FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0382, 710 aa
1>>>pF1KE0382 710 - 710 aa - 710 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7080+/-0.00101; mu= 17.4340+/- 0.061
mean_var=69.2727+/-14.147, 0's: 0 Z-trim(104.1): 24 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.154097
statistics sampled from 7710 (7723) to 7710 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32213.1 TGM7 gene_id:116179|Hs108|chr15 ( 710) 4816 1080.3 0
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CCDS58761.1 TGM6 gene_id:343641|Hs108|chr20 ( 625) 1760 400.9 3e-111
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CCDS32211.1 TGM5 gene_id:9333|Hs108|chr15 ( 638) 1471 336.7 6.7e-92
CCDS9622.1 TGM1 gene_id:7051|Hs108|chr14 ( 817) 1340 307.6 4.9e-83
CCDS4496.1 F13A1 gene_id:2162|Hs108|chr6 ( 732) 1175 270.9 4.9e-72
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CCDS45249.1 EPB42 gene_id:2038|Hs108|chr15 ( 691) 817 191.3 4.2e-48
CCDS10093.1 EPB42 gene_id:2038|Hs108|chr15 ( 721) 817 191.3 4.4e-48
>>CCDS32213.1 TGM7 gene_id:116179|Hs108|chr15 (710 aa)
initn: 4816 init1: 4816 opt: 4816 Z-score: 5781.6 bits: 1080.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4816; 100.0% identity (100.0% similar) in 710 aa overlap (1-710:1-710)
10 20 30 40 50 60
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CCDS32 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHITF
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITSW
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILAH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLDLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 ESGGLRDQPAQLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQALLHGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESGGLRDQPAQLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQALLHGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 GTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLIRVSGIAEVEETGRSMLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLIRVSGIAEVEETGRSMLVL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 KDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCTMVLEGSGLINGQIAKDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCTMVLEGSGLINGQIAKDLG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE0 TLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDIFVTVAGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDIFVTVAGAP
670 680 690 700 710
>>CCDS13025.1 TGM6 gene_id:343641|Hs108|chr20 (706 aa)
initn: 1929 init1: 1418 opt: 1975 Z-score: 2368.2 bits: 448.7 E(32554): 1.4e-125
Smith-Waterman score: 2010; 46.0% identity (70.8% similar) in 722 aa overlap (4-707:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHITF
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CCDS13 MAGIRVTKVDWQRSRNGAAHHTQEYPCPELVVRRGQSFSLTLELSRALDCE-EILIF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLKI
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CCDS13 TMETGPRASEALHTKAVFQTSELERGEGWTAAREAQMEKTLTVSLASPPSAVIGRYLLSI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITSW
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CCDS13 RLSSHRKHS-NRRLGEFVLLFNPWCAEDDVFLASEEERQEYVLSDSGIIFRGVEKHIRAQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVLQ
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CCDS13 GWNYGQFEEDILNICLSILDRSPGHQNNPATDVSCRHNPIYVTRVISAMVNSNNDRGVVQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRVV
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CCDS13 GQWQGKYGGGTSPLHWRGSVAILQKWLKGRYKPVKYGQCWVFAGVLCTVLRCLGIATRVV
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 SNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQVL
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CCDS13 SNFNSAHDTDQNLSVDKYVDSFGRTLEDLTEDSMWNFHVWNESWFARQDLGPSYNGWQVL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILAH
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CCDS13 DATPQEESEGVFRCGPASVTAIREGDVHLAHDGPFVFAEVNADYITWLWHEDESRERVYS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLDLL
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CCDS13 NTKKIGRCISTKAVGSDSRVDITDLYKYPEGSRKERQVYSKAVNRLFGVE-ASGRRIWIR
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520
pF1KE0 ESGG---LRD---QPAQL-----QLHLARIPEWGQDLQLLL-------RIQRVPDSTHPR
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CCDS13 RAGGRCLWRDDLLEPATKPSIAGKFKVLEPPMLGHDLRLALCLANLTSRAQRV--RVNLS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 GPIGLVVRFCAQALLHGGGTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLI
: : .: . .:: . :.::.. . .: . :. . ::.:.. ::..: :
CCDS13 GATILYTRKPVAEILHES--------HAVRLGPQ--EEKRIPITISYSKYKEDLTEDKKI
540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 RVSGIAEVEETGRSMLVLKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCT
.... : . :...:: ::: :: ..:.: : :: :. :.::..: :. ...:.
CCDS13 LLAAMCLVTK-GEKLLVEKDITLED-FITIKVLGPAMVGVAVTVEVTVVNPLIERVKDCA
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 MVLEGSGLINGQIAKDLGTLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDI
...:::::.. :.. :. :: . ..:.:. :.:.::::::: . : . .:::. .
CCDS13 LMVEGSGLLQEQLSIDVPTLEPQERASVQFDITPSKSGPRQLQVDLVSPHFPDIKGFVIV
650 660 670 680 690 700
710
pF1KE0 FVTVAGAP
:..:
CCDS13 HVATAK
>>CCDS32212.1 TGM5 gene_id:9333|Hs108|chr15 (720 aa)
initn: 2098 init1: 1602 opt: 1895 Z-score: 2272.0 bits: 430.9 E(32554): 3.1e-120
Smith-Waterman score: 2255; 49.1% identity (72.5% similar) in 721 aa overlap (7-707:5-719)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSF-SRPFQSQNDHIT
:.. .:::::::: .:::.:. : .: ::::: : : : : .: :: :.:
CCDS32 MAQGLEVALTDLQSSRNNVRHHTEEITVDHLLVRRGQAFNLTLYFRNRSFQPGLDNII
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FVAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLK
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CCDS32 FVVETGPLPDLALGTRAVFSLARHHSPSPWIAWLETNGATSTEVSLCAPPTAAVGRYLLK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IEISQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITS
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CCDS32 IHIDSFQGSVTAYQLGEFILLFNPWCPEDAVYLDSEPQRQEYVMNDYGFIYQGSKNWIRP
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pF1KE0 WPWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVL
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CCDS32 CPWNYGQFEDKIIDICLKLLDKSLHFQTDPATDCALRGSPVYVSRVVCAMINSNDDNGVL
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QGNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRV
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CCDS32 NGNWSENYTDGANPAEWTGSVAILKQWNATGCQPVRYGQCWVFAAVMCTVMRCLGIPTRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VSNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQV
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CCDS32 ITNFDSGHDTDGNLIIDEYYDNTGRILGNKKKDTIWNFHVWNECWMARKDLPPAYGGWQV
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pF1KE0 LDPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILA
:: :::. :.:..:::::::.::.::.: : ::::::.. :::: . ::. :. :. :
CCDS32 LDATPQEMSNGVYCCGPASVRAIKEGEVDLNYDTPFVFSMVNADCMSWLVQGGKEQK-LH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE0 HNTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKM-------------
..:::.:. :::: . ::.:..:: .::: ::: .:: ::.:: .:.
CCDS32 QDTSSVGNFISTKSIQSDERDDITENYKYEEGSLQERQVFLKALQKLKARSFHGSQRGAE
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470 480 490 500 510 520
pF1KE0 LGPQRASLPFLDL---LESGGLRDQPA---QLQLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTH
: :.: . : :.. .:: . . .:...: :. :::. ..: . .. .
CCDS32 LQPSRPTSLSQDSPRSLHTPSLRPSDVVQVSLKFKLLDPPNMGQDICFVLLALNMSSQFK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 PRGPIGLVVRFCAQALLHGGGTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEK
: : . ::.::: :. .:::. :. ..:. . .: . ::.: . :. .:
CCDS32 -----DLKVNLSAQSLLHDGSPLSPFWQDTAFITLSPKEAKTYPCKISYSQYSQYLSTDK
540 550 560 570 580 590
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pF1KE0 LIRVSGIAEVEETGRSMLVLKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSS
:::.:...: . . ...:: : : : : ..:.: : :.. : ..: ..: : . .
CCDS32 LIRISALGEEKSSPEKILVNKIITLSYPSITINVLGAAVVNQPLSIQVIFSNPLSEQVED
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pF1KE0 CTMVLEGSGLINGQIAKDLGTLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYK
:....:::::.. : ::.: : .: :. : :.: ::.:. . ::. :.::::.
CCDS32 CVLTVEGSGLFKKQQKVFLGVLKPQHQASIILETVPFKSGQRQIQANMRSNKFKDIKGYR
660 670 680 690 700 710
710
pF1KE0 DIFVTVAGAP
...: :
CCDS32 NVYVDFAL
720
>>CCDS33435.1 TGM3 gene_id:7053|Hs108|chr20 (693 aa)
initn: 1147 init1: 767 opt: 1820 Z-score: 2182.1 bits: 414.3 E(32554): 3.2e-115
Smith-Waterman score: 1820; 40.6% identity (72.1% similar) in 705 aa overlap (4-702:1-689)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MDQVATLRLESVDLQSSRNNKEHHTQEMGVKRLTVRRGQPFYLRLSFSRPFQSQNDHITF
.:.: ..:.. :.. : . :::.... ..: .:::: : . . ... . : :... :
CCDS33 MAALGVQSINWQTAFNRQAHHTDKFSSQELILRRGQNFQVLMIMNKGLGS-NERLEF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VAETGPKPSELLGTRATFFLTRVQPGNVWSASDFTIDSNSLQVSLFTPANAVIGHYTLKI
.. ::: ::: :.:.: :. . :. ::: . ..:.: .:. .::.: ::.::. .
CCDS33 IVSTGPYPSESAMTKAVFPLSNGSSGG-WSAVLQASNGNTLTISISSPASAPIGRYTMAL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 EI-SQGQGHSVTYPLGTFILLFNPWSPEDDVYLPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITS
.: ::: :: ::::::::::: :.:.. .. .::...: :... : :
CCDS33 QIFSQGGISSVK--LGTFILLFNPWLNVDSVFMGNHAEREEYVQEDAGIIFVGSTNRIGM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 WPWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAKDCSQRNDVVYVCRVVSAMINSNDDNGVL
::.:::::::..::. ::..:: .. : : ..::: :: ::.:::::::::::::
CCDS33 IGWNFGQFEEDILSICLSILDRSLNFRRDAATDVASRNDPKYVGRVLSAMINSNDDNGVL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 QGNWGEDYSKGVSPLEWKGSVAILQQWSARGGQPVKYGQCWVFASVMCTVMRCLGVPTRV
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CCDS33 AGNWSGTYTGGRDPRSWNGSVEILKNWKKSGFSPVRYGQCWVFAGTLNTALRSLGIPSRV
240 250 260 270 280 290
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pF1KE0 VSNFRSAHNVDRNLTIDTYYDRNAEMLSTQKRDKIWNFHVWNECWMIRKDLPPGYNGWQV
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CCDS33 ITNFNSAHDTDRNLSVDVYYDPMGNPLD-KGSDSVWNFHVWNEGWFVRSDLGPSYGGWQV
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 LDPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILA
:: :::. :.:.: :::::: ..:::::.: .: ::..::::::.. :: . ...
CCDS33 LDATPQERSQGVFQCGPASVIGVREGDVQLNFDMPFIFAEVNADRITWLYDNTTGKQWKN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 H-NTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLD
:. .::. :::: :::. :...:..::::::: .:: ::.:: :: . . ::
CCDS33 SVNSHTIGRYISTKAVGSNARMDVTDKYKYPEGSDQERQVFQKA----LGKLKPNTPFAA
420 430 440 450 460
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pF1KE0 LLESGGLR---DQPAQL-QLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQ
: ::. ..:. . .:..: . :....:.: .. . .:. ..: . :
CCDS33 T-SSMGLETEEQEPSIIGKLKVAGMLAVGKEVNLVLLLKNLSRDTKT-----VTVNMTAW
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
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.....: . :. .. :.:: .:.. :. . :..:.. : ....::.... .: . .
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. ..: .:: :. : :..:: ..:.: : . :.. ..: : . .:....:::::. :.
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. :. :: . ....:. :...: .:: . .: :. ::.. .:
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::..::. :::: ::::.: .::. ::::::: .:: :. :: ...: . :: . .
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..:: :: .:: .... . : :.::.: : : ::: ..
CCDS58 RAGGRCLWRDDLLEPATKPSIAGKFKVLEPPMLGHDLRLALCLANLTSRAQRV--RVNLS
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CCDS58 GATILYTRKPVAEILHES--------HAVRLGPQ--EEKRIPITISYSKYKEDLTEDKKI
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CCDS58 LLAAMCLVTK-GEKLLVEKDITLEDFITIKRAYPGASGEGLSPV
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CCDS13 QALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTKYDAPFVFAEVNADVVDWIQQDDGSVHK
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CCDS13 AEKEETGM-----AMRIRVGQSMNMGSDFDVFAHI---TNNTAEEYVCRLLL--CARTVS
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CCDS13 SYLLAERDLYLENPEIKIRILGEPKQKRKLVAEVSLQNPLPVALEGCTFTVEGAGLTEEQ
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CCDS13 KTVEIPDPVEAGEEVKVRMDLLPLHMGLHKLVVNFESDKLKAVKGFRNVIIGPA
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CCDS32 FVVET-------------------------------------------------------
60
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CCDS32 LDATPQEMSNGVYCCGPASVRAIKEGEVDLNYDTPFVFSMVNADCMSWLVQGGKEQK-LH
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CCDS32 -----DLKVNLSAQSLLHDGSPLSPFWQDTAFITLSPKEAKTYPCKISYSQYSQYLSTDK
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CCDS32 LIRISALGEEKSSPEKILVNKIITLSYPSITINVLGAAVVNQPLSIQVIFSNPLSEQVED
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CCDS32 CVLTVEGSGLFKKQQKVFLGVLKPQHQASIILETVPFKSGQRQIQANMRSNKFKDIKGYR
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CCDS32 NVYVDFAL
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CCDS96 IVRRGQPFHMLLLLSRTYES-SDRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIPVGKGGSGG-WKAQV
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CCDS96 VKASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVY
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pF1KE0 LPSEILLQEYIMRDYGFVYKGHERFITSWPWNYGQFEEDIIDICFEILNKSLYHLKNPAK
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CCDS96 VDHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGM----PY-
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CCDS96 --GGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSY-LRTG
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CCDS96 YSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNH
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CCDS96 DSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKY
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CCDS96 DTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPEG
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CCDS96 SDAERKAVETAAAHGSKPNVYA-------NRGSAEDVAMQVEAQDAVM---GQD--LMVS
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CCDS96 VMLINHSSSRRT---VKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVELAPGASDRVTMPVAYKE
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CCDS96 YRPHLVDQGAMLLNVSG--HVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIV
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CCDS96 FKNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKIL-NVGDIGGNETVTLRQSFVPVRPGPRQLIASLD
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CCDS96 SPQLSQVHGV--IQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
780 790 800 810
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10 20 30
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