Result of FASTA (omim) for
pF1KE0373
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0373, 724 aa
1>>>pF1KE0373 724 - 724 aa - 724 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3564+/-0.0004; mu= 4.6325+/- 0.025
mean_var=122.6538+/-25.001, 0's: 0 Z-trim(115.8): 78 B-trim: 438 in 1/55
Lambda= 0.115807
statistics sampled from 26386 (26464) to 26386 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 12.340
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_851322 (OMIM: 609013) solute carrier organic an ( 724) 4861 823.7 0
XP_011541674 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 586) 3940 669.8 8.4e-192
XP_011541672 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carr ( 636) 3504 597.0 7.7e-170
XP_005271931 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 719) 1824 316.3 2.7e-85
NP_775759 (OMIM: 613365) solute carrier organic an ( 719) 1824 316.3 2.7e-85
NP_001275931 (OMIM: 613365) solute carrier organic ( 719) 1824 316.3 2.7e-85
NP_057438 (OMIM: 612436) solute carrier organic an ( 722) 1795 311.5 7.8e-84
XP_005260260 (OMIM: 612436) PREDICTED: solute carr ( 684) 1739 302.1 4.9e-81
XP_016883316 (OMIM: 612436) PREDICTED: solute carr ( 700) 1739 302.1 5e-81
XP_016883315 (OMIM: 612436) PREDICTED: solute carr ( 768) 1739 302.1 5.4e-81
XP_011527094 (OMIM: 612436) PREDICTED: solute carr ( 768) 1739 302.1 5.4e-81
XP_011541450 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 640) 1515 264.7 8.4e-70
XP_011541449 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 684) 1511 264.0 1.4e-69
XP_011541452 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 476) 1497 261.6 5.1e-69
NP_001275933 (OMIM: 613365) solute carrier organic ( 657) 1441 252.3 4.5e-66
XP_011541455 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 445) 1402 245.8 2.9e-64
NP_005621 (OMIM: 601460,614441) solute carrier org ( 643) 954 170.9 1.4e-41
XP_016862564 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 653) 954 170.9 1.4e-41
XP_016862566 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 475) 946 169.6 2.6e-41
XP_005253534 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 650) 886 159.6 3.7e-38
XP_011519122 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 668) 886 159.6 3.8e-38
XP_011519120 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 886 159.6 3.8e-38
XP_011519121 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 886 159.6 3.8e-38
XP_005253531 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 670) 886 159.6 3.8e-38
NP_602307 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 886 159.6 3.8e-38
NP_066580 (OMIM: 602883) solute carrier organic an ( 670) 886 159.6 3.8e-38
XP_016875339 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 578) 884 159.2 4.1e-38
XP_016875338 (OMIM: 602883) PREDICTED: solute carr ( 598) 884 159.2 4.3e-38
XP_016862565 (OMIM: 601460,614441) PREDICTED: solu ( 597) 829 150.0 2.5e-35
NP_001294943 (OMIM: 613365) solute carrier organic ( 466) 747 136.3 2.6e-31
NP_006437 (OMIM: 237450,604843) solute carrier org ( 691) 744 135.9 5.4e-31
XP_011541456 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carr ( 380) 728 133.2 1.9e-30
NP_062818 (OMIM: 237450,605495) solute carrier org ( 702) 708 129.8 3.6e-29
XP_011519006 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 711) 697 128.0 1.3e-28
XP_016874976 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 695 127.7 1.4e-28
XP_016874975 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 594) 695 127.7 1.4e-28
NP_001139417 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 663) 695 127.7 1.5e-28
NP_059131 (OMIM: 613389) solute carrier organic an ( 712) 695 127.7 1.6e-28
XP_005253451 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 712) 695 127.7 1.6e-28
XP_016874979 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 669 123.3 2.5e-27
XP_016874978 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 545) 669 123.3 2.5e-27
XP_016874977 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 669 123.3 2.6e-27
XP_011519013 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 564) 669 123.3 2.6e-27
XP_011519011 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 669 123.3 2.9e-27
XP_016874974 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 669 123.3 2.9e-27
NP_001139416 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 612) 669 123.3 2.9e-27
XP_005253453 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 669 123.3 2.9e-27
XP_016874973 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 612) 669 123.3 2.9e-27
NP_001139418 (OMIM: 613389) solute carrier organic ( 730) 669 123.3 3.4e-27
XP_011519005 (OMIM: 613389) PREDICTED: solute carr ( 729) 667 123.0 4.3e-27
>>NP_851322 (OMIM: 609013) solute carrier organic anion (724 aa)
initn: 4861 init1: 4861 opt: 4861 Z-score: 4394.5 bits: 823.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4861; 100.0% identity (100.0% similar) in 724 aa overlap (1-724:1-724)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKSAKGIENLAFVPSSPDILRRLSASPSQIEVSALSSDPQRENSQPQELQKPQEPQKSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 MKSAKGIENLAFVPSSPDILRRLSASPSQIEVSALSSDPQRENSQPQELQKPQEPQKSPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PSLPSAPPNVSEEKLRSLSLSEFEEGSYGWRNFHPQCLQRCNTPGGFLLHYCLLAVTQGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 PSLPSAPPNVSEEKLRSLSLSEFEEGSYGWRNFHPQCLQRCNTPGGFLLHYCLLAVTQGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VVNGLVNISISTVEKRYEMKSSLTGLISSSYDISFCLLSLFVSFFGERGHKPRWLAFAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 VVNGLVNISISTVEKRYEMKSSLTGLISSSYDISFCLLSLFVSFFGERGHKPRWLAFAAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MIGLGALVFSLPQFFSGEYKLGSLFEDTCVTTRNSTSCTSSTSSLSNYLYVFILGQLLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 MIGLGALVFSLPQFFSGEYKLGSLFEDTCVTTRNSTSCTSSTSSLSNYLYVFILGQLLLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AGGTPLYTLGTAFLDDSVPTHKSSLYIGTGYAMSILGPAIGYVLGGQLLTIYIDVAMGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 AGGTPLYTLGTAFLDDSVPTHKSSLYIGTGYAMSILGPAIGYVLGGQLLTIYIDVAMGES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TDVTEDDPRWLGAWWIGFLLSWIFAWSLIIPFSCFPKHLPGTAEIQAGKTSQAHQSNSNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 TDVTEDDPRWLGAWWIGFLLSWIFAWSLIIPFSCFPKHLPGTAEIQAGKTSQAHQSNSNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DVKFGKSIKDFPAALKNLMKNAVFMCLVLSTSSEALITTGFATFLPKFIENQFGLTSSFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 DVKFGKSIKDFPAALKNLMKNAVFMCLVLSTSSEALITTGFATFLPKFIENQFGLTSSFA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ATLGGAVLIPGAALGQILGGFLVSKFRMTCKNTMKFALFTSGVALTLSFVFMYAKCENEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 ATLGGAVLIPGAALGQILGGFLVSKFRMTCKNTMKFALFTSGVALTLSFVFMYAKCENEP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 FAGVSESYNGTGELGNLIAPCNANCNCSRSYYYPVCGDGVQYFSPCFAGCSNPVAHRKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 FAGVSESYNGTGELGNLIAPCNANCNCSRSYYYPVCGDGVQYFSPCFAGCSNPVAHRKPK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 VYYNCSCIERKTEITSTAETFGFEAKAGKCETHCAKLPIFLCIFFIVIIFTFMAGTPITV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 VYYNCSCIERKTEITSTAETFGFEAKAGKCETHCAKLPIFLCIFFIVIIFTFMAGTPITV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SILRCVNHRQRSLALGIQFMVLRLLGTIPGPIIFGFTIDSTCILWDINDCGIKGACWIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 SILRCVNHRQRSLALGIQFMVLRLLGTIPGPIIFGFTIDSTCILWDINDCGIKGACWIYD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 NIKMAHMLVAISVTCKVITMFFNGFAIFLYKPPPSATDVSFHKENAVVTNVLAEQDLNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_851 NIKMAHMLVAISVTCKVITMFFNGFAIFLYKPPPSATDVSFHKENAVVTNVLAEQDLNKI
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 VKEG
::::
NP_851 VKEG
>>XP_011541674 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carrier (586 aa)
initn: 3940 init1: 3940 opt: 3940 Z-score: 3564.4 bits: 669.8 E(85289): 8.4e-192
Smith-Waterman score: 3940; 100.0% identity (100.0% similar) in 586 aa overlap (139-724:1-586)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 LHYCLLAVTQGIVVNGLVNISISTVEKRYEMKSSLTGLISSSYDISFCLLSLFVSFFGER
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MKSSLTGLISSSYDISFCLLSLFVSFFGER
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 GHKPRWLAFAAFMIGLGALVFSLPQFFSGEYKLGSLFEDTCVTTRNSTSCTSSTSSLSNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GHKPRWLAFAAFMIGLGALVFSLPQFFSGEYKLGSLFEDTCVTTRNSTSCTSSTSSLSNY
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LYVFILGQLLLGAGGTPLYTLGTAFLDDSVPTHKSSLYIGTGYAMSILGPAIGYVLGGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LYVFILGQLLLGAGGTPLYTLGTAFLDDSVPTHKSSLYIGTGYAMSILGPAIGYVLGGQL
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LTIYIDVAMGESTDVTEDDPRWLGAWWIGFLLSWIFAWSLIIPFSCFPKHLPGTAEIQAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTIYIDVAMGESTDVTEDDPRWLGAWWIGFLLSWIFAWSLIIPFSCFPKHLPGTAEIQAG
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 KTSQAHQSNSNADVKFGKSIKDFPAALKNLMKNAVFMCLVLSTSSEALITTGFATFLPKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KTSQAHQSNSNADVKFGKSIKDFPAALKNLMKNAVFMCLVLSTSSEALITTGFATFLPKF
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 IENQFGLTSSFAATLGGAVLIPGAALGQILGGFLVSKFRMTCKNTMKFALFTSGVALTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IENQFGLTSSFAATLGGAVLIPGAALGQILGGFLVSKFRMTCKNTMKFALFTSGVALTLS
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 FVFMYAKCENEPFAGVSESYNGTGELGNLIAPCNANCNCSRSYYYPVCGDGVQYFSPCFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FVFMYAKCENEPFAGVSESYNGTGELGNLIAPCNANCNCSRSYYYPVCGDGVQYFSPCFA
340 350 360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 GCSNPVAHRKPKVYYNCSCIERKTEITSTAETFGFEAKAGKCETHCAKLPIFLCIFFIVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GCSNPVAHRKPKVYYNCSCIERKTEITSTAETFGFEAKAGKCETHCAKLPIFLCIFFIVI
400 410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 IFTFMAGTPITVSILRCVNHRQRSLALGIQFMVLRLLGTIPGPIIFGFTIDSTCILWDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IFTFMAGTPITVSILRCVNHRQRSLALGIQFMVLRLLGTIPGPIIFGFTIDSTCILWDIN
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 DCGIKGACWIYDNIKMAHMLVAISVTCKVITMFFNGFAIFLYKPPPSATDVSFHKENAVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DCGIKGACWIYDNIKMAHMLVAISVTCKVITMFFNGFAIFLYKPPPSATDVSFHKENAVV
520 530 540 550 560 570
710 720
pF1KE0 TNVLAEQDLNKIVKEG
::::::::::::::::
XP_011 TNVLAEQDLNKIVKEG
580
>>XP_011541672 (OMIM: 609013) PREDICTED: solute carrier (636 aa)
initn: 3540 init1: 3499 opt: 3504 Z-score: 3170.1 bits: 597.0 E(85289): 7.7e-170
Smith-Waterman score: 4108; 87.8% identity (87.8% similar) in 724 aa overlap (1-724:1-636)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKSAKGIENLAFVPSSPDILRRLSASPSQIEVSALSSDPQRENSQPQELQKPQEPQKSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MKSAKGIENLAFVPSSPDILRRLSASPSQIEVSALSSDPQRENSQPQELQKPQEPQKSPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PSLPSAPPNVSEEKLRSLSLSEFEEGSYGWRNFHPQCLQRCNTPGGFLLHYCLLAVTQGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PSLPSAPPNVSEEKLRSLSLSEFEEGSYGWRNFHPQCLQRCNTPGGFLLHYCLLAVTQ--
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VVNGLVNISISTVEKRYEMKSSLTGLISSSYDISFCLLSLFVSFFGERGHKPRWLAFAAF
XP_011 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MIGLGALVFSLPQFFSGEYKLGSLFEDTCVTTRNSTSCTSSTSSLSNYLYVFILGQLLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 --------------------------DTCVTTRNSTSCTSSTSSLSNYLYVFILGQLLLG
120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AGGTPLYTLGTAFLDDSVPTHKSSLYIGTGYAMSILGPAIGYVLGGQLLTIYIDVAMGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGGTPLYTLGTAFLDDSVPTHKSSLYIGTGYAMSILGPAIGYVLGGQLLTIYIDVAMGES
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TDVTEDDPRWLGAWWIGFLLSWIFAWSLIIPFSCFPKHLPGTAEIQAGKTSQAHQSNSNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TDVTEDDPRWLGAWWIGFLLSWIFAWSLIIPFSCFPKHLPGTAEIQAGKTSQAHQSNSNA
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DVKFGKSIKDFPAALKNLMKNAVFMCLVLSTSSEALITTGFATFLPKFIENQFGLTSSFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVKFGKSIKDFPAALKNLMKNAVFMCLVLSTSSEALITTGFATFLPKFIENQFGLTSSFA
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ATLGGAVLIPGAALGQILGGFLVSKFRMTCKNTMKFALFTSGVALTLSFVFMYAKCENEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATLGGAVLIPGAALGQILGGFLVSKFRMTCKNTMKFALFTSGVALTLSFVFMYAKCENEP
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 FAGVSESYNGTGELGNLIAPCNANCNCSRSYYYPVCGDGVQYFSPCFAGCSNPVAHRKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FAGVSESYNGTGELGNLIAPCNANCNCSRSYYYPVCGDGVQYFSPCFAGCSNPVAHRKPK
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 VYYNCSCIERKTEITSTAETFGFEAKAGKCETHCAKLPIFLCIFFIVIIFTFMAGTPITV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VYYNCSCIERKTEITSTAETFGFEAKAGKCETHCAKLPIFLCIFFIVIIFTFMAGTPITV
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 SILRCVNHRQRSLALGIQFMVLRLLGTIPGPIIFGFTIDSTCILWDINDCGIKGACWIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SILRCVNHRQRSLALGIQFMVLRLLGTIPGPIIFGFTIDSTCILWDINDCGIKGACWIYD
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 NIKMAHMLVAISVTCKVITMFFNGFAIFLYKPPPSATDVSFHKENAVVTNVLAEQDLNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NIKMAHMLVAISVTCKVITMFFNGFAIFLYKPPPSATDVSFHKENAVVTNVLAEQDLNKI
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 VKEG
::::
XP_011 VKEG
>>XP_005271931 (OMIM: 613365) PREDICTED: solute carrier (719 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]