Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0350
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0350, 747 aa
1>>>pF1KE0350 747 - 747 aa - 747 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2427+/-0.00119; mu= 20.4567+/- 0.071
mean_var=68.2835+/-13.614, 0's: 0 Z-trim(101.5): 30 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.155209
statistics sampled from 6527 (6543) to 6527 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS876.2 AMPD1 gene_id:270|Hs108|chr1 ( 780) 5045 1139.6 0
CCDS53349.1 AMPD1 gene_id:270|Hs108|chr1 ( 776) 4999 1129.3 0
CCDS41617.1 AMPD3 gene_id:272|Hs108|chr11 ( 767) 2991 679.6 4.8e-195
CCDS44537.1 AMPD3 gene_id:272|Hs108|chr11 ( 774) 2991 679.6 4.8e-195
CCDS7802.1 AMPD3 gene_id:272|Hs108|chr11 ( 776) 2991 679.6 4.8e-195
CCDS53601.1 AMPD3 gene_id:272|Hs108|chr11 ( 608) 2855 649.1 5.8e-186
CCDS30796.1 AMPD2 gene_id:271|Hs108|chr1 ( 760) 2331 531.8 1.5e-150
CCDS58016.1 AMPD2 gene_id:271|Hs108|chr1 ( 761) 2331 531.9 1.5e-150
CCDS804.1 AMPD2 gene_id:271|Hs108|chr1 ( 798) 2331 531.9 1.5e-150
CCDS76186.1 AMPD2 gene_id:271|Hs108|chr1 ( 804) 2331 531.9 1.5e-150
CCDS805.1 AMPD2 gene_id:271|Hs108|chr1 ( 879) 2331 531.9 1.6e-150
>>CCDS876.2 AMPD1 gene_id:270|Hs108|chr1 (780 aa)
initn: 5045 init1: 5045 opt: 5045 Z-score: 6100.8 bits: 1139.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5045; 100.0% identity (100.0% similar) in 747 aa overlap (1-747:34-780)
10 20 30
pF1KE0 MPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 RIFYSVSQSPHSLLSLLFYCAILESRISATMPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 DEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFHLETLSTSTEARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFHLETLSTSTEARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TSSTKLSHIDEYISSSPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TSSTKLSHIDEYISSSPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKY
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 MQKSFQRFPKTPSKYLRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MQKSFQRFPKTPSKYLRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KDGVVYVYPNEAAVSKDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 KDGVVYVYPNEAAVSKDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 FQVHQMLNEMDELKELKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FQVHQMLNEMDELKELKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRV
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 VYSTKEKNLTLKELFAKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VYSTKEKNLTLKELFAKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 YLKTDNYINGEYFATIIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 YLKTDNYINGEYFATIIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHC
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 PNMTWMIQVPRIYDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 PNMTWMIQVPRIYDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFD
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SVDDESKHSGHMFSSKSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SVDDESKHSGHMFSSKSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFR
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 PHCGEAGALTHLMTAFMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 PHCGEAGALTHLMTAFMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYA
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 KNPFLDFLQKGLMISLSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 KNPFLDFLQKGLMISLSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQC
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740
pF1KE0 GISHEEKVKFLGDNYLEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GISHEEKVKFLGDNYLEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
730 740 750 760 770 780
>>CCDS53349.1 AMPD1 gene_id:270|Hs108|chr1 (776 aa)
initn: 5003 init1: 4966 opt: 4999 Z-score: 6045.1 bits: 1129.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4999; 99.3% identity (99.5% similar) in 747 aa overlap (1-747:34-776)
10 20 30
pF1KE0 MPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVK
::::::: .::::::::::::::::::
CCDS53 RIFYSVSQSPHSLLSLLFYCAILESRISATMPLFKLP----EIDDAMRNFAEKVFASEVK
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 DEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFHLETLSTSTEARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFHLETLSTSTEARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TSSTKLSHIDEYISSSPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSSTKLSHIDEYISSSPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKY
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 MQKSFQRFPKTPSKYLRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MQKSFQRFPKTPSKYLRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKM
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KDGVVYVYPNEAAVSKDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KDGVVYVYPNEAAVSKDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 FQVHQMLNEMDELKELKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FQVHQMLNEMDELKELKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 VYSTKEKNLTLKELFAKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VYSTKEKNLTLKELFAKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 YLKTDNYINGEYFATIIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLKTDNYINGEYFATIIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHC
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 PNMTWMIQVPRIYDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PNMTWMIQVPRIYDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFD
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SVDDESKHSGHMFSSKSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SVDDESKHSGHMFSSKSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFR
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 PHCGEAGALTHLMTAFMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PHCGEAGALTHLMTAFMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYA
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 KNPFLDFLQKGLMISLSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNPFLDFLQKGLMISLSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQC
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740
pF1KE0 GISHEEKVKFLGDNYLEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GISHEEKVKFLGDNYLEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
720 730 740 750 760 770
>>CCDS41617.1 AMPD3 gene_id:272|Hs108|chr11 (767 aa)
initn: 3129 init1: 2779 opt: 2991 Z-score: 3615.2 bits: 679.6 E(32554): 4.8e-195
Smith-Waterman score: 3101; 60.5% identity (83.2% similar) in 751 aa overlap (12-747:12-761)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVKDEGGRQEISPFDVDEICPISHHEMQAHIFH
..:. .: .::::::. ...: ... .: : : : :::...: . . ..
CCDS41 MPRQFPKLNISEVDEQVRLLAEKVFAKVLREEDSKDALSLFTVPEDCPIGQKEAKERELQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE0 LETL-STSTE-ARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE--------TSSTKLSHIDEYISS-----
: . :.: :.::: :. .. .::. . ..: .: ...
CCDS41 KELAEQKSVETAKRKKSFKMIRSQSLSLQMPPQQDWKGPPAASPAMSPTTPVVTGATSLP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 SPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKYMQKSFQRFPKTPSKY
.:. ..:.:::: :.::: .:.:.::.: . :.: .:: ::::: . ...:::. :.:
CCDS41 TPAPYAMPEFQRVTISGDYCAGITLEDYEQAAKSLAKALMIREKYARLAYHRFPRITSQY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKMKDGVVYVYPNEAAVS
: . ... .:.. : : :: :::. :. : :: : ..:. :...:: :. .
CCDS41 LGHPRADTAPPEEGL-PDFHPPPLPQEDPYCLDDAPPNLDYLVHMQGGILFVYDNKKMLE
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSKFQVHQMLNEMDELKE
..::. ::::.:.:. ::. .::::..::.::: ::::.:: :::..:.:::::.:.::
CCDS41 HQEPHSLPYPDLETYTVDMSHILALITDGPTKTYCHRRLNFLESKFSLHEMLNEMSEFKE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRVVYSTKEKNLTLKELF
::.:::::::: :::::::::::::::::::::::..:: . ::.: . ...::...:
CCDS41 LKSNPHRDFYNVRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKHTYQTEPDRTVAEKRGRKITLRQVF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 AKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDLYLKTDNYINGEYFAT
:.: ::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::..:::::
CCDS41 DGLHMDPYDLTVDSLDVHAGRQTFHRFDKFNSKYNPVGASELRDLYLKTENYLGGEYFAR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 IIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHCPNMTWMIQVPRIYDV
..:::. .: :.:::..:::::::::::.:: .:. ::. .... ::: :.::::::::.
CCDS41 MVKEVARELEESKYQYSEPRLSIYGRSPEEWPNLAYWFIQHKVYSPNMRWIIQVPRIYDI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 FRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFDSVDDESKHSGHMFSS
::::..::.:::::::::.:.:.:::::: :: .:::..::::::::::::: ::::.
CCDS41 FRSKKLLPNFGKMLENIFLPLFKATINPQDHRELHLFLKYVTGFDSVDDESKHSDHMFSD
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 KSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFRPHCGEAGALTHLMTA
:::.:. :: :.:: :.:: :::::::::::.::.:::..::::::::::::..:::..:
CCDS41 KSPNPDVWTSEQNPPYSYYLYYMYANIMVLNNLRRERGLSTFLFRPHCGEAGSITHLVSA
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 FMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYAKNPFLDFLQKGLMIS
:. ::.::::: ::::::::::..::::::::::::::::::::.:::. .::.::: .:
CCDS41 FLTADNISHGLLLKKSPVLQYLYYLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYSKNPLREFLHKGLHVS
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 LSTDDPMQFHFTKEPLMEEYAIAAQVFKLSTCDMCEVARNSVLQCGISHEEKVKFLGDNY
::::::::::.::: :::::::::::.::::::.::.::::::: :.::.:: ::::.::
CCDS41 LSTDDPMQFHYTKEALMEEYAIAAQVWKLSTCDLCEIARNSVLQSGLSHQEKQKFLGQNY
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740
pF1KE0 LEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
.::: :::::.:::::::::.:::: : ::.......:: :
CCDS41 YKEGPEGNDIRKTNVAQIRMAFRYETLCNELSFLSDAMKSEEITALTN
720 730 740 750 760
>>CCDS44537.1 AMPD3 gene_id:272|Hs108|chr11 (774 aa)
initn: 3129 init1: 2779 opt: 2991 Z-score: 3615.1 bits: 679.6 E(32554): 4.8e-195
Smith-Waterman score: 3101; 60.5% identity (83.2% similar) in 751 aa overlap (12-747:19-768)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MPLFKLPAEEKQIDDAMRNFAEKVFASEVKDEGGRQEISPFDVDEICPISHHE
..:. .: .::::::. ...: ... .: : : : :::...:
CCDS44 MEPGSAEMPRQFPKLNISEVDEQVRLLAEKVFAKVLREEDSKDALSLFTVPEDCPIGQKE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE0 MQAHIFHLETL-STSTE-ARRKKRFQGRKTVNLSIPLSE--------TSSTKLSHIDEYI
. . .. : . :.: :.::: :. .. .::. . ..: .: .
CCDS44 AKERELQKELAEQKSVETAKRKKSFKMIRSQSLSLQMPPQQDWKGPPAASPAMSPTTPVV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE0 SS-----SPTYQTVPDFQRVQITGDYASGVTVEDFEIVCKGLYRALCIREKYMQKSFQRF
.. .:. ..:.:::: :.::: .:.:.::.: . :.: .:: ::::: . ...::
CCDS44 TGATSLPTPAPYAMPEFQRVTISGDYCAGITLEDYEQAAKSLAKALMIREKYARLAYHRF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 PKTPSKYLRNIDGEAWVANESFYPVFTPPVKKGEDPFRTDNLPENLGYHLKMKDGVVYVY
:. :.:: . ... .:.. : : :: :::. :. : :: : ..:. :...::
CCDS44 PRITSQYLGHPRADTAPPEEGL-PDFHPPPLPQEDPYCLDDAPPNLDYLVHMQGGILFVY
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 PNEAAVSKDEPKPLPYPNLDTFLDDMNFLLALIAQGPVKTYTHRRLKFLSSKFQVHQMLN
:. . ..::. ::::.:.:. ::. .::::..::.::: ::::.:: :::..:.:::
CCDS44 DNKKMLEHQEPHSLPYPDLETYTVDMSHILALITDGPTKTYCHRRLNFLESKFSLHEMLN
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 EMDELKELKNNPHRDFYNCRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKKSYQIDADRVVYSTKEKN
::.:.::::.:::::::: :::::::::::::::::::::::..:: . ::.: . ..
CCDS44 EMSEFKELKSNPHRDFYNVRKVDTHIHAAACMNQKHLLRFIKHTYQTEPDRTVAEKRGRK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 LTLKELFAKLKMHPYDLTVDSLDVHAGRQTFQRFDKFNDKYNPVGASELRDLYLKTDNYI
.::...: :.: ::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::.
CCDS44 ITLRQVFDGLHMDPYDLTVDSLDVHAGRQTFHRFDKFNSKYNPVGASELRDLYLKTENYL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 NGEYFATIIKEVGADLVEAKYQHAEPRLSIYGRSPDEWSKLSSWFVCNRIHCPNMTWMIQ
.::::: ..:::. .: :.:::..:::::::::::.:: .:. ::. .... ::: :.::
CCDS44 GGEYFARMVKEVARELEESKYQYSEPRLSIYGRSPEEWPNLAYWFIQHKVYSPNMRWIIQ
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 VPRIYDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFDSVDDESKH
::::::.::::..::.:::::::::.:.:.:::::: :: .:::..::::::::::::
CCDS44 VPRIYDIFRSKKLLPNFGKMLENIFLPLFKATINPQDHRELHLFLKYVTGFDSVDDESKH
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 SGHMFSSKSPKPQEWTLEKNPSYTYYAYYMYANIMVLNSLRKERGMNTFLFRPHCGEAGA
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.:::..::. ::.::::: ::::::::::..::::::::::::::::::::.:::. .::
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640 650 660 670 680 690
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.::: .:::::::::::.::: :::::::::::.::::::.::.::::::: :.::.::
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700 710 720 730 740
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160 170 180 190 200 210
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:: :. . ..::. ::::.:.:. ::. .::::..::.::: ::::.:: :::..:.:
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::::.:.::::.:::::::: :::::::::::::::::::::::..:: . ::.: .
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...::...: :.: ::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.:
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460 470 480 490 500 510
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CCDS78 KHSDHMFSDKSPNPDVWTSEQNPPYSYYLYYMYANIMVLNNLRRERGLSTFLFRPHCGEA
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580 590 600 610 620 630
pF1KE0 GALTHLMTAFMIADDISHGLNLKKSPVLQYLFFLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYAKNPFLD
:..:::..::. ::.::::: ::::::::::..::::::::::::::::::::.:::. .
CCDS78 GSITHLVSAFLTADNISHGLLLKKSPVLQYLYYLAQIPIAMSPLSNNSLFLEYSKNPLRE
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CCDS78 KQKFLGQNYYKEGPEGNDIRKTNVAQIRMAFRYETLCNELSFLSDAMKSEEITALTN
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: ::::::::::..::::::::::::::::::::.:::. .::.::: .:::::::::::
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CCDS53 RKTNVAQIRMAFRYETLCNELSFLSDAMKSEEITALTN
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:. .:: ::..::..::..:::::::: . ::..:::.:..::::: :.:.::::::..:
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CCDS30 VWKLSSCDMCELARNSVLMSGFSHKVKSHWLGPNYTKEGPEGNDIRRTNVPDIRVGYRYE
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CCDS30 TLCQELALITQAVQSEMLETIPEEAGITMSPGPQ
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CCDS58 MDGKCKEIAEELFTRSLAESELRS--APYEFPEESPIEQLEERRQRLE
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CCDS58 RQISQDVKLEPDILLRAKQDFL--KTDSDS-DLQLYKEQGEGQGDRSLRERDVLER--EF
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CCDS58 QRVTISGEEKCGVPFTDLLDAAKSVVRALFIREKYMALSLQSFCPTTRRYLQQL-AEKPL
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CCDS58 ETRTYEQGPDTPVSADAPVHPPALE-QHPYEHCEPSTMPGDLGLGLRMVRGVVHVYTRRE
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CCDS58 PDEHCSEVELPYPDLQEFVADVNVLMALIINGPIKSFCYRRLQYLSSKFQMHVLLNEMKE
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CCDS58 LAAQKKVPHRDFYNIRKVDTHIHASSCMNQKHLLRFIKRAMKRHLEEIVHVEQGREQTLR
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CCDS58 EVFESMNLTAYDLSVDTLDVHADRNTFHRFDKFNAKYNPIGESVLREIFIKTDNRVSGKY
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CCDS58 FAHIIKEVMSDLEESKYQNAELRLSIYGRSRDEWDKLARWAVMHRVHSPNVRWLVQVPRL
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pF1KE0 YDVFRSKNFLPHFGKMLENIFMPVFEATINPQADPELSVFLKHITGFDSVDDESKHSGHM
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CCDS58 FDVYRTKGQLANFQEMLENIFLPLFEATVHPASHPELHLFLEHVDGFDSVDDESKPENHV
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CCDS58 FNLESPLPEAWVEEDNPPYAYYLYYTFANMAMLNHLRRQRGFHTFVLRPHCGEAGPIHHL
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pF1KE0 DNYLEEGPAGNDIRRTNVAQIRMAYRYETWCYELNLIAEGLKSTE
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CCDS58 PNYTKEGPEGNDIRRTNVPDIRVGYRYETLCQELALITQAVQSEMLETIPEEAGITMSPG
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CCDS58 PQ
760
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40 50 60 70 80 90
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. .:.. : :: . : .. .: . : . : :. : . . .. : .
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160 170 180 190
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: :.: : : .::... .: . .... :: . ::. . . :..
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:::.... ...:. . .. ::.:.: .... :::.::.::::: :.::.::::::
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740
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::.....:
CCDS80 LITQAVQSEMLETIPEEAGITMSPGPQ
780 790
>>CCDS76186.1 AMPD2 gene_id:271|Hs108|chr1 (804 aa)
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CCDS76 PYEHCEPSTMPGDLGLGLRMVRGVVHVYTRREPDEHCSEVELPYPDLQEFVADVNVLMAL
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CCDS76 IINGPIKSFCYRRLQYLSSKFQMHVLLNEMKELAAQKKVPHRDFYNIRKVDTHIHASSCM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]