FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0374, 780 aa
1>>>pF1KE0374 780 - 780 aa - 780 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8466+/-0.000394; mu= 22.8525+/- 0.025
mean_var=61.5798+/-12.382, 0's: 0 Z-trim(110.8): 57 B-trim: 1038 in 1/54
Lambda= 0.163439
statistics sampled from 19171 (19228) to 19171 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 11.000
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000432 (OMIM: 274600,600791,605646) pendrin [Ho ( 780) 4972 1181.6 0
XP_005250482 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 780) 4972 1181.6 0
XP_016867807 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 754) 2683 641.8 3.1e-183
XP_006716088 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 423) 2677 640.2 5.3e-183
NP_000102 (OMIM: 126650,214700) chloride anion exc ( 764) 2288 548.7 3.4e-155
XP_011514169 (OMIM: 126650,214700) PREDICTED: chlo ( 764) 2288 548.7 3.4e-155
NP_945350 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform a ( 744) 1830 440.7 1.1e-122
XP_011514472 (OMIM: 604943,613865) PREDICTED: pres ( 744) 1830 440.7 1.1e-122
NP_996766 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform b ( 685) 1773 427.2 1.1e-118
NP_996767 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform c ( 516) 1463 354.0 9.1e-97
NP_602298 (OMIM: 610068) solute carrier family 26 ( 740) 1462 353.9 1.4e-96
NP_443166 (OMIM: 608481) solute carrier family 26 ( 791) 1436 347.8 1.1e-94
NP_599152 (OMIM: 608481) solute carrier family 26 ( 887) 1436 347.8 1.2e-94
NP_998778 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 701) 1293 314.0 1.4e-84
NP_071325 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 701) 1293 314.0 1.4e-84
NP_001035544 (OMIM: 610068) solute carrier family ( 738) 1261 306.5 2.6e-82
NP_599025 (OMIM: 610068) solute carrier family 26 ( 758) 1261 306.5 2.7e-82
NP_075062 (OMIM: 610068) solute carrier family 26 ( 759) 1261 306.5 2.7e-82
XP_011507423 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 702) 1257 305.6 4.9e-82
NP_001308716 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform ( 653) 1224 297.8 1e-79
NP_001161434 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform ( 712) 1224 297.8 1.1e-79
XP_011507426 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 466) 1203 292.7 2.4e-78
NP_000103 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,60671 ( 739) 1088 265.7 5e-70
XP_016864680 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,60 ( 739) 1088 265.7 5e-70
NP_439897 (OMIM: 608479) anion exchange transporte ( 656) 1062 259.6 3.2e-68
NP_001269285 (OMIM: 608479) anion exchange transpo ( 656) 1062 259.6 3.2e-68
NP_599028 (OMIM: 608479) anion exchange transporte ( 663) 1062 259.6 3.2e-68
XP_011507424 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 627) 1031 252.2 4.9e-66
NP_001180405 (OMIM: 606766,608480) testis anion tr ( 970) 1007 246.7 3.5e-64
NP_443193 (OMIM: 606766,608480) testis anion trans ( 970) 1007 246.7 3.5e-64
XP_016865724 (OMIM: 606766,608480) PREDICTED: test ( 970) 1007 246.7 3.5e-64
NP_001268661 (OMIM: 610068) solute carrier family ( 723) 968 237.4 1.6e-61
NP_001268662 (OMIM: 610068) solute carrier family ( 651) 965 236.7 2.4e-61
NP_996768 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform d ( 335) 900 221.2 5.9e-57
XP_011512596 (OMIM: 606766,608480) PREDICTED: test ( 944) 721 179.3 6.8e-44
NP_619732 (OMIM: 606766,608480) testis anion trans ( 865) 559 141.0 2e-32
NP_001269286 (OMIM: 608479) anion exchange transpo ( 355) 474 120.7 1.1e-26
NP_775897 (OMIM: 610117) sodium-independent sulfat ( 606) 435 111.7 9.6e-24
NP_001159819 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606) 435 111.7 9.6e-24
NP_001159821 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606) 435 111.7 9.6e-24
NP_001159820 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606) 435 111.7 9.6e-24
NP_602297 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 224) 383 99.1 2.1e-20
XP_016879996 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 630) 358 93.5 2.9e-18
XP_006721896 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 630) 358 93.5 2.9e-18
XP_016879995 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 677) 358 93.6 3.1e-18
XP_016879994 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 696) 358 93.6 3.1e-18
XP_011522955 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 441) 252 68.4 7.3e-11
XP_011522956 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 441) 252 68.4 7.3e-11
XP_011522954 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 465) 252 68.5 7.6e-11
>>NP_000432 (OMIM: 274600,600791,605646) pendrin [Homo s (780 aa)
initn: 4972 init1: 4972 opt: 4972 Z-score: 6327.3 bits: 1181.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4972; 100.0% identity (100.0% similar) in 780 aa overlap (1-780:1-780)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAPGGRSEPPQLPEYSCSYMVSRPVYSELAFQQQHERRLQERKTLRESLAKCCSCSRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MAAPGGRSEPPQLPEYSCSYMVSRPVYSELAFQQQHERRLQERKTLRESLAKCCSCSRKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVGSVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMIDTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVGSVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMIDTAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RDTARVLIASALTLLVGIIQLIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQLKIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RDTARVLIASALTLLVGIIQLIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQLKIVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKIPVPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKIPVPI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSIAVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSIAVVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSCFVATTALSRTAVQESTGGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSCFVATTALSRTAVQESTGGKT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 QVAGIISAAIVMIAILALGKLLEPLQKSVLAAVVIANLKGMFMQLCDIPRLWRQNKIDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QVAGIISAAIVMIAILALGKLLEPLQKSVLAAVVIANLKGMFMQLCDIPRLWRQNKIDAV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 IWVFTCIVSIILGLDLGLLAGLIFGLLTVVLRVQFPSWNGLGSIPSTDIYKSTKNYKNIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IWVFTCIVSIILGLDLGLLAGLIFGLLTVVLRVQFPSWNGLGSIPSTDIYKSTKNYKNIE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 EPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQLRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQLRAT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 KNGIISDAVSTNNAFEPDEDIEDLEELDIPTKEIEIQVDWNSELPVKVNVPKVPIHSLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KNGIISDAVSTNNAFEPDEDIEDLEELDIPTKEIEIQVDWNSELPVKVNVPKVPIHSLVL
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670 680 690 700 710 720
pF1KE0 DCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVIEKLEQCGFFDDNIRKDTFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVIEKLEQCGFFDDNIRKDTFFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 TVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEAMRTLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEAMRTLAS
730 740 750 760 770 780
>>XP_005250482 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTED: p (780 aa)
initn: 4972 init1: 4972 opt: 4972 Z-score: 6327.3 bits: 1181.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4972; 100.0% identity (100.0% similar) in 780 aa overlap (1-780:1-780)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAPGGRSEPPQLPEYSCSYMVSRPVYSELAFQQQHERRLQERKTLRESLAKCCSCSRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAAPGGRSEPPQLPEYSCSYMVSRPVYSELAFQQQHERRLQERKTLRESLAKCCSCSRKR
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 FFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVGSVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMIDTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVGSVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMIDTAA
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pF1KE0 RDTARVLIASALTLLVGIIQLIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQLKIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RDTARVLIASALTLLVGIIQLIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQLKIVL
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pF1KE0 NVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKIPVPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKIPVPI
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310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSIAVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSIAVVA
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pF1KE0 YAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSCFVATTALSRTAVQESTGGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSCFVATTALSRTAVQESTGGKT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 QVAGIISAAIVMIAILALGKLLEPLQKSVLAAVVIANLKGMFMQLCDIPRLWRQNKIDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QVAGIISAAIVMIAILALGKLLEPLQKSVLAAVVIANLKGMFMQLCDIPRLWRQNKIDAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IWVFTCIVSIILGLDLGLLAGLIFGLLTVVLRVQFPSWNGLGSIPSTDIYKSTKNYKNIE
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pF1KE0 EPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQLRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQLRAT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 KNGIISDAVSTNNAFEPDEDIEDLEELDIPTKEIEIQVDWNSELPVKVNVPKVPIHSLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KNGIISDAVSTNNAFEPDEDIEDLEELDIPTKEIEIQVDWNSELPVKVNVPKVPIHSLVL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 DCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVIEKLEQCGFFDDNIRKDTFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVIEKLEQCGFFDDNIRKDTFFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 TVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEAMRTLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEAMRTLAS
730 740 750 760 770 780
>>XP_016867807 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTED: p (754 aa)
initn: 2677 init1: 2677 opt: 2683 Z-score: 3410.6 bits: 641.8 E(85289): 3.1e-183
Smith-Waterman score: 4762; 96.7% identity (96.7% similar) in 780 aa overlap (1-780:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAPGGRSEPPQLPEYSCSYMVSRPVYSELAFQQQHERRLQERKTLRESLAKCCSCSRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAAPGGRSEPPQLPEYSCSYMVSRPVYSELAFQQQHERRLQERKTLRESLAKCCSCSRKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 FFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVGSVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMIDTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVGSVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMIDTAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 RDTARVLIASALTLLVGIIQLIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQLKIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDTARVLIASALTLLVGIIQLIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQLKIVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKIPVPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKIPVPI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSIAVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSIAVVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSCFVATTALSRTAVQESTGGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSCFVATTALSRTAVQESTGGKT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 QVAGIISAAIVMIAILALGKLLEPLQKSVLAAVVIANLKGMFMQLCDIPRLWRQNKIDAV
: :::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 Q--------------------------SVLAAVVIANLKGMFMQLCDIPRLWRQNKIDAV
430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 IWVFTCIVSIILGLDLGLLAGLIFGLLTVVLRVQFPSWNGLGSIPSTDIYKSTKNYKNIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IWVFTCIVSIILGLDLGLLAGLIFGLLTVVLRVQFPSWNGLGSIPSTDIYKSTKNYKNIE
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pF1KE0 EPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQLRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQLRAT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KNGIISDAVSTNNAFEPDEDIEDLEELDIPTKEIEIQVDWNSELPVKVNVPKVPIHSLVL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVIEKLEQCGFFDDNIRKDTFFL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEAMRTLAS
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>>XP_006716088 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTED: p (423 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVGSVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMIDTAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RDTARVLIASALTLLVGIIQLIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQLKIVL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKIPVPI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSIAVVA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSCFVATTALSRTAVQESTGGKT
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:
XP_006 QSF
>>NP_000102 (OMIM: 126650,214700) chloride anion exchang (764 aa)
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10 20 30 40 50 60
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.. .:.:.::::: ::...:.. ...::. . : ::::: ..
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: .. .: :: ::: ::.:::::::..::.:::.::.:::.:.:::. .: ::::..
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::: . :..:::::::::::::..:.::: .: .: : ::.. . . .. :....
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: . .:: :...:.: ::::: :: :.:::.: ::.. :..::::::: .::::::
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:....... ... .::. .: .:..: ::.::....:....: :::.:.::. :.
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::::::: :.:.::...::: .... .....: .. :: :: : : :.. .. :.:
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:.::.:.: ::..::. :::: .:::::.::.:..:: : : :...:::::.::::::
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: .::..: : .:.::: ::: :.. : :::.:.:.:::. . :..: :.:::. :.:
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pF1KE0 KNIEEPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQ
.. ::.::::.: :::...:. :.. . ..:::. .:. :: ::::::.:: :.:
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:..: .:.: .:.: . . . : ...: :: : : .. ...:::..::....:::.
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.:::.:: .:.::::: .::.:. :..:: :: :.::... .: ::::.. ::: ...
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pF1KE0 KDTFFLTVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEA
.. ::::.:::.:..
NP_000 SSIFFLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF
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>>XP_011514169 (OMIM: 126650,214700) PREDICTED: chloride (764 aa)
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.. .:.:.::::: ::...:.. ...::. . : ::::: ..
XP_011 MIEPFGNQYIVARPVYSTNAFEENHKKTGRHHKTFLDHLKVCCSCSPQK
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pF1KE0 AFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATLQGMAYALLAAVPVGYGLYSA
: .. .: :: ::: ::.:::::::..::.:::.::.:::.:.:::. .: ::::..
XP_011 AKRIVLSLFPIASWLPAYRLKEWLLSDIVSGISTGIVAVLQGLAFALLVDIPPVYGLYAS
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::: . :..:::::::::::::..:.::: .: .: : ::.. . . .. :....
XP_011 FFPAIIYLFFGTSRHISVGPFPILSMMVGLAVSGAVSKAVPDRNATTLGLPNNSNNSSLL
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: . .:: :...:.: ::::: :: :.:::.: ::.. :..::::::: .::::::
XP_011 DD---ERVRVAAAASVTVLSGIIQLAFGILRIGFVVIYLSESLISGFTTAAAVHVLVSQL
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pF1KE0 KIVLNVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKI
:....... ... .::. .: .:..: ::.::....:....: :::.:.::. :.
XP_011 KFIFQLTVPSHTDPVSIFKVLYSVFSQIEKTNIADLVTALIVLLVVSIVKEINQRFKDKL
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::::::: :.:.::...::: .... .....: .. :: :: : : :.. .. :.:
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:.::.:.: ::..::. :::: .:::::.::.:..:: : : :...:::::.::::::
XP_011 AMVAFAVAFSVASVYSLKYDYPLDGNQELIALGLGNIVCGVFRGFAGSTALSRSAVQEST
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:::::.::.:.: ::.:..::.: :: :::::::::....:::::.::. .: ::::..:
XP_011 GGKTQIAGLIGAIIVLIVVLAIGFLLAPLQKSVLAALALGNLKGMLMQFAEIGRLWRKDK
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: .::..: : .:.::: ::: :.. : :::.:.:.:::. . :..: :.:::. :.:
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pF1KE0 KNIEEPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQ
.. ::.::::.: :::...:. :.. . ..:::. .:. :: ::::::.:: :.:
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:..: .:.: .:.: . . . : ...: :: : : .. ...:::..::....:::.
XP_011 LQVTPKGFIC-TVDTIKDSDEELDNNQIEVLDQPINTTDLPFHIDWNDDLPLNIEVPKIS
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pF1KE0 IHSLVLDCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVIEKLEQCGFFDDNIR
.:::.:: .:.::::: .::.:. :..:: :: :.::... .: ::::.. ::: ...
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pF1KE0 KDTFFLTVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEA
.. ::::.:::.:..
XP_011 SSIFFLTIHDAVLHILMKKDYSTSKFNPSQEKDGKIDFTINTNGGLRNRVYEVPVETKF
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:.: ::..:. ..:.. . . . .. ..: . .:. :.
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... ..:: .::: :. ::..:.:..::.:::.. ::.:.:.::::: .::::.
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:.:.. : ..:::::::.::: :.:::.:.:.. ..::. . .. :.: : :
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::. :: .: ..::: ::::. .: ..::.. ::..::: ::::::: .:..:.:: ..
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.:.:: :.:..:..:. : ..::. . :. .. .::... . .. ::.:.::..:.:.::
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:.: ......:.:: : ::...::. .: ..: :.::: : .::: . . ...::.:.
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.....:..:. :.:. : .:::::.::.:. : ....:. : . .:::. :::.:::::
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:.:: ... .....::: : :.: : ..::.:.::.::::::::. :.: .:: .::. .
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::. : . :..:::: ::....:..::::. :.: ::.. ::..: ::.: . :....
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: :.::.....::.:.: : ... .: .: . ... : ::.:: : . .... :.
NP_945 EIPGIKIFQINAPIYYANSDLYSNALKRKTGVNPAVIMGARRKAMRKYAKEVGNANM-AN
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. . .:: :. ..: .:.: :. .. : :. . :. . : .:...
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pF1KE0 LDCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVIEKLEQCGFFDDNIRKDTFF
:: ..:.: :::..: ::::. . . ::.:. . :.. : . ::.. . .:
NP_945 LDFTQVNFIDSVGVKTLAGIVKEYGDVGIYVYLAGCSAQVVNDLTRNRFFENPALWELLF
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..:::.: :.. . ::
NP_945 HSIHDAVLGSQLREALAEQEASAPPSQEDLEPNATPATPEA
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NP_996 PLEFFAVVMGTGISAGFNLKESYNVDVVGTLPLGLLPPANPDTSLFHLVYVDAIAIAIVG
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NP_996 QLAGCLASLMILLVILATGFLFESLPQAVLSAIVIVNLKGMFMQFSDLPFFWRTSKIELT
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pF1KE0 IWVFTCIVSIILGLDLGLLAGLIFGLLTVVLRVQFPSWNGLGSIPSTDIYKSTKNYKNIE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]