FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0370, 533 aa
1>>>pF1KE0370 533 - 533 aa - 533 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9999+/-0.000984; mu= 13.9700+/- 0.058
mean_var=65.4481+/-13.311, 0's: 0 Z-trim(104.1): 39 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.158535
statistics sampled from 7695 (7722) to 7695 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS5858.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 ( 443) 433 108.2 2e-23
CCDS75669.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 ( 478) 293 76.2 9.4e-14
>>CCDS13689.1 SLC37A1 gene_id:54020|Hs108|chr21 (533 aa)
initn: 3556 init1: 3556 opt: 3556 Z-score: 4392.9 bits: 822.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3556; 100.0% identity (100.0% similar) in 533 aa overlap (1-533:1-533)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGII
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFGLGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTCL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFLF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDPEMQCLLLSDGKGSIH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVDHL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYIFSTVSKMGLE
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAALGP
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pF1KE0 LLAGLLSPSGWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLAGLLSPSGWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
490 500 510 520 530
>>CCDS44757.1 SLC37A2 gene_id:219855|Hs108|chr11 (501 aa)
initn: 2050 init1: 963 opt: 976 Z-score: 1204.3 bits: 232.4 E(32554): 9.3e-61
Smith-Waterman score: 2012; 59.8% identity (80.2% similar) in 515 aa overlap (4-517:5-485)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEA
: :. :. .::::.:.:..:..::::.:: .:.:::::::::..::. :
CCDS44 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNC------
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 DVRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGI
: : . ... :.: :. :.::::::.::..:::..: .:: :::.::..::.
CCDS44 ----SEQIKPINDT--HSLNDTMW-CSWAPFDKDNYKELLGGVDNAFLIAYAIGMFISGV
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IGERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFGLGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTC
.:::::.::::. ::: :: ::.:::::::.::: . ..:: :: :::::::::::::::
CCDS44 FGERLPLRYYLSAGMLLSGLFTSLFGLGYFWNIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTC
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFL
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CCDS44 VGNWFGKGKRGFIMGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FLIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDP-EMQCLLLSDGKGS
::::::.:: :. :.. :: : : :: . : . .: .
CCDS44 FLIEHPEDVDCAPPQ-HHGEPAENQDN---------------PEDPGNSPCSIRESGLET
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300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IHPNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVD
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CCDS44 V--AKCSKGPCEE---PAAISFFGALRIPGVVEFSLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVA
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 HLDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYIFSTVSKMG
:..::.::.::::::::::.:::.::..:: . ::.:: .::.:::: ..... ... :
CCDS44 HFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSDYTNGRATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDG
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LEATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAAL
. ..:.::.. :.::.:::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::
CCDS44 IASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADLGTHKSLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAAL
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GPLLAGLLSPSGWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
:::::::.::.::.::::::. ::. : :.: ::..::.
CCDS44 GPLLAGLISPTGWNNVFYMLISADVLACLLLCRLVYKEILAWKVSLSRGSGYKEI
450 460 470 480 490 500
>>CCDS31714.1 SLC37A2 gene_id:219855|Hs108|chr11 (505 aa)
initn: 2083 init1: 963 opt: 976 Z-score: 1204.2 bits: 232.4 E(32554): 9.4e-61
Smith-Waterman score: 2012; 59.8% identity (80.2% similar) in 515 aa overlap (4-517:5-485)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEA
: :. :. .::::.:.:..:..::::.:: .:.:::::::::..::. :
CCDS31 MRSSLAPGVWFFRAFSRDSWFRGLILLLTFLIYACYHMSRKPISIVKSRLHQNC------
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 DVRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGI
: : . ... :.: :. :.::::::.::..:::..: .:: :::.::..::.
CCDS31 ----SEQIKPINDT--HSLNDTMW-CSWAPFDKDNYKELLGGVDNAFLIAYAIGMFISGV
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IGERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFGLGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTC
.:::::.::::. ::: :: ::.:::::::.::: . ..:: :: :::::::::::::::
CCDS31 FGERLPLRYYLSAGMLLSGLFTSLFGLGYFWNIHELWYFVVIQVCNGLVQTTGWPSVVTC
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFL
.:::::::.::.:::.::::::::::::::::: ::. :::::.::: :.:.::.. ::
CCDS31 VGNWFGKGKRGFIMGIWNSHTSVGNILGSLIAGIWVNGQWGLSFIVPGIITAVMGVITFL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FLIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDP-EMQCLLLSDGKGS
::::::.:: :. :.. :: : : :: . : . .: .
CCDS31 FLIEHPEDVDCAPPQ-HHGEPAENQDN---------------PEDPGNSPCSIRESGLET
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IHPNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVD
. . : . ::::: :::.::::.:::::::::::::::::.::::::.::
CCDS31 V--AKCSKGPCEE---PAAISFFGALRIPGVVEFSLCLLFAKLVSYTFLYWLPLYIANVA
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 HLDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYIFSTVSKMG
:..::.::.::::::::::.:::.::..:: . ::.:: .::.:::: ..... ... :
CCDS31 HFSAKEAGDLSTLFDVGGIIGGIVAGLVSDYTNGRATTCCVMLILAAPMMFLYNYIGQDG
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 LEATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAAL
. ..:.::.. :.::.:::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::
CCDS31 IASSIVMLIICGGLVNGPYALITTAVSADLGTHKSLKGNAKALSTVTAIIDGTGSIGAAL
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GPLLAGLLSPSGWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
:::::::.::.::.::::::. ::. : :.: ::..::.
CCDS31 GPLLAGLISPTGWNNVFYMLISADVLACLLLCRLVYKEILAWKVSLSRGSGSSMVLTHQ
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>>CCDS5859.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 (494 aa)
initn: 926 init1: 287 opt: 531 Z-score: 654.3 bits: 130.7 E(32554): 4e-30
Smith-Waterman score: 938; 34.8% identity (63.8% similar) in 500 aa overlap (20-517:19-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEAD
... .:.:::. :. .: ::: .: :: . . : .
CCDS58 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSISEQ---WTPSA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGII
: . .. : .:. : . .::.:: :: .::::...:::.
CCDS58 FNTSVELPVEIWSSNHLFPSAE-----------KATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIV
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pF1KE0 GERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFG-LGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTC
:.:: .:. :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::.:.:::: ::.
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pF1KE0 LGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFL
.::::::. ::...:.:.. .:::::::. .:. .. . .:.: ... : ::: :.
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170 180 190 200 210 220
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pF1KE0 FLIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDPEMQCLLLSDGKGSI
:. :... :. . ...:. ..: : .:.. .:.. ::
CCDS58 GLLVSPEEIGLSG--IEAEENFEEDSHR----PLINGGENEDEYEPNY----------SI
230 240 250 260
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pF1KE0 HPNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVDH
. . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.::::.:..:
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270 280 290 300 310 320
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pF1KE0 LDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLYIFSTVSKMGL
.: .:: .:::::.:: : : ::: :.::: . .: ::::. .: .: :
CCDS58 WKEAEADKLSIWYDVGGIIGGTLQGFISDVLQKRAPVLALSLLLAVGSLIGYSR-SPNDK
330 340 350 360 370 380
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pF1KE0 EATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAALG
. .. ..: ...:: ..:..:.::::: .. .. ...::.:::.:.::.::.:::.:
CCDS58 SINALLMTVTGFFIGGPSNMISSAISADLGRQELIQRSSEALATVTGIVDGSGSIGAAVG
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pF1KE0 PLLAGLLSPS-GWSNVFYMLMFADACALLFLIRLIHKELSCPGSATGDQVPFKEQ
:..:. . :: :::.... .:...:. :: .:.
CCDS58 QYLVSLIRDKLGWMWVFYFFILMTSCTIVFISPLIVREIFSLVLRRQAHILRE
450 460 470 480 490
>>CCDS5858.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 (443 aa)
initn: 648 init1: 264 opt: 433 Z-score: 534.0 bits: 108.2 E(32554): 2e-23
Smith-Waterman score: 615; 31.6% identity (59.7% similar) in 402 aa overlap (20-418:19-378)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEAD
... .:.:::. :. .: ::: .: :: . . : .
CCDS58 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSISEQ---WTPSA
10 20 30 40 50
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pF1KE0 VRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGII
: . .. : .:. : . .::.:: :: .::::...:::.
CCDS58 FNTSVELPVEIWSSNHLFPSAE-----------KATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIV
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE0 GERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFG-LGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTC
:.:: .:. :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::.:.:::: ::.
CCDS58 GDRLNLRWVLSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAV
110 120 130 140 150 160
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pF1KE0 LGNWFGKGRRGLIMGVWNSHTSVGNILGSLIAGYWVSTCWGLSFVVPGAIVAAMGIVCFL
.::::::. ::...:.:.. .:::::::. .:. .. . .:.: ... : ::: :.
CCDS58 MGNWFGKAGRGVVFGLWSACASVGNILGACLASSVLQYGYEYAFLVTASVQFAGGIVIFF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FLIEHPNDVRCSSTLVTHSKGYENGTNRLRLQKQILKSEKNKPLDPEMQCLLLSDGKGSI
:. :... :. . ...:. ..: : .:.. .:.. ::
CCDS58 GLLVSPEEIGLSG--IEAEENFEEDSHR----PLINGGENEDEYEPNY----------SI
230 240 250 260
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pF1KE0 HPNHVVILPGDGGSGTAAISFTGALKIPGVIEFSLCLLFAKLVSYTFLFWLPLYITNVDH
. . : . . :::: : .:::: .:: :::.:.:.::::.:..:
CCDS58 QDDSSV-------AQVKAISFYQACCLPGVIPYSLAYACLKLVNYSFFFWLPFYLSNNFG
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LDAKKAGELSTLFDVGGIFGGILAGVISDRLEKRASTCGLMLLLAAPTLY--IFSTVSKM
.: .:: .:::: :.. .:: . : .. :..:. . :: .. ....
CCDS58 WKEAEADKLSIWYDVGG----IIVFSVSDPGQARMDV-GFLLFHSHDKLYNCVYLAINSE
330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 GLEATIAMLLLSGALVSGPYTLITTAVSADLGTHKSLKGNAHALSTVTAIIDGTGSVGAA
:
CCDS58 GNILSRAKETGSHIEGVTGARETERTMSATSGPLGLRVCPNLGLSRSSSLILDCQASLNT
380 390 400 410 420 430
>>CCDS75669.1 SLC37A3 gene_id:84255|Hs108|chr7 (478 aa)
initn: 965 init1: 275 opt: 293 Z-score: 360.4 bits: 76.2 E(32554): 9.4e-14
Smith-Waterman score: 899; 34.4% identity (62.4% similar) in 500 aa overlap (20-517:19-464)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MARLPAGIRFIISFSRDQWYRAFIFILTFLLYASFHLSRKPISIVKGELHKYCTAWDEAD
... .:.:::. :. .: ::: .: :: . . : .
CCDS75 MAWPNVFQRGSLLSQFSHHHVVVFLLTFFSYSLLHASRKTFSNVKVSISEQ---WTPSA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VRFSSQNRKSGSAAPHQLPDNETDCGWAPFDKNNYQQLLGALDYSFLCAYAVGMYLSGII
: . .. : .:. : . .::.:: :: .::::...:::.
CCDS75 FNTSVELPVEIWSSNHLFPSAE-----------KATLFLGTLDTIFLFSYAVGLFISGIV
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE0 GERLPIRYYLTFGMLASGAFTALFG-LGYFYNIHSFGFYVVTQVINGLVQTTGWPSVVTC
:.:: .:. :.::: .:. . .:: : . ... .: ..:::.:.:::: ::.
CCDS75 GDRLNLRWVLSFGMCSSALVVFVFGALTEWLRFYNKWLYCCLWIVNGLLQSTGWPCVVAV
110 120 130 140 150 160
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