Result of FASTA (omim) for
pF1KE0358
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0358, 754 aa
1>>>pF1KE0358 754 - 754 aa - 754 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4891+/-0.000627; mu= 15.6155+/- 0.038
mean_var=180.8963+/-33.990, 0's: 0 Z-trim(111.0): 262 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.095358
statistics sampled from 19166 (19461) to 19166 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 11.010
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003808 (OMIM: 607310) disintegrin and metallopr ( 754) 5309 744.4 4e-214
XP_016869432 (OMIM: 607310) PREDICTED: disintegrin ( 755) 5309 744.4 4e-214
XP_005273439 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 621) 1663 242.7 3.5e-63
XP_011542671 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 673) 1663 242.7 3.7e-63
XP_006716337 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 728) 1663 242.8 3.8e-63
XP_011542670 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 728) 1663 242.8 3.8e-63
XP_016868464 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 732) 1663 242.8 3.9e-63
XP_005273437 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 736) 1663 242.8 3.9e-63
XP_016868463 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 741) 1663 242.8 3.9e-63
XP_011542669 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 746) 1663 242.8 3.9e-63
NP_001291280 (OMIM: 606188) disintegrin and metall ( 754) 1663 242.8 3.9e-63
XP_006716336 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 767) 1663 242.8 4e-63
NP_055080 (OMIM: 606188) disintegrin and metallopr ( 775) 1663 242.8 4e-63
XP_016868465 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 715) 1598 233.8 1.9e-60
NP_068547 (OMIM: 606188) disintegrin and metallopr ( 540) 1513 222.0 5.2e-57
NP_150377 (OMIM: 603640) disintegrin and metallopr ( 918) 1379 203.8 2.6e-51
XP_005266060 (OMIM: 603640) PREDICTED: disintegrin ( 955) 1379 203.9 2.6e-51
XP_011542984 (OMIM: 602713,612775) PREDICTED: disi ( 801) 1326 196.5 3.7e-49
NP_003807 (OMIM: 602713,612775) disintegrin and me ( 819) 1326 196.5 3.7e-49
XP_016869431 (OMIM: 602713,612775) PREDICTED: disi ( 821) 1326 196.5 3.7e-49
NP_001269376 (OMIM: 607114) disintegrin and metall ( 812) 1257 187.0 2.7e-46
NP_079496 (OMIM: 607114) disintegrin and metallopr ( 813) 1257 187.0 2.7e-46
XP_011527669 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 812) 1247 185.6 7e-46
XP_011542672 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin ( 542) 1232 183.3 2.3e-45
NP_001275904 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 735) 1224 182.4 5.9e-45
NP_001275903 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 737) 1224 182.4 5.9e-45
NP_067673 (OMIM: 602714) disintegrin and metallopr ( 738) 1224 182.4 5.9e-45
XP_016872194 (OMIM: 602714) PREDICTED: disintegrin ( 753) 1224 182.4 6e-45
NP_001275902 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 906) 1224 182.5 6.7e-45
NP_003465 (OMIM: 602714) disintegrin and metallopr ( 909) 1224 182.5 6.7e-45
XP_011527668 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 825) 1206 180.0 3.5e-44
XP_006723702 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 825) 1206 180.0 3.5e-44
XP_005260900 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 826) 1206 180.0 3.5e-44
NP_001124175 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
XP_011529859 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
XP_011529858 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
XP_011529862 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
NP_001265054 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
NP_001124176 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
NP_001265055 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
NP_055084 (OMIM: 604778) disintegrin and metallopr ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
XP_011529863 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
NP_001124177 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
NP_001265056 (OMIM: 604778) disintegrin and metall ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
XP_011529861 (OMIM: 604778) PREDICTED: disintegrin ( 820) 1205 179.8 3.8e-44
NP_694882 (OMIM: 607114) disintegrin and metallopr ( 787) 1200 179.1 6e-44
XP_006723703 (OMIM: 607114) PREDICTED: disintegrin ( 823) 1195 178.5 1e-43
NP_001157961 (OMIM: 602267) disintegrin and metall ( 742) 1179 176.2 4.3e-43
NP_001100 (OMIM: 602267) disintegrin and metallopr ( 824) 1177 176.0 5.6e-43
NP_003804 (OMIM: 603713) disintegrin and metallopr ( 722) 1174 175.5 6.8e-43
>>NP_003808 (OMIM: 607310) disintegrin and metalloprotei (754 aa)
initn: 5309 init1: 5309 opt: 5309 Z-score: 3965.2 bits: 744.4 E(85289): 4e-214
Smith-Waterman score: 5309; 100.0% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLPGCIFLMILLIPQVKEKFILGVEGQQLVRPKKLPLIQKRDTGHTHDDDILKTYEEELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MLPGCIFLMILLIPQVKEKFILGVEGQQLVRPKKLPLIQKRDTGHTHDDDILKTYEEELL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YEIKLNRKTLVLHLLRSREFLGSNYSETFYSMKGEAFTRHPQIMDHCFYQGSIVHEYDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YEIKLNRKTLVLHLLRSREFLGSNYSETFYSMKGEAFTRHPQIMDHCFYQGSIVHEYDSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ASISTCNGLRGFFRINDQRYLIEPVKYSDEGEHLVFKYNLRVPYGANYSCTELNFTRKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ASISTCNGLRGFFRINDQRYLIEPVKYSDEGEHLVFKYNLRVPYGANYSCTELNFTRKTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PGDNESEEDSKIKGIHDEKYVELFIVADDTVYRRNGHPHNKLRNRIWGMVNFVNMIYKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PGDNESEEDSKIKGIHDEKYVELFIVADDTVYRRNGHPHNKLRNRIWGMVNFVNMIYKTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NIHVTLVGIEIWTHEDKIELYSNIETTLLRFSFWQEKILKTRKDFDHVVLLSGKWLYSHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NIHVTLVGIEIWTHEDKIELYSNIETTLLRFSFWQEKILKTRKDFDHVVLLSGKWLYSHV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QGISYPGGMCLPYYSTSIIKDLLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFPCTCPSGKCVMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QGISYPGGMCLPYYSTSIIKDLLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFPCTCPSGKCVMD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SDGSIPALKFSKCSQNQYHQYLKDYKPTCMLNIPFPYNFHDFQFCGNKKLDEGEECDCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SDGSIPALKFSKCSQNQYHQYLKDYKPTCMLNIPFPYNFHDFQFCGNKKLDEGEECDCGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 AQECTNPCCDAHTCVLKPGFTCAEGECCESCQIKKAGSICRPAKDECDFPEMCTGHSPAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AQECTNPCCDAHTCVLKPGFTCAEGECCESCQIKKAGSICRPAKDECDFPEMCTGHSPAC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 PKDQFRVNGFPCKNSEGYCFMGKCPTREDQCSELFDDEAIESHDICYKMNTKGNKFGYCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PKDQFRVNGFPCKNSEGYCFMGKCPTREDQCSELFDDEAIESHDICYKMNTKGNKFGYCK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 NKENRFLPCEEKDVRCGKIYCTGGELSSLLGEDKTYHLKDPQKNATVKCKTIFLYHDSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NKENRFLPCEEKDVRCGKIYCTGGELSSLLGEDKTYHLKDPQKNATVKCKTIFLYHDSTD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 IGLVASGTKCGEGMVCNNGECLNMEKVYISTNCPSQCNENPVDGHGLQCHCEEGQAPVAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IGLVASGTKCGEGMVCNNGECLNMEKVYISTNCPSQCNENPVDGHGLQCHCEEGQAPVAC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 EETLHVTNITILVVVLVLVIVGIGVLILLVRYRKCIKLKQVQSPPTETLGVENKGYFGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EETLHVTNITILVVVLVLVIVGIGVLILLVRYRKCIKLKQVQSPPTETLGVENKGYFGDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE0 QQIRTEPILPEIHFLNKPASKDSRGIADPNQSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QQIRTEPILPEIHFLNKPASKDSRGIADPNQSAK
730 740 750
>>XP_016869432 (OMIM: 607310) PREDICTED: disintegrin and (755 aa)
initn: 5309 init1: 5309 opt: 5309 Z-score: 3965.2 bits: 744.4 E(85289): 4e-214
Smith-Waterman score: 5309; 100.0% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLPGCIFLMILLIPQVKEKFILGVEGQQLVRPKKLPLIQKRDTGHTHDDDILKTYEEELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLPGCIFLMILLIPQVKEKFILGVEGQQLVRPKKLPLIQKRDTGHTHDDDILKTYEEELL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YEIKLNRKTLVLHLLRSREFLGSNYSETFYSMKGEAFTRHPQIMDHCFYQGSIVHEYDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YEIKLNRKTLVLHLLRSREFLGSNYSETFYSMKGEAFTRHPQIMDHCFYQGSIVHEYDSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ASISTCNGLRGFFRINDQRYLIEPVKYSDEGEHLVFKYNLRVPYGANYSCTELNFTRKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASISTCNGLRGFFRINDQRYLIEPVKYSDEGEHLVFKYNLRVPYGANYSCTELNFTRKTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PGDNESEEDSKIKGIHDEKYVELFIVADDTVYRRNGHPHNKLRNRIWGMVNFVNMIYKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGDNESEEDSKIKGIHDEKYVELFIVADDTVYRRNGHPHNKLRNRIWGMVNFVNMIYKTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NIHVTLVGIEIWTHEDKIELYSNIETTLLRFSFWQEKILKTRKDFDHVVLLSGKWLYSHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NIHVTLVGIEIWTHEDKIELYSNIETTLLRFSFWQEKILKTRKDFDHVVLLSGKWLYSHV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QGISYPGGMCLPYYSTSIIKDLLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFPCTCPSGKCVMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QGISYPGGMCLPYYSTSIIKDLLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFPCTCPSGKCVMD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SDGSIPALKFSKCSQNQYHQYLKDYKPTCMLNIPFPYNFHDFQFCGNKKLDEGEECDCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDGSIPALKFSKCSQNQYHQYLKDYKPTCMLNIPFPYNFHDFQFCGNKKLDEGEECDCGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 AQECTNPCCDAHTCVLKPGFTCAEGECCESCQIKKAGSICRPAKDECDFPEMCTGHSPAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AQECTNPCCDAHTCVLKPGFTCAEGECCESCQIKKAGSICRPAKDECDFPEMCTGHSPAC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 PKDQFRVNGFPCKNSEGYCFMGKCPTREDQCSELFDDEAIESHDICYKMNTKGNKFGYCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDQFRVNGFPCKNSEGYCFMGKCPTREDQCSELFDDEAIESHDICYKMNTKGNKFGYCK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 NKENRFLPCEEKDVRCGKIYCTGGELSSLLGEDKTYHLKDPQKNATVKCKTIFLYHDSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NKENRFLPCEEKDVRCGKIYCTGGELSSLLGEDKTYHLKDPQKNATVKCKTIFLYHDSTD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 IGLVASGTKCGEGMVCNNGECLNMEKVYISTNCPSQCNENPVDGHGLQCHCEEGQAPVAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IGLVASGTKCGEGMVCNNGECLNMEKVYISTNCPSQCNENPVDGHGLQCHCEEGQAPVAC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 EETLHVTNITILVVVLVLVIVGIGVLILLVRYRKCIKLKQVQSPPTETLGVENKGYFGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETLHVTNITILVVVLVLVIVGIGVLILLVRYRKCIKLKQVQSPPTETLGVENKGYFGDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE0 QQIRTEPILPEIHFLNKPASKDSRGIADPNQSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QQIRTEPILPEIHFLNKPASKDSRGIADPNQSAKW
730 740 750
>>XP_005273439 (OMIM: 606188) PREDICTED: disintegrin and (621 aa)
initn: 1488 init1: 1085 opt: 1663 Z-score: 1255.3 bits: 242.7 E(85289): 3.5e-63
Smith-Waterman score: 1711; 41.2% identity (67.8% similar) in 628 aa overlap (1-612:1-608)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLPGCIFLMILLIPQVKE-KFILGVEGQQLVRPKKLPLIQKRDTGHTHDDDILKTYEEEL
:: : . . .:: :. : . ::. ..: : .: ..::.. .. . . .: ::
XP_005 MLQGLLPVSLLLSVAVSAIKELPGVKKYEVVYPIRLHPLHKREA---KEPEQQEQFETEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LYEIKLNRKTLVLHLLRSREFLGSNYSETFYSMKGEAFTRHPQIMDHCFYQGSIVHEYDS
:.. .: : ::.: .....:. .:.::.:. :. .: ::::: :.::: :..: :
XP_005 KYKMTINGKIAVLYLKKNKNLLAPGYTETYYNSTGKEITTSPQIMDDCYYQGHILNEKVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AASISTCNGLRGFFRINDQRYLIEPVK--YSDEGEHLVFKYNLRVPYGANY--SCTELNF
:::::: ::::.: .::::.:::.. . : :: .:::: : :: .: .
XP_005 DASISTCRGLRGYFSQGDQRYFIEPLSPIHRDGQEHALFKYN---PDEKNYDSTCGMDGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE0 TRKTVPGDNESEEDSKIKGIHD------EKYVELFIVADDTVYRRNGHPHNKLRNRIWGM
.: . .:. ..: :::.: ..: :. ..: .. ....:.:.. :
XP_005 LWAHDLQQNIALPATKLVKLKDRKVQEHEKYIEYYLVLDNGEFKRYNENQDEIRKRVFEM
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 VNFVNMIYKTLNIHVTLVGIEIWTHEDKIELYSNIETTLLRFSFWQEKILKTRKDFDHVV
.:.:::.:: :: ::.:::.:::: .:::.. : :: :: :. ..:. :: : .
XP_005 ANYVNMLYKKLNTHVALVGMEIWTDKDKIKITPNASFTLENFSKWRGSVLSRRKRHDIAQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LLSGKWLYSHVQGISYPGGMCLPYYSTSIIKDLLPDTNIIANRMAHQLGHNLGMQHDEFP
:... : . . :... . :: :: :.....: . .:. :::..:::.:: ::..
XP_005 LITATELAGTTVGLAFMSTMCSPY-SVGVVQDHSDNLLRVAGTMAHEMGHNFGMFHDDYS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 CTCPSGKCVMDSDGS--IPALKFSKCSQNQYHQYLKDYKPTCMLNIPFPYNFHDFQFCGN
: ::: ::::. : ::. ::.::. .: ....: .:..: :.: .. . .:::
XP_005 CKCPSTICVMDKALSFYIPT-DFSSCSRLSYDKFFEDKLSNCLFNAPLPTDIISTPICGN
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 KKLDEGEECDCGPAQECTNPCCDAHTCVLKPGFTCAEGECCESCQIKKAGSICRPAKDEC
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XP_005 QLVEMGEDCDCGTSEECTNICCDAKTCKIKATFQCALGECCEKCQFKKAGMVCRPAKDEC
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XP_011 PLSTTGTRPHKQKRKPQMMSQ--MKPHVYDLPVEGNEPPASFDSNPKA
710 720 730 740
754 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 14:15:45 2016 done: Thu Nov 3 14:15:47 2016
Total Scan time: 11.010 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]