9 3.1e-95
XP_011527330 (OMIM: 190196) PREDICTED: protein-glu ( 687) 1589 349.0 3.7e-95
NP_001310245 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 687) 1589 349.0 3.7e-95
NP_004604 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 687) 1589 349.0 3.7e-95
NP_004236 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 638) 1471 323.8 1.3e-87
NP_001310247 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 627) 1435 316.1 2.6e-85
NP_000350 (OMIM: 190195,242300) protein-glutamine ( 817) 1340 295.9 4.1e-79
NP_001310246 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 606) 1229 272.2 4.3e-72
NP_000120 (OMIM: 134570,188050,608446,613225) coag ( 732) 1175 260.7 1.4e-68
NP_003232 (OMIM: 600585) protein-glutamine gamma-g ( 684) 1146 254.5 1e-66
XP_011532344 (OMIM: 600585) PREDICTED: protein-glu ( 729) 1146 254.5 1e-66
NP_001107606 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte mem ( 691) 817 184.4 1.3e-45
NP_000110 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte membra ( 721) 817 184.4 1.4e-45
XP_011519651 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 817 184.4 1.4e-45
XP_011519652 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 817 184.4 1.4e-45
XP_011519653 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 817 184.4 1.4e-45
XP_011519654 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 709) 750 170.1 2.7e-41
XP_011519656 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 536) 724 164.5 1e-39
XP_005254282 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 656) 603 138.7 6.8e-32
XP_011519655 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 686) 603 138.8 7.1e-32
XP_011520532 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 399 95.1 5.4e-19
XP_016878218 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 399 95.1 5.4e-19
>>NP_443187 (OMIM: 606776) protein-glutamine gamma-gluta (710 aa)
initn: 4816 init1: 4816 opt: 4816 Z-score: 5547.5 bits: 1037.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4816; 100.0% identity (100.0% similar) in 710 aa overlap (1-710:1-710)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHITF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 VAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 EISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITSW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 PWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 GNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 SNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 DPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILAH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 NTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLDLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 ESGGLRDQPAQLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQALLHGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 ESGGLRDQPAQLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQALLHGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 GTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLIRVSGIAEVEETGRSMLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 GTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLIRVSGIAEVEETGRSMLVL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 KDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCTMVLEGSGLINGQIAKDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 KDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCTMVLEGSGLINGQIAKDLG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE0 TLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDIFVTVAGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 TLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDIFVTVAGAP
670 680 690 700 710
>>XP_016877392 (OMIM: 606776) PREDICTED: protein-glutami (711 aa)
initn: 4790 init1: 4790 opt: 4790 Z-score: 5517.5 bits: 1031.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4790; 99.9% identity (100.0% similar) in 707 aa overlap (4-710:5-711)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHIT
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MIPTMATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHIT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FVAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FVAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IEISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 WPWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WPWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QGNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QGNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VSNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LDPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 HNTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HNTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLDL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 LESGGLRDQPAQLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQALLHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LESGGLRDQPAQLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQALLHG
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 GGTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLIRVSGIAEVEETGRSMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLIRVSGIAEVEETGRSMLV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 LKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCTMVLEGSGLINGQIAKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCTMVLEGSGLINGQIAKDL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 GTLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDIFVTVAGAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GTLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDIFVTVAGAP
670 680 690 700 710
>>NP_945345 (OMIM: 613900,613908) protein-glutamine gamm (706 aa)
initn: 1929 init1: 1418 opt: 1975 Z-score: 2274.0 bits: 431.3 E(85289): 6.4e-120
Smith-Waterman score: 2010; 46.0% identity (70.8% similar) in 722 aa overlap (4-707:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHITF
.: .:. .:: : :::. :::::. .:.::::: : : : .:: .. . . . :
NP_945 MAGIRVTKVDWQRSRNGAAHHTQEYPCPELVVRRGQSFSLTLELSRALDCE-EILIF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLKI
. ::::. :: : :.:.: .... :. :.:. . ..: ::: .: .::::.: :.:
NP_945 TMETGPRASEALHTKAVFQTSELERGEGWTAAREAQMEKTLTVSLASPPSAVIGRYLLSI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITSW
..:. . :: . :: :.:::::: ::::.: :: :::.. : :....: :. : .
NP_945 RLSSHRKHS-NRRLGEFVLLFNPWCAEDDVFLASEEERQEYVLSDSGIIFRGVEKHIRAQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVLQ
::::::::::..::. ::..: : .::: : : :.. .:: ::.:::.:::.: ::.:
NP_945 GWNYGQFEEDILNICLSILDRSPGHQNNPATDVSCRHNPIYVTRVISAMVNSNNDRGVVQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRVV
:.: :. :.:::.:.:::::::.: .:::::::::::.:.:::.::::. ::::
NP_945 GQWQGKYGGGTSPLHWRGSVAILQKWLKGRYKPVKYGQCWVFAGVLCTVLRCLGIATRVV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQVL
::: :::..:.::..: : : .. : .:..:::::::: :. :.:: :.:::::::
NP_945 SNFNSAHDTDQNLSVDKYVDSFGRTLEDLTEDSMWNFHVWNESWFARQDLGPSYNGWQVL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILAH
: :::. : :.: :::::: ::::::::::.: :::.:::::: . :: . ...: .
NP_945 DATPQEESEGVFRCGPASVTAIREGDVHLAHDGPFVFAEVNADYITWLWHEDESRERVYS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLDLL
::..::. :::: ::::.: .::. ::::::: .:: :. :: ...: . :: . .
NP_945 NTKKIGRCISTKAVGSDSRVDITDLYKYPEGSRKERQVYSKAVNRLFGVE-ASGRRIWIR
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520
pF1KE0 ESGG---LRD---QPAQL-----QLHLARIPEWGQDLQLLL-------RIQRVPDSTHPR
..:: :: .:: .... . : :.::.: : : ::: ..
NP_945 RAGGRCLWRDDLLEPATKPSIAGKFKVLEPPMLGHDLRLALCLANLTSRAQRV--RVNLS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 GPIGLVVRFCAQALLHGGGTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLI
: : .: . .:: . :.::.. . .: . :. . ::.:.. ::..: :
NP_945 GATILYTRKPVAEILHES--------HAVRLGPQ--EEKRIPITISYSKYKEDLTEDKKI
540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 RVSGIAEVEETGRSMLVLKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCT
.... : . :...:: ::: :: ..:.: : :: :. :.::..: :. ...:.
NP_945 LLAAMCLVTK-GEKLLVEKDITLED-FITIKVLGPAMVGVAVTVEVTVVNPLIERVKDCA
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 MVLEGSGLINGQIAKDLGTLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDI
...:::::.. :.. :. :: . ..:.:. :.:.::::::: . : . .:::. .
NP_945 LMVEGSGLLQEQLSIDVPTLEPQERASVQFDITPSKSGPRQLQVDLVSPHFPDIKGFVIV
650 660 670 680 690 700
710
pF1KE0 FVTVAGAP
:..:
NP_945 HVATAK
>>NP_963925 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine gamm (720 aa)
initn: 2098 init1: 1602 opt: 1895 Z-score: 2181.7 bits: 414.2 E(85289): 8.8e-115
Smith-Waterman score: 2255; 49.1% identity (72.5% similar) in 721 aa overlap (7-707:5-719)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSF-SRPFQSQNDHIT
:.. .:::::::: .:::.:. : .: ::::: : : : : .: :: :.:
NP_963 MAQGLEVALTDLQSSRNNVRHHTEEITVDHLLVRRGQAFNLTLYFRNRSFQPGLDNII
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FVAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLK
::.:::: :. :::::.: :.: . . : : : ..: .::: .: .:..:.: ::
NP_963 FVVETGPLPDLALGTRAVFSLARHHSPSPWIAWLETNGATSTEVSLCAPPTAAVGRYLLK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IEISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITS
:.:.. :: ..: :: :::::::: ::: ::: :: :::.: ::::.:.: . .:
NP_963 IHIDSFQGSVTAYQLGEFILLFNPWCPEDAVYLDSEPQRQEYVMNDYGFIYQGSKNWIRP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 WPWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVL
::::::::. :::::...:.:::. .:: ::. :.. ::: ::: ::::::::::::
NP_963 CPWNYGQFEDKIIDICLKLLDKSLHFQTDPATDCALRGSPVYVSRVVCAMINSNDDNGVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QGNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRV
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NP_963 NGNWSENYTDGANPAEWTGSVAILKQWNATGCQPVRYGQCWVFAAVMCTVMRCLGIPTRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VSNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQV
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NP_963 ITNFDSGHDTDGNLIIDEYYDNTGRILGNKKKDTIWNFHVWNECWMARKDLPPAYGGWQV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LDPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILA
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NP_963 LDATPQEMSNGVYCCGPASVRAIKEGEVDLNYDTPFVFSMVNADCMSWLVQGGKEQK-LH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE0 HNTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKM-------------
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NP_963 QDTSSVGNFISTKSIQSDERDDITENYKYEEGSLQERQVFLKALQKLKARSFHGSQRGAE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 LGPQRASLPFLDL---LESGGLRDQPA---QLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTH
: :.: . : :.. .:: . . .:...: :. :::. ..: . .. .
NP_963 LQPSRPTSLSQDSPRSLHTPSLRPSDVVQVSLKFKLLDPPNMGQDICFVLLALNMSSQFK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 PRGPIGLVVRFCAQALLHGGGTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEK
: : . ::.::: :. .:::. :. ..:. . .: . ::.: . :. .:
NP_963 -----DLKVNLSAQSLLHDGSPLSPFWQDTAFITLSPKEAKTYPCKISYSQYSQYLSTDK
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 LIRVSGIAEVEETGRSMLVLKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSS
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NP_963 LIRISALGEEKSSPEKILVNKIITLSYPSITINVLGAAVVNQPLSIQVIFSNPLSEQVED
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 CTMVLEGSGLINGQIAKDLGTLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYK
:....:::::.. : ::.: : .: :. : :.: ::.:. . ::. :.::::.
NP_963 CVLTVEGSGLFKKQQKVFLGVLKPQHQASIILETVPFKSGQRQIQANMRSNKFKDIKGYR
660 670 680 690 700 710
710
pF1KE0 DIFVTVAGAP
...: :
NP_963 NVYVDFAL
720
>>NP_003236 (OMIM: 600238) protein-glutamine gamma-gluta (693 aa)
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Smith-Waterman score: 1820; 40.6% identity (72.1% similar) in 705 aa overlap (4-702:1-689)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHITF
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NP_003 MAALGVQSINWQTAFNRQAHHTDKFSSQELILRRGQNFQVLMIMNKGLGS-NERLEF
10 20 30 40 50
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pF1KE0 VAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLKI
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NP_003 IVSTGPYPSESAMTKAVFPLSNGSSGG-WSAVLQASNGNTLTISISSPASAPIGRYTMAL
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pF1KE0 EI-SQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITS
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NP_003 QIFSQGGISSVK--LGTFILLFNPWLNVDSVFMGNHAEREEYVQEDAGIIFVGSTNRIGM
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pF1KE0 WPWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVL
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NP_003 IGWNFGQFEEDILSICLSILDRSLNFRRDAATDVASRNDPKYVGRVLSAMINSNDDNGVL
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pF1KE0 QGNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRV
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NP_003 AGNWSGTYTGGRDPRSWNGSVEILKNWKKSGFSPVRYGQCWVFAGTLNTALRSLGIPSRV
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pF1KE0 VSNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQV
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NP_003 ITNFNSAHDTDRNLSVDVYYDPMGNPLD-KGSDSVWNFHVWNEGWFVRSDLGPSYGGWQV
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pF1KE0 LDPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILA
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NP_003 LDATPQERSQGVFQCGPASVIGVREGDVQLNFDMPFIFAEVNADRITWLYDNTTGKQWKN
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 H-NTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLD
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NP_003 SVNSHTIGRYISTKAVGSNARMDVTDKYKYPEGSDQERQVFQKA----LGKLKPNTPFAA
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pF1KE0 LLESGGLR---DQPAQL-QLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQ
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NP_003 T-SSMGLETEEQEPSIIGKLKVAGMLAVGKEVNLVLLLKNLSRDTKT-----VTVNMTAW
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pF1KE0 ALLHGGGTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLIRVSGIAEVEETG
.....: . :. .. :.:: .:.. :. . :..:.. : ....::.... .: . .
NP_003 TIIYNGTLVHEVWKDSATMSLDPEEEAEHPIKISYAQYEKYLKSDNMIRITAVCKVPDES
530 540 550 560 570 580
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pF1KE0 RSMLVLKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCTMVLEGSGLINGQ
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NP_003 E-VVVERDIILDNPTLTLEVLNEARVRKPVNVQMLFSNPLDEPVRDCVLMVEGSGLLLGN
590 600 610 620 630 640
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pF1KE0 IAKDLGTLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDIFVTVAGAP
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NP_003 LKIDVPTLGPKEGSRVRFDILPSRSGTKQLLADFSCNKFPAIKAMLSIDVAE
650 660 670 680 690
>>NP_001241663 (OMIM: 613900,613908) protein-glutamine g (625 aa)
initn: 1729 init1: 1418 opt: 1760 Z-score: 2027.0 bits: 385.4 E(85289): 3.6e-106
Smith-Waterman score: 1795; 47.3% identity (70.7% similar) in 621 aa overlap (4-606:1-605)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHITF
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pF1KE0 VAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLKI
. ::::. :: : :.:.: .... :. :.:. . ..: ::: .: .::::.: :.:
NP_001 TMETGPRASEALHTKAVFQTSELERGEGWTAAREAQMEKTLTVSLASPPSAVIGRYLLSI
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pF1KE0 EISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITSW
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NP_001 RLSSHRKHS-NRRLGEFVLLFNPWCAEDDVFLASEEERQEYVLSDSGIIFRGVEKHIRAQ
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pF1KE0 PWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVLQ
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NP_001 GWNYGQFEEDILNICLSILDRSPGHQNNPATDVSCRHNPIYVTRVISAMVNSNNDRGVVQ
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NP_001 GQWQGKYGGGTSPLHWRGSVAILQKWLKGRYKPVKYGQCWVFAGVLCTVLRCLGIATRVV
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pF1KE0 SNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQVL
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NP_001 SNFNSAHDTDQNLSVDKYVDSFGRTLEDLTEDSMWNFHVWNESWFARQDLGPSYNGWQVL
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 DPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILAH
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NP_001 DATPQEESEGVFRCGPASVTAIREGDVHLAHDGPFVFAEVNADYITWLWHEDESRERVYS
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 NTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLDLL
::..::. :::: ::::.: .::. ::::::: .:: :. :: ...: . :: . .
NP_001 NTKKIGRCISTKAVGSDSRVDITDLYKYPEGSRKERQVYSKAVNRLFGVE-ASGRRIWIR
420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 ESGG---LRD---QPAQL-----QLHLARIPEWGQDLQLLL-------RIQRVPDSTHPR
..:: :: .:: .... . : :.::.: : : ::: ..
NP_001 RAGGRCLWRDDLLEPATKPSIAGKFKVLEPPMLGHDLRLALCLANLTSRAQRV--RVNLS
480 490 500 510 520 530
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pF1KE0 GPIGLVVRFCAQALLHGGGTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLI
: : .: . .:: . :.::.. . .: . :. . ::.:.. ::..: :
NP_001 GATILYTRKPVAEILHES--------HAVRLGPQ--EEKRIPITISYSKYKEDLTEDKKI
540 550 560 570 580
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pF1KE0 RVSGIAEVEETGRSMLVLKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCT
.... : . :...:: ::: ::
NP_001 LLAAMCLVTK-GEKLLVEKDITLEDFITIKRAYPGASGEGLSPV
590 600 610 620
>>NP_945189 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-gluta (548 aa)
initn: 1351 init1: 801 opt: 1589 Z-score: 1830.8 bits: 348.9 E(85289): 3.1e-95
Smith-Waterman score: 1589; 51.1% identity (73.3% similar) in 460 aa overlap (7-463:5-460)
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pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSF-SRPFQSQNDHIT
: :: ::. :...::: .. ..:.:::::::.: : : .: .... : .:
NP_945 MAEELVLERCDLELETNGRDHHTADLCREKLVVRRGQPFWLTLHFEGRNYEASVDSLT
10 20 30 40 50
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pF1KE0 FVAETGPKPSELLGTRATFFLTR-VQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTL
: . ::: ::. ::.: : : :. :. :.:. .. .:...: ::::: :: : :
NP_945 FSVVTGPAPSQEAGTKARFPLRDAVEEGD-WTATVVDQQDCTLSLQLTTPANAPIGLYRL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 KIEISQG-QGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFI
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NP_945 SLEASTGYQGSS--FVLGHFILLFNAWCPADAVYLDSEEERQEYVLTQQGFIYQGSAKFI
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pF1KE0 TSWPWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNG
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NP_945 KNIPWNFGQFEDGILDICLILLDVNPKFLKNAGRDCSRRSSPVYVGRVVSGMVNCNDDQG
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 VLQGNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPT
:: : : ..:. ::::. : ::: ::..:. .: : ::::::::::.: :::.::::.::
NP_945 VLLGRWDNNYGDGVSPMSWIGSVDILRRWKNHGCQRVKYGQCWVFAAVACTVLRCLGIPT
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 RVVSNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGW
:::.:. :::. . :: :. . .. .:. . .: . ::::: : : :: : :: :::.::
NP_945 RVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEI-QGDKSEMIWNFHCWVESWMTRPDLQPGYEGW
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pF1KE0 QVLDPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEI
:.::::::. : : .::::. :.::.:::. ::.:::.:::::: : :. : . .
NP_945 QALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTKYDAPFVFAEVNADVVDWIQQDDGSVHK
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 LAHNTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFL
. . .: .:::: :: :.:..:: .::::::: ::: .: .:.
NP_945 SINRSLIVGLKISTKSVGRDEREDITHTYKYPEGSSEEREAFTRANHLNKLAEKEETGMA
420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 DLLESGGLRDQPAQLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQALL
NP_945 MRIRVGQSMNMGSDFDVFAHITNNTAEEYVCRLLLCARTVSYNGILGPECGTKYLLNLNL
480 490 500 510 520 530
>>XP_011527330 (OMIM: 190196) PREDICTED: protein-glutami (687 aa)
initn: 1512 init1: 801 opt: 1589 Z-score: 1829.4 bits: 349.0 E(85289): 3.7e-95
Smith-Waterman score: 1812; 42.3% identity (69.1% similar) in 705 aa overlap (7-704:5-684)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSF-SRPFQSQNDHIT
: :: ::. :...::: .. ..:.:::::::.: : : .: .... : .:
XP_011 MAEELVLERCDLELETNGRDHHTADLCREKLVVRRGQPFWLTLHFEGRNYEASVDSLT
10 20 30 40 50
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pF1KE0 FVAETGPKPSELLGTRATFFLTR-VQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTL
: . ::: ::. ::.: : : :. :. :.:. .. .:...: ::::: :: : :
XP_011 FSVVTGPAPSQEAGTKARFPLRDAVEEGD-WTATVVDQQDCTLSLQLTTPANAPIGLYRL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 KIEISQG-QGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFI
..: : : :: : . :: :::::: : : : ::: :: :::.. . ::.:.: .::
XP_011 SLEASTGYQGSS--FVLGHFILLFNAWCPADAVYLDSEEERQEYVLTQQGFIYQGSAKFI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 TSWPWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNG
. :::.::::. :.:::. .:. . ::: ..:::.:.. ::: ::::.:.: :::.:
XP_011 KNIPWNFGQFEDGILDICLILLDVNPKFLKNAGRDCSRRSSPVYVGRVVSGMVNCNDDQG
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 VLQGNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPT
:: : : ..:. ::::. : ::: ::..:. .: : ::::::::::.: :::.::::.::
XP_011 VLLGRWDNNYGDGVSPMSWIGSVDILRRWKNHGCQRVKYGQCWVFAAVACTVLRCLGIPT
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 RVVSNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGW
:::.:. :::. . :: :. . .. .:. . .: . ::::: : : :: : :: :::.::
XP_011 RVVTNYNSAHDQNSNLLIEYFRNEFGEIQG-DKSEMIWNFHCWVESWMTRPDLQPGYEGW
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 QVLDPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEI
:.::::::. : : .::::. :.::.:::. ::.:::.:::::: : :. : . .
XP_011 QALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTKYDAPFVFAEVNADVVDWIQQDDGSVHK
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 LAHNTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFL
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XP_011 SINRSLIVGLKISTKSVGRDEREDITHTYKYPEGSSEEREAFTRANH---------LNKL
420 430 440 450 460
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pF1KE0 DLLESGGLRDQPAQLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQALL
: :. ....... . :.:.... .: ..: . :.. ::...
XP_011 AEKEETGM-----AMRIRVGQSMNMGSDFDVFAHI---TNNTAEEYVCRLLL--CARTVS
470 480 490 500 510
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pF1KE0 HGG--GTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLIRVSGIAEVEETGR
..: : . .. . .::. .: . :: . : .::. ::. .::.: .. :: .
XP_011 YNGILGPECGT-KYLLNLNLEPFSEKSVPLCILYEKYRDCLTESNLIKVRALL-VEPVIN
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 S-MLVLKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCTMVLEGSGLINGQ
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]