Result of FASTA (omim) for
pF1KE0360
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0360, 659 aa
1>>>pF1KE0360 659 - 659 aa - 659 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8863+/-0.000385; mu= 21.8576+/- 0.024
mean_var=66.1749+/-13.240, 0's: 0 Z-trim(112.3): 54 B-trim: 22 in 1/52
Lambda= 0.157662
statistics sampled from 21098 (21152) to 21098 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 10.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000334 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose cot ( 664) 3222 742.3 1.3e-213
NP_001243243 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose ( 537) 2617 604.6 3e-172
NP_003032 (OMIM: 182381,233100) sodium/glucose cot ( 672) 2483 574.2 5.4e-163
XP_006721135 (OMIM: 182381,233100) PREDICTED: sodi ( 705) 2471 571.5 3.7e-162
XP_011528633 (OMIM: 182380,606824) PREDICTED: sodi ( 432) 2175 504.0 4.7e-142
XP_016878389 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2131 494.1 6.9e-139
XP_005255137 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2131 494.1 6.9e-139
NP_443176 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol cotra ( 675) 2131 494.1 6.9e-139
XP_016878390 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2131 494.1 6.9e-139
XP_016878392 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2131 494.1 6.9e-139
XP_016878391 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 675) 2131 494.1 6.9e-139
XP_016878393 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 662) 2025 470.0 1.2e-131
XP_016878395 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 611) 1957 454.5 5.2e-127
NP_001245342 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 611) 1957 454.5 5.2e-127
NP_008864 (OMIM: 600444) sodium/myo-inositol cotra ( 718) 1933 449.1 2.6e-125
NP_001245341 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 605) 1596 372.4 2.7e-102
XP_006721078 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 576) 1576 367.8 6.1e-101
XP_011544027 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 627) 1576 367.8 6.5e-101
XP_016878394 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 640) 1576 367.9 6.6e-101
NP_001245340 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 640) 1576 367.9 6.6e-101
XP_005255139 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 514) 1561 364.4 6e-100
XP_011544030 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 365) 950 225.3 3.1e-58
XP_016878396 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 583) 830 198.1 7.4e-50
XP_016878397 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 583) 830 198.1 7.4e-50
NP_001245343 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol co ( 519) 656 158.5 5.6e-38
XP_016878398 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo- ( 548) 573 139.7 2.8e-32
XP_011518223 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 413) 307 79.1 3.7e-14
XP_006718219 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 417) 307 79.1 3.7e-14
NP_848593 (OMIM: 612455) sodium-coupled monocarbox ( 618) 307 79.2 5e-14
NP_000444 (OMIM: 274400,601843) sodium/iodide cotr ( 643) 300 77.6 1.6e-13
XP_011526494 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 654) 300 77.6 1.6e-13
XP_006712191 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 277 72.4 5.8e-12
XP_006712193 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 277 72.4 5.8e-12
NP_066918 (OMIM: 604024) sodium-dependent multivit ( 635) 277 72.4 5.8e-12
XP_006712192 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 635) 277 72.4 5.8e-12
NP_068587 (OMIM: 158580,608761,617143) high affini ( 580) 258 68.0 1.1e-10
NP_001291934 (OMIM: 158580,608761,617143) high aff ( 580) 258 68.0 1.1e-10
XP_016874399 (OMIM: 608044) PREDICTED: sodium-coup ( 444) 245 65.0 6.8e-10
NP_666018 (OMIM: 608044) sodium-coupled monocarbox ( 610) 245 65.1 8.7e-10
XP_016882647 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 554) 197 54.1 1.6e-06
XP_011526495 (OMIM: 274400,601843) PREDICTED: sodi ( 565) 197 54.1 1.6e-06
XP_011531448 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 412) 192 52.9 2.7e-06
XP_016860705 (OMIM: 604024) PREDICTED: sodium-depe ( 426) 192 52.9 2.8e-06
XP_006718218 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 507) 176 49.3 4e-05
XP_011518222 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 430) 172 48.4 6.7e-05
XP_016872733 (OMIM: 612455) PREDICTED: sodium-coup ( 430) 172 48.4 6.7e-05
XP_011509882 (OMIM: 158580,608761,617143) PREDICTE ( 496) 157 45.0 0.00079
XP_016860117 (OMIM: 158580,608761,617143) PREDICTE ( 542) 157 45.0 0.00085
NP_001291935 (OMIM: 158580,608761,617143) high aff ( 475) 152 43.9 0.0017
XP_016860118 (OMIM: 158580,608761,617143) PREDICTE ( 475) 152 43.9 0.0017
>>NP_000334 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose cotrans (664 aa)
initn: 3266 init1: 2919 opt: 3222 Z-score: 3955.7 bits: 742.3 E(85289): 1.3e-213
Smith-Waterman score: 3222; 70.4% identity (89.9% similar) in 663 aa overlap (2-659:3-664)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MASTVSPSTIAETPEPPPLSDHIRNAADISVIVIYFLVVMAVGLWAMLKTNRGTIGGFF
.:: ::.: : : .: . ::::::::.:::::.::::::::::..:::::.::::
NP_000 MDSSTWSPKTTAVT-RPVETHELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LAGRDMAWWPMGASLFASNIGSNHYVGLAGTGAASGVATVTFEWTSSVMLLILGWIFVPI
::::.:.:::.:::::::::::.:.:::::::::::.: :::.. :....:::.::::
NP_000 LAGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YIKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLLISADIFAGAIFIKLALGLDLYL
:::.::.::::::.:::::.:.:::::.:::.. . ::::::.:::::.:::::.:::
NP_000 YIKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AIFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFILMGFAFNEVGGYESFTEKYVNA
:::.:::.::.:: :::::.:::::::::.:::.::.:: ::::.:::::..: :::..:
NP_000 AIFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TPSVVEGDNLTISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWPGIIFGMPITALWYWCTNQVIVQ
:..: : :.. .:::::::::::::: .:::.::::.:::: : .::::::.:::::
NP_000 IPTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RCLCGKDMSHVKAACIMCAYLKLLPMFLMVMPGMISRILYTDMVACVVPSECVKHCGVDV
::: .:.:::::..::.:.::::.:::.:::::::::::::. .:::::::: :.::. :
NP_000 RCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKYCGTKV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 GCTNYAYPTMVLELMPQGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTIDLYTKMRKQASE
:::: ::::.:.::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.:.::.:::
NP_000 GCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVRKRASE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 KELLIAGRIFVLLLTVVSIVWVPLVQVSQNGQLIHYTESISSYLGPPIAAVFVLAIFCKR
:::.::::.:.:.: .::.:::.:: .:.:::. : .::.:::::::::::.:::: ::
NP_000 KELMIAGRLFILVLIGISIAWVPIVQSAQSGQLFDYIQSITSYLGPPIAAVFLLAIFWKR
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 VNEQGAFWGLMVGLAMGLIRMITEFAYGTGSCLAPSNCPKIICGVHYLYFSIVLFFGSML
::: ::::::..:: .:. :::::::::::::. ::::: ::::::::::.:.:: :..
NP_000 VNEPGAFWGLILGLLIGISRMITEFAYGTGSCMEPSNCPTIICGVHYLYFAIILFAISFI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VTLGISLLTKPIPDVHLYRLCWVLRNSTEERIDIDAEEKSQEETDDG---VEEDYPEKSR
. . :::::::::::::::::: :::: :::::.::::.. .: .: . :::..
NP_000 TIVVISLLTKPIPDVHLYRLCWSLRNSKEERIDLDAEEENIQEGPKETIEIETQVPEKKK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 GCLKKAYDLFCGL-QKG-PKLTKEEEEALSKKLTDTSERPSWRTIVNINAILLLAVVVFI
: ...:::::::: :.: ::.:.:::.:.. :.:::::.: :::..:.:.:.:..:.::
NP_000 GIFRRAYDLFCGLEQHGAPKMTEEEEKAMKMKMTDTSEKPLWRTVLNVNGIILVTVAVFC
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 HGYYA
:.:.:
NP_000 HAYFA
660
>>NP_001243243 (OMIM: 182380,606824) sodium/glucose cotr (537 aa)
initn: 2686 init1: 2339 opt: 2617 Z-score: 3213.3 bits: 604.6 E(85289): 3e-172
Smith-Waterman score: 2617; 70.4% identity (89.9% similar) in 537 aa overlap (128-659:1-537)
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TVTFEWTSSVMLLILGWIFVPIYIKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLL
:::::.:::::.:.:::::.:::.. .
NP_001 MPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTK
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 ISADIFAGAIFIKLALGLDLYLAIFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFI
::::::.:::::.:::::.::::::.:::.::.:: :::::.:::::::::.:::.::.:
NP_001 ISADIFSGAIFINLALGLNLYLAIFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLI
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LMGFAFNEVGGYESFTEKYVNATPSVVEGDNLTISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWP
: ::::.:::::..: :::..: :..: : :.. .:::::::::::::: .:::.:::
NP_001 LTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKAIPTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWP
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 GIIFGMPITALWYWCTNQVIVQRCLCGKDMSHVKAACIMCAYLKLLPMFLMVMPGMISRI
:.:::: : .::::::.:::::::: .:.:::::..::.:.::::.:::.::::::::::
NP_001 GFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQRCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRI
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 LYTDMVACVVPSECVKHCGVDVGCTNYAYPTMVLELMPQGLRGLMLSVMLASLMSSLTSI
:::. .:::::::: :.::. ::::: ::::.:.::::.:::::::::::::::::::::
NP_001 LYTEKIACVVPSECEKYCGTKVGCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSI
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 FNSASTLFTIDLYTKMRKQASEKELLIAGRIFVLLLTVVSIVWVPLVQVSQNGQLIHYTE
:::::::::.:.:.:.::.::::::.::::.:.:.: .::.:::.:: .:.:::. : .
NP_001 FNSASTLFTMDIYAKVRKRASEKELMIAGRLFILVLIGISIAWVPIVQSAQSGQLFDYIQ
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 SISSYLGPPIAAVFVLAIFCKRVNEQGAFWGLMVGLAMGLIRMITEFAYGTGSCLAPSNC
::.:::::::::::.:::: ::::: ::::::..:: .:. :::::::::::::. ::::
NP_001 SITSYLGPPIAAVFLLAIFWKRVNEPGAFWGLILGLLIGISRMITEFAYGTGSCMEPSNC
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 PKIICGVHYLYFSIVLFFGSMLVTLGISLLTKPIPDVHLYRLCWVLRNSTEERIDIDAEE
: ::::::::::.:.:: :... . :::::::::::::::::: :::: :::::.::::
NP_001 PTIICGVHYLYFAIILFAISFITIVVISLLTKPIPDVHLYRLCWSLRNSKEERIDLDAEE
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 KSQEETDDG---VEEDYPEKSRGCLKKAYDLFCGL-QKG-PKLTKEEEEALSKKLTDTSE
.. .: .: . :::..: ...:::::::: :.: ::.:.:::.:.. :.:::::
NP_001 ENIQEGPKETIEIETQVPEKKKGIFRRAYDLFCGLEQHGAPKMTEEEEKAMKMKMTDTSE
460 470 480 490 500 510
640 650
pF1KE0 RPSWRTIVNINAILLLAVVVFIHGYYA
.: :::..:.:.:.:..:.:: :.:.:
NP_001 KPLWRTVLNVNGIILVTVAVFCHAYFA
520 530
>>NP_003032 (OMIM: 182381,233100) sodium/glucose cotrans (672 aa)
initn: 2666 init1: 1531 opt: 2483 Z-score: 3047.2 bits: 574.2 E(85289): 5.4e-163
Smith-Waterman score: 2641; 56.5% identity (83.4% similar) in 662 aa overlap (14-659:11-672)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MASTVSPSTIAETPEPPPLSDHIRNAADISVIVIYFLVVMAVGLWAMLKTNRGTIGGFFL
:: . : : ::: ::. :::.:..::::.: .:::::.::.::
NP_003 MEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVGGYFL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AGRDMAWWPMGASLFASNIGSNHYVGLAGTGAASGVATVTFEWTSSVMLLILGWIFVPIY
:::.:.:::.:::::::::::.:.:::::::::::.:.. :::.. ..:.:::.:.:.:
NP_003 AGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLFAPVY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 IKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLLISADIFAGAIFIKLALGLDLYLA
. .::.:::.::.:::::.:...:::.::::. . ::.:.:.::.::. ::: ..: .
NP_003 LTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWNIYAS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFILMGFAFNEVGGYESFTEKYVNAT
.. ::..: .::.:::::...::::.::...: :. ::::.::.::::: .. .::..:.
NP_003 VIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKYLGAA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE0 PSVVEGDNLT---ISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWPGIIFGMPITALWYWCTNQVI
:.. ... . ::. :: :: ::.:..: ::::.:::....:. :.. ::::..:::
NP_003 TSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCSDQVI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VQRCLCGKDMSHVKAACIMCAYLKLLPMFLMVMPGMISRILYTDMVACVVPSECVKHCGV
::::: ::...:.::.::.:.:::: :::::::::::::::: : :::::: : . ::.
NP_003 VQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRRVCGT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 DVGCTNYAYPTMVLELMPQGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTIDLYTKMRKQA
.:::.: ::: .:..:::.:::::::.::::.:::::.:::::.:::::.:.::..: .:
NP_003 EVGCSNIAYPRLVVKLMPNGLRGLMLAVMLAALMSSLASIFNSSSTLFTMDIYTRLRPRA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 SEKELLIAGRIFVLLLTVVSIVWVPLVQVSQNGQLIHYTESISSYLGPPIAAVFVLAIFC
...:::..::..:....:::..:.:.::..:.:::. : ...::::.::..::::::.:
NP_003 GDRELLLVGRLWVVFIVVVSVAWLPVVQAAQGGQLFDYIQAVSSYLAPPVSAVFVLALFV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 KRVNEQGAFWGLMVGLAMGLIRMITEFAYGTGSCLAPSNCPKIICGVHYLYFSIVLFFGS
:::::::::::. :: ::: :.: ::..:.:::. :: :: ..::::::::.::::: :
NP_003 PRVNEQGAFWGLIGGLLMGLARLIPEFSFGSGSCVQPSACPAFLCGVHYLYFAIVLFFCS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 MLVTLGISLLTKPIPDVHLYRLCWVLRNSTEERIDIDAEEK--SQEETDDG-----VEED
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NP_003 GLLTLTVSLCTAPIPRKHLHRLVFSLRHSKEEREDLDADEQQGSSLPVQNGCPESAMEMN
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KE0 YPEKSRGCL-KKAYDLFCGLQKG-----PKLTKEEEEALSKKLTDTSERPSWRTIVNINA
:. : .. :::...: : ::.:: : ...: : :: ::: .::.::
NP_003 EPQAPAPSLFRQCLLWFCGMSRGGVGSPPPLTQEEAAAAARRLEDISEDPSWARVVNLNA
600 610 620 630 640 650
650
pF1KE0 ILLLAVVVFIHGYYA
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NP_003 LLMMAVAVFLWGFYA
660 670
>>XP_006721135 (OMIM: 182381,233100) PREDICTED: sodium/g (705 aa)
initn: 2638 init1: 1531 opt: 2471 Z-score: 3032.2 bits: 571.5 E(85289): 3.7e-162
Smith-Waterman score: 2563; 54.5% identity (80.5% similar) in 681 aa overlap (14-652:18-698)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MASTVSPSTIAETPEPPPLSDHIRNAADISVIVIYFLVVMAVGLWAMLKTNRGTIG
:: . : : ::: ::. :::.:..::::.: .:::::.:
XP_006 MGQILGRMEEHTEAGSAPEMGAQKALIDNPADILVIAAYFLLVIGVGLWSMCRTNRGTVG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GFFLAGRDMAWWPMGASLFASNIGSNHYVGLAGTGAASGVATVTFEWTSSVMLLILGWIF
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XP_006 GYFLAGRSMVWWPVGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGLAVAGFEWNALFVVLLLGWLF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VPIYIKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLLISADIFAGAIFIKLALGLD
.:.:. .::.:::.::.:::::.:...:::.::::. . ::.:.:.::.::. ::: .
XP_006 APVYLTAGVITMPQYLRKRFGGRRIRLYLSVLSLFLYIFTKISVDMFSGAVFIQQALGWN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LYLAIFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFILMGFAFNEVGGYESFTEKY
.: ... ::..: .::.:::::...::::.::...: :. ::::.::.::::: .. .::
XP_006 IYASVIALLGITMIYTVTGGLAALMYTDTVQTFVILGGACILMGYAFHEVGGYSGLFDKY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 VNATPSVVEGDNLT---ISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWPGIIFGMPITALWYWCT
..:. :.. ... . ::. :: :: ::.:..: ::::.:::....:. :.. ::::.
XP_006 LGAATSLTVSEDPAVGNISSFCYRPRPDSYHLLRHPVTGDLPWPALLLGLTIVSGWYWCS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 NQVIVQRCLCGKDMSHVKAACIMCAYLKLLPMFLMVMPGMISRILYTDMVACVVPSECVK
.:::::::: ::...:.::.::.:.:::: :::::::::::::::: : :::::: : .
XP_006 DQVIVQRCLAGKSLTHIKAGCILCGYLKLTPMFLMVMPGMISRILYPDEVACVVPEVCRR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 HCGVDVGCTNYAYPTMVLELMPQGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTIDLYTKM
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XP_006 VCGTEVGCSNIAYPRLVVKLMPNGLRGLMLAVMLAALMSSLASIFNSSSTLFTMDIYTRL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 RKQASEKELLIAGRIFVLLLTVVSIVWVPLVQVSQNGQLIHYTESISSYLGPPIAAVFVL
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XP_006 RPRAGDRELLLVGRLWVVFIVVVSVAWLPVVQAAQGGQLFDYIQAVSSYLAPPVSAVFVL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 AIFCKRVNEQGAFWGLMVGLAMGLIRMITEFAYGTGSCLAPSNCPKIICGVHYLYFSIVL
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XP_006 ALFVPRVNEQGAFWGLIGGLLMGLARLIPEFSFGSGSCVQPSACPAFLCGVHYLYFAIVL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KE0 FFGSMLVTLGISLLTKPIPDVHLYRLCWVLRNSTEERIDIDAEEK-------------SQ
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XP_006 FFCSGLLTLTVSLCTAPIPRKHLHRLVFSLRHSKEEREDLDADEQQGSSLPVQNGCPESA
550 560 570 580 590 600
590 600 610
pF1KE0 EETDD-------GVEE----------DYPEKSRG----CLKKAYDLFCGLQKG-----PK
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XP_006 MEMNGRAPCWEVGLEELSSRKLTAGPQFPSEPQAPAPSLFRQCLLWFCGMSRGGVGSPPP
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650
pF1KE0 LTKEEEEALSKKLTDTSERPSWRTIVNINAILLLAVVVFIHGYYA
::.:: : ...: : :: ::: .::.::.:..::.:
XP_006 LTQEEAAAAARRLEDISEDPSWARVVNLNALLMMAVAVFLWGFYA
670 680 690 700
>>XP_011528633 (OMIM: 182380,606824) PREDICTED: sodium/g (432 aa)
initn: 2150 init1: 2150 opt: 2175 Z-score: 2671.3 bits: 504.0 E(85289): 4.7e-142
Smith-Waterman score: 2175; 73.9% identity (92.0% similar) in 426 aa overlap (2-427:3-427)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MASTVSPSTIAETPEPPPLSDHIRNAADISVIVIYFLVVMAVGLWAMLKTNRGTIGGFF
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XP_011 MDSSTWSPKTTAVT-RPVETHELIRNAADISIIVIYFVVVMAVGLWAMFSTNRGTVGGFF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LAGRDMAWWPMGASLFASNIGSNHYVGLAGTGAASGVATVTFEWTSSVMLLILGWIFVPI
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XP_011 LAGRSMVWWPIGASLFASNIGSGHFVGLAGTGAASGIAIGGFEWNALVLVVVLGWLFVPI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YIKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLLISADIFAGAIFIKLALGLDLYL
:::.::.::::::.:::::.:.:::::.:::.. . ::::::.:::::.:::::.:::
XP_011 YIKAGVVTMPEYLRKRFGGQRIQVYLSLLSLLLYIFTKISADIFSGAIFINLALGLNLYL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 AIFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFILMGFAFNEVGGYESFTEKYVNA
:::.:::.::.:: :::::.:::::::::.:::.::.:: ::::.:::::..: :::..:
XP_011 AIFLLLAITALYTITGGLAAVIYTDTLQTVIMLVGSLILTGFAFHEVGGYDAFMEKYMKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TPSVVEGDNLTISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWPGIIFGMPITALWYWCTNQVIVQ
:..: : :.. .:::::::::::::: .:::.::::.:::: : .::::::.:::::
XP_011 IPTIVSDGNTTFQEKCYTPRADSFHIFRDPLTGDLPWPGFIFGMSILTLWYWCTDQVIVQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RCLCGKDMSHVKAACIMCAYLKLLPMFLMVMPGMISRILYTDMVACVVPSECVKHCGVDV
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XP_011 RCLSAKNMSHVKGGCILCGYLKLMPMFIMVMPGMISRILYTEKIACVVPSECEKYCGTKV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 GCTNYAYPTMVLELMPQGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTIDLYTKMRKQASE
:::: ::::.:.::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.:.::.:::
XP_011 GCTNIAYPTLVVELMPNGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTMDIYAKVRKRASE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 KELLIAGRIFVLLLTVVSIVWVPLVQVSQNGQLIHYTESISSYLGPPIAAVFVLAIFCKR
:::.::::
XP_011 KELMIAGREPFGD
420 430
>>XP_016878389 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo-inos (675 aa)
initn: 2089 init1: 1229 opt: 2131 Z-score: 2614.5 bits: 494.1 E(85289): 6.9e-139
Smith-Waterman score: 2185; 49.2% identity (75.6% similar) in 677 aa overlap (13-659:7-675)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MASTVSPSTIAETPEPP---PLSDHIRNA---ADISVIVIYFLVVMAVGLWAMLKTNRGT
.:.:: ::. ... .::.:.:.::: :.:::::. .::.: :
XP_016 MESGTSSPQPPQLDPLDAFPQKGLEPGDIAVLVLYFLFVLAVGLWSTVKTKRDT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 IGGFFLAGRDMAWWPMGASLFASNIGSNHYVGLAGTGAASGVATVTFEWTSSVMLLILGW
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XP_016 VKGYFLAGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IFVPIYIKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLLISADIFAGAIFIKLALG
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XP_016 IFLPIYIAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LDLYLAIFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFILMGFAFNEVGGYESFTE
::::::: :::.:::::..::::.:::::.:::.:::::.. :::..: :::.:.. :
XP_016 LDLYLAIVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KYVNATPSVVEGDNLTISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWPGIIFGMPITALWYWCTN
:: : : : . ..:: :: :.:::::: .:.:.::::..::: : .::::::.
XP_016 KYFLALAS-----NRSENSSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTD
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 QVIVQRCLCGKDMSHVKAACIMCAYLKLLPMFLMVMPGMISRILYTDMVACVVPSECVKH
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XP_016 QVIVQRTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 CGVDVGCTNYAYPTMVLELMPQGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTIDLYTKMR
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XP_016 CSNPSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 KQASEKELLIAGRIFVLLLTVVSIVWVPLVQVSQNGQLIHYTESISSYLGPPIAAVFVLA
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XP_016 PRASEKELMIVGRVFVLLLVLVSILWIPVVQASQGGQLFIYIQSISSYLQPPVAVVFIMG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 IFCKRVNEQGAFWGLMVGLAMGLIRMITEFAYGTGSCLAPSNCPKIICGVHYLYFSIVLF
: ::.::.::::::. :: .::.:.. .: : : :.. : .. ..::::::..:
XP_016 CFWKRTNEKGAFWGLISGLLLGLVRLVLDFIYVQPRCDQPDERPVLVKSIHYLYFSMILS
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KE0 FGSMLVTLGISLLTKPIPDVHLYRLCWVLRNS--TEERIDIDAEEKSQEETDDGVEE---
..... .: .:.: . .: : :.. .... : : ...:. :
XP_016 TVTLITVSTVSWFTEPPSKEMVSHLTWFTRHDPVVQKEQAPPAAPLSLTLSQNGMPEASS
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630
pF1KE0 ----------DYPEKSRGC--------LKKAYDLFCGLQ-KGPKLTKEEEEALSKKLTDT
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XP_016 SSSVQFEMVQENTSKTHSCDMTPKQSKVVKAILWLCGIQEKGKEELPARAEAI---IVSL
590 600 610 620 630 640
640 650
pF1KE0 SERPSWRTIVNINAILLLAVVVFIHGYYA
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XP_016 EENPLVKTLLDVNLIFCVSCAIFIWGYFA
650 660 670
>>XP_005255137 (OMIM: 610238) PREDICTED: sodium/myo-inos (675 aa)
initn: 2089 init1: 1229 opt: 2131 Z-score: 2614.5 bits: 494.1 E(85289): 6.9e-139
Smith-Waterman score: 2185; 49.2% identity (75.6% similar) in 677 aa overlap (13-659:7-675)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MASTVSPSTIAETPEPP---PLSDHIRNA---ADISVIVIYFLVVMAVGLWAMLKTNRGT
.:.:: ::. ... .::.:.:.::: :.:::::. .::.: :
XP_005 MESGTSSPQPPQLDPLDAFPQKGLEPGDIAVLVLYFLFVLAVGLWSTVKTKRDT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 IGGFFLAGRDMAWWPMGASLFASNIGSNHYVGLAGTGAASGVATVTFEWTSSVMLLILGW
. :.:::: ::.:::.::::::::.::.:..::::.:::.:... ..: .. .:.:.:
XP_005 VKGYFLAGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IFVPIYIKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLLISADIFAGAIFIKLALG
::.:::: . : ::::::.::::: :. . :..: ::: . ::.:..::::::. .:
XP_005 IFLPIYIAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LDLYLAIFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFILMGFAFNEVGGYESFTE
::::::: :::.:::::..::::.:::::.:::.:::::.. :::..: :::.:.. :
XP_005 LDLYLAIVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KYVNATPSVVEGDNLTISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWPGIIFGMPITALWYWCTN
:: : : : . ..:: :: :.:::::: .:.:.::::..::: : .::::::.
XP_005 KYFLALAS-----NRSENSSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTD
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 QVIVQRCLCGKDMSHVKAACIMCAYLKLLPMFLMVMPGMISRILYTDMVACVVPSECVKH
:::::: : .:..::.:.. .: ::::.::.:.::.:::.::::. :.:::. : : :
XP_005 QVIVQRTLAAKNLSHAKGGALMAAYLKVLPLFIMVFPGMVSRILFPDQVACADPEICQKI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 CGVDVGCTNYAYPTMVLELMPQGLRGLMLSVMLASLMSSLTSIFNSASTLFTIDLYTKMR
:. ::.. ::: .::::.: ::::::..::.:.::::::::::::::.::.::....:
XP_005 CSNPSGCSDIAYPKLVLELLPTGLRGLMMAVMVAALMSSLTSIFNSASTIFTMDLWNHLR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 KQASEKELLIAGRIFVLLLTVVSIVWVPLVQVSQNGQLIHYTESISSYLGPPIAAVFVLA
.::::::.:.::.:::::..:::.:.:.::.::.:::. : .:::::: ::.:.::...
XP_005 PRASEKELMIVGRVFVLLLVLVSILWIPVVQASQGGQLFIYIQSISSYLQPPVAVVFIMG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 IFCKRVNEQGAFWGLMVGLAMGLIRMITEFAYGTGSCLAPSNCPKIICGVHYLYFSIVLF
: ::.::.::::::. :: .::.:.. .: : : :.. : .. ..::::::..:
XP_005 CFWKRTNEKGAFWGLISGLLLGLVRLVLDFIYVQPRCDQPDERPVLVKSIHYLYFSMILS
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KE0 FGSMLVTLGISLLTKPIPDVHLYRLCWVLRNS--TEERIDIDAEEKSQEETDDGVEE---
..... .: .:.: . .: : :.. .... : : ...:. :
XP_005 TVTLITVSTVSWFTEPPSKEMVSHLTWFTRHDPVVQKEQAPPAAPLSLTLSQNGMPEASS
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630
pF1KE0 ----------DYPEKSRGC--------LKKAYDLFCGLQ-KGPKLTKEEEEALSKKLTDT
. :...: . :: .::.: :: . . ::. ...
XP_005 SSSVQFEMVQENTSKTHSCDMTPKQSKVVKAILWLCGIQEKGKEELPARAEAI---IVSL
590 600 610 620 630 640
640 650
pF1KE0 SERPSWRTIVNINAILLLAVVVFIHGYYA
: : .:....: :. .. ..:: ::.:
XP_005 EENPLVKTLLDVNLIFCVSCAIFIWGYFA
650 660 670
>>NP_443176 (OMIM: 610238) sodium/myo-inositol cotranspo (675 aa)
initn: 2089 init1: 1229 opt: 2131 Z-score: 2614.5 bits: 494.1 E(85289): 6.9e-139
Smith-Waterman score: 2185; 49.2% identity (75.6% similar) in 677 aa overlap (13-659:7-675)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MASTVSPSTIAETPEPP---PLSDHIRNA---ADISVIVIYFLVVMAVGLWAMLKTNRGT
.:.:: ::. ... .::.:.:.::: :.:::::. .::.: :
NP_443 MESGTSSPQPPQLDPLDAFPQKGLEPGDIAVLVLYFLFVLAVGLWSTVKTKRDT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 IGGFFLAGRDMAWWPMGASLFASNIGSNHYVGLAGTGAASGVATVTFEWTSSVMLLILGW
. :.:::: ::.:::.::::::::.::.:..::::.:::.:... ..: .. .:.:.:
NP_443 VKGYFLAGGDMVWWPVGASLFASNVGSGHFIGLAGSGAATGISVSAYELNGLFSVLMLAW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 IFVPIYIKSGVMTMPEYLKKRFGGERLQVYLSILSLFICVVLLISADIFAGAIFIKLALG
::.:::: . : ::::::.::::: :. . :..: ::: . ::.:..::::::. .:
NP_443 IFLPIYIAGQVTTMPEYLRKRFGGIRIPIILAVLYLFIYIFTKISVDMYAGAIFIQQSLH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LDLYLAIFILLAMTAVYTTTGGLASVIYTDTLQTIIMLIGSFILMGFAFNEVGGYESFTE
::::::: :::.:::::..::::.:::::.:::.:::::.. :::..: :::.:.. :
NP_443 LDLYLAIVGLLAITAVYTVAGGLAAVIYTDALQTLIMLIGALTLMGYSFAAVGGMEGLKE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KYVNATPSVVEGDNLTISASCYTPRADSFHIFRDAVTGDIPWPGIIFGMPITALWYWCTN
:: : : : . ..:: :: :.:::::: .:.:.::::..::: : .::::::.
NP_443 KYFLALAS-----NRSENSSCGLPREDAFHIFRDPLTSDLPWPGVLFGMSIPSLWYWCTD
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NP_443 EENPLVKTLLDVNLIFCVSCAIFIWGYFA
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XP_016 EENPLVKTLLDVNLIFCVSCAIFIWGYFA
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300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 KQASEKELLIAGRIFVLLLTVVSIVWVPLVQVSQNGQLIHYTESISSYLGPPIAAVFVLA
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XP_016 PRASEKELMIVGRVFVLLLVLVSILWIPVVQASQGGQLFIYIQSISSYLQPPVAVVFIMG
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pF1KE0 FGSMLVTLGISLLTKPIPDVHLYRLCWVLRNS--TEERIDIDAEEKSQEETDDGVEE---
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530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630
pF1KE0 ----------DYPEKSRGC--------LKKAYDLFCGLQ-KGPKLTKEEEEALSKKLTDT
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XP_016 SSSVQFEMVQENTSKTHSCDMTPKQSKVVKAILWLCGIQEKGKEELPARAEAI---IVSL
590 600 610 620 630 640
640 650
pF1KE0 SERPSWRTIVNINAILLLAVVVFIHGYYA
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XP_016 EENPLVKTLLDVNLIFCVSCAIFIWGYFA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]