FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0367, 754 aa
1>>>pF1KE0367 754 - 754 aa - 754 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4305+/-0.00185; mu= 11.4088+/- 0.106
mean_var=345.6175+/-98.989, 0's: 0 Z-trim(101.7): 230 B-trim: 382 in 1/49
Lambda= 0.068988
statistics sampled from 6408 (6626) to 6408 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 754) 5068 520.6 3.5e-147
CCDS53862.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 730) 3096 324.3 4.2e-88
CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 757) 2689 283.8 6.6e-76
CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 724) 2428 257.8 4.3e-68
CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 784) 2414 256.5 1.2e-67
CCDS75205.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 626) 2307 245.7 1.7e-64
CCDS75206.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 601) 1906 205.8 1.7e-52
CCDS58929.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 709) 1867 202.0 2.7e-51
>>CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 (754 aa)
initn: 5068 init1: 5068 opt: 5068 Z-score: 2755.9 bits: 520.6 E(32554): 3.5e-147
Smith-Waterman score: 5068; 100.0% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE0 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
730 740 750
>>CCDS53862.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 (730 aa)
initn: 2973 init1: 2973 opt: 3096 Z-score: 1695.3 bits: 324.3 E(32554): 4.2e-88
Smith-Waterman score: 4853; 96.8% identity (96.8% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-730)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNNYLEALPKQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVL--------------
250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 FSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ----------DLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDL
290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRI
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKIL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKHQRKSIFKIKKK
640 650 660 670 680 690
730 740 750
pF1KE0 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
700 710 720 730
>>CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (757 aa)
initn: 2629 init1: 1919 opt: 2689 Z-score: 1476.2 bits: 283.8 E(32554): 6.6e-76
Smith-Waterman score: 2689; 55.0% identity (79.9% similar) in 716 aa overlap (24-730:8-721)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
: .:: : :. :. . .:. :::::::.:::::
CCDS43 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQECFLKQYPQ
. .::.: ::::: :::.::::..::. : .. .. : : ::.. . :
CCDS43 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 CCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCI
: :. ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..:: : .: :.:..::.: :
CCDS43 QCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLN
:: :: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :::
CCDS43 TSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQ
::..: ..:: : :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:.
CCDS43 SLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESL
:. . :.::. :..: ::::.:: : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::. :
CCDS43 INHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDL
.:.::.:: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:
CCDS43 VKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LANNILRIFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVG
::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..:: .:::: :::::::::.::: .:
CCDS43 LASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 IFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIR
::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.:: .:
CCDS43 GFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVR
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 PGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLG
::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..
CCDS43 PGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVA
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 IFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWI
::::.:: ::.:::::: .:: :....:. .::.:: .:. .:.:::::::.::.:::
CCDS43 IFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWI
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 PVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QR
:.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.::::::::::::: ::. .... ... ::
CCDS43 PIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQR
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750
pF1KE0 KSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
::. . .:. . :..:.:
CCDS43 KSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
710 720 730 740 750
>>CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (724 aa)
initn: 2556 init1: 1919 opt: 2428 Z-score: 1336.0 bits: 257.8 E(32554): 4.3e-68
Smith-Waterman score: 2596; 54.6% identity (78.6% similar) in 709 aa overlap (24-730:8-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
: .:: : :. :. . .:. :::::::.:::::
CCDS58 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKET
. .::.: ::::: :::.:: . :.: : : :.
CCDS58 QLLHCNGVDDCGNQADEDNC--------VVGSV------------------PVQCLCQGL
50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKA
::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..:: : .: :.:..::.: : :: :
CCDS58 ELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYA
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSM
: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :::::..: .
CCDS58 FRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVL
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290
pF1KE0 VNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEK
.:: : :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:.:. . :.
CCDS58 MNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNEN
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLD
::. :..: ::::.:: : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::. : .:.::.
CCDS58 TFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLS
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 LERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILR
:: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:::. : :
CCDS58 LEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQR
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 IFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYR
.::::.. .:::::.::: :: .:..:: .:::: :::::::::.::: .: ::.:.:
CCDS58 VFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFR
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 GQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTS
:.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.:: .:::: .:
CCDS58 GEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTI
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNL
..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..::::.::
CCDS58 TVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINL
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 LAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKI
::.:::::: .:: :....:. .::.:: .:. .:.:::::::.::.::::.::::.
CCDS58 AAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKF
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 LSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QRKSIFKIK
:::..:::: :.:::.:::.::.::::::::::::: ::. .... ... ::::. .
CCDS58 LSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKG
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750
pF1KE0 KKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
.:. . :..:.:
CCDS58 QKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
680 690 700 710 720
>>CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (784 aa)
initn: 2601 init1: 1919 opt: 2414 Z-score: 1328.1 bits: 256.5 E(32554): 1.2e-67
Smith-Waterman score: 2635; 53.3% identity (77.1% similar) in 743 aa overlap (24-730:8-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
: .:: : :. :. . .:. :::::::.:::::
CCDS75 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
10 20 30 40
70 80 90 100
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQEC-------
. .::.: ::::: :::.::::..::. : .. .. : : ::
CCDS75 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECSFHFFLF
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140
pF1KE0 --FLKQYPQC------------------CDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKK
.: :.: : :. ::.: . .:..:: .:.::: .::.
CCDS75 ITLLFLVPHCHHALPLPLDSVVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQW
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 NKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFK
: :..:: : .: :.:..::.: : :: :: :: .: :::.:: :: :.::.:.
CCDS75 NLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFE
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 DLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLE
:::.: :::..:: ..::: : :::::..: ..:: : :: : .: .::.:.:.:::
CCDS75 DLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLE
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 GNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLF
::.:. : : ::.::..:::: . .:.:. . :.::. :..: ::::.:: : .: : .:
CCDS75 GNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIF
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 KDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFK
:::: :..:::: ::.. .. :::. : .:.::.:: ::: ::. :::.:. ::::::::
CCDS75 KDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFK
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRIFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKA
.:.::.:::::: : : ::::::.:.:::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..
CCDS75 KFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRS
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 ENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLS
:: .:::: :::::::::.::: .: ::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.::
CCDS75 ENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILS
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 TEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGN
:::::::::.:::::.. ::.:: .:::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :
CCDS75 TEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKN
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 FYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTE
.:: :::::::. ..::.::.. ::..::::.:: ::.:::::: .:: :....:. .::
CCDS75 YYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATE
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 VRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSA
.:: .:. .:.:::::::.::.::::.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.:::
CCDS75 IRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSA
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KE0 LNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QRKSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKIT
:::::::::: ::. .... ... ::::. . .:. . :..:.:
CCDS75 LNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKP
710 720 730 740 750 760
750
pF1KE0 LGDSIMKPVS
CCDS75 DLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
770 780
>>CCDS75205.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (626 aa)
initn: 2214 init1: 1760 opt: 2307 Z-score: 1271.5 bits: 245.7 E(32554): 1.7e-64
Smith-Waterman score: 2307; 57.5% identity (82.6% similar) in 591 aa overlap (142-730:1-590)
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PQCCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHN
.::. : :..:: : .: :.:..::.:
CCDS75 MSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNN
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CIRHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTG
: :: :: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :
CCDS75 KITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYG
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LNSLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPR
::::..: ..:: : :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .
CCDS75 LNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRK
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 NQIGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFE
:.:. . :.::. :..: ::::.:: : .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::.
CCDS75 NKINHLNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFD
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 SLKQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFE
: .:.:: :: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:
CCDS75 YLVKLKSL-LEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLE
220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 DLLANNILRIFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFF
.:::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..:: .:::: :::::::::.:::
CCDS75 NLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFV
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 VGIFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSN
.: ::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.::
CCDS75 IGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRC
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 IRPGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYS
.:::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::
CCDS75 VRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYS
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 LGIFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAIC
..::::.:: ::.:::::: .:: :....:. .::.:: .:. .:.:::::::.::.:
CCDS75 VAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALC
450 460 470 480 490 500
660 670 680 690 700
pF1KE0 WIPVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-
:::.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.::::::::::::: ::. .... ...
CCDS75 WIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYR
510 520 530 540 550 560
710 720 730 740 750
pF1KE0 QRKSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
::::. . .:. . :..:.:
CCDS75 QRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
570 580 590 600 610 620
>>CCDS75206.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (601 aa)
initn: 2033 init1: 1760 opt: 1906 Z-score: 1055.9 bits: 205.8 E(32554): 1.7e-52
Smith-Waterman score: 2109; 55.7% identity (80.0% similar) in 566 aa overlap (167-730:24-565)
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 NNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKAFFGLCNLQILYLNHNC
.::.: : :: :: :: .: :::.::
CCDS75 MVTCTQNMKAALKSLLYHSRNLGYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNR
10 20 30 40 50
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 ITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQ
:: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :::::..: ..:: : :: : .: .
CCDS75 ITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQH
60 70 80 90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 MPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQIGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSN
::.:.:. .. :.:..:. :.::. :..: ::::.::
CCDS75 MPRLHWLVMRKNKINHLN------------------------ENTFAPLQKLDELDLGSN
120 130 140
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 TITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDLERIEIPNINTRMFQP
: .: : .::::: :..:::: ::.. .. :::. : .:.::.:: ::: ::. :::.:
CCDS75 KIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRP
150 160 170 180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 MKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRIFVWVIAFITCFGNLF
. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:::. : :.::::.. .:::::.:
CCDS75 LMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIF
210 220 230 240 250 260
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 VIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVGIFDIKYRGQYQKYALLWMESVQC
:: :: .:..:: .:::: :::::::::.::: .: ::.:.::.:.:.: :::::..:
CCDS75 VICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHC
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 RLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIRPGKRQTSVILICIWMAGFLIAVI
.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.:: .:::: .: ..:: ::..::..: :
CCDS75 QLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGFIVAFI
330 340 350 360 370 380
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 PFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLGIFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCS
:. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..::::.:: ::.:::::: .:: :
CCDS75 PLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYS
390 400 410 420 430 440
620 630 640 650 660 670
pF1KE0 IQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWIPVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWI
....:. .::.:: .:. .:.:::::::.::.::::.::::.:::..:::: :.:::.
CCDS75 VHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWV
450 460 470 480 490 500
680 690 700 710 720 730
pF1KE0 VIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QRKSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSS
:::.::.::::::::::::: ::. .... ... ::::. . .:. . :..:.:
CCDS75 VIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPL
510 520 530 540 550 560
740 750
pF1KE0 LKLGVLNKITLGDSIMKPVS
CCDS75 QEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
570 580 590 600
>>CCDS58929.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (709 aa)
initn: 2275 init1: 1565 opt: 1867 Z-score: 1034.3 bits: 202.0 E(32554): 2.7e-51
Smith-Waterman score: 2419; 51.3% identity (74.6% similar) in 716 aa overlap (24-730:8-673)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP
: .:: : :. :. . .:. :::::::.:::::
CCDS58 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQECFLKQYPQ
. .::.: ::::: :::.::::..::. : .. .. : : ::.. . :
CCDS58 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 CCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCI
: :. ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..:: : .: :.:..::.: :
CCDS58 QCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLN
:: :: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : :::
CCDS58 TSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SLFFLSMVNNYLEALP-KQMCAQMPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRNQ
::..: ..:: : :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:.
CCDS58 SLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IGFVPEKTFSSLKNLGELDLSSNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESL
:. . :.::. :..: :..:
CCDS58 INHLNENTFAPLQKLDEFSL----------------------------------------
290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KQLQSLDLERIEIPNINTRMFQPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDL
: ::: ::. :::.:. ::::::::.:.::.:::::: : : ::::::.:.:
CCDS58 --------EGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENL
310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LANNILRIFVWVIAFITCFGNLFVIGMRSFIKAENTTHAMSIKILCCADCLMGVYLFFVG
::. : :.::::.. .:::::.::: :: .:..:: .:::: :::::::::.::: .:
CCDS58 LASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIG
360 370 380 390 400 410
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 IFDIKYRGQYQKYALLWMESVQCRLMGFLAMLSTEVSVLLLTYLTLEKFLVIVFPFSNIR
::.:.::.:.:.: :::::..:.:.: ::.:::::::::::.:::::.. ::.:: .:
CCDS58 GFDLKFRGEYNKHAQLWMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVR
420 430 440 450 460 470
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 PGKRQTSVILICIWMAGFLIAVIPFWNKDYFGNFYGKNGVCFPLYYDQTEDIGSKGYSLG
::: .: ..:: ::..::..: ::. ::..: :.:: :::::::. ..::.::.. ::..
CCDS58 PGKCRTITVLILIWITGFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVA
480 490 500 510 520 530
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 IFLGVNLLAFLIIVFSYITMFCSIQKTALQTTEVRNCFGREVAVANRFFFIVFSDAICWI
::::.:: ::.:::::: .:: :....:. .::.:: .:. .:.:::::::.::.:::
CCDS58 IFLGINLAAFIIIVFSYGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWI
540 550 560 570 580 590
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 PVFVVKILSLFRVEIPDTMTSWIVIFFLPVNSALNPILYTLTTNFFKDKLKQLLHKH-QR
:.::::.:::..:::: :.:::.:::.::.::::::::::::: ::. .... ... ::
CCDS58 PIFVVKFLSLLQVEIPGTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQR
600 610 620 630 640 650
720 730 740 750
pF1KE0 KSIFKIKKKSLSTSIVWIEDSSSLKLGVLNKITLGDSIMKPVS
::. . .:. . :..:.:
CCDS58 KSMDSKGQKTYAPSFIWVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS
660 670 680 690 700
754 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 13:47:56 2016 done: Thu Nov 3 13:47:57 2016
Total Scan time: 3.020 Total Display time: 0.200
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]