FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0366, 634 aa
1>>>pF1KE0366 634 - 634 aa - 634 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3000+/-0.00103; mu= 19.1228+/- 0.062
mean_var=69.7759+/-15.280, 0's: 0 Z-trim(103.0): 38 B-trim: 435 in 1/48
Lambda= 0.153540
statistics sampled from 7152 (7186) to 7152 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 3.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 4296 961.4 0
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 2350 530.4 2.9e-150
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 2016 456.4 5.1e-128
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 1519 346.3 8.3e-95
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 730) 1498 341.7 2.1e-93
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 623) 1240 284.5 3e-76
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 980 226.9 6.2e-59
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 912 211.8 2e-54
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 854 199.0 1.9e-50
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 819 191.0 1.9e-48
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 571 136.3 1.2e-31
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 550 131.6 3.1e-30
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 550 131.7 3.1e-30
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 550 131.7 3.3e-30
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 520) 544 130.3 6.6e-30
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 544 130.3 7.7e-30
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 540 129.4 1.2e-29
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 540 129.4 1.4e-29
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 533 127.9 4.2e-29
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 530 127.3 8e-29
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 509 122.6 1.7e-27
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 496 119.7 1.2e-26
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 496 119.7 1.4e-26
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 494 119.2 1.7e-26
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 469 113.4 3e-25
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 440 107.2 5.6e-23
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 435 105.9 5.8e-23
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 440 107.3 6.5e-23
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 440 107.3 6.6e-23
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 435 106.2 1.4e-22
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 432 105.5 2.3e-22
>>CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 (634 aa)
initn: 4296 init1: 4296 opt: 4296 Z-score: 5140.9 bits: 961.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4296; 100.0% identity (100.0% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQEEASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCVGLGNVWRFPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MVRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQEEASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCVGLGNVWRFPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LCQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPALKGLGLASML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LCQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPALKGLGLASML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TSFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYVDECARSSPVDYFWYRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYVDECARSSPVDYFWYRET
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITSTLPYVVLTIFLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LNISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITSTLPYVVLTIFLIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GLTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLISFSSYNSVHNNCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GLTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLISFSSYNSVHNNCE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KDSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTNILTLINGFDLPEGNVTQENF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KDSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTNILTLINGFDLPEGNVTQENF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 VDMQQRCNASDPAAYAQLVFQTCDINAFLSEAVEGTGLAFIVFTEAITKMPLSPLWSVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDMQQRCNASDPAAYAQLVFQTCDINAFLSEAVEGTGLAFIVFTEAITKMPLSPLWSVLF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 FIMLFCLGLSSMFGNMEGVVVPLQDLRVIPPKWPKEVLTGLICLGTFLIGFIFTLNSGQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FIMLFCLGLSSMFGNMEGVVVPLQDLRVIPPKWPKEVLTGLICLGTFLIGFIFTLNSGQY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 WLSLLDSYAGSIPLLIIAFCEMFSVVYVYGVDRFNKDIEFMIGHKPNIFWQVTWRVVSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WLSLLDSYAGSIPLLIIAFCEMFSVVYVYGVDRFNKDIEFMIGHKPNIFWQVTWRVVSPL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LMLIIFLFFFVVEVSQELTYSIWDPGYEEFPKSQKISYPNWVYVVVVIVAGVPSLTIPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LMLIIFLFFFVVEVSQELTYSIWDPGYEEFPKSQKISYPNWVYVVVVIVAGVPSLTIPGY
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE0 AIYKLIRNHCQKPGDHQGLVSTLSTASMNGDLKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AIYKLIRNHCQKPGDHQGLVSTLSTASMNGDLKY
610 620 630
>>CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 (628 aa)
initn: 2343 init1: 2217 opt: 2350 Z-score: 2811.3 bits: 530.4 E(32554): 2.9e-150
Smith-Waterman score: 2350; 55.2% identity (84.7% similar) in 576 aa overlap (32-606:18-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 VRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQEEASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCVGLGNVWRFPYL
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CCDS38 MAHAPEPDPAACDLGDERPKWDNKAQYLLSCTGFAVGLGNIWRFPYL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPALKGLGLASMLT
::..:::::.::..: ::.::::....:.:::::::.::.:::..: : :.:.::. .
CCDS38 CQTYGGGAFLIPYVIALVFEGIPIFHVELAIGQRLRKGSVGVWTAISPYLSGVGLGCVTL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYVDECARSSPVDYFWYRETL
::...::::::..:..:::.::::.:::::.:: . :.::.:.:: :: :.:::::.::
CCDS38 SFLISLYYNTIVAWVLWYLLNSFQHPLPWSSCPPDLNRTGFVEECQGSSAVSYFWYRQTL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITSTLPYVVLTIFLIRG
::...:.::::::::.:.::: .:.:.:::.:::::::::..:.:. .::.:::::::::
CCDS38 NITADINDSGSIQWWLLICLAASWAVVYMCVIRGIETTGKVIYFTALFPYLVLTIFLIRG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLISFSSYNSVHNNCEK
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CCDS38 LTLPGATKGLIYLFTPNMHILQNPRVWLDAATQIFFSLSLAFGGHIAFASYNSPRNDCQK
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTNILTLINGFDLPEGNVTQENFV
:.:.....: .::.:..:.:.::.::.::. :. :.. :::.::: ::.:: .......
CCDS38 DAVVIALVNRMTSLYASIAVFSVLGFKATNDYEHCLDRNILSLINDFDFPEQSISRDDYP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DMQQRCNASDPAAYAQLVFQTCDINAFLSEAVEGTGLAFIVFTEAITKMPLSPLWSVLFF
. .. ::. : ::: ...: .. ::.... : ::::.::::. .:: .:.:..:::
CCDS38 AVLMHLNATWPKRVAQLPLKACLLEDFLDKSASGPGLAFVVFTETDLHMPGAPVWAMLFF
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 IMLFCLGLSSMFGNMEGVVVPLQDLRVIPPKW-PKEVLTGLICLGTFLIGFIFTLNSGQY
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CCDS38 GMLFTLGLSTMFGTVEAVITPLLDVGVLP-RWVPKEALTGLVCLVCFLSATCFTLQSGNY
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 WLSLLDSYAGSIPLLIIAFCEMFSVVYVYGVDRFNKDIEFMIGHKPNIFWQVTWRVVSPL
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CCDS38 WLEIFDNFAASPNLLMLAFLEVVGVVYVYGMKRFCDDIAWMTGRRPSPYWRLTWRVVSPL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LMLIIFLFFFVVEVSQELTYSIWDPGYEEFPKSQKISYPNWVYVVVVIVAGVPSLTIPGY
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CCDS38 L-LTIFVAYIILLFWKPLRYKAWNPKYELFPSRQEKLYPGWARAACVLLSLLPVLWVPVA
530 540 550 560 570 580
610 620 630
pF1KE0 AIYKLIRNHCQKPGDHQGLVSTLSTASMNGDLKY
:. .:.
CCDS38 ALAQLLTRRRRTWRDRDARPDTDMRPDTDTRPDTDMRPDTDMR
590 600 610 620
>>CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 (592 aa)
initn: 1978 init1: 1426 opt: 2016 Z-score: 2411.8 bits: 456.4 E(32554): 5.1e-128
Smith-Waterman score: 2016; 46.3% identity (80.4% similar) in 588 aa overlap (31-615:4-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MVRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQEEASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCVGLGNVWRFPY
.:: : :. :....:... :::::::::::
CCDS43 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LCQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPALKGLGLASML
::: .:::.:..:..:.:..::.::::::.:.:::.:.::.:.: .: : :.:.:.::..
CCDS43 LCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TSFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYVDECARSSPVDYFWYRET
.::....:::.: .: .::::.:::.::::: :::: :.::: .:: ..: ..:::::.:
CCDS43 VSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LNISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITSTLPYVVLTIFLIR
:::: :....:..:: ::: :: :.:.: .:: :.:::.::.:..::: :: :.:::
CCDS43 LNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGTESTGKVVYFTASLPYCVLIIYLIR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GLTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLISFSSYNSVHNNCE
::::.:::::....:::.. .::.: .:..:..:.:::..:.::.::.:.::: :::.
CCDS43 GLTLHGATNGLMYMFTPKIEQLANPKAWINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQ
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KDSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTNILTLINGFDLPEGNVTQENF
: ..:::.::.:::....::..:. ::.:: :..:.. : : : ::: .: .: :.
CCDS43 KHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KE0 VDMQQRCNASDPAAYAQLVFQ--TCDINAFLSEAVEGTGLAFIVFTEAITKMPLSPLWSV
... .. :. :... : .:.... :. ::.::::::::.:::: .: .: ::::
CCDS43 EQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSV
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LFFIMLFCLGLSSMFGNMEGVVVPLQDLRVIPPKWPKEVLTGLICLGTFLIGFIFTLNSG
:.:.::. ::..::.:: ....:: : ..: . :::...::.:: . ::..::...:
CCDS43 LYFFMLLMLGIGSMLGNTAAILTPLTDSKIISSHLPKEAISGLVCLVNCAIGMVFTMEAG
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 QYWLSLLDSYAGSIPLLIIAFCEMFSVVYVYGVDRFNKDIEFMIGHKPNIFWQVTWRVVS
.::......::... ::.:.. : ..: ::::. ::..:.. : :. . .:.: : ::
CCDS43 NYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVS
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 PLLMLIIFLFFFVVEV-SQELTYSIWDPGYEEFPKSQKISYPNWVYVVVVIVAGVPSLTI
:::.. .:.:.. . . : :. :: . .. .. :: .. .:. .... .. :
CCDS43 PLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTKD---YPAYALAVIGLLVASSTMCI
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630
pF1KE0 PGYAIYKLIRNHCQKPGDHQGLVSTLSTASMNGDLKY
: :. ... . .. ::
CCDS43 PLAALGTFVQRRLKR-GDADPVA
580 590
>>CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 (727 aa)
initn: 1527 init1: 633 opt: 1519 Z-score: 1815.5 bits: 346.3 E(32554): 8.3e-95
Smith-Waterman score: 1763; 42.4% identity (74.6% similar) in 615 aa overlap (22-621:49-654)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MVRLVLPNPGLDARIPSLAELETIEQE-EASSRPKWDNKAQYMLTCLGFCV
...:.: .: .:: :..: ::.:. .:: :
CCDS30 ESVADLLALEEPVDYKQSVLNVAGEAGGKQKAVEEELDAEDRPAWNSKLQYILAQIGFSV
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GLGNVWRFPYLCQSHGGGAFMIPFLILLVLEGIPLLYLEFAIGQRLRRGSLGVWSSIHPA
::::.::::::::..::::...:.:.::.. ::::..::.:.:::.::::.::: : :
CCDS30 GLGNIWRFPYLCQKNGGGAYLVPYLVLLIIIGIPLFFLELAVGQRIRRGSIGVWHYICPR
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160
pF1KE0 LKGLGLASMLTSFMVGLYYNTIISWIMWYLFNSFQEPLPWSDCPLNENQTGYV--DECAR
: :.:..: .. ..::::::.::.: ..:.:.::: :::::.::. .: . : :: .
CCDS30 LGGIGFSSCIVCLFVGLYYNVIIGWSIFYFFKSFQYPLPWSECPVVRNGSVAVVEAECEK
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SSPVDYFWYRETLNISTSISDSGSIQWWMLLCLACAWSVLYMCTIRGIETTGKAVYITST
:: . ::::::.:.:: :::.::...: : ::: :::.. : ...::...::..:..:
CCDS30 SSATTYFWYREALDISDSISESGGLNWKMTLCLLVAWSIVGMAVVKGIQSSGKVMYFSSL
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LPYVVLTIFLIRGLTLKGATNGIVFLFTPNVTELAQPDTWLDAGAQVFFSFSLAFGGLIS
.:::::. ::.::: :.::..::. .:::.. .. .:..: .:..::::...:.:::.:.
CCDS30 FPYVVLACFLVRGLLLRGAVDGILHMFTPKLDKMLDPQVWREAATQVFFALGLGFGGVIA
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 FSSYNSVHNNCEKDSVIVSIINGFTSVYVAIVVYSVIGFRATQRYDDCFSTN---ILTLI
:::::. :::. :...::.:: :::: ...::..:.::.:. . : : :: .
CCDS30 FSSYNKQDNNCHFDAALVSFINFFTSVLATLVVFAVLGFKANIMNEKCVVENAEKILGYL
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390
pF1KE0 N----GFDL--PEGN---VTQENFVDMQQRCNASDPAAYAQLVFQTCDINAFLSEAVEGT
: . :: :. : .: .....: . . .. : .. : .. :...:.::
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400 410 420 430 440 450
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CCDS30 GLAFIAFTEAMTHFPASPFWSVMFFLMLINLGLGSMIGTMAGITTPIIDTF----KVPKE
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460 470 480 490 500 510
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520 530 540 550 560 570
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.. :.: .: :. :. :::: : .. .. :: : .: . .
CCDS30 ELTEMLGFRPYRFYFYMWKFVSPLCMAVLTTASIIQLGVTPPGYSAW---IKEEAAERYL
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580 590 600 610 620 630
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.:::...... . : .: :: ... : . : . :.. ::
CCDS30 YFPNWAMALLITLIVVATLPIP--VVFVLRHFHLLSDGSNTLSVSYKKGRMMKDISNLEE
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CCDS30 NDETRFILSKVPSEAPSPMPTHRSYLGPGSTSPLETSGNPNGRYGSGYLLASTPESEL
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40 50 60 70 80 90
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...:.:::.:.:::::. :::. :.:.::.:: :::: ...::..:.::.:. . :.
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340 350 360 370 380
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. : :... : : ::..: :.. :. :. . . . : .
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..: :. :..::.:::::::.::::.:..: ::.:::.::.:: :::.::::..::.:
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CCDS90 VTYKRGRVLKEPVNLEGDDTSLIHGKIPSEMPSPNFGKNIYRKQSGSPTLDTAPNGRYGI
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::::. :::. :.:.::.:: :::: ...::..:.::.:. . :.. : :... :
CCDS53 SSYNKRDNNCHFDAVLVSFINFFTSVLATLVVFAVLGFKANVINEKCITQNSETIMK-F-
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: ::..: :.. :. :. . . . : ...: :. :..:
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.:::.: :: : .. : .:
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::: .::.:: ::. ::.....:..:..:: : .:
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CCDS26 WAILFFSMLLMLGIDSQFCTVEGFITALVDEYPRLLRNRRELFIAAVCIISYLIGLSNIT
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CCDS26 SFFTPIIVAGVFIFS-AVQMTP-LTM-----GNYVFPKWGQGV---GWLMALSSMV----
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:::: : ..
CCDS26 --LIPGYMAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDIVRPENGPEQPQAGSSTSKEAYI
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CCDS27 MEKARPLWANSLQFVFACISYAVGLGNVWRFPY
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::: .:::.:..:..:.:..::.::::::.:.:::.:.::.:.: .: : :.:.:.::..
CCDS27 LCQMYGGGSFLVPYIIMLIVEGMPLLYLELAVGQRMRQGSIGAWRTISPYLSGVGVASVV
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.::....:::.: .: .::::.:::.::::: :::: :.::: .:: ..: ..:::::.:
CCDS27 VSFFLSMYYNVINAWAFWYLFHSFQDPLPWSVCPLNGNHTGYDEECEKASSTQYFWYRKT
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:::: :....:..:: ::: :: :.:.: .:: :.:::
CCDS27 LNISPSLQENGGVQWEPALCLLLAWLVVYLCILRGTESTGK-------------------
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. .::.: .:..:..:.:::..:.::.::.:.::: :::.
CCDS27 ------------------IEQLANPKAWINAATQIFFSLGLGFGSLIAFASYNEPSNNCQ
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: ..:::.::.:::....::..:. ::.:: :..:.. : : : ::: .: .: :.
CCDS27 KHAIIVSLINSFTSIFASIVTFSIYGFKATFNYENCLKKVSLLLTNTFDLEDGFLTASNL
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CCDS27 EQVKGYLASAYPSKYSEMFPQIKNCSLESELDTAVQGTGLAFIVYTEAIKNMEVSQLWSV
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.::......::... ::.:.. : ..: ::::. ::..:.. : :. . .:.: : ::
CCDS27 NYWFDIFNDYAATLSLLLIVLVETIAVCYVYGLRRFESDLKAMTGRAVSWYWKVMWAGVS
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:::.. .:.:.. . . : :. :: . .. .. :: .. .:. .... .. :
CCDS27 PLLIVSLFVFYLSDYILTGTLKYQAWDASQGQLVTKD---YPAYALAVIGLLVASSTMCI
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pF1KE0 PGYAIYKLIRNHCQKPGDHQGLVSTLSTASMNGDLKY
: :. ... . .. ::
CCDS27 PLAALGTFVQRRLKR-GDADPVA
540 550
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CCDS42 ARVAEAQARTSQPKQISVLEALTASALNQKPTHEKVQMTEKKESEVLLARPFWSSKTEYI
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CCDS42 LAQVGFSMKPSCLWRFAYLWLNSGGCSFAAIYIFMLFLVGVPLLFLEMAAGQSMRQGGMG
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CCDS42 VWKIIAPWIGGVGYSSFMVCFILGLYFNVVNSWIIFYMSQSFQFPVPWEKCPLTMNSSGF
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